CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  Cluster1_zdock_1gng_model2  ***

LOGs for ID: 2607021445062007420

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607021445062007420.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607021445062007420.atom to be opened. Openam> File opened: 2607021445062007420.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1210 First residue number = 1 Last residue number = 383 Number of atoms found = 18776 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 91.023189 +/- 30.735760 From: 28.347000 To: 161.532000 = 91.006845 +/- 27.211023 From: 25.356000 To: 154.973000 = 91.029565 +/- 28.275021 From: 22.529000 To: 156.747000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 31 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -1.8226 % Filled. Pdbmat> 10225659 non-zero elements. Pdbmat> 1123852 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 119.71 +/- 56.80 Maximum number = 253 Minimum number = 18 Pdbmat> Matrix trace = 2.247704E+07 Pdbmat> Larger element = 896.659 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1210 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607021445062007420.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607021445062007420.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607021445062007420.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 18776 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1210 residues. Blocpdb> 85 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 68 atoms in block 2 Block first atom: 86 Blocpdb> 89 atoms in block 3 Block first atom: 154 Blocpdb> 94 atoms in block 4 Block first atom: 243 Blocpdb> 103 atoms in block 5 Block first atom: 337 Blocpdb> 149 atoms in block 6 Block first atom: 440 Blocpdb> 105 atoms in block 7 Block first atom: 589 Blocpdb> 88 atoms in block 8 Block first atom: 694 Blocpdb> 91 atoms in block 9 Block first atom: 782 Blocpdb> 111 atoms in block 10 Block first atom: 873 Blocpdb> 92 atoms in block 11 Block first atom: 984 Blocpdb> 112 atoms in block 12 Block first atom: 1076 Blocpdb> 101 atoms in block 13 Block first atom: 1188 Blocpdb> 110 atoms in block 14 Block first atom: 1289 Blocpdb> 90 atoms in block 15 Block first atom: 1399 Blocpdb> 109 atoms in block 16 Block first atom: 1489 Blocpdb> 86 atoms in block 17 Block first atom: 1598 Blocpdb> 107 atoms in block 18 Block first atom: 1684 Blocpdb> 123 atoms in block 19 Block first atom: 1791 Blocpdb> 88 atoms in block 20 Block first atom: 1914 Blocpdb> 110 atoms in block 21 Block first atom: 2002 Blocpdb> 86 atoms in block 22 Block first atom: 2112 Blocpdb> 105 atoms in block 23 Block first atom: 2198 Blocpdb> 71 atoms in block 24 Block first atom: 2303 Blocpdb> 115 atoms in block 25 Block first atom: 2374 Blocpdb> 99 atoms in block 26 Block first atom: 2489 Blocpdb> 83 atoms in block 27 Block first atom: 2588 Blocpdb> 84 atoms in block 28 Block first atom: 2671 Blocpdb> 91 atoms in block 29 Block first atom: 2755 Blocpdb> 97 atoms in block 30 Block first atom: 2846 Blocpdb> 123 atoms in block 31 Block first atom: 2943 Blocpdb> 81 atoms in block 32 Block first atom: 3066 Blocpdb> 86 atoms in block 33 Block first atom: 3147 Blocpdb> 103 atoms in block 34 Block first atom: 3233 Blocpdb> 102 atoms in block 35 Block first atom: 3336 Blocpdb> 89 atoms in block 36 Block first atom: 3438 Blocpdb> 91 atoms in block 37 Block first atom: 3527 Blocpdb> 123 atoms in block 38 Block first atom: 3618 Blocpdb> 113 atoms in block 39 Block first atom: 3741 Blocpdb> 89 atoms in block 40 Block first atom: 3854 Blocpdb> 108 atoms in block 41 Block first atom: 3943 Blocpdb> 115 atoms in block 42 Block first atom: 4051 Blocpdb> 87 atoms in block 43 Block first atom: 4166 Blocpdb> 89 atoms in block 44 Block first atom: 4253 Blocpdb> 73 atoms in block 45 Block first atom: 4342 Blocpdb> 66 atoms in block 46 Block first atom: 4415 Blocpdb> 107 atoms in block 47 Block first atom: 4481 Blocpdb> 134 atoms in block 48 Block first atom: 4588 Blocpdb> 128 atoms in block 49 Block first atom: 4722 Blocpdb> 127 atoms in block 50 Block first atom: 4850 Blocpdb> 133 atoms in block 51 Block first atom: 4977 Blocpdb> 112 atoms in block 52 Block first atom: 5110 Blocpdb> 102 atoms in block 53 Block first atom: 5222 Blocpdb> 114 atoms in block 54 Block first atom: 5324 Blocpdb> 121 atoms in block 55 Block first atom: 5438 Blocpdb> 123 atoms in block 56 Block first atom: 5559 Blocpdb> 116 atoms in block 57 Block first atom: 5682 Blocpdb> 97 atoms in block 58 Block first atom: 5798 Blocpdb> 106 atoms in block 59 Block first atom: 5895 Blocpdb> 104 atoms in block 60 Block first atom: 6001 Blocpdb> 88 atoms in block 61 Block first atom: 6105 Blocpdb> 114 atoms in block 62 Block first atom: 6193 Blocpdb> 123 atoms in block 63 Block first atom: 6307 Blocpdb> 97 atoms in block 64 Block first atom: 6430 Blocpdb> 125 atoms in block 65 Block first atom: 6527 Blocpdb> 128 atoms in block 66 Block first atom: 6652 Blocpdb> 126 atoms in block 67 Block first atom: 6780 Blocpdb> 112 atoms in block 68 Block first atom: 6906 Blocpdb> 114 atoms in block 69 Block first atom: 7018 Blocpdb> 135 atoms in block 70 Block first atom: 7132 Blocpdb> 115 atoms in block 71 Block first atom: 7267 Blocpdb> 107 atoms in block 72 Block first atom: 7382 Blocpdb> 106 atoms in block 73 Block first atom: 7489 Blocpdb> 105 atoms in block 74 Block first atom: 7595 Blocpdb> 107 atoms in block 75 Block first atom: 7700 Blocpdb> 88 atoms in block 76 Block first atom: 7807 Blocpdb> 109 atoms in block 77 Block first atom: 7895 Blocpdb> 116 atoms in block 78 Block first atom: 8004 Blocpdb> 127 atoms in block 79 Block first atom: 8120 Blocpdb> 119 atoms in block 80 Block first atom: 8247 Blocpdb> 105 atoms in block 81 Block first atom: 8366 Blocpdb> 112 atoms in block 82 Block first atom: 8471 Blocpdb> 129 atoms in block 83 Block first atom: 8583 Blocpdb> 108 atoms in block 84 Block first atom: 8712 Blocpdb> 111 atoms in block 85 Block first atom: 8820 Blocpdb> 112 atoms in block 86 Block first atom: 8931 Blocpdb> 106 atoms in block 87 Block first atom: 9043 Blocpdb> 113 atoms in block 88 Block first atom: 9149 Blocpdb> 102 atoms in block 89 Block first atom: 9262 Blocpdb> 125 atoms in block 90 Block first atom: 9364 Blocpdb> 117 atoms in block 91 Block first atom: 9489 Blocpdb> 112 atoms in block 92 Block first atom: 9606 Blocpdb> 138 atoms in block 93 Block first atom: 9718 Blocpdb> 109 atoms in block 94 Block first atom: 9856 Blocpdb> 109 atoms in block 95 Block first atom: 9965 Blocpdb> 120 atoms in block 96 Block first atom: 10074 Blocpdb> 125 atoms in block 97 Block first atom: 10194 Blocpdb> 99 atoms in block 98 Block first atom: 10319 Blocpdb> 113 atoms in block 99 Block first atom: 10418 Blocpdb> 110 atoms in block 100 Block first atom: 10531 Blocpdb> 121 atoms in block 101 Block first atom: 10641 Blocpdb> 103 atoms in block 102 Block first atom: 10762 Blocpdb> 110 atoms in block 103 Block first atom: 10865 Blocpdb> 92 atoms in block 104 Block first atom: 10975 Blocpdb> 109 atoms in block 105 Block first atom: 11067 Blocpdb> 120 atoms in block 106 Block first atom: 11176 Blocpdb> 126 atoms in block 107 Block first atom: 11296 Blocpdb> 126 atoms in block 108 Block first atom: 11422 Blocpdb> 101 atoms in block 109 Block first atom: 11548 Blocpdb> 98 atoms in block 110 Block first atom: 11649 Blocpdb> 106 atoms in block 111 Block first atom: 11747 Blocpdb> 101 atoms in block 112 Block first atom: 11853 Blocpdb> 129 atoms in block 113 Block first atom: 11954 Blocpdb> 114 atoms in block 114 Block first atom: 12083 Blocpdb> 101 atoms in block 115 Block first atom: 12197 Blocpdb> 121 atoms in block 116 Block first atom: 12298 Blocpdb> 130 atoms in block 117 Block first atom: 12419 Blocpdb> 111 atoms in block 118 Block first atom: 12549 Blocpdb> 118 atoms in block 119 Block first atom: 12660 Blocpdb> 96 atoms in block 120 Block first atom: 12778 Blocpdb> 83 atoms in block 121 Block first atom: 12874 Blocpdb> 93 atoms in block 122 Block first atom: 12957 Blocpdb> 106 atoms in block 123 Block first atom: 13050 Blocpdb> 109 atoms in block 124 Block first atom: 13156 Blocpdb> 83 atoms in block 125 Block first atom: 13265 Blocpdb> 109 atoms in block 126 Block first atom: 13348 Blocpdb> 118 atoms in block 127 Block first atom: 13457 Blocpdb> 82 atoms in block 128 Block first atom: 13575 Blocpdb> 116 atoms in block 129 Block first atom: 13657 Blocpdb> 90 atoms in block 130 Block first atom: 13773 Blocpdb> 127 atoms in block 131 Block first atom: 13863 Blocpdb> 141 atoms in block 132 Block first atom: 13990 Blocpdb> 137 atoms in block 133 Block first atom: 14131 Blocpdb> 114 atoms in block 134 Block first atom: 14268 Blocpdb> 136 atoms in block 135 Block first atom: 14382 Blocpdb> 104 atoms in block 136 Block first atom: 14518 Blocpdb> 124 atoms in block 137 Block first atom: 14622 Blocpdb> 108 atoms in block 138 Block first atom: 14746 Blocpdb> 133 atoms in block 139 Block first atom: 14854 Blocpdb> 117 atoms in block 140 Block first atom: 14987 Blocpdb> 127 atoms in block 141 Block first atom: 15104 Blocpdb> 139 atoms in block 142 Block first atom: 15231 Blocpdb> 108 atoms in block 143 Block first atom: 15370 Blocpdb> 110 atoms in block 144 Block first atom: 15478 Blocpdb> 124 atoms in block 145 Block first atom: 15588 Blocpdb> 97 atoms in block 146 Block first atom: 15712 Blocpdb> 110 atoms in block 147 Block first atom: 15809 Blocpdb> 119 atoms in block 148 Block first atom: 15919 Blocpdb> 98 atoms in block 149 Block first atom: 16038 Blocpdb> 131 atoms in block 150 Block first atom: 16136 Blocpdb> 104 atoms in block 151 Block first atom: 16267 Blocpdb> 93 atoms in block 152 Block first atom: 16371 Blocpdb> 99 atoms in block 153 Block first atom: 16464 Blocpdb> 109 atoms in block 154 Block first atom: 16563 Blocpdb> 110 atoms in block 155 Block first atom: 16672 Blocpdb> 82 atoms in block 156 Block first atom: 16782 Blocpdb> 126 atoms in block 157 Block first atom: 16864 Blocpdb> 107 atoms in block 158 Block first atom: 16990 Blocpdb> 120 atoms in block 159 Block first atom: 17097 Blocpdb> 126 atoms in block 160 Block first atom: 17217 Blocpdb> 113 atoms in block 161 Block first atom: 17343 Blocpdb> 134 atoms in block 162 Block first atom: 17456 Blocpdb> 110 atoms in block 163 Block first atom: 17590 Blocpdb> 113 atoms in block 164 Block first atom: 17700 Blocpdb> 112 atoms in block 165 Block first atom: 17813 Blocpdb> 102 atoms in block 166 Block first atom: 17925 Blocpdb> 105 atoms in block 167 Block first atom: 18027 Blocpdb> 121 atoms in block 168 Block first atom: 18132 Blocpdb> 104 atoms in block 169 Block first atom: 18253 Blocpdb> 111 atoms in block 170 Block first atom: 18357 Blocpdb> 101 atoms in block 171 Block first atom: 18468 Blocpdb> 109 atoms in block 172 Block first atom: 18569 Blocpdb> 99 atoms in block 173 Block first atom: 18677 Blocpdb> 173 blocks. Blocpdb> At most, 149 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 66 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10225832 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 56328 Prepmat> Matrix trace = 22477040.0001 Prepmat> Last element read: 56328 56328 103.2584 Prepmat> 15052 lines saved. Prepmat> 14109 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 18776 RTB> Total mass = 18776.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 18776 RTB> Number of blocks = 173 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 210274.0905 RTB> 31317 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1038 Diagstd> Nb of non-zero elements: 31317 Diagstd> Projected matrix trace = 210274.0905 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1038 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 210274.0905 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0001493 0.0002241 0.0003482 0.0006761 0.0010950 0.0013431 0.0016137 0.0019697 0.0024577 0.0027374 0.0039390 0.0063681 0.0075389 0.0082930 0.0088793 0.0119836 0.0126117 0.0130651 0.0140225 0.0154936 0.0168492 0.0209198 0.0248941 0.0259368 0.0303355 0.0363705 0.0386024 0.0426368 0.0501617 0.0559197 0.0580449 0.0639503 0.0710961 0.0771291 0.0795946 0.0806820 0.0863775 0.0895380 0.0974574 0.1124101 0.1153019 0.1214820 0.1267786 0.1396425 0.1478805 0.1625181 0.1726966 0.1814695 0.1930776 0.1972898 0.2140246 0.2303465 0.2356904 0.2420644 0.2661513 0.2712314 0.2857197 0.2950195 0.3063728 0.3168283 0.3405640 0.3816818 0.4091650 0.4250852 0.4578326 0.4630887 0.4845955 0.5112029 0.5123531 0.5766031 0.6040635 0.6192547 0.6649758 0.6680259 0.7128223 0.7352705 0.7541938 0.7843818 0.8045757 0.8395745 0.9110062 0.9383828 0.9418630 0.9784600 1.0621482 1.0678961 1.0866850 1.1231610 1.1342272 1.2355415 1.2567894 1.2913131 1.3235187 1.3609394 1.4003663 1.4045558 1.4517287 1.4914805 1.5976653 1.6973853 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034338 0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034341 1.3267736 1.6255888 2.0263716 2.8236233 3.5932950 3.9796615 4.3622192 4.8194384 5.3833935 5.6815346 6.8153652 8.6656196 9.4286150 9.8889635 10.2325559 11.8874494 12.1950048 12.4122862 12.8590364 13.5167102 14.0956571 15.7063052 17.1334019 17.4885448 18.9134392 20.7095030 21.3354787 22.4226774 24.3209930 25.6789682 26.1623951 27.4610050 28.9546486 30.1581318 30.6363622 30.8449159 31.9150598 32.4936930 33.9002400 36.4080954 36.8734342 37.8487264 38.6650255 40.5792608 41.7590581 43.7770126 45.1270801 46.2590857 47.7156921 48.2333734 50.2373933 52.1178008 52.7188875 53.4269913 56.0221258 56.5542549 58.0450699 58.9821556 60.1063489 61.1233708 63.3715934 67.0881771 69.4615550 70.7999993 73.4765282 73.8970945 75.5935894 77.6411481 77.7284427 82.4581870 84.3988574 85.4535141 88.5519679 88.7548147 91.6823915 93.1148304 94.3054418 96.1743017 97.4044355 99.5004177 103.6468104 105.1926286 105.3875126 107.4154675 111.9148795 112.2172916 113.2001791 115.0843528 115.6499138 120.7046367 121.7381047 123.3988346 124.9281557 126.6819327 128.5038401 128.6959204 130.8392419 132.6184866 137.2581613 141.4768867 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 18776 Rtb_to_modes> Number of blocs = 173 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4928E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2409E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.4822E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.7612E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0950E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3431E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6137E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9697E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4577E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.7374E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.9390E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.3681E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.5389E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.2930E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.8793E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1984E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2612E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3065E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4023E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5494E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6849E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0920E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4894E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5937E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0335E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6370E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8602E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.2637E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.0162E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.5920E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.8045E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.3950E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1096E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.7129E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.9595E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.0682E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.6378E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.9538E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.7457E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1124 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1153 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1215 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1268 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1396 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1479 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1625 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1815 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1931 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1973 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2140 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2303 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2357 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2421 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2662 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2712 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2857 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2950 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3064 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3168 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3817 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4092 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4251 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4578 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4631 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4846 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5112 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5124 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5766 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6041 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6193 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6650 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6680 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7128 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7353 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7542 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7844 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8046 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8396 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9110 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9384 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9785 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.062 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.068 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.087 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.123 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.134 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.236 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.257 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.291 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.324 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.361 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.400 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.405 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.452 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.491 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.598 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.697 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1038 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 0.99999 0.99996 0.99996 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00005 0.99995 1.00002 1.00003 1.00000 0.99997 1.00005 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99997 0.99997 1.00002 0.99998 0.99998 0.99996 0.99996 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00006 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 0.99997 1.00005 1.00002 1.00004 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00006 0.99994 0.99996 0.99998 0.99996 0.99999 1.00003 1.00001 0.99995 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99995 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 1.00002 1.00004 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 337968 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 0.99999 0.99996 0.99996 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00005 0.99995 1.00002 1.00003 1.00000 0.99997 1.00005 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99997 0.99997 1.00002 0.99998 0.99998 0.99996 0.99996 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00006 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 0.99997 1.00005 1.00002 1.00004 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00006 0.99994 0.99996 0.99998 0.99996 0.99999 1.00003 1.00001 0.99995 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99995 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 1.00002 1.00004 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021445062007420.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021445062007420.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607021445062007420.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607021445062007420.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1210 First residue number = 1 Last residue number = 383 Number of atoms found = 18776 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4928E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2409E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.4822E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.7612E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0950E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3431E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6137E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9697E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4577E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.7374E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9390E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.3681E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.5389E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.2930E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.8793E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1984E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2612E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3065E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4023E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5494E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6849E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0920E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4894E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5937E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0335E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6370E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8602E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.2637E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.0162E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.5920E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.8045E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.3950E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.1096E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7129E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.9595E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.0682E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.6378E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.9538E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.7457E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1124 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1153 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1215 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1268 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1396 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1479 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1625 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1815 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1931 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1973 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2140 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2303 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2357 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2421 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2662 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2712 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2857 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2950 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3064 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3168 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3817 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4092 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4251 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4578 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4631 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4846 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5112 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5124 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5766 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6041 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6193 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6650 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6680 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7128 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7353 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7542 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7844 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8046 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8396 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9110 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9384 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9419 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9785 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.062 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.068 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.087 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.123 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.134 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.236 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.257 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.324 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.361 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.400 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.405 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.452 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.491 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.598 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.697 Bfactors> 106 vectors, 56328 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000149 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 18.672 +/- 48.93 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -18.672 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021445062007420.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021445062007420.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.327 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.626 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.026 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.824 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.593 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.980 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.362 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.819 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.383 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.681 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.815 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.665 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.428 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.889 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.5 Chkmod> 106 vectors, 56328 coordinates in file. Chkmod> That is: 18776 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 18 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 19 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 53 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 71 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 72 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 79 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8326 0.0034 0.7320 0.0034 0.7715 0.0034 0.9296 0.0034 0.7843 0.0034 0.7388 1.3267 0.1324 1.6255 0.1216 2.0263 0.4400 2.8235 0.1270 3.5932 0.0163 3.9795 0.3361 4.3620 0.6186 4.8192 0.4197 5.3832 0.0123 5.6813 0.0818 6.8151 0.1042 8.6653 0.1737 9.4282 0.0927 9.8885 0.4537 10.2321 0.1634 11.8871 0.3690 12.1946 0.0341 12.4117 0.0881 12.8587 0.1550 13.5163 0.0313 14.0950 0.1404 15.7057 0.1620 17.1326 0.1007 17.4879 0.2722 18.9125 0.0698 20.7085 0.1025 21.3345 0.2095 22.4218 0.2232 24.3200 0.0719 25.6779 0.4060 26.1613 0.0901 27.4598 0.0712 28.9534 0.1266 30.1568 0.2586 30.6351 0.0828 30.8436 0.2228 31.9138 0.0722 32.4923 0.0863 33.8987 0.2860 36.4049 0.0576 36.8715 0.0789 37.8499 0.1097 38.6666 0.1030 40.5713 0.3486 41.7600 0.2027 43.7727 0.1811 45.1256 0.2175 46.2610 0.2530 47.7164 0.1615 48.2325 0.1556 50.2324 0.1831 52.1103 0.2494 52.7177 0.1225 53.4286 0.0616 56.0248 0.1293 56.5486 0.1572 58.0406 0.0598 58.9777 0.1217 60.1064 0.1828 61.1180 0.1565 63.3722 0.1769 67.0869 0.0944 69.4615 0.2246 70.7982 0.1119 73.4708 0.1194 73.8948 0.1611 75.5907 0.2031 77.6376 0.1415 77.7287 0.1009 82.4544 0.0548 84.3978 0.2851 85.4530 0.1561 88.5498 0.0977 88.7493 0.2268 91.6770 0.2062 93.1127 0.1589 94.3018 0.0399 96.1713 0.1219 97.4017 0.1877 99.4977 0.1607 103.6420 0.2261 105.1891 0.1585 105.3851 0.0891 107.4131 0.2571 111.9023 0.2878 112.2179 0.2460 113.2117 0.0382 115.0712 0.1239 115.6334 0.0350 120.7218 0.0482 121.7431 0.0542 123.3786 0.2192 124.9455 0.0721 126.6793 0.1451 128.4815 0.1313 128.7107 0.2023 130.8458 0.0550 132.5914 0.1498 137.2666 0.1588 141.4548 0.0489 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021445062007420 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445062007420.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445062007420.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445062007420.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021445062007420 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445062007420.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445062007420.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445062007420.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021445062007420 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445062007420.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445062007420.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445062007420.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021445062007420 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445062007420.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445062007420.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445062007420.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021445062007420 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445062007420.eigenfacs 2607021445062007420.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445062007420.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445062007420.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445062007420.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2607021445062007420.10.pdb 2607021445062007420.11.pdb 2607021445062007420.7.pdb 2607021445062007420.8.pdb 2607021445062007420.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 2m47.473s user 2m46.407s sys 0m0.839s rm: cannot remove '2607021445062007420.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.