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***  RECOMBINATION/DNA 24-JAN-08 3C29  ***

CA distance fluctuations for 2607041105042519188

---  normal mode 11  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
PRO 307 0.03 SER 20 -0.06 THR 253
PRO 307 0.03 ASP 21 -0.06 THR 253
PRO 105 0.04 GLU 22 -0.06 THR 253
PRO 307 0.04 VAL 23 -0.06 THR 253
PRO 307 0.04 ARG 24 -0.06 THR 253
PRO 307 0.04 LYS 25 -0.06 THR 253
PRO 307 0.04 ASN 26 -0.06 THR 253
PRO 307 0.04 LEU 27 -0.07 THR 253
PRO 307 0.04 MET 28 -0.06 THR 253
PRO 307 0.04 ASP 29 -0.06 THR 253
PRO 307 0.04 MET 30 -0.07 THR 253
SER 254 0.04 PHE 31 -0.07 THR 253
THR 253 0.04 ARG 32 -0.06 THR 253
THR 253 0.04 ASP 33 -0.07 THR 253
SER 254 0.04 ARG 34 -0.07 THR 253
THR 253 0.04 GLN 35 -0.07 THR 253
PRO 307 0.04 ALA 36 -0.07 THR 253
PRO 307 0.05 PHE 37 -0.08 THR 253
PRO 307 0.04 SER 38 -0.08 THR 253
PRO 307 0.04 GLU 39 -0.08 THR 253
PRO 307 0.04 HIS 40 -0.09 ASN 235
PRO 307 0.05 THR 41 -0.09 THR 253
PRO 307 0.04 TRP 42 -0.09 THR 253
PRO 307 0.04 LYS 43 -0.09 THR 253
PRO 307 0.04 MET 44 -0.10 THR 253
PRO 307 0.05 LEU 45 -0.09 THR 253
PRO 307 0.04 LEU 46 -0.09 THR 253
PRO 307 0.04 SER 47 -0.10 THR 253
PRO 307 0.04 VAL 48 -0.10 THR 253
PRO 307 0.04 CYS 49 -0.09 THR 253
PRO 307 0.04 ARG 50 -0.10 THR 253
PRO 307 0.04 SER 51 -0.11 THR 253
PRO 307 0.04 TRP 52 -0.10 THR 253
PRO 307 0.03 ALA 53 -0.09 THR 253
PRO 307 0.03 ALA 54 -0.10 THR 253
PRO 307 0.03 TRP 55 -0.11 THR 253
THR 316 0.03 CYS 56 -0.10 THR 253
PRO 307 0.03 LYS 57 -0.09 THR 253
PRO 307 0.03 LEU 58 -0.10 THR 253
THR 316 0.03 ASN 59 -0.10 THR 253
THR 316 0.03 ASN 60 -0.09 THR 253
THR 316 0.03 ARG 61 -0.09 THR 253
THR 316 0.03 LYS 62 -0.08 THR 253
THR 316 0.04 TRP 63 -0.09 THR 253
THR 316 0.04 PHE 64 -0.08 THR 253
THR 316 0.04 PRO 65 -0.07 THR 253
THR 316 0.04 ALA 66 -0.08 THR 253
THR 316 0.04 GLU 67 -0.08 THR 253
THR 316 0.04 PRO 68 -0.08 THR 253
THR 316 0.04 GLU 69 -0.08 THR 253
THR 316 0.04 ASP 70 -0.09 THR 253
THR 316 0.04 VAL 71 -0.10 THR 253
THR 316 0.04 ARG 72 -0.10 THR 253
THR 316 0.03 ASP 73 -0.11 THR 253
THR 316 0.03 TYR 74 -0.12 THR 253
THR 316 0.04 LEU 75 -0.12 THR 253
THR 316 0.03 LEU 76 -0.14 THR 253
PRO 307 0.03 TYR 77 -0.14 THR 253
PRO 307 0.03 LEU 78 -0.14 THR 253
GLN 311 0.03 GLN 79 -0.16 THR 253
PRO 307 0.02 ALA 80 -0.18 THR 253
PRO 307 0.03 ARG 81 -0.17 THR 253
GLN 311 0.03 GLY 82 -0.18 THR 253
PRO 307 0.03 LEU 83 -0.16 THR 253
GLN 311 0.04 ALA 84 -0.15 THR 253
GLN 311 0.05 VAL 85 -0.14 THR 253
PRO 307 0.05 LYS 86 -0.12 THR 253
PRO 307 0.05 THR 87 -0.12 THR 253
THR 316 0.05 ILE 88 -0.12 THR 253
THR 316 0.06 GLN 89 -0.11 THR 253
PRO 307 0.05 GLN 90 -0.10 THR 253
THR 316 0.05 HIS 91 -0.11 THR 253
THR 316 0.05 LEU 92 -0.10 THR 253
THR 316 0.06 GLY 93 -0.09 THR 253
PRO 307 0.05 GLN 94 -0.09 THR 253
THR 316 0.05 LEU 95 -0.09 THR 253
THR 316 0.05 ASN 96 -0.08 THR 253
PRO 307 0.05 MET 97 -0.08 THR 253
PRO 307 0.05 LEU 98 -0.08 THR 253
THR 316 0.05 HIS 99 -0.07 THR 253
THR 316 0.05 ARG 100 -0.07 THR 253
PRO 307 0.05 ARG 101 -0.07 THR 253
PRO 307 0.04 SER 102 -0.07 THR 253
ASN 317 0.04 GLY 103 -0.06 THR 253
ASN 317 0.04 LEU 104 -0.07 THR 253
THR 316 0.05 PRO 105 -0.07 THR 253
THR 316 0.05 ARG 106 -0.08 THR 253
THR 316 0.05 PRO 107 -0.08 THR 253
THR 316 0.06 SER 108 -0.08 THR 253
THR 316 0.06 ASP 109 -0.06 THR 253
THR 316 0.05 SER 110 -0.07 THR 253
THR 316 0.04 ASN 111 -0.06 THR 253
THR 316 0.04 ALA 112 -0.08 THR 253
THR 316 0.05 VAL 113 -0.09 THR 253
THR 316 0.05 SER 114 -0.08 THR 253
THR 316 0.04 LEU 115 -0.08 THR 253
TRP 315 0.04 VAL 116 -0.10 THR 253
TRP 315 0.04 MET 117 -0.10 THR 253
TRP 315 0.04 ARG 118 -0.09 THR 253
TRP 315 0.03 ARG 119 -0.11 THR 253
GLY 314 0.03 ILE 120 -0.13 THR 253
GLY 314 0.04 ARG 121 -0.12 THR 253
LEU 203 0.04 LYS 122 -0.12 THR 253
LEU 203 0.02 GLU 123 -0.17 THR 253
ASP 189 0.03 ASN 124 -0.17 THR 253
ASP 189 0.03 VAL 125 -0.14 THR 253
ASP 189 0.03 ASP 126 -0.17 THR 253
ASP 189 0.03 ALA 127 -0.23 THR 253
ASP 189 0.03 GLY 128 -0.19 ALA 252
ASP 189 0.03 GLU 129 -0.16 ASN 235
GLY 333 0.03 ARG 130 -0.14 ASN 235
GLY 333 0.04 ALA 131 -0.12 ASN 235
GLU 308 0.03 LYS 132 -0.16 ASN 235
GLU 308 0.03 GLN 133 -0.14 PRO 234
SER 305 0.02 ALA 134 -0.14 PRO 234
PHE 31 0.01 LEU 135 -0.15 PRO 234
HIS 40 0.01 ALA 136 -0.12 PRO 234
HIS 40 0.02 PHE 137 -0.11 PRO 234
ARG 34 0.01 GLU 138 -0.10 THR 140
ARG 34 0.02 ARG 139 -0.11 THR 140
ARG 34 0.01 THR 140 -0.10 THR 140
PHE 31 0.02 ASP 141 -0.10 PRO 234
ARG 34 0.02 PHE 142 -0.10 TYR 273
ARG 34 0.02 ASP 143 -0.11 TYR 273
PHE 31 0.02 GLN 144 -0.10 TYR 273
PHE 31 0.02 VAL 145 -0.10 TYR 273
ARG 34 0.02 ARG 146 -0.10 TYR 273
PHE 31 0.02 SER 147 -0.10 TYR 273
PHE 31 0.02 LEU 148 -0.09 TYR 273
PHE 31 0.02 MET 149 -0.10 TYR 273
PHE 31 0.02 GLU 150 -0.10 TYR 273
PHE 31 0.02 ASN 151 -0.10 TYR 273
PHE 31 0.02 SER 152 -0.10 TYR 273
PHE 31 0.02 ASP 153 -0.10 TYR 273
PHE 31 0.02 ARG 154 -0.09 ASP 277
PHE 31 0.03 CYS 155 -0.10 ASP 277
PHE 31 0.03 GLN 156 -0.10 ASP 277
PHE 31 0.02 ASP 157 -0.10 ASP 277
PHE 31 0.02 ILE 158 -0.11 ASP 277
ARG 34 0.03 ARG 159 -0.11 ASP 277
ARG 34 0.03 ASN 160 -0.10 ASP 277
ARG 34 0.02 LEU 161 -0.11 TYR 273
ARG 34 0.02 ALA 162 -0.12 ASP 277
ARG 34 0.02 PHE 163 -0.11 ASP 277
ARG 34 0.02 LEU 164 -0.11 ASP 277
ARG 34 0.02 GLY 165 -0.12 TYR 273
GLN 35 0.02 ILE 166 -0.12 ASP 277
GLN 35 0.02 ALA 167 -0.11 ASP 277
ARG 34 0.02 TYR 168 -0.11 TYR 273
GLY 303 0.02 ASN 169 -0.13 TYR 273
GLY 303 0.03 THR 170 -0.12 TYR 273
SER 305 0.03 LEU 171 -0.11 ASP 277
SER 305 0.03 LEU 172 -0.11 SER 279
SER 305 0.03 ARG 173 -0.10 SER 279
SER 305 0.03 ILE 174 -0.10 SER 279
GLN 35 0.03 ALA 175 -0.11 SER 279
SER 305 0.03 GLU 176 -0.12 SER 279
SER 305 0.03 ILE 177 -0.12 SER 279
GLN 35 0.03 ALA 178 -0.12 SER 279
GLN 35 0.03 ARG 179 -0.13 SER 279
SER 305 0.03 ILE 180 -0.14 SER 279
GLU 123 0.03 ARG 181 -0.15 SER 279
GLU 123 0.02 VAL 182 -0.16 SER 279
GLY 303 0.02 LYS 183 -0.19 SER 279
GLY 303 0.03 ASP 184 -0.19 SER 279
GLY 303 0.02 ILE 185 -0.19 ASP 277
GLY 303 0.02 SER 186 -0.21 ASP 277
GLY 303 0.02 ARG 187 -0.21 ASP 277
GLY 303 0.02 THR 188 -0.23 TYR 273
GLY 303 0.02 ASP 189 -0.25 TYR 273
GLY 303 0.02 GLY 190 -0.22 TYR 273
GLY 303 0.01 GLY 191 -0.20 TYR 273
GLY 303 0.02 ARG 192 -0.19 TYR 273
GLY 303 0.02 MET 193 -0.17 ASP 277
GLY 303 0.02 LEU 194 -0.18 ASP 277
GLY 303 0.03 ILE 195 -0.17 ASP 277
GLY 303 0.03 HIS 196 -0.19 SER 279
SER 305 0.03 ILE 197 -0.16 SER 279
SER 305 0.03 GLY 198 -0.17 SER 279
ASP 126 0.04 ARG 199 -0.14 SER 279
SER 305 0.04 THR 200 -0.12 SER 279
SER 305 0.05 LYS 201 -0.10 SER 279
SER 305 0.05 THR 202 -0.09 GLN 281
SER 305 0.05 LEU 203 -0.09 GLN 281
SER 305 0.05 VAL 204 -0.08 GLN 281
SER 305 0.05 SER 205 -0.10 GLN 281
SER 305 0.05 THR 206 -0.09 LEU 284
SER 305 0.04 ALA 207 -0.11 LEU 284
GLY 303 0.04 GLY 208 -0.13 LEU 284
GLY 303 0.03 VAL 209 -0.16 GLN 281
GLY 303 0.03 GLU 210 -0.16 LEU 284
GLY 303 0.03 LYS 211 -0.15 ASP 277
GLY 303 0.02 ALA 212 -0.17 TYR 273
GLY 303 0.02 LEU 213 -0.16 TYR 273
GLN 35 0.01 SER 214 -0.16 TYR 273
ARG 34 0.01 LEU 215 -0.16 TYR 273
ARG 34 0.02 GLY 216 -0.14 TYR 273
GLN 35 0.02 VAL 217 -0.14 TYR 273
GLN 35 0.02 THR 218 -0.15 TYR 273
ARG 34 0.02 LYS 219 -0.14 TYR 273
ARG 34 0.02 LEU 220 -0.13 TYR 273
ARG 34 0.02 VAL 221 -0.13 ASP 277
ARG 34 0.02 GLU 222 -0.14 ASP 277
ARG 34 0.02 ARG 223 -0.12 ASP 277
ARG 34 0.02 TRP 224 -0.12 ASP 277
ARG 34 0.02 ILE 225 -0.13 ASP 277
PHE 31 0.02 SER 226 -0.12 ASP 277
PHE 31 0.02 VAL 227 -0.11 ASP 277
PHE 31 0.02 SER 228 -0.11 ASP 278
ARG 32 0.02 GLY 229 -0.12 ASP 278
ARG 32 0.02 VAL 230 -0.13 ASP 278
ARG 32 0.02 ALA 231 -0.14 ASP 278
ARG 32 0.02 ASP 232 -0.13 ASP 278
ARG 32 0.02 ASP 233 -0.14 ASP 278
GLU 123 0.02 PRO 234 -0.16 ASP 278
GLU 123 0.03 ASN 235 -0.14 SER 279
GLN 35 0.03 ASN 236 -0.13 ASP 278
GLN 35 0.03 TYR 237 -0.13 SER 279
GLN 35 0.03 LEU 238 -0.13 SER 279
ARG 34 0.03 PHE 239 -0.12 SER 279
ARG 34 0.03 CYS 240 -0.11 ASP 278
PHE 31 0.03 ARG 241 -0.10 ASP 278
PHE 31 0.03 VAL 242 -0.09 ASP 278
PHE 31 0.03 ARG 243 -0.09 ASP 233
PHE 31 0.03 LYS 244 -0.10 ASP 232
PHE 31 0.03 ASN 245 -0.09 ASP 232
PHE 31 0.03 GLY 246 -0.09 ASP 277
PHE 31 0.03 VAL 247 -0.09 ASP 278
PHE 31 0.03 ALA 248 -0.10 ASP 278
ARG 32 0.03 ALA 249 -0.10 ASP 278
ARG 32 0.03 PRO 250 -0.11 ASP 278
ARG 32 0.04 SER 251 -0.11 ASP 278
GLN 35 0.04 ALA 252 -0.12 SER 279
GLN 35 0.04 THR 253 -0.11 SER 279
ARG 34 0.04 SER 254 -0.10 SER 279
GLN 35 0.04 GLN 255 -0.11 SER 279
ARG 34 0.04 LEU 256 -0.10 SER 279
ARG 34 0.04 SER 257 -0.10 ASP 233
GLU 39 0.04 THR 258 -0.10 PRO 234
GLU 39 0.04 ARG 259 -0.11 PRO 234
PHE 31 0.03 ALA 260 -0.11 ASP 233
ARG 34 0.03 LEU 261 -0.11 PRO 234
HIS 40 0.03 GLU 262 -0.12 PRO 234
PHE 31 0.03 GLY 263 -0.12 ASP 233
PHE 31 0.03 ILE 264 -0.11 PRO 234
PHE 31 0.02 PHE 265 -0.12 PRO 234
PHE 31 0.02 GLU 266 -0.13 PRO 234
PHE 31 0.02 ALA 267 -0.12 ASP 233
PHE 31 0.02 THR 268 -0.11 ASP 233
PHE 31 0.02 HIS 269 -0.13 PRO 234
PHE 31 0.02 ARG 270 -0.14 ASP 232
PHE 31 0.02 LEU 271 -0.12 ASP 232
PHE 31 0.02 ILE 272 -0.12 ASP 232
PHE 31 0.02 TYR 273 -0.14 ASP 232
PHE 31 0.02 GLY 274 -0.15 ASP 232
PHE 31 0.02 ALA 275 -0.16 ASP 232
PHE 31 0.02 LYS 276 -0.18 ASP 233
PHE 31 0.02 ASP 277 -0.21 ASP 233
ALA 54 0.02 ASP 278 -0.20 ASP 233
ARG 81 0.02 SER 279 -0.23 ASP 233
ALA 54 0.02 GLY 280 -0.20 ASP 233
ARG 81 0.02 GLN 281 -0.22 PRO 234
LEU 27 0.02 ARG 282 -0.19 PRO 234
LEU 284 0.02 TYR 283 -0.18 PRO 234
TYR 283 0.02 LEU 284 -0.19 PRO 234
PHE 31 0.02 ALA 285 -0.16 PRO 234
PHE 31 0.02 TRP 286 -0.14 PRO 234
HIS 40 0.02 SER 287 -0.13 PRO 234
HIS 40 0.02 GLY 288 -0.12 PRO 234
SER 305 0.03 HIS 289 -0.11 PRO 234
SER 305 0.02 SER 290 -0.12 PRO 234
SER 305 0.02 ALA 291 -0.10 PRO 234
SER 305 0.03 ARG 292 -0.10 PRO 234
SER 305 0.03 VAL 293 -0.10 PRO 234
GLY 303 0.02 GLY 294 -0.10 THR 140
GLY 303 0.02 ALA 295 -0.11 THR 140
GLY 303 0.03 ALA 296 -0.11 THR 140
GLY 303 0.02 ARG 297 -0.10 THR 140
ASP 341 0.02 ASP 298 -0.12 THR 140
ALA 302 0.02 MET 299 -0.13 THR 140
GLY 303 0.03 ALA 300 -0.11 THR 140
ASP 341 0.02 ARG 301 -0.11 THR 140
ASP 341 0.02 ALA 302 -0.13 THR 140
ASP 341 0.04 GLY 303 -0.13 THR 140
ASP 341 0.04 VAL 304 -0.14 THR 140
ASP 341 0.04 SER 305 -0.13 ARG 301
GLY 303 0.05 ILE 306 -0.09 THR 140
GLY 303 0.05 PRO 307 -0.10 ARG 297
PRO 307 0.05 GLU 308 -0.12 THR 140
GLY 303 0.04 ILE 309 -0.11 THR 140
SER 305 0.05 MET 310 -0.09 THR 140
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SER 279 0.11 ASP 126 -0.05 ARG 199
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