*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260710104922341818.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260710104922341818.atom to be opened.
Openam> File opened: 260710104922341818.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 263
First residue number = 30
Last residue number = 292
Number of atoms found = 3802
Mean number per residue = 14.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -1.462608 +/- 10.123643 From: -23.111000 To: 22.854000
= 12.909891 +/- 8.965146 From: -8.593000 To: 34.916000
= -18.322110 +/- 9.672104 From: -39.668000 To: 4.799000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.5379 % Filled.
Pdbmat> 2952117 non-zero elements.
Pdbmat> 325530 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 171.24 +/- 51.53
Maximum number = 260
Minimum number = 24
Pdbmat> Matrix trace = 6.510600E+06
Pdbmat> Larger element = 887.757
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
263 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260710104922341818.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260710104922341818.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260710104922341818.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3802 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 263 residues.
Blocpdb> 20 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 34 atoms in block 2
Block first atom: 21
Blocpdb> 31 atoms in block 3
Block first atom: 55
Blocpdb> 28 atoms in block 4
Block first atom: 86
Blocpdb> 28 atoms in block 5
Block first atom: 114
Blocpdb> 20 atoms in block 6
Block first atom: 142
Blocpdb> 30 atoms in block 7
Block first atom: 162
Blocpdb> 25 atoms in block 8
Block first atom: 192
Blocpdb> 21 atoms in block 9
Block first atom: 217
Blocpdb> 21 atoms in block 10
Block first atom: 238
Blocpdb> 34 atoms in block 11
Block first atom: 259
Blocpdb> 40 atoms in block 12
Block first atom: 293
Blocpdb> 31 atoms in block 13
Block first atom: 333
Blocpdb> 30 atoms in block 14
Block first atom: 364
Blocpdb> 35 atoms in block 15
Block first atom: 394
Blocpdb> 25 atoms in block 16
Block first atom: 429
Blocpdb> 28 atoms in block 17
Block first atom: 454
Blocpdb> 17 atoms in block 18
Block first atom: 482
Blocpdb> 21 atoms in block 19
Block first atom: 499
Blocpdb> 37 atoms in block 20
Block first atom: 520
Blocpdb> 35 atoms in block 21
Block first atom: 557
Blocpdb> 28 atoms in block 22
Block first atom: 592
Blocpdb> 17 atoms in block 23
Block first atom: 620
Blocpdb> 21 atoms in block 24
Block first atom: 637
Blocpdb> 23 atoms in block 25
Block first atom: 658
Blocpdb> 29 atoms in block 26
Block first atom: 681
Blocpdb> 29 atoms in block 27
Block first atom: 710
Blocpdb> 30 atoms in block 28
Block first atom: 739
Blocpdb> 28 atoms in block 29
Block first atom: 769
Blocpdb> 24 atoms in block 30
Block first atom: 797
Blocpdb> 41 atoms in block 31
Block first atom: 821
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 862
Blocpdb> 41 atoms in block 33
Block first atom: 884
Blocpdb> 48 atoms in block 34
Block first atom: 925
Blocpdb> 21 atoms in block 35
Block first atom: 973
Blocpdb> 43 atoms in block 36
Block first atom: 994
Blocpdb> 21 atoms in block 37
Block first atom: 1037
Blocpdb> 24 atoms in block 38
Block first atom: 1058
Blocpdb> 36 atoms in block 39
Block first atom: 1082
Blocpdb> 35 atoms in block 40
Block first atom: 1118
Blocpdb> 33 atoms in block 41
Block first atom: 1153
Blocpdb> 26 atoms in block 42
Block first atom: 1186
Blocpdb> 25 atoms in block 43
Block first atom: 1212
Blocpdb> 33 atoms in block 44
Block first atom: 1237
Blocpdb> 29 atoms in block 45
Block first atom: 1270
Blocpdb> 25 atoms in block 46
Block first atom: 1299
Blocpdb> 35 atoms in block 47
Block first atom: 1324
Blocpdb> 22 atoms in block 48
Block first atom: 1359
Blocpdb> 34 atoms in block 49
Block first atom: 1381
Blocpdb> 27 atoms in block 50
Block first atom: 1415
Blocpdb> 29 atoms in block 51
Block first atom: 1442
Blocpdb> 41 atoms in block 52
Block first atom: 1471
Blocpdb> 26 atoms in block 53
Block first atom: 1512
Blocpdb> 30 atoms in block 54
Block first atom: 1538
Blocpdb> 21 atoms in block 55
Block first atom: 1568
Blocpdb> 25 atoms in block 56
Block first atom: 1589
Blocpdb> 22 atoms in block 57
Block first atom: 1614
Blocpdb> 33 atoms in block 58
Block first atom: 1636
Blocpdb> 28 atoms in block 59
Block first atom: 1669
Blocpdb> 38 atoms in block 60
Block first atom: 1697
Blocpdb> 26 atoms in block 61
Block first atom: 1735
Blocpdb> 34 atoms in block 62
Block first atom: 1761
Blocpdb> 24 atoms in block 63
Block first atom: 1795
Blocpdb> 33 atoms in block 64
Block first atom: 1819
Blocpdb> 31 atoms in block 65
Block first atom: 1852
Blocpdb> 28 atoms in block 66
Block first atom: 1883
Blocpdb> 14 atoms in block 67
Block first atom: 1911
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1925
Blocpdb> 30 atoms in block 69
Block first atom: 1939
Blocpdb> 30 atoms in block 70
Block first atom: 1969
Blocpdb> 20 atoms in block 71
Block first atom: 1999
Blocpdb> 28 atoms in block 72
Block first atom: 2019
Blocpdb> 25 atoms in block 73
Block first atom: 2047
Blocpdb> 41 atoms in block 74
Block first atom: 2072
Blocpdb> 20 atoms in block 75
Block first atom: 2113
Blocpdb> 24 atoms in block 76
Block first atom: 2133
Blocpdb> 27 atoms in block 77
Block first atom: 2157
Blocpdb> 38 atoms in block 78
Block first atom: 2184
Blocpdb> 23 atoms in block 79
Block first atom: 2222
Blocpdb> 25 atoms in block 80
Block first atom: 2245
Blocpdb> 34 atoms in block 81
Block first atom: 2270
Blocpdb> 22 atoms in block 82
Block first atom: 2304
Blocpdb> 30 atoms in block 83
Block first atom: 2326
Blocpdb> 30 atoms in block 84
Block first atom: 2356
Blocpdb> 33 atoms in block 85
Block first atom: 2386
Blocpdb> 39 atoms in block 86
Block first atom: 2419
Blocpdb> 21 atoms in block 87
Block first atom: 2458
Blocpdb> 29 atoms in block 88
Block first atom: 2479
Blocpdb> 23 atoms in block 89
Block first atom: 2508
Blocpdb> 29 atoms in block 90
Block first atom: 2531
Blocpdb> 30 atoms in block 91
Block first atom: 2560
Blocpdb> 25 atoms in block 92
Block first atom: 2590
Blocpdb> 21 atoms in block 93
Block first atom: 2615
Blocpdb> 33 atoms in block 94
Block first atom: 2636
Blocpdb> 40 atoms in block 95
Block first atom: 2669
Blocpdb> 23 atoms in block 96
Block first atom: 2709
Blocpdb> 28 atoms in block 97
Block first atom: 2732
Blocpdb> 43 atoms in block 98
Block first atom: 2760
Blocpdb> 32 atoms in block 99
Block first atom: 2803
Blocpdb> 37 atoms in block 100
Block first atom: 2835
Blocpdb> 34 atoms in block 101
Block first atom: 2872
Blocpdb> 33 atoms in block 102
Block first atom: 2906
Blocpdb> 14 atoms in block 103
Block first atom: 2939
Blocpdb> 28 atoms in block 104
Block first atom: 2953
Blocpdb> 22 atoms in block 105
Block first atom: 2981
Blocpdb> 24 atoms in block 106
Block first atom: 3003
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 3027
Blocpdb> 25 atoms in block 108
Block first atom: 3045
Blocpdb> 31 atoms in block 109
Block first atom: 3070
Blocpdb> 29 atoms in block 110
Block first atom: 3101
Blocpdb> 26 atoms in block 111
Block first atom: 3130
Blocpdb> 44 atoms in block 112
Block first atom: 3156
Blocpdb> 23 atoms in block 113
Block first atom: 3200
Blocpdb> 34 atoms in block 114
Block first atom: 3223
Blocpdb> 39 atoms in block 115
Block first atom: 3257
Blocpdb> 44 atoms in block 116
Block first atom: 3296
Blocpdb> 29 atoms in block 117
Block first atom: 3340
Blocpdb> 26 atoms in block 118
Block first atom: 3369
Blocpdb> 38 atoms in block 119
Block first atom: 3395
Blocpdb> 32 atoms in block 120
Block first atom: 3433
Blocpdb> 34 atoms in block 121
Block first atom: 3465
Blocpdb> 21 atoms in block 122
Block first atom: 3499
Blocpdb> 29 atoms in block 123
Block first atom: 3520
Blocpdb> 28 atoms in block 124
Block first atom: 3549
Blocpdb> 25 atoms in block 125
Block first atom: 3577
Blocpdb> 40 atoms in block 126
Block first atom: 3602
Blocpdb> 23 atoms in block 127
Block first atom: 3642
Blocpdb> 44 atoms in block 128
Block first atom: 3665
Blocpdb> 24 atoms in block 129
Block first atom: 3709
Blocpdb> 25 atoms in block 130
Block first atom: 3733
Blocpdb> 30 atoms in block 131
Block first atom: 3758
Blocpdb> 15 atoms in block 132
Block first atom: 3787
Blocpdb> 132 blocks.
Blocpdb> At most, 48 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2952249 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 11406
Prepmat> Matrix trace = 6510600.0000
Prepmat> Last element read: 11406 11406 353.4067
Prepmat> 8779 lines saved.
Prepmat> 6945 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3802
RTB> Total mass = 3802.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3802
RTB> Number of blocks = 132
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 387386.3231
RTB> 64008 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 792
Diagstd> Nb of non-zero elements: 64008
Diagstd> Projected matrix trace = 387386.3231
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 792 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 387386.3231
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 13.9424055 16.6604405 20.7341452 26.1177284
33.2932600 34.9957977 37.7137844 39.7392892 42.3994842
44.2315866 47.5961107 49.4937081 52.5459692 56.5550065
57.7671534 62.1189578 63.0678494 63.6758772 64.8258906
67.4130483 69.7382015 72.0005945 72.4212265 75.3407479
76.3405035 78.9359633 80.1394414 83.0656159 86.7177465
88.2444195 88.3834707 93.2480154 94.7865078 96.9678815
99.6037389 102.6499598 103.5969777 106.0496605 107.4244790
107.8040140 110.4433955 112.0730166 115.1750401 117.5160861
119.5463794 122.7322647 124.6197453 125.3987534 128.0020685
131.0111453 132.9814276 134.3129084 136.3590954 137.0824811
138.3143656 139.4295122 141.0448079 142.7323779 143.8300508
145.1391846 146.6622251 148.3138798 149.9934890 151.3124486
152.5593711 154.4749075 157.3741969 158.3608157 161.5266353
163.7209480 165.5414200 166.5819471 168.1230707 169.2901365
170.0838695 171.4503124 172.8210760 175.8008115 178.2213961
180.0336480 181.0205889 181.2901560 182.4074444 184.8161492
187.1919118 188.1979357 190.4121560 191.4764057 192.6489580
193.9665276 196.4512974 197.2976960 198.8990200 200.7658590
203.0951472 204.1817173 205.5501925 207.5301339 208.6477181
208.9424978
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034313 0.0034314 0.0034321 0.0034336 0.0034348
0.0034353 405.4750494 443.2395648 494.4681794 554.9616605
626.5755462 642.3965930 666.8763831 684.5502408 707.0914189
722.2067436 749.1710961 763.9593955 787.1635648 816.6403015
825.3454546 855.8691266 862.3812217 866.5282952 874.3182150
891.5942587 906.8399659 921.4320656 924.1196777 942.5626876
948.7958801 964.7898746 972.1167712 989.7053663 1011.2284326
1020.0909754 1020.8943640 1048.6126175 1057.2277202 1069.3238026
1083.7599578 1100.2076798 1105.2711220 1118.2783615 1125.5036517
1127.4901233 1141.2089144 1149.5975014 1165.3985312 1177.1828860
1187.3082735 1203.0250052 1212.2402785 1216.0232817 1228.5809423
1242.9378172 1252.2492372 1258.5027154 1268.0527960 1271.4118601
1277.1118210 1282.2497830 1289.6558489 1297.3481320 1302.3271580
1308.2405905 1315.0867894 1322.4710636 1329.9382716 1335.7728433
1341.2654116 1349.6596126 1362.2663958 1366.5299210 1380.1216018
1389.4643412 1397.1679619 1401.5521027 1408.0203675 1412.8989677
1416.2073505 1421.8848295 1427.5575744 1439.8117652 1449.6901930
1457.0421689 1461.0304486 1462.1178921 1466.6164764 1476.2681118
1485.7263308 1489.7133442 1498.4512401 1502.6329697 1507.2268163
1512.3721657 1522.0283118 1525.3035712 1531.4809604 1538.6513101
1547.5512968 1551.6855161 1556.8767183 1564.3569769 1568.5634822
1569.6711324
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3802
Rtb_to_modes> Number of blocs = 132
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9848E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9853E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9894E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.66
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 208.9
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 792 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 68436 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
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1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998
1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000
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0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999
1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002
0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
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0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260710104922341818.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260710104922341818.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260710104922341818.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260710104922341818.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 263
First residue number = 30
Last residue number = 292
Number of atoms found = 3802
Mean number per residue = 14.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9848E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9853E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9894E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.83
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.8
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 198.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 200.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 203.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 204.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 205.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 207.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.9
Bfactors> 106 vectors, 11406 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 13.940000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.742 for 263 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.004 +/- 0.00
Bfactors> = 14.699 +/- 4.68
Bfactors> Shiftng-fct= 14.695
Bfactors> Scaling-fct= 1094.009
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260710104922341818.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260710104922341818.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4312E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.3
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.5
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.8
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1049.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1057.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1100.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1118.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1125.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1127.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1141.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1177.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1203.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1212.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1216.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1252.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1258.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1268.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1282.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1289.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1297.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1302.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1308.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1315.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1322.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1330.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1336.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1341.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1350.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1362.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1367.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1380.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1389.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1397.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1402.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1408.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1413.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1416.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1422.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1427.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1440.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1450.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1457.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1461.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1462.
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1467.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1476.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1486.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1490.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1498.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1503.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1507.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1512.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1522.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1525.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1531.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1539.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1548.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1552.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1557.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1564.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1568.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1569.
Chkmod> 106 vectors, 11406 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3802 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 75 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7435
0.0034 0.9371
0.0034 0.7713
0.0034 0.7587
0.0034 0.9055
0.0034 0.7615
405.4227 0.0151
443.2147 0.4497
494.3975 0.4187
554.9620 0.3035
626.5180 0.1496
642.4076 0.4751
666.8143 0.5192
684.5270 0.4201
707.0654 0.4313
722.1628 0.5994
749.1695 0.6864
763.8980 0.3608
787.1600 0.5038
816.6413 0.3515
825.3304 0.2486
855.8396 0.4288
862.3589 0.4948
866.5191 0.5450
874.3084 0.3933
891.5358 0.2384
906.8127 0.5884
921.3887 0.2081
924.0722 0.3080
942.5175 0.1463
948.7520 0.2877
964.7731 0.0970
972.0784 0.2791
989.6890 0.2142
1011.1982 0.3193
1020.0216 0.3430
1020.8305 0.4603
1048.5788 0.2898
1057.2018 0.5035
1069.2896 0.5459
1083.6931 0.3450
1099.8927 0.4663
1105.2398 0.2009
1117.9685 0.4177
1125.3271 0.2868
1127.4207 0.5020
1140.9357 0.2686
1149.6865 0.3811
1165.4748 0.3794
1177.0518 0.5070
1187.0270 0.5386
1202.8152 0.3659
1212.0922 0.3747
1215.9771 0.3217
1228.5183 0.3018
1242.8316 0.3678
1252.2829 0.4376
1258.3882 0.4729
1268.1885 0.2965
1271.4385 0.3212
1276.9907 0.4366
1282.0590 0.3360
1289.3956 0.3005
1297.1453 0.3061
1302.1352 0.3870
1308.0078 0.3486
1315.1997 0.4099
1322.3524 0.3436
1329.9100 0.3328
1335.6606 0.5261
1341.3864 0.3567
1349.7113 0.4111
1362.3196 0.2689
1366.6403 0.4674
1379.9486 0.3570
1389.3158 0.4609
1396.9332 0.3954
1401.5679 0.3789
1407.8633 0.4620
1412.8795 0.4722
1416.2137 0.4419
1422.0298 0.3666
1427.4092 0.3541
1439.7466 0.2376
1449.5409 0.4428
1456.8435 0.4413
1460.8846 0.3264
1462.0948 0.4429
1466.5236 0.3688
1476.1402 0.3833
1485.6946 0.5460
1489.6576 0.4136
1498.3391 0.4496
1502.6610 0.4473
1506.9706 0.4121
1512.4377 0.4714
1522.1516 0.3837
1525.2470 0.4236
1531.4190 0.4755
1538.7161 0.4796
1547.5034 0.3224
1551.6884 0.4215
1556.9985 0.4522
1564.1762 0.3933
1568.3168 0.4370
1569.4441 0.3867
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 260710104922341818.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260710104922341818.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 260710104922341818.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260710104922341818.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 260710104922341818.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
260710104922341818.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4312E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1049.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1057.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1100.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1118.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1125.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1127.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1141.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1177.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1203.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1212.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1216.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1252.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1258.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1268.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1282.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1289.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1297.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1302.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1308.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1315.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1322.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1330.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1336.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1341.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1350.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1362.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1367.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1380.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1389.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1397.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1402.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1408.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1413.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1416.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1422.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1427.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1440.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1450.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1457.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1461.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1462.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1467.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1476.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1486.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1490.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1498.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1503.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1507.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1512.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1522.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1525.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1531.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1539.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1548.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1552.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1557.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1564.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1568.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1569.
Projmod> 106 vectors, 11406 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 263
First residue number = 30
Last residue number = 292
Number of atoms found = 3802
Mean number per residue = 14.5
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 263
First residue number = 30
Last residue number = 292
Number of atoms found = 2395
Mean number per residue = 9.1
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260710104922341818 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
making animated gifs
11 models are in 260710104922341818.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710104922341818.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710104922341818.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 263 0.735 261 0.531
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 263 0.589 261 0.426
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 263 0.443 262 0.365
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 263 0.297 263 0.297
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 263 0.154 263 0.154
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 263 0.046 263 0.046
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 263 0.154 263 0.154
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 263 0.297 263 0.297
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 263 0.443 262 0.366
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 263 0.589 261 0.426
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 263 0.735 261 0.531
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260710104922341818 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
making animated gifs
11 models are in 260710104922341818.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710104922341818.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710104922341818.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 263 1.562 255 1.290
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 263 1.250 257 1.068
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 263 0.938 260 0.853
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 263 0.626 263 0.626
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 263 0.316 263 0.316
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 263 0.046 263 0.046
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 263 0.315 263 0.315
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 263 0.625 263 0.625
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 263 0.937 260 0.852
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 263 1.248 257 1.067
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 263 1.560 255 1.289
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260710104922341818 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
making animated gifs
11 models are in 260710104922341818.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710104922341818.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710104922341818.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 263 1.494 255 1.372
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 263 1.196 261 1.155
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 263 0.897 263 0.897
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 263 0.599 263 0.599
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 263 0.302 263 0.302
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 263 0.046 263 0.046
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 263 0.303 263 0.303
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 263 0.600 263 0.600
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 263 0.898 263 0.898
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 263 1.197 261 1.156
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 263 1.495 255 1.373
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260710104922341818 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260710104922341818.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710104922341818.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710104922341818.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 263 1.579 254 1.164
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 263 1.264 257 0.981
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 263 0.948 259 0.777
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 263 0.633 261 0.557
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 263 0.319 263 0.319
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 263 0.046 263 0.046
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 263 0.319 263 0.319
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 263 0.633 261 0.557
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 263 0.948 259 0.777
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 263 1.264 257 0.981
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 263 1.579 254 1.163
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260710104922341818 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260710104922341818.eigenfacs
260710104922341818.atom
making animated gifs
11 models are in 260710104922341818.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710104922341818.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710104922341818.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 263 1.366 255 1.040
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 263 1.093 258 0.878
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 263 0.820 259 0.677
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 263 0.548 263 0.548
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 263 0.276 263 0.276
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 263 0.046 263 0.046
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 263 0.278 263 0.278
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 263 0.549 263 0.549
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 263 0.822 259 0.679
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 263 1.095 258 0.880
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 263 1.368 255 1.041
260710104922341818.10.pdb
260710104922341818.11.pdb
260710104922341818.7.pdb
260710104922341818.8.pdb
260710104922341818.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m11.716s
user 0m11.589s
sys 0m0.123s
rm: cannot remove '260710104922341818.sdijf': No such file or directory
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