CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 260709234131248460

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260709234131248460.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260709234131248460.atom to be opened. Openam> File opened: 260709234131248460.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 792 First residue number = 1 Last residue number = 396 Number of atoms found = 5890 Mean number per residue = 7.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = 1.967299 +/- 14.946556 From: -34.553000 To: 37.518000 = 0.791225 +/- 12.239680 From: -31.487000 To: 30.745000 = 1.035793 +/- 22.358184 From: -47.063000 To: 49.486000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.4461 % Filled. Pdbmat> 2257766 non-zero elements. Pdbmat> 246979 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.86 +/- 22.71 Maximum number = 127 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 4.939580E+06 Pdbmat> Larger element = 509.084 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 792 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260709234131248460.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260709234131248460.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260709234131248460.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5890 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 792 residues. Blocpdb> 31 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 37 atoms in block 2 Block first atom: 32 Blocpdb> 26 atoms in block 3 Block first atom: 69 Blocpdb> 29 atoms in block 4 Block first atom: 95 Blocpdb> 34 atoms in block 5 Block first atom: 124 Blocpdb> 28 atoms in block 6 Block first atom: 158 Blocpdb> 31 atoms in block 7 Block first atom: 186 Blocpdb> 30 atoms in block 8 Block first atom: 217 Blocpdb> 29 atoms in block 9 Block first atom: 247 Blocpdb> 28 atoms in block 10 Block first atom: 276 Blocpdb> 33 atoms in block 11 Block first atom: 304 Blocpdb> 29 atoms in block 12 Block first atom: 337 Blocpdb> 28 atoms in block 13 Block first atom: 366 Blocpdb> 31 atoms in block 14 Block first atom: 394 Blocpdb> 29 atoms in block 15 Block first atom: 425 Blocpdb> 31 atoms in block 16 Block first atom: 454 Blocpdb> 37 atoms in block 17 Block first atom: 485 Blocpdb> 28 atoms in block 18 Block first atom: 522 Blocpdb> 32 atoms in block 19 Block first atom: 550 Blocpdb> 27 atoms in block 20 Block first atom: 582 Blocpdb> 31 atoms in block 21 Block first atom: 609 Blocpdb> 30 atoms in block 22 Block first atom: 640 Blocpdb> 28 atoms in block 23 Block first atom: 670 Blocpdb> 31 atoms in block 24 Block first atom: 698 Blocpdb> 27 atoms in block 25 Block first atom: 729 Blocpdb> 30 atoms in block 26 Block first atom: 756 Blocpdb> 33 atoms in block 27 Block first atom: 786 Blocpdb> 34 atoms in block 28 Block first atom: 819 Blocpdb> 32 atoms in block 29 Block first atom: 853 Blocpdb> 28 atoms in block 30 Block first atom: 885 Blocpdb> 35 atoms in block 31 Block first atom: 913 Blocpdb> 24 atoms in block 32 Block first atom: 948 Blocpdb> 32 atoms in block 33 Block first atom: 972 Blocpdb> 37 atoms in block 34 Block first atom: 1004 Blocpdb> 27 atoms in block 35 Block first atom: 1041 Blocpdb> 30 atoms in block 36 Block first atom: 1068 Blocpdb> 31 atoms in block 37 Block first atom: 1098 Blocpdb> 39 atoms in block 38 Block first atom: 1129 Blocpdb> 31 atoms in block 39 Block first atom: 1168 Blocpdb> 36 atoms in block 40 Block first atom: 1199 Blocpdb> 31 atoms in block 41 Block first atom: 1235 Blocpdb> 31 atoms in block 42 Block first atom: 1266 Blocpdb> 31 atoms in block 43 Block first atom: 1297 Blocpdb> 37 atoms in block 44 Block first atom: 1328 Blocpdb> 30 atoms in block 45 Block first atom: 1365 Blocpdb> 33 atoms in block 46 Block first atom: 1395 Blocpdb> 30 atoms in block 47 Block first atom: 1428 Blocpdb> 28 atoms in block 48 Block first atom: 1458 Blocpdb> 31 atoms in block 49 Block first atom: 1486 Blocpdb> 28 atoms in block 50 Block first atom: 1517 Blocpdb> 30 atoms in block 51 Block first atom: 1545 Blocpdb> 19 atoms in block 52 Block first atom: 1575 Blocpdb> 25 atoms in block 53 Block first atom: 1594 Blocpdb> 33 atoms in block 54 Block first atom: 1619 Blocpdb> 33 atoms in block 55 Block first atom: 1652 Blocpdb> 26 atoms in block 56 Block first atom: 1685 Blocpdb> 30 atoms in block 57 Block first atom: 1711 Blocpdb> 28 atoms in block 58 Block first atom: 1741 Blocpdb> 30 atoms in block 59 Block first atom: 1769 Blocpdb> 27 atoms in block 60 Block first atom: 1799 Blocpdb> 26 atoms in block 61 Block first atom: 1826 Blocpdb> 37 atoms in block 62 Block first atom: 1852 Blocpdb> 32 atoms in block 63 Block first atom: 1889 Blocpdb> 26 atoms in block 64 Block first atom: 1921 Blocpdb> 33 atoms in block 65 Block first atom: 1947 Blocpdb> 31 atoms in block 66 Block first atom: 1980 Blocpdb> 27 atoms in block 67 Block first atom: 2011 Blocpdb> 22 atoms in block 68 Block first atom: 2038 Blocpdb> 25 atoms in block 69 Block first atom: 2060 Blocpdb> 35 atoms in block 70 Block first atom: 2085 Blocpdb> 27 atoms in block 71 Block first atom: 2120 Blocpdb> 35 atoms in block 72 Block first atom: 2147 Blocpdb> 24 atoms in block 73 Block first atom: 2182 Blocpdb> 34 atoms in block 74 Block first atom: 2206 Blocpdb> 37 atoms in block 75 Block first atom: 2240 Blocpdb> 36 atoms in block 76 Block first atom: 2277 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 2313 Blocpdb> 21 atoms in block 78 Block first atom: 2336 Blocpdb> 25 atoms in block 79 Block first atom: 2357 Blocpdb> 33 atoms in block 80 Block first atom: 2382 Blocpdb> 21 atoms in block 81 Block first atom: 2415 Blocpdb> 31 atoms in block 82 Block first atom: 2436 Blocpdb> 33 atoms in block 83 Block first atom: 2467 Blocpdb> 35 atoms in block 84 Block first atom: 2500 Blocpdb> 30 atoms in block 85 Block first atom: 2535 Blocpdb> 29 atoms in block 86 Block first atom: 2565 Blocpdb> 26 atoms in block 87 Block first atom: 2594 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 2620 Blocpdb> 24 atoms in block 89 Block first atom: 2642 Blocpdb> 26 atoms in block 90 Block first atom: 2666 Blocpdb> 28 atoms in block 91 Block first atom: 2692 Blocpdb> 24 atoms in block 92 Block first atom: 2720 Blocpdb> 28 atoms in block 93 Block first atom: 2744 Blocpdb> 30 atoms in block 94 Block first atom: 2772 Blocpdb> 32 atoms in block 95 Block first atom: 2802 Blocpdb> 28 atoms in block 96 Block first atom: 2834 Blocpdb> 31 atoms in block 97 Block first atom: 2862 Blocpdb> 27 atoms in block 98 Block first atom: 2893 Blocpdb> 26 atoms in block 99 Block first atom: 2920 Blocpdb> 31 atoms in block 100 Block first atom: 2946 Blocpdb> 37 atoms in block 101 Block first atom: 2977 Blocpdb> 26 atoms in block 102 Block first atom: 3014 Blocpdb> 29 atoms in block 103 Block first atom: 3040 Blocpdb> 34 atoms in block 104 Block first atom: 3069 Blocpdb> 28 atoms in block 105 Block first atom: 3103 Blocpdb> 31 atoms in block 106 Block first atom: 3131 Blocpdb> 30 atoms in block 107 Block first atom: 3162 Blocpdb> 29 atoms in block 108 Block first atom: 3192 Blocpdb> 28 atoms in block 109 Block first atom: 3221 Blocpdb> 33 atoms in block 110 Block first atom: 3249 Blocpdb> 29 atoms in block 111 Block first atom: 3282 Blocpdb> 28 atoms in block 112 Block first atom: 3311 Blocpdb> 31 atoms in block 113 Block first atom: 3339 Blocpdb> 29 atoms in block 114 Block first atom: 3370 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 3399 Blocpdb> 37 atoms in block 116 Block first atom: 3430 Blocpdb> 28 atoms in block 117 Block first atom: 3467 Blocpdb> 32 atoms in block 118 Block first atom: 3495 Blocpdb> 27 atoms in block 119 Block first atom: 3527 Blocpdb> 31 atoms in block 120 Block first atom: 3554 Blocpdb> 30 atoms in block 121 Block first atom: 3585 Blocpdb> 28 atoms in block 122 Block first atom: 3615 Blocpdb> 31 atoms in block 123 Block first atom: 3643 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 3674 Blocpdb> 30 atoms in block 125 Block first atom: 3701 Blocpdb> 33 atoms in block 126 Block first atom: 3731 Blocpdb> 34 atoms in block 127 Block first atom: 3764 Blocpdb> 32 atoms in block 128 Block first atom: 3798 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 3830 Blocpdb> 35 atoms in block 130 Block first atom: 3858 Blocpdb> 24 atoms in block 131 Block first atom: 3893 Blocpdb> 32 atoms in block 132 Block first atom: 3917 Blocpdb> 37 atoms in block 133 Block first atom: 3949 Blocpdb> 27 atoms in block 134 Block first atom: 3986 Blocpdb> 30 atoms in block 135 Block first atom: 4013 Blocpdb> 31 atoms in block 136 Block first atom: 4043 Blocpdb> 39 atoms in block 137 Block first atom: 4074 Blocpdb> 31 atoms in block 138 Block first atom: 4113 Blocpdb> 36 atoms in block 139 Block first atom: 4144 Blocpdb> 31 atoms in block 140 Block first atom: 4180 Blocpdb> 31 atoms in block 141 Block first atom: 4211 Blocpdb> 31 atoms in block 142 Block first atom: 4242 Blocpdb> 37 atoms in block 143 Block first atom: 4273 Blocpdb> 30 atoms in block 144 Block first atom: 4310 Blocpdb> 33 atoms in block 145 Block first atom: 4340 Blocpdb> 30 atoms in block 146 Block first atom: 4373 Blocpdb> 28 atoms in block 147 Block first atom: 4403 Blocpdb> 31 atoms in block 148 Block first atom: 4431 Blocpdb> 28 atoms in block 149 Block first atom: 4462 Blocpdb> 30 atoms in block 150 Block first atom: 4490 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 4520 Blocpdb> 25 atoms in block 152 Block first atom: 4539 Blocpdb> 33 atoms in block 153 Block first atom: 4564 Blocpdb> 33 atoms in block 154 Block first atom: 4597 Blocpdb> 26 atoms in block 155 Block first atom: 4630 Blocpdb> 30 atoms in block 156 Block first atom: 4656 Blocpdb> 28 atoms in block 157 Block first atom: 4686 Blocpdb> 30 atoms in block 158 Block first atom: 4714 Blocpdb> 27 atoms in block 159 Block first atom: 4744 Blocpdb> 26 atoms in block 160 Block first atom: 4771 Blocpdb> 37 atoms in block 161 Block first atom: 4797 Blocpdb> 32 atoms in block 162 Block first atom: 4834 Blocpdb> 26 atoms in block 163 Block first atom: 4866 Blocpdb> 33 atoms in block 164 Block first atom: 4892 Blocpdb> 31 atoms in block 165 Block first atom: 4925 Blocpdb> 27 atoms in block 166 Block first atom: 4956 Blocpdb> 22 atoms in block 167 Block first atom: 4983 Blocpdb> 25 atoms in block 168 Block first atom: 5005 Blocpdb> 35 atoms in block 169 Block first atom: 5030 Blocpdb> 27 atoms in block 170 Block first atom: 5065 Blocpdb> 35 atoms in block 171 Block first atom: 5092 Blocpdb> 24 atoms in block 172 Block first atom: 5127 Blocpdb> 34 atoms in block 173 Block first atom: 5151 Blocpdb> 37 atoms in block 174 Block first atom: 5185 Blocpdb> 36 atoms in block 175 Block first atom: 5222 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 5258 Blocpdb> 21 atoms in block 177 Block first atom: 5281 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 5302 Blocpdb> 33 atoms in block 179 Block first atom: 5327 Blocpdb> 21 atoms in block 180 Block first atom: 5360 Blocpdb> 31 atoms in block 181 Block first atom: 5381 Blocpdb> 33 atoms in block 182 Block first atom: 5412 Blocpdb> 35 atoms in block 183 Block first atom: 5445 Blocpdb> 30 atoms in block 184 Block first atom: 5480 Blocpdb> 29 atoms in block 185 Block first atom: 5510 Blocpdb> 26 atoms in block 186 Block first atom: 5539 Blocpdb> 22 atoms in block 187 Block first atom: 5565 Blocpdb> 24 atoms in block 188 Block first atom: 5587 Blocpdb> 26 atoms in block 189 Block first atom: 5611 Blocpdb> 28 atoms in block 190 Block first atom: 5637 Blocpdb> 24 atoms in block 191 Block first atom: 5665 Blocpdb> 28 atoms in block 192 Block first atom: 5689 Blocpdb> 30 atoms in block 193 Block first atom: 5717 Blocpdb> 32 atoms in block 194 Block first atom: 5747 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 5779 Blocpdb> 31 atoms in block 196 Block first atom: 5807 Blocpdb> 27 atoms in block 197 Block first atom: 5838 Blocpdb> 26 atoms in block 198 Block first atom: 5864 Blocpdb> 198 blocks. Blocpdb> At most, 39 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 19 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2257964 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 17670 Prepmat> Matrix trace = 4939580.0000 Prepmat> Last element read: 17670 17670 78.9252 Prepmat> 19702 lines saved. Prepmat> 17704 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5890 RTB> Total mass = 5890.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5890 RTB> Number of blocks = 198 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 251483.5081 RTB> 68922 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1188 Diagstd> Nb of non-zero elements: 68922 Diagstd> Projected matrix trace = 251483.5081 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1188 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 251483.5081 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5286608 0.7132813 0.7771449 1.2358061 1.6850431 2.6438356 3.1360006 3.8507307 4.4377173 6.0270946 6.3512996 7.3053821 7.5497909 8.9812784 9.4375273 10.0865858 11.6199672 11.9623197 12.4992556 12.9881128 13.3672655 13.5705131 14.2463171 14.8471363 15.4270232 15.7274122 15.9761798 16.3926808 17.3645883 18.2057206 18.2934063 19.1583029 19.2579034 20.5326900 20.5949443 21.2339681 21.2716093 22.5323964 22.7403390 23.1598703 23.7823753 24.7676472 24.7964093 25.0096796 25.3640775 25.6400613 26.7790212 27.1548368 27.4517448 27.5701595 27.9044332 28.4751883 28.9990355 29.0877593 29.6363729 30.1412463 30.3959782 30.5276702 31.1304383 31.3221959 31.9051388 32.4874196 32.9126355 33.5488077 33.6005152 34.5316922 34.8781992 34.9492550 35.5857717 35.6624243 35.9250284 36.4872015 36.9571771 38.2700220 38.5606330 39.5445270 40.0233970 40.8884827 41.1096001 41.3954971 41.7092925 41.9596924 42.4561381 42.8633222 42.9978603 44.9680008 45.3476234 45.5305643 45.5395694 46.2758900 46.7713891 48.0376029 48.0455523 48.7490875 48.9976505 49.9639897 50.0178852 50.6252221 50.9902521 51.8865256 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034330 0.0034335 0.0034339 0.0034344 0.0034363 78.9557636 91.7118996 95.7296071 120.7175592 140.9615878 176.5682059 192.3018004 213.0918573 228.7573699 266.5933340 273.6696152 293.5058413 298.3752125 325.4350759 333.5987310 344.8794955 370.1670274 375.5804544 383.9170104 391.3526745 397.0238232 400.0307850 409.8704261 418.4240401 426.5170002 430.6494682 434.0419947 439.6633573 452.5093174 463.3393839 464.4538538 475.3065482 476.5404633 492.0601617 492.8055513 500.3925788 500.8359028 515.4647500 517.8377988 522.5927039 529.5694148 540.4277695 540.7414716 543.0619118 546.8960869 549.8633955 561.9434707 565.8728782 568.9580637 570.1838600 573.6300351 579.4668323 584.7726561 585.6665423 591.1637640 596.1779138 598.6918452 599.9873738 605.8817876 607.7449807 613.3743344 618.9461830 622.9835942 628.9756394 629.4601606 638.1227246 641.3163424 641.9692730 647.7888588 648.4861596 650.8693797 655.9421783 660.1531131 671.7762354 674.3220444 682.8706905 686.9929075 694.3777205 696.2527223 698.6695751 701.3126810 703.4146806 707.5636669 710.9485859 712.0634639 728.1939561 731.2612254 732.7347640 732.8072209 738.7077757 742.6521018 752.6376575 752.6999291 758.1908267 760.1213096 767.5803270 767.9942052 772.6427808 775.4233240 782.2085806 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5890 Rtb_to_modes> Number of blocs = 198 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9903E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5287 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7133 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7771 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.236 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.685 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.644 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.136 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.851 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.438 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.351 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.305 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.550 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.981 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.438 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.89 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1188 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 106020 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260709234131248460.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260709234131248460.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260709234131248460.atom Openam> file on opening on unit 11: 260709234131248460.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 792 First residue number = 1 Last residue number = 396 Number of atoms found = 5890 Mean number per residue = 7.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9903E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5287 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7133 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7771 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.236 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.685 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.644 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.136 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.851 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.438 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.351 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.305 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.550 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.981 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.438 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.89 Bfactors> 106 vectors, 17670 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.528700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.723 for 792 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.028 +/- 0.03 Bfactors> = 95.126 +/- 5.13 Bfactors> Shiftng-fct= 95.098 Bfactors> Scaling-fct= 201.887 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260709234131248460.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260709234131248460.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.2 Chkmod> 106 vectors, 17670 coordinates in file. Chkmod> That is: 5890 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6886 0.0034 0.8530 0.0034 0.7872 0.0034 0.6136 0.0034 0.7206 0.0034 0.9910 78.9553 0.5574 91.7092 0.4326 95.7227 0.5865 120.7218 0.5051 140.9537 0.5601 176.5661 0.5881 192.2935 0.6091 213.0902 0.6549 228.7548 0.5240 266.5798 0.5121 273.6514 0.4683 293.4856 0.5751 298.3665 0.5585 325.4161 0.6567 333.5928 0.3396 344.9231 0.5355 370.1517 0.5405 375.5279 0.4791 383.9120 0.3992 391.3643 0.2874 397.0474 0.4746 400.0061 0.3539 409.9058 0.3685 418.4464 0.4061 426.5398 0.3609 430.6664 0.5335 434.0753 0.5636 439.6085 0.5007 452.4301 0.3184 463.3739 0.6297 464.3907 0.5135 475.3072 0.4308 476.5459 0.2161 492.0068 0.5498 492.7252 0.5156 500.3243 0.5035 500.7955 0.2934 515.4152 0.2811 517.8117 0.3542 522.5717 0.4778 529.5202 0.3804 540.4302 0.4501 540.7574 0.4972 543.0421 0.3515 546.8287 0.4518 549.8391 0.5100 561.9296 0.4867 565.7982 0.5229 568.9156 0.3804 570.1577 0.4442 573.5598 0.4030 579.4909 0.3572 584.7573 0.1285 585.6640 0.1731 591.1746 0.3348 596.1400 0.1883 598.7057 0.4776 599.9845 0.2657 605.8515 0.4644 607.6976 0.5325 613.3947 0.5567 618.9442 0.4580 622.9319 0.4640 628.9598 0.3264 629.4283 0.2906 638.0797 0.3450 641.3054 0.3589 641.9486 0.2805 647.7995 0.2952 648.4363 0.5040 650.8865 0.3731 655.9392 0.4748 660.1500 0.5264 671.7472 0.4826 674.2876 0.5277 682.8023 0.5366 686.9343 0.5127 694.3608 0.2362 696.2262 0.3789 698.6776 0.2790 701.2885 0.4476 703.3871 0.4543 707.5655 0.4205 710.8905 0.4921 712.0506 0.4950 728.1789 0.4715 731.2490 0.3554 732.6988 0.5561 732.7792 0.4761 738.7089 0.5752 742.6092 0.5031 752.6241 0.4150 752.7025 0.4523 758.1654 0.3741 760.1069 0.5098 767.5167 0.4609 767.9775 0.3246 772.6461 0.4890 775.3881 0.4949 782.2012 0.4667 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 260709234131248460 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom making animated gifs 11 models are in 260709234131248460.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260709234131248460.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260709234131248460.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260709234131248460 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom making animated gifs 11 models are in 260709234131248460.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260709234131248460.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260709234131248460.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 260709234131248460 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom making animated gifs 11 models are in 260709234131248460.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260709234131248460.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260709234131248460.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260709234131248460 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom making animated gifs 11 models are in 260709234131248460.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260709234131248460.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260709234131248460.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 260709234131248460 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260709234131248460.eigenfacs 260709234131248460.atom making animated gifs 11 models are in 260709234131248460.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260709234131248460.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260709234131248460.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260709234131248460.10.pdb 260709234131248460.11.pdb 260709234131248460.7.pdb 260709234131248460.8.pdb 260709234131248460.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m31.712s user 0m31.582s sys 0m0.120s rm: cannot remove '260709234131248460.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.