*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607081251143332259.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607081251143332259.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607081251143332259.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1383
First residue number = 53
Last residue number = 12
Number of atoms found = 11308
Mean number per residue = 8.2
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 159.011126 +/- 19.266625 From: 107.170000 To: 201.068000
= 170.741527 +/- 20.895971 From: 111.729000 To: 216.791000
= 179.048132 +/- 24.889879 From: 125.990000 To: 232.856000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 33 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.7055 % Filled.
Pdbmat> 4059692 non-zero elements.
Pdbmat> 443616 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.46 +/- 20.92
Maximum number = 124
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 8.872320E+06
Pdbmat> Larger element = 491.041
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1383 non-zero elements, NRBL set to 7
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607081251143332259.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 7
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607081251143332259.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607081251143332259.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 11308 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 7 residue(s) per block.
Blocpdb> 1383 residues.
Blocpdb> 61 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 51 atoms in block 2
Block first atom: 62
Blocpdb> 51 atoms in block 3
Block first atom: 113
Blocpdb> 58 atoms in block 4
Block first atom: 164
Blocpdb> 62 atoms in block 5
Block first atom: 222
Blocpdb> 52 atoms in block 6
Block first atom: 284
Blocpdb> 46 atoms in block 7
Block first atom: 336
Blocpdb> 58 atoms in block 8
Block first atom: 382
Blocpdb> 55 atoms in block 9
Block first atom: 440
Blocpdb> 60 atoms in block 10
Block first atom: 495
Blocpdb> 54 atoms in block 11
Block first atom: 555
Blocpdb> 53 atoms in block 12
Block first atom: 609
Blocpdb> 50 atoms in block 13
Block first atom: 662
Blocpdb> 45 atoms in block 14
Block first atom: 712
Blocpdb> 58 atoms in block 15
Block first atom: 757
Blocpdb> 58 atoms in block 16
Block first atom: 815
Blocpdb> 51 atoms in block 17
Block first atom: 873
Blocpdb> 53 atoms in block 18
Block first atom: 924
Blocpdb> 66 atoms in block 19
Block first atom: 977
Blocpdb> 54 atoms in block 20
Block first atom: 1043
Blocpdb> 48 atoms in block 21
Block first atom: 1097
Blocpdb> 43 atoms in block 22
Block first atom: 1145
Blocpdb> 57 atoms in block 23
Block first atom: 1188
Blocpdb> 46 atoms in block 24
Block first atom: 1245
Blocpdb> 50 atoms in block 25
Block first atom: 1291
Blocpdb> 62 atoms in block 26
Block first atom: 1341
Blocpdb> 58 atoms in block 27
Block first atom: 1403
Blocpdb> 58 atoms in block 28
Block first atom: 1461
Blocpdb> 57 atoms in block 29
Block first atom: 1519
Blocpdb> 59 atoms in block 30
Block first atom: 1576
Blocpdb> 52 atoms in block 31
Block first atom: 1635
Blocpdb> 59 atoms in block 32
Block first atom: 1687
Blocpdb> 54 atoms in block 33
Block first atom: 1746
Blocpdb> 54 atoms in block 34
Block first atom: 1800
Blocpdb> 58 atoms in block 35
Block first atom: 1854
Blocpdb> 52 atoms in block 36
Block first atom: 1912
Blocpdb> 52 atoms in block 37
Block first atom: 1964
Blocpdb> 56 atoms in block 38
Block first atom: 2016
Blocpdb> 52 atoms in block 39
Block first atom: 2072
Blocpdb> 60 atoms in block 40
Block first atom: 2124
Blocpdb> 56 atoms in block 41
Block first atom: 2184
Blocpdb> 52 atoms in block 42
Block first atom: 2240
Blocpdb> 53 atoms in block 43
Block first atom: 2292
Blocpdb> 68 atoms in block 44
Block first atom: 2345
Blocpdb> 51 atoms in block 45
Block first atom: 2413
Blocpdb> 58 atoms in block 46
Block first atom: 2464
Blocpdb> 60 atoms in block 47
Block first atom: 2522
Blocpdb> 53 atoms in block 48
Block first atom: 2582
Blocpdb> 57 atoms in block 49
Block first atom: 2635
Blocpdb> 55 atoms in block 50
Block first atom: 2692
Blocpdb> 66 atoms in block 51
Block first atom: 2747
Blocpdb> 62 atoms in block 52
Block first atom: 2813
Blocpdb> 64 atoms in block 53
Block first atom: 2875
Blocpdb> 46 atoms in block 54
Block first atom: 2939
Blocpdb> 63 atoms in block 55
Block first atom: 2985
Blocpdb> 60 atoms in block 56
Block first atom: 3048
Blocpdb> 62 atoms in block 57
Block first atom: 3108
Blocpdb> 50 atoms in block 58
Block first atom: 3170
Blocpdb> 51 atoms in block 59
Block first atom: 3220
Blocpdb> 56 atoms in block 60
Block first atom: 3271
Blocpdb> 59 atoms in block 61
Block first atom: 3327
Blocpdb> 53 atoms in block 62
Block first atom: 3386
Blocpdb> 57 atoms in block 63
Block first atom: 3439
Blocpdb> 62 atoms in block 64
Block first atom: 3496
Blocpdb> 60 atoms in block 65
Block first atom: 3558
Blocpdb> 64 atoms in block 66
Block first atom: 3618
Blocpdb> 57 atoms in block 67
Block first atom: 3682
Blocpdb> 48 atoms in block 68
Block first atom: 3739
Blocpdb> 56 atoms in block 69
Block first atom: 3787
Blocpdb> 52 atoms in block 70
Block first atom: 3843
Blocpdb> 50 atoms in block 71
Block first atom: 3895
Blocpdb> 66 atoms in block 72
Block first atom: 3945
Blocpdb> 50 atoms in block 73
Block first atom: 4011
Blocpdb> 57 atoms in block 74
Block first atom: 4061
Blocpdb> 51 atoms in block 75
Block first atom: 4118
Blocpdb> 53 atoms in block 76
Block first atom: 4169
Blocpdb> 63 atoms in block 77
Block first atom: 4222
Blocpdb> 54 atoms in block 78
Block first atom: 4285
Blocpdb> 50 atoms in block 79
Block first atom: 4339
Blocpdb> 56 atoms in block 80
Block first atom: 4389
Blocpdb> 55 atoms in block 81
Block first atom: 4445
Blocpdb> 49 atoms in block 82
Block first atom: 4500
Blocpdb> 37 atoms in block 83
Block first atom: 4549
Blocpdb> 35 atoms in block 84
Block first atom: 4586
Blocpdb> 37 atoms in block 85
Block first atom: 4621
Blocpdb> 46 atoms in block 86
Block first atom: 4658
Blocpdb> 52 atoms in block 87
Block first atom: 4704
Blocpdb> 57 atoms in block 88
Block first atom: 4756
Blocpdb> 44 atoms in block 89
Block first atom: 4813
Blocpdb> 41 atoms in block 90
Block first atom: 4857
Blocpdb> 60 atoms in block 91
Block first atom: 4898
Blocpdb> 57 atoms in block 92
Block first atom: 4958
Blocpdb> 52 atoms in block 93
Block first atom: 5015
Blocpdb> 50 atoms in block 94
Block first atom: 5067
Blocpdb> 47 atoms in block 95
Block first atom: 5117
Blocpdb> 45 atoms in block 96
Block first atom: 5164
Blocpdb> 35 atoms in block 97
Block first atom: 5209
Blocpdb> 50 atoms in block 98
Block first atom: 5244
Blocpdb> 50 atoms in block 99
Block first atom: 5294
Blocpdb> 55 atoms in block 100
Block first atom: 5344
Blocpdb> 58 atoms in block 101
Block first atom: 5399
Blocpdb> 68 atoms in block 102
Block first atom: 5457
Blocpdb> 57 atoms in block 103
Block first atom: 5525
Blocpdb> 58 atoms in block 104
Block first atom: 5582
Blocpdb> 47 atoms in block 105
Block first atom: 5640
Blocpdb> 52 atoms in block 106
Block first atom: 5687
Blocpdb> 55 atoms in block 107
Block first atom: 5739
Blocpdb> 44 atoms in block 108
Block first atom: 5794
Blocpdb> 56 atoms in block 109
Block first atom: 5838
Blocpdb> 49 atoms in block 110
Block first atom: 5894
Blocpdb> 55 atoms in block 111
Block first atom: 5943
Blocpdb> 52 atoms in block 112
Block first atom: 5998
Blocpdb> 61 atoms in block 113
Block first atom: 6050
Blocpdb> 65 atoms in block 114
Block first atom: 6111
Blocpdb> 64 atoms in block 115
Block first atom: 6176
Blocpdb> 58 atoms in block 116
Block first atom: 6240
Blocpdb> 59 atoms in block 117
Block first atom: 6298
Blocpdb> 48 atoms in block 118
Block first atom: 6357
Blocpdb> 51 atoms in block 119
Block first atom: 6405
Blocpdb> 58 atoms in block 120
Block first atom: 6456
Blocpdb> 56 atoms in block 121
Block first atom: 6514
Blocpdb> 57 atoms in block 122
Block first atom: 6570
Blocpdb> 64 atoms in block 123
Block first atom: 6627
Blocpdb> 59 atoms in block 124
Block first atom: 6691
Blocpdb> 55 atoms in block 125
Block first atom: 6750
Blocpdb> 49 atoms in block 126
Block first atom: 6805
Blocpdb> 54 atoms in block 127
Block first atom: 6854
Blocpdb> 53 atoms in block 128
Block first atom: 6908
Blocpdb> 48 atoms in block 129
Block first atom: 6961
Blocpdb> 56 atoms in block 130
Block first atom: 7009
Blocpdb> 65 atoms in block 131
Block first atom: 7065
Blocpdb> 53 atoms in block 132
Block first atom: 7130
Blocpdb> 63 atoms in block 133
Block first atom: 7183
Blocpdb> 56 atoms in block 134
Block first atom: 7246
Blocpdb> 60 atoms in block 135
Block first atom: 7302
Blocpdb> 56 atoms in block 136
Block first atom: 7362
Blocpdb> 50 atoms in block 137
Block first atom: 7418
Blocpdb> 50 atoms in block 138
Block first atom: 7468
Blocpdb> 65 atoms in block 139
Block first atom: 7518
Blocpdb> 62 atoms in block 140
Block first atom: 7583
Blocpdb> 66 atoms in block 141
Block first atom: 7645
Blocpdb> 51 atoms in block 142
Block first atom: 7711
Blocpdb> 51 atoms in block 143
Block first atom: 7762
Blocpdb> 51 atoms in block 144
Block first atom: 7813
Blocpdb> 58 atoms in block 145
Block first atom: 7864
Blocpdb> 57 atoms in block 146
Block first atom: 7922
Blocpdb> 54 atoms in block 147
Block first atom: 7979
Blocpdb> 65 atoms in block 148
Block first atom: 8033
Blocpdb> 56 atoms in block 149
Block first atom: 8098
Blocpdb> 49 atoms in block 150
Block first atom: 8154
Blocpdb> 55 atoms in block 151
Block first atom: 8203
Blocpdb> 48 atoms in block 152
Block first atom: 8258
Blocpdb> 50 atoms in block 153
Block first atom: 8306
Blocpdb> 53 atoms in block 154
Block first atom: 8356
Blocpdb> 51 atoms in block 155
Block first atom: 8409
Blocpdb> 45 atoms in block 156
Block first atom: 8460
Blocpdb> 57 atoms in block 157
Block first atom: 8505
Blocpdb> 54 atoms in block 158
Block first atom: 8562
Blocpdb> 44 atoms in block 159
Block first atom: 8616
Blocpdb> 55 atoms in block 160
Block first atom: 8660
Blocpdb> 46 atoms in block 161
Block first atom: 8715
Blocpdb> 53 atoms in block 162
Block first atom: 8761
Blocpdb> 57 atoms in block 163
Block first atom: 8814
Blocpdb> 55 atoms in block 164
Block first atom: 8871
Blocpdb> 62 atoms in block 165
Block first atom: 8926
Blocpdb> 55 atoms in block 166
Block first atom: 8988
Blocpdb> 59 atoms in block 167
Block first atom: 9043
Blocpdb> 58 atoms in block 168
Block first atom: 9102
Blocpdb> 53 atoms in block 169
Block first atom: 9160
Blocpdb> 59 atoms in block 170
Block first atom: 9213
Blocpdb> 53 atoms in block 171
Block first atom: 9272
Blocpdb> 57 atoms in block 172
Block first atom: 9325
Blocpdb> 50 atoms in block 173
Block first atom: 9382
Blocpdb> 55 atoms in block 174
Block first atom: 9432
Blocpdb> 54 atoms in block 175
Block first atom: 9487
Blocpdb> 59 atoms in block 176
Block first atom: 9541
Blocpdb> 60 atoms in block 177
Block first atom: 9600
Blocpdb> 63 atoms in block 178
Block first atom: 9660
Blocpdb> 54 atoms in block 179
Block first atom: 9723
Blocpdb> 69 atoms in block 180
Block first atom: 9777
Blocpdb> 65 atoms in block 181
Block first atom: 9846
Blocpdb> 22 atoms in block 182
Block first atom: 9911
Blocpdb> 144 atoms in block 183
Block first atom: 9933
Blocpdb> 140 atoms in block 184
Block first atom: 10077
Blocpdb> 39 atoms in block 185
Block first atom: 10217
Blocpdb> 149 atoms in block 186
Block first atom: 10256
Blocpdb> 143 atoms in block 187
Block first atom: 10405
Blocpdb> 41 atoms in block 188
Block first atom: 10548
Blocpdb> 18 atoms in block 189
Block first atom: 10589
Blocpdb> 26 atoms in block 190
Block first atom: 10607
Blocpdb> 64 atoms in block 191
Block first atom: 10633
Blocpdb> 51 atoms in block 192
Block first atom: 10697
Blocpdb> 60 atoms in block 193
Block first atom: 10748
Blocpdb> 59 atoms in block 194
Block first atom: 10808
Blocpdb> 59 atoms in block 195
Block first atom: 10867
Blocpdb> 56 atoms in block 196
Block first atom: 10926
Blocpdb> 48 atoms in block 197
Block first atom: 10982
Blocpdb> 22 atoms in block 198
Block first atom: 11030
Blocpdb> 62 atoms in block 199
Block first atom: 11052
Blocpdb> 57 atoms in block 200
Block first atom: 11114
Blocpdb> 54 atoms in block 201
Block first atom: 11171
Blocpdb> 62 atoms in block 202
Block first atom: 11225
Blocpdb> 22 atoms in block 203
Block first atom: 11286
Blocpdb> 203 blocks.
Blocpdb> At most, 149 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 18 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 4059895 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 33924
Prepmat> Matrix trace = 8872320.0000
Prepmat> Last element read: 33924 33924 13.3996
Prepmat> 20707 lines saved.
Prepmat> 19183 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11308
RTB> Total mass = 11308.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 11308
RTB> Number of blocks = 203
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 193902.8559
RTB> 51783 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1218
Diagstd> Nb of non-zero elements: 51783
Diagstd> Projected matrix trace = 193902.8559
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1218 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 193902.8559
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 12 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
%Diagstd-Wn> Six expected. Parts of the structure interact too little ?
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.1710321 0.1808049 0.2622380
0.2970914 0.3367317 0.5158053 0.6275017 0.7107481
0.7749936 0.9244730 1.0003987 1.0433987 1.0941143
1.2135828 1.2652462 1.4825761 1.6145438 1.7961885
2.0997051 2.3165475 2.6255721 2.8377007 3.2663423
3.4998453 3.5635048 3.8277864 4.0835894 4.3673211
4.8135763 5.1065074 5.3297087 5.5423716 5.9438230
6.2096471 6.3585075 6.5441870 7.1623060 7.3684466
7.6150198 7.7001010 7.8252864 8.1645993 8.6275665
8.9251271 9.3198650 9.5272130 9.7399801 9.9579497
10.3766370 10.9271366 10.9660514 11.4088489 11.7238580
12.1398839 12.3277814 12.7748322 12.8914793 13.0031668
13.5590135 13.8060141 14.3900268 14.6063459 14.8093334
15.1960833 15.4933135 15.6779308 16.1621878 16.6096889
16.6618828 16.8118498 17.2612846 17.6517320 18.0736665
18.6369014 18.8491008 19.3732876 19.8408313 20.0729317
20.4053224 20.6028086 21.2999971 21.7437764 22.1317566
22.2172842 22.2987886 22.6915544 23.0158761 23.2204366
23.3833358 23.7809677 24.2546179 24.8256962 25.1359296
25.2570394
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034337 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034340
0.0034340 0.0034340 0.0034342 0.0034343 0.0034345
0.0034346 0.0034349 44.9090781 46.1743013 55.6087426
59.1889115 63.0140302 77.9898643 86.0206550 91.5488993
95.5970169 104.4100744 108.6130102 110.9226989 113.5864744
119.6272136 122.1470000 132.2220178 137.9812903 145.5362671
157.3527852 165.2783182 175.9572863 182.9273224 196.2574399
203.1513468 204.9906030 212.4560633 219.4402628 226.9357116
238.2479709 245.3902272 250.6957750 255.6484122 264.7452723
270.6005907 273.8248603 277.7941717 290.6174699 294.7699790
299.6613971 301.3307764 303.7703636 310.2863841 318.9623622
324.4161638 331.5126391 335.1800934 338.9021435 342.6732822
349.8030504 358.9619912 359.6006100 366.7889093 371.8181232
378.3576740 381.2744846 388.1261309 389.8940956 391.5794088
399.8612572 403.4868978 411.9325222 415.0171764 417.8910166
423.3125195 427.4323951 429.9714815 436.5614208 442.5639452
443.2587511 445.2490798 451.1612977 456.2353614 461.6559230
468.7940962 471.4553829 477.9659333 483.6990259 486.5199844
490.5316238 492.8996323 501.1699836 506.3639360 510.8615567
511.8477109 512.7857121 517.2820438 520.9655860 523.2755843
525.1078534 529.5537429 534.8013549 541.0607110 544.4308871
545.7408981
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11308
Rtb_to_modes> Number of blocs = 203
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1710
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1808
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2622
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2971
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3367
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5158
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6275
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7107
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7750
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9245
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.000
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.043
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.094
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.214
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.265
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.483
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.615
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.796
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.100
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.317
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.626
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.838
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.266
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.500
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.564
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.828
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.084
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.367
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.814
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.107
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.330
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.542
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.944
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.210
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.359
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.544
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.162
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.368
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.615
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.700
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.825
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.165
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.628
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.925
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.320
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.527
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.740
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.958
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.26
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1218 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002
1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001
1.00004 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
0.99997 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001
0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
0.99998 1.00004 1.00002 1.00001 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00003
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001
1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998
1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 0.99998 1.00003 0.99999 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 203544 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002
1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001
1.00004 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
0.99997 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001
0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
0.99998 1.00004 1.00002 1.00001 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00003
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001
1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998
1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 0.99998 1.00003 0.99999 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607081251143332259.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607081251143332259.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607081251143332259.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607081251143332259.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1383
First residue number = 53
Last residue number = 12
Number of atoms found = 11308
Mean number per residue = 8.2
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1710
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1808
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2622
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2971
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3367
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5158
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6275
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7107
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7750
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9245
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.000
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.043
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.094
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.214
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.265
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.483
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.615
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.796
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.100
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.317
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.626
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.838
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.266
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.500
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.564
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.828
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.084
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.367
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.814
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.107
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.330
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.542
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.944
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.210
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.359
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.544
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.162
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.368
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.615
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.700
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.825
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.165
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.628
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.925
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.320
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.527
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.740
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.958
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.26
Bfactors> 106 vectors, 33924 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 12 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.171000
Bfactors> 94 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.680 for 1350 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.061 +/- 0.08
Bfactors> = 122.869 +/- 51.60
Bfactors> Shiftng-fct= 122.807
Bfactors> Scaling-fct= 671.942
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607081251143332259.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607081251143332259.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.7
Chkmod> 106 vectors, 33924 coordinates in file.
Chkmod> That is: 11308 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
44.9029 NaN
46.1717 NaN
55.6023 NaN
59.1872 NaN
63.0084 NaN
77.9861 NaN
86.0168 NaN
91.5419 NaN
95.5933 NaN
104.4071 NaN
108.5867 NaN
110.8967 NaN
113.5757 NaN
119.6426 NaN
122.1299 NaN
132.2352 NaN
137.9949 NaN
145.5224 NaN
157.3571 NaN
165.2874 NaN
175.9641 NaN
182.9291 NaN
196.2387 NaN
203.1471 NaN
204.9960 NaN
212.4529 NaN
219.4419 NaN
226.9176 NaN
238.2482 NaN
245.3915 NaN
250.6919 NaN
255.6289 NaN
264.7378 NaN
270.5967 NaN
273.8237 NaN
277.7783 NaN
290.5988 NaN
294.7484 NaN
299.6481 NaN
301.3159 NaN
303.7518 NaN
310.2807 NaN
318.9567 NaN
324.3999 NaN
331.5008 NaN
335.1620 NaN
338.8879 NaN
342.6594 NaN
349.8447 NaN
358.9936 NaN
359.6499 NaN
366.7917 NaN
371.7410 NaN
378.3432 NaN
381.2924 NaN
388.0361 NaN
389.8550 NaN
391.5149 NaN
399.8586 NaN
403.5278 NaN
411.9145 NaN
415.0513 NaN
417.8825 NaN
423.3489 NaN
427.3683 NaN
429.9814 NaN
436.5131 NaN
442.5491 NaN
443.2147 NaN
445.2055 NaN
451.1251 NaN
456.1934 NaN
461.5893 NaN
468.8129 NaN
471.4464 NaN
477.9049 NaN
483.6681 NaN
486.4636 NaN
490.5668 NaN
492.8449 NaN
501.1485 NaN
506.2982 NaN
510.8194 NaN
511.8570 NaN
512.7776 NaN
517.2421 NaN
520.9899 NaN
523.2482 NaN
525.0479 NaN
529.5202 NaN
534.7275 NaN
541.0844 NaN
544.4516 NaN
545.7495 NaN
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2607081251143332259 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
making animated gifs
11 models are in 2607081251143332259.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607081251143332259.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607081251143332259.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2607081251143332259 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
making animated gifs
11 models are in 2607081251143332259.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607081251143332259.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607081251143332259.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2607081251143332259 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
making animated gifs
11 models are in 2607081251143332259.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607081251143332259.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607081251143332259.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2607081251143332259 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
making animated gifs
11 models are in 2607081251143332259.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607081251143332259.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607081251143332259.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2607081251143332259 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607081251143332259.eigenfacs
2607081251143332259.atom
making animated gifs
11 models are in 2607081251143332259.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607081251143332259.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607081251143332259.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2607081251143332259.10.pdb
2607081251143332259.11.pdb
2607081251143332259.7.pdb
2607081251143332259.8.pdb
2607081251143332259.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m13.374s
user 1m12.857s
sys 0m0.486s
rm: cannot remove '2607081251143332259.sdijf': No such file or directory
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_INVALID_FLAG IEEE_DIVIDE_BY_ZERO
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
