CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 260712013124675673

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260712013124675673.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260712013124675673.atom to be opened. Openam> File opened: 260712013124675673.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1362 First residue number = 4 Last residue number = 1391 Number of atoms found = 17251 Mean number per residue = 12.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 144.882306 +/- 18.654242 From: 104.811000 To: 195.644000 = 153.317939 +/- 18.395208 From: 108.408000 To: 200.047000 = 151.332281 +/- 18.654714 From: 105.276000 To: 203.501000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -1.3663 % Filled. Pdbmat> 11043773 non-zero elements. Pdbmat> 1215793 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 140.95 +/- 33.25 Maximum number = 219 Minimum number = 29 Pdbmat> Matrix trace = 2.431586E+07 Pdbmat> Larger element = 803.779 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1362 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260712013124675673.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260712013124675673.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260712013124675673.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 17251 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1362 residues. Blocpdb> 94 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 81 atoms in block 2 Block first atom: 95 Blocpdb> 79 atoms in block 3 Block first atom: 176 Blocpdb> 76 atoms in block 4 Block first atom: 255 Blocpdb> 93 atoms in block 5 Block first atom: 331 Blocpdb> 92 atoms in block 6 Block first atom: 424 Blocpdb> 104 atoms in block 7 Block first atom: 516 Blocpdb> 92 atoms in block 8 Block first atom: 620 Blocpdb> 91 atoms in block 9 Block first atom: 712 Blocpdb> 76 atoms in block 10 Block first atom: 803 Blocpdb> 85 atoms in block 11 Block first atom: 879 Blocpdb> 79 atoms in block 12 Block first atom: 964 Blocpdb> 80 atoms in block 13 Block first atom: 1043 Blocpdb> 95 atoms in block 14 Block first atom: 1123 Blocpdb> 99 atoms in block 15 Block first atom: 1218 Blocpdb> 95 atoms in block 16 Block first atom: 1317 Blocpdb> 97 atoms in block 17 Block first atom: 1412 Blocpdb> 78 atoms in block 18 Block first atom: 1509 Blocpdb> 100 atoms in block 19 Block first atom: 1587 Blocpdb> 73 atoms in block 20 Block first atom: 1687 Blocpdb> 106 atoms in block 21 Block first atom: 1760 Blocpdb> 106 atoms in block 22 Block first atom: 1866 Blocpdb> 92 atoms in block 23 Block first atom: 1972 Blocpdb> 82 atoms in block 24 Block first atom: 2064 Blocpdb> 101 atoms in block 25 Block first atom: 2146 Blocpdb> 83 atoms in block 26 Block first atom: 2247 Blocpdb> 107 atoms in block 27 Block first atom: 2330 Blocpdb> 78 atoms in block 28 Block first atom: 2437 Blocpdb> 75 atoms in block 29 Block first atom: 2515 Blocpdb> 104 atoms in block 30 Block first atom: 2590 Blocpdb> 94 atoms in block 31 Block first atom: 2694 Blocpdb> 81 atoms in block 32 Block first atom: 2788 Blocpdb> 72 atoms in block 33 Block first atom: 2869 Blocpdb> 87 atoms in block 34 Block first atom: 2941 Blocpdb> 91 atoms in block 35 Block first atom: 3028 Blocpdb> 84 atoms in block 36 Block first atom: 3119 Blocpdb> 79 atoms in block 37 Block first atom: 3203 Blocpdb> 83 atoms in block 38 Block first atom: 3282 Blocpdb> 95 atoms in block 39 Block first atom: 3365 Blocpdb> 92 atoms in block 40 Block first atom: 3460 Blocpdb> 72 atoms in block 41 Block first atom: 3552 Blocpdb> 103 atoms in block 42 Block first atom: 3624 Blocpdb> 80 atoms in block 43 Block first atom: 3727 Blocpdb> 92 atoms in block 44 Block first atom: 3807 Blocpdb> 102 atoms in block 45 Block first atom: 3899 Blocpdb> 97 atoms in block 46 Block first atom: 4001 Blocpdb> 82 atoms in block 47 Block first atom: 4098 Blocpdb> 86 atoms in block 48 Block first atom: 4180 Blocpdb> 89 atoms in block 49 Block first atom: 4266 Blocpdb> 110 atoms in block 50 Block first atom: 4355 Blocpdb> 91 atoms in block 51 Block first atom: 4465 Blocpdb> 83 atoms in block 52 Block first atom: 4556 Blocpdb> 98 atoms in block 53 Block first atom: 4639 Blocpdb> 93 atoms in block 54 Block first atom: 4737 Blocpdb> 86 atoms in block 55 Block first atom: 4830 Blocpdb> 92 atoms in block 56 Block first atom: 4916 Blocpdb> 91 atoms in block 57 Block first atom: 5008 Blocpdb> 94 atoms in block 58 Block first atom: 5099 Blocpdb> 98 atoms in block 59 Block first atom: 5193 Blocpdb> 106 atoms in block 60 Block first atom: 5291 Blocpdb> 90 atoms in block 61 Block first atom: 5397 Blocpdb> 83 atoms in block 62 Block first atom: 5487 Blocpdb> 88 atoms in block 63 Block first atom: 5570 Blocpdb> 94 atoms in block 64 Block first atom: 5658 Blocpdb> 92 atoms in block 65 Block first atom: 5752 Blocpdb> 113 atoms in block 66 Block first atom: 5844 Blocpdb> 90 atoms in block 67 Block first atom: 5957 Blocpdb> 83 atoms in block 68 Block first atom: 6047 Blocpdb> 97 atoms in block 69 Block first atom: 6130 Blocpdb> 82 atoms in block 70 Block first atom: 6227 Blocpdb> 97 atoms in block 71 Block first atom: 6309 Blocpdb> 81 atoms in block 72 Block first atom: 6406 Blocpdb> 102 atoms in block 73 Block first atom: 6487 Blocpdb> 95 atoms in block 74 Block first atom: 6589 Blocpdb> 90 atoms in block 75 Block first atom: 6684 Blocpdb> 86 atoms in block 76 Block first atom: 6774 Blocpdb> 100 atoms in block 77 Block first atom: 6860 Blocpdb> 101 atoms in block 78 Block first atom: 6960 Blocpdb> 103 atoms in block 79 Block first atom: 7061 Blocpdb> 86 atoms in block 80 Block first atom: 7164 Blocpdb> 89 atoms in block 81 Block first atom: 7250 Blocpdb> 84 atoms in block 82 Block first atom: 7339 Blocpdb> 74 atoms in block 83 Block first atom: 7423 Blocpdb> 90 atoms in block 84 Block first atom: 7497 Blocpdb> 85 atoms in block 85 Block first atom: 7587 Blocpdb> 95 atoms in block 86 Block first atom: 7672 Blocpdb> 99 atoms in block 87 Block first atom: 7767 Blocpdb> 74 atoms in block 88 Block first atom: 7866 Blocpdb> 94 atoms in block 89 Block first atom: 7940 Blocpdb> 109 atoms in block 90 Block first atom: 8034 Blocpdb> 94 atoms in block 91 Block first atom: 8143 Blocpdb> 101 atoms in block 92 Block first atom: 8237 Blocpdb> 85 atoms in block 93 Block first atom: 8338 Blocpdb> 106 atoms in block 94 Block first atom: 8423 Blocpdb> 94 atoms in block 95 Block first atom: 8529 Blocpdb> 99 atoms in block 96 Block first atom: 8623 Blocpdb> 87 atoms in block 97 Block first atom: 8722 Blocpdb> 74 atoms in block 98 Block first atom: 8809 Blocpdb> 93 atoms in block 99 Block first atom: 8883 Blocpdb> 67 atoms in block 100 Block first atom: 8976 Blocpdb> 98 atoms in block 101 Block first atom: 9043 Blocpdb> 76 atoms in block 102 Block first atom: 9141 Blocpdb> 88 atoms in block 103 Block first atom: 9217 Blocpdb> 92 atoms in block 104 Block first atom: 9305 Blocpdb> 73 atoms in block 105 Block first atom: 9397 Blocpdb> 84 atoms in block 106 Block first atom: 9470 Blocpdb> 82 atoms in block 107 Block first atom: 9554 Blocpdb> 81 atoms in block 108 Block first atom: 9636 Blocpdb> 77 atoms in block 109 Block first atom: 9717 Blocpdb> 81 atoms in block 110 Block first atom: 9794 Blocpdb> 87 atoms in block 111 Block first atom: 9875 Blocpdb> 89 atoms in block 112 Block first atom: 9962 Blocpdb> 99 atoms in block 113 Block first atom: 10051 Blocpdb> 90 atoms in block 114 Block first atom: 10150 Blocpdb> 89 atoms in block 115 Block first atom: 10240 Blocpdb> 85 atoms in block 116 Block first atom: 10329 Blocpdb> 84 atoms in block 117 Block first atom: 10414 Blocpdb> 75 atoms in block 118 Block first atom: 10498 Blocpdb> 80 atoms in block 119 Block first atom: 10573 Blocpdb> 89 atoms in block 120 Block first atom: 10653 Blocpdb> 95 atoms in block 121 Block first atom: 10742 Blocpdb> 95 atoms in block 122 Block first atom: 10837 Blocpdb> 92 atoms in block 123 Block first atom: 10932 Blocpdb> 98 atoms in block 124 Block first atom: 11024 Blocpdb> 85 atoms in block 125 Block first atom: 11122 Blocpdb> 82 atoms in block 126 Block first atom: 11207 Blocpdb> 80 atoms in block 127 Block first atom: 11289 Blocpdb> 76 atoms in block 128 Block first atom: 11369 Blocpdb> 77 atoms in block 129 Block first atom: 11445 Blocpdb> 102 atoms in block 130 Block first atom: 11522 Blocpdb> 78 atoms in block 131 Block first atom: 11624 Blocpdb> 83 atoms in block 132 Block first atom: 11702 Blocpdb> 104 atoms in block 133 Block first atom: 11785 Blocpdb> 93 atoms in block 134 Block first atom: 11889 Blocpdb> 84 atoms in block 135 Block first atom: 11982 Blocpdb> 70 atoms in block 136 Block first atom: 12066 Blocpdb> 79 atoms in block 137 Block first atom: 12136 Blocpdb> 73 atoms in block 138 Block first atom: 12215 Blocpdb> 92 atoms in block 139 Block first atom: 12288 Blocpdb> 90 atoms in block 140 Block first atom: 12380 Blocpdb> 90 atoms in block 141 Block first atom: 12470 Blocpdb> 91 atoms in block 142 Block first atom: 12560 Blocpdb> 84 atoms in block 143 Block first atom: 12651 Blocpdb> 101 atoms in block 144 Block first atom: 12735 Blocpdb> 79 atoms in block 145 Block first atom: 12836 Blocpdb> 88 atoms in block 146 Block first atom: 12915 Blocpdb> 84 atoms in block 147 Block first atom: 13003 Blocpdb> 89 atoms in block 148 Block first atom: 13087 Blocpdb> 90 atoms in block 149 Block first atom: 13176 Blocpdb> 84 atoms in block 150 Block first atom: 13266 Blocpdb> 79 atoms in block 151 Block first atom: 13350 Blocpdb> 97 atoms in block 152 Block first atom: 13429 Blocpdb> 97 atoms in block 153 Block first atom: 13526 Blocpdb> 107 atoms in block 154 Block first atom: 13623 Blocpdb> 81 atoms in block 155 Block first atom: 13730 Blocpdb> 81 atoms in block 156 Block first atom: 13811 Blocpdb> 77 atoms in block 157 Block first atom: 13892 Blocpdb> 106 atoms in block 158 Block first atom: 13969 Blocpdb> 84 atoms in block 159 Block first atom: 14075 Blocpdb> 73 atoms in block 160 Block first atom: 14159 Blocpdb> 92 atoms in block 161 Block first atom: 14232 Blocpdb> 102 atoms in block 162 Block first atom: 14324 Blocpdb> 89 atoms in block 163 Block first atom: 14426 Blocpdb> 79 atoms in block 164 Block first atom: 14515 Blocpdb> 84 atoms in block 165 Block first atom: 14594 Blocpdb> 92 atoms in block 166 Block first atom: 14678 Blocpdb> 85 atoms in block 167 Block first atom: 14770 Blocpdb> 89 atoms in block 168 Block first atom: 14855 Blocpdb> 39 atoms in block 169 Block first atom: 14944 Blocpdb> 80 atoms in block 170 Block first atom: 14983 Blocpdb> 81 atoms in block 171 Block first atom: 15063 Blocpdb> 86 atoms in block 172 Block first atom: 15144 Blocpdb> 94 atoms in block 173 Block first atom: 15230 Blocpdb> 71 atoms in block 174 Block first atom: 15324 Blocpdb> 95 atoms in block 175 Block first atom: 15395 Blocpdb> 83 atoms in block 176 Block first atom: 15490 Blocpdb> 87 atoms in block 177 Block first atom: 15573 Blocpdb> 84 atoms in block 178 Block first atom: 15660 Blocpdb> 95 atoms in block 179 Block first atom: 15744 Blocpdb> 90 atoms in block 180 Block first atom: 15839 Blocpdb> 97 atoms in block 181 Block first atom: 15929 Blocpdb> 82 atoms in block 182 Block first atom: 16026 Blocpdb> 71 atoms in block 183 Block first atom: 16108 Blocpdb> 42 atoms in block 184 Block first atom: 16179 Blocpdb> 86 atoms in block 185 Block first atom: 16221 Blocpdb> 83 atoms in block 186 Block first atom: 16307 Blocpdb> 100 atoms in block 187 Block first atom: 16390 Blocpdb> 84 atoms in block 188 Block first atom: 16490 Blocpdb> 98 atoms in block 189 Block first atom: 16574 Blocpdb> 88 atoms in block 190 Block first atom: 16672 Blocpdb> 85 atoms in block 191 Block first atom: 16760 Blocpdb> 95 atoms in block 192 Block first atom: 16845 Blocpdb> 86 atoms in block 193 Block first atom: 16940 Blocpdb> 97 atoms in block 194 Block first atom: 17026 Blocpdb> 94 atoms in block 195 Block first atom: 17123 Blocpdb> 35 atoms in block 196 Block first atom: 17216 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 113 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 35 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 11043969 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 51753 Prepmat> Matrix trace = 24315860.0001 Prepmat> Last element read: 51753 51753 282.8558 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 17397 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 17251 RTB> Total mass = 17251.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 17251 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 363990.7006 RTB> 65784 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 65784 Diagstd> Projected matrix trace = 363990.7006 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 363990.7006 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 3.6537013 4.3185545 6.0888012 6.4673802 7.2376743 7.8313532 8.4304455 9.6884924 10.2654758 10.7249564 12.0084396 12.5356753 13.3047800 14.6903698 15.5706567 16.5601314 17.5273668 18.3407537 18.9197223 20.6733702 21.1453472 21.9145688 22.7469761 23.8154505 24.6350234 25.3178099 25.9408774 26.4559901 27.8255454 28.0668524 28.9705329 29.5218579 29.7979930 31.4509753 32.7547757 33.5735809 35.1294850 35.4911834 36.6684628 37.2559388 38.1419924 38.8308729 40.0481302 40.7316984 41.4119384 42.5575546 43.3493655 43.8827224 44.4772303 44.9826080 46.1065092 47.6647947 48.5540991 48.7964624 49.9250636 51.6511311 52.2768947 53.2034839 54.8027940 55.1308475 55.3782648 55.9626181 57.1127936 58.1577432 58.2871354 58.8006290 60.3138371 61.1372328 61.6582044 62.4452771 63.2564107 63.6386981 64.8230612 66.0071802 66.8676885 67.2309378 68.5026022 69.0950591 70.1623140 71.5586226 71.6807538 72.5070740 72.7457365 73.9079611 74.5872293 75.4668570 75.9071599 77.0908833 77.4060466 77.9764323 78.6681376 79.4833326 80.3411284 80.9838021 81.4040874 81.9037861 83.2248783 83.9315152 84.1222803 84.4719247 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034312 0.0034315 0.0034319 0.0034326 0.0034337 0.0034342 207.5686677 225.6651443 267.9545750 276.1591752 292.1425387 303.8880946 315.2975122 338.0051997 347.9243481 355.6256265 376.3037695 384.4759231 396.0947893 416.2091705 428.4979468 441.9032229 454.6253175 465.0545198 472.3377529 493.7429659 499.3472827 508.3487327 517.9133619 529.9375346 538.9789076 546.3970518 553.0795625 558.5438701 572.8186155 575.2970350 584.4852050 590.0205299 592.7735098 608.9930539 621.4877825 629.2078217 643.6224316 646.9273624 657.5694566 662.8160803 670.6516043 676.6808046 687.2051449 693.0451680 698.8083083 708.4082543 714.9680794 719.3530036 724.2093837 728.3122182 737.3546130 749.7114498 756.6729875 758.5591461 767.2812643 780.4322336 785.1455456 792.0731949 803.8900077 806.2924901 808.0997122 812.3520717 820.6575738 828.1310210 829.0517423 832.6955928 843.3420582 849.0791355 852.6891107 858.1141805 863.6694406 866.2752838 874.2991343 882.2483819 887.9805138 890.3891619 898.7705118 902.6487326 909.5932572 918.5996305 919.3831971 924.6672376 926.1877934 933.5571105 937.8373345 943.3512121 946.0991480 953.4475151 955.3944712 958.9080412 963.1517421 968.1291889 973.3392663 977.2245333 979.7570253 982.7595418 990.6536969 994.8504758 995.9804148 998.0481070 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 17251 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9839E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9858E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9882E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.319 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.089 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.467 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.238 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.831 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.430 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.688 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.47 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 310518 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260712013124675673.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260712013124675673.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260712013124675673.atom Openam> file on opening on unit 11: 260712013124675673.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1362 First residue number = 4 Last residue number = 1391 Number of atoms found = 17251 Mean number per residue = 12.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9839E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9858E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9882E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9919E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.319 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.089 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.467 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.238 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.831 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.430 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.688 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.47 Bfactors> 106 vectors, 51753 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.654000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.027 for 1362 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.003 +/- 0.00 Bfactors> = 5.530 +/- 11.67 Bfactors> Shiftng-fct= 5.527 Bfactors> Scaling-fct= 4050.159 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260712013124675673.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260712013124675673.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 995.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.0 Chkmod> 106 vectors, 51753 coordinates in file. Chkmod> That is: 17251 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8291 0.0034 0.6939 0.0034 0.9244 0.0034 0.7611 0.0034 0.8161 0.0034 0.8109 207.5682 0.4606 225.6671 0.4961 267.9474 0.4588 276.1392 0.6823 292.1366 0.3108 303.8682 0.7516 315.2756 0.3937 337.9821 0.6589 347.9861 0.7541 355.5282 0.7251 376.3121 0.7048 384.5257 0.4348 396.0066 0.6490 416.1861 0.6231 428.4705 0.5368 441.8825 0.3835 454.6399 0.4858 465.0250 0.5693 472.3209 0.5837 493.6815 0.5326 499.3808 0.5517 508.2739 0.5984 517.9256 0.5754 529.9654 0.4618 539.0102 0.6616 546.3972 0.6437 553.0465 0.6144 558.5622 0.6606 572.8399 0.4483 575.3046 0.5515 584.4547 0.6122 589.9766 0.4666 592.7680 0.5042 608.9575 0.4538 621.4158 0.5465 629.1473 0.6001 643.5995 0.4350 646.8888 0.5760 657.5550 0.4828 662.8238 0.5172 670.6053 0.5982 676.6442 0.3738 687.1917 0.6225 693.0010 0.5653 698.7620 0.5567 708.3982 0.5327 714.9426 0.5378 719.2998 0.4223 724.2008 0.4928 728.2598 0.4749 737.3509 0.4091 749.6416 0.5478 756.6086 0.6043 758.5541 0.4826 767.2863 0.4391 780.3902 0.5351 785.1352 0.5567 792.0133 0.5188 803.8350 0.5378 806.2517 0.5081 808.0777 0.4636 812.2982 0.5288 820.6023 0.5040 828.1115 0.5329 829.0365 0.6225 832.6554 0.2784 843.2790 0.4465 849.0619 0.4169 852.6649 0.5369 858.1098 0.4458 863.6569 0.4551 866.2470 0.5287 874.2410 0.5261 882.2294 0.4752 887.9577 0.6225 890.3447 0.4331 898.7149 0.5689 902.6423 0.4653 909.5392 0.6149 918.5690 0.5443 919.3389 0.5555 924.6462 0.4990 926.1752 0.4950 933.5299 0.4911 937.8145 0.5329 943.3304 0.4624 946.0762 0.5498 953.4011 0.4236 955.3779 0.3281 958.8888 0.5819 963.1218 0.5501 968.0673 0.5719 973.2906 0.4435 977.1596 0.5542 979.6904 0.5449 982.6946 0.4836 990.5821 0.5826 994.7988 0.3360 995.9242 0.5936 997.9939 0.5867 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 260712013124675673 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom making animated gifs 11 models are in 260712013124675673.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712013124675673.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712013124675673.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260712013124675673 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom making animated gifs 11 models are in 260712013124675673.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712013124675673.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712013124675673.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 260712013124675673 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom making animated gifs 11 models are in 260712013124675673.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712013124675673.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712013124675673.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260712013124675673 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom making animated gifs 11 models are in 260712013124675673.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712013124675673.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712013124675673.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 260712013124675673 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260712013124675673.eigenfacs 260712013124675673.atom making animated gifs 11 models are in 260712013124675673.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712013124675673.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260712013124675673.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260712013124675673.10.pdb 260712013124675673.11.pdb 260712013124675673.7.pdb 260712013124675673.8.pdb 260712013124675673.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 2m19.720s user 2m18.874s sys 0m0.788s rm: cannot remove '260712013124675673.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.