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***  AF2MV3_model5  ***

LOGs for ID: 2607021444302006775

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607021444302006775.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607021444302006775.atom to be opened. Openam> File opened: 2607021444302006775.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1216 First residue number = 1 Last residue number = 854 Number of atoms found = 18884 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 127.304089 +/- 25.387919 From: 20.080000 To: 206.000000 = 112.850399 +/- 33.044312 From: 31.780000 To: 194.290000 = 107.372899 +/- 24.828050 From: 34.740000 To: 191.340000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'GLH ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSP ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'LSN ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 45 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -2.0179 % Filled. Pdbmat> 10951965 non-zero elements. Pdbmat> 1206311 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 127.76 +/- 60.53 Maximum number = 254 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 2.412622E+07 Pdbmat> Larger element = 920.302 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1216 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607021444302006775.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607021444302006775.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607021444302006775.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 18884 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1216 residues. Blocpdb> 106 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 109 atoms in block 2 Block first atom: 107 Blocpdb> 83 atoms in block 3 Block first atom: 216 Blocpdb> 109 atoms in block 4 Block first atom: 299 Blocpdb> 118 atoms in block 5 Block first atom: 408 Blocpdb> 82 atoms in block 6 Block first atom: 526 Blocpdb> 116 atoms in block 7 Block first atom: 608 Blocpdb> 90 atoms in block 8 Block first atom: 724 Blocpdb> 127 atoms in block 9 Block first atom: 814 Blocpdb> 142 atoms in block 10 Block first atom: 941 Blocpdb> 137 atoms in block 11 Block first atom: 1083 Blocpdb> 114 atoms in block 12 Block first atom: 1220 Blocpdb> 136 atoms in block 13 Block first atom: 1334 Blocpdb> 104 atoms in block 14 Block first atom: 1470 Blocpdb> 124 atoms in block 15 Block first atom: 1574 Blocpdb> 108 atoms in block 16 Block first atom: 1698 Blocpdb> 133 atoms in block 17 Block first atom: 1806 Blocpdb> 117 atoms in block 18 Block first atom: 1939 Blocpdb> 127 atoms in block 19 Block first atom: 2056 Blocpdb> 139 atoms in block 20 Block first atom: 2183 Blocpdb> 108 atoms in block 21 Block first atom: 2322 Blocpdb> 110 atoms in block 22 Block first atom: 2430 Blocpdb> 124 atoms in block 23 Block first atom: 2540 Blocpdb> 97 atoms in block 24 Block first atom: 2664 Blocpdb> 110 atoms in block 25 Block first atom: 2761 Blocpdb> 118 atoms in block 26 Block first atom: 2871 Blocpdb> 98 atoms in block 27 Block first atom: 2989 Blocpdb> 131 atoms in block 28 Block first atom: 3087 Blocpdb> 104 atoms in block 29 Block first atom: 3218 Blocpdb> 93 atoms in block 30 Block first atom: 3322 Blocpdb> 99 atoms in block 31 Block first atom: 3415 Blocpdb> 109 atoms in block 32 Block first atom: 3514 Blocpdb> 110 atoms in block 33 Block first atom: 3623 Blocpdb> 82 atoms in block 34 Block first atom: 3733 Blocpdb> 126 atoms in block 35 Block first atom: 3815 Blocpdb> 107 atoms in block 36 Block first atom: 3941 Blocpdb> 120 atoms in block 37 Block first atom: 4048 Blocpdb> 126 atoms in block 38 Block first atom: 4168 Blocpdb> 113 atoms in block 39 Block first atom: 4294 Blocpdb> 134 atoms in block 40 Block first atom: 4407 Blocpdb> 110 atoms in block 41 Block first atom: 4541 Blocpdb> 113 atoms in block 42 Block first atom: 4651 Blocpdb> 112 atoms in block 43 Block first atom: 4764 Blocpdb> 102 atoms in block 44 Block first atom: 4876 Blocpdb> 105 atoms in block 45 Block first atom: 4978 Blocpdb> 121 atoms in block 46 Block first atom: 5083 Blocpdb> 104 atoms in block 47 Block first atom: 5204 Blocpdb> 111 atoms in block 48 Block first atom: 5308 Blocpdb> 101 atoms in block 49 Block first atom: 5419 Blocpdb> 109 atoms in block 50 Block first atom: 5520 Blocpdb> 113 atoms in block 51 Block first atom: 5629 Blocpdb> 92 atoms in block 52 Block first atom: 5742 Blocpdb> 85 atoms in block 53 Block first atom: 5834 Blocpdb> 68 atoms in block 54 Block first atom: 5919 Blocpdb> 89 atoms in block 55 Block first atom: 5987 Blocpdb> 94 atoms in block 56 Block first atom: 6076 Blocpdb> 103 atoms in block 57 Block first atom: 6170 Blocpdb> 149 atoms in block 58 Block first atom: 6273 Blocpdb> 105 atoms in block 59 Block first atom: 6422 Blocpdb> 88 atoms in block 60 Block first atom: 6527 Blocpdb> 91 atoms in block 61 Block first atom: 6615 Blocpdb> 111 atoms in block 62 Block first atom: 6706 Blocpdb> 92 atoms in block 63 Block first atom: 6817 Blocpdb> 112 atoms in block 64 Block first atom: 6909 Blocpdb> 101 atoms in block 65 Block first atom: 7021 Blocpdb> 110 atoms in block 66 Block first atom: 7122 Blocpdb> 90 atoms in block 67 Block first atom: 7232 Blocpdb> 109 atoms in block 68 Block first atom: 7322 Blocpdb> 86 atoms in block 69 Block first atom: 7431 Blocpdb> 107 atoms in block 70 Block first atom: 7517 Blocpdb> 123 atoms in block 71 Block first atom: 7624 Blocpdb> 88 atoms in block 72 Block first atom: 7747 Blocpdb> 110 atoms in block 73 Block first atom: 7835 Blocpdb> 86 atoms in block 74 Block first atom: 7945 Blocpdb> 105 atoms in block 75 Block first atom: 8031 Blocpdb> 71 atoms in block 76 Block first atom: 8136 Blocpdb> 115 atoms in block 77 Block first atom: 8207 Blocpdb> 99 atoms in block 78 Block first atom: 8322 Blocpdb> 83 atoms in block 79 Block first atom: 8421 Blocpdb> 84 atoms in block 80 Block first atom: 8504 Blocpdb> 91 atoms in block 81 Block first atom: 8588 Blocpdb> 97 atoms in block 82 Block first atom: 8679 Blocpdb> 123 atoms in block 83 Block first atom: 8776 Blocpdb> 81 atoms in block 84 Block first atom: 8899 Blocpdb> 87 atoms in block 85 Block first atom: 8980 Blocpdb> 103 atoms in block 86 Block first atom: 9067 Blocpdb> 102 atoms in block 87 Block first atom: 9170 Blocpdb> 89 atoms in block 88 Block first atom: 9272 Blocpdb> 91 atoms in block 89 Block first atom: 9361 Blocpdb> 123 atoms in block 90 Block first atom: 9452 Blocpdb> 113 atoms in block 91 Block first atom: 9575 Blocpdb> 89 atoms in block 92 Block first atom: 9688 Blocpdb> 108 atoms in block 93 Block first atom: 9777 Blocpdb> 115 atoms in block 94 Block first atom: 9885 Blocpdb> 87 atoms in block 95 Block first atom: 10000 Blocpdb> 89 atoms in block 96 Block first atom: 10087 Blocpdb> 73 atoms in block 97 Block first atom: 10176 Blocpdb> 66 atoms in block 98 Block first atom: 10249 Blocpdb> 107 atoms in block 99 Block first atom: 10315 Blocpdb> 134 atoms in block 100 Block first atom: 10422 Blocpdb> 128 atoms in block 101 Block first atom: 10556 Blocpdb> 127 atoms in block 102 Block first atom: 10684 Blocpdb> 133 atoms in block 103 Block first atom: 10811 Blocpdb> 112 atoms in block 104 Block first atom: 10944 Blocpdb> 103 atoms in block 105 Block first atom: 11056 Blocpdb> 115 atoms in block 106 Block first atom: 11159 Blocpdb> 121 atoms in block 107 Block first atom: 11274 Blocpdb> 123 atoms in block 108 Block first atom: 11395 Blocpdb> 116 atoms in block 109 Block first atom: 11518 Blocpdb> 97 atoms in block 110 Block first atom: 11634 Blocpdb> 106 atoms in block 111 Block first atom: 11731 Blocpdb> 104 atoms in block 112 Block first atom: 11837 Blocpdb> 88 atoms in block 113 Block first atom: 11941 Blocpdb> 114 atoms in block 114 Block first atom: 12029 Blocpdb> 123 atoms in block 115 Block first atom: 12143 Blocpdb> 97 atoms in block 116 Block first atom: 12266 Blocpdb> 125 atoms in block 117 Block first atom: 12363 Blocpdb> 128 atoms in block 118 Block first atom: 12488 Blocpdb> 126 atoms in block 119 Block first atom: 12616 Blocpdb> 112 atoms in block 120 Block first atom: 12742 Blocpdb> 114 atoms in block 121 Block first atom: 12854 Blocpdb> 135 atoms in block 122 Block first atom: 12968 Blocpdb> 115 atoms in block 123 Block first atom: 13103 Blocpdb> 107 atoms in block 124 Block first atom: 13218 Blocpdb> 106 atoms in block 125 Block first atom: 13325 Blocpdb> 105 atoms in block 126 Block first atom: 13431 Blocpdb> 107 atoms in block 127 Block first atom: 13536 Blocpdb> 88 atoms in block 128 Block first atom: 13643 Blocpdb> 109 atoms in block 129 Block first atom: 13731 Blocpdb> 116 atoms in block 130 Block first atom: 13840 Blocpdb> 127 atoms in block 131 Block first atom: 13956 Blocpdb> 120 atoms in block 132 Block first atom: 14083 Blocpdb> 104 atoms in block 133 Block first atom: 14203 Blocpdb> 112 atoms in block 134 Block first atom: 14307 Blocpdb> 129 atoms in block 135 Block first atom: 14419 Blocpdb> 108 atoms in block 136 Block first atom: 14548 Blocpdb> 110 atoms in block 137 Block first atom: 14656 Blocpdb> 112 atoms in block 138 Block first atom: 14766 Blocpdb> 106 atoms in block 139 Block first atom: 14878 Blocpdb> 113 atoms in block 140 Block first atom: 14984 Blocpdb> 102 atoms in block 141 Block first atom: 15097 Blocpdb> 125 atoms in block 142 Block first atom: 15199 Blocpdb> 117 atoms in block 143 Block first atom: 15324 Blocpdb> 112 atoms in block 144 Block first atom: 15441 Blocpdb> 138 atoms in block 145 Block first atom: 15553 Blocpdb> 109 atoms in block 146 Block first atom: 15691 Blocpdb> 109 atoms in block 147 Block first atom: 15800 Blocpdb> 120 atoms in block 148 Block first atom: 15909 Blocpdb> 125 atoms in block 149 Block first atom: 16029 Blocpdb> 99 atoms in block 150 Block first atom: 16154 Blocpdb> 113 atoms in block 151 Block first atom: 16253 Blocpdb> 110 atoms in block 152 Block first atom: 16366 Blocpdb> 121 atoms in block 153 Block first atom: 16476 Blocpdb> 103 atoms in block 154 Block first atom: 16597 Blocpdb> 110 atoms in block 155 Block first atom: 16700 Blocpdb> 92 atoms in block 156 Block first atom: 16810 Blocpdb> 109 atoms in block 157 Block first atom: 16902 Blocpdb> 120 atoms in block 158 Block first atom: 17011 Blocpdb> 126 atoms in block 159 Block first atom: 17131 Blocpdb> 126 atoms in block 160 Block first atom: 17257 Blocpdb> 101 atoms in block 161 Block first atom: 17383 Blocpdb> 98 atoms in block 162 Block first atom: 17484 Blocpdb> 106 atoms in block 163 Block first atom: 17582 Blocpdb> 101 atoms in block 164 Block first atom: 17688 Blocpdb> 128 atoms in block 165 Block first atom: 17789 Blocpdb> 115 atoms in block 166 Block first atom: 17917 Blocpdb> 101 atoms in block 167 Block first atom: 18032 Blocpdb> 121 atoms in block 168 Block first atom: 18133 Blocpdb> 130 atoms in block 169 Block first atom: 18254 Blocpdb> 111 atoms in block 170 Block first atom: 18384 Blocpdb> 117 atoms in block 171 Block first atom: 18495 Blocpdb> 97 atoms in block 172 Block first atom: 18612 Blocpdb> 83 atoms in block 173 Block first atom: 18709 Blocpdb> 93 atoms in block 174 Block first atom: 18791 Blocpdb> 174 blocks. Blocpdb> At most, 149 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 66 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10952139 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 56652 Prepmat> Matrix trace = 24126220.0001 Prepmat> Last element read: 56652 56652 52.2744 Prepmat> 15226 lines saved. Prepmat> 14141 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 18884 RTB> Total mass = 18884.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 18884 RTB> Number of blocks = 174 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 236888.7100 RTB> 36414 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1044 Diagstd> Nb of non-zero elements: 36414 Diagstd> Projected matrix trace = 236888.7100 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1044 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 236888.7100 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000862 0.0001449 0.0002634 0.0006687 0.0013499 0.0017082 0.0021103 0.0025415 0.0031912 0.0040591 0.0064289 0.0092513 0.0105956 0.0111870 0.0145440 0.0167394 0.0203505 0.0230370 0.0267797 0.0297728 0.0314354 0.0394828 0.0401743 0.0475481 0.0504319 0.0537464 0.0607162 0.0621780 0.0728712 0.0867138 0.0940465 0.1108322 0.1148036 0.1315098 0.1369463 0.1454610 0.1577280 0.1727160 0.1838939 0.2152260 0.2181225 0.2320012 0.2387041 0.2402033 0.2542774 0.2720778 0.2819468 0.3087118 0.3214236 0.3273728 0.3526950 0.3803852 0.4088049 0.4226978 0.4406559 0.4448059 0.4735845 0.4956284 0.5144601 0.5468116 0.5814834 0.6338408 0.6456661 0.6903816 0.6962109 0.7096458 0.7550686 0.7736523 0.8208086 0.8341017 0.8587075 0.8924808 0.9070331 0.9779252 1.0750963 1.0982353 1.1498658 1.1644499 1.2339371 1.2484826 1.2532754 1.2693607 1.2800596 1.3452828 1.4262180 1.4769349 1.5075609 1.5202860 1.5547945 1.6536624 1.7414535 1.7666625 1.8290546 1.8518604 1.9408765 2.0102727 2.1049056 2.1267161 2.2276644 2.2995089 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034338 0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034341 0.0034348 1.0082592 1.3069683 1.7624374 2.8079867 3.9897232 4.4880944 4.9884364 5.4744066 6.1343552 6.9184671 8.7069265 10.4447315 11.1778355 11.4855523 13.0959385 14.0496444 15.4911314 16.4819485 17.7704528 18.7372065 19.2532741 21.5774043 21.7655528 23.6789237 24.3864234 25.1750179 26.7576331 27.0778158 29.3138726 31.9771170 33.3017147 36.1516589 36.7936566 39.3798785 40.1856049 41.4160330 43.1270489 45.1296119 46.5670775 50.3782047 50.7160606 52.3046651 53.0548698 53.2212146 54.7582036 56.6424197 57.6605581 60.3353612 61.5650414 62.1321732 64.4903779 66.9741348 69.4309871 70.6009081 72.0850309 72.4236724 74.7298320 76.4492741 77.8881027 80.2997391 82.8064092 86.4540577 87.2568001 90.2276999 90.6078244 91.4778808 94.3601175 95.5142559 98.3821296 99.1755878 100.6277841 102.5875644 103.4205515 107.3861061 112.5949659 113.8001867 116.4444693 117.1805927 120.6262394 121.3351201 121.5677939 122.3454443 122.8599608 125.9511336 129.6845476 131.9702245 133.3314823 133.8930194 135.4040888 139.6428507 143.3016596 144.3351397 146.8617225 147.7744658 151.2844284 153.9652717 157.5475290 158.3616584 162.0765412 164.6693706 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 18884 Rtb_to_modes> Number of blocs = 174 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.6209E-05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4486E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6341E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.6865E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3499E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7082E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1103E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5415E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1912E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0591E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.4289E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.2513E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0596E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1187E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4544E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6739E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0351E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3037E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6780E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.9773E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1435E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.9483E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0174E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7548E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.0432E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.3746E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.0716E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.2178E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.2871E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.6714E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.4046E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1108 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1148 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1315 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1369 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1455 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1577 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1839 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2152 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2181 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2320 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2387 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2402 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2543 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2721 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2819 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3087 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3214 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3274 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3527 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3804 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4088 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4227 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4407 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4448 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4736 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4956 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5145 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5468 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5815 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6338 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6904 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6962 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7096 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7551 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7737 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8208 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8341 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8587 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8925 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9070 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9779 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.075 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.098 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.150 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.164 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.234 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.248 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.253 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.269 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.280 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.345 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.426 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.477 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.508 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.520 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.555 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.741 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.767 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.829 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.852 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.941 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.010 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.105 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.127 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.228 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.300 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1044 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 0.99996 1.00006 1.00001 1.00001 1.00004 1.00005 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 0.99997 1.00001 0.99995 1.00000 1.00002 0.99998 1.00004 0.99998 0.99998 1.00005 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 1.00004 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99995 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99995 1.00003 0.99999 1.00001 0.99996 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00004 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99993 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99997 0.99996 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 339912 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 0.99996 1.00006 1.00001 1.00001 1.00004 1.00005 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 0.99997 1.00001 0.99995 1.00000 1.00002 0.99998 1.00004 0.99998 0.99998 1.00005 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 1.00004 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99995 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99995 1.00003 0.99999 1.00001 0.99996 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00004 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99993 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99997 0.99996 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021444302006775.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021444302006775.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607021444302006775.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607021444302006775.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1216 First residue number = 1 Last residue number = 854 Number of atoms found = 18884 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.6209E-05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4486E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6341E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.6865E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3499E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7082E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1103E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5415E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1912E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.0591E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.4289E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.2513E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0596E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1187E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4544E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6739E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0351E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3037E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6780E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9773E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1435E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9483E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.0174E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7548E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.0432E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.3746E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.0716E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.2178E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.2871E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.6714E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.4046E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1108 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1148 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1315 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1455 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1577 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1839 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2152 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2181 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2320 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2387 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2402 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2543 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2721 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2819 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3087 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3214 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3274 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3527 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3804 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4088 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4227 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4407 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4448 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4736 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4956 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5145 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5468 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5815 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6338 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6904 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6962 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7096 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7551 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8208 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8341 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8587 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8925 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9070 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9779 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.075 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.098 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.150 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.164 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.234 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.248 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.253 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.269 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.280 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.345 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.426 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.477 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.508 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.520 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.555 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.741 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.767 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.829 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.852 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.941 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.010 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.105 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.127 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.228 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.300 Bfactors> 106 vectors, 56652 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000086 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 26.296 +/- 99.66 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -26.296 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021444302006775.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021444302006775.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.008 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.307 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.762 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.808 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.990 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.488 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.988 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.474 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.134 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.918 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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vecteur en lecture: 102.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 18884 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 18 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 26 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 30 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 62 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 86 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 106 is: 0.9999 (instead of 1.0000). 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running: ../../bin/get_modes.sh 2607021444302006775 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021444302006775.eigenfacs 2607021444302006775.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021444302006775.eigenfacs 2607021444302006775.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021444302006775.eigenfacs 2607021444302006775.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021444302006775.eigenfacs 2607021444302006775.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021444302006775.eigenfacs 2607021444302006775.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021444302006775.eigenfacs 2607021444302006775.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021444302006775.eigenfacs 2607021444302006775.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021444302006775.eigenfacs 2607021444302006775.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021444302006775.eigenfacs 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