*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607071443313176463.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607071443313176463.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607071443313176463.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 453
First residue number = 8
Last residue number = 804
Number of atoms found = 3601
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 14.024944 +/- 9.795848 From: -13.998000 To: 38.759000
= -3.967612 +/- 14.593069 From: -36.289000 To: 30.626000
= -30.428855 +/- 18.035533 From: -65.918000 To: 13.864000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.3025 % Filled.
Pdbmat> 1343667 non-zero elements.
Pdbmat> 146914 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.60 +/- 24.46
Maximum number = 134
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 2.938280E+06
Pdbmat> Larger element = 508.962
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
453 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607071443313176463.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607071443313176463.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607071443313176463.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3601 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 453 residues.
Blocpdb> 22 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 30 atoms in block 2
Block first atom: 23
Blocpdb> 28 atoms in block 3
Block first atom: 53
Blocpdb> 24 atoms in block 4
Block first atom: 81
Blocpdb> 25 atoms in block 5
Block first atom: 105
Blocpdb> 24 atoms in block 6
Block first atom: 130
Blocpdb> 23 atoms in block 7
Block first atom: 154
Blocpdb> 26 atoms in block 8
Block first atom: 177
Blocpdb> 30 atoms in block 9
Block first atom: 203
Blocpdb> 25 atoms in block 10
Block first atom: 233
Blocpdb> 20 atoms in block 11
Block first atom: 258
Blocpdb> 25 atoms in block 12
Block first atom: 278
Blocpdb> 28 atoms in block 13
Block first atom: 303
Blocpdb> 31 atoms in block 14
Block first atom: 331
Blocpdb> 19 atoms in block 15
Block first atom: 362
Blocpdb> 27 atoms in block 16
Block first atom: 381
Blocpdb> 24 atoms in block 17
Block first atom: 408
Blocpdb> 24 atoms in block 18
Block first atom: 432
Blocpdb> 25 atoms in block 19
Block first atom: 456
Blocpdb> 20 atoms in block 20
Block first atom: 481
Blocpdb> 22 atoms in block 21
Block first atom: 501
Blocpdb> 20 atoms in block 22
Block first atom: 523
Blocpdb> 28 atoms in block 23
Block first atom: 543
Blocpdb> 28 atoms in block 24
Block first atom: 571
Blocpdb> 25 atoms in block 25
Block first atom: 599
Blocpdb> 22 atoms in block 26
Block first atom: 624
Blocpdb> 29 atoms in block 27
Block first atom: 646
Blocpdb> 23 atoms in block 28
Block first atom: 675
Blocpdb> 27 atoms in block 29
Block first atom: 698
Blocpdb> 19 atoms in block 30
Block first atom: 725
Blocpdb> 24 atoms in block 31
Block first atom: 744
Blocpdb> 32 atoms in block 32
Block first atom: 768
Blocpdb> 24 atoms in block 33
Block first atom: 800
Blocpdb> 26 atoms in block 34
Block first atom: 824
Blocpdb> 27 atoms in block 35
Block first atom: 850
Blocpdb> 28 atoms in block 36
Block first atom: 877
Blocpdb> 26 atoms in block 37
Block first atom: 905
Blocpdb> 26 atoms in block 38
Block first atom: 931
Blocpdb> 22 atoms in block 39
Block first atom: 957
Blocpdb> 27 atoms in block 40
Block first atom: 979
Blocpdb> 29 atoms in block 41
Block first atom: 1006
Blocpdb> 30 atoms in block 42
Block first atom: 1035
Blocpdb> 23 atoms in block 43
Block first atom: 1065
Blocpdb> 24 atoms in block 44
Block first atom: 1088
Blocpdb> 25 atoms in block 45
Block first atom: 1112
Blocpdb> 22 atoms in block 46
Block first atom: 1137
Blocpdb> 25 atoms in block 47
Block first atom: 1159
Blocpdb> 28 atoms in block 48
Block first atom: 1184
Blocpdb> 20 atoms in block 49
Block first atom: 1212
Blocpdb> 26 atoms in block 50
Block first atom: 1232
Blocpdb> 27 atoms in block 51
Block first atom: 1258
Blocpdb> 30 atoms in block 52
Block first atom: 1285
Blocpdb> 22 atoms in block 53
Block first atom: 1315
Blocpdb> 29 atoms in block 54
Block first atom: 1337
Blocpdb> 26 atoms in block 55
Block first atom: 1366
Blocpdb> 18 atoms in block 56
Block first atom: 1392
Blocpdb> 29 atoms in block 57
Block first atom: 1410
Blocpdb> 21 atoms in block 58
Block first atom: 1439
Blocpdb> 27 atoms in block 59
Block first atom: 1460
Blocpdb> 23 atoms in block 60
Block first atom: 1487
Blocpdb> 22 atoms in block 61
Block first atom: 1510
Blocpdb> 28 atoms in block 62
Block first atom: 1532
Blocpdb> 31 atoms in block 63
Block first atom: 1560
Blocpdb> 20 atoms in block 64
Block first atom: 1591
Blocpdb> 25 atoms in block 65
Block first atom: 1611
Blocpdb> 22 atoms in block 66
Block first atom: 1636
Blocpdb> 21 atoms in block 67
Block first atom: 1658
Blocpdb> 19 atoms in block 68
Block first atom: 1679
Blocpdb> 27 atoms in block 69
Block first atom: 1698
Blocpdb> 24 atoms in block 70
Block first atom: 1725
Blocpdb> 25 atoms in block 71
Block first atom: 1749
Blocpdb> 20 atoms in block 72
Block first atom: 1774
Blocpdb> 26 atoms in block 73
Block first atom: 1794
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1820
Blocpdb> 20 atoms in block 75
Block first atom: 1836
Blocpdb> 22 atoms in block 76
Block first atom: 1856
Blocpdb> 21 atoms in block 77
Block first atom: 1878
Blocpdb> 34 atoms in block 78
Block first atom: 1899
Blocpdb> 21 atoms in block 79
Block first atom: 1933
Blocpdb> 25 atoms in block 80
Block first atom: 1954
Blocpdb> 23 atoms in block 81
Block first atom: 1979
Blocpdb> 18 atoms in block 82
Block first atom: 2002
Blocpdb> 20 atoms in block 83
Block first atom: 2020
Blocpdb> 27 atoms in block 84
Block first atom: 2040
Blocpdb> 24 atoms in block 85
Block first atom: 2067
Blocpdb> 28 atoms in block 86
Block first atom: 2091
Blocpdb> 20 atoms in block 87
Block first atom: 2119
Blocpdb> 24 atoms in block 88
Block first atom: 2139
Blocpdb> 18 atoms in block 89
Block first atom: 2163
Blocpdb> 20 atoms in block 90
Block first atom: 2181
Blocpdb> 6 atoms in block 91
Block first atom: 2201
Blocpdb> 21 atoms in block 92
Block first atom: 2207
Blocpdb> 20 atoms in block 93
Block first atom: 2228
Blocpdb> 20 atoms in block 94
Block first atom: 2248
Blocpdb> 20 atoms in block 95
Block first atom: 2268
Blocpdb> 22 atoms in block 96
Block first atom: 2288
Blocpdb> 17 atoms in block 97
Block first atom: 2310
Blocpdb> 24 atoms in block 98
Block first atom: 2327
Blocpdb> 28 atoms in block 99
Block first atom: 2351
Blocpdb> 18 atoms in block 100
Block first atom: 2379
Blocpdb> 17 atoms in block 101
Block first atom: 2397
Blocpdb> 17 atoms in block 102
Block first atom: 2414
Blocpdb> 23 atoms in block 103
Block first atom: 2431
Blocpdb> 21 atoms in block 104
Block first atom: 2454
Blocpdb> 25 atoms in block 105
Block first atom: 2475
Blocpdb> 20 atoms in block 106
Block first atom: 2500
Blocpdb> 33 atoms in block 107
Block first atom: 2520
Blocpdb> 17 atoms in block 108
Block first atom: 2553
Blocpdb> 28 atoms in block 109
Block first atom: 2570
Blocpdb> 10 atoms in block 110
Block first atom: 2598
Blocpdb> 29 atoms in block 111
Block first atom: 2608
Blocpdb> 26 atoms in block 112
Block first atom: 2637
Blocpdb> 18 atoms in block 113
Block first atom: 2663
Blocpdb> 29 atoms in block 114
Block first atom: 2681
Blocpdb> 24 atoms in block 115
Block first atom: 2710
Blocpdb> 21 atoms in block 116
Block first atom: 2734
Blocpdb> 21 atoms in block 117
Block first atom: 2755
Blocpdb> 22 atoms in block 118
Block first atom: 2776
Blocpdb> 19 atoms in block 119
Block first atom: 2798
Blocpdb> 20 atoms in block 120
Block first atom: 2817
Blocpdb> 27 atoms in block 121
Block first atom: 2837
Blocpdb> 25 atoms in block 122
Block first atom: 2864
Blocpdb> 26 atoms in block 123
Block first atom: 2889
Blocpdb> 20 atoms in block 124
Block first atom: 2915
Blocpdb> 23 atoms in block 125
Block first atom: 2935
Blocpdb> 25 atoms in block 126
Block first atom: 2958
Blocpdb> 26 atoms in block 127
Block first atom: 2983
Blocpdb> 20 atoms in block 128
Block first atom: 3009
Blocpdb> 11 atoms in block 129
Block first atom: 3029
Blocpdb> 20 atoms in block 130
Block first atom: 3040
Blocpdb> 24 atoms in block 131
Block first atom: 3060
Blocpdb> 28 atoms in block 132
Block first atom: 3084
Blocpdb> 25 atoms in block 133
Block first atom: 3112
Blocpdb> 29 atoms in block 134
Block first atom: 3137
Blocpdb> 25 atoms in block 135
Block first atom: 3166
Blocpdb> 16 atoms in block 136
Block first atom: 3191
Blocpdb> 26 atoms in block 137
Block first atom: 3207
Blocpdb> 19 atoms in block 138
Block first atom: 3233
Blocpdb> 29 atoms in block 139
Block first atom: 3252
Blocpdb> 22 atoms in block 140
Block first atom: 3281
Blocpdb> 20 atoms in block 141
Block first atom: 3303
Blocpdb> 26 atoms in block 142
Block first atom: 3323
Blocpdb> 20 atoms in block 143
Block first atom: 3349
Blocpdb> 24 atoms in block 144
Block first atom: 3369
Blocpdb> 25 atoms in block 145
Block first atom: 3393
Blocpdb> 25 atoms in block 146
Block first atom: 3418
Blocpdb> 24 atoms in block 147
Block first atom: 3443
Blocpdb> 16 atoms in block 148
Block first atom: 3467
Blocpdb> 24 atoms in block 149
Block first atom: 3483
Blocpdb> 30 atoms in block 150
Block first atom: 3507
Blocpdb> 27 atoms in block 151
Block first atom: 3537
Blocpdb> 23 atoms in block 152
Block first atom: 3564
Blocpdb> 15 atoms in block 153
Block first atom: 3586
Blocpdb> 153 blocks.
Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1343820 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 10803
Prepmat> Matrix trace = 2938280.0000
Prepmat> Last element read: 10803 10803 110.3311
Prepmat> 11782 lines saved.
Prepmat> 10307 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3601
RTB> Total mass = 3601.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3601
RTB> Number of blocks = 153
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 192064.3501
RTB> 50769 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 918
Diagstd> Nb of non-zero elements: 50769
Diagstd> Projected matrix trace = 192064.3501
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 918 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 192064.3501
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.8930230 1.0491976 1.2326489 2.7565777
3.0704856 3.6221530 4.2189615 4.4201518 4.8194843
5.6692553 5.7920621 6.6813046 7.4906338 7.6731242
9.5261497 9.9888591 10.3885888 11.1058712 11.3729220
11.5762548 12.4231116 12.8557568 13.3760965 13.9448015
14.2838235 15.3715991 15.8732311 16.9061649 17.0628576
17.3356285 17.6515889 18.3596224 19.8611494 20.2436654
20.4219556 20.7366185 21.0969983 21.7922974 22.3864019
23.1348813 23.7689866 24.0187362 24.8833785 25.3270725
25.5624402 26.3304109 26.4564423 27.3403298 27.9980355
28.4955988 28.8373861 29.3042278 30.6063999 31.3543589
31.9346247 32.0147284 32.4637396 33.0031816 33.2961520
33.9185387 34.5371329 35.0842131 35.5972879 35.9885481
36.2082339 36.7743517 37.2149396 37.6366642 38.1081489
38.6697497 40.3411697 40.7089505 40.9378435 41.2811080
41.5688869 42.0469004 42.4704058 43.1429015 44.2559388
44.5713298 44.8572035 45.5133887 46.2658869 46.6041711
47.1022603 47.3201034 48.4448752 49.1930700 49.6467880
49.8019060 50.0937422 50.5857990 51.4847176 51.8170800
52.5441357 52.9033417 53.4457114 53.8840507 54.1866753
55.1536156
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034318 0.0034325 0.0034334 0.0034336 0.0034338
0.0034346 102.6187234 111.2305100 120.5632582 180.2936366
190.2824829 206.6705893 223.0478616 228.3041862 238.3941344
258.5581839 261.3436087 280.6893373 297.2039407 300.8024679
335.1613883 343.2046983 350.0044447 361.8858456 366.2109367
369.4701174 382.7458345 389.3535194 397.1549477 405.5098880
410.4096059 425.7501453 432.6412752 446.4962649 448.5606403
452.1318240 456.2335114 465.2936784 483.9466293 488.5846917
490.7315093 494.4976700 498.7760765 506.9285936 513.7921069
522.3106939 529.4203286 532.1944687 541.6889213 546.4969938
549.0304536 557.2166673 558.5486434 567.8023095 574.5913190
579.6744702 583.1405287 587.8417409 600.7605476 608.0569310
613.6577006 614.4268580 618.7205680 623.8399524 626.6027592
632.4320150 638.1729926 643.2075746 647.8936682 651.4445319
653.4298219 658.5182161 662.4512739 666.1941928 670.3540027
675.2754498 689.7147659 692.8516146 694.7967226 697.7035825
700.1312746 704.1452816 707.6825478 713.2634252 722.4055253
724.9750760 727.2962998 732.5965450 738.6279304 741.3233412
745.2743158 746.9957357 755.8214295 761.6356144 765.1399148
766.3342964 768.5763533 772.3418843 779.1739918 781.6849459
787.1498310 789.8358335 793.8742425 797.1231065 799.3583810
806.4589652
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3601
Rtb_to_modes> Number of blocs = 153
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9872E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9912E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8930
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.049
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.233
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.757
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.070
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.622
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.219
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.420
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.819
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.669
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.792
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.681
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.491
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.673
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.526
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.989
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.15
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 918 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997
1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002
1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 0.99996
0.99997 0.99997 0.99994 1.00001 0.99998
1.00002 1.00005 1.00002 1.00003 0.99998
1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000
0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 1.00003 0.99998
1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99997
1.00000 1.00002 1.00000 1.00004 0.99999
1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 0.99996 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 0.99997 1.00002 1.00000
0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997
1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002
0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002
0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998
0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 64818 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997
1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002
1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 0.99996
0.99997 0.99997 0.99994 1.00001 0.99998
1.00002 1.00005 1.00002 1.00003 0.99998
1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000
0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 1.00003 0.99998
1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99997
1.00000 1.00002 1.00000 1.00004 0.99999
1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 0.99996 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 0.99997 1.00002 1.00000
0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997
1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002
0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002
0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998
0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607071443313176463.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607071443313176463.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607071443313176463.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607071443313176463.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 453
First residue number = 8
Last residue number = 804
Number of atoms found = 3601
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9872E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8930
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.049
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.233
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.757
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.070
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.622
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.219
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.420
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.819
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.669
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.792
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.681
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.491
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.673
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.526
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.989
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.15
Bfactors> 106 vectors, 10803 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.893000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.552 for 453 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.036 +/- 0.05
Bfactors> = 36.645 +/- 14.85
Bfactors> Shiftng-fct= 36.610
Bfactors> Scaling-fct= 324.291
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607071443313176463.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607071443313176463.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.4
Chkmod> 106 vectors, 10803 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3601 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 18 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7438
0.0034 0.8158
0.0034 0.6909
0.0034 0.9529
0.0034 0.7941
0.0034 0.7297
102.6130 0.5544
111.2153 0.4779
120.5753 0.5027
180.2997 0.4093
190.2593 0.3881
206.6574 0.3061
223.0393 0.4412
228.2905 0.3696
238.3719 0.3625
258.5413 0.2399
261.3310 0.2355
280.6709 0.3653
297.1984 0.4270
300.7871 0.1201
335.1444 0.4542
343.1924 0.3410
350.0132 0.3331
361.9376 0.2479
366.1482 0.1805
369.5140 0.2220
382.6815 0.3720
389.4011 0.3276
397.1958 0.3833
405.4227 0.4426
410.3371 0.3842
425.7097 0.3373
432.5787 0.2851
446.5277 0.3267
448.5038 0.1237
452.1694 0.0894
456.1934 0.2419
465.2785 0.2358
483.9119 0.3825
488.5195 0.0729
490.6869 0.2313
494.5168 0.0751
498.7901 0.1429
506.8801 0.3341
513.8113 0.2687
522.2332 0.4082
529.4089 0.2621
532.1856 0.1941
541.6289 0.3024
546.5051 0.2211
548.9807 0.1391
557.1884 0.3303
558.5622 0.2325
567.7745 0.3095
574.5868 0.4027
579.6943 0.4719
583.1419 0.3992
587.7741 0.3600
600.7701 0.4513
607.9886 0.4101
613.5869 0.4537
614.3551 0.2759
618.6584 0.3313
623.7831 0.4642
626.6121 0.5052
632.4185 0.3211
638.1721 0.4023
643.1413 0.3145
647.8905 0.1765
651.4297 0.2190
653.4177 0.4198
658.4510 0.3782
662.3789 0.4848
666.1951 0.3570
670.3415 0.2851
675.2486 0.4000
689.6752 0.3452
692.8308 0.3659
694.7852 0.2618
697.6643 0.3157
700.1106 0.3994
704.1410 0.3120
707.6488 0.1877
713.2088 0.4361
722.4077 0.3689
724.9331 0.4438
727.2877 0.3774
732.5378 0.4736
738.6291 0.4139
741.2583 0.4825
745.2244 0.2329
746.9629 0.3550
755.7510 0.4504
761.5792 0.2604
765.1318 0.4594
766.2867 0.4008
768.5147 0.5123
772.3408 0.4886
779.1048 0.3386
781.6734 0.4447
787.0851 0.1199
789.7770 0.3017
793.8720 0.3880
797.0589 0.4413
799.3486 0.3551
806.3979 0.3880
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2607071443313176463 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
making animated gifs
11 models are in 2607071443313176463.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607071443313176463.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607071443313176463.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2607071443313176463 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
making animated gifs
11 models are in 2607071443313176463.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607071443313176463.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607071443313176463.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2607071443313176463 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
making animated gifs
11 models are in 2607071443313176463.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607071443313176463.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607071443313176463.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2607071443313176463 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
making animated gifs
11 models are in 2607071443313176463.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607071443313176463.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607071443313176463.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2607071443313176463 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607071443313176463.eigenfacs
2607071443313176463.atom
making animated gifs
11 models are in 2607071443313176463.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607071443313176463.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607071443313176463.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2607071443313176463.10.pdb
2607071443313176463.11.pdb
2607071443313176463.7.pdb
2607071443313176463.8.pdb
2607071443313176463.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m13.944s
user 0m13.838s
sys 0m0.096s
rm: cannot remove '2607071443313176463.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
