*** MD snap ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607022151012161870.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607022151012161870.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607022151012161870.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 573
First residue number = 77
Last residue number = 649
Number of atoms found = 8477
Mean number per residue = 14.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 82.291958 +/- 11.370583 From: 53.880000 To: 111.800000
= 89.728097 +/- 14.764773 From: 53.060000 To: 122.470000
= 37.776586 +/- 14.543899 From: -1.750000 To: 75.420000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'HISD' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISH' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISD' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HISE' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 11 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.9375 % Filled.
Pdbmat> 6265563 non-zero elements.
Pdbmat> 691688 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 163.19 +/- 47.41
Maximum number = 254
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 1.383376E+07
Pdbmat> Larger element = 893.007
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
573 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607022151012161870.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607022151012161870.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607022151012161870.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 8477 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 573 residues.
Blocpdb> 43 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 34 atoms in block 2
Block first atom: 44
Blocpdb> 55 atoms in block 3
Block first atom: 78
Blocpdb> 59 atoms in block 4
Block first atom: 133
Blocpdb> 30 atoms in block 5
Block first atom: 192
Blocpdb> 31 atoms in block 6
Block first atom: 222
Blocpdb> 37 atoms in block 7
Block first atom: 253
Blocpdb> 43 atoms in block 8
Block first atom: 290
Blocpdb> 54 atoms in block 9
Block first atom: 333
Blocpdb> 29 atoms in block 10
Block first atom: 387
Blocpdb> 57 atoms in block 11
Block first atom: 416
Blocpdb> 51 atoms in block 12
Block first atom: 473
Blocpdb> 44 atoms in block 13
Block first atom: 524
Blocpdb> 33 atoms in block 14
Block first atom: 568
Blocpdb> 39 atoms in block 15
Block first atom: 601
Blocpdb> 52 atoms in block 16
Block first atom: 640
Blocpdb> 55 atoms in block 17
Block first atom: 692
Blocpdb> 39 atoms in block 18
Block first atom: 747
Blocpdb> 57 atoms in block 19
Block first atom: 786
Blocpdb> 55 atoms in block 20
Block first atom: 843
Blocpdb> 45 atoms in block 21
Block first atom: 898
Blocpdb> 57 atoms in block 22
Block first atom: 943
Blocpdb> 46 atoms in block 23
Block first atom: 1000
Blocpdb> 51 atoms in block 24
Block first atom: 1046
Blocpdb> 46 atoms in block 25
Block first atom: 1097
Blocpdb> 56 atoms in block 26
Block first atom: 1143
Blocpdb> 57 atoms in block 27
Block first atom: 1199
Blocpdb> 41 atoms in block 28
Block first atom: 1256
Blocpdb> 62 atoms in block 29
Block first atom: 1297
Blocpdb> 25 atoms in block 30
Block first atom: 1359
Blocpdb> 35 atoms in block 31
Block first atom: 1384
Blocpdb> 38 atoms in block 32
Block first atom: 1419
Blocpdb> 57 atoms in block 33
Block first atom: 1457
Blocpdb> 41 atoms in block 34
Block first atom: 1514
Blocpdb> 29 atoms in block 35
Block first atom: 1555
Blocpdb> 43 atoms in block 36
Block first atom: 1584
Blocpdb> 47 atoms in block 37
Block first atom: 1627
Blocpdb> 46 atoms in block 38
Block first atom: 1674
Blocpdb> 37 atoms in block 39
Block first atom: 1720
Blocpdb> 47 atoms in block 40
Block first atom: 1757
Blocpdb> 55 atoms in block 41
Block first atom: 1804
Blocpdb> 43 atoms in block 42
Block first atom: 1859
Blocpdb> 43 atoms in block 43
Block first atom: 1902
Blocpdb> 42 atoms in block 44
Block first atom: 1945
Blocpdb> 28 atoms in block 45
Block first atom: 1987
Blocpdb> 49 atoms in block 46
Block first atom: 2015
Blocpdb> 25 atoms in block 47
Block first atom: 2064
Blocpdb> 38 atoms in block 48
Block first atom: 2089
Blocpdb> 55 atoms in block 49
Block first atom: 2127
Blocpdb> 52 atoms in block 50
Block first atom: 2182
Blocpdb> 49 atoms in block 51
Block first atom: 2234
Blocpdb> 58 atoms in block 52
Block first atom: 2283
Blocpdb> 41 atoms in block 53
Block first atom: 2341
Blocpdb> 62 atoms in block 54
Block first atom: 2382
Blocpdb> 35 atoms in block 55
Block first atom: 2444
Blocpdb> 38 atoms in block 56
Block first atom: 2479
Blocpdb> 47 atoms in block 57
Block first atom: 2517
Blocpdb> 37 atoms in block 58
Block first atom: 2564
Blocpdb> 46 atoms in block 59
Block first atom: 2601
Blocpdb> 52 atoms in block 60
Block first atom: 2647
Blocpdb> 39 atoms in block 61
Block first atom: 2699
Blocpdb> 35 atoms in block 62
Block first atom: 2738
Blocpdb> 51 atoms in block 63
Block first atom: 2773
Blocpdb> 50 atoms in block 64
Block first atom: 2824
Blocpdb> 41 atoms in block 65
Block first atom: 2874
Blocpdb> 48 atoms in block 66
Block first atom: 2915
Blocpdb> 50 atoms in block 67
Block first atom: 2963
Blocpdb> 62 atoms in block 68
Block first atom: 3013
Blocpdb> 55 atoms in block 69
Block first atom: 3075
Blocpdb> 42 atoms in block 70
Block first atom: 3130
Blocpdb> 62 atoms in block 71
Block first atom: 3172
Blocpdb> 52 atoms in block 72
Block first atom: 3234
Blocpdb> 40 atoms in block 73
Block first atom: 3286
Blocpdb> 36 atoms in block 74
Block first atom: 3326
Blocpdb> 52 atoms in block 75
Block first atom: 3362
Blocpdb> 45 atoms in block 76
Block first atom: 3414
Blocpdb> 37 atoms in block 77
Block first atom: 3459
Blocpdb> 39 atoms in block 78
Block first atom: 3496
Blocpdb> 46 atoms in block 79
Block first atom: 3535
Blocpdb> 38 atoms in block 80
Block first atom: 3581
Blocpdb> 45 atoms in block 81
Block first atom: 3619
Blocpdb> 33 atoms in block 82
Block first atom: 3664
Blocpdb> 36 atoms in block 83
Block first atom: 3697
Blocpdb> 54 atoms in block 84
Block first atom: 3733
Blocpdb> 44 atoms in block 85
Block first atom: 3787
Blocpdb> 31 atoms in block 86
Block first atom: 3831
Blocpdb> 38 atoms in block 87
Block first atom: 3862
Blocpdb> 47 atoms in block 88
Block first atom: 3900
Blocpdb> 27 atoms in block 89
Block first atom: 3947
Blocpdb> 47 atoms in block 90
Block first atom: 3974
Blocpdb> 53 atoms in block 91
Block first atom: 4021
Blocpdb> 58 atoms in block 92
Block first atom: 4074
Blocpdb> 34 atoms in block 93
Block first atom: 4132
Blocpdb> 32 atoms in block 94
Block first atom: 4166
Blocpdb> 44 atoms in block 95
Block first atom: 4198
Blocpdb> 57 atoms in block 96
Block first atom: 4242
Blocpdb> 40 atoms in block 97
Block first atom: 4299
Blocpdb> 43 atoms in block 98
Block first atom: 4339
Blocpdb> 43 atoms in block 99
Block first atom: 4382
Blocpdb> 30 atoms in block 100
Block first atom: 4425
Blocpdb> 50 atoms in block 101
Block first atom: 4455
Blocpdb> 46 atoms in block 102
Block first atom: 4505
Blocpdb> 35 atoms in block 103
Block first atom: 4551
Blocpdb> 43 atoms in block 104
Block first atom: 4586
Blocpdb> 40 atoms in block 105
Block first atom: 4629
Blocpdb> 59 atoms in block 106
Block first atom: 4669
Blocpdb> 40 atoms in block 107
Block first atom: 4728
Blocpdb> 48 atoms in block 108
Block first atom: 4768
Blocpdb> 40 atoms in block 109
Block first atom: 4816
Blocpdb> 54 atoms in block 110
Block first atom: 4856
Blocpdb> 44 atoms in block 111
Block first atom: 4910
Blocpdb> 60 atoms in block 112
Block first atom: 4954
Blocpdb> 56 atoms in block 113
Block first atom: 5014
Blocpdb> 40 atoms in block 114
Block first atom: 5070
Blocpdb> 59 atoms in block 115
Block first atom: 5110
Blocpdb> 38 atoms in block 116
Block first atom: 5169
Blocpdb> 33 atoms in block 117
Block first atom: 5207
Blocpdb> 39 atoms in block 118
Block first atom: 5240
Blocpdb> 30 atoms in block 119
Block first atom: 5279
Blocpdb> 41 atoms in block 120
Block first atom: 5309
Blocpdb> 60 atoms in block 121
Block first atom: 5350
Blocpdb> 31 atoms in block 122
Block first atom: 5410
Blocpdb> 46 atoms in block 123
Block first atom: 5441
Blocpdb> 45 atoms in block 124
Block first atom: 5487
Blocpdb> 57 atoms in block 125
Block first atom: 5532
Blocpdb> 50 atoms in block 126
Block first atom: 5589
Blocpdb> 34 atoms in block 127
Block first atom: 5639
Blocpdb> 45 atoms in block 128
Block first atom: 5673
Blocpdb> 35 atoms in block 129
Block first atom: 5718
Blocpdb> 46 atoms in block 130
Block first atom: 5753
Blocpdb> 60 atoms in block 131
Block first atom: 5799
Blocpdb> 52 atoms in block 132
Block first atom: 5859
Blocpdb> 45 atoms in block 133
Block first atom: 5911
Blocpdb> 48 atoms in block 134
Block first atom: 5956
Blocpdb> 49 atoms in block 135
Block first atom: 6004
Blocpdb> 40 atoms in block 136
Block first atom: 6053
Blocpdb> 53 atoms in block 137
Block first atom: 6093
Blocpdb> 40 atoms in block 138
Block first atom: 6146
Blocpdb> 55 atoms in block 139
Block first atom: 6186
Blocpdb> 32 atoms in block 140
Block first atom: 6241
Blocpdb> 34 atoms in block 141
Block first atom: 6273
Blocpdb> 52 atoms in block 142
Block first atom: 6307
Blocpdb> 36 atoms in block 143
Block first atom: 6359
Blocpdb> 44 atoms in block 144
Block first atom: 6395
Blocpdb> 55 atoms in block 145
Block first atom: 6439
Blocpdb> 32 atoms in block 146
Block first atom: 6494
Blocpdb> 54 atoms in block 147
Block first atom: 6526
Blocpdb> 46 atoms in block 148
Block first atom: 6580
Blocpdb> 29 atoms in block 149
Block first atom: 6626
Blocpdb> 43 atoms in block 150
Block first atom: 6655
Blocpdb> 65 atoms in block 151
Block first atom: 6698
Blocpdb> 43 atoms in block 152
Block first atom: 6763
Blocpdb> 58 atoms in block 153
Block first atom: 6806
Blocpdb> 38 atoms in block 154
Block first atom: 6864
Blocpdb> 46 atoms in block 155
Block first atom: 6902
Blocpdb> 40 atoms in block 156
Block first atom: 6948
Blocpdb> 55 atoms in block 157
Block first atom: 6988
Blocpdb> 34 atoms in block 158
Block first atom: 7043
Blocpdb> 53 atoms in block 159
Block first atom: 7077
Blocpdb> 25 atoms in block 160
Block first atom: 7130
Blocpdb> 43 atoms in block 161
Block first atom: 7155
Blocpdb> 41 atoms in block 162
Block first atom: 7198
Blocpdb> 46 atoms in block 163
Block first atom: 7239
Blocpdb> 64 atoms in block 164
Block first atom: 7285
Blocpdb> 54 atoms in block 165
Block first atom: 7349
Blocpdb> 39 atoms in block 166
Block first atom: 7403
Blocpdb> 43 atoms in block 167
Block first atom: 7442
Blocpdb> 35 atoms in block 168
Block first atom: 7485
Blocpdb> 50 atoms in block 169
Block first atom: 7520
Blocpdb> 31 atoms in block 170
Block first atom: 7570
Blocpdb> 30 atoms in block 171
Block first atom: 7601
Blocpdb> 38 atoms in block 172
Block first atom: 7631
Blocpdb> 42 atoms in block 173
Block first atom: 7669
Blocpdb> 60 atoms in block 174
Block first atom: 7711
Blocpdb> 40 atoms in block 175
Block first atom: 7771
Blocpdb> 38 atoms in block 176
Block first atom: 7811
Blocpdb> 59 atoms in block 177
Block first atom: 7849
Blocpdb> 38 atoms in block 178
Block first atom: 7908
Blocpdb> 43 atoms in block 179
Block first atom: 7946
Blocpdb> 55 atoms in block 180
Block first atom: 7989
Blocpdb> 28 atoms in block 181
Block first atom: 8044
Blocpdb> 38 atoms in block 182
Block first atom: 8072
Blocpdb> 40 atoms in block 183
Block first atom: 8110
Blocpdb> 52 atoms in block 184
Block first atom: 8150
Blocpdb> 49 atoms in block 185
Block first atom: 8202
Blocpdb> 30 atoms in block 186
Block first atom: 8251
Blocpdb> 52 atoms in block 187
Block first atom: 8281
Blocpdb> 39 atoms in block 188
Block first atom: 8333
Blocpdb> 40 atoms in block 189
Block first atom: 8372
Blocpdb> 31 atoms in block 190
Block first atom: 8412
Blocpdb> 35 atoms in block 191
Block first atom: 8442
Blocpdb> 191 blocks.
Blocpdb> At most, 65 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 25 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 6265754 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 25431
Prepmat> Matrix trace = 13833760.0000
Prepmat> Last element read: 25431 25431 216.2352
Prepmat> 18337 lines saved.
Prepmat> 15943 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8477
RTB> Total mass = 8477.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 8477
RTB> Number of blocks = 191
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 501221.7782
RTB> 83283 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1146
Diagstd> Nb of non-zero elements: 83283
Diagstd> Projected matrix trace = 501221.7782
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1146 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 501221.7782
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.3409446 3.0076999 4.1491178 6.7382276
7.7134426 8.9110136 14.7262518 16.5402873 18.0014737
19.3160252 19.6716526 20.3968752 21.3709907 21.4993951
24.5820499 26.3400611 27.3181187 28.1110392 29.4569087
29.7581448 30.4046880 32.0604239 33.3337299 33.9192589
34.6755124 35.6420301 36.7032314 37.4988912 38.0071948
38.4913924 40.9544872 42.1456544 43.7785215 43.9687490
46.0099022 47.1557412 47.4002799 48.1892021 48.6147482
49.9296705 50.8369525 51.8585149 53.4488126 54.0714755
54.7862601 56.6948363 57.1836324 57.6089700 60.3850840
60.8048442 62.3717961 64.6154581 64.9478482 66.5059558
66.8633733 67.5875146 68.3465949 69.6638716 70.4011865
71.2393100 72.4207816 73.7167044 74.3537671 75.4326986
76.5029444 77.1015123 78.0856434 79.2881275 79.8333192
80.7025872 81.4908642 84.0819699 84.6338473 85.7349546
87.7345435 88.6429758 90.0262214 90.3335186 91.6912102
92.7858919 94.0730659 95.2878366 95.8610067 96.7599085
98.4622475 100.4103907 101.7922311 102.0439631 103.0904778
104.8870688 106.5126211 107.8860007 108.5535787 109.8735943
110.7470614 112.1385815 112.4413749 113.7671058 115.1366053
115.8512552
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034273 0.0034328 0.0034340 0.0034342 0.0034344
0.0034345 125.7478893 188.3269749 221.1939096 281.8825029
301.5917155 324.1595587 416.7171657 441.6383766 460.7329906
477.2590379 481.6324096 490.4300804 502.0044975 503.5103487
538.3991034 557.3187693 567.5716231 575.7497141 589.3711389
592.3770258 598.7776149 614.8651956 626.9562503 632.4387296
639.4501946 648.3007086 657.8811325 664.9737376 669.4654808
673.7163563 694.9379464 704.9716962 718.4984334 720.0577598
736.5817178 745.6972954 747.6283016 753.8243261 757.1454219
767.3166648 774.2568112 781.9974159 793.8972749 798.5082190
803.7687330 817.6492317 821.1663605 824.2146614 843.8400185
846.7678694 857.6091494 872.8979916 875.1402605 885.5754122
887.9518609 892.7472448 897.7465019 906.3565629 911.1403286
916.5478281 924.1168394 932.3484130 936.3684422 943.1376945
949.8047901 953.5132419 959.5793131 966.9396318 970.2583154
975.5263603 980.2790970 995.7417552 999.0042180 1005.4818635
1017.1396649 1022.3920028 1030.3381757 1032.0951653 1039.8223133
1046.0110047 1053.2414186 1060.0198886 1063.2031948 1068.1764647
1077.5319407 1088.1395829 1095.6014463 1096.9553201 1102.5658997
1112.1317889 1120.7166297 1127.9187791 1131.4030705 1138.2612364
1142.7767237 1149.9337206 1151.4851829 1158.2535372 1165.2040636
1168.8146650
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8477
Rtb_to_modes> Number of blocs = 191
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9614E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.341
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.008
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.149
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.738
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.713
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.911
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.61
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001
1.00000 0.99998 1.00003 0.99998 1.00002
0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999
0.99999 1.00002 0.99996 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 1.00003
0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999
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1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003
1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00003
1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999
1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999
1.00006 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 152586 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001
1.00000 0.99998 1.00003 0.99998 1.00002
0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999
0.99999 1.00002 0.99996 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 1.00003
0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999
0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003
1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00003
1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999
1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999
1.00006 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607022151012161870.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607022151012161870.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607022151012161870.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607022151012161870.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 573
First residue number = 77
Last residue number = 649
Number of atoms found = 8477
Mean number per residue = 14.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9614E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.341
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.008
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.149
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.738
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.713
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.911
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9
Bfactors> 106 vectors, 25431 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.341000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.007 +/- 0.03
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.007
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607022151012161870.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607022151012161870.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4272E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 995.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1030.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1063.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1068.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1077.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1088.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1097.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1103.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1128.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1158.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Chkmod> 106 vectors, 25431 coordinates in file.
Chkmod> That is: 8477 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 86 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9486
0.0034 0.9593
0.0034 0.7280
0.0034 0.8425
0.0034 0.7489
0.0034 0.7258
125.7451 0.0080
188.3283 0.0096
221.1813 0.0075
281.8656 0.5714
301.5701 0.6221
324.1454 0.6221
416.7523 0.2854
441.6156 0.2277
460.6944 0.4457
477.2877 0.4421
481.5915 0.3656
490.4466 0.0822
501.9713 0.3502
503.4958 0.1265
538.3535 0.3490
557.2942 0.3244
567.5668 0.2981
575.7144 0.4360
589.3768 0.3906
592.3701 0.2650
598.7057 0.3881
614.8347 0.4619
626.8943 0.2091
632.4185 0.3717
639.4641 0.1899
648.2544 0.3809
657.8239 0.3216
664.9550 0.4070
669.4614 0.3110
673.6753 0.2827
694.8700 0.2449
704.9778 0.2573
718.4797 0.3096
720.0371 0.2361
736.5509 0.2418
745.6990 0.4942
747.5940 0.3849
753.7982 0.3342
757.0759 0.1040
767.2863 0.4633
774.2468 0.3310
781.9750 0.1180
793.8720 0.3690
798.4630 0.4660
803.7617 0.4780
817.5793 0.3416
821.1050 0.4193
824.1866 0.2297
843.8381 0.3116
846.6978 0.3696
857.5600 0.4014
872.8912 0.3460
875.1172 0.2978
885.5643 0.5313
887.8913 0.4032
892.7253 0.2638
897.7303 0.3344
906.2925 0.2713
911.0935 0.3028
916.5129 0.2206
924.0722 0.3292
932.3292 0.3980
936.3045 0.3680
943.0803 0.3961
949.7457 0.3674
953.4630 0.4787
959.5649 0.3809
966.9095 0.3809
970.1965 0.4234
975.4688 0.2464
980.2318 0.4971
995.6873 0.3701
998.9386 0.3674
1005.4096 0.4942
1017.0697 0.4842
1022.3310 0.3137
1030.3156 0.4552
1032.0308 0.3591
1039.7708 0.2911
1045.9893 0.3535
1053.1790 0.4096
1059.9864 0.3489
1063.1520 0.4414
1068.1311 0.2825
1077.4734 0.3844
1088.0366 0.4856
1095.5962 0.3754
1096.6719 0.4060
1102.5695 0.3812
1112.1526 0.4002
1120.6021 0.4577
1127.9435 0.4376
1131.5964 0.3856
1138.3491 0.4564
1142.4848 0.2118
1149.6865 0.4587
1151.2239 0.5224
1158.3712 0.3614
1164.9688 0.4371
1169.0103 0.4209
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2607022151012161870.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607022151012161870.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2607022151012161870.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607022151012161870.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2607022151012161870.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2607022151012161870.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4272E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.5
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 995.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1030.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1068.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1097.
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1103.
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1128.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1158.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Projmod> 106 vectors, 25431 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 573
First residue number = 77
Last residue number = 649
Number of atoms found = 8477
Mean number per residue = 14.8
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 573
First residue number = 77
Last residue number = 649
Number of atoms found = 8477
Mean number per residue = 14.8
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 8477 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 33.48
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.195 Sum= 0.038 q= 599.6887
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.148 Sum= 0.060 q= -455.4156
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.069 Sum= 0.064 q= 212.6413
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.107 Sum= 0.076 q= -329.3884
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.023 Sum= 0.076 q= 71.8915
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.102 Sum= 0.087 q= -312.9689
Vector: 7 F= 125.75 Cos= -0.056 Sum= 0.090 q= -173.2667
Vector: 8 F= 188.33 Cos= 0.050 Sum= 0.092 q= 153.9696
Vector: 9 F= 221.18 Cos= -0.010 Sum= 0.092 q= -31.8104
Vector: 10 F= 281.87 Cos= 0.026 Sum= 0.093 q= 79.3755
Vector: 11 F= 301.57 Cos= -0.054 Sum= 0.096 q= -164.9883
Vector: 12 F= 324.15 Cos= -0.060 Sum= 0.100 q= -184.3698
Vector: 13 F= 416.75 Cos= 0.038 Sum= 0.101 q= 115.9759
Vector: 14 F= 441.62 Cos= 0.037 Sum= 0.102 q= 113.8368
Vector: 15 F= 460.69 Cos= 0.120 Sum= 0.117 q= 371.1958
Vector: 16 F= 477.29 Cos= -0.057 Sum= 0.120 q= -175.7972
Vector: 17 F= 481.59 Cos= -0.097 Sum= 0.130 q= -300.1498
Vector: 18 F= 490.45 Cos= 0.123 Sum= 0.145 q= 377.6647
Vector: 19 F= 501.97 Cos= 0.238 Sum= 0.201 q= 733.6741
Vector: 20 F= 503.50 Cos= 0.005 Sum= 0.201 q= 14.1564
Vector: 21 F= 538.35 Cos= 0.051 Sum= 0.204 q= 156.4157
Vector: 22 F= 557.29 Cos= -0.058 Sum= 0.207 q= -178.8142
Vector: 23 F= 567.57 Cos= 0.049 Sum= 0.210 q= 149.8774
Vector: 24 F= 575.71 Cos= -0.097 Sum= 0.219 q= -299.3070
Vector: 25 F= 589.38 Cos= -0.017 Sum= 0.219 q= -53.8205
Vector: 26 F= 592.37 Cos= -0.042 Sum= 0.221 q= -129.5149
Vector: 27 F= 598.71 Cos= 0.058 Sum= 0.224 q= 177.8166
Vector: 28 F= 614.83 Cos= 0.095 Sum= 0.233 q= 292.8941
Vector: 29 F= 626.89 Cos= -0.007 Sum= 0.233 q= -20.4428
Vector: 30 F= 632.42 Cos= 0.051 Sum= 0.236 q= 157.5027
Vector: 31 F= 639.46 Cos= 0.054 Sum= 0.239 q= 165.2204
Vector: 32 F= 648.25 Cos= -0.033 Sum= 0.240 q= -102.7632
Vector: 33 F= 657.82 Cos= -0.075 Sum= 0.246 q= -232.1631
Vector: 34 F= 664.96 Cos= 0.101 Sum= 0.256 q= 312.6297
Vector: 35 F= 669.46 Cos= -0.095 Sum= 0.265 q= -291.3811
Vector: 36 F= 673.68 Cos= -0.077 Sum= 0.271 q= -237.4621
Vector: 37 F= 694.87 Cos= -0.130 Sum= 0.288 q= -399.4659
Vector: 38 F= 704.98 Cos= 0.037 Sum= 0.289 q= 112.7475
Vector: 39 F= 718.48 Cos= 0.020 Sum= 0.289 q= 60.9847
Vector: 40 F= 720.04 Cos= 0.042 Sum= 0.291 q= 128.6761
Vector: 41 F= 736.55 Cos= 0.063 Sum= 0.295 q= 195.1293
Vector: 42 F= 745.70 Cos= 0.230 Sum= 0.348 q= 707.9402
Vector: 43 F= 747.59 Cos= 0.045 Sum= 0.350 q= 138.7137
Vector: 44 F= 753.80 Cos= -0.057 Sum= 0.353 q= -177.1179
Vector: 45 F= 757.08 Cos= 0.012 Sum= 0.353 q= 35.9968
Vector: 46 F= 767.29 Cos= 0.066 Sum= 0.358 q= 204.5430
Vector: 47 F= 774.25 Cos= 0.034 Sum= 0.359 q= 106.2649
Vector: 48 F= 781.98 Cos= -0.064 Sum= 0.363 q= -196.7646
Vector: 49 F= 793.87 Cos= 0.125 Sum= 0.379 q= 386.4543
Vector: 50 F= 798.46 Cos= 0.053 Sum= 0.382 q= 164.8694
Vector: 51 F= 803.76 Cos= 0.120 Sum= 0.396 q= 369.2207
Vector: 52 F= 817.58 Cos= -0.007 Sum= 0.396 q= -20.7422
Vector: 53 F= 821.11 Cos= -0.014 Sum= 0.396 q= -42.8012
Vector: 54 F= 824.19 Cos= -0.006 Sum= 0.396 q= -19.5101
Vector: 55 F= 843.84 Cos= -0.049 Sum= 0.399 q= -151.6197
Vector: 56 F= 846.70 Cos= -0.147 Sum= 0.420 q= -454.2136
Vector: 57 F= 857.56 Cos= -0.005 Sum= 0.420 q= -14.7536
Vector: 58 F= 872.89 Cos= -0.032 Sum= 0.421 q= -97.1118
Vector: 59 F= 875.12 Cos= 0.059 Sum= 0.425 q= 182.9634
Vector: 60 F= 885.56 Cos= 0.194 Sum= 0.462 q= 597.2370
Vector: 61 F= 887.89 Cos= -0.137 Sum= 0.481 q= -423.1190
Vector: 62 F= 892.73 Cos= 0.012 Sum= 0.481 q= 36.7723
Vector: 63 F= 897.73 Cos= 0.083 Sum= 0.488 q= 255.2097
Vector: 64 F= 906.29 Cos= -0.147 Sum= 0.510 q= -452.5921
Vector: 65 F= 911.09 Cos= 0.134 Sum= 0.528 q= 412.4251
Vector: 66 F= 916.51 Cos= 0.135 Sum= 0.546 q= 416.9487
Vector: 67 F= 924.07 Cos= -0.177 Sum= 0.577 q= -544.7646
Vector: 68 F= 932.33 Cos= -0.254 Sum= 0.642 q= -782.5292
Vector: 69 F= 936.30 Cos= -0.052 Sum= 0.644 q= -161.6418
Vector: 70 F= 943.08 Cos= 0.066 Sum= 0.649 q= 202.3227
Vector: 71 F= 949.75 Cos= -0.060 Sum= 0.652 q= -186.1627
Vector: 72 F= 953.46 Cos= -0.044 Sum= 0.654 q= -134.6811
Vector: 73 F= 959.56 Cos= 0.072 Sum= 0.660 q= 222.9760
Vector: 74 F= 966.91 Cos= 0.166 Sum= 0.687 q= 511.1796
Vector: 75 F= 970.20 Cos= 0.040 Sum= 0.689 q= 122.6500
Vector: 76 F= 975.47 Cos= -0.162 Sum= 0.715 q= -499.1960
Vector: 77 F= 980.23 Cos= 0.157 Sum= 0.740 q= 483.7435
Vector: 78 F= 995.69 Cos= 0.022 Sum= 0.740 q= 67.3269
Vector: 79 F= 998.94 Cos= 0.023 Sum= 0.741 q= 71.2170
Vector: 80 F= 1005.41 Cos= 0.025 Sum= 0.741 q= 75.8610
Vector: 81 F= 1017.07 Cos= -0.078 Sum= 0.747 q= -241.8044
Vector: 82 F= 1022.33 Cos= 0.184 Sum= 0.781 q= 565.6660
Vector: 83 F= 1030.32 Cos= 0.013 Sum= 0.781 q= 40.3411
Vector: 84 F= 1032.03 Cos= 0.049 Sum= 0.784 q= 151.8685
Vector: 85 F= 1039.77 Cos= 0.031 Sum= 0.785 q= 95.0128
%Projmod-Wn> Eigenvector 86 Norm= 1.0001
Vector: 86 F= 1045.99 Cos= -0.072 Sum= 0.790 q= -222.9458
Vector: 87 F= 1053.18 Cos= 0.039 Sum= 0.791 q= 120.8817
Vector: 88 F= 1059.99 Cos= -0.090 Sum= 0.799 q= -277.7185
Vector: 89 F= 1063.15 Cos= -0.159 Sum= 0.825 q= -488.8190
Vector: 90 F= 1068.13 Cos= -0.002 Sum= 0.825 q= -6.0165
Vector: 91 F= 1077.47 Cos= 0.046 Sum= 0.827 q= 142.1174
Vector: 92 F= 1088.04 Cos= -0.003 Sum= 0.827 q= -8.0361
Vector: 93 F= 1095.60 Cos= -0.113 Sum= 0.839 q= -347.4038
Vector: 94 F= 1096.67 Cos= -0.101 Sum= 0.849 q= -309.8475
Vector: 95 F= 1102.57 Cos= -0.018 Sum= 0.850 q= -55.3628
Vector: 96 F= 1112.15 Cos= 0.066 Sum= 0.854 q= 203.0990
Vector: 97 F= 1120.60 Cos= -0.066 Sum= 0.859 q= -203.9154
Vector: 98 F= 1127.94 Cos= -0.062 Sum= 0.862 q= -190.1064
Vector: 99 F= 1131.60 Cos= 0.013 Sum= 0.862 q= 39.7857
Vector: 100 F= 1138.35 Cos= 0.026 Sum= 0.863 q= 79.0037
Vector: 101 F= 1142.48 Cos= -0.013 Sum= 0.863 q= -39.5253
Vector: 102 F= 1149.69 Cos= 0.020 Sum= 0.864 q= 60.3073
Vector: 103 F= 1151.22 Cos= -0.010 Sum= 0.864 q= -30.0679
Vector: 104 F= 1158.37 Cos= 0.060 Sum= 0.867 q= 185.6060
Vector: 105 F= 1164.97 Cos= -0.011 Sum= 0.868 q= -33.5124
Vector: 106 F= 1169.01 Cos= 0.045 Sum= 0.870 q= 138.9020
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003427
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 125.745087
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.25 for mode 68 with F= 932.33 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.064 0.174 0.283 0.368 0.439 0.870
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2607022151012161870 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
making animated gifs
11 models are in 2607022151012161870.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607022151012161870.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607022151012161870.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 573 2.261 545 1.137
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 573 2.120 544 1.126
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 573 1.996 543 1.116
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 573 1.893 543 1.112
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 573 1.814 543 1.109
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 573 1.762 543 1.105
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 573 1.740 543 1.102
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 573 1.749 543 1.099
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 573 1.789 543 1.096
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 573 1.857 543 1.093
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 573 1.951 542 1.083
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2607022151012161870 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
making animated gifs
11 models are in 2607022151012161870.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607022151012161870.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607022151012161870.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 573 1.614 546 1.134
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 573 1.570 547 1.142
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 573 1.563 546 1.127
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 573 1.594 544 1.117
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 573 1.662 543 1.108
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 573 1.762 543 1.105
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 573 1.889 543 1.104
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 573 2.038 543 1.102
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 573 2.204 543 1.101
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 573 2.384 543 1.101
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 573 2.575 542 1.096
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2607022151012161870 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
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2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
making animated gifs
11 models are in 2607022151012161870.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607022151012161870.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607022151012161870.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 573 2.242 542 1.146
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 573 2.108 542 1.136
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 573 1.989 542 1.127
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 573 1.890 543 1.125
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 573 1.813 543 1.115
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 573 1.762 543 1.105
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 573 1.738 543 1.096
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 573 1.743 543 1.088
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 573 1.777 543 1.080
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 573 1.837 544 1.079
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 573 1.922 544 1.070
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2607022151012161870 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
making animated gifs
11 models are in 2607022151012161870.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607022151012161870.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607022151012161870.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 573 1.793 544 1.160
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 573 1.736 548 1.106
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 573 1.703 548 1.059
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 573 1.697 548 1.049
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 573 1.717 546 1.063
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 573 1.762 543 1.105
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 573 1.831 541 1.187
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 573 1.921 537 1.281
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 573 2.030 533 1.393
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 573 2.154 522 1.484
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 573 2.290 507 1.557
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2607022151012161870 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607022151012161870.eigenfacs
2607022151012161870.atom
making animated gifs
11 models are in 2607022151012161870.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607022151012161870.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607022151012161870.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 573 2.087 536 1.451
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 573 1.980 543 1.358
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 573 1.892 544 1.257
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 573 1.824 545 1.183
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 573 1.780 544 1.128
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 573 1.762 543 1.105
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 573 1.770 543 1.128
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 573 1.804 541 1.170
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 573 1.862 536 1.225
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 573 1.942 538 1.342
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 573 2.042 533 1.441
2607022151012161870.10.pdb
2607022151012161870.11.pdb
2607022151012161870.7.pdb
2607022151012161870.8.pdb
2607022151012161870.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m50.080s
user 0m49.635s
sys 0m0.422s
rm: cannot remove '2607022151012161870.sdijf': No such file or directory
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