*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260710105908346657.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260710105908346657.atom to be opened.
Openam> File opened: 260710105908346657.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 263
First residue number = 30
Last residue number = 292
Number of atoms found = 2395
Mean number per residue = 9.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -1.488402 +/- 10.214589 From: -22.718000 To: 22.862000
= 12.949781 +/- 9.161475 From: -8.611000 To: 34.913000
= -18.325223 +/- 9.774380 From: -39.160000 To: 4.165000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.3879 % Filled.
Pdbmat> 1132779 non-zero elements.
Pdbmat> 124291 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 103.79 +/- 28.76
Maximum number = 161
Minimum number = 15
Pdbmat> Matrix trace = 2.485820E+06
Pdbmat> Larger element = 634.201
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
263 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260710105908346657.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260710105908346657.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260710105908346657.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2395 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 263 residues.
Blocpdb> 15 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 21 atoms in block 2
Block first atom: 16
Blocpdb> 22 atoms in block 3
Block first atom: 37
Blocpdb> 18 atoms in block 4
Block first atom: 59
Blocpdb> 16 atoms in block 5
Block first atom: 77
Blocpdb> 12 atoms in block 6
Block first atom: 93
Blocpdb> 17 atoms in block 7
Block first atom: 105
Blocpdb> 16 atoms in block 8
Block first atom: 122
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 138
Blocpdb> 12 atoms in block 10
Block first atom: 152
Blocpdb> 21 atoms in block 11
Block first atom: 164
Blocpdb> 25 atoms in block 12
Block first atom: 185
Blocpdb> 20 atoms in block 13
Block first atom: 210
Blocpdb> 17 atoms in block 14
Block first atom: 230
Blocpdb> 25 atoms in block 15
Block first atom: 247
Blocpdb> 15 atoms in block 16
Block first atom: 272
Blocpdb> 19 atoms in block 17
Block first atom: 287
Blocpdb> 11 atoms in block 18
Block first atom: 306
Blocpdb> 14 atoms in block 19
Block first atom: 317
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 331
Blocpdb> 21 atoms in block 21
Block first atom: 353
Blocpdb> 20 atoms in block 22
Block first atom: 374
Blocpdb> 11 atoms in block 23
Block first atom: 394
Blocpdb> 14 atoms in block 24
Block first atom: 405
Blocpdb> 13 atoms in block 25
Block first atom: 419
Blocpdb> 15 atoms in block 26
Block first atom: 432
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 447
Blocpdb> 15 atoms in block 28
Block first atom: 462
Blocpdb> 19 atoms in block 29
Block first atom: 477
Blocpdb> 15 atoms in block 30
Block first atom: 496
Blocpdb> 29 atoms in block 31
Block first atom: 511
Blocpdb> 16 atoms in block 32
Block first atom: 540
Blocpdb> 22 atoms in block 33
Block first atom: 556
Blocpdb> 32 atoms in block 34
Block first atom: 578
Blocpdb> 12 atoms in block 35
Block first atom: 610
Blocpdb> 26 atoms in block 36
Block first atom: 622
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 648
Blocpdb> 17 atoms in block 38
Block first atom: 662
Blocpdb> 20 atoms in block 39
Block first atom: 679
Blocpdb> 17 atoms in block 40
Block first atom: 699
Blocpdb> 18 atoms in block 41
Block first atom: 716
Blocpdb> 18 atoms in block 42
Block first atom: 734
Blocpdb> 19 atoms in block 43
Block first atom: 752
Blocpdb> 18 atoms in block 44
Block first atom: 771
Blocpdb> 21 atoms in block 45
Block first atom: 789
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 810
Blocpdb> 25 atoms in block 47
Block first atom: 825
Blocpdb> 16 atoms in block 48
Block first atom: 850
Blocpdb> 24 atoms in block 49
Block first atom: 866
Blocpdb> 15 atoms in block 50
Block first atom: 890
Blocpdb> 15 atoms in block 51
Block first atom: 905
Blocpdb> 29 atoms in block 52
Block first atom: 920
Blocpdb> 14 atoms in block 53
Block first atom: 949
Blocpdb> 17 atoms in block 54
Block first atom: 963
Blocpdb> 16 atoms in block 55
Block first atom: 980
Blocpdb> 17 atoms in block 56
Block first atom: 996
Blocpdb> 16 atoms in block 57
Block first atom: 1013
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 1029
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 1045
Blocpdb> 21 atoms in block 60
Block first atom: 1064
Blocpdb> 18 atoms in block 61
Block first atom: 1085
Blocpdb> 23 atoms in block 62
Block first atom: 1103
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 1126
Blocpdb> 17 atoms in block 64
Block first atom: 1140
Blocpdb> 21 atoms in block 65
Block first atom: 1157
Blocpdb> 17 atoms in block 66
Block first atom: 1178
Blocpdb> 10 atoms in block 67
Block first atom: 1195
Blocpdb> 10 atoms in block 68
Block first atom: 1205
Blocpdb> 17 atoms in block 69
Block first atom: 1215
Blocpdb> 17 atoms in block 70
Block first atom: 1232
Blocpdb> 12 atoms in block 71
Block first atom: 1249
Blocpdb> 22 atoms in block 72
Block first atom: 1261
Blocpdb> 15 atoms in block 73
Block first atom: 1283
Blocpdb> 22 atoms in block 74
Block first atom: 1298
Blocpdb> 12 atoms in block 75
Block first atom: 1320
Blocpdb> 13 atoms in block 76
Block first atom: 1332
Blocpdb> 18 atoms in block 77
Block first atom: 1345
Blocpdb> 23 atoms in block 78
Block first atom: 1363
Blocpdb> 17 atoms in block 79
Block first atom: 1386
Blocpdb> 17 atoms in block 80
Block first atom: 1403
Blocpdb> 23 atoms in block 81
Block first atom: 1420
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1443
Blocpdb> 17 atoms in block 83
Block first atom: 1459
Blocpdb> 15 atoms in block 84
Block first atom: 1476
Blocpdb> 18 atoms in block 85
Block first atom: 1491
Blocpdb> 21 atoms in block 86
Block first atom: 1509
Blocpdb> 14 atoms in block 87
Block first atom: 1530
Blocpdb> 21 atoms in block 88
Block first atom: 1544
Blocpdb> 17 atoms in block 89
Block first atom: 1565
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1582
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1597
Blocpdb> 19 atoms in block 92
Block first atom: 1612
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1631
Blocpdb> 16 atoms in block 94
Block first atom: 1645
Blocpdb> 23 atoms in block 95
Block first atom: 1661
Blocpdb> 17 atoms in block 96
Block first atom: 1684
Blocpdb> 17 atoms in block 97
Block first atom: 1701
Blocpdb> 28 atoms in block 98
Block first atom: 1718
Blocpdb> 19 atoms in block 99
Block first atom: 1746
Blocpdb> 24 atoms in block 100
Block first atom: 1765
Blocpdb> 19 atoms in block 101
Block first atom: 1789
Blocpdb> 20 atoms in block 102
Block first atom: 1808
Blocpdb> 10 atoms in block 103
Block first atom: 1828
Blocpdb> 20 atoms in block 104
Block first atom: 1838
Blocpdb> 16 atoms in block 105
Block first atom: 1858
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1874
Blocpdb> 13 atoms in block 107
Block first atom: 1891
Blocpdb> 19 atoms in block 108
Block first atom: 1904
Blocpdb> 23 atoms in block 109
Block first atom: 1923
Blocpdb> 15 atoms in block 110
Block first atom: 1946
Blocpdb> 14 atoms in block 111
Block first atom: 1961
Blocpdb> 26 atoms in block 112
Block first atom: 1975
Blocpdb> 13 atoms in block 113
Block first atom: 2001
Blocpdb> 22 atoms in block 114
Block first atom: 2014
Blocpdb> 22 atoms in block 115
Block first atom: 2036
Blocpdb> 29 atoms in block 116
Block first atom: 2058
Blocpdb> 18 atoms in block 117
Block first atom: 2087
Blocpdb> 20 atoms in block 118
Block first atom: 2105
Blocpdb> 26 atoms in block 119
Block first atom: 2125
Blocpdb> 22 atoms in block 120
Block first atom: 2151
Blocpdb> 21 atoms in block 121
Block first atom: 2173
Blocpdb> 14 atoms in block 122
Block first atom: 2194
Blocpdb> 21 atoms in block 123
Block first atom: 2208
Blocpdb> 18 atoms in block 124
Block first atom: 2229
Blocpdb> 17 atoms in block 125
Block first atom: 2247
Blocpdb> 25 atoms in block 126
Block first atom: 2264
Blocpdb> 17 atoms in block 127
Block first atom: 2289
Blocpdb> 29 atoms in block 128
Block first atom: 2306
Blocpdb> 15 atoms in block 129
Block first atom: 2335
Blocpdb> 19 atoms in block 130
Block first atom: 2350
Blocpdb> 17 atoms in block 131
Block first atom: 2369
Blocpdb> 10 atoms in block 132
Block first atom: 2385
Blocpdb> 132 blocks.
Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1132911 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7185
Prepmat> Matrix trace = 2485820.0000
Prepmat> Last element read: 7185 7185 196.6160
Prepmat> 8779 lines saved.
Prepmat> 7140 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2395
RTB> Total mass = 2395.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2395
RTB> Number of blocks = 132
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 236754.7665
RTB> 56988 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 792
Diagstd> Nb of non-zero elements: 56988
Diagstd> Projected matrix trace = 236754.7665
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 792 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 236754.7665
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 4.2914894 9.0124776 11.2410159 14.6354900
18.3099996 18.9628842 20.5418041 22.3825770 22.9937015
23.5626849 25.2603276 26.3436802 27.4070046 29.5202332
29.9539833 31.3456102 32.5433499 33.8784687 34.3455444
35.5312108 36.2435676 38.1114829 39.2360192 42.4903518
42.9394473 44.0436516 45.4731117 46.4123966 46.9513452
48.4336696 49.2197068 50.7581183 52.0483817 53.1488986
54.2264266 55.6125420 57.5716099 58.4696594 59.8580690
61.1702789 61.5221139 62.4418619 63.0746102 63.7148572
65.3497652 65.9262115 67.3102024 69.7848165 70.5669825
71.5132742 72.0140698 72.9399776 73.9754723 74.8780880
76.1326185 77.6678173 78.2615577 79.1702756 80.1231994
80.6574928 82.5373221 83.1517549 83.7396050 85.4028942
85.7963124 87.4270764 88.5738476 89.7214866 90.1729451
91.7024849 92.3773554 94.0117795 95.3522823 96.0226574
97.0270972 97.5645339 99.1554906 100.8105607 101.1825668
102.5762973 102.9171664 104.1822692 104.9197323 106.0351278
107.2094137 107.5896214 108.2096022 108.6174267 109.8856782
110.8781160 112.6382764 114.6201929 115.2939162 115.9455773
116.7743990 117.7310442 118.9580878 119.2049863 120.5287885
121.5850481
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034307 0.0034321 0.0034336 0.0034349 0.0034351
0.0034359 224.9568917 325.9998335 364.0810387 415.4310127
464.6644501 472.8762221 492.1693587 513.7482125 520.7145639
527.1177836 545.7764216 557.3570556 568.4942367 590.0042935
594.3230475 607.9720930 619.4787421 632.0583406 636.4004566
647.2920662 653.7485675 670.3833260 680.2017573 707.8487079
711.5796268 720.6708232 732.2723184 739.7965089 744.0794329
755.7340110 761.8417892 773.6562477 783.4276509 791.6667682
799.6515314 809.8072373 823.9473611 830.3487999 840.1496125
849.3085783 851.7475738 858.0907147 862.4274434 866.7934828
877.8439007 881.7071039 890.9138870 907.1429941 912.2125729
918.3085154 921.5182871 927.4234928 933.9833914 939.6641402
947.5031529 957.0085776 960.6595933 966.2207471 972.0182561
975.2537733 986.5531040 990.2183953 993.7124572 1003.5328065
1005.8415952 1015.3558097 1021.9932692 1028.5928729 1031.1774504
1039.8862417 1043.7056697 1052.8982814 1060.3782876 1064.0992589
1069.6502564 1072.6085817 1081.3185767 1090.3057322 1092.3155756
1099.8128495 1101.6387164 1108.3889475 1112.3049429 1118.2017366
1124.3764501 1126.3684308 1129.6090950 1131.7357505 1138.3238279
1143.4526868 1152.4929527 1162.5880315 1165.9998000 1169.2903728
1173.4621897 1178.2590339 1184.3832794 1185.6117406 1192.1768266
1197.3892802
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2395
Rtb_to_modes> Number of blocs = 132
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9812E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9892E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.291
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.012
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.6
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 792 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999
0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
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0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 43110 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
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0.99997 1.00004 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999
0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999
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1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999
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1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260710105908346657.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260710105908346657.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260710105908346657.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260710105908346657.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 263
First residue number = 30
Last residue number = 292
Number of atoms found = 2395
Mean number per residue = 9.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9812E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9892E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.291
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.012
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.6
Bfactors> 106 vectors, 7185 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.291000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.748 for 263 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.011 +/- 0.01
Bfactors> = 14.746 +/- 4.59
Bfactors> Shiftng-fct= 14.735
Bfactors> Scaling-fct= 458.702
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260710105908346657.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260710105908346657.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4306E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1064.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1070.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1073.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1092.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1100.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1101.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1108.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1118.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1124.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1130.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1144.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1152.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1162.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1166.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1174.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1178.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1185.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1186.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1192.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1197.
Chkmod> 106 vectors, 7185 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2395 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7513
0.0034 0.8273
0.0034 0.9940
0.0034 0.9396
0.0034 0.9776
0.0034 0.7853
224.9344 0.0080
325.9772 0.4770
364.0490 0.4658
415.4772 0.3124
464.6445 0.1464
472.8200 0.5664
492.1266 0.3858
513.6966 0.5327
520.6503 0.4889
527.0651 0.6333
545.7495 0.6345
557.2942 0.3715
568.5009 0.1420
589.9766 0.4110
594.2580 0.2280
607.9886 0.3953
619.4203 0.5436
632.0455 0.4859
636.4144 0.5949
647.2533 0.3576
653.6883 0.3462
670.3415 0.2897
680.2071 0.3677
707.8154 0.2018
711.5537 0.2601
720.6100 0.3891
732.2158 0.3762
739.7457 0.3152
744.0368 0.4468
755.6729 0.3204
761.8114 0.3100
773.6374 0.3150
783.4062 0.4631
791.6410 0.4159
799.6436 0.4625
809.7540 0.4483
823.9005 0.5178
830.3156 0.3497
840.1271 0.4533
849.2702 0.4631
851.6964 0.3819
858.0411 0.4191
862.3589 0.4755
866.7232 0.4171
877.8078 0.4014
881.6946 0.4607
890.8743 0.5706
907.0727 0.3786
912.1929 0.2972
918.2481 0.4459
921.4527 0.4114
927.3838 0.4050
933.9719 0.3303
939.6358 0.3715
947.4462 0.2951
956.9809 0.4416
960.6088 0.3490
966.1776 0.4515
971.9571 0.3837
975.2271 0.4561
986.5268 0.4433
990.1654 0.4683
993.6721 0.4394
1003.4727 0.5016
1005.8200 0.4919
1015.3292 0.5152
1021.9272 0.4502
1028.5402 0.2268
1031.1163 0.4966
1039.8275 0.3919
1043.6758 0.4262
1052.8431 0.4412
1060.3201 0.4871
1064.0389 0.3970
1069.6203 0.4490
1072.5376 0.4528
1081.2967 0.5042
1090.2018 0.4119
1092.3628 0.3929
1099.8927 0.4280
1101.4995 0.4077
1108.4357 0.3803
1112.1526 0.2759
1117.9685 0.4773
1124.2788 0.3583
1126.3744 0.2936
1129.5105 0.3683
1131.5964 0.3696
1138.3491 0.4138
1143.5164 0.3915
1152.2477 0.4623
1162.4357 0.4831
1165.9805 0.3886
1169.0103 0.4722
1173.5404 0.4703
1178.0531 0.5725
1184.5411 0.4488
1185.5360 0.4386
1191.9833 0.4855
1197.4115 0.5088
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 260710105908346657.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260710105908346657.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 260710105908346657.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260710105908346657.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 260710105908346657.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
260710105908346657.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4306E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1064.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1070.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1073.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1092.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1100.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1101.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1108.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1118.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1124.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1130.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1144.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1152.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1162.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1166.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1174.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1178.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1185.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1186.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1192.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1197.
Projmod> 106 vectors, 7185 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 263
First residue number = 30
Last residue number = 292
Number of atoms found = 2395
Mean number per residue = 9.1
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 263
First residue number = 30
Last residue number = 292
Number of atoms found = 3802
Mean number per residue = 14.5
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Er> Atom 50 of first conformer: ARG 34 1HH1 not found in second one.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260710105908346657 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
making animated gifs
11 models are in 260710105908346657.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710105908346657.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710105908346657.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 263 0.588 261 0.223
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 263 0.471 261 0.181
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 263 0.355 261 0.139
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 263 0.239 263 0.239
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 263 0.126 263 0.126
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 263 0.046 263 0.046
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 263 0.126 263 0.126
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 263 0.239 263 0.239
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 263 0.354 261 0.139
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 263 0.471 261 0.181
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 263 0.588 261 0.223
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260710105908346657 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
making animated gifs
11 models are in 260710105908346657.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710105908346657.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710105908346657.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 263 1.951 247 1.469
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 263 1.561 253 1.254
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 263 1.171 258 1.021
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 263 0.781 261 0.732
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 263 0.392 263 0.392
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 263 0.046 263 0.046
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 263 0.394 263 0.394
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 263 0.783 261 0.733
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 263 1.173 258 1.023
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 263 1.563 253 1.255
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 263 1.953 247 1.471
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260710105908346657 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
making animated gifs
11 models are in 260710105908346657.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710105908346657.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710105908346657.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 263 1.868 242 1.564
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 263 1.495 255 1.364
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 263 1.122 261 1.082
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 263 0.749 263 0.749
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 263 0.377 263 0.377
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 263 0.046 263 0.046
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 263 0.376 263 0.376
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 263 0.748 263 0.748
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 263 1.121 261 1.081
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 263 1.494 255 1.364
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 263 1.868 241 1.557
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260710105908346657 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710105908346657.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710105908346657.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 263 1.948 244 1.298
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 263 1.559 256 1.191
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 263 1.170 257 0.909
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 263 0.781 261 0.686
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 263 0.392 263 0.392
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 263 0.046 263 0.046
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 263 0.392 263 0.392
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 263 0.780 261 0.686
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 263 1.169 257 0.909
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 263 1.559 256 1.191
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 263 1.948 244 1.297
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260710105908346657 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260710105908346657.eigenfacs
260710105908346657.atom
making animated gifs
11 models are in 260710105908346657.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710105908346657.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260710105908346657.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 263 1.609 251 1.193
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 263 1.288 257 1.036
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 263 0.966 258 0.794
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 263 0.645 261 0.577
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 263 0.325 263 0.325
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 263 0.046 263 0.046
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 263 0.324 263 0.324
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 263 0.644 261 0.576
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 263 0.965 258 0.793
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 263 1.286 257 1.035
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 263 1.608 250 1.177
260710105908346657.10.pdb
260710105908346657.11.pdb
260710105908346657.7.pdb
260710105908346657.8.pdb
260710105908346657.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m8.257s
user 0m8.174s
sys 0m0.081s
rm: cannot remove '260710105908346657.sdijf': No such file or directory
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