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***  TMEM63A_V53A_9N93  ***

LOGs for ID: 260711162148591136

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260711162148591136.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260711162148591136.atom to be opened. Openam> File opened: 260711162148591136.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 650 First residue number = 44 Last residue number = 728 Number of atoms found = 5275 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 123.868418 +/- 18.085368 From: 88.167000 To: 163.179000 = 131.000617 +/- 15.033711 From: 96.573000 To: 167.167000 = 128.170631 +/- 16.821983 From: 94.353000 To: 175.630000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.5607 % Filled. Pdbmat> 1954405 non-zero elements. Pdbmat> 213675 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.01 +/- 21.54 Maximum number = 130 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 4.273500E+06 Pdbmat> Larger element = 531.399 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 650 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260711162148591136.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260711162148591136.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260711162148591136.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5275 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 650 residues. Blocpdb> 29 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 23 atoms in block 2 Block first atom: 30 Blocpdb> 31 atoms in block 3 Block first atom: 53 Blocpdb> 29 atoms in block 4 Block first atom: 84 Blocpdb> 36 atoms in block 5 Block first atom: 113 Blocpdb> 31 atoms in block 6 Block first atom: 149 Blocpdb> 33 atoms in block 7 Block first atom: 180 Blocpdb> 44 atoms in block 8 Block first atom: 213 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 257 Blocpdb> 32 atoms in block 10 Block first atom: 295 Blocpdb> 13 atoms in block 11 Block first atom: 327 Blocpdb> 33 atoms in block 12 Block first atom: 340 Blocpdb> 28 atoms in block 13 Block first atom: 373 Blocpdb> 40 atoms in block 14 Block first atom: 401 Blocpdb> 33 atoms in block 15 Block first atom: 441 Blocpdb> 37 atoms in block 16 Block first atom: 474 Blocpdb> 26 atoms in block 17 Block first atom: 511 Blocpdb> 38 atoms in block 18 Block first atom: 537 Blocpdb> 37 atoms in block 19 Block first atom: 575 Blocpdb> 37 atoms in block 20 Block first atom: 612 Blocpdb> 30 atoms in block 21 Block first atom: 649 Blocpdb> 32 atoms in block 22 Block first atom: 679 Blocpdb> 27 atoms in block 23 Block first atom: 711 Blocpdb> 30 atoms in block 24 Block first atom: 738 Blocpdb> 26 atoms in block 25 Block first atom: 768 Blocpdb> 29 atoms in block 26 Block first atom: 794 Blocpdb> 32 atoms in block 27 Block first atom: 823 Blocpdb> 32 atoms in block 28 Block first atom: 855 Blocpdb> 27 atoms in block 29 Block first atom: 887 Blocpdb> 32 atoms in block 30 Block first atom: 914 Blocpdb> 32 atoms in block 31 Block first atom: 946 Blocpdb> 40 atoms in block 32 Block first atom: 978 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 1018 Blocpdb> 35 atoms in block 34 Block first atom: 1049 Blocpdb> 33 atoms in block 35 Block first atom: 1084 Blocpdb> 34 atoms in block 36 Block first atom: 1117 Blocpdb> 36 atoms in block 37 Block first atom: 1151 Blocpdb> 35 atoms in block 38 Block first atom: 1187 Blocpdb> 35 atoms in block 39 Block first atom: 1222 Blocpdb> 37 atoms in block 40 Block first atom: 1257 Blocpdb> 34 atoms in block 41 Block first atom: 1294 Blocpdb> 26 atoms in block 42 Block first atom: 1328 Blocpdb> 35 atoms in block 43 Block first atom: 1354 Blocpdb> 32 atoms in block 44 Block first atom: 1389 Blocpdb> 36 atoms in block 45 Block first atom: 1421 Blocpdb> 36 atoms in block 46 Block first atom: 1457 Blocpdb> 29 atoms in block 47 Block first atom: 1493 Blocpdb> 29 atoms in block 48 Block first atom: 1522 Blocpdb> 35 atoms in block 49 Block first atom: 1551 Blocpdb> 29 atoms in block 50 Block first atom: 1586 Blocpdb> 36 atoms in block 51 Block first atom: 1615 Blocpdb> 33 atoms in block 52 Block first atom: 1651 Blocpdb> 34 atoms in block 53 Block first atom: 1684 Blocpdb> 30 atoms in block 54 Block first atom: 1718 Blocpdb> 39 atoms in block 55 Block first atom: 1748 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1787 Blocpdb> 25 atoms in block 57 Block first atom: 1816 Blocpdb> 31 atoms in block 58 Block first atom: 1841 Blocpdb> 29 atoms in block 59 Block first atom: 1872 Blocpdb> 30 atoms in block 60 Block first atom: 1901 Blocpdb> 24 atoms in block 61 Block first atom: 1931 Blocpdb> 27 atoms in block 62 Block first atom: 1955 Blocpdb> 36 atoms in block 63 Block first atom: 1982 Blocpdb> 38 atoms in block 64 Block first atom: 2018 Blocpdb> 35 atoms in block 65 Block first atom: 2056 Blocpdb> 35 atoms in block 66 Block first atom: 2091 Blocpdb> 35 atoms in block 67 Block first atom: 2126 Blocpdb> 38 atoms in block 68 Block first atom: 2161 Blocpdb> 34 atoms in block 69 Block first atom: 2199 Blocpdb> 28 atoms in block 70 Block first atom: 2233 Blocpdb> 31 atoms in block 71 Block first atom: 2261 Blocpdb> 36 atoms in block 72 Block first atom: 2292 Blocpdb> 28 atoms in block 73 Block first atom: 2328 Blocpdb> 35 atoms in block 74 Block first atom: 2356 Blocpdb> 36 atoms in block 75 Block first atom: 2391 Blocpdb> 11 atoms in block 76 Block first atom: 2427 Blocpdb> 29 atoms in block 77 Block first atom: 2438 Blocpdb> 29 atoms in block 78 Block first atom: 2467 Blocpdb> 34 atoms in block 79 Block first atom: 2496 Blocpdb> 34 atoms in block 80 Block first atom: 2530 Blocpdb> 35 atoms in block 81 Block first atom: 2564 Blocpdb> 29 atoms in block 82 Block first atom: 2599 Blocpdb> 32 atoms in block 83 Block first atom: 2628 Blocpdb> 37 atoms in block 84 Block first atom: 2660 Blocpdb> 31 atoms in block 85 Block first atom: 2697 Blocpdb> 37 atoms in block 86 Block first atom: 2728 Blocpdb> 45 atoms in block 87 Block first atom: 2765 Blocpdb> 28 atoms in block 88 Block first atom: 2810 Blocpdb> 37 atoms in block 89 Block first atom: 2838 Blocpdb> 31 atoms in block 90 Block first atom: 2875 Blocpdb> 33 atoms in block 91 Block first atom: 2906 Blocpdb> 29 atoms in block 92 Block first atom: 2939 Blocpdb> 29 atoms in block 93 Block first atom: 2968 Blocpdb> 36 atoms in block 94 Block first atom: 2997 Blocpdb> 30 atoms in block 95 Block first atom: 3033 Blocpdb> 31 atoms in block 96 Block first atom: 3063 Blocpdb> 31 atoms in block 97 Block first atom: 3094 Blocpdb> 34 atoms in block 98 Block first atom: 3125 Blocpdb> 33 atoms in block 99 Block first atom: 3159 Blocpdb> 36 atoms in block 100 Block first atom: 3192 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 3228 Blocpdb> 29 atoms in block 102 Block first atom: 3258 Blocpdb> 37 atoms in block 103 Block first atom: 3287 Blocpdb> 32 atoms in block 104 Block first atom: 3324 Blocpdb> 37 atoms in block 105 Block first atom: 3356 Blocpdb> 28 atoms in block 106 Block first atom: 3393 Blocpdb> 33 atoms in block 107 Block first atom: 3421 Blocpdb> 31 atoms in block 108 Block first atom: 3454 Blocpdb> 39 atoms in block 109 Block first atom: 3485 Blocpdb> 34 atoms in block 110 Block first atom: 3524 Blocpdb> 31 atoms in block 111 Block first atom: 3558 Blocpdb> 26 atoms in block 112 Block first atom: 3589 Blocpdb> 29 atoms in block 113 Block first atom: 3615 Blocpdb> 44 atoms in block 114 Block first atom: 3644 Blocpdb> 41 atoms in block 115 Block first atom: 3688 Blocpdb> 28 atoms in block 116 Block first atom: 3729 Blocpdb> 28 atoms in block 117 Block first atom: 3757 Blocpdb> 34 atoms in block 118 Block first atom: 3785 Blocpdb> 33 atoms in block 119 Block first atom: 3819 Blocpdb> 26 atoms in block 120 Block first atom: 3852 Blocpdb> 37 atoms in block 121 Block first atom: 3878 Blocpdb> 32 atoms in block 122 Block first atom: 3915 Blocpdb> 30 atoms in block 123 Block first atom: 3947 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 3977 Blocpdb> 36 atoms in block 125 Block first atom: 4001 Blocpdb> 27 atoms in block 126 Block first atom: 4037 Blocpdb> 35 atoms in block 127 Block first atom: 4064 Blocpdb> 38 atoms in block 128 Block first atom: 4099 Blocpdb> 29 atoms in block 129 Block first atom: 4137 Blocpdb> 29 atoms in block 130 Block first atom: 4166 Blocpdb> 35 atoms in block 131 Block first atom: 4195 Blocpdb> 31 atoms in block 132 Block first atom: 4230 Blocpdb> 41 atoms in block 133 Block first atom: 4261 Blocpdb> 28 atoms in block 134 Block first atom: 4302 Blocpdb> 39 atoms in block 135 Block first atom: 4330 Blocpdb> 32 atoms in block 136 Block first atom: 4369 Blocpdb> 29 atoms in block 137 Block first atom: 4401 Blocpdb> 31 atoms in block 138 Block first atom: 4430 Blocpdb> 28 atoms in block 139 Block first atom: 4461 Blocpdb> 31 atoms in block 140 Block first atom: 4489 Blocpdb> 32 atoms in block 141 Block first atom: 4520 Blocpdb> 33 atoms in block 142 Block first atom: 4552 Blocpdb> 33 atoms in block 143 Block first atom: 4585 Blocpdb> 37 atoms in block 144 Block first atom: 4618 Blocpdb> 42 atoms in block 145 Block first atom: 4655 Blocpdb> 25 atoms in block 146 Block first atom: 4697 Blocpdb> 30 atoms in block 147 Block first atom: 4722 Blocpdb> 34 atoms in block 148 Block first atom: 4752 Blocpdb> 29 atoms in block 149 Block first atom: 4786 Blocpdb> 23 atoms in block 150 Block first atom: 4815 Blocpdb> 29 atoms in block 151 Block first atom: 4838 Blocpdb> 41 atoms in block 152 Block first atom: 4867 Blocpdb> 40 atoms in block 153 Block first atom: 4908 Blocpdb> 38 atoms in block 154 Block first atom: 4948 Blocpdb> 26 atoms in block 155 Block first atom: 4986 Blocpdb> 27 atoms in block 156 Block first atom: 5012 Blocpdb> 37 atoms in block 157 Block first atom: 5039 Blocpdb> 31 atoms in block 158 Block first atom: 5076 Blocpdb> 30 atoms in block 159 Block first atom: 5107 Blocpdb> 29 atoms in block 160 Block first atom: 5137 Blocpdb> 28 atoms in block 161 Block first atom: 5166 Blocpdb> 36 atoms in block 162 Block first atom: 5194 Blocpdb> 26 atoms in block 163 Block first atom: 5230 Blocpdb> 20 atoms in block 164 Block first atom: 5255 Blocpdb> 164 blocks. Blocpdb> At most, 45 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 11 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1954569 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 15825 Prepmat> Matrix trace = 4273500.0000 Prepmat> Last element read: 15825 15825 38.7320 Prepmat> 13531 lines saved. Prepmat> 12186 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5275 RTB> Total mass = 5275.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5275 RTB> Number of blocks = 164 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 189687.8426 RTB> 45924 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 984 Diagstd> Nb of non-zero elements: 45924 Diagstd> Projected matrix trace = 189687.8426 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 984 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 189687.8426 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2720589 0.2938541 0.6714995 0.8416813 1.2095847 1.4667597 1.7506489 1.8915773 2.5709565 2.9526202 3.0004970 3.1478422 3.5860212 4.2702324 4.6473348 4.7473277 4.9536331 5.3899926 6.1647033 6.4394571 6.4449635 7.0699432 7.4105436 7.9626537 8.2256391 8.8027497 9.1647756 9.4313024 10.1867908 10.4549393 10.7674647 11.4075007 11.7226921 12.3785829 12.6468342 13.2256459 13.6076008 14.1549514 14.5053786 14.6919520 15.7976859 16.0615166 16.6522998 17.4517520 17.6778118 18.3429618 18.6634271 18.9670771 19.6481218 20.2734440 20.5684809 21.0304515 21.8393663 22.4802188 22.9980788 23.9979535 24.3711520 24.7820222 25.0924665 25.8690806 26.3680527 26.5940094 27.2154350 28.1350332 28.3900107 28.5128002 28.9692966 29.4304111 29.7881576 30.1730318 30.5755154 31.3885327 31.9001816 32.3693027 32.4028548 33.0007860 33.2440625 33.7848899 35.0625351 35.3650125 35.5853477 36.2094593 36.7466180 37.2583236 38.2185987 39.1782067 39.3607333 39.5474430 39.8758381 39.9718050 40.7357891 41.7364997 41.9282774 42.5568137 43.1866440 43.5351608 44.0116082 44.4333840 44.8764234 45.3546722 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034322 0.0034322 0.0034327 0.0034333 0.0034338 0.0034349 56.6404528 58.8655384 88.9852679 99.6251786 119.4299982 131.5148403 143.6795004 149.3507222 174.1175880 186.5945998 188.1013359 192.6645267 205.6372113 224.3990602 234.0977613 236.6028043 241.6891751 252.1095888 269.6195450 275.5623668 275.6801597 288.7375342 295.6108109 306.4249994 311.4440982 322.1843610 328.7427615 333.4886949 346.5883613 351.1203797 356.3296894 366.7672357 371.7996360 382.0592728 386.1768116 394.9150869 400.5770469 408.5540047 413.5802722 416.2315834 431.6105162 435.1996686 443.1312633 453.6436093 456.5722722 465.0825140 469.1275929 472.9284980 481.3442647 488.9439160 492.4888344 497.9888041 507.4757534 514.8675809 520.7641262 531.9641732 536.0845727 540.5845775 543.9599891 552.3136513 557.6148216 559.9989200 566.5039213 575.9953751 578.5995054 579.8494051 584.4727338 589.1059981 592.6756730 596.4921813 600.4573612 608.3882080 613.3266809 617.8199848 618.1400993 623.8173113 626.1124298 631.1848037 643.0088302 645.7764280 647.7849997 653.4408784 658.2698555 662.8372939 671.3247518 679.7004490 681.2819308 682.8958673 685.7253299 686.5499823 693.0799689 701.5413791 703.1513101 708.4020875 713.6249223 716.4986174 720.4086180 723.8523275 727.4520942 731.3180568 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5275 Rtb_to_modes> Number of blocs = 164 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9900E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9900E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9926E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2721 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2939 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6715 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8417 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.210 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.467 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.751 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.892 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.571 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.953 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.000 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.148 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.586 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.270 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.647 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.747 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.954 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.390 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.165 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 94950 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260711162148591136.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260711162148591136.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260711162148591136.atom Openam> file on opening on unit 11: 260711162148591136.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 650 First residue number = 44 Last residue number = 728 Number of atoms found = 5275 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9900E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9900E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9926E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2721 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2939 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6715 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8417 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.210 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.467 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.751 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.892 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.571 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.953 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.000 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.148 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.411 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.963 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.226 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.803 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.165 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.431 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.79 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.01 Rdmodfacs> 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Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.272100 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.613 for 650 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.056 +/- 0.10 Bfactors> = 75.705 +/- 30.69 Bfactors> Shiftng-fct= 75.649 Bfactors> Scaling-fct= 321.692 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260711162148591136.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260711162148591136.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 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CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.6 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vecteur en lecture: 371.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.9 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vecteur en lecture: 608.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.2 Chkmod> 106 vectors, 15825 coordinates in file. Chkmod> That is: 5275 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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