CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 260712001326660546

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260712001326660546.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260712001326660546.atom to be opened. Openam> File opened: 260712001326660546.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 415 First residue number = 77 Last residue number = 148 Number of atoms found = 3309 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 14.652611 +/- 9.677743 From: -13.998000 To: 38.759000 = -5.980073 +/- 12.969763 From: -36.289000 To: 22.361000 = -32.698972 +/- 16.361537 From: -65.918000 To: -0.083000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.5185 % Filled. Pdbmat> 1241044 non-zero elements. Pdbmat> 135705 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.02 +/- 24.43 Maximum number = 134 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 2.714100E+06 Pdbmat> Larger element = 508.963 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 415 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260712001326660546.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260712001326660546.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260712001326660546.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3309 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 415 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 30 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 28 atoms in block 3 Block first atom: 53 Blocpdb> 24 atoms in block 4 Block first atom: 81 Blocpdb> 25 atoms in block 5 Block first atom: 105 Blocpdb> 24 atoms in block 6 Block first atom: 130 Blocpdb> 23 atoms in block 7 Block first atom: 154 Blocpdb> 26 atoms in block 8 Block first atom: 177 Blocpdb> 30 atoms in block 9 Block first atom: 203 Blocpdb> 25 atoms in block 10 Block first atom: 233 Blocpdb> 20 atoms in block 11 Block first atom: 258 Blocpdb> 25 atoms in block 12 Block first atom: 278 Blocpdb> 28 atoms in block 13 Block first atom: 303 Blocpdb> 31 atoms in block 14 Block first atom: 331 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 362 Blocpdb> 27 atoms in block 16 Block first atom: 381 Blocpdb> 24 atoms in block 17 Block first atom: 408 Blocpdb> 24 atoms in block 18 Block first atom: 432 Blocpdb> 25 atoms in block 19 Block first atom: 456 Blocpdb> 20 atoms in block 20 Block first atom: 481 Blocpdb> 22 atoms in block 21 Block first atom: 501 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 523 Blocpdb> 28 atoms in block 23 Block first atom: 543 Blocpdb> 28 atoms in block 24 Block first atom: 571 Blocpdb> 25 atoms in block 25 Block first atom: 599 Blocpdb> 22 atoms in block 26 Block first atom: 624 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 646 Blocpdb> 23 atoms in block 28 Block first atom: 675 Blocpdb> 27 atoms in block 29 Block first atom: 698 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 725 Blocpdb> 24 atoms in block 31 Block first atom: 744 Blocpdb> 32 atoms in block 32 Block first atom: 768 Blocpdb> 24 atoms in block 33 Block first atom: 800 Blocpdb> 26 atoms in block 34 Block first atom: 824 Blocpdb> 27 atoms in block 35 Block first atom: 850 Blocpdb> 28 atoms in block 36 Block first atom: 877 Blocpdb> 26 atoms in block 37 Block first atom: 905 Blocpdb> 26 atoms in block 38 Block first atom: 931 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 957 Blocpdb> 27 atoms in block 40 Block first atom: 979 Blocpdb> 29 atoms in block 41 Block first atom: 1006 Blocpdb> 30 atoms in block 42 Block first atom: 1035 Blocpdb> 23 atoms in block 43 Block first atom: 1065 Blocpdb> 24 atoms in block 44 Block first atom: 1088 Blocpdb> 25 atoms in block 45 Block first atom: 1112 Blocpdb> 22 atoms in block 46 Block first atom: 1137 Blocpdb> 25 atoms in block 47 Block first atom: 1159 Blocpdb> 28 atoms in block 48 Block first atom: 1184 Blocpdb> 20 atoms in block 49 Block first atom: 1212 Blocpdb> 26 atoms in block 50 Block first atom: 1232 Blocpdb> 27 atoms in block 51 Block first atom: 1258 Blocpdb> 30 atoms in block 52 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 53 Block first atom: 1315 Blocpdb> 29 atoms in block 54 Block first atom: 1337 Blocpdb> 26 atoms in block 55 Block first atom: 1366 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 1392 Blocpdb> 29 atoms in block 57 Block first atom: 1410 Blocpdb> 21 atoms in block 58 Block first atom: 1439 Blocpdb> 27 atoms in block 59 Block first atom: 1460 Blocpdb> 23 atoms in block 60 Block first atom: 1487 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 1510 Blocpdb> 28 atoms in block 62 Block first atom: 1532 Blocpdb> 31 atoms in block 63 Block first atom: 1560 Blocpdb> 20 atoms in block 64 Block first atom: 1591 Blocpdb> 25 atoms in block 65 Block first atom: 1611 Blocpdb> 22 atoms in block 66 Block first atom: 1636 Blocpdb> 21 atoms in block 67 Block first atom: 1658 Blocpdb> 19 atoms in block 68 Block first atom: 1679 Blocpdb> 27 atoms in block 69 Block first atom: 1698 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1725 Blocpdb> 25 atoms in block 71 Block first atom: 1749 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1774 Blocpdb> 26 atoms in block 73 Block first atom: 1794 Blocpdb> 16 atoms in block 74 Block first atom: 1820 Blocpdb> 20 atoms in block 75 Block first atom: 1836 Blocpdb> 22 atoms in block 76 Block first atom: 1856 Blocpdb> 21 atoms in block 77 Block first atom: 1878 Blocpdb> 34 atoms in block 78 Block first atom: 1899 Blocpdb> 21 atoms in block 79 Block first atom: 1933 Blocpdb> 25 atoms in block 80 Block first atom: 1954 Blocpdb> 23 atoms in block 81 Block first atom: 1979 Blocpdb> 18 atoms in block 82 Block first atom: 2002 Blocpdb> 20 atoms in block 83 Block first atom: 2020 Blocpdb> 27 atoms in block 84 Block first atom: 2040 Blocpdb> 24 atoms in block 85 Block first atom: 2067 Blocpdb> 28 atoms in block 86 Block first atom: 2091 Blocpdb> 20 atoms in block 87 Block first atom: 2119 Blocpdb> 24 atoms in block 88 Block first atom: 2139 Blocpdb> 18 atoms in block 89 Block first atom: 2163 Blocpdb> 20 atoms in block 90 Block first atom: 2181 Blocpdb> 6 atoms in block 91 Block first atom: 2201 Blocpdb> 21 atoms in block 92 Block first atom: 2207 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 2228 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 2248 Blocpdb> 20 atoms in block 95 Block first atom: 2268 Blocpdb> 22 atoms in block 96 Block first atom: 2288 Blocpdb> 17 atoms in block 97 Block first atom: 2310 Blocpdb> 24 atoms in block 98 Block first atom: 2327 Blocpdb> 28 atoms in block 99 Block first atom: 2351 Blocpdb> 18 atoms in block 100 Block first atom: 2379 Blocpdb> 17 atoms in block 101 Block first atom: 2397 Blocpdb> 17 atoms in block 102 Block first atom: 2414 Blocpdb> 23 atoms in block 103 Block first atom: 2431 Blocpdb> 21 atoms in block 104 Block first atom: 2454 Blocpdb> 25 atoms in block 105 Block first atom: 2475 Blocpdb> 20 atoms in block 106 Block first atom: 2500 Blocpdb> 33 atoms in block 107 Block first atom: 2520 Blocpdb> 17 atoms in block 108 Block first atom: 2553 Blocpdb> 28 atoms in block 109 Block first atom: 2570 Blocpdb> 10 atoms in block 110 Block first atom: 2598 Blocpdb> 29 atoms in block 111 Block first atom: 2608 Blocpdb> 26 atoms in block 112 Block first atom: 2637 Blocpdb> 18 atoms in block 113 Block first atom: 2663 Blocpdb> 29 atoms in block 114 Block first atom: 2681 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 2710 Blocpdb> 21 atoms in block 116 Block first atom: 2734 Blocpdb> 13 atoms in block 117 Block first atom: 2755 Blocpdb> 24 atoms in block 118 Block first atom: 2768 Blocpdb> 28 atoms in block 119 Block first atom: 2792 Blocpdb> 25 atoms in block 120 Block first atom: 2820 Blocpdb> 29 atoms in block 121 Block first atom: 2845 Blocpdb> 25 atoms in block 122 Block first atom: 2874 Blocpdb> 16 atoms in block 123 Block first atom: 2899 Blocpdb> 26 atoms in block 124 Block first atom: 2915 Blocpdb> 19 atoms in block 125 Block first atom: 2941 Blocpdb> 29 atoms in block 126 Block first atom: 2960 Blocpdb> 22 atoms in block 127 Block first atom: 2989 Blocpdb> 20 atoms in block 128 Block first atom: 3011 Blocpdb> 26 atoms in block 129 Block first atom: 3031 Blocpdb> 20 atoms in block 130 Block first atom: 3057 Blocpdb> 24 atoms in block 131 Block first atom: 3077 Blocpdb> 25 atoms in block 132 Block first atom: 3101 Blocpdb> 25 atoms in block 133 Block first atom: 3126 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3151 Blocpdb> 16 atoms in block 135 Block first atom: 3175 Blocpdb> 24 atoms in block 136 Block first atom: 3191 Blocpdb> 30 atoms in block 137 Block first atom: 3215 Blocpdb> 27 atoms in block 138 Block first atom: 3245 Blocpdb> 23 atoms in block 139 Block first atom: 3272 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 3294 Blocpdb> 140 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1241184 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9927 Prepmat> Matrix trace = 2714100.0000 Prepmat> Last element read: 9927 9927 110.3304 Prepmat> 9871 lines saved. Prepmat> 8512 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3309 RTB> Total mass = 3309.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3309 RTB> Number of blocks = 140 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 177143.5073 RTB> 46788 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 840 Diagstd> Nb of non-zero elements: 46788 Diagstd> Projected matrix trace = 177143.5073 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 840 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 177143.5073 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.3289881 1.4237022 2.3611574 3.3919749 4.2663314 4.9193086 5.6230063 6.0422314 6.1620940 7.3024268 7.6331391 9.5518012 10.5453244 11.0092508 11.5918276 11.8041750 12.9239837 13.7366772 14.0000910 14.7692616 16.0069114 17.0076498 17.2692226 18.4064050 19.2281322 19.5288393 19.8317409 20.3853993 20.5855515 20.9073243 21.2816772 21.5499685 23.2102193 23.2456659 23.8298946 24.6435806 25.2845049 25.6200622 26.4946334 27.0308031 27.3485633 28.0216760 28.3099552 28.5382584 29.7500414 30.5019867 31.5667969 32.2053941 32.5488711 32.7819113 33.9351704 34.3226455 34.5103768 34.9855055 36.0054670 36.1260573 36.8905462 37.5776727 38.1736992 39.2274894 39.6313019 39.8164205 40.7398075 41.0581077 41.6561883 42.6001729 43.1276146 43.9405517 44.6077401 44.9910329 45.4698861 46.1633730 47.0491973 47.4979995 47.8501044 48.3860612 49.4977915 49.8066973 50.3422960 50.4616248 50.8217983 51.8506628 52.2166521 52.4721561 53.0003970 53.7014357 53.7653081 54.6013855 55.3368808 56.1153791 56.6809809 56.9120151 58.6086605 58.8754970 59.2025071 59.6450124 60.1629959 60.7148863 60.9939510 61.5483695 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034326 0.0034336 0.0034336 0.0034339 0.0034345 0.0034362 125.1860191 129.5701181 166.8621170 199.9961309 224.2965405 240.8503680 257.5013836 266.9278917 269.5624782 293.4464680 300.0176935 335.6123372 352.6348681 360.3082137 369.7185470 373.0895627 390.3853224 402.4724216 406.3129917 417.3252585 434.4592521 447.8343823 451.2650240 465.8861147 476.1719733 479.8809346 483.5882058 490.2920956 492.6931602 496.5288733 500.9544118 504.1022081 523.1604475 523.5597790 530.0982135 539.0725093 546.0375478 549.6489086 558.9516437 564.5790452 567.8877996 574.8338498 577.7831483 580.1082114 592.2963654 599.7349296 610.1133643 616.2537698 619.5312896 621.7451635 632.5870510 636.1882706 637.9257466 642.3021220 651.5976421 652.6879029 659.5577430 665.6718933 670.9302972 680.1278159 683.6195119 685.2142520 693.1141525 695.8165357 700.8660839 708.7628750 713.1370487 719.8268353 725.2711311 728.3804192 732.2463463 737.8091673 744.8544035 748.3985534 751.1673889 755.3624912 763.9909102 766.3711587 770.4807449 771.3933585 774.1414016 781.9382113 784.6930243 786.6104927 790.5600096 795.7712208 796.2443244 802.4114402 807.7977109 813.4600533 817.5493150 819.2138045 831.3352161 833.2255401 835.5363132 838.6530814 842.2868246 846.1412611 848.0835969 851.9293027 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3309 Rtb_to_modes> Number of blocs = 140 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9923E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.329 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.424 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.361 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.266 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.919 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.623 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.042 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.162 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.302 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.633 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.552 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.55 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 840 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00004 1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99995 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99996 0.99998 0.99999 1.00004 0.99997 0.99999 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 0.99997 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 59562 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00004 1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99995 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99996 0.99998 0.99999 1.00004 0.99997 0.99999 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 0.99997 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260712001326660546.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260712001326660546.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260712001326660546.atom Openam> file on opening on unit 11: 260712001326660546.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 415 First residue number = 77 Last residue number = 148 Number of atoms found = 3309 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9923E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.329 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.424 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.361 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.266 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.919 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.623 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.042 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.162 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.302 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.633 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.552 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.55 Bfactors> 106 vectors, 9927 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.329000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.573 for 415 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.030 +/- 0.04 Bfactors> = 36.436 +/- 14.97 Bfactors> Shiftng-fct= 36.406 Bfactors> Scaling-fct= 349.483 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260712001326660546.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260712001326660546.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.9 Chkmod> 106 vectors, 9927 coordinates in file. Chkmod> That is: 3309 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7488 0.0034 0.6671 0.0034 0.7437 0.0034 0.9652 0.0034 0.8922 0.0034 0.8286 125.1812 0.5557 129.5781 0.6174 166.8494 0.6043 199.9883 0.4386 224.2782 0.1680 240.8325 0.3022 257.4902 0.4819 266.9113 0.1584 269.5489 0.4190 293.4253 0.3433 300.0021 0.5436 335.6014 0.4350 352.6979 0.4468 360.3050 0.3833 369.6735 0.2973 373.0076 0.3888 390.3084 0.4295 402.5038 0.4557 406.2942 0.3837 417.3178 0.2747 434.4825 0.3451 447.8461 0.3398 451.2558 0.2597 465.9116 0.2628 476.1747 0.3148 479.8746 0.4210 483.5462 0.3021 490.3264 0.1999 492.7252 0.1626 496.5393 0.1717 500.9132 0.2767 504.0809 0.2662 523.1355 0.3473 523.5861 0.3918 530.0766 0.2302 539.0102 0.2312 545.9655 0.1683 549.6246 0.2251 558.8788 0.4475 564.5464 0.3167 567.8783 0.3767 574.7920 0.1975 577.7588 0.4228 580.1010 0.3897 592.2705 0.4199 599.6897 0.4561 610.1181 0.3536 616.2714 0.2792 619.5154 0.3514 621.7003 0.4745 632.6049 0.2712 636.1364 0.3370 637.8949 0.3771 642.3158 0.4267 651.6107 0.2821 652.6955 0.4249 659.5245 0.3199 665.6639 0.3360 670.8690 0.2595 680.1204 0.3936 683.5789 0.3592 685.2156 0.1828 693.0860 0.3732 695.8027 0.3146 700.8681 0.4029 708.7310 0.4174 713.1262 0.3556 719.7914 0.3727 725.2584 0.2736 728.3408 0.3581 732.2158 0.4108 737.7505 0.3736 744.8288 0.4117 748.3822 0.3693 751.1343 0.3357 755.3608 0.4624 763.9752 0.3429 766.3637 0.4189 770.4301 0.1642 771.3478 0.4302 774.0945 0.2547 781.8996 0.4571 784.6845 0.4200 786.5606 0.4597 790.5231 0.2334 795.7264 0.4367 796.2449 0.3962 802.3668 0.4344 807.7858 0.4252 813.4586 0.4292 817.5071 0.3485 819.1641 0.3977 831.3090 0.4053 833.2216 0.3703 835.4828 0.3217 838.6521 0.4115 842.2297 0.4637 846.0709 0.3591 848.0197 0.4858 851.9040 0.4040 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 260712001326660546 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom making animated gifs 11 models are in 260712001326660546.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712001326660546.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712001326660546.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260712001326660546 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom making animated gifs 11 models are in 260712001326660546.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712001326660546.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712001326660546.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 260712001326660546 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom making animated gifs 11 models are in 260712001326660546.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712001326660546.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712001326660546.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260712001326660546 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom making animated gifs 11 models are in 260712001326660546.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712001326660546.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712001326660546.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 260712001326660546 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260712001326660546.eigenfacs 260712001326660546.atom making animated gifs 11 models are in 260712001326660546.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712001326660546.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712001326660546.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260712001326660546.10.pdb 260712001326660546.11.pdb 260712001326660546.7.pdb 260712001326660546.8.pdb 260712001326660546.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m10.293s user 0m10.225s sys 0m0.063s rm: cannot remove '260712001326660546.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.