*** ALone ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607040151152441353.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607040151152441353.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607040151152441353.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 341
First residue number = 49
Last residue number = 529
Number of atoms found = 2686
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 11.656880 +/- 8.873764 From: -13.998000 To: 34.400000
= 1.629069 +/- 11.618100 From: -24.931000 To: 30.626000
= -25.896203 +/- 18.038586 From: -64.423000 To: 13.864000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.9783 % Filled.
Pdbmat> 967056 non-zero elements.
Pdbmat> 105675 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.69 +/- 25.44
Maximum number = 134
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 2.113500E+06
Pdbmat> Larger element = 482.868
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
341 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607040151152441353.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607040151152441353.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607040151152441353.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2686 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 341 residues.
Blocpdb> 13 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 14
Blocpdb> 13 atoms in block 3
Block first atom: 28
Blocpdb> 22 atoms in block 4
Block first atom: 41
Blocpdb> 16 atoms in block 5
Block first atom: 63
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 79
Blocpdb> 16 atoms in block 7
Block first atom: 95
Blocpdb> 17 atoms in block 8
Block first atom: 111
Blocpdb> 11 atoms in block 9
Block first atom: 128
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 139
Blocpdb> 15 atoms in block 11
Block first atom: 155
Blocpdb> 15 atoms in block 12
Block first atom: 170
Blocpdb> 13 atoms in block 13
Block first atom: 185
Blocpdb> 20 atoms in block 14
Block first atom: 198
Blocpdb> 17 atoms in block 15
Block first atom: 218
Blocpdb> 18 atoms in block 16
Block first atom: 235
Blocpdb> 18 atoms in block 17
Block first atom: 253
Blocpdb> 14 atoms in block 18
Block first atom: 271
Blocpdb> 19 atoms in block 19
Block first atom: 285
Blocpdb> 18 atoms in block 20
Block first atom: 304
Blocpdb> 14 atoms in block 21
Block first atom: 322
Blocpdb> 23 atoms in block 22
Block first atom: 336
Blocpdb> 13 atoms in block 23
Block first atom: 359
Blocpdb> 11 atoms in block 24
Block first atom: 372
Blocpdb> 20 atoms in block 25
Block first atom: 383
Blocpdb> 12 atoms in block 26
Block first atom: 403
Blocpdb> 20 atoms in block 27
Block first atom: 415
Blocpdb> 20 atoms in block 28
Block first atom: 435
Blocpdb> 16 atoms in block 29
Block first atom: 455
Blocpdb> 15 atoms in block 30
Block first atom: 471
Blocpdb> 19 atoms in block 31
Block first atom: 486
Blocpdb> 19 atoms in block 32
Block first atom: 505
Blocpdb> 20 atoms in block 33
Block first atom: 524
Blocpdb> 15 atoms in block 34
Block first atom: 544
Blocpdb> 19 atoms in block 35
Block first atom: 559
Blocpdb> 17 atoms in block 36
Block first atom: 578
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 595
Blocpdb> 17 atoms in block 38
Block first atom: 609
Blocpdb> 18 atoms in block 39
Block first atom: 626
Blocpdb> 18 atoms in block 40
Block first atom: 644
Blocpdb> 20 atoms in block 41
Block first atom: 662
Blocpdb> 21 atoms in block 42
Block first atom: 682
Blocpdb> 16 atoms in block 43
Block first atom: 703
Blocpdb> 16 atoms in block 44
Block first atom: 719
Blocpdb> 16 atoms in block 45
Block first atom: 735
Blocpdb> 16 atoms in block 46
Block first atom: 751
Blocpdb> 17 atoms in block 47
Block first atom: 767
Blocpdb> 14 atoms in block 48
Block first atom: 784
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 798
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 814
Blocpdb> 17 atoms in block 51
Block first atom: 831
Blocpdb> 18 atoms in block 52
Block first atom: 848
Blocpdb> 13 atoms in block 53
Block first atom: 866
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 879
Blocpdb> 21 atoms in block 55
Block first atom: 894
Blocpdb> 17 atoms in block 56
Block first atom: 915
Blocpdb> 22 atoms in block 57
Block first atom: 932
Blocpdb> 17 atoms in block 58
Block first atom: 954
Blocpdb> 13 atoms in block 59
Block first atom: 971
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 984
Blocpdb> 21 atoms in block 61
Block first atom: 1004
Blocpdb> 14 atoms in block 62
Block first atom: 1025
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 1039
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 1053
Blocpdb> 18 atoms in block 65
Block first atom: 1068
Blocpdb> 13 atoms in block 66
Block first atom: 1086
Blocpdb> 16 atoms in block 67
Block first atom: 1099
Blocpdb> 19 atoms in block 68
Block first atom: 1115
Blocpdb> 14 atoms in block 69
Block first atom: 1134
Blocpdb> 14 atoms in block 70
Block first atom: 1148
Blocpdb> 17 atoms in block 71
Block first atom: 1162
Blocpdb> 21 atoms in block 72
Block first atom: 1179
Blocpdb> 18 atoms in block 73
Block first atom: 1200
Blocpdb> 20 atoms in block 74
Block first atom: 1218
Blocpdb> 10 atoms in block 75
Block first atom: 1238
Blocpdb> 19 atoms in block 76
Block first atom: 1248
Blocpdb> 16 atoms in block 77
Block first atom: 1267
Blocpdb> 14 atoms in block 78
Block first atom: 1283
Blocpdb> 16 atoms in block 79
Block first atom: 1297
Blocpdb> 13 atoms in block 80
Block first atom: 1313
Blocpdb> 11 atoms in block 81
Block first atom: 1326
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1337
Blocpdb> 19 atoms in block 83
Block first atom: 1353
Blocpdb> 15 atoms in block 84
Block first atom: 1372
Blocpdb> 17 atoms in block 85
Block first atom: 1387
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1404
Blocpdb> 16 atoms in block 87
Block first atom: 1421
Blocpdb> 11 atoms in block 88
Block first atom: 1437
Blocpdb> 19 atoms in block 89
Block first atom: 1448
Blocpdb> 12 atoms in block 90
Block first atom: 1467
Blocpdb> 12 atoms in block 91
Block first atom: 1479
Blocpdb> 12 atoms in block 92
Block first atom: 1491
Blocpdb> 18 atoms in block 93
Block first atom: 1503
Blocpdb> 12 atoms in block 94
Block first atom: 1521
Blocpdb> 13 atoms in block 95
Block first atom: 1533
Blocpdb> 22 atoms in block 96
Block first atom: 1546
Blocpdb> 18 atoms in block 97
Block first atom: 1568
Blocpdb> 15 atoms in block 98
Block first atom: 1586
Blocpdb> 14 atoms in block 99
Block first atom: 1601
Blocpdb> 19 atoms in block 100
Block first atom: 1615
Blocpdb> 15 atoms in block 101
Block first atom: 1634
Blocpdb> 14 atoms in block 102
Block first atom: 1649
Blocpdb> 12 atoms in block 103
Block first atom: 1663
Blocpdb> 12 atoms in block 104
Block first atom: 1675
Blocpdb> 19 atoms in block 105
Block first atom: 1687
Blocpdb> 14 atoms in block 106
Block first atom: 1706
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 1720
Blocpdb> 20 atoms in block 108
Block first atom: 1738
Blocpdb> 13 atoms in block 109
Block first atom: 1758
Blocpdb> 15 atoms in block 110
Block first atom: 1771
Blocpdb> 17 atoms in block 111
Block first atom: 1786
Blocpdb> 12 atoms in block 112
Block first atom: 1803
Blocpdb> 13 atoms in block 113
Block first atom: 1815
Blocpdb> 15 atoms in block 114
Block first atom: 1828
Blocpdb> 11 atoms in block 115
Block first atom: 1843
Blocpdb> 16 atoms in block 116
Block first atom: 1854
Blocpdb> 9 atoms in block 117
Block first atom: 1870
Blocpdb> 16 atoms in block 118
Block first atom: 1879
Blocpdb> 14 atoms in block 119
Block first atom: 1895
Blocpdb> 6 atoms in block 120
Block first atom: 1909
Blocpdb> 13 atoms in block 121
Block first atom: 1915
Blocpdb> 18 atoms in block 122
Block first atom: 1928
Blocpdb> 11 atoms in block 123
Block first atom: 1946
Blocpdb> 12 atoms in block 124
Block first atom: 1957
Blocpdb> 13 atoms in block 125
Block first atom: 1969
Blocpdb> 16 atoms in block 126
Block first atom: 1982
Blocpdb> 20 atoms in block 127
Block first atom: 1998
Blocpdb> 16 atoms in block 128
Block first atom: 2018
Blocpdb> 10 atoms in block 129
Block first atom: 2034
Blocpdb> 12 atoms in block 130
Block first atom: 2044
Blocpdb> 5 atoms in block 131
Block first atom: 2056
Blocpdb> 13 atoms in block 132
Block first atom: 2061
Blocpdb> 13 atoms in block 133
Block first atom: 2074
Blocpdb> 14 atoms in block 134
Block first atom: 2087
Blocpdb> 12 atoms in block 135
Block first atom: 2101
Blocpdb> 16 atoms in block 136
Block first atom: 2113
Blocpdb> 18 atoms in block 137
Block first atom: 2129
Blocpdb> 13 atoms in block 138
Block first atom: 2147
Blocpdb> 18 atoms in block 139
Block first atom: 2160
Blocpdb> 22 atoms in block 140
Block first atom: 2178
Blocpdb> 13 atoms in block 141
Block first atom: 2200
Blocpdb> 15 atoms in block 142
Block first atom: 2213
Blocpdb> 17 atoms in block 143
Block first atom: 2228
Blocpdb> 10 atoms in block 144
Block first atom: 2245
Blocpdb> 15 atoms in block 145
Block first atom: 2255
Blocpdb> 22 atoms in block 146
Block first atom: 2270
Blocpdb> 18 atoms in block 147
Block first atom: 2292
Blocpdb> 11 atoms in block 148
Block first atom: 2310
Blocpdb> 18 atoms in block 149
Block first atom: 2321
Blocpdb> 18 atoms in block 150
Block first atom: 2339
Blocpdb> 19 atoms in block 151
Block first atom: 2357
Blocpdb> 10 atoms in block 152
Block first atom: 2376
Blocpdb> 16 atoms in block 153
Block first atom: 2386
Blocpdb> 13 atoms in block 154
Block first atom: 2402
Blocpdb> 17 atoms in block 155
Block first atom: 2415
Blocpdb> 13 atoms in block 156
Block first atom: 2432
Blocpdb> 11 atoms in block 157
Block first atom: 2445
Blocpdb> 12 atoms in block 158
Block first atom: 2456
Blocpdb> 16 atoms in block 159
Block first atom: 2468
Blocpdb> 18 atoms in block 160
Block first atom: 2484
Blocpdb> 17 atoms in block 161
Block first atom: 2502
Blocpdb> 17 atoms in block 162
Block first atom: 2519
Blocpdb> 18 atoms in block 163
Block first atom: 2536
Blocpdb> 13 atoms in block 164
Block first atom: 2554
Blocpdb> 15 atoms in block 165
Block first atom: 2567
Blocpdb> 14 atoms in block 166
Block first atom: 2582
Blocpdb> 18 atoms in block 167
Block first atom: 2596
Blocpdb> 16 atoms in block 168
Block first atom: 2614
Blocpdb> 17 atoms in block 169
Block first atom: 2630
Blocpdb> 16 atoms in block 170
Block first atom: 2647
Blocpdb> 13 atoms in block 171
Block first atom: 2663
Blocpdb> 11 atoms in block 172
Block first atom: 2675
Blocpdb> 172 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 967228 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 8058
Prepmat> Matrix trace = 2113500.0000
Prepmat> Last element read: 8058 8058 12.9291
Prepmat> 14879 lines saved.
Prepmat> 13111 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2686
RTB> Total mass = 2686.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2686
RTB> Number of blocks = 172
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 225187.2882
RTB> 61032 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1032
Diagstd> Nb of non-zero elements: 61032
Diagstd> Projected matrix trace = 225187.2882
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1032 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 225187.2882
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.5986550 0.9267343 1.1722171 1.8932353
2.5024851 2.6921559 3.5270064 3.7360418 4.5638195
4.7883917 4.9508331 5.8742452 6.5359048 6.7621152
7.3069491 7.8135526 8.3715385 8.9741664 9.1276492
9.6766843 10.0757887 11.1489765 11.5491020 12.1105314
12.5608483 13.2988097 13.9393854 14.5811029 14.7646776
15.1936078 15.5904448 16.5003085 17.0503710 17.3724767
17.8592294 18.1988948 18.5116931 19.3464924 19.6563567
20.4784707 20.9063580 21.2499684 22.4366404 22.6505739
23.2651934 23.4765539 23.6902594 24.8737255 25.8866099
26.7430132 27.1888890 27.8854013 28.8752730 29.0691996
29.6457632 29.8144780 30.5790472 31.2731884 31.6631361
32.0438175 32.3608710 32.8014566 33.3465047 34.6583087
35.2976086 35.6605828 36.1185540 36.9255739 37.8948452
38.2734405 38.4342627 39.4658018 39.5425309 40.0677677
40.3666372 40.5153479 40.8614688 41.3110416 41.7593572
42.5259919 42.9078431 44.0232912 44.3642667 44.4296026
44.7767341 45.3866753 45.5048862 45.9171842 46.2256022
46.5685912 46.7988283 47.8093851 48.4800841 48.8131313
49.4014869 49.6198427 50.3833482 50.9993121 51.3285671
51.9344671
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034330 0.0034334 0.0034339 0.0034347 0.0034358
0.0034362 84.0201751 104.5376926 117.5707548 149.4161605
171.7833362 178.1744323 203.9381166 209.8945404 231.9847905
237.6238985 241.6208586 263.1911701 277.6183319 282.3817089
293.5373167 303.5425313 314.1940242 325.3061984 328.0762193
337.7991610 344.6948585 362.5874606 369.0365565 377.8999904
384.8617641 396.0059092 405.4311313 414.6583996 417.2604902
423.2780379 428.7701405 441.1043207 448.3964826 452.6120889
458.9090667 463.2525165 467.2166928 477.6352807 481.4451242
491.4100574 496.5173994 500.5810722 514.3682977 516.8147325
523.7796416 526.1534880 528.5428332 541.5838426 552.5007476
561.5655395 566.2275691 573.4343830 583.5234714 585.4796672
591.2574117 592.9374555 600.4920399 607.2693484 611.0436629
614.7059330 617.7395134 621.9304849 627.0763755 639.2915485
645.1607254 648.4694167 652.6201183 659.8707945 668.4752752
671.8062384 673.2161992 682.1906233 682.8534555 687.3736091
689.9324408 691.2021277 694.1483039 697.9564951 701.7334564
708.1455110 711.3177105 720.5042283 723.2891225 723.8215264
726.6436577 731.5760271 732.5281126 735.8391733 738.3062908
741.0403060 742.8699146 750.8477074 756.0960387 758.6886975
763.2473246 764.9322507 770.7948292 775.4922099 777.9914976
782.5698651
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2686
Rtb_to_modes> Number of blocs = 172
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5987
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9267
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.172
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.893
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.502
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.692
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.527
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.736
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.564
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.788
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.951
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.874
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.536
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.762
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.307
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.814
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.372
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.974
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.128
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.677
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.93
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1032 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00005
1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999
0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999
1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00003
0.99998 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999
0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000
0.99999 1.00003 1.00002 0.99998 0.99998
1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001
1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00003
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 48348 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00005
1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999
0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999
1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00003
0.99998 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999
0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000
0.99999 1.00003 1.00002 0.99998 0.99998
1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001
1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00003
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607040151152441353.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607040151152441353.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607040151152441353.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607040151152441353.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 341
First residue number = 49
Last residue number = 529
Number of atoms found = 2686
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5987
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9267
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.172
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.893
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.502
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.692
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.527
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.736
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.564
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.788
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.951
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.874
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.536
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.762
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.307
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.814
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.372
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.974
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.128
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.677
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.93
Bfactors> 106 vectors, 8058 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.598700
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.375 for 341 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.054 +/- 0.07
Bfactors> = 35.509 +/- 14.70
Bfactors> Shiftng-fct= 35.455
Bfactors> Scaling-fct= 213.460
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607040151152441353.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607040151152441353.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.5
Chkmod> 106 vectors, 8058 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2686 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9654
0.0034 0.6272
0.0034 0.8363
0.0034 0.7375
0.0034 0.8634
0.0034 0.7015
84.0197 0.4841
104.5313 0.3933
117.5548 0.4869
149.4005 0.2384
171.7593 0.3046
178.1616 0.3252
203.9292 0.4247
209.8844 0.1167
231.9794 0.2507
237.6040 0.2291
241.6146 0.1672
263.1744 0.1109
277.6084 0.3978
282.3672 0.3464
293.5257 0.4452
303.5382 0.3936
314.1892 0.1889
325.2892 0.2601
328.0684 0.2827
337.7902 0.3276
344.7521 0.1226
362.5885 0.1771
369.0351 0.1284
377.8755 0.2322
384.8322 0.3510
396.0066 0.2449
405.4227 0.2867
414.6249 0.3798
417.1765 0.1369
423.2096 0.2133
428.7456 0.1495
441.0813 0.1663
448.3724 0.3579
452.5604 0.1192
458.8993 0.2809
463.2467 0.2248
467.1753 0.3058
477.6581 0.3371
481.4691 0.2071
491.4073 0.3542
496.5393 0.4192
500.5600 0.2920
514.3847 0.2846
516.7860 0.3846
523.8113 0.2762
526.1695 0.3357
528.5173 0.3331
541.5200 0.3110
552.5132 0.3855
561.5098 0.3226
566.2148 0.3515
573.4570 0.4004
583.5462 0.3573
585.4626 0.3182
591.2743 0.3605
592.8675 0.2738
600.4756 0.3967
607.2123 0.3739
610.9872 0.3435
614.6429 0.4597
617.7047 0.3857
621.8900 0.3795
627.0823 0.3906
639.2797 0.3812
645.1549 0.2270
648.4363 0.3824
652.6052 0.3298
659.8820 0.2719
668.4038 0.3697
671.7472 0.4741
673.1500 0.4100
682.1976 0.2799
682.8023 0.2856
687.3632 0.2813
689.9316 0.2605
691.2121 0.2074
694.1060 0.2530
697.9177 0.1812
701.7087 0.3117
708.1485 0.3930
711.3051 0.3194
720.4464 0.3048
723.2233 0.3856
723.7937 0.2606
726.6390 0.3929
731.5714 0.3584
732.4573 0.1210
735.8301 0.4118
738.3097 0.4008
741.0197 0.3415
742.8473 0.3637
750.8203 0.3521
756.0629 0.2534
758.6318 0.1472
763.2031 0.1085
764.9006 0.2134
770.7361 0.1405
775.4641 0.3873
777.9690 0.2796
782.5026 0.4095
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2607040151152441353 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
making animated gifs
11 models are in 2607040151152441353.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607040151152441353.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607040151152441353.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2607040151152441353 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
making animated gifs
11 models are in 2607040151152441353.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607040151152441353.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607040151152441353.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2607040151152441353 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
making animated gifs
11 models are in 2607040151152441353.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607040151152441353.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607040151152441353.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2607040151152441353 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
making animated gifs
11 models are in 2607040151152441353.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607040151152441353.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607040151152441353.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2607040151152441353 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607040151152441353.eigenfacs
2607040151152441353.atom
making animated gifs
11 models are in 2607040151152441353.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607040151152441353.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607040151152441353.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2607040151152441353.10.pdb
2607040151152441353.11.pdb
2607040151152441353.7.pdb
2607040151152441353.8.pdb
2607040151152441353.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m13.905s
user 0m13.835s
sys 0m0.067s
rm: cannot remove '2607040151152441353.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
