***  RECOMBINATION/DNA 24-JAN-08 3C29  ***

CA distance fluctuations for 2607041105042519188

---  normal mode 7  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner). The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations. [HELP on distance fluctuations]

GD ok

largest increase			ref	largest decrease
THR 253		0.03	SER 20	-0.09		SER 20
ASN 60		0.03	ASP 21	-0.08		SER 20
GLU 69		0.04	GLU 22	-0.08		SER 20
PRO 65		0.04	VAL 23	-0.08		SER 20
THR 253		0.03	ARG 24	-0.07		SER 20
GLU 69		0.03	LYS 25	-0.07		SER 20
GLU 69		0.04	ASN 26	-0.07		PRO 105
THR 253		0.03	LEU 27	-0.07		SER 20
THR 253		0.03	MET 28	-0.06		SER 20
SER 102		0.03	ASP 29	-0.06		PRO 105
THR 253		0.03	MET 30	-0.06		PRO 105
ASN 235		0.03	PHE 31	-0.06		SER 20
THR 253		0.02	ARG 32	-0.05		SER 20
THR 253		0.02	ASP 33	-0.05		PRO 105
ASN 235		0.02	ARG 34	-0.05		SER 20
ALA 36		0.03	GLN 35	-0.05		THR 253
GLN 35		0.03	ALA 36	-0.05		PRO 105
ASN 235		0.03	PHE 37	-0.05		PRO 105
ASN 235		0.02	SER 38	-0.04		GLU 22
ASN 235		0.03	GLU 39	-0.04		SER 20
ASN 235		0.03	HIS 40	-0.04		GLU 22
ASN 235		0.03	THR 41	-0.04		GLU 22
ASN 235		0.03	TRP 42	-0.05		GLU 22
ASN 235		0.04	LYS 43	-0.05		GLU 22
ASN 235		0.04	MET 44	-0.05		GLU 22
ASN 235		0.04	LEU 45	-0.05		GLU 22
ASN 235		0.04	LEU 46	-0.05		GLU 22
ASN 235		0.05	SER 47	-0.05		GLU 22
ASN 235		0.05	VAL 48	-0.05		GLU 22
ASN 235		0.04	CYS 49	-0.05		GLU 22
ASP 233		0.05	ARG 50	-0.05		GLU 22
ASN 235		0.05	SER 51	-0.05		GLU 22
THR 253		0.05	TRP 52	-0.05		GLU 22
THR 253		0.05	ALA 53	-0.05		GLU 22
ASP 233		0.05	ALA 54	-0.05		GLU 22
THR 253		0.06	TRP 55	-0.05		GLY 103
THR 253		0.05	CYS 56	-0.05		GLY 103
THR 253		0.05	LYS 57	-0.05		GLU 22
THR 253		0.06	LEU 58	-0.05		GLY 103
THR 253		0.06	ASN 59	-0.05		GLY 103
THR 253		0.05	ASN 60	-0.06		GLY 103
THR 253		0.05	ARG 61	-0.06		GLY 103
THR 253		0.04	LYS 62	-0.06		GLU 22
THR 253		0.04	TRP 63	-0.06		GLU 22
THR 253		0.04	PHE 64	-0.07		GLU 22
GLU 67		0.04	PRO 65	-0.07		GLU 22
ASP 109		0.04	ALA 66	-0.07		GLU 22
PRO 105		0.04	GLU 67	-0.08		GLY 103
PRO 105		0.05	PRO 68	-0.08		GLY 103
PRO 105		0.05	GLU 69	-0.08		GLY 103
THR 253		0.05	ASP 70	-0.07		GLY 103
THR 253		0.04	VAL 71	-0.06		GLY 103
THR 253		0.05	ARG 72	-0.06		GLY 103
THR 253		0.06	ASP 73	-0.06		GLY 103
THR 253		0.06	TYR 74	-0.05		GLY 103
THR 253		0.06	LEU 75	-0.04		GLY 103
THR 253		0.06	LEU 76	-0.05		GLY 103
THR 253		0.07	TYR 77	-0.04		GLY 103
ASN 235		0.06	LEU 78	-0.04		GLY 103
THR 253		0.07	GLN 79	-0.04		GLY 103
THR 253		0.08	ALA 80	-0.04		GLY 103
ASN 235		0.08	ARG 81	-0.03		GLY 280
ASN 235		0.09	GLY 82	-0.03		GLN 281
ASN 235		0.07	LEU 83	-0.03		GLN 281
GLU 129		0.06	ALA 84	-0.03		GLY 103
ASN 235		0.05	VAL 85	-0.03		GLU 22
ASN 235		0.04	LYS 86	-0.03		GLU 22
ASN 235		0.05	THR 87	-0.03		GLU 22
ASN 235		0.05	ILE 88	-0.04		GLY 103
ASN 235		0.04	GLN 89	-0.04		GLU 22
ASN 235		0.04	GLN 90	-0.04		GLU 22
ASN 235		0.04	HIS 91	-0.05		GLU 22
THR 253		0.04	LEU 92	-0.05		GLU 22
ASN 235		0.03	GLY 93	-0.05		GLU 22
ASN 235		0.04	GLN 94	-0.05		GLU 22
THR 253		0.04	LEU 95	-0.06		GLU 22
ASP 109		0.05	ASN 96	-0.06		GLU 22
ASP 109		0.04	MET 97	-0.06		GLY 103
ASP 109		0.03	LEU 98	-0.06		GLU 22
ASP 109		0.05	HIS 99	-0.07		GLU 22
ASP 109		0.06	ARG 100	-0.07		GLY 103
ASN 111		0.06	ARG 101	-0.07		GLY 103
PRO 68		0.05	SER 102	-0.07		GLY 103
SER 110		0.07	GLY 103	-0.08		GLY 103
ASP 109		0.06	LEU 104	-0.08		GLU 22
ASP 109		0.06	PRO 105	-0.08		GLY 103
ASP 109		0.05	ARG 106	-0.07		GLU 22
PRO 105		0.04	PRO 107	-0.06		GLU 22
ASP 109		0.06	SER 108	-0.06		ASP 109
PRO 105		0.07	ASP 109	-0.08		ASP 109
PRO 105		0.07	SER 110	-0.08		GLY 103
GLY 103		0.07	ASN 111	-0.08		GLY 103
GLY 103		0.06	ALA 112	-0.07		GLY 103
PRO 105		0.05	VAL 113	-0.05		GLY 103
PRO 105		0.06	SER 114	-0.05		ARG 100
GLY 103		0.05	LEU 115	-0.05		ARG 101
GLY 103		0.05	VAL 116	-0.04		ARG 101
PRO 105		0.05	MET 117	-0.03		ASP 109
GLY 103		0.05	ARG 118	-0.03		ASP 109
GLY 103		0.04	ARG 119	-0.03		ALA 36
THR 253		0.05	ILE 120	-0.03		ARG 101
THR 253		0.04	ARG 121	-0.02		ASP 109
THR 253		0.04	LYS 122	-0.02		GLY 303
THR 253		0.06	GLU 123	-0.04		ASN 124
GLN 79		0.05	ASN 124	-0.04		GLU 123
ARG 179		0.04	VAL 125	-0.03		GLY 303
ARG 179		0.06	ASP 126	-0.03		GLY 303
ALA 252		0.06	ALA 127	-0.03		THR 140
ASN 235		0.06	GLY 128	-0.03		THR 140
ALA 84		0.06	GLU 129	-0.03		THR 140
ALA 84		0.05	ARG 130	-0.03		ASN 323
ALA 84		0.03	ALA 131	-0.04		LYS 132
SER 186		0.06	LYS 132	-0.04		ALA 131
GLY 303		0.05	GLN 133	-0.03		ALA 131
ASP 189		0.06	ALA 134	-0.03		SER 279
ASP 189		0.08	LEU 135	-0.03		SER 279
ASP 189		0.07	ALA 136	-0.03		SER 279
ASP 189		0.07	PHE 137	-0.04		SER 279
GLY 303		0.07	GLU 138	-0.04		SER 279
GLY 303		0.08	ARG 139	-0.04		SER 279
GLY 303		0.08	THR 140	-0.04		SER 279
ASP 189		0.08	ASP 141	-0.04		SER 279
GLY 303		0.07	PHE 142	-0.05		SER 279
ASP 341		0.08	ASP 143	-0.05		SER 279
ASP 341		0.07	GLN 144	-0.04		SER 279
ASP 341		0.07	VAL 145	-0.04		SER 279
ASP 341		0.07	ARG 146	-0.05		SER 279
ASP 341		0.07	SER 147	-0.05		SER 279
ASP 341		0.07	LEU 148	-0.04		SER 279
ASP 341		0.06	MET 149	-0.05		SER 279
ASP 341		0.07	GLU 150	-0.05		SER 279
ASP 341		0.06	ASN 151	-0.05		SER 279
ASP 341		0.06	SER 152	-0.05		SER 279
ASP 341		0.06	ASP 153	-0.05		SER 279
ASP 341		0.05	ARG 154	-0.05		SER 279
ASP 341		0.05	CYS 155	-0.05		SER 279
ASP 341		0.05	GLN 156	-0.05		SER 279
ASP 341		0.06	ASP 157	-0.05		SER 279
ASP 341		0.05	ILE 158	-0.05		SER 279
ASP 341		0.05	ARG 159	-0.05		SER 279
ASP 341		0.05	ASN 160	-0.05		SER 279
ASP 341		0.06	LEU 161	-0.05		SER 279
GLY 303		0.06	ALA 162	-0.06		SER 279
GLY 303		0.05	PHE 163	-0.05		SER 279
GLY 303		0.06	LEU 164	-0.05		SER 279
GLY 303		0.06	GLY 165	-0.05		SER 279
GLY 303		0.06	ILE 166	-0.06		SER 279
GLY 303		0.06	ALA 167	-0.05		SER 279
GLY 303		0.06	TYR 168	-0.05		SER 279
GLY 303		0.06	ASN 169	-0.06		SER 279
GLY 303		0.06	THR 170	-0.06		SER 279
GLY 303		0.06	LEU 171	-0.04		SER 279
GLY 303		0.05	LEU 172	-0.04		SER 279
GLY 303		0.05	ARG 173	-0.03		SER 279
GLY 303		0.04	ILE 174	-0.03		SER 279
GLY 303		0.04	ALA 175	-0.04		GLU 123
GLY 303		0.04	GLU 176	-0.04		ASP 126
GLY 303		0.04	ILE 177	-0.04		SER 279
GLY 303		0.04	ALA 178	-0.04		GLY 82
GLY 303		0.03	ARG 179	-0.06		ASP 126
GLY 303		0.04	ILE 180	-0.06		SER 279
GLY 303		0.03	ARG 181	-0.07		GLY 82
ASP 341		0.04	VAL 182	-0.08		SER 279
ASP 341		0.03	LYS 183	-0.09		SER 279
GLY 303		0.03	ASP 184	-0.09		SER 279
GLY 303		0.04	ILE 185	-0.09		SER 279
THR 140		0.04	SER 186	-0.11		SER 279
THR 140		0.05	ARG 187	-0.11		SER 279
THR 140		0.05	THR 188	-0.11		SER 279
ASP 341		0.05	ASP 189	-0.11		ASP 277
ASP 341		0.06	GLY 190	-0.09		ASP 277
THR 140		0.05	GLY 191	-0.09		ASP 278
GLY 303		0.05	ARG 192	-0.08		SER 279
GLY 303		0.05	MET 193	-0.09		SER 279
GLY 303		0.05	LEU 194	-0.09		SER 279
GLY 303		0.04	ILE 195	-0.08		SER 279
THR 140		0.04	HIS 196	-0.08		SER 279
GLY 303		0.03	ILE 197	-0.06		SER 279
GLY 303		0.03	GLY 198	-0.05		GLY 82
GLY 303		0.03	ARG 199	-0.04		GLY 82
GLY 303		0.03	THR 200	-0.03		ALA 84
GLY 303		0.03	LYS 201	-0.03		PRO 105
GLY 303		0.03	THR 202	-0.03		ASP 109
THR 140		0.02	LEU 203	-0.04		ASP 109
THR 140		0.03	VAL 204	-0.03		ASP 109
GLY 303		0.03	SER 205	-0.03		GLN 281
GLY 303		0.04	THR 206	-0.03		GLU 331
GLY 303		0.04	ALA 207	-0.04		GLN 281
ARG 301		0.04	GLY 208	-0.05		GLN 281
THR 140		0.04	VAL 209	-0.07		GLN 281
GLY 303		0.04	GLU 210	-0.07		SER 279
GLY 303		0.05	LYS 211	-0.07		SER 279
GLY 303		0.05	ALA 212	-0.08		SER 279
GLY 303		0.06	LEU 213	-0.07		SER 279
GLY 303		0.07	SER 214	-0.07		SER 279
GLY 303		0.06	LEU 215	-0.07		SER 279
GLY 303		0.07	GLY 216	-0.06		SER 279
GLY 303		0.06	VAL 217	-0.06		SER 279
GLY 303		0.06	THR 218	-0.07		SER 279
ASP 341		0.06	LYS 219	-0.07		SER 279
ASP 341		0.06	LEU 220	-0.06		SER 279
ASP 341		0.05	VAL 221	-0.07		SER 279
ASP 341		0.05	GLU 222	-0.07		SER 279
ASP 341		0.05	ARG 223	-0.06		SER 279
ASP 341		0.05	TRP 224	-0.06		SER 279
ASP 341		0.05	ILE 225	-0.07		SER 279
ASP 341		0.05	SER 226	-0.07		SER 279
ASP 341		0.05	VAL 227	-0.06		SER 279
ASP 341		0.04	SER 228	-0.06		SER 279
ASP 341		0.04	GLY 229	-0.06		SER 279
ASP 341		0.04	VAL 230	-0.06		SER 279
ASP 341		0.04	ALA 231	-0.07		SER 279
ASP 341		0.04	ASP 232	-0.07		SER 279
ASP 341		0.03	ASP 233	-0.07		GLY 82
ASP 341		0.03	PRO 234	-0.08		SER 279
ASP 341		0.03	ASN 235	-0.08		GLY 82
ASP 341		0.03	ASN 236	-0.07		GLY 82
ASP 341		0.03	TYR 237	-0.06		GLY 82
GLY 303		0.04	LEU 238	-0.06		SER 279
GLY 303		0.04	PHE 239	-0.05		SER 279
ASP 341		0.04	CYS 240	-0.05		ALA 80
ASP 341		0.04	ARG 241	-0.05		ALA 80
ASP 341		0.04	VAL 242	-0.05		ALA 80
ASP 189		0.04	ARG 243	-0.04		ALA 80
ASP 189		0.05	LYS 244	-0.04		ALA 80
ASP 341		0.05	ASN 245	-0.04		ALA 80
ASP 341		0.05	GLY 246	-0.04		SER 279
ASP 341		0.04	VAL 247	-0.05		ALA 80
ASP 341		0.04	ALA 248	-0.05		ALA 80
ASP 341		0.04	ALA 249	-0.06		ALA 80
ASP 341		0.04	PRO 250	-0.06		ALA 80
ASP 341		0.03	SER 251	-0.07		ALA 80
ASP 341		0.03	ALA 252	-0.08		ALA 80
ASP 341		0.03	THR 253	-0.08		ALA 80
ASP 341		0.03	SER 254	-0.07		ALA 80
GLY 303		0.03	GLN 255	-0.06		ALA 80
GLY 303		0.04	LEU 256	-0.05		ALA 80
GLY 303		0.04	SER 257	-0.04		GLU 123
GLY 303		0.04	THR 258	-0.04		GLU 123
ASP 189		0.04	ARG 259	-0.03		GLU 123
ASP 189		0.04	ALA 260	-0.03		ALA 80
GLY 303		0.05	LEU 261	-0.04		SER 279
ASP 189		0.05	GLU 262	-0.03		SER 279
ASP 189		0.06	GLY 263	-0.03		SER 279
ASP 189		0.06	ILE 264	-0.04		SER 279
ASP 189		0.06	PHE 265	-0.04		SER 279
ASP 189		0.07	GLU 266	-0.03		SER 279
ASP 189		0.07	ALA 267	-0.03		SER 279
ASP 189		0.07	THR 268	-0.04		SER 279
ASP 189		0.09	HIS 269	-0.03		SER 279
ASP 189		0.08	ARG 270	-0.03		SER 279
ASP 189		0.08	LEU 271	-0.03		SER 279
ASP 189		0.09	ILE 272	-0.03		SER 279
ASP 189		0.11	TYR 273	-0.03		SER 279
ASP 189		0.09	GLY 274	-0.03		SER 279
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