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LOGs for ID: 2607070804273120202

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607070804273120202.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607070804273120202.atom to be opened. Openam> File opened: 2607070804273120202.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 382 First residue number = 3 Last residue number = 384 Number of atoms found = 2802 Mean number per residue = 7.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 9.463793 +/- 11.838513 From: -18.369000 To: 33.322000 = 5.403544 +/- 11.150849 From: -22.981000 To: 31.852000 = 2.683377 +/- 13.289146 From: -30.832000 To: 36.993000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.8842 % Filled. Pdbmat> 1019107 non-zero elements. Pdbmat> 111385 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.50 +/- 21.32 Maximum number = 127 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 2.227700E+06 Pdbmat> Larger element = 480.789 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 382 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607070804273120202.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607070804273120202.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607070804273120202.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2802 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 382 residues. Blocpdb> 12 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 10 atoms in block 2 Block first atom: 13 Blocpdb> 12 atoms in block 3 Block first atom: 23 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 35 Blocpdb> 12 atoms in block 5 Block first atom: 51 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 63 Blocpdb> 18 atoms in block 7 Block first atom: 77 Blocpdb> 13 atoms in block 8 Block first atom: 95 Blocpdb> 11 atoms in block 9 Block first atom: 108 Blocpdb> 20 atoms in block 10 Block first atom: 119 Blocpdb> 14 atoms in block 11 Block first atom: 139 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 153 Blocpdb> 17 atoms in block 13 Block first atom: 167 Blocpdb> 13 atoms in block 14 Block first atom: 184 Blocpdb> 16 atoms in block 15 Block first atom: 197 Blocpdb> 13 atoms in block 16 Block first atom: 213 Blocpdb> 19 atoms in block 17 Block first atom: 226 Blocpdb> 14 atoms in block 18 Block first atom: 245 Blocpdb> 13 atoms in block 19 Block first atom: 259 Blocpdb> 19 atoms in block 20 Block first atom: 272 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 291 Blocpdb> 15 atoms in block 22 Block first atom: 307 Blocpdb> 16 atoms in block 23 Block first atom: 322 Blocpdb> 19 atoms in block 24 Block first atom: 338 Blocpdb> 12 atoms in block 25 Block first atom: 357 Blocpdb> 13 atoms in block 26 Block first atom: 369 Blocpdb> 14 atoms in block 27 Block first atom: 382 Blocpdb> 17 atoms in block 28 Block first atom: 396 Blocpdb> 12 atoms in block 29 Block first atom: 413 Blocpdb> 16 atoms in block 30 Block first atom: 425 Blocpdb> 16 atoms in block 31 Block first atom: 441 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 457 Blocpdb> 18 atoms in block 33 Block first atom: 472 Blocpdb> 13 atoms in block 34 Block first atom: 490 Blocpdb> 20 atoms in block 35 Block first atom: 503 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 523 Blocpdb> 15 atoms in block 37 Block first atom: 539 Blocpdb> 18 atoms in block 38 Block first atom: 554 Blocpdb> 12 atoms in block 39 Block first atom: 572 Blocpdb> 12 atoms in block 40 Block first atom: 584 Blocpdb> 16 atoms in block 41 Block first atom: 596 Blocpdb> 13 atoms in block 42 Block first atom: 612 Blocpdb> 17 atoms in block 43 Block first atom: 625 Blocpdb> 24 atoms in block 44 Block first atom: 642 Blocpdb> 18 atoms in block 45 Block first atom: 666 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 684 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 700 Blocpdb> 12 atoms in block 48 Block first atom: 716 Blocpdb> 14 atoms in block 49 Block first atom: 728 Blocpdb> 16 atoms in block 50 Block first atom: 742 Blocpdb> 16 atoms in block 51 Block first atom: 758 Blocpdb> 13 atoms in block 52 Block first atom: 774 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 787 Blocpdb> 13 atoms in block 54 Block first atom: 806 Blocpdb> 13 atoms in block 55 Block first atom: 819 Blocpdb> 16 atoms in block 56 Block first atom: 832 Blocpdb> 19 atoms in block 57 Block first atom: 848 Blocpdb> 18 atoms in block 58 Block first atom: 867 Blocpdb> 14 atoms in block 59 Block first atom: 885 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 899 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 913 Blocpdb> 16 atoms in block 62 Block first atom: 928 Blocpdb> 17 atoms in block 63 Block first atom: 944 Blocpdb> 17 atoms in block 64 Block first atom: 961 Blocpdb> 14 atoms in block 65 Block first atom: 978 Blocpdb> 17 atoms in block 66 Block first atom: 992 Blocpdb> 12 atoms in block 67 Block first atom: 1009 Blocpdb> 19 atoms in block 68 Block first atom: 1021 Blocpdb> 14 atoms in block 69 Block first atom: 1040 Blocpdb> 13 atoms in block 70 Block first atom: 1054 Blocpdb> 15 atoms in block 71 Block first atom: 1067 Blocpdb> 14 atoms in block 72 Block first atom: 1082 Blocpdb> 12 atoms in block 73 Block first atom: 1096 Blocpdb> 23 atoms in block 74 Block first atom: 1108 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1131 Blocpdb> 15 atoms in block 76 Block first atom: 1147 Blocpdb> 20 atoms in block 77 Block first atom: 1162 Blocpdb> 12 atoms in block 78 Block first atom: 1182 Blocpdb> 17 atoms in block 79 Block first atom: 1194 Blocpdb> 9 atoms in block 80 Block first atom: 1211 Blocpdb> 15 atoms in block 81 Block first atom: 1220 Blocpdb> 9 atoms in block 82 Block first atom: 1235 Blocpdb> 16 atoms in block 83 Block first atom: 1244 Blocpdb> 15 atoms in block 84 Block first atom: 1260 Blocpdb> 19 atoms in block 85 Block first atom: 1275 Blocpdb> 16 atoms in block 86 Block first atom: 1294 Blocpdb> 16 atoms in block 87 Block first atom: 1310 Blocpdb> 12 atoms in block 88 Block first atom: 1326 Blocpdb> 10 atoms in block 89 Block first atom: 1338 Blocpdb> 13 atoms in block 90 Block first atom: 1348 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1361 Blocpdb> 16 atoms in block 92 Block first atom: 1377 Blocpdb> 18 atoms in block 93 Block first atom: 1393 Blocpdb> 8 atoms in block 94 Block first atom: 1411 Blocpdb> 13 atoms in block 95 Block first atom: 1419 Blocpdb> 19 atoms in block 96 Block first atom: 1432 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1451 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 1466 Blocpdb> 16 atoms in block 99 Block first atom: 1485 Blocpdb> 8 atoms in block 100 Block first atom: 1501 Blocpdb> 11 atoms in block 101 Block first atom: 1509 Blocpdb> 19 atoms in block 102 Block first atom: 1520 Blocpdb> 13 atoms in block 103 Block first atom: 1539 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1552 Blocpdb> 15 atoms in block 105 Block first atom: 1568 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1583 Blocpdb> 12 atoms in block 107 Block first atom: 1599 Blocpdb> 20 atoms in block 108 Block first atom: 1611 Blocpdb> 13 atoms in block 109 Block first atom: 1631 Blocpdb> 12 atoms in block 110 Block first atom: 1644 Blocpdb> 9 atoms in block 111 Block first atom: 1656 Blocpdb> 15 atoms in block 112 Block first atom: 1665 Blocpdb> 13 atoms in block 113 Block first atom: 1680 Blocpdb> 8 atoms in block 114 Block first atom: 1693 Blocpdb> 17 atoms in block 115 Block first atom: 1701 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 1718 Blocpdb> 19 atoms in block 117 Block first atom: 1737 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1756 Blocpdb> 18 atoms in block 119 Block first atom: 1771 Blocpdb> 18 atoms in block 120 Block first atom: 1789 Blocpdb> 18 atoms in block 121 Block first atom: 1807 Blocpdb> 12 atoms in block 122 Block first atom: 1825 Blocpdb> 16 atoms in block 123 Block first atom: 1837 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 1853 Blocpdb> 13 atoms in block 125 Block first atom: 1868 Blocpdb> 14 atoms in block 126 Block first atom: 1881 Blocpdb> 13 atoms in block 127 Block first atom: 1895 Blocpdb> 10 atoms in block 128 Block first atom: 1908 Blocpdb> 12 atoms in block 129 Block first atom: 1918 Blocpdb> 16 atoms in block 130 Block first atom: 1930 Blocpdb> 10 atoms in block 131 Block first atom: 1946 Blocpdb> 12 atoms in block 132 Block first atom: 1956 Blocpdb> 15 atoms in block 133 Block first atom: 1968 Blocpdb> 16 atoms in block 134 Block first atom: 1983 Blocpdb> 20 atoms in block 135 Block first atom: 1999 Blocpdb> 15 atoms in block 136 Block first atom: 2019 Blocpdb> 12 atoms in block 137 Block first atom: 2034 Blocpdb> 12 atoms in block 138 Block first atom: 2046 Blocpdb> 10 atoms in block 139 Block first atom: 2058 Blocpdb> 11 atoms in block 140 Block first atom: 2068 Blocpdb> 13 atoms in block 141 Block first atom: 2079 Blocpdb> 11 atoms in block 142 Block first atom: 2092 Blocpdb> 16 atoms in block 143 Block first atom: 2103 Blocpdb> 9 atoms in block 144 Block first atom: 2119 Blocpdb> 10 atoms in block 145 Block first atom: 2128 Blocpdb> 16 atoms in block 146 Block first atom: 2138 Blocpdb> 12 atoms in block 147 Block first atom: 2154 Blocpdb> 15 atoms in block 148 Block first atom: 2166 Blocpdb> 16 atoms in block 149 Block first atom: 2181 Blocpdb> 22 atoms in block 150 Block first atom: 2197 Blocpdb> 18 atoms in block 151 Block first atom: 2219 Blocpdb> 14 atoms in block 152 Block first atom: 2237 Blocpdb> 14 atoms in block 153 Block first atom: 2251 Blocpdb> 19 atoms in block 154 Block first atom: 2265 Blocpdb> 14 atoms in block 155 Block first atom: 2284 Blocpdb> 15 atoms in block 156 Block first atom: 2298 Blocpdb> 16 atoms in block 157 Block first atom: 2313 Blocpdb> 16 atoms in block 158 Block first atom: 2329 Blocpdb> 12 atoms in block 159 Block first atom: 2345 Blocpdb> 13 atoms in block 160 Block first atom: 2357 Blocpdb> 13 atoms in block 161 Block first atom: 2370 Blocpdb> 11 atoms in block 162 Block first atom: 2383 Blocpdb> 10 atoms in block 163 Block first atom: 2394 Blocpdb> 13 atoms in block 164 Block first atom: 2404 Blocpdb> 18 atoms in block 165 Block first atom: 2417 Blocpdb> 16 atoms in block 166 Block first atom: 2435 Blocpdb> 15 atoms in block 167 Block first atom: 2451 Blocpdb> 11 atoms in block 168 Block first atom: 2466 Blocpdb> 10 atoms in block 169 Block first atom: 2477 Blocpdb> 18 atoms in block 170 Block first atom: 2487 Blocpdb> 15 atoms in block 171 Block first atom: 2505 Blocpdb> 14 atoms in block 172 Block first atom: 2520 Blocpdb> 14 atoms in block 173 Block first atom: 2534 Blocpdb> 16 atoms in block 174 Block first atom: 2548 Blocpdb> 17 atoms in block 175 Block first atom: 2564 Blocpdb> 22 atoms in block 176 Block first atom: 2581 Blocpdb> 12 atoms in block 177 Block first atom: 2603 Blocpdb> 10 atoms in block 178 Block first atom: 2615 Blocpdb> 16 atoms in block 179 Block first atom: 2625 Blocpdb> 14 atoms in block 180 Block first atom: 2641 Blocpdb> 16 atoms in block 181 Block first atom: 2655 Blocpdb> 15 atoms in block 182 Block first atom: 2671 Blocpdb> 14 atoms in block 183 Block first atom: 2686 Blocpdb> 12 atoms in block 184 Block first atom: 2700 Blocpdb> 16 atoms in block 185 Block first atom: 2712 Blocpdb> 10 atoms in block 186 Block first atom: 2728 Blocpdb> 16 atoms in block 187 Block first atom: 2738 Blocpdb> 10 atoms in block 188 Block first atom: 2754 Blocpdb> 16 atoms in block 189 Block first atom: 2764 Blocpdb> 13 atoms in block 190 Block first atom: 2780 Blocpdb> 10 atoms in block 191 Block first atom: 2792 Blocpdb> 191 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1019298 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8406 Prepmat> Matrix trace = 2227700.0000 Prepmat> Last element read: 8406 8406 38.1206 Prepmat> 18337 lines saved. Prepmat> 16238 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2802 RTB> Total mass = 2802.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2802 RTB> Number of blocks = 191 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 257126.8419 RTB> 72663 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1146 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72663 Diagstd> Projected matrix trace = 257126.8419 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1146 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 257126.8419 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.7958655 1.0735401 1.6036952 2.2155285 2.3799592 3.3198079 3.9092635 4.2329815 4.7226620 5.5697437 6.2120476 7.2486991 7.4932987 9.1729532 9.3297786 10.7334841 11.6300979 11.9813495 12.2609008 12.7259237 14.0861272 14.2901331 14.6657870 15.2668268 15.7277601 17.4064968 17.9471223 19.1726077 19.8039089 20.4933111 21.6847406 21.8930382 22.4642585 23.1037773 23.6981607 24.2646347 25.5695094 25.8056385 26.7144118 27.3581480 28.3547900 28.9403453 29.4686362 30.0722151 30.1829638 31.5118612 32.2325683 32.5863430 33.2880426 33.4693227 34.0031750 34.1868925 34.8891038 35.6785155 36.2337434 36.3788414 37.6184899 37.8913751 38.8544288 39.6278767 40.5927711 40.7288814 41.1361421 41.6606601 41.8545482 42.3775963 43.7076615 44.0259295 44.6337976 45.0202474 45.4637115 46.4615710 46.7658799 47.3236184 47.9106372 48.5787162 49.4510116 49.7688018 50.4714140 50.8811260 51.8407995 52.1139390 52.5262361 52.8482898 53.5816985 53.8284193 54.0846698 55.1431506 55.2784124 56.0288613 57.1010925 57.6952476 58.1260825 58.3883703 59.1146669 59.7757452 59.9559522 60.0639272 60.8083117 60.9759988 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034325 0.0034329 0.0034336 0.0034337 0.0034340 96.8757599 112.5134448 137.5169383 161.6344595 167.5251591 197.8571526 214.7052930 223.4181561 235.9873429 256.2789196 270.6528885 292.3649561 297.2568028 328.8893943 331.6889092 355.7669821 370.3283538 375.8790742 380.2388345 387.3824461 407.5595581 410.5002416 415.8607829 424.2967158 430.6542310 453.0550409 460.0369245 475.4839630 483.2487507 491.5880837 505.6760630 508.0989500 514.6847787 521.9594622 528.6309673 534.9117762 549.1063651 551.6359803 561.2651650 567.9873035 578.2404889 584.1806055 589.4884480 595.4948228 596.5903470 609.5822430 616.5137061 619.8878049 626.5264491 628.2301025 633.2205721 634.9288970 641.4165877 648.6324447 653.6599588 654.9674419 666.0333241 668.4446684 676.8860204 683.5899699 691.8622425 693.0212019 696.4774507 700.9037018 702.5328066 706.9088847 717.9167159 720.5258182 725.4829330 728.6168643 732.1966269 740.1883161 742.6083625 747.0234796 751.6423708 756.8647811 763.6298041 766.0795565 771.4681771 774.5931232 781.8638358 783.9208765 787.0157449 789.4247698 794.8835662 796.7115144 798.6056376 806.3824520 807.3708420 812.8327215 820.5735028 824.8316193 827.9055754 829.7713907 834.9162308 839.5716779 840.8362613 841.5930541 846.7920130 847.9587806 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2802 Rtb_to_modes> Number of blocs = 191 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9904E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9918E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7959 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.074 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.604 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.216 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.380 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.320 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.909 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.233 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.723 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.570 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.249 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.493 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.173 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.98 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 0.99997 1.00004 1.00000 1.00004 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00006 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00004 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99996 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00004 1.00001 1.00000 0.99999 0.99996 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 50436 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 0.99997 1.00004 1.00000 1.00004 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00006 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00004 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99996 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00004 1.00001 1.00000 0.99999 0.99996 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607070804273120202.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607070804273120202.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607070804273120202.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607070804273120202.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 382 First residue number = 3 Last residue number = 384 Number of atoms found = 2802 Mean number per residue = 7.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9904E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9918E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7959 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.074 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.604 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.216 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.380 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.320 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.909 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.233 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.723 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.570 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.249 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.493 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.173 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.98 Bfactors> 106 vectors, 8406 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.795900 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.251 for 382 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.047 +/- 0.22 Bfactors> = 56.762 +/- 29.10 Bfactors> Shiftng-fct= 56.715 Bfactors> Scaling-fct= 134.205 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607070804273120202.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607070804273120202.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.0 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vecteur en lecture: 740.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.0 Chkmod> 106 vectors, 8406 coordinates in file. Chkmod> That is: 2802 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 27 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7298 0.0034 0.9142 0.0034 0.8240 0.0034 0.7464 0.0034 0.8943 0.0034 0.6380 96.8737 0.0049 112.5327 0.3764 137.5241 0.0033 161.6447 0.1968 167.5194 0.4349 197.8544 0.5455 214.6888 0.0088 223.4091 0.2985 235.9857 0.4964 256.2738 0.5438 270.6402 0.4425 292.3585 0.5695 297.2381 0.2960 328.8761 0.3868 331.6786 0.5269 355.6940 0.6346 370.3109 0.5578 375.8418 0.4563 380.2085 0.0943 387.4279 0.4465 407.5981 0.0517 410.4807 0.3311 415.9027 0.1569 424.3226 0.5396 430.6664 0.4202 453.0812 0.3815 460.0541 0.3363 475.4312 0.3792 483.1803 0.3843 491.5273 0.3971 505.5991 0.3821 508.0419 0.3658 514.6139 0.3200 521.8944 0.4490 528.6288 0.3223 534.8377 0.3656 549.0881 0.4102 551.6589 0.4636 561.1947 0.3730 567.9821 0.3241 578.1668 0.1974 584.1520 0.3950 589.4768 0.3968 595.4473 0.5086 596.5354 0.5453 609.5381 0.4568 616.4627 0.3176 619.8960 0.4435 626.5180 0.1984 628.2095 0.4461 633.1638 0.4771 634.9305 0.3019 641.3973 0.4126 648.6181 0.1840 653.5981 0.3540 654.9498 0.4472 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DQ=-80 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom making animated gifs 11 models are in 2607070804273120202.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607070804273120202.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607070804273120202.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2607070804273120202 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom making animated gifs 11 models are in 2607070804273120202.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607070804273120202.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607070804273120202.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2607070804273120202 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607070804273120202.eigenfacs 2607070804273120202.atom making animated gifs 11 models are in 2607070804273120202.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607070804273120202.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607070804273120202.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted 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