***  TMEM63A_V53A_9N93  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260711162148591136.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260711162148591136.atom to be opened.
Openam> File opened: 260711162148591136.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 650
First residue number = 44
Last residue number = 728
Number of atoms found = 5275
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 123.868418 +/- 18.085368 From: 88.167000 To: 163.179000
= 131.000617 +/- 15.033711 From: 96.573000 To: 167.167000
= 128.170631 +/- 16.821983 From: 94.353000 To: 175.630000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.5607 % Filled.
Pdbmat> 1954405 non-zero elements.
Pdbmat> 213675 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 81.01 +/- 21.54
Maximum number = 130
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 4.273500E+06
Pdbmat> Larger element = 531.399
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
650 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260711162148591136.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260711162148591136.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260711162148591136.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 5275 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 650 residues.
Blocpdb> 29 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 23 atoms in block 2
Block first atom: 30
Blocpdb> 31 atoms in block 3
Block first atom: 53
Blocpdb> 29 atoms in block 4
Block first atom: 84
Blocpdb> 36 atoms in block 5
Block first atom: 113
Blocpdb> 31 atoms in block 6
Block first atom: 149
Blocpdb> 33 atoms in block 7
Block first atom: 180
Blocpdb> 44 atoms in block 8
Block first atom: 213
Blocpdb> 38 atoms in block 9
Block first atom: 257
Blocpdb> 32 atoms in block 10
Block first atom: 295
Blocpdb> 13 atoms in block 11
Block first atom: 327
Blocpdb> 33 atoms in block 12
Block first atom: 340
Blocpdb> 28 atoms in block 13
Block first atom: 373
Blocpdb> 40 atoms in block 14
Block first atom: 401
Blocpdb> 33 atoms in block 15
Block first atom: 441
Blocpdb> 37 atoms in block 16
Block first atom: 474
Blocpdb> 26 atoms in block 17
Block first atom: 511
Blocpdb> 38 atoms in block 18
Block first atom: 537
Blocpdb> 37 atoms in block 19
Block first atom: 575
Blocpdb> 37 atoms in block 20
Block first atom: 612
Blocpdb> 30 atoms in block 21
Block first atom: 649
Blocpdb> 32 atoms in block 22
Block first atom: 679
Blocpdb> 27 atoms in block 23
Block first atom: 711
Blocpdb> 30 atoms in block 24
Block first atom: 738
Blocpdb> 26 atoms in block 25
Block first atom: 768
Blocpdb> 29 atoms in block 26
Block first atom: 794
Blocpdb> 32 atoms in block 27
Block first atom: 823
Blocpdb> 32 atoms in block 28
Block first atom: 855
Blocpdb> 27 atoms in block 29
Block first atom: 887
Blocpdb> 32 atoms in block 30
Block first atom: 914
Blocpdb> 32 atoms in block 31
Block first atom: 946
Blocpdb> 40 atoms in block 32
Block first atom: 978
Blocpdb> 31 atoms in block 33
Block first atom: 1018
Blocpdb> 35 atoms in block 34
Block first atom: 1049
Blocpdb> 33 atoms in block 35
Block first atom: 1084
Blocpdb> 34 atoms in block 36
Block first atom: 1117
Blocpdb> 36 atoms in block 37
Block first atom: 1151
Blocpdb> 35 atoms in block 38
Block first atom: 1187
Blocpdb> 35 atoms in block 39
Block first atom: 1222
Blocpdb> 37 atoms in block 40
Block first atom: 1257
Blocpdb> 34 atoms in block 41
Block first atom: 1294
Blocpdb> 26 atoms in block 42
Block first atom: 1328
Blocpdb> 35 atoms in block 43
Block first atom: 1354
Blocpdb> 32 atoms in block 44
Block first atom: 1389
Blocpdb> 36 atoms in block 45
Block first atom: 1421
Blocpdb> 36 atoms in block 46
Block first atom: 1457
Blocpdb> 29 atoms in block 47
Block first atom: 1493
Blocpdb> 29 atoms in block 48
Block first atom: 1522
Blocpdb> 35 atoms in block 49
Block first atom: 1551
Blocpdb> 29 atoms in block 50
Block first atom: 1586
Blocpdb> 36 atoms in block 51
Block first atom: 1615
Blocpdb> 33 atoms in block 52
Block first atom: 1651
Blocpdb> 34 atoms in block 53
Block first atom: 1684
Blocpdb> 30 atoms in block 54
Block first atom: 1718
Blocpdb> 39 atoms in block 55
Block first atom: 1748
Blocpdb> 29 atoms in block 56
Block first atom: 1787
Blocpdb> 25 atoms in block 57
Block first atom: 1816
Blocpdb> 31 atoms in block 58
Block first atom: 1841
Blocpdb> 29 atoms in block 59
Block first atom: 1872
Blocpdb> 30 atoms in block 60
Block first atom: 1901
Blocpdb> 24 atoms in block 61
Block first atom: 1931
Blocpdb> 27 atoms in block 62
Block first atom: 1955
Blocpdb> 36 atoms in block 63
Block first atom: 1982
Blocpdb> 38 atoms in block 64
Block first atom: 2018
Blocpdb> 35 atoms in block 65
Block first atom: 2056
Blocpdb> 35 atoms in block 66
Block first atom: 2091
Blocpdb> 35 atoms in block 67
Block first atom: 2126
Blocpdb> 38 atoms in block 68
Block first atom: 2161
Blocpdb> 34 atoms in block 69
Block first atom: 2199
Blocpdb> 28 atoms in block 70
Block first atom: 2233
Blocpdb> 31 atoms in block 71
Block first atom: 2261
Blocpdb> 36 atoms in block 72
Block first atom: 2292
Blocpdb> 28 atoms in block 73
Block first atom: 2328
Blocpdb> 35 atoms in block 74
Block first atom: 2356
Blocpdb> 36 atoms in block 75
Block first atom: 2391
Blocpdb> 11 atoms in block 76
Block first atom: 2427
Blocpdb> 29 atoms in block 77
Block first atom: 2438
Blocpdb> 29 atoms in block 78
Block first atom: 2467
Blocpdb> 34 atoms in block 79
Block first atom: 2496
Blocpdb> 34 atoms in block 80
Block first atom: 2530
Blocpdb> 35 atoms in block 81
Block first atom: 2564
Blocpdb> 29 atoms in block 82
Block first atom: 2599
Blocpdb> 32 atoms in block 83
Block first atom: 2628
Blocpdb> 37 atoms in block 84
Block first atom: 2660
Blocpdb> 31 atoms in block 85
Block first atom: 2697
Blocpdb> 37 atoms in block 86
Block first atom: 2728
Blocpdb> 45 atoms in block 87
Block first atom: 2765
Blocpdb> 28 atoms in block 88
Block first atom: 2810
Blocpdb> 37 atoms in block 89
Block first atom: 2838
Blocpdb> 31 atoms in block 90
Block first atom: 2875
Blocpdb> 33 atoms in block 91
Block first atom: 2906
Blocpdb> 29 atoms in block 92
Block first atom: 2939
Blocpdb> 29 atoms in block 93
Block first atom: 2968
Blocpdb> 36 atoms in block 94
Block first atom: 2997
Blocpdb> 30 atoms in block 95
Block first atom: 3033
Blocpdb> 31 atoms in block 96
Block first atom: 3063
Blocpdb> 31 atoms in block 97
Block first atom: 3094
Blocpdb> 34 atoms in block 98
Block first atom: 3125
Blocpdb> 33 atoms in block 99
Block first atom: 3159
Blocpdb> 36 atoms in block 100
Block first atom: 3192
Blocpdb> 30 atoms in block 101
Block first atom: 3228
Blocpdb> 29 atoms in block 102
Block first atom: 3258
Blocpdb> 37 atoms in block 103
Block first atom: 3287
Blocpdb> 32 atoms in block 104
Block first atom: 3324
Blocpdb> 37 atoms in block 105
Block first atom: 3356
Blocpdb> 28 atoms in block 106
Block first atom: 3393
Blocpdb> 33 atoms in block 107
Block first atom: 3421
Blocpdb> 31 atoms in block 108
Block first atom: 3454
Blocpdb> 39 atoms in block 109
Block first atom: 3485
Blocpdb> 34 atoms in block 110
Block first atom: 3524
Blocpdb> 31 atoms in block 111
Block first atom: 3558
Blocpdb> 26 atoms in block 112
Block first atom: 3589
Blocpdb> 29 atoms in block 113
Block first atom: 3615
Blocpdb> 44 atoms in block 114
Block first atom: 3644
Blocpdb> 41 atoms in block 115
Block first atom: 3688
Blocpdb> 28 atoms in block 116
Block first atom: 3729
Blocpdb> 28 atoms in block 117
Block first atom: 3757
Blocpdb> 34 atoms in block 118
Block first atom: 3785
Blocpdb> 33 atoms in block 119
Block first atom: 3819
Blocpdb> 26 atoms in block 120
Block first atom: 3852
Blocpdb> 37 atoms in block 121
Block first atom: 3878
Blocpdb> 32 atoms in block 122
Block first atom: 3915
Blocpdb> 30 atoms in block 123
Block first atom: 3947
Blocpdb> 24 atoms in block 124
Block first atom: 3977
Blocpdb> 36 atoms in block 125
Block first atom: 4001
Blocpdb> 27 atoms in block 126
Block first atom: 4037
Blocpdb> 35 atoms in block 127
Block first atom: 4064
Blocpdb> 38 atoms in block 128
Block first atom: 4099
Blocpdb> 29 atoms in block 129
Block first atom: 4137
Blocpdb> 29 atoms in block 130
Block first atom: 4166
Blocpdb> 35 atoms in block 131
Block first atom: 4195
Blocpdb> 31 atoms in block 132
Block first atom: 4230
Blocpdb> 41 atoms in block 133
Block first atom: 4261
Blocpdb> 28 atoms in block 134
Block first atom: 4302
Blocpdb> 39 atoms in block 135
Block first atom: 4330
Blocpdb> 32 atoms in block 136
Block first atom: 4369
Blocpdb> 29 atoms in block 137
Block first atom: 4401
Blocpdb> 31 atoms in block 138
Block first atom: 4430
Blocpdb> 28 atoms in block 139
Block first atom: 4461
Blocpdb> 31 atoms in block 140
Block first atom: 4489
Blocpdb> 32 atoms in block 141
Block first atom: 4520
Blocpdb> 33 atoms in block 142
Block first atom: 4552
Blocpdb> 33 atoms in block 143
Block first atom: 4585
Blocpdb> 37 atoms in block 144
Block first atom: 4618
Blocpdb> 42 atoms in block 145
Block first atom: 4655
Blocpdb> 25 atoms in block 146
Block first atom: 4697
Blocpdb> 30 atoms in block 147
Block first atom: 4722
Blocpdb> 34 atoms in block 148
Block first atom: 4752
Blocpdb> 29 atoms in block 149
Block first atom: 4786
Blocpdb> 23 atoms in block 150
Block first atom: 4815
Blocpdb> 29 atoms in block 151
Block first atom: 4838
Blocpdb> 41 atoms in block 152
Block first atom: 4867
Blocpdb> 40 atoms in block 153
Block first atom: 4908
Blocpdb> 38 atoms in block 154
Block first atom: 4948
Blocpdb> 26 atoms in block 155
Block first atom: 4986
Blocpdb> 27 atoms in block 156
Block first atom: 5012
Blocpdb> 37 atoms in block 157
Block first atom: 5039
Blocpdb> 31 atoms in block 158
Block first atom: 5076
Blocpdb> 30 atoms in block 159
Block first atom: 5107
Blocpdb> 29 atoms in block 160
Block first atom: 5137
Blocpdb> 28 atoms in block 161
Block first atom: 5166
Blocpdb> 36 atoms in block 162
Block first atom: 5194
Blocpdb> 26 atoms in block 163
Block first atom: 5230
Blocpdb> 20 atoms in block 164
Block first atom: 5255
Blocpdb> 164 blocks.
Blocpdb> At most, 45 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 11 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1954569 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 15825
Prepmat> Matrix trace = 4273500.0000
Prepmat> Last element read: 15825 15825 38.7320
Prepmat> 13531 lines saved.
Prepmat> 12186 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5275
RTB> Total mass = 5275.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 5275
RTB> Number of blocks = 164
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 189687.8426
RTB> 45924 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 984
Diagstd> Nb of non-zero elements: 45924
Diagstd> Projected matrix trace = 189687.8426
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 984 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 189687.8426
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2720589 0.2938541 0.6714995 0.8416813
1.2095847 1.4667597 1.7506489 1.8915773 2.5709565
2.9526202 3.0004970 3.1478422 3.5860212 4.2702324
4.6473348 4.7473277 4.9536331 5.3899926 6.1647033
6.4394571 6.4449635 7.0699432 7.4105436 7.9626537
8.2256391 8.8027497 9.1647756 9.4313024 10.1867908
10.4549393 10.7674647 11.4075007 11.7226921 12.3785829
12.6468342 13.2256459 13.6076008 14.1549514 14.5053786
14.6919520 15.7976859 16.0615166 16.6522998 17.4517520
17.6778118 18.3429618 18.6634271 18.9670771 19.6481218
20.2734440 20.5684809 21.0304515 21.8393663 22.4802188
22.9980788 23.9979535 24.3711520 24.7820222 25.0924665
25.8690806 26.3680527 26.5940094 27.2154350 28.1350332
28.3900107 28.5128002 28.9692966 29.4304111 29.7881576
30.1730318 30.5755154 31.3885327 31.9001816 32.3693027
32.4028548 33.0007860 33.2440625 33.7848899 35.0625351
35.3650125 35.5853477 36.2094593 36.7466180 37.2583236
38.2185987 39.1782067 39.3607333 39.5474430 39.8758381
39.9718050 40.7357891 41.7364997 41.9282774 42.5568137
43.1866440 43.5351608 44.0116082 44.4333840 44.8764234
45.3546722
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034322 0.0034322 0.0034327 0.0034333 0.0034338
0.0034349 56.6404528 58.8655384 88.9852679 99.6251786
119.4299982 131.5148403 143.6795004 149.3507222 174.1175880
186.5945998 188.1013359 192.6645267 205.6372113 224.3990602
234.0977613 236.6028043 241.6891751 252.1095888 269.6195450
275.5623668 275.6801597 288.7375342 295.6108109 306.4249994
311.4440982 322.1843610 328.7427615 333.4886949 346.5883613
351.1203797 356.3296894 366.7672357 371.7996360 382.0592728
386.1768116 394.9150869 400.5770469 408.5540047 413.5802722
416.2315834 431.6105162 435.1996686 443.1312633 453.6436093
456.5722722 465.0825140 469.1275929 472.9284980 481.3442647
488.9439160 492.4888344 497.9888041 507.4757534 514.8675809
520.7641262 531.9641732 536.0845727 540.5845775 543.9599891
552.3136513 557.6148216 559.9989200 566.5039213 575.9953751
578.5995054 579.8494051 584.4727338 589.1059981 592.6756730
596.4921813 600.4573612 608.3882080 613.3266809 617.8199848
618.1400993 623.8173113 626.1124298 631.1848037 643.0088302
645.7764280 647.7849997 653.4408784 658.2698555 662.8372939
671.3247518 679.7004490 681.2819308 682.8958673 685.7253299
686.5499823 693.0799689 701.5413791 703.1513101 708.4020875
713.6249223 716.4986174 720.4086180 723.8523275 727.4520942
731.3180568
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5275
Rtb_to_modes> Number of blocs = 164
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9900E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9900E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9926E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2721
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2939
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6715
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8417
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.210
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.467
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.751
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.892
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.571
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.953
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.000
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.148
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.586
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.270
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.647
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.747
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.954
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.390
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.165
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.439
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.445
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.070
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.411
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.963
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.226
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.803
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.165
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.431
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.35
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 984 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 0.99998
1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 0.99996
1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001
0.99998 0.99998 1.00001 1.00002 0.99997
1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 0.99996
1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000
1.00004 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
0.99997 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999
0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002
1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00003
1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 0.99998
0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997
0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 94950 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 0.99998
1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 0.99996
1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001
0.99998 0.99998 1.00001 1.00002 0.99997
1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 0.99996
1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000
1.00004 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
0.99997 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999
0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002
1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00003
1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 0.99998
0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997
0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260711162148591136.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260711162148591136.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260711162148591136.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260711162148591136.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 650
First residue number = 44
Last residue number = 728
Number of atoms found = 5275
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9900E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9900E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9926E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2721
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2939
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6715
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8417
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.210
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.467
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.751
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.892
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.571
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.953
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.000
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.148
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.586
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.270
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.647
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.747
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.954
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.390
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.165
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.439
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.445
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.070
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.411
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.963
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.226
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.803
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.165
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.431
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.35
Bfactors> 106 vectors, 15825 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.272100
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.613 for 650 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.056 +/- 0.10
Bfactors> = 75.705 +/- 30.69
Bfactors> Shiftng-fct= 75.649
Bfactors> Scaling-fct= 321.692
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260711162148591136.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260711162148591136.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.2
Chkmod> 106 vectors, 15825 coordinates in file.
Chkmod> That is: 5275 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6495
0.0034 0.7417
0.0034 0.7718
0.0034 0.7507
0.0034 0.7355
0.0034 0.8256
56.6423 0.2508
58.8676 0.1281
88.9815 0.3882
99.6220 0.4011
119.4454 0.4408
131.5200 0.6748
143.6877 0.1013
149.3610 0.5759
174.1116 0.4446
186.5986 0.5046
188.0777 0.5623
192.6611 0.5129
205.6278 0.3616
224.3833 0.4598
234.0793 0.4398
236.5845 0.2558
241.6877 0.2867
252.0989 0.5112
269.6145 0.5086
275.5408 0.5332
275.6691 0.4662
288.7263 0.3954
295.6072 0.3230
306.4185 0.3384
311.4376 0.3537
322.1751 0.2477
328.7327 0.4190
333.4690 0.2790
346.6281 0.4706
351.0224 0.4054
356.3563 0.3984
366.7917 0.5324
371.7410 0.4212
382.0647 0.4384
386.2086 0.4028
394.9631 0.5235
400.5952 0.4665
408.4650 0.4280
413.6284 0.4367
416.1861 0.4603
431.6236 0.3711
435.1604 0.3068
443.0816 0.4131
453.6014 0.6026
456.5809 0.4798
465.0250 0.4805
469.0644 0.4438
472.9446 0.3187
481.3466 0.2664
488.8814 0.3633
492.4859 0.3879
497.9621 0.5311
507.4613 0.3898
514.8430 0.3445
520.7635 0.2916
531.9640 0.3752
536.0489 0.3403
540.5393 0.5145
543.9099 0.5701
552.2998 0.4255
557.6115 0.4425
559.9327 0.5491
566.5271 0.4294
576.0215 0.4613
578.5746 0.2438
579.7960 0.4834
584.4547 0.4819
589.0766 0.4918
592.6686 0.4634
596.4366 0.4295
600.4756 0.5355
608.3763 0.5434
613.2986 0.5840
617.8001 0.3603
618.0863 0.5364
623.7831 0.4355
626.0473 0.4301
631.1120 0.3372
642.9580 0.4094
645.7942 0.4739
647.7995 0.4838
653.4177 0.5959
658.2719 0.3347
662.8238 0.4571
671.3082 0.5677
679.6868 0.5415
681.2463 0.4989
682.8886 0.5019
685.7317 0.5490
686.5050 0.5247
693.0860 0.5915
701.5407 0.4530
703.1356 0.5221
708.3982 0.4328
713.6220 0.5997
716.5077 0.3373
720.3645 0.5443
723.7937 0.4883
727.4499 0.1777
731.2490 0.5267
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260711162148591136 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
making animated gifs
11 models are in 260711162148591136.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711162148591136.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711162148591136.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260711162148591136 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
making animated gifs
11 models are in 260711162148591136.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711162148591136.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711162148591136.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260711162148591136 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
making animated gifs
11 models are in 260711162148591136.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711162148591136.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711162148591136.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260711162148591136 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
making animated gifs
11 models are in 260711162148591136.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711162148591136.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711162148591136.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260711162148591136 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260711162148591136.eigenfacs
260711162148591136.atom
making animated gifs
11 models are in 260711162148591136.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711162148591136.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260711162148591136.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260711162148591136.10.pdb
260711162148591136.11.pdb
260711162148591136.7.pdb
260711162148591136.8.pdb
260711162148591136.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m21.694s
user 0m21.542s
sys 0m0.142s
rm: cannot remove '260711162148591136.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|