*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607021803312099038.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607021803312099038.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607021803312099038.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 573
First residue number = 77
Last residue number = 649
Number of atoms found = 8477
Mean number per residue = 14.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 86.694911 +/- 10.984203 From: 59.750000 To: 114.770000
= 87.693457 +/- 17.278963 From: 47.770000 To: 128.000000
= 44.255011 +/- 11.335230 From: 17.390000 To: 72.160000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'HISD' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISH' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISD' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 11 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.9924 % Filled.
Pdbmat> 6442931 non-zero elements.
Pdbmat> 711258 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 167.81 +/- 48.11
Maximum number = 251
Minimum number = 21
Pdbmat> Matrix trace = 1.422516E+07
Pdbmat> Larger element = 903.780
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
573 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607021803312099038.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607021803312099038.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607021803312099038.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 8477 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 573 residues.
Blocpdb> 43 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 34 atoms in block 2
Block first atom: 44
Blocpdb> 55 atoms in block 3
Block first atom: 78
Blocpdb> 59 atoms in block 4
Block first atom: 133
Blocpdb> 30 atoms in block 5
Block first atom: 192
Blocpdb> 31 atoms in block 6
Block first atom: 222
Blocpdb> 37 atoms in block 7
Block first atom: 253
Blocpdb> 43 atoms in block 8
Block first atom: 290
Blocpdb> 54 atoms in block 9
Block first atom: 333
Blocpdb> 29 atoms in block 10
Block first atom: 387
Blocpdb> 57 atoms in block 11
Block first atom: 416
Blocpdb> 51 atoms in block 12
Block first atom: 473
Blocpdb> 44 atoms in block 13
Block first atom: 524
Blocpdb> 33 atoms in block 14
Block first atom: 568
Blocpdb> 39 atoms in block 15
Block first atom: 601
Blocpdb> 52 atoms in block 16
Block first atom: 640
Blocpdb> 55 atoms in block 17
Block first atom: 692
Blocpdb> 39 atoms in block 18
Block first atom: 747
Blocpdb> 57 atoms in block 19
Block first atom: 786
Blocpdb> 55 atoms in block 20
Block first atom: 843
Blocpdb> 45 atoms in block 21
Block first atom: 898
Blocpdb> 57 atoms in block 22
Block first atom: 943
Blocpdb> 46 atoms in block 23
Block first atom: 1000
Blocpdb> 51 atoms in block 24
Block first atom: 1046
Blocpdb> 46 atoms in block 25
Block first atom: 1097
Blocpdb> 56 atoms in block 26
Block first atom: 1143
Blocpdb> 57 atoms in block 27
Block first atom: 1199
Blocpdb> 41 atoms in block 28
Block first atom: 1256
Blocpdb> 62 atoms in block 29
Block first atom: 1297
Blocpdb> 25 atoms in block 30
Block first atom: 1359
Blocpdb> 35 atoms in block 31
Block first atom: 1384
Blocpdb> 38 atoms in block 32
Block first atom: 1419
Blocpdb> 57 atoms in block 33
Block first atom: 1457
Blocpdb> 41 atoms in block 34
Block first atom: 1514
Blocpdb> 29 atoms in block 35
Block first atom: 1555
Blocpdb> 43 atoms in block 36
Block first atom: 1584
Blocpdb> 47 atoms in block 37
Block first atom: 1627
Blocpdb> 46 atoms in block 38
Block first atom: 1674
Blocpdb> 37 atoms in block 39
Block first atom: 1720
Blocpdb> 47 atoms in block 40
Block first atom: 1757
Blocpdb> 55 atoms in block 41
Block first atom: 1804
Blocpdb> 43 atoms in block 42
Block first atom: 1859
Blocpdb> 43 atoms in block 43
Block first atom: 1902
Blocpdb> 42 atoms in block 44
Block first atom: 1945
Blocpdb> 28 atoms in block 45
Block first atom: 1987
Blocpdb> 49 atoms in block 46
Block first atom: 2015
Blocpdb> 25 atoms in block 47
Block first atom: 2064
Blocpdb> 38 atoms in block 48
Block first atom: 2089
Blocpdb> 55 atoms in block 49
Block first atom: 2127
Blocpdb> 52 atoms in block 50
Block first atom: 2182
Blocpdb> 49 atoms in block 51
Block first atom: 2234
Blocpdb> 58 atoms in block 52
Block first atom: 2283
Blocpdb> 41 atoms in block 53
Block first atom: 2341
Blocpdb> 62 atoms in block 54
Block first atom: 2382
Blocpdb> 35 atoms in block 55
Block first atom: 2444
Blocpdb> 38 atoms in block 56
Block first atom: 2479
Blocpdb> 47 atoms in block 57
Block first atom: 2517
Blocpdb> 37 atoms in block 58
Block first atom: 2564
Blocpdb> 46 atoms in block 59
Block first atom: 2601
Blocpdb> 52 atoms in block 60
Block first atom: 2647
Blocpdb> 39 atoms in block 61
Block first atom: 2699
Blocpdb> 35 atoms in block 62
Block first atom: 2738
Blocpdb> 51 atoms in block 63
Block first atom: 2773
Blocpdb> 50 atoms in block 64
Block first atom: 2824
Blocpdb> 41 atoms in block 65
Block first atom: 2874
Blocpdb> 48 atoms in block 66
Block first atom: 2915
Blocpdb> 50 atoms in block 67
Block first atom: 2963
Blocpdb> 62 atoms in block 68
Block first atom: 3013
Blocpdb> 55 atoms in block 69
Block first atom: 3075
Blocpdb> 42 atoms in block 70
Block first atom: 3130
Blocpdb> 62 atoms in block 71
Block first atom: 3172
Blocpdb> 52 atoms in block 72
Block first atom: 3234
Blocpdb> 40 atoms in block 73
Block first atom: 3286
Blocpdb> 36 atoms in block 74
Block first atom: 3326
Blocpdb> 52 atoms in block 75
Block first atom: 3362
Blocpdb> 45 atoms in block 76
Block first atom: 3414
Blocpdb> 37 atoms in block 77
Block first atom: 3459
Blocpdb> 39 atoms in block 78
Block first atom: 3496
Blocpdb> 46 atoms in block 79
Block first atom: 3535
Blocpdb> 38 atoms in block 80
Block first atom: 3581
Blocpdb> 45 atoms in block 81
Block first atom: 3619
Blocpdb> 33 atoms in block 82
Block first atom: 3664
Blocpdb> 36 atoms in block 83
Block first atom: 3697
Blocpdb> 54 atoms in block 84
Block first atom: 3733
Blocpdb> 44 atoms in block 85
Block first atom: 3787
Blocpdb> 31 atoms in block 86
Block first atom: 3831
Blocpdb> 38 atoms in block 87
Block first atom: 3862
Blocpdb> 47 atoms in block 88
Block first atom: 3900
Blocpdb> 27 atoms in block 89
Block first atom: 3947
Blocpdb> 47 atoms in block 90
Block first atom: 3974
Blocpdb> 53 atoms in block 91
Block first atom: 4021
Blocpdb> 58 atoms in block 92
Block first atom: 4074
Blocpdb> 34 atoms in block 93
Block first atom: 4132
Blocpdb> 32 atoms in block 94
Block first atom: 4166
Blocpdb> 44 atoms in block 95
Block first atom: 4198
Blocpdb> 57 atoms in block 96
Block first atom: 4242
Blocpdb> 40 atoms in block 97
Block first atom: 4299
Blocpdb> 43 atoms in block 98
Block first atom: 4339
Blocpdb> 43 atoms in block 99
Block first atom: 4382
Blocpdb> 30 atoms in block 100
Block first atom: 4425
Blocpdb> 50 atoms in block 101
Block first atom: 4455
Blocpdb> 46 atoms in block 102
Block first atom: 4505
Blocpdb> 35 atoms in block 103
Block first atom: 4551
Blocpdb> 43 atoms in block 104
Block first atom: 4586
Blocpdb> 40 atoms in block 105
Block first atom: 4629
Blocpdb> 59 atoms in block 106
Block first atom: 4669
Blocpdb> 40 atoms in block 107
Block first atom: 4728
Blocpdb> 48 atoms in block 108
Block first atom: 4768
Blocpdb> 40 atoms in block 109
Block first atom: 4816
Blocpdb> 54 atoms in block 110
Block first atom: 4856
Blocpdb> 44 atoms in block 111
Block first atom: 4910
Blocpdb> 60 atoms in block 112
Block first atom: 4954
Blocpdb> 56 atoms in block 113
Block first atom: 5014
Blocpdb> 40 atoms in block 114
Block first atom: 5070
Blocpdb> 59 atoms in block 115
Block first atom: 5110
Blocpdb> 38 atoms in block 116
Block first atom: 5169
Blocpdb> 33 atoms in block 117
Block first atom: 5207
Blocpdb> 39 atoms in block 118
Block first atom: 5240
Blocpdb> 30 atoms in block 119
Block first atom: 5279
Blocpdb> 41 atoms in block 120
Block first atom: 5309
Blocpdb> 60 atoms in block 121
Block first atom: 5350
Blocpdb> 31 atoms in block 122
Block first atom: 5410
Blocpdb> 46 atoms in block 123
Block first atom: 5441
Blocpdb> 45 atoms in block 124
Block first atom: 5487
Blocpdb> 57 atoms in block 125
Block first atom: 5532
Blocpdb> 50 atoms in block 126
Block first atom: 5589
Blocpdb> 34 atoms in block 127
Block first atom: 5639
Blocpdb> 45 atoms in block 128
Block first atom: 5673
Blocpdb> 35 atoms in block 129
Block first atom: 5718
Blocpdb> 46 atoms in block 130
Block first atom: 5753
Blocpdb> 60 atoms in block 131
Block first atom: 5799
Blocpdb> 52 atoms in block 132
Block first atom: 5859
Blocpdb> 45 atoms in block 133
Block first atom: 5911
Blocpdb> 48 atoms in block 134
Block first atom: 5956
Blocpdb> 49 atoms in block 135
Block first atom: 6004
Blocpdb> 40 atoms in block 136
Block first atom: 6053
Blocpdb> 53 atoms in block 137
Block first atom: 6093
Blocpdb> 40 atoms in block 138
Block first atom: 6146
Blocpdb> 55 atoms in block 139
Block first atom: 6186
Blocpdb> 32 atoms in block 140
Block first atom: 6241
Blocpdb> 34 atoms in block 141
Block first atom: 6273
Blocpdb> 52 atoms in block 142
Block first atom: 6307
Blocpdb> 36 atoms in block 143
Block first atom: 6359
Blocpdb> 44 atoms in block 144
Block first atom: 6395
Blocpdb> 55 atoms in block 145
Block first atom: 6439
Blocpdb> 32 atoms in block 146
Block first atom: 6494
Blocpdb> 54 atoms in block 147
Block first atom: 6526
Blocpdb> 46 atoms in block 148
Block first atom: 6580
Blocpdb> 29 atoms in block 149
Block first atom: 6626
Blocpdb> 43 atoms in block 150
Block first atom: 6655
Blocpdb> 65 atoms in block 151
Block first atom: 6698
Blocpdb> 43 atoms in block 152
Block first atom: 6763
Blocpdb> 58 atoms in block 153
Block first atom: 6806
Blocpdb> 38 atoms in block 154
Block first atom: 6864
Blocpdb> 46 atoms in block 155
Block first atom: 6902
Blocpdb> 40 atoms in block 156
Block first atom: 6948
Blocpdb> 55 atoms in block 157
Block first atom: 6988
Blocpdb> 34 atoms in block 158
Block first atom: 7043
Blocpdb> 53 atoms in block 159
Block first atom: 7077
Blocpdb> 25 atoms in block 160
Block first atom: 7130
Blocpdb> 43 atoms in block 161
Block first atom: 7155
Blocpdb> 41 atoms in block 162
Block first atom: 7198
Blocpdb> 46 atoms in block 163
Block first atom: 7239
Blocpdb> 64 atoms in block 164
Block first atom: 7285
Blocpdb> 54 atoms in block 165
Block first atom: 7349
Blocpdb> 39 atoms in block 166
Block first atom: 7403
Blocpdb> 43 atoms in block 167
Block first atom: 7442
Blocpdb> 35 atoms in block 168
Block first atom: 7485
Blocpdb> 50 atoms in block 169
Block first atom: 7520
Blocpdb> 31 atoms in block 170
Block first atom: 7570
Blocpdb> 30 atoms in block 171
Block first atom: 7601
Blocpdb> 38 atoms in block 172
Block first atom: 7631
Blocpdb> 42 atoms in block 173
Block first atom: 7669
Blocpdb> 60 atoms in block 174
Block first atom: 7711
Blocpdb> 40 atoms in block 175
Block first atom: 7771
Blocpdb> 38 atoms in block 176
Block first atom: 7811
Blocpdb> 59 atoms in block 177
Block first atom: 7849
Blocpdb> 38 atoms in block 178
Block first atom: 7908
Blocpdb> 43 atoms in block 179
Block first atom: 7946
Blocpdb> 55 atoms in block 180
Block first atom: 7989
Blocpdb> 28 atoms in block 181
Block first atom: 8044
Blocpdb> 38 atoms in block 182
Block first atom: 8072
Blocpdb> 40 atoms in block 183
Block first atom: 8110
Blocpdb> 52 atoms in block 184
Block first atom: 8150
Blocpdb> 49 atoms in block 185
Block first atom: 8202
Blocpdb> 30 atoms in block 186
Block first atom: 8251
Blocpdb> 52 atoms in block 187
Block first atom: 8281
Blocpdb> 39 atoms in block 188
Block first atom: 8333
Blocpdb> 40 atoms in block 189
Block first atom: 8372
Blocpdb> 31 atoms in block 190
Block first atom: 8412
Blocpdb> 35 atoms in block 191
Block first atom: 8442
Blocpdb> 191 blocks.
Blocpdb> At most, 65 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 25 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 6443122 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 25431
Prepmat> Matrix trace = 14225160.0000
Prepmat> Last element read: 25431 25431 87.9873
Prepmat> 18337 lines saved.
Prepmat> 15888 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8477
RTB> Total mass = 8477.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 8477
RTB> Number of blocks = 191
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 518811.8094
RTB> 85263 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1146
Diagstd> Nb of non-zero elements: 85263
Diagstd> Projected matrix trace = 518811.8094
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1146 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 518811.8094
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.5255029 0.9412518 3.3051792 7.2518128
8.1920124 9.7336511 9.9596385 15.1653685 17.1376789
19.2705073 20.0260170 21.2638338 22.4441138 23.2941389
25.3735458 26.4464987 29.1070518 30.0669886 30.8556269
31.4363031 32.4082739 34.4900994 36.4828854 36.5733953
37.9714479 38.7647314 39.1270056 40.8076804 42.2477037
42.6905446 43.3561527 44.8445854 45.8868019 48.3644737
50.1442860 51.6222982 52.4014112 52.6923835 54.3026160
54.5487081 56.5877604 57.6253456 58.4710233 59.3910447
60.1192194 61.6056204 63.9262619 64.2862443 65.5193095
66.0741829 67.7654216 68.7661221 70.0060863 71.5201816
72.5845380 73.7940097 75.1011692 75.6748390 76.5063150
77.4055468 78.5719903 78.9965302 80.3708186 80.7952495
82.5380272 83.4646022 85.3105147 85.5869802 87.3356739
88.3237405 89.7423607 91.0346596 91.3502308 92.9230845
93.9622963 94.9504970 96.0674773 97.1225196 97.2230219
98.0562067 100.7271790 101.5506035 103.5097836 104.7281405
105.6296877 106.2314115 106.8270790 107.6640251 109.5506293
109.8890020 110.4047602 111.0820869 112.1486139 112.4289784
113.5578561 116.4666385 117.1320266 118.4096285 119.9931864
120.2045280
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034324 0.0034326 0.0034332 0.0034336 0.0034343
0.0034370 78.7195898 105.3533125 197.4207446 292.4277434
310.8068500 338.7920170 342.7023389 422.8844968 449.5430436
476.6963797 485.9511014 500.7443582 514.4539567 524.1053719
546.9981542 558.4436690 585.8607314 595.4430725 603.2015761
608.8509860 618.1917863 637.7383052 655.9033817 656.7164880
669.1505806 676.1042564 679.2561618 693.6912794 705.8246713
709.5142594 715.0240489 727.1939998 735.5956890 755.1939693
768.9639966 780.2143751 786.0800455 788.2594799 800.2130988
802.0242783 816.8767464 824.3317964 830.3584845 836.8656893
841.9803321 852.3254335 868.2302945 870.6714572 878.9819079
882.6960453 893.9214380 900.4975746 908.5800147 918.3528637
925.1610462 932.8371529 941.0628501 944.6502268 949.8257129
955.3913869 962.5629858 965.1599411 973.5190990 976.0862464
986.5573182 992.0794285 1002.9899038 1004.6137821 1014.8249081
1020.5493413 1028.7125188 1036.0928259 1037.8870775 1046.7840314
1052.6211482 1058.1418746 1064.3475713 1070.1761071 1070.7296722
1075.3078707 1089.8547362 1094.3003409 1104.8058894 1111.2889000
1116.0618886 1119.2362204 1122.3697600 1126.7578340 1136.5870897
1138.3410437 1141.0092878 1144.5039486 1149.9851582 1151.4217066
1157.1878700 1171.9148319 1175.2577100 1181.6498103 1189.5249982
1190.5720809
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8477
Rtb_to_modes> Number of blocs = 191
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9909E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9920E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9956E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0017E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5255
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9413
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.305
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.252
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.192
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.734
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.960
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.07
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.2
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
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0.99999 1.00000 0.99999 1.00006 1.00000
1.00002 0.99997 1.00002 0.99999 1.00002
0.99997 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999
1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999
1.00003 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000
1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003
1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999
0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999
1.00002 1.00002 0.99995 1.00002 1.00001
0.99995 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 152586 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 1.00003 0.99997 0.99999
0.99999 1.00000 0.99999 1.00006 1.00000
1.00002 0.99997 1.00002 0.99999 1.00002
0.99997 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999
1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999
1.00003 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000
1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003
1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000
0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999
0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999
1.00002 1.00002 0.99995 1.00002 1.00001
0.99995 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607021803312099038.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607021803312099038.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607021803312099038.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607021803312099038.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 573
First residue number = 77
Last residue number = 649
Number of atoms found = 8477
Mean number per residue = 14.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9909E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9920E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9956E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0017E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5255
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9413
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.305
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.252
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.192
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.734
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.960
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.86
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.2
Bfactors> 106 vectors, 25431 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.525500
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.018 for 573 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.010 +/- 0.09
Bfactors> = 0.035 +/- 0.18
Bfactors> Shiftng-fct= 0.025
Bfactors> Scaling-fct= 1.943
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607021803312099038.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607021803312099038.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 962.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1064.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1070.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1111.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1119.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1122.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1127.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1137.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1141.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1157.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1175.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1182.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190.
Chkmod> 106 vectors, 25431 coordinates in file.
Chkmod> That is: 8477 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9059
0.0034 0.8208
0.0034 0.7594
0.0034 0.7576
0.0034 0.9631
0.0034 0.7866
78.7160 0.0048
105.3515 0.0047
197.4069 0.0042
292.4190 0.5815
310.7933 0.6033
338.7835 0.5762
342.6938 0.0151
422.9309 0.0201
449.5542 0.4292
476.6696 0.4417
485.9786 0.4678
500.6777 0.1844
514.3847 0.2760
524.0363 0.3358
546.9365 0.2130
558.4567 0.3150
585.8653 0.1189
595.4473 0.4955
603.2184 0.3945
608.8606 0.3351
618.1817 0.5094
637.7100 0.3153
655.8493 0.4933
656.6578 0.4216
669.1091 0.3100
676.0340 0.4601
679.2530 0.4415
693.6812 0.2133
705.8136 0.2275
709.4793 0.3194
715.0251 0.3893
727.1256 0.3753
735.5897 0.4031
755.1266 0.4812
768.8981 0.2798
780.1635 0.2136
786.0357 0.2016
788.2078 0.1736
800.1595 0.5756
801.9993 0.4514
816.8578 0.3530
824.3297 0.4174
830.3156 0.4130
836.8224 0.4029
841.9497 0.4019
852.3191 0.3554
868.2184 0.2861
870.6595 0.3116
878.9488 0.2461
882.6302 0.3365
893.9133 0.3413
900.4843 0.1813
908.5664 0.3647
918.3123 0.4644
925.0924 0.4047
932.7718 0.3335
941.0151 0.2544
944.5795 0.4362
949.8078 0.3384
955.3779 0.2016
962.5095 0.2533
965.1397 0.4276
973.4724 0.3244
976.0730 0.4637
986.5268 0.4499
992.0095 0.3720
1002.9438 0.3403
1004.5884 0.4336
1014.8065 0.3329
1020.4839 0.4168
1028.6548 0.2407
1036.0218 0.1082
1037.8412 0.3816
1046.7217 0.4479
1052.5631 0.2911
1058.0937 0.3942
1064.3159 0.4413
1070.1163 0.3387
1070.6671 0.3615
1075.2825 0.3130
1089.6609 0.3659
1094.5195 0.4088
1104.7063 0.3086
1111.0919 0.2259
1115.8571 0.3472
1119.0227 0.4383
1122.1793 0.3192
1126.8977 0.2411
1136.7944 0.3732
1138.3491 0.4048
1140.9357 0.3268
1144.5471 0.3863
1149.6865 0.4336
1151.2239 0.4407
1157.3529 0.4450
1172.0324 0.3118
1175.0466 0.3048
1181.5510 0.4633
1189.5077 0.3873
1190.4985 0.2961
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2607021803312099038.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607021803312099038.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2607021803312099038.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607021803312099038.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2607021803312099038.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2607021803312099038.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.9
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.6
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 962.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1064.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1070.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1111.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1119.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1122.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1127.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1137.
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1141.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1157.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1175.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1182.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190.
Projmod> 106 vectors, 25431 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 573
First residue number = 77
Last residue number = 649
Number of atoms found = 8477
Mean number per residue = 14.8
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 573
First residue number = 77
Last residue number = 649
Number of atoms found = 8477
Mean number per residue = 14.8
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 8477 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 33.48
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.235 Sum= 0.055 q= -724.9709
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.013 Sum= 0.055 q= -39.9321
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.010 Sum= 0.056 q= 31.9040
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.143 Sum= 0.076 q= -441.2891
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.099 Sum= 0.086 q= -306.3930
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.034 Sum= 0.087 q= -104.0914
Vector: 7 F= 78.72 Cos= 0.043 Sum= 0.089 q= 133.4795
Vector: 8 F= 105.35 Cos= 0.044 Sum= 0.091 q= 135.6530
Vector: 9 F= 197.41 Cos= 0.015 Sum= 0.091 q= 47.7696
Vector: 10 F= 292.42 Cos= -0.017 Sum= 0.091 q= -53.1962
Vector: 11 F= 310.79 Cos= -0.042 Sum= 0.093 q= -129.9029
Vector: 12 F= 338.78 Cos= 0.062 Sum= 0.097 q= 189.7659
Vector: 13 F= 342.69 Cos= 0.007 Sum= 0.097 q= 22.5548
%Projmod-Wn> Eigenvector 14 Norm= 1.0001
Vector: 14 F= 422.93 Cos= -0.133 Sum= 0.115 q= -411.0634
Vector: 15 F= 449.55 Cos= -0.085 Sum= 0.122 q= -260.5742
Vector: 16 F= 476.67 Cos= -0.020 Sum= 0.122 q= -61.0754
Vector: 17 F= 485.98 Cos= -0.089 Sum= 0.130 q= -274.7143
Vector: 18 F= 500.68 Cos= -0.013 Sum= 0.131 q= -41.4377
Vector: 19 F= 514.38 Cos= 0.186 Sum= 0.165 q= 571.8490
Vector: 20 F= 524.04 Cos= 0.128 Sum= 0.181 q= 394.0202
Vector: 21 F= 546.94 Cos= 0.122 Sum= 0.196 q= 375.9868
Vector: 22 F= 558.46 Cos= 0.018 Sum= 0.196 q= 54.3184
Vector: 23 F= 585.87 Cos= 0.054 Sum= 0.199 q= 167.1491
Vector: 24 F= 595.45 Cos= -0.013 Sum= 0.200 q= -38.9782
Vector: 25 F= 603.22 Cos= -0.116 Sum= 0.213 q= -357.7229
Vector: 26 F= 608.86 Cos= -0.101 Sum= 0.223 q= -311.3645
Vector: 27 F= 618.18 Cos= 0.107 Sum= 0.235 q= 330.3894
Vector: 28 F= 637.71 Cos= -0.012 Sum= 0.235 q= -36.9094
Vector: 29 F= 655.85 Cos= 0.068 Sum= 0.239 q= 208.3159
Vector: 30 F= 656.66 Cos= 0.010 Sum= 0.240 q= 31.5350
Vector: 31 F= 669.11 Cos= -0.128 Sum= 0.256 q= -395.6759
Vector: 32 F= 676.03 Cos= 0.043 Sum= 0.258 q= 133.4796
Vector: 33 F= 679.25 Cos= 0.078 Sum= 0.264 q= 241.2971
Vector: 34 F= 693.68 Cos= 0.087 Sum= 0.272 q= 266.7746
Vector: 35 F= 705.81 Cos= -0.061 Sum= 0.275 q= -187.3479
Vector: 36 F= 709.48 Cos= -0.090 Sum= 0.283 q= -278.0465
Vector: 37 F= 715.03 Cos= -0.029 Sum= 0.284 q= -89.1704
Vector: 38 F= 727.13 Cos= -0.071 Sum= 0.289 q= -219.2096
Vector: 39 F= 735.59 Cos= 0.016 Sum= 0.289 q= 48.8684
Vector: 40 F= 755.13 Cos= 0.141 Sum= 0.309 q= 434.4564
Vector: 41 F= 768.90 Cos= 0.077 Sum= 0.315 q= 235.8134
Vector: 42 F= 780.16 Cos= 0.033 Sum= 0.316 q= 101.4789
Vector: 43 F= 786.04 Cos= 0.140 Sum= 0.336 q= 431.1756
Vector: 44 F= 788.21 Cos= -0.015 Sum= 0.336 q= -47.4274
Vector: 45 F= 800.16 Cos= -0.010 Sum= 0.336 q= -30.2719
Vector: 46 F= 802.00 Cos= -0.011 Sum= 0.336 q= -34.4561
Vector: 47 F= 816.86 Cos= -0.056 Sum= 0.339 q= -172.6731
Vector: 48 F= 824.33 Cos= -0.004 Sum= 0.339 q= -11.4966
Vector: 49 F= 830.32 Cos= -0.006 Sum= 0.339 q= -18.7190
Vector: 50 F= 836.82 Cos= -0.066 Sum= 0.344 q= -202.1474
Vector: 51 F= 841.95 Cos= -0.060 Sum= 0.347 q= -183.5686
Vector: 52 F= 852.32 Cos= -0.082 Sum= 0.354 q= -253.8336
Vector: 53 F= 868.22 Cos= 0.083 Sum= 0.361 q= 254.7414
Vector: 54 F= 870.66 Cos= -0.007 Sum= 0.361 q= -20.8064
Vector: 55 F= 878.95 Cos= -0.025 Sum= 0.362 q= -76.0112
Vector: 56 F= 882.63 Cos= 0.218 Sum= 0.409 q= 673.3564
Vector: 57 F= 893.91 Cos= 0.011 Sum= 0.409 q= 35.2341
Vector: 58 F= 900.48 Cos= -0.104 Sum= 0.420 q= -319.3011
Vector: 59 F= 908.57 Cos= 0.161 Sum= 0.446 q= 495.8670
Vector: 60 F= 918.31 Cos= -0.054 Sum= 0.449 q= -166.6573
Vector: 61 F= 925.09 Cos= -0.114 Sum= 0.462 q= -349.9789
Vector: 62 F= 932.77 Cos= -0.019 Sum= 0.462 q= -59.3124
Vector: 63 F= 941.02 Cos= -0.208 Sum= 0.506 q= -642.5118
Vector: 64 F= 944.58 Cos= -0.214 Sum= 0.552 q= -660.7594
Vector: 65 F= 949.81 Cos= -0.174 Sum= 0.582 q= -536.9708
Vector: 66 F= 955.38 Cos= 0.069 Sum= 0.587 q= 211.1522
Vector: 67 F= 962.51 Cos= -0.108 Sum= 0.598 q= -333.3634
Vector: 68 F= 965.14 Cos= -0.216 Sum= 0.645 q= -665.7222
Vector: 69 F= 973.47 Cos= 0.127 Sum= 0.661 q= 391.4915
Vector: 70 F= 976.07 Cos= -0.189 Sum= 0.697 q= -583.3727
Vector: 71 F= 986.53 Cos= 0.204 Sum= 0.739 q= 628.4362
Vector: 72 F= 992.01 Cos= 0.079 Sum= 0.745 q= 244.0763
Vector: 73 F= 1002.94 Cos= -0.043 Sum= 0.747 q= -131.6974
Vector: 74 F= 1004.59 Cos= -0.020 Sum= 0.747 q= -60.4498
Vector: 75 F= 1014.81 Cos= 0.016 Sum= 0.747 q= 50.8541
Vector: 76 F= 1020.48 Cos= 0.033 Sum= 0.748 q= 102.5723
Vector: 77 F= 1028.65 Cos= -0.143 Sum= 0.769 q= -441.6196
Vector: 78 F= 1036.02 Cos= 0.064 Sum= 0.773 q= 197.1801
Vector: 79 F= 1037.84 Cos= 0.061 Sum= 0.777 q= 189.0561
Vector: 80 F= 1046.72 Cos= -0.090 Sum= 0.785 q= -277.0654
Vector: 81 F= 1052.56 Cos= 0.023 Sum= 0.785 q= 69.3736
Vector: 82 F= 1058.09 Cos= 0.038 Sum= 0.787 q= 116.2003
Vector: 83 F= 1064.32 Cos= -0.056 Sum= 0.790 q= -171.7682
Vector: 84 F= 1070.12 Cos= -0.017 Sum= 0.790 q= -51.4454
Vector: 85 F= 1070.67 Cos= 0.024 Sum= 0.791 q= 72.6344
Vector: 86 F= 1075.28 Cos= -0.041 Sum= 0.792 q= -126.8122
Vector: 87 F= 1089.66 Cos= -0.038 Sum= 0.794 q= -118.1880
Vector: 88 F= 1094.52 Cos= -0.141 Sum= 0.814 q= -434.3988
Vector: 89 F= 1104.71 Cos= 0.027 Sum= 0.814 q= 82.4265
Vector: 90 F= 1111.09 Cos= -0.022 Sum= 0.815 q= -66.6840
Vector: 91 F= 1115.86 Cos= -0.051 Sum= 0.818 q= -158.6056
Vector: 92 F= 1119.02 Cos= -0.168 Sum= 0.846 q= -517.9071
Vector: 93 F= 1122.18 Cos= 0.063 Sum= 0.850 q= 194.7957
Vector: 94 F= 1126.90 Cos= 0.055 Sum= 0.853 q= 169.2347
Vector: 95 F= 1136.79 Cos= 0.057 Sum= 0.856 q= 175.9082
Vector: 96 F= 1138.35 Cos= 0.072 Sum= 0.861 q= 221.7021
Vector: 97 F= 1140.94 Cos= -0.015 Sum= 0.861 q= -45.5405
Vector: 98 F= 1144.55 Cos= -0.042 Sum= 0.863 q= -129.3692
Vector: 99 F= 1149.69 Cos= 0.011 Sum= 0.863 q= 32.8110
Vector: 100 F= 1151.22 Cos= -0.062 Sum= 0.867 q= -190.2590
Vector: 101 F= 1157.35 Cos= 0.058 Sum= 0.870 q= 177.7726
Vector: 102 F= 1172.03 Cos= 0.006 Sum= 0.870 q= 17.5486
Vector: 103 F= 1175.05 Cos= 0.075 Sum= 0.876 q= 229.7400
Vector: 104 F= 1181.55 Cos= 0.021 Sum= 0.876 q= 64.0140
Vector: 105 F= 1189.51 Cos= 0.002 Sum= 0.876 q= 5.3187
Vector: 106 F= 1190.50 Cos= -0.040 Sum= 0.878 q= -124.3326
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003437
Projmod> Lowest non-zero frequency : 78.715996
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.24 for mode 1 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.055 0.150 0.281 0.381 0.456 0.878
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2607021803312099038 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
making animated gifs
11 models are in 2607021803312099038.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607021803312099038.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 573 2.462 543 1.106
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 573 2.295 543 1.106
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 573 2.138 543 1.106
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 573 1.995 543 1.106
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 573 1.869 543 1.106
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 573 1.762 543 1.105
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 573 1.679 543 1.105
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 573 1.624 543 1.105
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 573 1.600 543 1.105
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 573 1.607 543 1.105
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 573 1.646 542 1.098
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2607021803312099038 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
making animated gifs
11 models are in 2607021803312099038.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607021803312099038.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607021803312099038.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 573 2.104 543 1.114
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 573 1.992 543 1.112
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 573 1.898 543 1.110
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 573 1.827 543 1.109
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 573 1.781 543 1.107
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 573 1.762 543 1.105
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 573 1.770 543 1.104
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 573 1.806 543 1.102
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 573 1.868 543 1.101
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 573 1.952 543 1.099
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 573 2.057 543 1.097
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2607021803312099038 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
making animated gifs
11 models are in 2607021803312099038.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607021803312099038.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607021803312099038.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 573 1.899 543 1.089
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 573 1.841 543 1.092
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 573 1.797 543 1.095
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 573 1.769 543 1.099
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 573 1.757 543 1.102
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 573 1.762 543 1.105
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 573 1.784 543 1.109
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 573 1.822 543 1.113
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 573 1.875 544 1.123
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 573 1.941 544 1.120
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 573 2.021 544 1.124
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2607021803312099038 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
making animated gifs
11 models are in 2607021803312099038.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607021803312099038.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607021803312099038.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 573 2.310 506 1.543
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 573 2.170 520 1.469
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 573 2.042 533 1.392
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 573 1.930 536 1.275
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 573 1.836 541 1.187
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 573 1.762 543 1.105
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 573 1.712 545 1.055
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 573 1.687 546 1.030
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 573 1.689 547 1.043
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 573 1.717 546 1.079
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 573 1.771 545 1.149
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2607021803312099038 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607021803312099038.eigenfacs
2607021803312099038.atom
making animated gifs
11 models are in 2607021803312099038.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607021803312099038.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607021803312099038.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 573 2.090 533 1.380
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 573 1.982 537 1.283
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 573 1.892 540 1.203
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 573 1.824 541 1.138
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 573 1.780 543 1.111
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 573 1.762 543 1.105
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 573 1.770 544 1.144
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 573 1.805 545 1.214
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 573 1.864 544 1.300
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 573 1.946 541 1.401
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 573 2.047 535 1.507
2607021803312099038.10.pdb
2607021803312099038.11.pdb
2607021803312099038.7.pdb
2607021803312099038.8.pdb
2607021803312099038.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m50.669s
user 0m50.271s
sys 0m0.368s
rm: cannot remove '2607021803312099038.sdijf': No such file or directory
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