CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  Complex  ***

LOGs for ID: 2607040140552435582

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607040140552435582.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607040140552435582.atom to be opened. Openam> File opened: 2607040140552435582.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 567 First residue number = 8 Last residue number = 804 Number of atoms found = 4500 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 14.698987 +/- 9.156840 From: -13.998000 To: 38.759000 = 5.607980 +/- 23.750088 From: -36.289000 To: 66.045000 = -24.188973 +/- 20.689365 From: -65.918000 To: 16.345000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8589 % Filled. Pdbmat> 1694009 non-zero elements. Pdbmat> 185246 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.33 +/- 24.43 Maximum number = 134 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 3.704920E+06 Pdbmat> Larger element = 508.962 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 567 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607040140552435582.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607040140552435582.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607040140552435582.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4500 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 567 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 30 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 28 atoms in block 3 Block first atom: 53 Blocpdb> 24 atoms in block 4 Block first atom: 81 Blocpdb> 25 atoms in block 5 Block first atom: 105 Blocpdb> 24 atoms in block 6 Block first atom: 130 Blocpdb> 23 atoms in block 7 Block first atom: 154 Blocpdb> 26 atoms in block 8 Block first atom: 177 Blocpdb> 30 atoms in block 9 Block first atom: 203 Blocpdb> 25 atoms in block 10 Block first atom: 233 Blocpdb> 20 atoms in block 11 Block first atom: 258 Blocpdb> 25 atoms in block 12 Block first atom: 278 Blocpdb> 28 atoms in block 13 Block first atom: 303 Blocpdb> 31 atoms in block 14 Block first atom: 331 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 362 Blocpdb> 27 atoms in block 16 Block first atom: 381 Blocpdb> 24 atoms in block 17 Block first atom: 408 Blocpdb> 24 atoms in block 18 Block first atom: 432 Blocpdb> 25 atoms in block 19 Block first atom: 456 Blocpdb> 20 atoms in block 20 Block first atom: 481 Blocpdb> 22 atoms in block 21 Block first atom: 501 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 523 Blocpdb> 28 atoms in block 23 Block first atom: 543 Blocpdb> 28 atoms in block 24 Block first atom: 571 Blocpdb> 25 atoms in block 25 Block first atom: 599 Blocpdb> 22 atoms in block 26 Block first atom: 624 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 646 Blocpdb> 23 atoms in block 28 Block first atom: 675 Blocpdb> 27 atoms in block 29 Block first atom: 698 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 725 Blocpdb> 24 atoms in block 31 Block first atom: 744 Blocpdb> 32 atoms in block 32 Block first atom: 768 Blocpdb> 24 atoms in block 33 Block first atom: 800 Blocpdb> 26 atoms in block 34 Block first atom: 824 Blocpdb> 27 atoms in block 35 Block first atom: 850 Blocpdb> 28 atoms in block 36 Block first atom: 877 Blocpdb> 26 atoms in block 37 Block first atom: 905 Blocpdb> 26 atoms in block 38 Block first atom: 931 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 957 Blocpdb> 27 atoms in block 40 Block first atom: 979 Blocpdb> 29 atoms in block 41 Block first atom: 1006 Blocpdb> 30 atoms in block 42 Block first atom: 1035 Blocpdb> 23 atoms in block 43 Block first atom: 1065 Blocpdb> 24 atoms in block 44 Block first atom: 1088 Blocpdb> 25 atoms in block 45 Block first atom: 1112 Blocpdb> 22 atoms in block 46 Block first atom: 1137 Blocpdb> 25 atoms in block 47 Block first atom: 1159 Blocpdb> 28 atoms in block 48 Block first atom: 1184 Blocpdb> 20 atoms in block 49 Block first atom: 1212 Blocpdb> 26 atoms in block 50 Block first atom: 1232 Blocpdb> 27 atoms in block 51 Block first atom: 1258 Blocpdb> 30 atoms in block 52 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 53 Block first atom: 1315 Blocpdb> 29 atoms in block 54 Block first atom: 1337 Blocpdb> 26 atoms in block 55 Block first atom: 1366 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 1392 Blocpdb> 29 atoms in block 57 Block first atom: 1410 Blocpdb> 21 atoms in block 58 Block first atom: 1439 Blocpdb> 27 atoms in block 59 Block first atom: 1460 Blocpdb> 23 atoms in block 60 Block first atom: 1487 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 1510 Blocpdb> 28 atoms in block 62 Block first atom: 1532 Blocpdb> 31 atoms in block 63 Block first atom: 1560 Blocpdb> 20 atoms in block 64 Block first atom: 1591 Blocpdb> 25 atoms in block 65 Block first atom: 1611 Blocpdb> 22 atoms in block 66 Block first atom: 1636 Blocpdb> 21 atoms in block 67 Block first atom: 1658 Blocpdb> 19 atoms in block 68 Block first atom: 1679 Blocpdb> 27 atoms in block 69 Block first atom: 1698 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1725 Blocpdb> 25 atoms in block 71 Block first atom: 1749 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1774 Blocpdb> 26 atoms in block 73 Block first atom: 1794 Blocpdb> 16 atoms in block 74 Block first atom: 1820 Blocpdb> 20 atoms in block 75 Block first atom: 1836 Blocpdb> 22 atoms in block 76 Block first atom: 1856 Blocpdb> 21 atoms in block 77 Block first atom: 1878 Blocpdb> 34 atoms in block 78 Block first atom: 1899 Blocpdb> 21 atoms in block 79 Block first atom: 1933 Blocpdb> 25 atoms in block 80 Block first atom: 1954 Blocpdb> 23 atoms in block 81 Block first atom: 1979 Blocpdb> 18 atoms in block 82 Block first atom: 2002 Blocpdb> 20 atoms in block 83 Block first atom: 2020 Blocpdb> 27 atoms in block 84 Block first atom: 2040 Blocpdb> 24 atoms in block 85 Block first atom: 2067 Blocpdb> 28 atoms in block 86 Block first atom: 2091 Blocpdb> 20 atoms in block 87 Block first atom: 2119 Blocpdb> 24 atoms in block 88 Block first atom: 2139 Blocpdb> 18 atoms in block 89 Block first atom: 2163 Blocpdb> 20 atoms in block 90 Block first atom: 2181 Blocpdb> 6 atoms in block 91 Block first atom: 2201 Blocpdb> 21 atoms in block 92 Block first atom: 2207 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 2228 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 2248 Blocpdb> 20 atoms in block 95 Block first atom: 2268 Blocpdb> 22 atoms in block 96 Block first atom: 2288 Blocpdb> 17 atoms in block 97 Block first atom: 2310 Blocpdb> 24 atoms in block 98 Block first atom: 2327 Blocpdb> 28 atoms in block 99 Block first atom: 2351 Blocpdb> 18 atoms in block 100 Block first atom: 2379 Blocpdb> 17 atoms in block 101 Block first atom: 2397 Blocpdb> 17 atoms in block 102 Block first atom: 2414 Blocpdb> 23 atoms in block 103 Block first atom: 2431 Blocpdb> 21 atoms in block 104 Block first atom: 2454 Blocpdb> 25 atoms in block 105 Block first atom: 2475 Blocpdb> 20 atoms in block 106 Block first atom: 2500 Blocpdb> 33 atoms in block 107 Block first atom: 2520 Blocpdb> 17 atoms in block 108 Block first atom: 2553 Blocpdb> 28 atoms in block 109 Block first atom: 2570 Blocpdb> 10 atoms in block 110 Block first atom: 2598 Blocpdb> 29 atoms in block 111 Block first atom: 2608 Blocpdb> 26 atoms in block 112 Block first atom: 2637 Blocpdb> 18 atoms in block 113 Block first atom: 2663 Blocpdb> 29 atoms in block 114 Block first atom: 2681 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 2710 Blocpdb> 21 atoms in block 116 Block first atom: 2734 Blocpdb> 21 atoms in block 117 Block first atom: 2755 Blocpdb> 22 atoms in block 118 Block first atom: 2776 Blocpdb> 19 atoms in block 119 Block first atom: 2798 Blocpdb> 20 atoms in block 120 Block first atom: 2817 Blocpdb> 27 atoms in block 121 Block first atom: 2837 Blocpdb> 25 atoms in block 122 Block first atom: 2864 Blocpdb> 26 atoms in block 123 Block first atom: 2889 Blocpdb> 20 atoms in block 124 Block first atom: 2915 Blocpdb> 23 atoms in block 125 Block first atom: 2935 Blocpdb> 25 atoms in block 126 Block first atom: 2958 Blocpdb> 26 atoms in block 127 Block first atom: 2983 Blocpdb> 20 atoms in block 128 Block first atom: 3009 Blocpdb> 31 atoms in block 129 Block first atom: 3029 Blocpdb> 25 atoms in block 130 Block first atom: 3060 Blocpdb> 19 atoms in block 131 Block first atom: 3085 Blocpdb> 17 atoms in block 132 Block first atom: 3104 Blocpdb> 26 atoms in block 133 Block first atom: 3121 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3147 Blocpdb> 23 atoms in block 135 Block first atom: 3171 Blocpdb> 24 atoms in block 136 Block first atom: 3194 Blocpdb> 19 atoms in block 137 Block first atom: 3218 Blocpdb> 22 atoms in block 138 Block first atom: 3237 Blocpdb> 26 atoms in block 139 Block first atom: 3259 Blocpdb> 23 atoms in block 140 Block first atom: 3285 Blocpdb> 31 atoms in block 141 Block first atom: 3308 Blocpdb> 23 atoms in block 142 Block first atom: 3339 Blocpdb> 34 atoms in block 143 Block first atom: 3362 Blocpdb> 20 atoms in block 144 Block first atom: 3396 Blocpdb> 22 atoms in block 145 Block first atom: 3416 Blocpdb> 23 atoms in block 146 Block first atom: 3438 Blocpdb> 28 atoms in block 147 Block first atom: 3461 Blocpdb> 24 atoms in block 148 Block first atom: 3489 Blocpdb> 23 atoms in block 149 Block first atom: 3513 Blocpdb> 27 atoms in block 150 Block first atom: 3536 Blocpdb> 15 atoms in block 151 Block first atom: 3563 Blocpdb> 24 atoms in block 152 Block first atom: 3578 Blocpdb> 26 atoms in block 153 Block first atom: 3602 Blocpdb> 27 atoms in block 154 Block first atom: 3628 Blocpdb> 18 atoms in block 155 Block first atom: 3655 Blocpdb> 27 atoms in block 156 Block first atom: 3673 Blocpdb> 19 atoms in block 157 Block first atom: 3700 Blocpdb> 19 atoms in block 158 Block first atom: 3719 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3738 Blocpdb> 21 atoms in block 160 Block first atom: 3760 Blocpdb> 24 atoms in block 161 Block first atom: 3781 Blocpdb> 29 atoms in block 162 Block first atom: 3805 Blocpdb> 30 atoms in block 163 Block first atom: 3834 Blocpdb> 23 atoms in block 164 Block first atom: 3864 Blocpdb> 24 atoms in block 165 Block first atom: 3887 Blocpdb> 22 atoms in block 166 Block first atom: 3911 Blocpdb> 6 atoms in block 167 Block first atom: 3933 Blocpdb> 20 atoms in block 168 Block first atom: 3939 Blocpdb> 24 atoms in block 169 Block first atom: 3959 Blocpdb> 28 atoms in block 170 Block first atom: 3983 Blocpdb> 25 atoms in block 171 Block first atom: 4011 Blocpdb> 29 atoms in block 172 Block first atom: 4036 Blocpdb> 25 atoms in block 173 Block first atom: 4065 Blocpdb> 16 atoms in block 174 Block first atom: 4090 Blocpdb> 26 atoms in block 175 Block first atom: 4106 Blocpdb> 19 atoms in block 176 Block first atom: 4132 Blocpdb> 29 atoms in block 177 Block first atom: 4151 Blocpdb> 22 atoms in block 178 Block first atom: 4180 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4202 Blocpdb> 26 atoms in block 180 Block first atom: 4222 Blocpdb> 20 atoms in block 181 Block first atom: 4248 Blocpdb> 24 atoms in block 182 Block first atom: 4268 Blocpdb> 25 atoms in block 183 Block first atom: 4292 Blocpdb> 25 atoms in block 184 Block first atom: 4317 Blocpdb> 24 atoms in block 185 Block first atom: 4342 Blocpdb> 16 atoms in block 186 Block first atom: 4366 Blocpdb> 24 atoms in block 187 Block first atom: 4382 Blocpdb> 30 atoms in block 188 Block first atom: 4406 Blocpdb> 27 atoms in block 189 Block first atom: 4436 Blocpdb> 23 atoms in block 190 Block first atom: 4463 Blocpdb> 15 atoms in block 191 Block first atom: 4485 Blocpdb> 191 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1694200 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13500 Prepmat> Matrix trace = 3704920.0000 Prepmat> Last element read: 13500 13500 110.3311 Prepmat> 18337 lines saved. Prepmat> 16497 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4500 RTB> Total mass = 4500.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4500 RTB> Number of blocks = 191 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 243273.3508 RTB> 63339 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1146 Diagstd> Nb of non-zero elements: 63339 Diagstd> Projected matrix trace = 243273.3508 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1146 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 243273.3508 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1412439 0.2360020 0.4741665 0.9901123 1.3920566 1.5129023 2.4984661 3.0311242 3.5894482 3.7601170 3.9880986 4.8625968 5.4279385 5.9294043 6.3132601 7.0186589 7.8894232 8.1579135 9.3744201 9.5236365 10.1416527 10.5142025 10.9320502 11.1707702 11.4331670 11.6240861 12.2158818 12.6676762 13.3233584 13.4198935 13.8742829 14.2946395 15.0084157 15.6110345 16.0884274 16.4827373 17.5466141 17.7583053 18.4211418 19.8609495 20.2525223 20.5344684 20.7340622 21.0881656 21.3002866 21.8460981 22.3282993 22.8436429 23.0027518 23.5419685 23.9409984 24.5893820 24.9272091 25.2070570 25.6882455 25.8774261 26.5286787 26.8912997 27.5098934 27.8965145 28.2425253 28.9917215 29.4354797 30.1044137 31.4609162 31.6745159 31.8594952 32.2893173 32.3352321 32.9110492 33.0762178 33.5597830 33.8508927 34.2300131 34.8149018 35.3817684 35.8354928 36.3696632 36.6846382 37.0584574 37.4177867 38.1253264 38.2744437 38.3234739 39.0808071 39.9806100 40.2999514 40.7084118 41.0463163 41.2221500 41.5176528 41.9646152 42.5974966 43.0041534 43.4998442 44.1884238 44.7738721 44.8661510 45.8427632 46.0039462 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034327 0.0034332 0.0034333 0.0034343 0.0034348 40.8112662 52.7537248 74.7757359 108.0531704 128.1220037 133.5674788 171.6453377 189.0589100 205.7354470 210.5697392 216.8593866 239.4580323 252.9954670 264.4239646 272.8488464 287.6883994 305.0126883 310.1593146 332.4815000 335.1171748 345.8196349 352.1141257 359.0426892 362.9416748 367.1796075 370.2326272 379.5401204 386.4948905 396.3712397 397.8046130 404.4832602 410.5649628 420.6905003 429.0531774 435.5641013 440.8693927 454.8748680 457.6105609 466.0725800 483.9441944 488.6915608 492.0814713 494.4671894 498.6716541 501.1733904 507.5539596 513.1249159 519.0126714 520.8170303 526.8860097 531.3325338 538.4793919 542.1657873 545.2006343 550.3798196 552.4027334 559.3106517 563.1202910 569.5603315 573.5486377 577.0946440 584.6989076 589.1567251 595.8135379 609.0892904 611.1534578 612.9354289 617.0561880 617.4947526 622.9685812 624.5298516 629.0785140 631.8010500 635.3291954 640.7341441 645.9293933 650.0577955 654.8848143 657.7144759 661.0570621 664.2542287 670.5050689 671.8150429 672.2452081 678.8550335 686.6255947 689.3623201 692.8470301 695.7166127 697.2051718 699.6996825 703.4559429 708.7406114 712.1155703 716.2079390 721.8542793 726.6204353 727.3688313 735.2426201 736.5340410 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4500 Rtb_to_modes> Number of blocs = 191 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9927E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9928E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1412 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2360 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4742 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9901 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.513 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.498 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.031 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.589 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.760 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.988 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.863 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.428 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.929 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.313 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.019 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.889 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.158 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.374 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.00 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99995 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99996 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00003 0.99998 1.00003 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00004 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00005 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81000 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99995 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99996 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00003 0.99998 1.00003 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00004 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00005 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607040140552435582.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607040140552435582.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607040140552435582.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607040140552435582.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 567 First residue number = 8 Last residue number = 804 Number of atoms found = 4500 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9927E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9928E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1412 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2360 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4742 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9901 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.513 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.498 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.031 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.589 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.760 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.988 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.863 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.428 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.929 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.313 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.019 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.889 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.158 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.374 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.00 Bfactors> 106 vectors, 13500 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.141200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.393 for 567 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.075 +/- 0.08 Bfactors> = 36.028 +/- 14.06 Bfactors> Shiftng-fct= 35.953 Bfactors> Scaling-fct= 175.001 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607040140552435582.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607040140552435582.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.5 Chkmod> 106 vectors, 13500 coordinates in file. Chkmod> That is: 4500 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 81 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8264 0.0034 0.6693 0.0034 0.6848 0.0034 0.8259 0.0034 0.9563 0.0034 0.8892 40.8032 0.5793 52.7512 0.5479 74.7752 0.3989 108.0479 0.6032 128.1139 0.7406 133.5661 0.6369 171.6220 0.5929 189.0469 0.5866 205.7138 0.3089 210.5574 0.5930 216.8474 0.4814 239.4577 0.2213 252.9860 0.3624 264.4036 0.2810 272.8315 0.5372 287.6830 0.5271 304.9914 0.3017 310.1476 0.1286 332.4598 0.3239 335.1092 0.3955 345.7766 0.1656 352.0286 0.1543 358.9936 0.2962 362.9136 0.0655 367.1130 0.1920 370.1517 0.2248 379.5878 0.3357 386.5137 0.3565 396.3043 0.3945 397.7891 0.3245 404.4035 0.3985 410.4807 0.3227 420.6946 0.2691 429.0205 0.4633 435.5667 0.3970 440.8139 0.5654 454.8992 0.2305 457.6128 0.2594 466.0381 0.3346 483.9119 0.3231 488.6402 0.0826 492.0068 0.1119 494.3975 0.3004 498.6719 0.1146 501.1485 0.1771 507.5775 0.1881 513.1224 0.2509 518.9490 0.2712 520.7635 0.0172 526.8414 0.3390 531.2986 0.3056 538.4630 0.1273 542.1729 0.3895 545.2091 0.1756 550.3750 0.1597 552.4065 0.3863 559.3006 0.2793 563.0825 0.2551 569.5370 0.3529 573.5598 0.4563 577.0441 0.3282 584.6564 0.4007 589.1767 0.4532 595.7443 0.4727 609.0543 0.3518 611.0837 0.3409 612.9140 0.3978 617.0362 0.2964 617.5138 0.2563 622.9319 0.3934 624.5387 0.4173 629.0535 0.4318 631.7656 0.4043 635.3018 0.4258 640.6615 0.2950 645.8855 0.3165 650.0708 0.2170 654.8597 0.3286 657.6447 0.2014 661.0424 0.3027 664.2454 0.3397 670.5174 0.2020 671.7472 0.3636 672.1859 0.1869 678.8189 0.5035 686.5909 0.2055 689.3331 0.2523 692.8308 0.4339 695.7180 0.4053 697.1571 0.2131 699.6894 0.4592 703.3871 0.4165 708.7310 0.2553 712.0506 0.5076 716.1785 0.3060 721.8362 0.3925 726.5578 0.4096 727.3688 0.3529 735.1889 0.4648 736.4708 0.3856 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2607040140552435582 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom making animated gifs 11 models are in 2607040140552435582.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607040140552435582.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607040140552435582.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2607040140552435582 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom making animated gifs 11 models are in 2607040140552435582.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607040140552435582.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607040140552435582.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2607040140552435582 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom making animated gifs 11 models are in 2607040140552435582.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607040140552435582.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607040140552435582.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2607040140552435582 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom making animated gifs 11 models are in 2607040140552435582.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607040140552435582.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607040140552435582.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2607040140552435582 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607040140552435582.eigenfacs 2607040140552435582.atom making animated gifs 11 models are in 2607040140552435582.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607040140552435582.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607040140552435582.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2607040140552435582.10.pdb 2607040140552435582.11.pdb 2607040140552435582.7.pdb 2607040140552435582.8.pdb 2607040140552435582.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m23.403s user 0m23.281s sys 0m0.113s rm: cannot remove '2607040140552435582.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.