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***  Holo AMPK  ***

LOGs for ID: 260711185133617066

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260711185133617066.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260711185133617066.atom to be opened. Openam> File opened: 260711185133617066.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 848 First residue number = 11 Last residue number = 324 Number of atoms found = 6844 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = -33.774553 +/- 16.363310 From: -70.290000 To: 5.162000 = 46.123612 +/- 19.311958 From: 1.770000 To: 87.045000 = -7.284385 +/- 24.372302 From: -72.161000 To: 49.746000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.1858 % Filled. Pdbmat> 2499494 non-zero elements. Pdbmat> 273200 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.84 +/- 22.14 Maximum number = 126 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 5.464000E+06 Pdbmat> Larger element = 494.413 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 848 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260711185133617066.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260711185133617066.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260711185133617066.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6844 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 848 residues. Blocpdb> 34 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 42 atoms in block 2 Block first atom: 35 Blocpdb> 31 atoms in block 3 Block first atom: 77 Blocpdb> 33 atoms in block 4 Block first atom: 108 Blocpdb> 36 atoms in block 5 Block first atom: 141 Blocpdb> 43 atoms in block 6 Block first atom: 177 Blocpdb> 35 atoms in block 7 Block first atom: 220 Blocpdb> 40 atoms in block 8 Block first atom: 255 Blocpdb> 48 atoms in block 9 Block first atom: 295 Blocpdb> 36 atoms in block 10 Block first atom: 343 Blocpdb> 43 atoms in block 11 Block first atom: 379 Blocpdb> 42 atoms in block 12 Block first atom: 422 Blocpdb> 49 atoms in block 13 Block first atom: 464 Blocpdb> 42 atoms in block 14 Block first atom: 513 Blocpdb> 44 atoms in block 15 Block first atom: 555 Blocpdb> 34 atoms in block 16 Block first atom: 599 Blocpdb> 42 atoms in block 17 Block first atom: 633 Blocpdb> 38 atoms in block 18 Block first atom: 675 Blocpdb> 40 atoms in block 19 Block first atom: 713 Blocpdb> 43 atoms in block 20 Block first atom: 753 Blocpdb> 40 atoms in block 21 Block first atom: 796 Blocpdb> 46 atoms in block 22 Block first atom: 836 Blocpdb> 45 atoms in block 23 Block first atom: 882 Blocpdb> 33 atoms in block 24 Block first atom: 927 Blocpdb> 49 atoms in block 25 Block first atom: 960 Blocpdb> 43 atoms in block 26 Block first atom: 1009 Blocpdb> 41 atoms in block 27 Block first atom: 1052 Blocpdb> 39 atoms in block 28 Block first atom: 1093 Blocpdb> 36 atoms in block 29 Block first atom: 1132 Blocpdb> 41 atoms in block 30 Block first atom: 1168 Blocpdb> 34 atoms in block 31 Block first atom: 1209 Blocpdb> 35 atoms in block 32 Block first atom: 1243 Blocpdb> 30 atoms in block 33 Block first atom: 1278 Blocpdb> 29 atoms in block 34 Block first atom: 1308 Blocpdb> 37 atoms in block 35 Block first atom: 1337 Blocpdb> 34 atoms in block 36 Block first atom: 1374 Blocpdb> 40 atoms in block 37 Block first atom: 1408 Blocpdb> 39 atoms in block 38 Block first atom: 1448 Blocpdb> 37 atoms in block 39 Block first atom: 1487 Blocpdb> 41 atoms in block 40 Block first atom: 1524 Blocpdb> 33 atoms in block 41 Block first atom: 1565 Blocpdb> 42 atoms in block 42 Block first atom: 1598 Blocpdb> 39 atoms in block 43 Block first atom: 1640 Blocpdb> 43 atoms in block 44 Block first atom: 1679 Blocpdb> 43 atoms in block 45 Block first atom: 1722 Blocpdb> 43 atoms in block 46 Block first atom: 1765 Blocpdb> 36 atoms in block 47 Block first atom: 1808 Blocpdb> 41 atoms in block 48 Block first atom: 1844 Blocpdb> 40 atoms in block 49 Block first atom: 1885 Blocpdb> 40 atoms in block 50 Block first atom: 1925 Blocpdb> 40 atoms in block 51 Block first atom: 1965 Blocpdb> 53 atoms in block 52 Block first atom: 2005 Blocpdb> 45 atoms in block 53 Block first atom: 2058 Blocpdb> 47 atoms in block 54 Block first atom: 2103 Blocpdb> 24 atoms in block 55 Block first atom: 2150 Blocpdb> 47 atoms in block 56 Block first atom: 2174 Blocpdb> 37 atoms in block 57 Block first atom: 2221 Blocpdb> 41 atoms in block 58 Block first atom: 2258 Blocpdb> 38 atoms in block 59 Block first atom: 2299 Blocpdb> 37 atoms in block 60 Block first atom: 2337 Blocpdb> 46 atoms in block 61 Block first atom: 2374 Blocpdb> 46 atoms in block 62 Block first atom: 2420 Blocpdb> 47 atoms in block 63 Block first atom: 2466 Blocpdb> 49 atoms in block 64 Block first atom: 2513 Blocpdb> 35 atoms in block 65 Block first atom: 2562 Blocpdb> 42 atoms in block 66 Block first atom: 2597 Blocpdb> 43 atoms in block 67 Block first atom: 2639 Blocpdb> 41 atoms in block 68 Block first atom: 2682 Blocpdb> 43 atoms in block 69 Block first atom: 2723 Blocpdb> 44 atoms in block 70 Block first atom: 2766 Blocpdb> 17 atoms in block 71 Block first atom: 2810 Blocpdb> 40 atoms in block 72 Block first atom: 2827 Blocpdb> 35 atoms in block 73 Block first atom: 2867 Blocpdb> 48 atoms in block 74 Block first atom: 2902 Blocpdb> 35 atoms in block 75 Block first atom: 2950 Blocpdb> 30 atoms in block 76 Block first atom: 2985 Blocpdb> 37 atoms in block 77 Block first atom: 3015 Blocpdb> 43 atoms in block 78 Block first atom: 3052 Blocpdb> 33 atoms in block 79 Block first atom: 3095 Blocpdb> 45 atoms in block 80 Block first atom: 3128 Blocpdb> 35 atoms in block 81 Block first atom: 3173 Blocpdb> 45 atoms in block 82 Block first atom: 3208 Blocpdb> 41 atoms in block 83 Block first atom: 3253 Blocpdb> 44 atoms in block 84 Block first atom: 3294 Blocpdb> 37 atoms in block 85 Block first atom: 3338 Blocpdb> 39 atoms in block 86 Block first atom: 3375 Blocpdb> 52 atoms in block 87 Block first atom: 3414 Blocpdb> 42 atoms in block 88 Block first atom: 3466 Blocpdb> 38 atoms in block 89 Block first atom: 3508 Blocpdb> 38 atoms in block 90 Block first atom: 3546 Blocpdb> 34 atoms in block 91 Block first atom: 3584 Blocpdb> 39 atoms in block 92 Block first atom: 3618 Blocpdb> 41 atoms in block 93 Block first atom: 3657 Blocpdb> 46 atoms in block 94 Block first atom: 3698 Blocpdb> 36 atoms in block 95 Block first atom: 3744 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 3780 Blocpdb> 47 atoms in block 97 Block first atom: 3803 Blocpdb> 22 atoms in block 98 Block first atom: 3850 Blocpdb> 38 atoms in block 99 Block first atom: 3872 Blocpdb> 40 atoms in block 100 Block first atom: 3910 Blocpdb> 40 atoms in block 101 Block first atom: 3950 Blocpdb> 36 atoms in block 102 Block first atom: 3990 Blocpdb> 35 atoms in block 103 Block first atom: 4026 Blocpdb> 37 atoms in block 104 Block first atom: 4061 Blocpdb> 40 atoms in block 105 Block first atom: 4098 Blocpdb> 46 atoms in block 106 Block first atom: 4138 Blocpdb> 36 atoms in block 107 Block first atom: 4184 Blocpdb> 34 atoms in block 108 Block first atom: 4220 Blocpdb> 36 atoms in block 109 Block first atom: 4254 Blocpdb> 50 atoms in block 110 Block first atom: 4290 Blocpdb> 41 atoms in block 111 Block first atom: 4340 Blocpdb> 44 atoms in block 112 Block first atom: 4381 Blocpdb> 40 atoms in block 113 Block first atom: 4425 Blocpdb> 40 atoms in block 114 Block first atom: 4465 Blocpdb> 47 atoms in block 115 Block first atom: 4505 Blocpdb> 36 atoms in block 116 Block first atom: 4552 Blocpdb> 37 atoms in block 117 Block first atom: 4588 Blocpdb> 40 atoms in block 118 Block first atom: 4625 Blocpdb> 39 atoms in block 119 Block first atom: 4665 Blocpdb> 42 atoms in block 120 Block first atom: 4704 Blocpdb> 37 atoms in block 121 Block first atom: 4746 Blocpdb> 39 atoms in block 122 Block first atom: 4783 Blocpdb> 41 atoms in block 123 Block first atom: 4822 Blocpdb> 36 atoms in block 124 Block first atom: 4863 Blocpdb> 38 atoms in block 125 Block first atom: 4899 Blocpdb> 43 atoms in block 126 Block first atom: 4937 Blocpdb> 54 atoms in block 127 Block first atom: 4980 Blocpdb> 35 atoms in block 128 Block first atom: 5034 Blocpdb> 46 atoms in block 129 Block first atom: 5069 Blocpdb> 45 atoms in block 130 Block first atom: 5115 Blocpdb> 48 atoms in block 131 Block first atom: 5160 Blocpdb> 43 atoms in block 132 Block first atom: 5208 Blocpdb> 42 atoms in block 133 Block first atom: 5251 Blocpdb> 35 atoms in block 134 Block first atom: 5293 Blocpdb> 38 atoms in block 135 Block first atom: 5328 Blocpdb> 32 atoms in block 136 Block first atom: 5366 Blocpdb> 44 atoms in block 137 Block first atom: 5398 Blocpdb> 43 atoms in block 138 Block first atom: 5442 Blocpdb> 38 atoms in block 139 Block first atom: 5485 Blocpdb> 39 atoms in block 140 Block first atom: 5523 Blocpdb> 42 atoms in block 141 Block first atom: 5562 Blocpdb> 47 atoms in block 142 Block first atom: 5604 Blocpdb> 44 atoms in block 143 Block first atom: 5651 Blocpdb> 43 atoms in block 144 Block first atom: 5695 Blocpdb> 41 atoms in block 145 Block first atom: 5738 Blocpdb> 41 atoms in block 146 Block first atom: 5779 Blocpdb> 36 atoms in block 147 Block first atom: 5820 Blocpdb> 38 atoms in block 148 Block first atom: 5856 Blocpdb> 40 atoms in block 149 Block first atom: 5894 Blocpdb> 40 atoms in block 150 Block first atom: 5934 Blocpdb> 36 atoms in block 151 Block first atom: 5974 Blocpdb> 44 atoms in block 152 Block first atom: 6010 Blocpdb> 33 atoms in block 153 Block first atom: 6054 Blocpdb> 37 atoms in block 154 Block first atom: 6087 Blocpdb> 41 atoms in block 155 Block first atom: 6124 Blocpdb> 46 atoms in block 156 Block first atom: 6165 Blocpdb> 36 atoms in block 157 Block first atom: 6211 Blocpdb> 42 atoms in block 158 Block first atom: 6247 Blocpdb> 39 atoms in block 159 Block first atom: 6289 Blocpdb> 34 atoms in block 160 Block first atom: 6328 Blocpdb> 44 atoms in block 161 Block first atom: 6362 Blocpdb> 46 atoms in block 162 Block first atom: 6406 Blocpdb> 42 atoms in block 163 Block first atom: 6452 Blocpdb> 42 atoms in block 164 Block first atom: 6494 Blocpdb> 40 atoms in block 165 Block first atom: 6536 Blocpdb> 40 atoms in block 166 Block first atom: 6576 Blocpdb> 45 atoms in block 167 Block first atom: 6616 Blocpdb> 38 atoms in block 168 Block first atom: 6661 Blocpdb> 39 atoms in block 169 Block first atom: 6699 Blocpdb> 33 atoms in block 170 Block first atom: 6738 Blocpdb> 39 atoms in block 171 Block first atom: 6771 Blocpdb> 35 atoms in block 172 Block first atom: 6809 Blocpdb> 172 blocks. Blocpdb> At most, 54 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 17 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2499666 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 20532 Prepmat> Matrix trace = 5464000.0000 Prepmat> Last element read: 20532 20532 153.1922 Prepmat> 14879 lines saved. Prepmat> 13413 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6844 RTB> Total mass = 6844.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6844 RTB> Number of blocks = 172 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 187334.3774 RTB> 50160 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1032 Diagstd> Nb of non-zero elements: 50160 Diagstd> Projected matrix trace = 187334.3774 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1032 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 187334.3774 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0707949 0.1076982 0.2508951 0.4799739 0.6688471 0.9657194 1.3483766 1.7720163 2.1921498 2.7472562 3.1906068 3.8074374 4.1857218 4.2950902 4.8559525 5.1204645 5.3802682 6.2014836 6.6789674 6.7177207 7.3470639 8.3193489 8.6282834 9.1412177 9.4942909 9.9278964 10.2907883 10.6952640 10.9790246 11.6205125 11.9140730 12.2709552 13.0792042 13.4182673 13.5011256 13.9610417 14.5186050 14.9917300 15.3173812 15.7378649 16.0335475 17.2905725 17.5176963 17.5414384 17.9481867 18.2323231 18.6614817 19.3091266 19.3477437 19.5183115 20.8055806 21.1095232 21.5741768 22.1459471 22.6775614 22.7261905 22.8722977 23.7238075 24.0354094 24.6407332 25.1920114 25.8449262 26.5414576 26.6855350 26.9233331 27.4209663 27.6973119 28.4422647 28.5243930 29.0508713 29.6750197 29.7826523 30.1961848 30.6611017 30.8145471 31.2266907 31.4806059 32.4821117 32.8958593 33.0422972 33.4135362 33.9586145 34.4342105 35.4060394 35.7881868 36.2643008 36.4721815 37.1302896 37.7016620 37.8565997 38.1951492 38.6766782 39.1723986 39.4972285 39.5963398 39.9495967 40.2600263 40.7174009 41.1805849 41.6700409 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034328 0.0034329 0.0034334 0.0034347 0.0034352 0.0034352 28.8932401 35.6368643 54.3927985 75.2322590 88.8093529 106.7138429 126.0958780 144.5536745 160.7793977 179.9885423 193.9688186 211.8905882 222.1674656 225.0512475 239.2943787 245.7253477 251.8820647 270.4226607 280.6402384 281.4532399 294.3419682 313.2131221 318.9756125 328.3199749 334.6004704 342.1557932 348.3530379 355.1330033 359.8132568 370.1757126 374.8222884 380.3947069 392.7226411 397.7805100 399.0067738 405.7459487 413.7687865 420.4565823 424.9986402 430.7925521 434.8205810 451.5438869 454.4998846 454.8077762 460.0505661 463.6777803 469.1031422 477.1738057 477.6507269 479.7515674 495.3192427 498.9241115 504.3852726 511.0253086 517.1225258 517.6766799 519.3380918 528.9169388 532.3791545 539.0413648 545.0378996 552.0557384 559.4453458 560.9617348 563.4555911 568.6390205 571.4971794 579.1317400 579.9672710 585.2950639 591.5490867 592.6209026 596.7209937 601.2971673 602.7999046 606.8177294 609.2798588 618.8956182 622.8248015 624.2095331 627.7063186 632.8055244 637.2213897 646.1509017 649.6285869 653.9355302 655.8071550 661.6974314 666.7691965 668.1378601 671.1187704 675.3359415 679.6500655 682.4621841 683.3179064 686.3592327 689.0207605 692.9235224 696.8535799 700.9826091 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6844 Rtb_to_modes> Number of blocs = 172 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.0795E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1077 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2509 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6688 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9657 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.348 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.772 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.192 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.747 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.191 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.807 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.186 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.295 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.856 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.120 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.380 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.201 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.718 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.347 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.319 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.628 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.141 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.494 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.928 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.67 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1032 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99996 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 0.99997 1.00001 0.99997 0.99997 1.00004 1.00002 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00006 1.00000 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 0.99995 0.99999 1.00005 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 123192 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99996 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 0.99997 1.00001 0.99997 0.99997 1.00004 1.00002 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00006 1.00000 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 0.99995 0.99999 1.00005 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260711185133617066.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260711185133617066.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260711185133617066.atom Openam> file on opening on unit 11: 260711185133617066.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 848 First residue number = 11 Last residue number = 324 Number of atoms found = 6844 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9937E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.0795E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1077 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2509 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6688 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9657 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.348 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.772 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.192 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.747 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.191 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.807 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.186 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.295 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.856 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.120 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.380 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.201 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.718 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.347 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.319 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.628 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.141 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.494 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.928 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.67 Bfactors> 106 vectors, 20532 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.070795 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.071 for 848 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.088 +/- 0.08 Bfactors> = 67.559 +/- 29.96 Bfactors> Shiftng-fct= 67.470 Bfactors> Scaling-fct= 383.271 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260711185133617066.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260711185133617066.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 6844 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 37 is: 0.9999 (instead of 1.0000). 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260711185133617066 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260711185133617066.eigenfacs 260711185133617066.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260711185133617066.eigenfacs 260711185133617066.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260711185133617066.eigenfacs 260711185133617066.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260711185133617066.eigenfacs 260711185133617066.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260711185133617066.eigenfacs 260711185133617066.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260711185133617066.eigenfacs 260711185133617066.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260711185133617066.eigenfacs 260711185133617066.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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