***  RECOMBINATION/DNA 24-JAN-08 3C29  ***

CA distance fluctuations for 2607041105042519188

---  normal mode 9  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner). The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations. [HELP on distance fluctuations]

GD ok

largest increase			ref	largest decrease
GLU 22		0.07	SER 20	-0.07		GLU 22
GLU 22		0.07	ASP 21	-0.07		GLU 22
PRO 105		0.07	GLU 22	-0.07		GLU 22
PRO 105		0.07	VAL 23	-0.07		GLU 22
PRO 105		0.06	ARG 24	-0.06		GLU 22
PRO 105		0.06	LYS 25	-0.06		GLY 103
PRO 105		0.07	ASN 26	-0.07		GLY 103
PRO 105		0.05	LEU 27	-0.05		GLY 103
PRO 105		0.04	MET 28	-0.06		GLY 103
PRO 105		0.05	ASP 29	-0.06		GLY 103
ASN 111		0.05	MET 30	-0.06		GLY 103
PRO 105		0.04	PHE 31	-0.05		GLY 103
SER 279		0.04	ARG 32	-0.05		GLY 103
SER 279		0.04	ASP 33	-0.05		GLY 103
SER 279		0.04	ARG 34	-0.05		SER 279
SER 279		0.04	GLN 35	-0.06		SER 279
SER 279		0.04	ALA 36	-0.05		GLY 103
SER 279		0.04	PHE 37	-0.05		SER 279
SER 279		0.03	SER 38	-0.07		SER 279
ASP 233		0.03	GLU 39	-0.07		SER 279
ASP 233		0.04	HIS 40	-0.07		SER 279
SER 279		0.03	THR 41	-0.06		SER 279
PRO 105		0.04	TRP 42	-0.06		SER 279
ASN 111		0.03	LYS 43	-0.06		SER 279
ASN 111		0.04	MET 44	-0.05		SER 279
ASN 111		0.04	LEU 45	-0.05		SER 279
ASN 111		0.04	LEU 46	-0.05		SER 279
ASN 111		0.04	SER 47	-0.05		SER 279
ASN 111		0.05	VAL 48	-0.04		SER 279
ASN 111		0.05	CYS 49	-0.04		SER 279
ASN 111		0.05	ARG 50	-0.04		SER 279
SER 110		0.05	SER 51	-0.04		SER 279
SER 110		0.05	TRP 52	-0.04		SER 279
PRO 68		0.05	ALA 53	-0.04		SER 279
GLU 67		0.05	ALA 54	-0.04		SER 279
PRO 105		0.06	TRP 55	-0.04		SER 279
PRO 105		0.06	CYS 56	-0.03		SER 279
GLU 67		0.06	LYS 57	-0.03		SER 279
PRO 105		0.06	LEU 58	-0.03		SER 279
PRO 105		0.06	ASN 59	-0.03		SER 279
PRO 105		0.06	ASN 60	-0.03		SER 279
PRO 105		0.07	ARG 61	-0.03		SER 279
GLU 67		0.07	LYS 62	-0.03		SER 279
PRO 68		0.06	TRP 63	-0.03		SER 279
ASN 111		0.07	PHE 64	-0.03		GLU 22
ASN 111		0.07	PRO 65	-0.04		GLU 22
SER 110		0.07	ALA 66	-0.04		GLU 22
PRO 105		0.08	GLU 67	-0.04		GLU 22
PRO 105		0.08	PRO 68	-0.04		PRO 105
PRO 105		0.08	GLU 69	-0.03		PRO 234
PRO 105		0.07	ASP 70	-0.03		SER 279
PRO 105		0.07	VAL 71	-0.03		SER 279
PRO 105		0.07	ARG 72	-0.03		PRO 234
PRO 105		0.07	ASP 73	-0.03		PRO 234
PRO 105		0.06	TYR 74	-0.03		SER 279
PRO 105		0.06	LEU 75	-0.03		PRO 234
PRO 105		0.06	LEU 76	-0.04		PRO 234
PRO 105		0.06	TYR 77	-0.03		SER 279
PRO 105		0.05	LEU 78	-0.04		SER 279
PRO 105		0.05	GLN 79	-0.04		ASP 189
PRO 105		0.05	ALA 80	-0.04		ASP 189
GLY 280		0.05	ARG 81	-0.04		SER 279
GLY 280		0.07	GLY 82	-0.04		ASP 189
GLY 280		0.05	LEU 83	-0.04		SER 279
GLN 281		0.05	ALA 84	-0.04		SER 279
ASP 109		0.05	VAL 85	-0.04		ASP 189
ASP 109		0.05	LYS 86	-0.04		SER 279
ASP 109		0.05	THR 87	-0.04		SER 279
ASP 109		0.06	ILE 88	-0.04		SER 279
ASP 109		0.06	GLN 89	-0.04		SER 279
ASP 109		0.05	GLN 90	-0.04		SER 279
ASP 109		0.05	HIS 91	-0.04		SER 279
ASP 109		0.06	LEU 92	-0.04		SER 279
ASN 111		0.06	GLY 93	-0.04		SER 279
ASN 111		0.05	GLN 94	-0.04		SER 279
ASN 111		0.06	LEU 95	-0.04		SER 279
ASN 111		0.07	ASN 96	-0.06		SER 108
ASN 111		0.06	MET 97	-0.05		GLY 103
ASN 111		0.06	LEU 98	-0.04		GLY 103
ASN 111		0.07	HIS 99	-0.05		GLU 22
ASN 111		0.07	ARG 100	-0.07		GLY 103
PRO 105		0.07	ARG 101	-0.06		GLY 103
PRO 105		0.07	SER 102	-0.06		GLY 103
PRO 105		0.09	GLY 103	-0.08		GLY 103
ASN 111		0.08	LEU 104	-0.08		GLU 22
ASN 111		0.09	PRO 105	-0.09		GLU 22
ASN 111		0.09	ARG 106	-0.08		ASP 109
ASP 109		0.08	PRO 107	-0.06		VAL 113
ASP 109		0.08	SER 108	-0.07		ARG 106
ASP 109		0.09	ASP 109	-0.08		ARG 106
PRO 105		0.09	SER 110	-0.08		PRO 105
PRO 105		0.09	ASN 111	-0.07		ASN 26
PRO 105		0.08	ALA 112	-0.05		PRO 105
PRO 105		0.08	VAL 113	-0.06		PRO 107
PRO 105		0.08	SER 114	-0.05		ALA 36
PRO 105		0.08	LEU 115	-0.07		ALA 36
PRO 105		0.07	VAL 116	-0.05		PRO 107
PRO 105		0.07	MET 117	-0.04		PRO 107
PRO 105		0.06	ARG 118	-0.04		PRO 234
PRO 105		0.06	ARG 119	-0.04		PRO 234
SER 279		0.06	ILE 120	-0.04		PRO 234
GLN 281		0.06	ARG 121	-0.04		PRO 234
SER 279		0.06	LYS 122	-0.05		PRO 234
SER 279		0.08	GLU 123	-0.05		PRO 234
GLN 281		0.08	ASN 124	-0.04		PRO 234
GLN 281		0.07	VAL 125	-0.05		ASP 189
SER 279		0.08	ASP 126	-0.05		PRO 234
SER 279		0.11	ALA 127	-0.05		PRO 234
GLN 281		0.11	GLY 128	-0.05		ASP 189
GLN 281		0.11	GLU 129	-0.05		ASP 189
LYS 132		0.11	ARG 130	-0.05		ASP 189
LYS 132		0.10	ALA 131	-0.04		ASP 189
ARG 130		0.11	LYS 132	-0.04		SER 279
PRO 234		0.08	GLN 133	-0.05		SER 279
PRO 234		0.09	ALA 134	-0.05		SER 279
PRO 234		0.11	LEU 135	-0.05		SER 279
PRO 234		0.09	ALA 136	-0.05		SER 279
PRO 234		0.09	PHE 137	-0.06		ASP 277
SER 186		0.09	GLU 138	-0.06		ASP 277
ASP 189		0.08	ARG 139	-0.06		TYR 273
ASP 189		0.11	THR 140	-0.06		TYR 273
ASP 232		0.10	ASP 141	-0.06		ASP 277
ASP 232		0.09	PHE 142	-0.07		ASP 277
ASP 232		0.09	ASP 143	-0.07		TYR 273
ASP 232		0.10	GLN 144	-0.07		ASP 277
ASP 232		0.10	VAL 145	-0.08		ASP 277
ASP 232		0.09	ARG 146	-0.08		ASP 277
ASP 232		0.10	SER 147	-0.08		TYR 273
ASP 232		0.11	LEU 148	-0.08		ASP 277
ASP 232		0.10	MET 149	-0.09		ASP 277
ASP 232		0.09	GLU 150	-0.09		ASP 277
ASP 232		0.09	ASN 151	-0.09		ASP 277
ASP 232		0.09	SER 152	-0.10		ASP 277
ASP 232		0.09	ASP 153	-0.10		ASP 277
ASP 232		0.09	ARG 154	-0.10		ASP 277
ASP 232		0.08	CYS 155	-0.11		ASP 278
ASP 232		0.09	GLN 156	-0.11		ASP 278
ASP 232		0.09	ASP 157	-0.10		ASP 277
ASP 232		0.08	ILE 158	-0.11		ASP 277
ASP 232		0.08	ARG 159	-0.12		ASP 277
ASP 232		0.09	ASN 160	-0.10		ASP 277
ASP 232		0.08	LEU 161	-0.10		ASP 277
ASP 232		0.07	ALA 162	-0.11		ASP 277
ASP 232		0.07	PHE 163	-0.11		ASP 277
PRO 234		0.08	LEU 164	-0.09		ASP 277
ASP 232		0.07	GLY 165	-0.09		ASP 277
PRO 234		0.06	ILE 166	-0.10		ASP 277
PRO 234		0.07	ALA 167	-0.09		ASP 277
PRO 234		0.07	TYR 168	-0.08		ASP 277
PRO 234		0.06	ASN 169	-0.09		TYR 273
PRO 234		0.05	THR 170	-0.09		TYR 273
PRO 234		0.05	LEU 171	-0.07		ASP 277
PRO 234		0.05	LEU 172	-0.09		SER 279
PRO 234		0.06	ARG 173	-0.09		SER 279
PRO 234		0.06	ILE 174	-0.09		SER 279
PRO 234		0.05	ALA 175	-0.10		SER 279
PRO 234		0.05	GLU 176	-0.11		SER 279
PRO 234		0.06	ILE 177	-0.12		SER 279
ASP 233		0.06	ALA 178	-0.12		SER 279
ASP 233		0.05	ARG 179	-0.14		SER 279
ASP 233		0.05	ILE 180	-0.16		SER 279
ASP 232		0.05	ARG 181	-0.19		SER 279
ASP 232		0.05	VAL 182	-0.19		SER 279
ASP 232		0.05	LYS 183	-0.23		SER 279
ASP 232		0.04	ASP 184	-0.21		SER 279
ASP 232		0.05	ILE 185	-0.19		ASP 277
ASP 232		0.04	SER 186	-0.21		ASP 277
ASP 232		0.04	ARG 187	-0.20		TYR 273
ASP 232		0.04	THR 188	-0.20		TYR 273
ASP 232		0.04	ASP 189	-0.22		TYR 273
ASP 232		0.04	GLY 190	-0.17		TYR 273
ASP 232		0.05	GLY 191	-0.16		TYR 273
ASP 232		0.05	ARG 192	-0.15		TYR 273
ASP 232		0.05	MET 193	-0.15		TYR 273
ASP 232		0.04	LEU 194	-0.15		TYR 273
PRO 234		0.04	ILE 195	-0.15		ASP 277
ASP 232		0.04	HIS 196	-0.16		SER 279
PRO 234		0.04	ILE 197	-0.13		SER 279
ASP 126		0.04	GLY 198	-0.16		SER 279
ASP 126		0.05	ARG 199	-0.12		SER 279
ASP 126		0.04	THR 200	-0.10		GLN 281
PRO 234		0.03	LYS 201	-0.07		GLN 281
SER 279		0.03	THR 202	-0.06		GLN 281
SER 205		0.04	LEU 203	-0.06		THR 316
SER 279		0.04	VAL 204	-0.07		THR 316
LEU 203		0.04	SER 205	-0.06		THR 316
SER 279		0.03	THR 206	-0.07		THR 316
PRO 234		0.03	ALA 207	-0.07		LEU 284
SER 330		0.04	GLY 208	-0.09		LEU 135
SER 330		0.03	VAL 209	-0.13		LEU 284
PRO 234		0.04	GLU 210	-0.13		LEU 284
PRO 234		0.04	LYS 211	-0.11		LEU 284
ASP 232		0.04	ALA 212	-0.12		TYR 273
ASP 232		0.05	LEU 213	-0.12		TYR 273
ASP 232		0.05	SER 214	-0.11		TYR 273
ASP 232		0.05	LEU 215	-0.12		TYR 273
ASP 232		0.06	GLY 216	-0.10		TYR 273
ASP 232		0.06	VAL 217	-0.11		TYR 273
ASP 232		0.06	THR 218	-0.13		TYR 273
ASP 232		0.06	LYS 219	-0.12		TYR 273
ASP 232		0.07	LEU 220	-0.11		ASP 277
ASP 232		0.07	VAL 221	-0.13		ASP 277
ASP 232		0.06	GLU 222	-0.14		ASP 277
ASP 232		0.07	ARG 223	-0.13		ASP 277
ASP 232		0.07	TRP 224	-0.13		ASP 277
ASP 232		0.06	ILE 225	-0.15		ASP 277
ASP 232		0.07	SER 226	-0.14		ASP 277
ASP 232		0.07	VAL 227	-0.13		ASP 277
ASP 232		0.07	SER 228	-0.14		ASP 278
ASP 232		0.06	GLY 229	-0.16		ASP 278
ASP 232		0.06	VAL 230	-0.17		ASP 278
ASP 232		0.06	ALA 231	-0.19		ASP 278
ASP 232		0.06	ASP 232	-0.19		ASP 278
ASP 232		0.05	ASP 233	-0.20		SER 279
ASP 232		0.05	PRO 234	-0.23		SER 279
ASP 232		0.05	ASN 235	-0.22		SER 279
ASP 232		0.05	ASN 236	-0.19		SER 279
ASP 232		0.06	TYR 237	-0.17		SER 279
ASP 232		0.06	LEU 238	-0.16		SER 279
ASP 232		0.07	PHE 239	-0.14		SER 279
ASP 232		0.07	CYS 240	-0.14		SER 279
ASP 232		0.07	ARG 241	-0.12		SER 279
ASP 232		0.08	VAL 242	-0.12		SER 279
ASP 232		0.08	ARG 243	-0.11		ASP 278
ASP 232		0.09	LYS 244	-0.10		ASP 278
ASP 232		0.09	ASN 245	-0.11		ASP 278
ASP 232		0.09	GLY 246	-0.11		ASP 278
ASP 232		0.08	VAL 247	-0.12		ASP 278
ASP 232		0.07	ALA 248	-0.13		ASP 278
ASP 232		0.07	ALA 249	-0.14		SER 279
ASP 232		0.06	PRO 250	-0.16		SER 279
ASP 232		0.06	SER 251	-0.16		SER 279
ASP 232		0.05	ALA 252	-0.18		SER 279
ASP 233		0.05	THR 253	-0.16		SER 279
ASP 233		0.06	SER 254	-0.14		SER 279
ASP 233		0.06	GLN 255	-0.14		SER 279
ASP 233		0.07	LEU 256	-0.13		SER 279
ASP 233		0.07	SER 257	-0.11		SER 279
PRO 234		0.07	THR 258	-0.10		SER 279
ASP 233		0.08	ARG 259	-0.09		SER 279
ASP 233		0.08	ALA 260	-0.10		SER 279
PRO 234		0.08	LEU 261	-0.10		SER 279
PRO 234		0.09	GLU 262	-0.09		SER 279
ASP 233		0.09	GLY 263	-0.09		SER 279
ASP 233		0.09	ILE 264	-0.09		SER 279
PRO 234		0.10	PHE 265	-0.08		SER 279
PRO 234		0.11	GLU 266	-0.08		SER 279
ASP 233		0.11	ALA 267	-0.08		SER 279
ASP 232		0.11	THR 268	-0.08		SER 279
PRO 234		0.12	HIS 269	-0.07		SER 279
ASP 232		0.13	ARG 270	-0.07		SER 279
ASP 232		0.13	LEU 271	-0.07		ASP 277
ASP 232		0.13	ILE 272	-0.07		ASP 277
ASP 232		0.15	TYR 273	-0.06		SER 279
ASP 232		0.15	GLY 274	-0.06		SER 279
ASP 233		0.15	ALA 275	-0.06		SER 279
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