*** ITD ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607150529311443284.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607150529311443284.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607150529311443284.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1000
First residue number = 1
Last residue number = 1000
Number of atoms found = 8004
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.184590 +/- 24.123275 From: -53.147000 To: 76.807000
= 0.759298 +/- 24.750309 From: -64.511000 To: 56.243000
= -0.561080 +/- 19.318799 From: -50.959000 To: 40.433000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.8921 % Filled.
Pdbmat> 2571971 non-zero elements.
Pdbmat> 280483 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 70.09 +/- 25.74
Maximum number = 132
Minimum number = 7
Pdbmat> Matrix trace = 5.609660E+06
Pdbmat> Larger element = 522.225
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1000 non-zero elements, NRBL set to 6
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607150529311443284.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 6
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607150529311443284.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607150529311443284.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 8004 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 6 residue(s) per block.
Blocpdb> 1000 residues.
Blocpdb> 44 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 40 atoms in block 2
Block first atom: 45
Blocpdb> 47 atoms in block 3
Block first atom: 85
Blocpdb> 43 atoms in block 4
Block first atom: 132
Blocpdb> 48 atoms in block 5
Block first atom: 175
Blocpdb> 44 atoms in block 6
Block first atom: 223
Blocpdb> 51 atoms in block 7
Block first atom: 267
Blocpdb> 39 atoms in block 8
Block first atom: 318
Blocpdb> 46 atoms in block 9
Block first atom: 357
Blocpdb> 43 atoms in block 10
Block first atom: 403
Blocpdb> 40 atoms in block 11
Block first atom: 446
Blocpdb> 47 atoms in block 12
Block first atom: 486
Blocpdb> 44 atoms in block 13
Block first atom: 533
Blocpdb> 41 atoms in block 14
Block first atom: 577
Blocpdb> 39 atoms in block 15
Block first atom: 618
Blocpdb> 47 atoms in block 16
Block first atom: 657
Blocpdb> 38 atoms in block 17
Block first atom: 704
Blocpdb> 55 atoms in block 18
Block first atom: 742
Blocpdb> 44 atoms in block 19
Block first atom: 797
Blocpdb> 53 atoms in block 20
Block first atom: 841
Blocpdb> 46 atoms in block 21
Block first atom: 894
Blocpdb> 46 atoms in block 22
Block first atom: 940
Blocpdb> 45 atoms in block 23
Block first atom: 986
Blocpdb> 52 atoms in block 24
Block first atom: 1031
Blocpdb> 44 atoms in block 25
Block first atom: 1083
Blocpdb> 54 atoms in block 26
Block first atom: 1127
Blocpdb> 47 atoms in block 27
Block first atom: 1181
Blocpdb> 50 atoms in block 28
Block first atom: 1228
Blocpdb> 63 atoms in block 29
Block first atom: 1278
Blocpdb> 51 atoms in block 30
Block first atom: 1341
Blocpdb> 40 atoms in block 31
Block first atom: 1392
Blocpdb> 45 atoms in block 32
Block first atom: 1432
Blocpdb> 53 atoms in block 33
Block first atom: 1477
Blocpdb> 42 atoms in block 34
Block first atom: 1530
Blocpdb> 45 atoms in block 35
Block first atom: 1572
Blocpdb> 44 atoms in block 36
Block first atom: 1617
Blocpdb> 52 atoms in block 37
Block first atom: 1661
Blocpdb> 47 atoms in block 38
Block first atom: 1713
Blocpdb> 47 atoms in block 39
Block first atom: 1760
Blocpdb> 49 atoms in block 40
Block first atom: 1807
Blocpdb> 50 atoms in block 41
Block first atom: 1856
Blocpdb> 48 atoms in block 42
Block first atom: 1906
Blocpdb> 45 atoms in block 43
Block first atom: 1954
Blocpdb> 52 atoms in block 44
Block first atom: 1999
Blocpdb> 50 atoms in block 45
Block first atom: 2051
Blocpdb> 48 atoms in block 46
Block first atom: 2101
Blocpdb> 44 atoms in block 47
Block first atom: 2149
Blocpdb> 55 atoms in block 48
Block first atom: 2193
Blocpdb> 48 atoms in block 49
Block first atom: 2248
Blocpdb> 52 atoms in block 50
Block first atom: 2296
Blocpdb> 46 atoms in block 51
Block first atom: 2348
Blocpdb> 53 atoms in block 52
Block first atom: 2394
Blocpdb> 48 atoms in block 53
Block first atom: 2447
Blocpdb> 45 atoms in block 54
Block first atom: 2495
Blocpdb> 48 atoms in block 55
Block first atom: 2540
Blocpdb> 44 atoms in block 56
Block first atom: 2588
Blocpdb> 41 atoms in block 57
Block first atom: 2632
Blocpdb> 44 atoms in block 58
Block first atom: 2673
Blocpdb> 47 atoms in block 59
Block first atom: 2717
Blocpdb> 50 atoms in block 60
Block first atom: 2764
Blocpdb> 55 atoms in block 61
Block first atom: 2814
Blocpdb> 52 atoms in block 62
Block first atom: 2869
Blocpdb> 53 atoms in block 63
Block first atom: 2921
Blocpdb> 53 atoms in block 64
Block first atom: 2974
Blocpdb> 54 atoms in block 65
Block first atom: 3027
Blocpdb> 44 atoms in block 66
Block first atom: 3081
Blocpdb> 46 atoms in block 67
Block first atom: 3125
Blocpdb> 48 atoms in block 68
Block first atom: 3171
Blocpdb> 49 atoms in block 69
Block first atom: 3219
Blocpdb> 55 atoms in block 70
Block first atom: 3268
Blocpdb> 47 atoms in block 71
Block first atom: 3323
Blocpdb> 53 atoms in block 72
Block first atom: 3370
Blocpdb> 55 atoms in block 73
Block first atom: 3423
Blocpdb> 45 atoms in block 74
Block first atom: 3478
Blocpdb> 36 atoms in block 75
Block first atom: 3523
Blocpdb> 41 atoms in block 76
Block first atom: 3559
Blocpdb> 54 atoms in block 77
Block first atom: 3600
Blocpdb> 51 atoms in block 78
Block first atom: 3654
Blocpdb> 44 atoms in block 79
Block first atom: 3705
Blocpdb> 49 atoms in block 80
Block first atom: 3749
Blocpdb> 53 atoms in block 81
Block first atom: 3798
Blocpdb> 51 atoms in block 82
Block first atom: 3851
Blocpdb> 46 atoms in block 83
Block first atom: 3902
Blocpdb> 43 atoms in block 84
Block first atom: 3948
Blocpdb> 46 atoms in block 85
Block first atom: 3991
Blocpdb> 41 atoms in block 86
Block first atom: 4037
Blocpdb> 45 atoms in block 87
Block first atom: 4078
Blocpdb> 44 atoms in block 88
Block first atom: 4123
Blocpdb> 40 atoms in block 89
Block first atom: 4167
Blocpdb> 54 atoms in block 90
Block first atom: 4207
Blocpdb> 50 atoms in block 91
Block first atom: 4261
Blocpdb> 40 atoms in block 92
Block first atom: 4311
Blocpdb> 49 atoms in block 93
Block first atom: 4351
Blocpdb> 47 atoms in block 94
Block first atom: 4400
Blocpdb> 59 atoms in block 95
Block first atom: 4447
Blocpdb> 55 atoms in block 96
Block first atom: 4506
Blocpdb> 47 atoms in block 97
Block first atom: 4561
Blocpdb> 41 atoms in block 98
Block first atom: 4608
Blocpdb> 61 atoms in block 99
Block first atom: 4649
Blocpdb> 61 atoms in block 100
Block first atom: 4710
Blocpdb> 61 atoms in block 101
Block first atom: 4771
Blocpdb> 59 atoms in block 102
Block first atom: 4832
Blocpdb> 52 atoms in block 103
Block first atom: 4891
Blocpdb> 43 atoms in block 104
Block first atom: 4943
Blocpdb> 39 atoms in block 105
Block first atom: 4986
Blocpdb> 40 atoms in block 106
Block first atom: 5025
Blocpdb> 46 atoms in block 107
Block first atom: 5065
Blocpdb> 41 atoms in block 108
Block first atom: 5111
Blocpdb> 46 atoms in block 109
Block first atom: 5152
Blocpdb> 43 atoms in block 110
Block first atom: 5198
Blocpdb> 50 atoms in block 111
Block first atom: 5241
Blocpdb> 48 atoms in block 112
Block first atom: 5291
Blocpdb> 44 atoms in block 113
Block first atom: 5339
Blocpdb> 48 atoms in block 114
Block first atom: 5383
Blocpdb> 38 atoms in block 115
Block first atom: 5431
Blocpdb> 45 atoms in block 116
Block first atom: 5469
Blocpdb> 52 atoms in block 117
Block first atom: 5514
Blocpdb> 48 atoms in block 118
Block first atom: 5566
Blocpdb> 57 atoms in block 119
Block first atom: 5614
Blocpdb> 57 atoms in block 120
Block first atom: 5671
Blocpdb> 58 atoms in block 121
Block first atom: 5728
Blocpdb> 55 atoms in block 122
Block first atom: 5786
Blocpdb> 52 atoms in block 123
Block first atom: 5841
Blocpdb> 45 atoms in block 124
Block first atom: 5893
Blocpdb> 44 atoms in block 125
Block first atom: 5938
Blocpdb> 48 atoms in block 126
Block first atom: 5982
Blocpdb> 43 atoms in block 127
Block first atom: 6030
Blocpdb> 49 atoms in block 128
Block first atom: 6073
Blocpdb> 49 atoms in block 129
Block first atom: 6122
Blocpdb> 58 atoms in block 130
Block first atom: 6171
Blocpdb> 52 atoms in block 131
Block first atom: 6229
Blocpdb> 49 atoms in block 132
Block first atom: 6281
Blocpdb> 50 atoms in block 133
Block first atom: 6330
Blocpdb> 47 atoms in block 134
Block first atom: 6380
Blocpdb> 49 atoms in block 135
Block first atom: 6427
Blocpdb> 49 atoms in block 136
Block first atom: 6476
Blocpdb> 48 atoms in block 137
Block first atom: 6525
Blocpdb> 47 atoms in block 138
Block first atom: 6573
Blocpdb> 44 atoms in block 139
Block first atom: 6620
Blocpdb> 42 atoms in block 140
Block first atom: 6664
Blocpdb> 49 atoms in block 141
Block first atom: 6706
Blocpdb> 51 atoms in block 142
Block first atom: 6755
Blocpdb> 43 atoms in block 143
Block first atom: 6806
Blocpdb> 50 atoms in block 144
Block first atom: 6849
Blocpdb> 47 atoms in block 145
Block first atom: 6899
Blocpdb> 50 atoms in block 146
Block first atom: 6946
Blocpdb> 51 atoms in block 147
Block first atom: 6996
Blocpdb> 55 atoms in block 148
Block first atom: 7047
Blocpdb> 44 atoms in block 149
Block first atom: 7102
Blocpdb> 45 atoms in block 150
Block first atom: 7146
Blocpdb> 51 atoms in block 151
Block first atom: 7191
Blocpdb> 46 atoms in block 152
Block first atom: 7242
Blocpdb> 52 atoms in block 153
Block first atom: 7288
Blocpdb> 53 atoms in block 154
Block first atom: 7340
Blocpdb> 53 atoms in block 155
Block first atom: 7393
Blocpdb> 50 atoms in block 156
Block first atom: 7446
Blocpdb> 50 atoms in block 157
Block first atom: 7496
Blocpdb> 47 atoms in block 158
Block first atom: 7546
Blocpdb> 46 atoms in block 159
Block first atom: 7593
Blocpdb> 41 atoms in block 160
Block first atom: 7639
Blocpdb> 52 atoms in block 161
Block first atom: 7680
Blocpdb> 43 atoms in block 162
Block first atom: 7732
Blocpdb> 53 atoms in block 163
Block first atom: 7775
Blocpdb> 57 atoms in block 164
Block first atom: 7828
Blocpdb> 45 atoms in block 165
Block first atom: 7885
Blocpdb> 44 atoms in block 166
Block first atom: 7930
Blocpdb> 31 atoms in block 167
Block first atom: 7973
Blocpdb> 167 blocks.
Blocpdb> At most, 63 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 31 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2572138 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 24012
Prepmat> Matrix trace = 5609660.0000
Prepmat> Last element read: 24012 24012 40.0093
Prepmat> 14029 lines saved.
Prepmat> 12875 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8004
RTB> Total mass = 8004.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 8004
RTB> Number of blocks = 167
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 145465.6406
RTB> 39003 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1002
Diagstd> Nb of non-zero elements: 39003
Diagstd> Projected matrix trace = 145465.6406
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1002 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 145465.6406
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0001447 0.0003949 0.0020518 0.0034869
0.0046998 0.0061125 0.0067597 0.0096426 0.0104627
0.0199595 0.0220820 0.0283749 0.0338908 0.0398705
0.0693215 0.0847454 0.0913019 0.1036868 0.1190743
0.1230863 0.1931118 0.2104519 0.2278042 0.2509392
0.2642362 0.2816510 0.3654293 0.4102233 0.4405185
0.4868881 0.5028956 0.5405592 0.6128929 0.6640893
0.8087806 0.8552728 0.8783083 0.9936502 1.0991302
1.1904218 1.2304732 1.2979588 1.4244155 1.4440575
1.5262883 1.6182194 1.6692749 1.6906044 1.8048187
1.9888100 2.3324626 2.3931522 2.4861505 2.5272081
2.5595293 2.6311063 2.7721737 2.8590501 2.9740335
3.0703628 3.2107280 3.4796092 3.7319564 3.7977846
3.9308668 3.9382196 4.0396916 4.1405645 4.2734657
4.6556625 4.8802916 4.9357774 5.1260988 5.2285361
5.6094166 5.6404850 5.8835854 6.2508688 6.3357350
6.3786574 6.7901438 6.9577218 7.1715257 7.3980822
7.6828902 7.9866013 8.2844292 8.3700290 8.5904157
8.8771292 9.1308237 9.2644569 9.2932118 9.5297281
9.8179378 9.9359294 10.1560052 10.2617778 10.7229047
11.0542931
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034332 0.0034336 0.0034337 0.0034337 0.0034339
0.0034341 1.3061131 2.1578062 4.9188618 6.4123501
7.4445090 8.4899307 8.9280703 10.6633269 11.1075110
15.3415673 16.1366980 18.2920541 19.9910880 21.6831000
28.5909892 31.6121091 32.8121835 34.9668956 37.4717852
38.0978147 47.7199221 49.8163319 51.8293986 54.3975752
55.8202022 57.6303114 65.6442910 69.5513341 72.0737914
75.7721922 77.0077065 79.8393331 85.0134362 88.4929184
97.6586322 100.4263347 101.7697674 108.2460487 113.8465417
118.4801819 120.4568110 123.7159629 129.6025758 130.4930909
134.1570726 138.1382615 140.3004958 141.1940119 145.8854827
153.1411585 165.8450909 167.9888442 171.2217710 172.6298077
173.7302062 176.1426308 180.8029457 183.6141575 187.2699987
190.2786783 194.5794793 202.5631831 209.7797475 211.6218207
215.2977267 215.4989918 218.2576052 220.9657975 224.4839994
234.3074121 239.8933267 241.2531881 245.8605034 248.3049261
257.1900282 257.9012847 263.4003269 271.4972739 273.3340781
274.2583874 282.9663326 286.4367988 290.8044575 295.3621608
300.9938295 306.8854383 312.5550892 314.1656956 318.2748845
323.5426583 328.1332645 330.5257225 331.0382663 335.2243335
340.2557080 342.2941915 346.0642506 347.8616740 355.5916075
361.0445293
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8004
Rtb_to_modes> Number of blocs = 167
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9955E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.4869E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6998E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2817
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3654
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4405
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6641
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8088
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8783
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9937
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.298
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.424
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.444
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.618
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.393
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.486
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.527
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.560
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.631
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.772
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.859
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.974
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.070
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.211
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.798
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.931
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.938
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.040
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.141
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.273
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.656
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.936
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.126
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.609
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.640
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.884
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.251
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.336
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.379
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.790
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.958
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.172
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.398
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.683
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.987
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.284
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.370
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.590
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.877
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.131
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.264
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.293
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.530
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.818
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.936
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.05
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1002 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99997
1.00002 1.00000 1.00000 0.99996 0.99998
1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99997 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997
0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00006
0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002
1.00002 0.99999 1.00005 1.00003 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00004 0.99997
1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00004
0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002
0.99996 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
1.00002 0.99998 0.99999 1.00003 1.00002
0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 1.00003
1.00002 1.00003 1.00004 0.99996 0.99998
0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 1.00003 0.99997 1.00003
0.99998 1.00002 1.00000 0.99996 0.99999
1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 144072 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99997
1.00002 1.00000 1.00000 0.99996 0.99998
1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99997 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997
0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00006
0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002
1.00002 0.99999 1.00005 1.00003 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00004 0.99997
1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00004
0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002
0.99996 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
1.00002 0.99998 0.99999 1.00003 1.00002
0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 1.00003
1.00002 1.00003 1.00004 0.99996 0.99998
0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 1.00003 0.99997 1.00003
0.99998 1.00002 1.00000 0.99996 0.99999
1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607150529311443284.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607150529311443284.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607150529311443284.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607150529311443284.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1000
First residue number = 1
Last residue number = 1000
Number of atoms found = 8004
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9955E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4467E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9485E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0518E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.4869E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6998E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.1125E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.7597E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.6426E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0463E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9959E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2082E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8375E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3891E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9871E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.9321E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.4745E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.1302E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1037
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1191
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1231
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1931
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2105
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2278
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2509
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2642
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2817
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3654
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4102
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4405
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4869
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5029
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5406
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6129
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.958
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.172
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.398
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.683
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.987
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.284
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.370
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.590
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.877
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.131
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.264
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.293
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.530
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.818
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.936
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.05
Bfactors> 106 vectors, 24012 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000145
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.415 for 1000 C-alpha atoms.
Bfactors> = 21.817 +/- 22.68
Bfactors> = 75.087 +/- 20.82
Bfactors> Shiftng-fct= 53.270
Bfactors> Scaling-fct= 0.918
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607150529311443284.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607150529311443284.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.306
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.158
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.919
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.412
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.444
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.490
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.928
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.00
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.0
Chkmod> 106 vectors, 24012 coordinates in file.
Chkmod> That is: 8004 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 35 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 43 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9066
0.0034 0.8061
0.0034 0.7168
0.0034 0.7345
0.0034 0.8833
0.0034 0.7893
1.3061 0.7331
2.1577 0.6910
4.9186 0.0307
6.4120 0.0364
7.4442 0.6454
8.4896 0.0681
8.9277 0.5541
10.6629 0.0190
11.1072 0.2568
15.3407 0.0263
16.1360 0.0370
18.2913 0.4845
19.9903 0.1675
21.6823 0.2813
28.5897 0.0464
31.6107 0.0959
32.8108 0.1321
34.9676 0.0408
37.4742 0.2740
38.0983 0.5716
47.7164 0.0961
49.8199 0.3448
51.8267 0.0540
54.3910 0.0801
55.8140 0.0771
57.6328 0.4438
65.6388 0.0376
69.5464 0.0701
72.0692 0.0766
75.7699 0.2027
77.0047 0.0667
79.8389 0.3703
85.0103 0.0765
88.4898 0.0903
97.6556 0.3459
100.4236 0.3961
101.7649 0.0195
108.2441 0.0708
113.8349 0.1625
118.4541 0.3879
120.4285 0.0216
123.7126 0.0417
129.5781 0.0676
130.4849 0.1442
134.1386 0.0193
138.1230 0.1749
140.2829 0.2038
141.2045 0.0997
145.8865 0.0531
153.1419 0.0368
165.8215 0.2794
167.9763 0.2317
171.2092 0.0162
172.6153 0.0472
173.7387 0.0272
176.1315 0.1287
180.7895 0.0403
183.6047 0.0465
187.2609 0.1403
190.2593 0.0925
194.5794 0.1401
202.5659 0.1633
209.7720 0.0938
211.6187 0.3004
215.2921 0.2547
215.4837 0.1768
218.2566 0.0812
220.9679 0.2130
224.4621 0.1075
234.3058 0.0731
239.8759 0.0277
241.2483 0.0844
245.8476 0.0822
248.3053 0.0329
257.1694 0.0331
257.8791 0.2475
263.3983 0.2280
271.4885 0.1816
273.3281 0.2139
274.2540 0.1941
282.9512 0.1378
286.4302 0.1199
290.8016 0.2652
295.3478 0.2959
300.9831 0.2633
306.8799 0.1814
312.5336 0.1207
314.1517 0.0671
318.2535 0.1070
323.5264 0.0554
328.1223 0.2935
330.5034 0.2043
331.0203 0.0363
335.2147 0.1744
340.2422 0.2756
342.2807 0.0924
346.1174 0.3971
347.8166 0.2624
355.5282 0.0954
360.9589 0.1482
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2607150529311443284.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607150529311443284.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2607150529311443284.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607150529311443284.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2607150529311443284.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2607150529311443284.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.306
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.158
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.919
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.412
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.444
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.490
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.928
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.29
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.10
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.0
Projmod> 106 vectors, 24012 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1000
First residue number = 1
Last residue number = 1000
Number of atoms found = 8004
Mean number per residue = 8.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 993
First residue number = 1
Last residue number = 993
Number of atoms found = 7935
Mean number per residue = 8.0
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2607150529311443284 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
making animated gifs
11 models are in 2607150529311443284.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150529311443284.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150529311443284.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 993 29.895
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 993 29.845
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 993 29.797
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 993 29.751
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 993 29.705
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 993 29.662
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 993 29.619
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 993 29.578
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 993 29.539
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 993 29.501
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 993 29.464
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2607150529311443284 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
making animated gifs
11 models are in 2607150529311443284.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150529311443284.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150529311443284.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 993 29.874
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 993 29.829
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 993 29.785
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 993 29.743
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 993 29.702
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 993 29.662
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 993 29.623
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 993 29.586 6 1.915
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 993 29.549 6 1.867
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 993 29.515 6 1.829
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 993 29.481
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2607150529311443284 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
making animated gifs
11 models are in 2607150529311443284.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150529311443284.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150529311443284.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 993 29.602
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 993 29.613
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 993 29.624
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 993 29.636
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 993 29.649
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 993 29.662
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 993 29.675
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 993 29.690
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 993 29.705
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 993 29.720 8 1.624
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 993 29.737 8 1.618
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2607150529311443284 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607150529311443284.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
11 models are in 2607150529311443284.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150529311443284.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150529311443284.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 993 29.607
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 993 29.614
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 993 29.623
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 993 29.634
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 993 29.647
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 993 29.662
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 993 29.678
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 993 29.696
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 993 29.716
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 993 29.737
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 993 29.761
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2607150529311443284 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607150529311443284.eigenfacs
2607150529311443284.atom
making animated gifs
11 models are in 2607150529311443284.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150529311443284.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150529311443284.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 993 29.784 6 1.885
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 993 29.757
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 993 29.730
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 993 29.706
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 993 29.683
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 993 29.662
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 993 29.642
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 993 29.624 7 1.473
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 993 29.607 7 1.481
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 993 29.593 7 1.494
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 993 29.579 7 1.513
2607150529311443284.10.pdb
2607150529311443284.11.pdb
2607150529311443284.7.pdb
2607150529311443284.8.pdb
2607150529311443284.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m37.592s
user 0m37.329s
sys 0m0.253s
rm: cannot remove '2607150529311443284.sdijf': No such file or directory
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