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***  Cluster3_zdock_7z1g_model10  ***

LOGs for ID: 2607021445462007839

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607021445462007839.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607021445462007839.atom to be opened. Openam> File opened: 2607021445462007839.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1211 First residue number = 1 Last residue number = 384 Number of atoms found = 18790 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 100.520004 +/- 26.548818 From: 25.315000 To: 166.965000 = 100.522998 +/- 16.365115 From: 55.303000 To: 162.145000 = 100.517743 +/- 42.287095 From: 13.527000 To: 193.660000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 31 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -1.8216 % Filled. Pdbmat> 10176649 non-zero elements. Pdbmat> 1118406 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 119.04 +/- 56.79 Maximum number = 253 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 2.236812E+07 Pdbmat> Larger element = 890.859 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1211 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607021445462007839.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607021445462007839.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607021445462007839.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 18790 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1211 residues. Blocpdb> 85 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 68 atoms in block 2 Block first atom: 86 Blocpdb> 89 atoms in block 3 Block first atom: 154 Blocpdb> 94 atoms in block 4 Block first atom: 243 Blocpdb> 103 atoms in block 5 Block first atom: 337 Blocpdb> 149 atoms in block 6 Block first atom: 440 Blocpdb> 105 atoms in block 7 Block first atom: 589 Blocpdb> 88 atoms in block 8 Block first atom: 694 Blocpdb> 91 atoms in block 9 Block first atom: 782 Blocpdb> 111 atoms in block 10 Block first atom: 873 Blocpdb> 92 atoms in block 11 Block first atom: 984 Blocpdb> 112 atoms in block 12 Block first atom: 1076 Blocpdb> 101 atoms in block 13 Block first atom: 1188 Blocpdb> 110 atoms in block 14 Block first atom: 1289 Blocpdb> 90 atoms in block 15 Block first atom: 1399 Blocpdb> 109 atoms in block 16 Block first atom: 1489 Blocpdb> 86 atoms in block 17 Block first atom: 1598 Blocpdb> 107 atoms in block 18 Block first atom: 1684 Blocpdb> 123 atoms in block 19 Block first atom: 1791 Blocpdb> 88 atoms in block 20 Block first atom: 1914 Blocpdb> 110 atoms in block 21 Block first atom: 2002 Blocpdb> 86 atoms in block 22 Block first atom: 2112 Blocpdb> 105 atoms in block 23 Block first atom: 2198 Blocpdb> 71 atoms in block 24 Block first atom: 2303 Blocpdb> 115 atoms in block 25 Block first atom: 2374 Blocpdb> 99 atoms in block 26 Block first atom: 2489 Blocpdb> 83 atoms in block 27 Block first atom: 2588 Blocpdb> 84 atoms in block 28 Block first atom: 2671 Blocpdb> 91 atoms in block 29 Block first atom: 2755 Blocpdb> 97 atoms in block 30 Block first atom: 2846 Blocpdb> 123 atoms in block 31 Block first atom: 2943 Blocpdb> 81 atoms in block 32 Block first atom: 3066 Blocpdb> 86 atoms in block 33 Block first atom: 3147 Blocpdb> 103 atoms in block 34 Block first atom: 3233 Blocpdb> 102 atoms in block 35 Block first atom: 3336 Blocpdb> 89 atoms in block 36 Block first atom: 3438 Blocpdb> 91 atoms in block 37 Block first atom: 3527 Blocpdb> 123 atoms in block 38 Block first atom: 3618 Blocpdb> 113 atoms in block 39 Block first atom: 3741 Blocpdb> 89 atoms in block 40 Block first atom: 3854 Blocpdb> 108 atoms in block 41 Block first atom: 3943 Blocpdb> 115 atoms in block 42 Block first atom: 4051 Blocpdb> 87 atoms in block 43 Block first atom: 4166 Blocpdb> 89 atoms in block 44 Block first atom: 4253 Blocpdb> 73 atoms in block 45 Block first atom: 4342 Blocpdb> 66 atoms in block 46 Block first atom: 4415 Blocpdb> 107 atoms in block 47 Block first atom: 4481 Blocpdb> 134 atoms in block 48 Block first atom: 4588 Blocpdb> 128 atoms in block 49 Block first atom: 4722 Blocpdb> 127 atoms in block 50 Block first atom: 4850 Blocpdb> 133 atoms in block 51 Block first atom: 4977 Blocpdb> 112 atoms in block 52 Block first atom: 5110 Blocpdb> 102 atoms in block 53 Block first atom: 5222 Blocpdb> 114 atoms in block 54 Block first atom: 5324 Blocpdb> 121 atoms in block 55 Block first atom: 5438 Blocpdb> 123 atoms in block 56 Block first atom: 5559 Blocpdb> 116 atoms in block 57 Block first atom: 5682 Blocpdb> 97 atoms in block 58 Block first atom: 5798 Blocpdb> 106 atoms in block 59 Block first atom: 5895 Blocpdb> 104 atoms in block 60 Block first atom: 6001 Blocpdb> 88 atoms in block 61 Block first atom: 6105 Blocpdb> 114 atoms in block 62 Block first atom: 6193 Blocpdb> 123 atoms in block 63 Block first atom: 6307 Blocpdb> 97 atoms in block 64 Block first atom: 6430 Blocpdb> 125 atoms in block 65 Block first atom: 6527 Blocpdb> 128 atoms in block 66 Block first atom: 6652 Blocpdb> 126 atoms in block 67 Block first atom: 6780 Blocpdb> 112 atoms in block 68 Block first atom: 6906 Blocpdb> 114 atoms in block 69 Block first atom: 7018 Blocpdb> 135 atoms in block 70 Block first atom: 7132 Blocpdb> 115 atoms in block 71 Block first atom: 7267 Blocpdb> 107 atoms in block 72 Block first atom: 7382 Blocpdb> 106 atoms in block 73 Block first atom: 7489 Blocpdb> 105 atoms in block 74 Block first atom: 7595 Blocpdb> 107 atoms in block 75 Block first atom: 7700 Blocpdb> 88 atoms in block 76 Block first atom: 7807 Blocpdb> 109 atoms in block 77 Block first atom: 7895 Blocpdb> 116 atoms in block 78 Block first atom: 8004 Blocpdb> 127 atoms in block 79 Block first atom: 8120 Blocpdb> 119 atoms in block 80 Block first atom: 8247 Blocpdb> 105 atoms in block 81 Block first atom: 8366 Blocpdb> 112 atoms in block 82 Block first atom: 8471 Blocpdb> 129 atoms in block 83 Block first atom: 8583 Blocpdb> 108 atoms in block 84 Block first atom: 8712 Blocpdb> 111 atoms in block 85 Block first atom: 8820 Blocpdb> 112 atoms in block 86 Block first atom: 8931 Blocpdb> 106 atoms in block 87 Block first atom: 9043 Blocpdb> 113 atoms in block 88 Block first atom: 9149 Blocpdb> 102 atoms in block 89 Block first atom: 9262 Blocpdb> 125 atoms in block 90 Block first atom: 9364 Blocpdb> 117 atoms in block 91 Block first atom: 9489 Blocpdb> 112 atoms in block 92 Block first atom: 9606 Blocpdb> 138 atoms in block 93 Block first atom: 9718 Blocpdb> 109 atoms in block 94 Block first atom: 9856 Blocpdb> 109 atoms in block 95 Block first atom: 9965 Blocpdb> 120 atoms in block 96 Block first atom: 10074 Blocpdb> 125 atoms in block 97 Block first atom: 10194 Blocpdb> 99 atoms in block 98 Block first atom: 10319 Blocpdb> 113 atoms in block 99 Block first atom: 10418 Blocpdb> 110 atoms in block 100 Block first atom: 10531 Blocpdb> 121 atoms in block 101 Block first atom: 10641 Blocpdb> 103 atoms in block 102 Block first atom: 10762 Blocpdb> 110 atoms in block 103 Block first atom: 10865 Blocpdb> 92 atoms in block 104 Block first atom: 10975 Blocpdb> 109 atoms in block 105 Block first atom: 11067 Blocpdb> 120 atoms in block 106 Block first atom: 11176 Blocpdb> 126 atoms in block 107 Block first atom: 11296 Blocpdb> 126 atoms in block 108 Block first atom: 11422 Blocpdb> 101 atoms in block 109 Block first atom: 11548 Blocpdb> 98 atoms in block 110 Block first atom: 11649 Blocpdb> 106 atoms in block 111 Block first atom: 11747 Blocpdb> 101 atoms in block 112 Block first atom: 11853 Blocpdb> 129 atoms in block 113 Block first atom: 11954 Blocpdb> 114 atoms in block 114 Block first atom: 12083 Blocpdb> 101 atoms in block 115 Block first atom: 12197 Blocpdb> 121 atoms in block 116 Block first atom: 12298 Blocpdb> 130 atoms in block 117 Block first atom: 12419 Blocpdb> 111 atoms in block 118 Block first atom: 12549 Blocpdb> 118 atoms in block 119 Block first atom: 12660 Blocpdb> 96 atoms in block 120 Block first atom: 12778 Blocpdb> 83 atoms in block 121 Block first atom: 12874 Blocpdb> 93 atoms in block 122 Block first atom: 12957 Blocpdb> 106 atoms in block 123 Block first atom: 13050 Blocpdb> 109 atoms in block 124 Block first atom: 13156 Blocpdb> 83 atoms in block 125 Block first atom: 13265 Blocpdb> 109 atoms in block 126 Block first atom: 13348 Blocpdb> 118 atoms in block 127 Block first atom: 13457 Blocpdb> 82 atoms in block 128 Block first atom: 13575 Blocpdb> 116 atoms in block 129 Block first atom: 13657 Blocpdb> 90 atoms in block 130 Block first atom: 13773 Blocpdb> 127 atoms in block 131 Block first atom: 13863 Blocpdb> 141 atoms in block 132 Block first atom: 13990 Blocpdb> 137 atoms in block 133 Block first atom: 14131 Blocpdb> 113 atoms in block 134 Block first atom: 14268 Blocpdb> 136 atoms in block 135 Block first atom: 14381 Blocpdb> 104 atoms in block 136 Block first atom: 14517 Blocpdb> 124 atoms in block 137 Block first atom: 14621 Blocpdb> 108 atoms in block 138 Block first atom: 14745 Blocpdb> 133 atoms in block 139 Block first atom: 14853 Blocpdb> 117 atoms in block 140 Block first atom: 14986 Blocpdb> 127 atoms in block 141 Block first atom: 15103 Blocpdb> 139 atoms in block 142 Block first atom: 15230 Blocpdb> 108 atoms in block 143 Block first atom: 15369 Blocpdb> 110 atoms in block 144 Block first atom: 15477 Blocpdb> 124 atoms in block 145 Block first atom: 15587 Blocpdb> 97 atoms in block 146 Block first atom: 15711 Blocpdb> 110 atoms in block 147 Block first atom: 15808 Blocpdb> 119 atoms in block 148 Block first atom: 15918 Blocpdb> 98 atoms in block 149 Block first atom: 16037 Blocpdb> 131 atoms in block 150 Block first atom: 16135 Blocpdb> 104 atoms in block 151 Block first atom: 16266 Blocpdb> 93 atoms in block 152 Block first atom: 16370 Blocpdb> 99 atoms in block 153 Block first atom: 16463 Blocpdb> 109 atoms in block 154 Block first atom: 16562 Blocpdb> 110 atoms in block 155 Block first atom: 16671 Blocpdb> 82 atoms in block 156 Block first atom: 16781 Blocpdb> 126 atoms in block 157 Block first atom: 16863 Blocpdb> 107 atoms in block 158 Block first atom: 16989 Blocpdb> 120 atoms in block 159 Block first atom: 17096 Blocpdb> 126 atoms in block 160 Block first atom: 17216 Blocpdb> 113 atoms in block 161 Block first atom: 17342 Blocpdb> 134 atoms in block 162 Block first atom: 17455 Blocpdb> 110 atoms in block 163 Block first atom: 17589 Blocpdb> 113 atoms in block 164 Block first atom: 17699 Blocpdb> 112 atoms in block 165 Block first atom: 17812 Blocpdb> 102 atoms in block 166 Block first atom: 17924 Blocpdb> 105 atoms in block 167 Block first atom: 18026 Blocpdb> 121 atoms in block 168 Block first atom: 18131 Blocpdb> 104 atoms in block 169 Block first atom: 18252 Blocpdb> 111 atoms in block 170 Block first atom: 18356 Blocpdb> 101 atoms in block 171 Block first atom: 18467 Blocpdb> 109 atoms in block 172 Block first atom: 18568 Blocpdb> 114 atoms in block 173 Block first atom: 18676 Blocpdb> 173 blocks. Blocpdb> At most, 149 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 66 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10176822 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 56370 Prepmat> Matrix trace = 22368120.0001 Prepmat> Last element read: 56370 56370 77.9222 Prepmat> 15052 lines saved. Prepmat> 14113 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 18790 RTB> Total mass = 18790.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 18790 RTB> Number of blocks = 173 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 207227.7261 RTB> 31173 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1038 Diagstd> Nb of non-zero elements: 31173 Diagstd> Projected matrix trace = 207227.7261 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1038 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 207227.7261 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0002927 0.0003282 0.0005712 0.0009177 0.0013580 0.0019504 0.0024543 0.0028861 0.0045083 0.0061863 0.0064329 0.0078158 0.0092056 0.0105459 0.0108285 0.0118842 0.0121274 0.0134925 0.0144127 0.0192677 0.0235175 0.0283165 0.0311349 0.0365359 0.0371688 0.0400492 0.0425312 0.0439595 0.0486370 0.0653946 0.0702879 0.0743552 0.0780667 0.0835551 0.0876788 0.0926229 0.0945379 0.0978525 0.1079219 0.1129723 0.1149102 0.1258499 0.1530812 0.1586036 0.1723401 0.1813848 0.1990096 0.2049184 0.2258784 0.2404856 0.2463785 0.2692162 0.2873848 0.3029181 0.3067456 0.3229769 0.3409266 0.3537301 0.3695918 0.4015030 0.4142224 0.4185248 0.4446402 0.4778747 0.5265868 0.5486382 0.5641459 0.5928527 0.6103887 0.6605397 0.6635017 0.7052278 0.7276541 0.7387016 0.7604015 0.7622547 0.8106049 0.8393792 0.8605991 0.8850751 0.9249300 0.9751571 0.9878517 1.0078139 1.0179881 1.0967868 1.1055867 1.1594126 1.1658327 1.1903016 1.2177890 1.2919094 1.4098665 1.4776420 1.5010038 1.5316904 1.5660063 1.6610775 1.6659632 1.7131706 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034337 0.0034338 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034349 1.8579534 1.9673544 2.5952432 3.2896574 4.0017641 4.7957171 5.3796917 5.8337963 7.2912495 8.5410741 8.7096350 9.6002259 10.4188854 11.1516009 11.3000216 11.8380688 11.9585532 12.6136584 13.0367066 15.0733746 16.6529554 18.2732306 19.1610431 20.7565493 20.9355554 21.7316354 22.3949014 22.7678189 23.9485128 27.7693752 28.7895954 29.6108510 30.3408769 31.3893115 32.1545581 33.0487152 33.3886102 33.9688859 35.6738625 36.4990231 36.8107384 38.5231410 42.4870141 43.2465820 45.0804664 46.2482894 48.4431401 49.1570401 51.6098566 53.2524801 53.9009845 56.3437658 58.2139669 59.7665052 60.1429149 61.7136149 63.4053194 64.5849401 66.0171039 68.8081178 69.8895179 70.2515411 72.4101812 75.0675616 78.8007350 80.4337483 81.5625904 83.6120155 84.8395833 88.2561051 88.4537628 91.1926849 92.6313017 93.3318365 94.6927546 94.8080794 97.7687126 99.4888447 100.7385552 102.1610464 104.4358768 107.2340146 107.9297473 109.0147993 109.5636861 113.7251153 114.1804301 116.9268587 117.2501465 118.4742030 119.8343443 123.4273235 128.9389947 132.0018142 133.0412066 134.3942775 135.8914179 139.9555841 140.1612559 142.1332171 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 18790 Rtb_to_modes> Number of blocs = 173 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.9274E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2823E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.7117E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.1772E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3580E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9504E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4543E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8861E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.5083E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.1863E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.4329E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.8158E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.2056E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0546E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0828E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1884E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2127E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3492E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4413E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9268E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3518E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8317E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1135E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6536E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7169E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0049E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.2531E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.3959E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.8637E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.5395E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.0288E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.4355E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.8067E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.3555E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.7679E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.2623E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.4538E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.7853E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1079 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1130 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1149 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1258 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1531 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1586 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1723 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1814 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1990 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2049 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2259 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2405 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2692 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2874 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3029 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3230 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3409 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3537 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3696 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4015 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4142 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4185 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4446 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4779 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5266 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5486 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5641 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5929 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6605 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6635 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7052 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7277 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7387 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7604 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7623 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8106 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8394 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8606 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8851 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9249 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9752 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9879 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.008 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.018 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.097 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.106 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.166 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.190 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.218 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.292 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.410 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.478 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.501 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.532 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.566 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.661 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.666 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.713 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1038 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00004 0.99998 0.99997 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00004 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00003 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00002 1.00003 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99994 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99995 1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00004 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999 1.00005 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99995 1.00001 1.00000 0.99999 1.00004 0.99998 1.00002 0.99996 1.00002 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 338220 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00004 0.99998 0.99997 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00004 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00003 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00002 1.00003 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99994 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99995 1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00004 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999 1.00005 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99995 1.00001 1.00000 0.99999 1.00004 0.99998 1.00002 0.99996 1.00002 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021445462007839.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021445462007839.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607021445462007839.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607021445462007839.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1211 First residue number = 1 Last residue number = 384 Number of atoms found = 18790 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9274E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2823E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.7117E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.1772E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3580E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9504E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4543E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8861E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5083E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.1863E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.8158E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.2056E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0546E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0828E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1884E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2127E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3492E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4413E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9268E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3518E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8317E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1135E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6536E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7169E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.0049E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.2531E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.3959E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.8637E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.5395E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.0288E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.4355E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.8067E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.3555E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.7679E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.2623E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.4538E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.7853E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1079 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1130 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1149 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1258 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1531 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1586 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1723 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1814 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1990 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2049 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2259 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2405 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2692 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2874 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3029 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3230 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3409 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3537 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3696 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4015 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4142 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4185 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4446 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4779 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5266 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5486 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5641 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5929 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6605 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6635 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7052 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7277 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7387 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7604 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7623 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8106 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8394 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8606 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8851 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9249 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9752 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9879 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.008 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.018 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.097 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.106 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.166 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.190 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.218 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.292 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.410 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.478 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.501 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.566 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.661 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.666 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.713 Bfactors> 106 vectors, 56370 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000293 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 11.918 +/- 34.61 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -11.918 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021445462007839.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021445462007839.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.858 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.967 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.595 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.290 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.002 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.796 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.379 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.834 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.541 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.709 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.600 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.1 Chkmod> 106 vectors, 56370 coordinates in file. Chkmod> That is: 18790 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 72 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7360 0.0034 0.9356 0.0034 0.7641 0.0034 0.8046 0.0034 0.9078 0.0034 0.5662 1.8579 0.1651 1.9673 0.0770 2.5951 0.5883 3.2895 0.0079 4.0015 0.2647 4.7956 0.0096 5.3795 0.1881 5.8335 0.1915 7.2909 0.2239 8.5407 0.4332 8.7092 0.3863 9.5998 0.1251 10.4184 0.1766 11.1512 0.1127 11.2993 0.0499 11.8374 0.0547 11.9579 0.1519 12.6129 0.0300 13.0363 0.0702 15.0728 0.5412 16.6524 0.1278 18.2726 0.3107 19.1602 0.1056 20.7557 0.0703 20.9347 0.1968 21.7306 0.1279 22.3939 0.1051 22.7667 0.3794 23.9475 0.0840 27.7683 0.0690 28.7884 0.2641 29.6095 0.1395 30.3396 0.2916 31.3879 0.0883 32.1532 0.0724 33.0473 0.1629 33.3872 0.1619 33.9675 0.1674 35.6687 0.2705 36.5019 0.0975 36.8075 0.1119 38.5139 0.1643 42.4878 0.1240 43.2442 0.1347 45.0733 0.0473 46.2482 0.3636 48.4399 0.0597 49.1527 0.1174 51.6101 0.0637 53.2518 0.0788 53.9010 0.1771 56.3397 0.1240 58.2130 0.0963 59.7622 0.0591 60.1359 0.1552 61.7132 0.0462 63.4001 0.2397 64.5794 0.1638 66.0150 0.1138 68.8049 0.1501 69.8846 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for DQ=-60 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445462007839.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445462007839.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445462007839.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021445462007839 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445462007839.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445462007839.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445462007839.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021445462007839 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021445462007839.eigenfacs 2607021445462007839.atom making animated gifs 11 models are in 2607021445462007839.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445462007839.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021445462007839.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted 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