*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260711055515516635.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260711055515516635.atom to be opened.
Openam> File opened: 260711055515516635.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 499
First residue number = 1
Last residue number = 499
Number of atoms found = 3973
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.064590 +/- 23.096291 From: -49.517000 To: 58.054000
= -0.856531 +/- 14.418995 From: -31.068000 To: 32.711000
= -1.200143 +/- 12.742604 From: -30.737000 To: 30.838000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.0547 % Filled.
Pdbmat> 1459570 non-zero elements.
Pdbmat> 159553 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.32 +/- 23.54
Maximum number = 133
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 3.191060E+06
Pdbmat> Larger element = 508.937
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
499 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260711055515516635.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260711055515516635.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260711055515516635.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3973 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 499 residues.
Blocpdb> 22 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 25 atoms in block 2
Block first atom: 23
Blocpdb> 19 atoms in block 3
Block first atom: 48
Blocpdb> 21 atoms in block 4
Block first atom: 67
Blocpdb> 29 atoms in block 5
Block first atom: 88
Blocpdb> 25 atoms in block 6
Block first atom: 117
Blocpdb> 25 atoms in block 7
Block first atom: 142
Blocpdb> 23 atoms in block 8
Block first atom: 167
Blocpdb> 23 atoms in block 9
Block first atom: 190
Blocpdb> 28 atoms in block 10
Block first atom: 213
Blocpdb> 19 atoms in block 11
Block first atom: 241
Blocpdb> 21 atoms in block 12
Block first atom: 260
Blocpdb> 25 atoms in block 13
Block first atom: 281
Blocpdb> 23 atoms in block 14
Block first atom: 306
Blocpdb> 21 atoms in block 15
Block first atom: 329
Blocpdb> 32 atoms in block 16
Block first atom: 350
Blocpdb> 24 atoms in block 17
Block first atom: 382
Blocpdb> 21 atoms in block 18
Block first atom: 406
Blocpdb> 26 atoms in block 19
Block first atom: 427
Blocpdb> 32 atoms in block 20
Block first atom: 453
Blocpdb> 25 atoms in block 21
Block first atom: 485
Blocpdb> 22 atoms in block 22
Block first atom: 510
Blocpdb> 22 atoms in block 23
Block first atom: 532
Blocpdb> 21 atoms in block 24
Block first atom: 554
Blocpdb> 23 atoms in block 25
Block first atom: 575
Blocpdb> 28 atoms in block 26
Block first atom: 598
Blocpdb> 22 atoms in block 27
Block first atom: 626
Blocpdb> 33 atoms in block 28
Block first atom: 648
Blocpdb> 19 atoms in block 29
Block first atom: 681
Blocpdb> 28 atoms in block 30
Block first atom: 700
Blocpdb> 24 atoms in block 31
Block first atom: 728
Blocpdb> 27 atoms in block 32
Block first atom: 752
Blocpdb> 23 atoms in block 33
Block first atom: 779
Blocpdb> 22 atoms in block 34
Block first atom: 802
Blocpdb> 18 atoms in block 35
Block first atom: 824
Blocpdb> 25 atoms in block 36
Block first atom: 842
Blocpdb> 24 atoms in block 37
Block first atom: 867
Blocpdb> 26 atoms in block 38
Block first atom: 891
Blocpdb> 22 atoms in block 39
Block first atom: 917
Blocpdb> 21 atoms in block 40
Block first atom: 939
Blocpdb> 24 atoms in block 41
Block first atom: 960
Blocpdb> 25 atoms in block 42
Block first atom: 984
Blocpdb> 22 atoms in block 43
Block first atom: 1009
Blocpdb> 23 atoms in block 44
Block first atom: 1031
Blocpdb> 30 atoms in block 45
Block first atom: 1054
Blocpdb> 28 atoms in block 46
Block first atom: 1084
Blocpdb> 24 atoms in block 47
Block first atom: 1112
Blocpdb> 21 atoms in block 48
Block first atom: 1136
Blocpdb> 27 atoms in block 49
Block first atom: 1157
Blocpdb> 23 atoms in block 50
Block first atom: 1184
Blocpdb> 29 atoms in block 51
Block first atom: 1207
Blocpdb> 24 atoms in block 52
Block first atom: 1236
Blocpdb> 24 atoms in block 53
Block first atom: 1260
Blocpdb> 23 atoms in block 54
Block first atom: 1284
Blocpdb> 23 atoms in block 55
Block first atom: 1307
Blocpdb> 22 atoms in block 56
Block first atom: 1330
Blocpdb> 23 atoms in block 57
Block first atom: 1352
Blocpdb> 26 atoms in block 58
Block first atom: 1375
Blocpdb> 26 atoms in block 59
Block first atom: 1401
Blocpdb> 18 atoms in block 60
Block first atom: 1427
Blocpdb> 24 atoms in block 61
Block first atom: 1445
Blocpdb> 26 atoms in block 62
Block first atom: 1469
Blocpdb> 22 atoms in block 63
Block first atom: 1495
Blocpdb> 22 atoms in block 64
Block first atom: 1517
Blocpdb> 30 atoms in block 65
Block first atom: 1539
Blocpdb> 26 atoms in block 66
Block first atom: 1569
Blocpdb> 29 atoms in block 67
Block first atom: 1595
Blocpdb> 25 atoms in block 68
Block first atom: 1624
Blocpdb> 23 atoms in block 69
Block first atom: 1649
Blocpdb> 21 atoms in block 70
Block first atom: 1672
Blocpdb> 25 atoms in block 71
Block first atom: 1693
Blocpdb> 18 atoms in block 72
Block first atom: 1718
Blocpdb> 29 atoms in block 73
Block first atom: 1736
Blocpdb> 19 atoms in block 74
Block first atom: 1765
Blocpdb> 24 atoms in block 75
Block first atom: 1784
Blocpdb> 23 atoms in block 76
Block first atom: 1808
Blocpdb> 31 atoms in block 77
Block first atom: 1831
Blocpdb> 20 atoms in block 78
Block first atom: 1862
Blocpdb> 21 atoms in block 79
Block first atom: 1882
Blocpdb> 19 atoms in block 80
Block first atom: 1903
Blocpdb> 23 atoms in block 81
Block first atom: 1922
Blocpdb> 24 atoms in block 82
Block first atom: 1945
Blocpdb> 22 atoms in block 83
Block first atom: 1969
Blocpdb> 23 atoms in block 84
Block first atom: 1991
Blocpdb> 24 atoms in block 85
Block first atom: 2014
Blocpdb> 24 atoms in block 86
Block first atom: 2038
Blocpdb> 21 atoms in block 87
Block first atom: 2062
Blocpdb> 28 atoms in block 88
Block first atom: 2083
Blocpdb> 18 atoms in block 89
Block first atom: 2111
Blocpdb> 29 atoms in block 90
Block first atom: 2129
Blocpdb> 27 atoms in block 91
Block first atom: 2158
Blocpdb> 23 atoms in block 92
Block first atom: 2185
Blocpdb> 22 atoms in block 93
Block first atom: 2208
Blocpdb> 27 atoms in block 94
Block first atom: 2230
Blocpdb> 18 atoms in block 95
Block first atom: 2257
Blocpdb> 24 atoms in block 96
Block first atom: 2275
Blocpdb> 24 atoms in block 97
Block first atom: 2299
Blocpdb> 20 atoms in block 98
Block first atom: 2323
Blocpdb> 32 atoms in block 99
Block first atom: 2343
Blocpdb> 24 atoms in block 100
Block first atom: 2375
Blocpdb> 25 atoms in block 101
Block first atom: 2399
Blocpdb> 24 atoms in block 102
Block first atom: 2424
Blocpdb> 25 atoms in block 103
Block first atom: 2448
Blocpdb> 21 atoms in block 104
Block first atom: 2473
Blocpdb> 24 atoms in block 105
Block first atom: 2494
Blocpdb> 23 atoms in block 106
Block first atom: 2518
Blocpdb> 27 atoms in block 107
Block first atom: 2541
Blocpdb> 27 atoms in block 108
Block first atom: 2568
Blocpdb> 19 atoms in block 109
Block first atom: 2595
Blocpdb> 19 atoms in block 110
Block first atom: 2614
Blocpdb> 24 atoms in block 111
Block first atom: 2633
Blocpdb> 24 atoms in block 112
Block first atom: 2657
Blocpdb> 32 atoms in block 113
Block first atom: 2681
Blocpdb> 24 atoms in block 114
Block first atom: 2713
Blocpdb> 20 atoms in block 115
Block first atom: 2737
Blocpdb> 21 atoms in block 116
Block first atom: 2757
Blocpdb> 22 atoms in block 117
Block first atom: 2778
Blocpdb> 22 atoms in block 118
Block first atom: 2800
Blocpdb> 24 atoms in block 119
Block first atom: 2822
Blocpdb> 24 atoms in block 120
Block first atom: 2846
Blocpdb> 29 atoms in block 121
Block first atom: 2870
Blocpdb> 24 atoms in block 122
Block first atom: 2899
Blocpdb> 18 atoms in block 123
Block first atom: 2923
Blocpdb> 25 atoms in block 124
Block first atom: 2941
Blocpdb> 26 atoms in block 125
Block first atom: 2966
Blocpdb> 20 atoms in block 126
Block first atom: 2992
Blocpdb> 26 atoms in block 127
Block first atom: 3012
Blocpdb> 24 atoms in block 128
Block first atom: 3038
Blocpdb> 22 atoms in block 129
Block first atom: 3062
Blocpdb> 29 atoms in block 130
Block first atom: 3084
Blocpdb> 23 atoms in block 131
Block first atom: 3113
Blocpdb> 24 atoms in block 132
Block first atom: 3136
Blocpdb> 24 atoms in block 133
Block first atom: 3160
Blocpdb> 20 atoms in block 134
Block first atom: 3184
Blocpdb> 26 atoms in block 135
Block first atom: 3204
Blocpdb> 23 atoms in block 136
Block first atom: 3230
Blocpdb> 25 atoms in block 137
Block first atom: 3253
Blocpdb> 31 atoms in block 138
Block first atom: 3278
Blocpdb> 26 atoms in block 139
Block first atom: 3309
Blocpdb> 27 atoms in block 140
Block first atom: 3335
Blocpdb> 21 atoms in block 141
Block first atom: 3362
Blocpdb> 22 atoms in block 142
Block first atom: 3383
Blocpdb> 22 atoms in block 143
Block first atom: 3405
Blocpdb> 25 atoms in block 144
Block first atom: 3427
Blocpdb> 23 atoms in block 145
Block first atom: 3452
Blocpdb> 24 atoms in block 146
Block first atom: 3475
Blocpdb> 28 atoms in block 147
Block first atom: 3499
Blocpdb> 19 atoms in block 148
Block first atom: 3527
Blocpdb> 24 atoms in block 149
Block first atom: 3546
Blocpdb> 24 atoms in block 150
Block first atom: 3570
Blocpdb> 25 atoms in block 151
Block first atom: 3594
Blocpdb> 22 atoms in block 152
Block first atom: 3619
Blocpdb> 27 atoms in block 153
Block first atom: 3641
Blocpdb> 22 atoms in block 154
Block first atom: 3668
Blocpdb> 24 atoms in block 155
Block first atom: 3690
Blocpdb> 20 atoms in block 156
Block first atom: 3714
Blocpdb> 26 atoms in block 157
Block first atom: 3734
Blocpdb> 23 atoms in block 158
Block first atom: 3760
Blocpdb> 26 atoms in block 159
Block first atom: 3783
Blocpdb> 22 atoms in block 160
Block first atom: 3809
Blocpdb> 20 atoms in block 161
Block first atom: 3831
Blocpdb> 21 atoms in block 162
Block first atom: 3851
Blocpdb> 21 atoms in block 163
Block first atom: 3872
Blocpdb> 30 atoms in block 164
Block first atom: 3893
Blocpdb> 21 atoms in block 165
Block first atom: 3923
Blocpdb> 21 atoms in block 166
Block first atom: 3944
Blocpdb> 9 atoms in block 167
Block first atom: 3964
Blocpdb> 167 blocks.
Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1459737 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 11919
Prepmat> Matrix trace = 3191060.0000
Prepmat> Last element read: 11919 11919 159.6767
Prepmat> 14029 lines saved.
Prepmat> 12477 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3973
RTB> Total mass = 3973.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3973
RTB> Number of blocks = 167
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 208328.9082
RTB> 53331 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1002
Diagstd> Nb of non-zero elements: 53331
Diagstd> Projected matrix trace = 208328.9082
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1002 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 208328.9082
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1134050 0.2607628 0.4463720 0.6181406
0.7655149 1.1149529 1.2428733 2.0936423 2.2103561
2.7094547 3.5410590 3.6493350 4.2558507 4.6128676
5.0604254 5.7857366 6.5018244 6.8184770 7.5792735
8.4180463 8.8707639 9.3760665 9.8223547 10.7372601
11.3316994 11.5956133 11.8826463 12.1646650 12.3782538
12.5489880 13.8998973 14.5076382 14.7496143 15.8345930
16.3794698 16.7774749 17.0636741 17.5875382 18.7719241
18.9781022 19.5180685 20.2875491 20.5442798 21.2892771
21.7040563 22.3700954 22.5079992 23.0197203 23.2263878
24.4595329 24.6044437 25.1432734 25.5202191 25.8090783
26.1586011 26.7222466 27.0431965 28.3897428 29.1244603
29.4072370 29.9014606 30.2852870 31.1037881 31.5790261
32.0631717 32.7187695 33.6645225 33.7750877 34.6067179
35.1304111 35.7821485 36.5362350 36.9042889 37.0432547
37.6699213 37.9750977 38.5790047 39.2964589 39.5076476
40.8195130 41.2501193 41.5984081 42.6391799 43.2325839
43.7072550 44.1748524 44.6299234 44.7439759 45.9542529
46.1888014 46.7929233 47.1305116 48.1547914 48.3749534
48.6137507 49.3963882 50.0141733 50.6813197 51.2194196
51.3589380
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034327 0.0034333 0.0034338 0.0034339
0.0034346 36.5688610 55.4521107 72.5510577 85.3766083
95.0106126 114.6630615 121.0622392 157.1254461 161.4456711
178.7459573 204.3439872 207.4446063 224.0208664 233.2280461
244.2804958 261.2008639 276.8935883 283.5560836 298.9572369
315.0655618 323.4266412 332.5106957 340.3322357 355.8295553
365.5466456 369.7789141 374.3276140 378.7436474 382.0541940
384.6800214 404.8564628 413.6124838 417.0475858 432.1143933
439.4861576 444.7936507 448.5713731 455.4050137 470.4892178
473.0659295 479.7485815 489.1139751 492.1990151 501.0438519
505.9012289 513.6049469 515.1856127 521.0090912 523.3426346
537.0557367 538.6442840 544.5104128 548.5768543 551.6727439
555.3957314 561.3474627 564.7084575 578.5967761 586.0359028
588.8740156 593.8017613 597.6007409 605.6223899 610.2315344
614.8915439 621.1460982 630.0594209 631.0932319 638.8155614
643.6309154 649.5737809 656.3827763 659.6805822 660.9214530
666.4884642 669.1827394 674.4826612 680.7254513 682.5521926
693.7918432 697.4416586 700.3798383 709.0872914 714.0043813
717.9133779 721.7434209 725.4514463 726.3778067 736.1361325
738.0123454 742.8230458 745.4977849 753.5551342 755.2757832
757.1376539 763.2079366 767.9657073 773.0707433 777.1638778
778.2216300
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3973
Rtb_to_modes> Number of blocs = 167
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9927E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1134
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2608
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4464
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6181
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7655
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.115
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.243
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.094
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.210
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.709
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.541
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.649
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.256
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.613
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.060
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.786
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.502
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.818
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.579
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.418
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.871
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.376
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.822
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.36
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1002 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 0.99999
0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999
0.99999 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 1.00005
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998
0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 71514 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 0.99999
0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999
0.99999 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 1.00005
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998
0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260711055515516635.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260711055515516635.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260711055515516635.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260711055515516635.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 499
First residue number = 1
Last residue number = 499
Number of atoms found = 3973
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9927E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1134
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2608
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4464
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6181
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7655
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.115
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.243
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.094
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.210
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.709
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.541
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.649
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.256
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.613
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.060
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.786
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.502
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.818
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.579
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.418
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.871
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.376
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.822
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.36
Bfactors> 106 vectors, 11919 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.113400
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.739 for 499 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.094 +/- 0.13
Bfactors> = 93.422 +/- 11.85
Bfactors> Shiftng-fct= 93.329
Bfactors> Scaling-fct= 91.802
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260711055515516635.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260711055515516635.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.2
Chkmod> 106 vectors, 11919 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3973 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9425
0.0034 0.8576
0.0034 0.9941
0.0034 0.7725
0.0034 0.6702
0.0034 0.9164
36.5665 0.6320
55.4537 0.1992
72.5502 0.4129
85.3701 0.5219
95.0056 0.2053
114.6606 0.1434
121.0632 0.4045
157.1321 0.4390
161.4257 0.5616
178.7233 0.4685
204.3335 0.5964
207.4262 0.4535
224.0152 0.0381
233.2214 0.5818
244.2597 0.5895
261.1956 0.3184
276.8854 0.7217
283.5340 0.7105
298.9390 0.1960
315.0512 0.4263
323.4171 0.3557
332.4952 0.5322
340.3115 0.5325
355.8597 0.5049
365.5035 0.2893
369.8330 0.4297
374.2699 0.3063
378.6548 0.3326
382.0647 0.3349
384.6790 0.1657
404.8406 0.5688
413.6284 0.4615
417.0351 0.1475
432.0332 0.5089
439.4744 0.2236
444.8080 0.3838
448.5038 0.4996
455.4173 0.4275
470.4449 0.5468
473.0693 0.5000
479.7517 0.2850
489.1225 0.3632
492.1266 0.4973
501.0308 0.3185
505.8322 0.1490
513.5818 0.4480
515.1864 0.4181
520.9899 0.4767
523.3609 0.4580
537.0378 0.4512
538.5725 0.4715
544.4516 0.4405
548.5510 0.2220
551.6589 0.5096
555.3867 0.5596
561.2998 0.4806
564.6508 0.5452
578.5746 0.3244
585.9659 0.5586
588.8764 0.2265
593.7618 0.2544
597.6216 0.3084
605.5595 0.3402
610.2147 0.4333
614.8347 0.5098
621.1311 0.3082
629.9901 0.4328
631.1120 0.4148
638.8184 0.1106
643.5995 0.3949
649.5264 0.4774
656.3884 0.4606
659.6139 0.4842
660.8640 0.5641
666.4605 0.4289
669.1972 0.4506
674.4624 0.5255
680.7269 0.4434
682.5432 0.5281
693.7662 0.3179
697.4107 0.4845
700.3632 0.5394
709.0637 0.3654
713.9524 0.5136
717.9051 0.4574
721.6728 0.4110
725.4209 0.4324
726.3144 0.2346
736.0705 0.3761
737.9902 0.4091
742.7680 0.3787
745.4617 0.3955
753.4853 0.3736
755.2047 0.3855
757.0759 0.5083
763.2031 0.5510
767.9007 0.5215
773.0275 0.4622
777.1349 0.3307
778.1963 0.3553
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260711055515516635 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
making animated gifs
11 models are in 260711055515516635.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711055515516635.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711055515516635.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260711055515516635 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
making animated gifs
11 models are in 260711055515516635.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711055515516635.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711055515516635.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260711055515516635 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
making animated gifs
11 models are in 260711055515516635.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711055515516635.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711055515516635.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260711055515516635 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
making animated gifs
11 models are in 260711055515516635.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711055515516635.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711055515516635.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260711055515516635 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260711055515516635.eigenfacs
260711055515516635.atom
making animated gifs
11 models are in 260711055515516635.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711055515516635.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711055515516635.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260711055515516635.10.pdb
260711055515516635.11.pdb
260711055515516635.7.pdb
260711055515516635.8.pdb
260711055515516635.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m17.013s
user 0m16.900s
sys 0m0.109s
rm: cannot remove '260711055515516635.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
