*** 201 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607080941383306448.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607080941383306448.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607080941383306448.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 595
First residue number = 8
Last residue number = 314
Number of atoms found = 4141
Mean number per residue = 7.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -50.879056 +/- 20.972114 From: -95.659000 To: -11.366000
= 20.938312 +/- 11.719015 From: -11.953000 To: 51.389000
= 11.573148 +/- 12.135230 From: -18.691000 To: 39.502000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.9344 % Filled.
Pdbmat> 1492823 non-zero elements.
Pdbmat> 163138 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.79 +/- 20.66
Maximum number = 121
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 3.262760E+06
Pdbmat> Larger element = 454.561
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
595 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607080941383306448.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607080941383306448.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607080941383306448.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4141 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 595 residues.
Blocpdb> 20 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 24 atoms in block 2
Block first atom: 21
Blocpdb> 19 atoms in block 3
Block first atom: 45
Blocpdb> 12 atoms in block 4
Block first atom: 64
Blocpdb> 19 atoms in block 5
Block first atom: 76
Blocpdb> 20 atoms in block 6
Block first atom: 95
Blocpdb> 27 atoms in block 7
Block first atom: 115
Blocpdb> 22 atoms in block 8
Block first atom: 142
Blocpdb> 17 atoms in block 9
Block first atom: 164
Blocpdb> 27 atoms in block 10
Block first atom: 181
Blocpdb> 21 atoms in block 11
Block first atom: 208
Blocpdb> 23 atoms in block 12
Block first atom: 229
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 252
Blocpdb> 24 atoms in block 14
Block first atom: 271
Blocpdb> 19 atoms in block 15
Block first atom: 295
Blocpdb> 24 atoms in block 16
Block first atom: 314
Blocpdb> 23 atoms in block 17
Block first atom: 338
Blocpdb> 23 atoms in block 18
Block first atom: 361
Blocpdb> 13 atoms in block 19
Block first atom: 384
Blocpdb> 17 atoms in block 20
Block first atom: 397
Blocpdb> 23 atoms in block 21
Block first atom: 414
Blocpdb> 21 atoms in block 22
Block first atom: 437
Blocpdb> 19 atoms in block 23
Block first atom: 458
Blocpdb> 22 atoms in block 24
Block first atom: 477
Blocpdb> 22 atoms in block 25
Block first atom: 499
Blocpdb> 26 atoms in block 26
Block first atom: 521
Blocpdb> 19 atoms in block 27
Block first atom: 547
Blocpdb> 21 atoms in block 28
Block first atom: 566
Blocpdb> 25 atoms in block 29
Block first atom: 587
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 612
Blocpdb> 17 atoms in block 31
Block first atom: 628
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 645
Blocpdb> 15 atoms in block 33
Block first atom: 660
Blocpdb> 19 atoms in block 34
Block first atom: 675
Blocpdb> 18 atoms in block 35
Block first atom: 694
Blocpdb> 24 atoms in block 36
Block first atom: 712
Blocpdb> 21 atoms in block 37
Block first atom: 736
Blocpdb> 20 atoms in block 38
Block first atom: 757
Blocpdb> 18 atoms in block 39
Block first atom: 777
Blocpdb> 25 atoms in block 40
Block first atom: 795
Blocpdb> 24 atoms in block 41
Block first atom: 820
Blocpdb> 24 atoms in block 42
Block first atom: 844
Blocpdb> 25 atoms in block 43
Block first atom: 868
Blocpdb> 23 atoms in block 44
Block first atom: 893
Blocpdb> 22 atoms in block 45
Block first atom: 916
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 938
Blocpdb> 20 atoms in block 47
Block first atom: 955
Blocpdb> 17 atoms in block 48
Block first atom: 975
Blocpdb> 23 atoms in block 49
Block first atom: 992
Blocpdb> 23 atoms in block 50
Block first atom: 1015
Blocpdb> 23 atoms in block 51
Block first atom: 1038
Blocpdb> 27 atoms in block 52
Block first atom: 1061
Blocpdb> 21 atoms in block 53
Block first atom: 1088
Blocpdb> 21 atoms in block 54
Block first atom: 1109
Blocpdb> 18 atoms in block 55
Block first atom: 1130
Blocpdb> 23 atoms in block 56
Block first atom: 1148
Blocpdb> 22 atoms in block 57
Block first atom: 1171
Blocpdb> 23 atoms in block 58
Block first atom: 1193
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 1216
Blocpdb> 21 atoms in block 60
Block first atom: 1235
Blocpdb> 23 atoms in block 61
Block first atom: 1256
Blocpdb> 22 atoms in block 62
Block first atom: 1279
Blocpdb> 19 atoms in block 63
Block first atom: 1301
Blocpdb> 23 atoms in block 64
Block first atom: 1320
Blocpdb> 24 atoms in block 65
Block first atom: 1343
Blocpdb> 24 atoms in block 66
Block first atom: 1367
Blocpdb> 20 atoms in block 67
Block first atom: 1391
Blocpdb> 15 atoms in block 68
Block first atom: 1411
Blocpdb> 16 atoms in block 69
Block first atom: 1426
Blocpdb> 20 atoms in block 70
Block first atom: 1442
Blocpdb> 18 atoms in block 71
Block first atom: 1462
Blocpdb> 20 atoms in block 72
Block first atom: 1480
Blocpdb> 24 atoms in block 73
Block first atom: 1500
Blocpdb> 19 atoms in block 74
Block first atom: 1524
Blocpdb> 19 atoms in block 75
Block first atom: 1543
Blocpdb> 21 atoms in block 76
Block first atom: 1562
Blocpdb> 21 atoms in block 77
Block first atom: 1583
Blocpdb> 25 atoms in block 78
Block first atom: 1604
Blocpdb> 19 atoms in block 79
Block first atom: 1629
Blocpdb> 18 atoms in block 80
Block first atom: 1648
Blocpdb> 16 atoms in block 81
Block first atom: 1666
Blocpdb> 22 atoms in block 82
Block first atom: 1682
Blocpdb> 17 atoms in block 83
Block first atom: 1704
Blocpdb> 18 atoms in block 84
Block first atom: 1721
Blocpdb> 20 atoms in block 85
Block first atom: 1739
Blocpdb> 28 atoms in block 86
Block first atom: 1759
Blocpdb> 19 atoms in block 87
Block first atom: 1787
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 1806
Blocpdb> 24 atoms in block 89
Block first atom: 1825
Blocpdb> 20 atoms in block 90
Block first atom: 1849
Blocpdb> 20 atoms in block 91
Block first atom: 1869
Blocpdb> 24 atoms in block 92
Block first atom: 1889
Blocpdb> 22 atoms in block 93
Block first atom: 1913
Blocpdb> 23 atoms in block 94
Block first atom: 1935
Blocpdb> 22 atoms in block 95
Block first atom: 1958
Blocpdb> 21 atoms in block 96
Block first atom: 1980
Blocpdb> 25 atoms in block 97
Block first atom: 2001
Blocpdb> 22 atoms in block 98
Block first atom: 2026
Blocpdb> 14 atoms in block 99
Block first atom: 2048
Blocpdb> 11 atoms in block 100
Block first atom: 2062
Blocpdb> 28 atoms in block 101
Block first atom: 2073
Blocpdb> 20 atoms in block 102
Block first atom: 2101
Blocpdb> 23 atoms in block 103
Block first atom: 2121
Blocpdb> 16 atoms in block 104
Block first atom: 2144
Blocpdb> 12 atoms in block 105
Block first atom: 2160
Blocpdb> 20 atoms in block 106
Block first atom: 2172
Blocpdb> 26 atoms in block 107
Block first atom: 2192
Blocpdb> 25 atoms in block 108
Block first atom: 2218
Blocpdb> 21 atoms in block 109
Block first atom: 2243
Blocpdb> 17 atoms in block 110
Block first atom: 2264
Blocpdb> 28 atoms in block 111
Block first atom: 2281
Blocpdb> 21 atoms in block 112
Block first atom: 2309
Blocpdb> 20 atoms in block 113
Block first atom: 2330
Blocpdb> 19 atoms in block 114
Block first atom: 2350
Blocpdb> 22 atoms in block 115
Block first atom: 2369
Blocpdb> 21 atoms in block 116
Block first atom: 2391
Blocpdb> 24 atoms in block 117
Block first atom: 2412
Blocpdb> 19 atoms in block 118
Block first atom: 2436
Blocpdb> 5 atoms in block 119
Block first atom: 2455
Blocpdb> 20 atoms in block 120
Block first atom: 2460
Blocpdb> 16 atoms in block 121
Block first atom: 2480
Blocpdb> 21 atoms in block 122
Block first atom: 2496
Blocpdb> 22 atoms in block 123
Block first atom: 2517
Blocpdb> 22 atoms in block 124
Block first atom: 2539
Blocpdb> 26 atoms in block 125
Block first atom: 2561
Blocpdb> 25 atoms in block 126
Block first atom: 2587
Blocpdb> 20 atoms in block 127
Block first atom: 2612
Blocpdb> 23 atoms in block 128
Block first atom: 2632
Blocpdb> 25 atoms in block 129
Block first atom: 2655
Blocpdb> 18 atoms in block 130
Block first atom: 2680
Blocpdb> 12 atoms in block 131
Block first atom: 2698
Blocpdb> 18 atoms in block 132
Block first atom: 2710
Blocpdb> 13 atoms in block 133
Block first atom: 2728
Blocpdb> 21 atoms in block 134
Block first atom: 2741
Blocpdb> 19 atoms in block 135
Block first atom: 2762
Blocpdb> 18 atoms in block 136
Block first atom: 2781
Blocpdb> 17 atoms in block 137
Block first atom: 2799
Blocpdb> 22 atoms in block 138
Block first atom: 2816
Blocpdb> 18 atoms in block 139
Block first atom: 2838
Blocpdb> 22 atoms in block 140
Block first atom: 2856
Blocpdb> 28 atoms in block 141
Block first atom: 2878
Blocpdb> 22 atoms in block 142
Block first atom: 2906
Blocpdb> 9 atoms in block 143
Block first atom: 2928
Blocpdb> 19 atoms in block 144
Block first atom: 2937
Blocpdb> 20 atoms in block 145
Block first atom: 2956
Blocpdb> 18 atoms in block 146
Block first atom: 2976
Blocpdb> 26 atoms in block 147
Block first atom: 2994
Blocpdb> 21 atoms in block 148
Block first atom: 3020
Blocpdb> 23 atoms in block 149
Block first atom: 3041
Blocpdb> 23 atoms in block 150
Block first atom: 3064
Blocpdb> 24 atoms in block 151
Block first atom: 3087
Blocpdb> 25 atoms in block 152
Block first atom: 3111
Blocpdb> 17 atoms in block 153
Block first atom: 3136
Blocpdb> 18 atoms in block 154
Block first atom: 3153
Blocpdb> 24 atoms in block 155
Block first atom: 3171
Blocpdb> 27 atoms in block 156
Block first atom: 3195
Blocpdb> 19 atoms in block 157
Block first atom: 3222
Blocpdb> 24 atoms in block 158
Block first atom: 3241
Blocpdb> 20 atoms in block 159
Block first atom: 3265
Blocpdb> 20 atoms in block 160
Block first atom: 3285
Blocpdb> 23 atoms in block 161
Block first atom: 3305
Blocpdb> 23 atoms in block 162
Block first atom: 3328
Blocpdb> 18 atoms in block 163
Block first atom: 3351
Blocpdb> 24 atoms in block 164
Block first atom: 3369
Blocpdb> 26 atoms in block 165
Block first atom: 3393
Blocpdb> 20 atoms in block 166
Block first atom: 3419
Blocpdb> 21 atoms in block 167
Block first atom: 3439
Blocpdb> 18 atoms in block 168
Block first atom: 3460
Blocpdb> 16 atoms in block 169
Block first atom: 3478
Blocpdb> 21 atoms in block 170
Block first atom: 3494
Blocpdb> 16 atoms in block 171
Block first atom: 3515
Blocpdb> 18 atoms in block 172
Block first atom: 3531
Blocpdb> 17 atoms in block 173
Block first atom: 3549
Blocpdb> 25 atoms in block 174
Block first atom: 3566
Blocpdb> 15 atoms in block 175
Block first atom: 3591
Blocpdb> 22 atoms in block 176
Block first atom: 3606
Blocpdb> 22 atoms in block 177
Block first atom: 3628
Blocpdb> 23 atoms in block 178
Block first atom: 3650
Blocpdb> 20 atoms in block 179
Block first atom: 3673
Blocpdb> 21 atoms in block 180
Block first atom: 3693
Blocpdb> 18 atoms in block 181
Block first atom: 3714
Blocpdb> 23 atoms in block 182
Block first atom: 3732
Blocpdb> 19 atoms in block 183
Block first atom: 3755
Blocpdb> 14 atoms in block 184
Block first atom: 3774
Blocpdb> 20 atoms in block 185
Block first atom: 3788
Blocpdb> 28 atoms in block 186
Block first atom: 3808
Blocpdb> 22 atoms in block 187
Block first atom: 3836
Blocpdb> 16 atoms in block 188
Block first atom: 3858
Blocpdb> 24 atoms in block 189
Block first atom: 3874
Blocpdb> 18 atoms in block 190
Block first atom: 3898
Blocpdb> 25 atoms in block 191
Block first atom: 3916
Blocpdb> 21 atoms in block 192
Block first atom: 3941
Blocpdb> 23 atoms in block 193
Block first atom: 3962
Blocpdb> 22 atoms in block 194
Block first atom: 3985
Blocpdb> 22 atoms in block 195
Block first atom: 4007
Blocpdb> 20 atoms in block 196
Block first atom: 4029
Blocpdb> 24 atoms in block 197
Block first atom: 4049
Blocpdb> 21 atoms in block 198
Block first atom: 4073
Blocpdb> 18 atoms in block 199
Block first atom: 4094
Blocpdb> 23 atoms in block 200
Block first atom: 4112
Blocpdb> 7 atoms in block 201
Block first atom: 4134
Blocpdb> 201 blocks.
Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1493024 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 12423
Prepmat> Matrix trace = 3262760.0000
Prepmat> Last element read: 12423 12423 98.4908
Prepmat> 20302 lines saved.
Prepmat> 18226 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4141
RTB> Total mass = 4141.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4141
RTB> Number of blocks = 201
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 252848.2149
RTB> 71685 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1206
Diagstd> Nb of non-zero elements: 71685
Diagstd> Projected matrix trace = 252848.2149
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1206 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 252848.2149
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.4374805 0.6126378 1.1322771 2.2491385
2.9815037 3.6619505 4.1430997 4.6443587 5.2494727
5.7415974 6.6648364 6.9783263 7.7287426 8.2368732
8.4805726 8.7929562 9.2044188 9.2734995 10.2896328
10.6936293 11.1004846 11.8152241 12.2300757 13.5327873
14.0686667 14.3817977 15.1815138 15.5301454 16.2331178
16.7983296 17.5572356 18.0291486 18.4853190 19.4550983
19.8129738 20.1438291 20.7821902 21.1322333 21.4385312
21.9425095 22.2048279 23.5481217 23.7592983 24.6295858
24.7128145 24.8658954 25.9190000 26.3572769 27.0668872
27.3520861 27.3797197 28.1829693 28.5812805 28.9215061
29.3221780 29.9205043 31.0051840 31.2347283 31.4286918
32.0226698 32.1479443 32.8940676 33.8764827 35.0703518
35.3379997 35.7672749 35.9358186 36.2351090 36.5464709
36.9310146 36.9377077 37.3748220 38.3146126 38.5074786
38.9519157 39.2179082 39.8603073 40.4492402 40.6856684
41.1190613 41.4992055 42.2168303 42.3871947 42.5706046
43.6227232 43.7496021 44.0227355 44.3630735 44.4385071
44.7224219 45.4270705 45.8205768 46.5076715 47.0027833
47.3685468 47.8063969 48.1304311 48.6363794 48.8374577
49.2300089
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034314 0.0034326 0.0034331 0.0034337 0.0034338
0.0034347 71.8248335 84.9957400 115.5504527 162.8558568
187.5050447 207.8028565 221.0334342 234.0227915 248.8015720
260.2026091 280.3432010 286.8606101 301.8906773 311.6567020
316.2334960 322.0050881 329.4529985 330.6869883 348.3334806
355.1058631 361.7980730 373.2641337 379.7605539 399.4743593
407.3068840 411.8147225 423.1095418 427.9401570 437.5183277
445.0700076 455.0125216 461.0870130 466.8837458 478.9740608
483.3593376 487.3784187 495.0407364 499.1924156 502.7971343
508.6726970 511.7042054 526.9548623 529.3124215 538.9194210
539.8292161 541.4985919 552.8462926 557.5008706 564.9557544
567.9243741 568.2111863 576.4858527 580.5453106 583.9904338
588.0217539 593.9908221 604.6616667 606.8958200 608.7772751
614.5030585 615.7038706 622.8078400 632.0398143 643.0805014
645.5297493 649.4387625 650.9671173 653.6722770 656.4747151
659.9194063 659.9792029 663.8727561 672.1674843 673.8571202
677.7346516 680.0447512 685.5917795 690.6379908 692.6534602
696.3328373 699.5442181 705.5667257 706.9889361 708.5168599
717.2188037 718.2610793 720.4996811 723.2793964 723.8940562
726.2028309 731.9015142 735.0646818 740.5554432 744.4869132
747.3780018 750.8242428 753.3645081 757.3138497 758.8777235
761.9215150
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4141
Rtb_to_modes> Number of blocs = 201
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9853E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9919E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4375
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6126
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.132
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.249
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.982
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.662
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.143
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.644
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.249
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.742
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.665
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.978
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.729
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.237
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.481
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.793
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.204
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.273
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.38
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.23
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1206 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000
1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999
1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00003 1.00002 0.99999 1.00002 1.00003
0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998
1.00000 0.99999 0.99997 1.00004 0.99999
1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002
1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002
1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 0.99998
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998
1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 74538 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000
1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999
1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00003 1.00002 0.99999 1.00002 1.00003
0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998
1.00000 0.99999 0.99997 1.00004 0.99999
1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002
1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002
1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 0.99998
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998
1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607080941383306448.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607080941383306448.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607080941383306448.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607080941383306448.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 595
First residue number = 8
Last residue number = 314
Number of atoms found = 4141
Mean number per residue = 7.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9853E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9919E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4375
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6126
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.132
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.249
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.982
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.662
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.143
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.644
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.249
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.742
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.665
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.978
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.729
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.237
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.481
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.793
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.204
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.273
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.38
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.23
Bfactors> 106 vectors, 12423 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.437500
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.545 for 595 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.038 +/- 0.04
Bfactors> = 37.123 +/- 16.31
Bfactors> Shiftng-fct= 37.086
Bfactors> Scaling-fct= 439.983
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607080941383306448.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607080941383306448.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.9
Chkmod> 106 vectors, 12423 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4141 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 24 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7630
0.0034 0.9342
0.0034 0.9084
0.0034 0.8765
0.0034 0.6862
0.0034 0.7925
71.8234 0.5946
84.9895 0.6356
115.5314 0.6841
162.8439 0.5753
187.5126 0.6410
207.7953 0.4385
221.0213 0.7700
234.0037 0.3511
248.7797 0.0147
260.2006 0.5461
280.3346 0.3433
286.8416 0.2586
301.8827 0.2706
311.6457 0.0992
316.2279 0.4311
321.9921 0.0927
329.4314 0.0065
330.6639 0.0356
348.3247 0.2323
355.0304 0.2091
361.7746 0.2443
373.3235 0.4569
379.7431 0.4423
399.4161 0.3047
407.3087 0.5060
411.7713 0.4927
423.0703 0.4208
427.9198 0.2422
437.4575 0.2096
445.0730 0.4568
455.0288 0.2480
461.0781 0.3224
466.9228 0.4797
479.0138 0.2179
483.3023 0.3444
487.3112 0.3251
494.9934 0.2474
499.1446 0.4555
502.7928 0.3339
508.6218 0.3692
511.6266 0.5199
526.9533 0.2723
529.2975 0.4905
538.9008 0.5874
539.7753 0.4037
541.5200 0.5151
552.8332 0.4471
557.5057 0.3147
564.9640 0.5030
567.8783 0.5415
568.1897 0.4045
576.4307 0.4010
580.5074 0.4656
583.9502 0.2834
587.9747 0.4905
593.9603 0.4802
604.6827 0.3398
606.8238 0.4321
608.7638 0.2791
614.4511 0.4807
615.6971 0.4209
622.7426 0.3379
632.0455 0.3792
643.0497 0.4534
645.5203 0.3913
649.4356 0.5030
650.9770 0.4493
653.6883 0.3811
656.4782 0.3347
659.8820 0.3459
659.9713 0.3619
663.8014 0.4139
672.0982 0.3962
673.8503 0.4376
677.6889 0.4303
680.0337 0.3494
685.5597 0.3123
690.6148 0.5253
692.6606 0.5598
696.3109 0.6067
699.5209 0.4284
705.5629 0.4927
706.9820 0.5326
708.4814 0.5287
717.1656 0.3698
718.2335 0.6047
720.4464 0.5170
723.2233 0.4285
723.8751 0.5011
726.1520 0.4951
731.8937 0.4730
735.0285 0.3833
740.5422 0.5105
744.4329 0.5042
747.3574 0.5322
750.8203 0.4390
753.3288 0.4985
757.3095 0.4644
758.8649 0.5341
761.8887 0.5398
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2607080941383306448.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607080941383306448.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2607080941383306448.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607080941383306448.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2607080941383306448.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2607080941383306448.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.9
Projmod> 106 vectors, 12423 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 595
First residue number = 8
Last residue number = 314
Number of atoms found = 4141
Mean number per residue = 7.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 598
First residue number = 7
Last residue number = 315
Number of atoms found = 4189
Mean number per residue = 7.0
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Atom 390 of first conformer: THR 63 N not found in second one.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2607080941383306448 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
making animated gifs
11 models are in 2607080941383306448.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607080941383306448.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607080941383306448.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 298 17.329
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 298 17.324
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 298 17.322
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 298 17.323
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 298 17.327
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 298 17.334
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 298 17.344
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 298 17.357
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 298 17.373
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 298 17.392
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 298 17.415
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2607080941383306448 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
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2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
2607080941383306448.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 298 17.288
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 298 17.295
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 298 17.303
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 298 17.312
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 298 17.322
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 298 17.334
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 298 17.347
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 298 17.361
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 298 17.376
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 298 17.393
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 298 17.410
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2607080941383306448 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 298 17.941
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 298 17.815
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 298 17.692
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 298 17.570
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 298 17.451
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 298 17.334
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 298 17.219
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 298 17.107
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 298 16.997
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 298 16.889
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 298 16.785
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2607080941383306448 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607080941383306448.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 298 17.443
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 298 17.409
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 298 17.382
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 298 17.360
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 298 17.344
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 298 17.334
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 298 17.330
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 298 17.331
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 298 17.338
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 298 17.351
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 298 17.370
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2607080941383306448 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
2607080941383306448.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-60
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607080941383306448.eigenfacs
2607080941383306448.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607080941383306448.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=40
2607080941383306448.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
2607080941383306448.eigenfacs
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607080941383306448.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 298 17.804
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 298 17.702
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 298 17.604
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 298 17.510
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MODEL 7 MODE=11 DQ=20 298 17.253
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 298 17.175
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 298 17.103
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MODEL 11 MODE=11 DQ=100 298 16.971 174 1.072
2607080941383306448.10.pdb
2607080941383306448.11.pdb
2607080941383306448.7.pdb
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2607080941383306448.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m26.682s
user 0m26.530s
sys 0m0.148s
rm: cannot remove '2607080941383306448.sdijf': No such file or directory
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