CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  Cluster2_zdock_7z1f_model5  ***

LOGs for ID: 2607021445272007688

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607021445272007688.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607021445272007688.atom to be opened. Openam> File opened: 2607021445272007688.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1213 First residue number = 1 Last residue number = 386 Number of atoms found = 18824 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 88.560838 +/- 26.609519 From: 13.667000 To: 155.029000 = 88.566956 +/- 21.445706 From: 36.347000 To: 157.439000 = 88.567146 +/- 32.646711 From: 22.945000 To: 172.863000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 31 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -1.8719 % Filled. Pdbmat> 10350112 non-zero elements. Pdbmat> 1137652 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 120.87 +/- 57.65 Maximum number = 255 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 2.275304E+07 Pdbmat> Larger element = 904.553 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1213 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607021445272007688.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607021445272007688.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607021445272007688.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 18824 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1213 residues. Blocpdb> 85 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 68 atoms in block 2 Block first atom: 86 Blocpdb> 89 atoms in block 3 Block first atom: 154 Blocpdb> 94 atoms in block 4 Block first atom: 243 Blocpdb> 103 atoms in block 5 Block first atom: 337 Blocpdb> 149 atoms in block 6 Block first atom: 440 Blocpdb> 105 atoms in block 7 Block first atom: 589 Blocpdb> 88 atoms in block 8 Block first atom: 694 Blocpdb> 91 atoms in block 9 Block first atom: 782 Blocpdb> 111 atoms in block 10 Block first atom: 873 Blocpdb> 92 atoms in block 11 Block first atom: 984 Blocpdb> 112 atoms in block 12 Block first atom: 1076 Blocpdb> 101 atoms in block 13 Block first atom: 1188 Blocpdb> 110 atoms in block 14 Block first atom: 1289 Blocpdb> 90 atoms in block 15 Block first atom: 1399 Blocpdb> 109 atoms in block 16 Block first atom: 1489 Blocpdb> 86 atoms in block 17 Block first atom: 1598 Blocpdb> 107 atoms in block 18 Block first atom: 1684 Blocpdb> 123 atoms in block 19 Block first atom: 1791 Blocpdb> 88 atoms in block 20 Block first atom: 1914 Blocpdb> 110 atoms in block 21 Block first atom: 2002 Blocpdb> 86 atoms in block 22 Block first atom: 2112 Blocpdb> 105 atoms in block 23 Block first atom: 2198 Blocpdb> 71 atoms in block 24 Block first atom: 2303 Blocpdb> 115 atoms in block 25 Block first atom: 2374 Blocpdb> 99 atoms in block 26 Block first atom: 2489 Blocpdb> 83 atoms in block 27 Block first atom: 2588 Blocpdb> 84 atoms in block 28 Block first atom: 2671 Blocpdb> 91 atoms in block 29 Block first atom: 2755 Blocpdb> 97 atoms in block 30 Block first atom: 2846 Blocpdb> 123 atoms in block 31 Block first atom: 2943 Blocpdb> 81 atoms in block 32 Block first atom: 3066 Blocpdb> 86 atoms in block 33 Block first atom: 3147 Blocpdb> 103 atoms in block 34 Block first atom: 3233 Blocpdb> 102 atoms in block 35 Block first atom: 3336 Blocpdb> 89 atoms in block 36 Block first atom: 3438 Blocpdb> 91 atoms in block 37 Block first atom: 3527 Blocpdb> 123 atoms in block 38 Block first atom: 3618 Blocpdb> 113 atoms in block 39 Block first atom: 3741 Blocpdb> 89 atoms in block 40 Block first atom: 3854 Blocpdb> 108 atoms in block 41 Block first atom: 3943 Blocpdb> 115 atoms in block 42 Block first atom: 4051 Blocpdb> 87 atoms in block 43 Block first atom: 4166 Blocpdb> 89 atoms in block 44 Block first atom: 4253 Blocpdb> 73 atoms in block 45 Block first atom: 4342 Blocpdb> 66 atoms in block 46 Block first atom: 4415 Blocpdb> 107 atoms in block 47 Block first atom: 4481 Blocpdb> 134 atoms in block 48 Block first atom: 4588 Blocpdb> 128 atoms in block 49 Block first atom: 4722 Blocpdb> 127 atoms in block 50 Block first atom: 4850 Blocpdb> 133 atoms in block 51 Block first atom: 4977 Blocpdb> 112 atoms in block 52 Block first atom: 5110 Blocpdb> 102 atoms in block 53 Block first atom: 5222 Blocpdb> 114 atoms in block 54 Block first atom: 5324 Blocpdb> 121 atoms in block 55 Block first atom: 5438 Blocpdb> 123 atoms in block 56 Block first atom: 5559 Blocpdb> 116 atoms in block 57 Block first atom: 5682 Blocpdb> 97 atoms in block 58 Block first atom: 5798 Blocpdb> 106 atoms in block 59 Block first atom: 5895 Blocpdb> 104 atoms in block 60 Block first atom: 6001 Blocpdb> 88 atoms in block 61 Block first atom: 6105 Blocpdb> 114 atoms in block 62 Block first atom: 6193 Blocpdb> 123 atoms in block 63 Block first atom: 6307 Blocpdb> 97 atoms in block 64 Block first atom: 6430 Blocpdb> 125 atoms in block 65 Block first atom: 6527 Blocpdb> 128 atoms in block 66 Block first atom: 6652 Blocpdb> 126 atoms in block 67 Block first atom: 6780 Blocpdb> 112 atoms in block 68 Block first atom: 6906 Blocpdb> 114 atoms in block 69 Block first atom: 7018 Blocpdb> 135 atoms in block 70 Block first atom: 7132 Blocpdb> 115 atoms in block 71 Block first atom: 7267 Blocpdb> 107 atoms in block 72 Block first atom: 7382 Blocpdb> 106 atoms in block 73 Block first atom: 7489 Blocpdb> 105 atoms in block 74 Block first atom: 7595 Blocpdb> 107 atoms in block 75 Block first atom: 7700 Blocpdb> 88 atoms in block 76 Block first atom: 7807 Blocpdb> 109 atoms in block 77 Block first atom: 7895 Blocpdb> 116 atoms in block 78 Block first atom: 8004 Blocpdb> 127 atoms in block 79 Block first atom: 8120 Blocpdb> 119 atoms in block 80 Block first atom: 8247 Blocpdb> 105 atoms in block 81 Block first atom: 8366 Blocpdb> 112 atoms in block 82 Block first atom: 8471 Blocpdb> 129 atoms in block 83 Block first atom: 8583 Blocpdb> 108 atoms in block 84 Block first atom: 8712 Blocpdb> 111 atoms in block 85 Block first atom: 8820 Blocpdb> 112 atoms in block 86 Block first atom: 8931 Blocpdb> 106 atoms in block 87 Block first atom: 9043 Blocpdb> 113 atoms in block 88 Block first atom: 9149 Blocpdb> 102 atoms in block 89 Block first atom: 9262 Blocpdb> 125 atoms in block 90 Block first atom: 9364 Blocpdb> 117 atoms in block 91 Block first atom: 9489 Blocpdb> 112 atoms in block 92 Block first atom: 9606 Blocpdb> 138 atoms in block 93 Block first atom: 9718 Blocpdb> 109 atoms in block 94 Block first atom: 9856 Blocpdb> 109 atoms in block 95 Block first atom: 9965 Blocpdb> 120 atoms in block 96 Block first atom: 10074 Blocpdb> 125 atoms in block 97 Block first atom: 10194 Blocpdb> 99 atoms in block 98 Block first atom: 10319 Blocpdb> 113 atoms in block 99 Block first atom: 10418 Blocpdb> 110 atoms in block 100 Block first atom: 10531 Blocpdb> 121 atoms in block 101 Block first atom: 10641 Blocpdb> 103 atoms in block 102 Block first atom: 10762 Blocpdb> 110 atoms in block 103 Block first atom: 10865 Blocpdb> 92 atoms in block 104 Block first atom: 10975 Blocpdb> 109 atoms in block 105 Block first atom: 11067 Blocpdb> 120 atoms in block 106 Block first atom: 11176 Blocpdb> 126 atoms in block 107 Block first atom: 11296 Blocpdb> 126 atoms in block 108 Block first atom: 11422 Blocpdb> 101 atoms in block 109 Block first atom: 11548 Blocpdb> 98 atoms in block 110 Block first atom: 11649 Blocpdb> 106 atoms in block 111 Block first atom: 11747 Blocpdb> 101 atoms in block 112 Block first atom: 11853 Blocpdb> 129 atoms in block 113 Block first atom: 11954 Blocpdb> 114 atoms in block 114 Block first atom: 12083 Blocpdb> 101 atoms in block 115 Block first atom: 12197 Blocpdb> 121 atoms in block 116 Block first atom: 12298 Blocpdb> 130 atoms in block 117 Block first atom: 12419 Blocpdb> 111 atoms in block 118 Block first atom: 12549 Blocpdb> 118 atoms in block 119 Block first atom: 12660 Blocpdb> 96 atoms in block 120 Block first atom: 12778 Blocpdb> 83 atoms in block 121 Block first atom: 12874 Blocpdb> 93 atoms in block 122 Block first atom: 12957 Blocpdb> 106 atoms in block 123 Block first atom: 13050 Blocpdb> 109 atoms in block 124 Block first atom: 13156 Blocpdb> 83 atoms in block 125 Block first atom: 13265 Blocpdb> 109 atoms in block 126 Block first atom: 13348 Blocpdb> 118 atoms in block 127 Block first atom: 13457 Blocpdb> 82 atoms in block 128 Block first atom: 13575 Blocpdb> 116 atoms in block 129 Block first atom: 13657 Blocpdb> 90 atoms in block 130 Block first atom: 13773 Blocpdb> 127 atoms in block 131 Block first atom: 13863 Blocpdb> 141 atoms in block 132 Block first atom: 13990 Blocpdb> 137 atoms in block 133 Block first atom: 14131 Blocpdb> 114 atoms in block 134 Block first atom: 14268 Blocpdb> 136 atoms in block 135 Block first atom: 14382 Blocpdb> 104 atoms in block 136 Block first atom: 14518 Blocpdb> 124 atoms in block 137 Block first atom: 14622 Blocpdb> 108 atoms in block 138 Block first atom: 14746 Blocpdb> 133 atoms in block 139 Block first atom: 14854 Blocpdb> 117 atoms in block 140 Block first atom: 14987 Blocpdb> 127 atoms in block 141 Block first atom: 15104 Blocpdb> 139 atoms in block 142 Block first atom: 15231 Blocpdb> 108 atoms in block 143 Block first atom: 15370 Blocpdb> 110 atoms in block 144 Block first atom: 15478 Blocpdb> 124 atoms in block 145 Block first atom: 15588 Blocpdb> 97 atoms in block 146 Block first atom: 15712 Blocpdb> 110 atoms in block 147 Block first atom: 15809 Blocpdb> 119 atoms in block 148 Block first atom: 15919 Blocpdb> 98 atoms in block 149 Block first atom: 16038 Blocpdb> 131 atoms in block 150 Block first atom: 16136 Blocpdb> 104 atoms in block 151 Block first atom: 16267 Blocpdb> 93 atoms in block 152 Block first atom: 16371 Blocpdb> 99 atoms in block 153 Block first atom: 16464 Blocpdb> 109 atoms in block 154 Block first atom: 16563 Blocpdb> 110 atoms in block 155 Block first atom: 16672 Blocpdb> 82 atoms in block 156 Block first atom: 16782 Blocpdb> 126 atoms in block 157 Block first atom: 16864 Blocpdb> 107 atoms in block 158 Block first atom: 16990 Blocpdb> 120 atoms in block 159 Block first atom: 17097 Blocpdb> 126 atoms in block 160 Block first atom: 17217 Blocpdb> 113 atoms in block 161 Block first atom: 17343 Blocpdb> 134 atoms in block 162 Block first atom: 17456 Blocpdb> 110 atoms in block 163 Block first atom: 17590 Blocpdb> 113 atoms in block 164 Block first atom: 17700 Blocpdb> 112 atoms in block 165 Block first atom: 17813 Blocpdb> 102 atoms in block 166 Block first atom: 17925 Blocpdb> 105 atoms in block 167 Block first atom: 18027 Blocpdb> 121 atoms in block 168 Block first atom: 18132 Blocpdb> 104 atoms in block 169 Block first atom: 18253 Blocpdb> 111 atoms in block 170 Block first atom: 18357 Blocpdb> 101 atoms in block 171 Block first atom: 18468 Blocpdb> 109 atoms in block 172 Block first atom: 18569 Blocpdb> 113 atoms in block 173 Block first atom: 18678 Blocpdb> 34 atoms in block 174 Block first atom: 18790 Blocpdb> 174 blocks. Blocpdb> At most, 149 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 34 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10350286 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 56472 Prepmat> Matrix trace = 22753040.0001 Prepmat> Last element read: 56472 56472 321.1025 Prepmat> 15226 lines saved. Prepmat> 14254 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 18824 RTB> Total mass = 18824.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 18824 RTB> Number of blocks = 174 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 215103.4423 RTB> 32346 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1044 Diagstd> Nb of non-zero elements: 32346 Diagstd> Projected matrix trace = 215103.4423 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1044 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 215103.4423 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0003512 0.0007246 0.0009384 0.0018705 0.0020427 0.0021234 0.0036238 0.0057778 0.0069740 0.0086574 0.0091436 0.0109924 0.0120620 0.0126285 0.0130254 0.0159406 0.0168576 0.0238090 0.0255722 0.0267441 0.0303949 0.0336143 0.0349721 0.0394172 0.0409675 0.0459252 0.0521224 0.0529580 0.0570117 0.0653282 0.0662371 0.0734815 0.0771232 0.0825906 0.0882110 0.0929306 0.0967560 0.1009821 0.1091633 0.1196789 0.1267159 0.1415106 0.1622615 0.1636748 0.1833234 0.1916097 0.2046389 0.2195009 0.2256765 0.2467879 0.2554174 0.2693021 0.2733066 0.2899729 0.2971077 0.3123589 0.3388661 0.3555039 0.3896946 0.4195100 0.4275830 0.4482754 0.4490983 0.4679286 0.5025839 0.5210885 0.5266991 0.5932706 0.6001744 0.6193080 0.6393826 0.6789056 0.6994208 0.7131629 0.7221823 0.7898589 0.7908372 0.8235791 0.8741439 0.9484674 0.9542669 0.9597868 1.0235549 1.0635846 1.1971448 1.2286455 1.2427331 1.2536461 1.2588716 1.2816499 1.3694297 1.4188953 1.4892577 1.5638548 1.6048548 1.6425260 1.6999654 1.7210478 1.7967217 1.8755098 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034334 0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034341 0.0034342 2.0351501 2.9231851 3.3264370 4.6964521 4.9079719 5.0038972 6.5369538 8.2542009 9.0685330 10.1039254 10.3837140 11.3852470 11.9262790 12.2031202 12.3934227 13.7103344 14.0991666 16.7558262 17.3651823 17.7586267 18.9319546 19.9093566 20.3074929 21.5594632 21.9793504 23.2713151 24.7917585 24.9897130 25.9284971 27.7552725 27.9477002 29.4363653 30.1569745 31.2076103 32.2520062 33.1035499 33.7780236 34.5078158 35.8784370 37.5667880 38.6554555 40.8497903 43.7424406 43.9325331 46.4947839 47.5339612 49.1235120 50.8760544 51.5867858 53.9457454 54.8808112 56.3527567 56.7701907 58.4755028 59.1905273 60.6907141 63.2134286 64.7466781 67.7887262 70.3341818 71.0077066 72.7055767 72.7722769 74.2822513 76.9838393 78.3882586 78.8091364 83.6414755 84.1267319 85.4571934 86.8311746 89.4746412 90.8164586 91.7042903 92.2823647 96.5094923 96.5692444 98.5480296 101.5282116 105.7563564 106.0791958 106.3855539 109.8628499 111.9905322 118.8142773 120.3673148 121.0554104 121.5857724 121.8389098 122.9362544 127.0764725 129.3511984 132.5196267 135.7980360 137.5666459 139.1718530 141.5843749 142.4596065 145.5578685 148.7150589 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 18824 Rtb_to_modes> Number of blocs = 174 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.5124E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.2464E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.3836E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8705E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0427E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1234E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6238E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.7778E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.9740E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.6574E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.1436E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0992E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2062E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2628E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3025E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5941E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6858E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3809E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5572E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6744E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0395E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3614E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.4972E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.9417E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0967E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.5925E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.2122E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.2958E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.7012E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.5328E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.6237E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.3481E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.7123E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.2591E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.8211E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.2931E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.6756E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1010 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1092 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1197 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1623 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1637 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1833 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1916 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2046 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2195 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2257 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2468 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2554 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2693 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2733 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2900 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2971 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3124 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3389 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3555 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3897 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4195 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4276 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4483 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4491 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5026 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5211 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5933 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6002 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6193 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6394 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6789 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6994 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7132 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7222 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7899 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7908 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8236 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8741 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9485 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9543 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9598 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.024 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.064 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.197 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.229 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.243 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.254 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.259 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.282 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.369 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.489 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.564 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.605 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.643 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.700 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.721 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.797 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.876 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1044 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99993 1.00004 0.99997 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99996 0.99997 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00004 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00004 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 0.99996 0.99994 1.00002 0.99998 1.00005 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 0.99993 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 1.00002 1.00004 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99996 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00004 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 338832 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99993 1.00004 0.99997 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99996 0.99997 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00004 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00004 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 0.99996 0.99994 1.00002 0.99998 1.00005 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 0.99993 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99997 1.00002 1.00004 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99996 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00004 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021445272007688.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021445272007688.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607021445272007688.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607021445272007688.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1213 First residue number = 1 Last residue number = 386 Number of atoms found = 18824 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5124E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.2464E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.3836E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8705E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0427E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1234E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6238E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.7778E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.9740E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.6574E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.1436E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0992E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2062E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2628E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3025E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5941E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6858E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3809E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5572E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6744E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0395E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3614E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.4972E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9417E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.0967E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5925E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.2122E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.2958E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.7012E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.5328E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.6237E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.3481E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7123E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.2591E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.8211E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.2931E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.6756E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1010 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1092 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1197 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1623 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1637 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1833 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1916 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2046 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2195 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2257 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2468 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2554 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2693 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2733 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2900 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2971 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3124 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3389 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3555 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3897 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4195 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4276 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4483 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4491 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5026 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5211 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5933 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6002 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6193 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6394 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6789 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6994 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7132 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7222 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7899 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7908 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8236 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8741 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9485 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9543 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9598 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.024 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.064 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.197 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.229 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.243 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.254 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.259 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.282 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.419 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.489 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.564 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.605 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.643 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.700 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.721 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.797 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.876 Bfactors> 106 vectors, 56472 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000351 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 7.971 +/- 28.24 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -7.971 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021445272007688.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021445272007688.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.035 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.923 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.326 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.696 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.908 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.004 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.537 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.254 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.068 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.7 Chkmod> 106 vectors, 56472 coordinates in file. Chkmod> That is: 18824 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 57 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 70 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6352 0.0034 0.7156 0.0034 0.9655 0.0034 0.6641 0.0034 0.9280 0.0034 0.7846 2.0351 0.0848 2.9231 0.0860 3.3263 0.0075 4.6963 0.1560 4.9077 0.0913 5.0037 0.0242 6.5367 0.0902 8.2539 0.1077 9.0681 0.4028 10.1035 0.1466 10.3833 0.2042 11.3845 0.0465 11.9258 0.0544 12.2024 0.2207 12.3927 0.1404 13.7099 0.0287 14.0987 0.1094 16.7551 0.1220 17.3644 0.3358 17.7578 0.2484 18.9312 0.2014 19.9084 0.2164 20.3066 0.2122 21.5585 0.1999 21.9783 0.1553 23.2703 0.2781 24.7906 0.2084 24.9886 0.2643 25.9274 0.2474 27.7540 0.0532 27.9465 0.6496 29.4350 0.1222 30.1556 0.1301 31.2064 0.0689 32.2506 0.0494 33.1022 0.1250 33.7766 0.2971 34.5094 0.3456 35.8829 0.1940 37.5685 0.1257 38.6514 0.1569 40.8465 0.3641 43.7458 0.2345 43.9340 0.0995 46.4898 0.1097 47.5307 0.1750 49.1167 0.0852 50.8738 0.3313 51.5873 0.3775 53.9448 0.1593 54.8766 0.2342 56.3501 0.1646 56.7671 0.1978 58.4757 0.1158 59.1872 0.1019 60.6921 0.1832 63.2139 0.1942 64.7435 0.2163 67.7863 0.1471 70.3303 0.2640 71.0061 0.1483 72.7045 0.0929 72.7693 0.1361 74.2768 0.0912 76.9818 0.1358 78.3858 0.1487 78.8058 0.1871 83.6400 0.2462 84.1249 0.1010 85.4530 0.0632 86.8286 0.2127 89.4704 0.1769 90.8112 0.2635 91.7027 0.2591 92.2795 0.0768 96.5079 0.2384 96.5628 0.0704 98.5450 0.0491 101.5213 0.2681 105.7536 0.0452 106.0765 0.2504 106.3817 0.0949 109.8820 0.3025 112.0076 0.2784 118.8020 0.0680 120.3795 0.2343 121.0632 0.1113 121.5977 0.1729 121.8399 0.1671 122.9478 0.0747 127.0511 0.1992 129.3504 0.1444 132.5025 0.0365 135.7985 0.1420 137.5670 0.0520 139.1860 0.1482 141.5797 0.0430 142.4515 0.1746 145.5629 0.0400 148.7281 0.0321 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021445272007688 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445272007688.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445272007688.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445272007688.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021445272007688 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445272007688.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445272007688.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445272007688.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021445272007688 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445272007688.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445272007688.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445272007688.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021445272007688 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445272007688.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445272007688.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445272007688.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021445272007688 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445272007688.eigenfacs 2607021445272007688.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445272007688.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445272007688.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445272007688.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2607021445272007688.10.pdb 2607021445272007688.11.pdb 2607021445272007688.7.pdb 2607021445272007688.8.pdb 2607021445272007688.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 2m42.704s user 2m41.718s sys 0m0.833s rm: cannot remove '2607021445272007688.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.