*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607150732291466857.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607150732291466857.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607150732291466857.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 803
First residue number = 1
Last residue number = 803
Number of atoms found = 12711
Mean number per residue = 15.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 57.351334 +/- 17.579869 From: 24.735000 To: 110.265000
= 66.712097 +/- 19.606160 From: 19.840000 To: 115.160000
= 69.028613 +/- 13.485418 From: 35.705000 To: 99.295000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.2483 % Filled.
Pdbmat> 9076338 non-zero elements.
Pdbmat> 1001738 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 157.62 +/- 44.03
Maximum number = 242
Minimum number = 24
Pdbmat> Matrix trace = 2.003476E+07
Pdbmat> Larger element = 867.105
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
803 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607150732291466857.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607150732291466857.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607150732291466857.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 12711 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 803 residues.
Blocpdb> 71 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 70 atoms in block 2
Block first atom: 72
Blocpdb> 82 atoms in block 3
Block first atom: 142
Blocpdb> 55 atoms in block 4
Block first atom: 224
Blocpdb> 71 atoms in block 5
Block first atom: 279
Blocpdb> 81 atoms in block 6
Block first atom: 350
Blocpdb> 77 atoms in block 7
Block first atom: 431
Blocpdb> 100 atoms in block 8
Block first atom: 508
Blocpdb> 95 atoms in block 9
Block first atom: 608
Blocpdb> 90 atoms in block 10
Block first atom: 703
Blocpdb> 76 atoms in block 11
Block first atom: 793
Blocpdb> 68 atoms in block 12
Block first atom: 869
Blocpdb> 93 atoms in block 13
Block first atom: 937
Blocpdb> 77 atoms in block 14
Block first atom: 1030
Blocpdb> 92 atoms in block 15
Block first atom: 1107
Blocpdb> 73 atoms in block 16
Block first atom: 1199
Blocpdb> 77 atoms in block 17
Block first atom: 1272
Blocpdb> 97 atoms in block 18
Block first atom: 1349
Blocpdb> 76 atoms in block 19
Block first atom: 1446
Blocpdb> 65 atoms in block 20
Block first atom: 1522
Blocpdb> 85 atoms in block 21
Block first atom: 1587
Blocpdb> 69 atoms in block 22
Block first atom: 1672
Blocpdb> 75 atoms in block 23
Block first atom: 1741
Blocpdb> 75 atoms in block 24
Block first atom: 1816
Blocpdb> 76 atoms in block 25
Block first atom: 1891
Blocpdb> 100 atoms in block 26
Block first atom: 1967
Blocpdb> 80 atoms in block 27
Block first atom: 2067
Blocpdb> 84 atoms in block 28
Block first atom: 2147
Blocpdb> 56 atoms in block 29
Block first atom: 2231
Blocpdb> 88 atoms in block 30
Block first atom: 2287
Blocpdb> 88 atoms in block 31
Block first atom: 2375
Blocpdb> 81 atoms in block 32
Block first atom: 2463
Blocpdb> 87 atoms in block 33
Block first atom: 2544
Blocpdb> 84 atoms in block 34
Block first atom: 2631
Blocpdb> 88 atoms in block 35
Block first atom: 2715
Blocpdb> 74 atoms in block 36
Block first atom: 2803
Blocpdb> 88 atoms in block 37
Block first atom: 2877
Blocpdb> 82 atoms in block 38
Block first atom: 2965
Blocpdb> 87 atoms in block 39
Block first atom: 3047
Blocpdb> 71 atoms in block 40
Block first atom: 3134
Blocpdb> 83 atoms in block 41
Block first atom: 3205
Blocpdb> 81 atoms in block 42
Block first atom: 3288
Blocpdb> 81 atoms in block 43
Block first atom: 3369
Blocpdb> 100 atoms in block 44
Block first atom: 3450
Blocpdb> 95 atoms in block 45
Block first atom: 3550
Blocpdb> 83 atoms in block 46
Block first atom: 3645
Blocpdb> 84 atoms in block 47
Block first atom: 3728
Blocpdb> 90 atoms in block 48
Block first atom: 3812
Blocpdb> 99 atoms in block 49
Block first atom: 3902
Blocpdb> 80 atoms in block 50
Block first atom: 4001
Blocpdb> 81 atoms in block 51
Block first atom: 4081
Blocpdb> 85 atoms in block 52
Block first atom: 4162
Blocpdb> 79 atoms in block 53
Block first atom: 4247
Blocpdb> 70 atoms in block 54
Block first atom: 4326
Blocpdb> 65 atoms in block 55
Block first atom: 4396
Blocpdb> 81 atoms in block 56
Block first atom: 4461
Blocpdb> 105 atoms in block 57
Block first atom: 4542
Blocpdb> 89 atoms in block 58
Block first atom: 4647
Blocpdb> 80 atoms in block 59
Block first atom: 4736
Blocpdb> 84 atoms in block 60
Block first atom: 4816
Blocpdb> 65 atoms in block 61
Block first atom: 4900
Blocpdb> 94 atoms in block 62
Block first atom: 4965
Blocpdb> 86 atoms in block 63
Block first atom: 5059
Blocpdb> 73 atoms in block 64
Block first atom: 5145
Blocpdb> 98 atoms in block 65
Block first atom: 5218
Blocpdb> 76 atoms in block 66
Block first atom: 5316
Blocpdb> 76 atoms in block 67
Block first atom: 5392
Blocpdb> 92 atoms in block 68
Block first atom: 5468
Blocpdb> 88 atoms in block 69
Block first atom: 5560
Blocpdb> 80 atoms in block 70
Block first atom: 5648
Blocpdb> 74 atoms in block 71
Block first atom: 5728
Blocpdb> 85 atoms in block 72
Block first atom: 5802
Blocpdb> 97 atoms in block 73
Block first atom: 5887
Blocpdb> 68 atoms in block 74
Block first atom: 5984
Blocpdb> 66 atoms in block 75
Block first atom: 6052
Blocpdb> 76 atoms in block 76
Block first atom: 6118
Blocpdb> 63 atoms in block 77
Block first atom: 6194
Blocpdb> 83 atoms in block 78
Block first atom: 6257
Blocpdb> 81 atoms in block 79
Block first atom: 6340
Blocpdb> 83 atoms in block 80
Block first atom: 6421
Blocpdb> 64 atoms in block 81
Block first atom: 6504
Blocpdb> 63 atoms in block 82
Block first atom: 6568
Blocpdb> 76 atoms in block 83
Block first atom: 6631
Blocpdb> 67 atoms in block 84
Block first atom: 6707
Blocpdb> 64 atoms in block 85
Block first atom: 6774
Blocpdb> 75 atoms in block 86
Block first atom: 6838
Blocpdb> 62 atoms in block 87
Block first atom: 6913
Blocpdb> 77 atoms in block 88
Block first atom: 6975
Blocpdb> 67 atoms in block 89
Block first atom: 7052
Blocpdb> 97 atoms in block 90
Block first atom: 7119
Blocpdb> 79 atoms in block 91
Block first atom: 7216
Blocpdb> 85 atoms in block 92
Block first atom: 7295
Blocpdb> 69 atoms in block 93
Block first atom: 7380
Blocpdb> 78 atoms in block 94
Block first atom: 7449
Blocpdb> 68 atoms in block 95
Block first atom: 7527
Blocpdb> 68 atoms in block 96
Block first atom: 7595
Blocpdb> 90 atoms in block 97
Block first atom: 7663
Blocpdb> 69 atoms in block 98
Block first atom: 7753
Blocpdb> 84 atoms in block 99
Block first atom: 7822
Blocpdb> 61 atoms in block 100
Block first atom: 7906
Blocpdb> 71 atoms in block 101
Block first atom: 7967
Blocpdb> 73 atoms in block 102
Block first atom: 8038
Blocpdb> 91 atoms in block 103
Block first atom: 8111
Blocpdb> 86 atoms in block 104
Block first atom: 8202
Blocpdb> 76 atoms in block 105
Block first atom: 8288
Blocpdb> 70 atoms in block 106
Block first atom: 8364
Blocpdb> 82 atoms in block 107
Block first atom: 8434
Blocpdb> 78 atoms in block 108
Block first atom: 8516
Blocpdb> 72 atoms in block 109
Block first atom: 8594
Blocpdb> 80 atoms in block 110
Block first atom: 8666
Blocpdb> 80 atoms in block 111
Block first atom: 8746
Blocpdb> 95 atoms in block 112
Block first atom: 8826
Blocpdb> 64 atoms in block 113
Block first atom: 8921
Blocpdb> 85 atoms in block 114
Block first atom: 8985
Blocpdb> 82 atoms in block 115
Block first atom: 9070
Blocpdb> 87 atoms in block 116
Block first atom: 9152
Blocpdb> 81 atoms in block 117
Block first atom: 9239
Blocpdb> 74 atoms in block 118
Block first atom: 9320
Blocpdb> 96 atoms in block 119
Block first atom: 9394
Blocpdb> 75 atoms in block 120
Block first atom: 9490
Blocpdb> 76 atoms in block 121
Block first atom: 9565
Blocpdb> 74 atoms in block 122
Block first atom: 9641
Blocpdb> 84 atoms in block 123
Block first atom: 9715
Blocpdb> 81 atoms in block 124
Block first atom: 9799
Blocpdb> 79 atoms in block 125
Block first atom: 9880
Blocpdb> 79 atoms in block 126
Block first atom: 9959
Blocpdb> 78 atoms in block 127
Block first atom: 10038
Blocpdb> 86 atoms in block 128
Block first atom: 10116
Blocpdb> 78 atoms in block 129
Block first atom: 10202
Blocpdb> 58 atoms in block 130
Block first atom: 10280
Blocpdb> 92 atoms in block 131
Block first atom: 10338
Blocpdb> 85 atoms in block 132
Block first atom: 10430
Blocpdb> 91 atoms in block 133
Block first atom: 10515
Blocpdb> 81 atoms in block 134
Block first atom: 10606
Blocpdb> 83 atoms in block 135
Block first atom: 10687
Blocpdb> 84 atoms in block 136
Block first atom: 10770
Blocpdb> 72 atoms in block 137
Block first atom: 10854
Blocpdb> 83 atoms in block 138
Block first atom: 10926
Blocpdb> 85 atoms in block 139
Block first atom: 11009
Blocpdb> 82 atoms in block 140
Block first atom: 11094
Blocpdb> 71 atoms in block 141
Block first atom: 11176
Blocpdb> 48 atoms in block 142
Block first atom: 11247
Blocpdb> 65 atoms in block 143
Block first atom: 11295
Blocpdb> 62 atoms in block 144
Block first atom: 11360
Blocpdb> 84 atoms in block 145
Block first atom: 11422
Blocpdb> 69 atoms in block 146
Block first atom: 11506
Blocpdb> 78 atoms in block 147
Block first atom: 11575
Blocpdb> 80 atoms in block 148
Block first atom: 11653
Blocpdb> 76 atoms in block 149
Block first atom: 11733
Blocpdb> 84 atoms in block 150
Block first atom: 11809
Blocpdb> 75 atoms in block 151
Block first atom: 11893
Blocpdb> 68 atoms in block 152
Block first atom: 11968
Blocpdb> 73 atoms in block 153
Block first atom: 12036
Blocpdb> 100 atoms in block 154
Block first atom: 12109
Blocpdb> 86 atoms in block 155
Block first atom: 12209
Blocpdb> 69 atoms in block 156
Block first atom: 12295
Blocpdb> 83 atoms in block 157
Block first atom: 12364
Blocpdb> 91 atoms in block 158
Block first atom: 12447
Blocpdb> 64 atoms in block 159
Block first atom: 12538
Blocpdb> 63 atoms in block 160
Block first atom: 12602
Blocpdb> 47 atoms in block 161
Block first atom: 12664
Blocpdb> 161 blocks.
Blocpdb> At most, 105 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 47 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 9076499 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 38133
Prepmat> Matrix trace = 20034760.0000
Prepmat> Last element read: 38133 38133 277.2441
Prepmat> 13042 lines saved.
Prepmat> 11409 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 12711
RTB> Total mass = 12711.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 12711
RTB> Number of blocks = 161
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 359179.8237
RTB> 56337 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 966
Diagstd> Nb of non-zero elements: 56337
Diagstd> Projected matrix trace = 359179.8237
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 966 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 359179.8237
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.3669255 0.7818960 1.2253842 3.2010746
3.9509087 5.2976519 6.2724143 6.9371404 7.9402634
7.9756559 8.6652287 10.3007814 12.3171281 12.4421970
13.0434208 14.3812229 14.7842964 15.9986148 17.7301667
19.1887849 20.1240262 20.9854825 22.2873464 23.4839921
24.6929038 26.3447153 27.9294734 28.3041622 28.7403260
30.2298471 31.2162979 31.9966660 32.6804755 34.4503780
35.6555800 37.4897071 37.9821371 38.9234072 40.1157606
40.4212931 42.5462675 42.8528971 44.2222617 46.0015699
46.5334803 49.1133843 49.8593936 51.5141486 53.0019628
53.9223690 54.2645932 56.5470996 57.3365975 58.0175837
59.3063843 59.9606403 60.7383532 63.2486485 63.8048589
64.5448397 66.2120421 66.7659191 68.1568392 68.2517354
69.0266437 69.7311966 70.5813958 71.9005047 73.5718776
74.2633679 75.6691504 76.5072449 77.3022105 78.2097896
79.2595819 80.4866523 80.6411987 82.9303658 83.2042689
84.6403467 85.3673902 86.6234666 87.1720838 88.7257834
89.7198922 91.7642660 92.0110588 92.8620522 95.3258395
95.8301413 96.5767325 97.5073173 98.0851593 98.4376369
99.8986822 100.1927523 100.9309469 102.4543511 102.8087076
103.9069221
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034311 0.0034334 0.0034338 0.0034339 0.0034351
0.0034355 65.7785355 96.0217879 120.2074608 194.2867484
215.8458881 249.9407034 271.9647685 286.0128350 305.9938767
306.6750778 319.6577918 348.5221353 381.1097063 383.0397244
392.1850481 411.8064923 417.5376198 434.3466454 457.2478688
475.6845186 487.1387952 497.4560988 512.6541320 526.2368343
539.6117064 557.3680050 573.8873530 577.7240307 582.1583422
597.0535092 606.7167409 614.2535061 620.7824971 637.3709655
648.4239287 664.8923008 669.2447590 677.4865924 687.7851516
690.3993625 708.3143056 710.8621228 722.1306116 736.5150178
740.7608952 761.0184940 766.7764683 779.3966658 790.5716869
797.4064829 799.9328945 816.5832127 822.2639286 827.1325254
836.2690117 840.8691344 846.3047657 863.6164481 867.4054697
872.4208643 883.6164075 887.3045248 896.4993958 897.1232861
902.2017365 906.7944206 912.3057281 920.7913902 931.4320982
935.7990514 944.6147203 949.8314855 954.7534509 960.3418146
966.7655556 974.2203840 975.1552601 988.8993030 990.5310290
999.0425767 1003.3241888 1010.6785770 1013.8740190 1022.8694357
1028.5837335 1040.2364747 1041.6343530 1046.4402091 1060.2312473
1063.0320157 1067.1649042 1072.2940207 1075.4666092 1077.3972683
1085.3633685 1086.9596780 1090.9565502 1099.1589074 1101.0580845
1106.9232779
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 12711
Rtb_to_modes> Number of blocs = 161
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9835E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.976
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.29
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.85
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.22
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.26
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.9
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 966 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
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1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998
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1.00002 1.00005 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998
1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00005 1.00001 1.00001
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1.00001 1.00000 1.00001 1.00005 1.00001
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998
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1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 228798 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 1.00004 1.00000 1.00001
1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998
1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998
1.00002 1.00005 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998
1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00005 1.00001 1.00001
0.99998 0.99999 0.99996 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00005 1.00001
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998
1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607150732291466857.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607150732291466857.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607150732291466857.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607150732291466857.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 803
First residue number = 1
Last residue number = 803
Number of atoms found = 12711
Mean number per residue = 15.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9835E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3669
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7819
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.225
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.201
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.951
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.298
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.272
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.937
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.940
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.976
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.665
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.00
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.9
Bfactors> 106 vectors, 38133 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.366900
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.010 +/- 0.02
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.010
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607150732291466857.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607150732291466857.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1063.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1072.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1077.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1085.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1087.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1101.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1107.
Chkmod> 106 vectors, 38133 coordinates in file.
Chkmod> That is: 12711 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7077
0.0034 0.7983
0.0034 0.7541
0.0034 0.9317
0.0034 0.7575
0.0034 0.9766
65.7734 0.2077
96.0179 0.1588
120.1835 0.0711
194.2761 0.2575
215.8391 0.2279
249.9382 0.5292
271.9441 0.4556
285.9977 0.3230
305.9757 0.4013
306.6685 0.2813
319.6399 0.4131
348.4940 0.4096
381.1378 0.3648
382.9895 0.4813
392.1168 0.4102
411.7713 0.3224
417.4590 0.5855
434.3468 0.5712
457.2261 0.5365
475.6792 0.5364
487.0692 0.3250
497.4883 0.5325
512.6626 0.3311
526.1695 0.4215
539.5568 0.5358
557.2942 0.4822
573.8681 0.5046
577.6568 0.5238
582.1301 0.3568
597.0294 0.2984
606.7267 0.3782
614.2591 0.4062
620.7513 0.3755
637.3401 0.4204
648.4363 0.3795
664.8664 0.4177
669.1972 0.5120
677.4279 0.5016
687.7920 0.3561
690.3587 0.3089
708.3150 0.3573
710.8076 0.3604
722.0811 0.4150
736.4708 0.2248
740.7014 0.3822
760.9596 0.5087
766.7482 0.2119
779.3318 0.5156
790.5231 0.4258
797.3547 0.3839
799.8647 0.5342
816.5691 0.4072
822.2530 0.3553
827.1142 0.4350
836.2586 0.4739
840.8285 0.3613
846.2799 0.2394
863.5886 0.4040
867.3352 0.5068
872.3507 0.3972
883.5649 0.4191
887.2936 0.4584
896.4817 0.2686
897.0734 0.5048
902.1849 0.4857
906.7477 0.5116
912.2575 0.3785
920.7486 0.3999
931.3802 0.4380
935.7377 0.3185
944.5795 0.4228
949.8078 0.3174
954.6988 0.4593
960.3019 0.2026
966.7266 0.4076
974.1988 0.4430
975.1062 0.4551
988.8547 0.3699
990.4631 0.5133
998.9976 0.5190
1003.2965 0.4895
1010.6150 0.5745
1013.8184 0.5282
1022.8498 0.5262
1028.5402 0.5050
1040.1676 0.5477
1041.5836 0.4802
1046.3837 0.5055
1060.2089 0.1762
1062.9856 0.3417
1067.1371 0.4685
1072.2627 0.4523
1075.4470 0.4669
1077.3639 0.5222
1085.3239 0.5299
1086.9523 0.1406
1090.7425 0.4298
1099.3566 0.4366
1100.9642 0.4849
1106.8389 0.4848
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2607150732291466857.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607150732291466857.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2607150732291466857.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607150732291466857.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2607150732291466857.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2607150732291466857.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.4
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1063.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1072.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1077.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1085.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1087.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1101.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1107.
Projmod> 106 vectors, 38133 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 803
First residue number = 1
Last residue number = 803
Number of atoms found = 12711
Mean number per residue = 15.8
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 803
First residue number = 1
Last residue number = 803
Number of atoms found = 12711
Mean number per residue = 15.8
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 12711 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 25.96
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.121 Sum= 0.015 q= 353.2962
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.602 Sum= 0.377 q= 1762.1736
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.384 Sum= 0.524 q= -1122.6133
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.285 Sum= 0.605 q= -834.2474
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.320 Sum= 0.708 q= -937.6489
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.273 Sum= 0.783 q= 799.0530
Vector: 7 F= 65.77 Cos= 0.023 Sum= 0.783 q= 66.8609
Vector: 8 F= 96.02 Cos= 0.079 Sum= 0.789 q= 231.4781
Vector: 9 F= 120.18 Cos= -0.050 Sum= 0.792 q= -145.1351
Vector: 10 F= 194.28 Cos= -0.088 Sum= 0.800 q= -258.7666
Vector: 11 F= 215.84 Cos= -0.137 Sum= 0.819 q= -401.8640
Vector: 12 F= 249.94 Cos= -0.028 Sum= 0.819 q= -80.5521
Vector: 13 F= 271.94 Cos= -0.113 Sum= 0.832 q= -330.2195
Vector: 14 F= 286.00 Cos= 0.005 Sum= 0.832 q= 15.2877
Vector: 15 F= 305.98 Cos= -0.081 Sum= 0.839 q= -236.6581
Vector: 16 F= 306.67 Cos= 0.192 Sum= 0.875 q= 560.8530
Vector: 17 F= 319.64 Cos= 0.027 Sum= 0.876 q= 78.1723
Vector: 18 F= 348.49 Cos= 0.050 Sum= 0.879 q= 146.1564
Vector: 19 F= 381.14 Cos= 0.014 Sum= 0.879 q= 39.7795
Vector: 20 F= 382.99 Cos= 0.037 Sum= 0.880 q= 109.0254
Vector: 21 F= 392.12 Cos= -0.022 Sum= 0.881 q= -65.5938
Vector: 22 F= 411.77 Cos= -0.069 Sum= 0.885 q= -200.6711
Vector: 23 F= 417.46 Cos= -0.013 Sum= 0.886 q= -39.3847
Vector: 24 F= 434.35 Cos= -0.075 Sum= 0.891 q= -218.8585
Vector: 25 F= 457.23 Cos= 0.028 Sum= 0.892 q= 82.4266
Vector: 26 F= 475.68 Cos= 0.041 Sum= 0.894 q= 120.7291
Vector: 27 F= 487.07 Cos= 0.063 Sum= 0.898 q= 184.0575
Vector: 28 F= 497.49 Cos= 0.026 Sum= 0.898 q= 75.9289
Vector: 29 F= 512.66 Cos= 0.045 Sum= 0.900 q= 132.7743
Vector: 30 F= 526.17 Cos= 0.070 Sum= 0.905 q= 204.4998
Vector: 31 F= 539.56 Cos= -0.039 Sum= 0.907 q= -114.4134
Vector: 32 F= 557.29 Cos= 0.050 Sum= 0.909 q= 145.3731
Vector: 33 F= 573.87 Cos= 0.009 Sum= 0.909 q= 25.9434
Vector: 34 F= 577.66 Cos= 0.015 Sum= 0.909 q= 43.2091
Vector: 35 F= 582.13 Cos= -0.013 Sum= 0.910 q= -38.2870
Vector: 36 F= 597.03 Cos= -0.009 Sum= 0.910 q= -26.3383
Vector: 37 F= 606.73 Cos= 0.055 Sum= 0.913 q= 162.1961
Vector: 38 F= 614.26 Cos= 0.036 Sum= 0.914 q= 106.7174
Vector: 39 F= 620.75 Cos= 0.068 Sum= 0.919 q= 198.9090
Vector: 40 F= 637.34 Cos= -0.057 Sum= 0.922 q= -166.7198
Vector: 41 F= 648.44 Cos= 0.064 Sum= 0.926 q= 185.8514
Vector: 42 F= 664.87 Cos= -0.059 Sum= 0.930 q= -172.7975
Vector: 43 F= 669.20 Cos= -0.005 Sum= 0.930 q= -14.7048
Vector: 44 F= 677.43 Cos= -0.034 Sum= 0.931 q= -100.1380
Vector: 45 F= 687.79 Cos= -0.026 Sum= 0.931 q= -77.0375
Vector: 46 F= 690.36 Cos= 0.045 Sum= 0.933 q= 132.0155
Vector: 47 F= 708.31 Cos= -0.015 Sum= 0.934 q= -44.6444
Vector: 48 F= 710.81 Cos= 0.022 Sum= 0.934 q= 64.4174
Vector: 49 F= 722.08 Cos= 0.008 Sum= 0.934 q= 22.7858
Vector: 50 F= 736.47 Cos= -0.020 Sum= 0.935 q= -57.8363
Vector: 51 F= 740.70 Cos= -0.000 Sum= 0.935 q= -0.6198
Vector: 52 F= 760.96 Cos= -0.055 Sum= 0.938 q= -159.6378
Vector: 53 F= 766.75 Cos= 0.031 Sum= 0.939 q= 92.1754
Vector: 54 F= 779.33 Cos= 0.056 Sum= 0.942 q= 164.4288
Vector: 55 F= 790.52 Cos= 0.017 Sum= 0.942 q= 48.6793
Vector: 56 F= 797.35 Cos= -0.040 Sum= 0.944 q= -117.0469
Vector: 57 F= 799.86 Cos= -0.001 Sum= 0.944 q= -4.1333
Vector: 58 F= 816.57 Cos= 0.040 Sum= 0.945 q= 118.1009
Vector: 59 F= 822.25 Cos= -0.016 Sum= 0.945 q= -46.3022
Vector: 60 F= 827.11 Cos= 0.017 Sum= 0.946 q= 50.9881
Vector: 61 F= 836.26 Cos= -0.027 Sum= 0.947 q= -79.4449
Vector: 62 F= 840.83 Cos= 0.061 Sum= 0.950 q= 178.2107
Vector: 63 F= 846.28 Cos= -0.071 Sum= 0.955 q= -207.8482
Vector: 64 F= 863.59 Cos= 0.038 Sum= 0.957 q= 110.8681
Vector: 65 F= 867.34 Cos= -0.003 Sum= 0.957 q= -8.4981
Vector: 66 F= 872.35 Cos= -0.041 Sum= 0.958 q= -121.2882
Vector: 67 F= 883.56 Cos= 0.002 Sum= 0.958 q= 5.8759
Vector: 68 F= 887.29 Cos= -0.015 Sum= 0.959 q= -44.4602
Vector: 69 F= 896.48 Cos= 0.005 Sum= 0.959 q= 14.9239
Vector: 70 F= 897.07 Cos= -0.012 Sum= 0.959 q= -33.8423
Vector: 71 F= 902.18 Cos= -0.028 Sum= 0.960 q= -81.7140
Vector: 72 F= 906.75 Cos= 0.002 Sum= 0.960 q= 6.7898
Vector: 73 F= 912.26 Cos= -0.007 Sum= 0.960 q= -21.7915
Vector: 74 F= 920.75 Cos= 0.016 Sum= 0.960 q= 47.5118
Vector: 75 F= 931.38 Cos= 0.009 Sum= 0.960 q= 25.3560
Vector: 76 F= 935.74 Cos= 0.008 Sum= 0.960 q= 22.3939
Vector: 77 F= 944.58 Cos= 0.004 Sum= 0.960 q= 11.1371
Vector: 78 F= 949.81 Cos= -0.014 Sum= 0.960 q= -41.7519
Vector: 79 F= 954.70 Cos= 0.005 Sum= 0.960 q= 14.6214
Vector: 80 F= 960.30 Cos= -0.013 Sum= 0.960 q= -37.1694
Vector: 81 F= 966.73 Cos= 0.002 Sum= 0.960 q= 4.4763
Vector: 82 F= 974.20 Cos= -0.014 Sum= 0.961 q= -40.7400
Vector: 83 F= 975.11 Cos= -0.004 Sum= 0.961 q= -11.9325
Vector: 84 F= 988.85 Cos= -0.008 Sum= 0.961 q= -22.9524
Vector: 85 F= 990.46 Cos= 0.013 Sum= 0.961 q= 39.3682
Vector: 86 F= 999.00 Cos= -0.041 Sum= 0.963 q= -119.3129
Vector: 87 F= 1003.30 Cos= 0.022 Sum= 0.963 q= 63.6717
Vector: 88 F= 1010.61 Cos= 0.029 Sum= 0.964 q= 83.8387
Vector: 89 F= 1013.82 Cos= -0.026 Sum= 0.965 q= -75.3453
Vector: 90 F= 1022.85 Cos= -0.012 Sum= 0.965 q= -34.0268
Vector: 91 F= 1028.54 Cos= 0.004 Sum= 0.965 q= 12.1662
Vector: 92 F= 1040.17 Cos= -0.006 Sum= 0.965 q= -17.1583
Vector: 93 F= 1041.58 Cos= 0.012 Sum= 0.965 q= 34.1132
Vector: 94 F= 1046.38 Cos= 0.000 Sum= 0.965 q= 1.0279
Vector: 95 F= 1060.21 Cos= -0.016 Sum= 0.965 q= -47.2854
Vector: 96 F= 1062.99 Cos= 0.044 Sum= 0.967 q= 128.9783
Vector: 97 F= 1067.14 Cos= -0.019 Sum= 0.967 q= -56.5969
Vector: 98 F= 1072.26 Cos= -0.009 Sum= 0.968 q= -25.9801
Vector: 99 F= 1075.45 Cos= -0.012 Sum= 0.968 q= -34.4217
Vector: 100 F= 1077.36 Cos= -0.013 Sum= 0.968 q= -37.9361
Vector: 101 F= 1085.32 Cos= 0.013 Sum= 0.968 q= 36.6485
Vector: 102 F= 1086.95 Cos= -0.018 Sum= 0.968 q= -52.8626
Vector: 103 F= 1090.74 Cos= 0.001 Sum= 0.968 q= 2.8943
Vector: 104 F= 1099.36 Cos= -0.007 Sum= 0.968 q= -21.2473
Vector: 105 F= 1100.96 Cos= -0.004 Sum= 0.968 q= -10.9105
Vector: 106 F= 1106.84 Cos= 0.002 Sum= 0.968 q= 6.3012
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003431
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 65.773430
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.60 for mode 2 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.363 0.612 0.805 0.851 0.872 0.968
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2607150732291466857 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
making animated gifs
11 models are in 2607150732291466857.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150732291466857.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150732291466857.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 803 4.570 727 1.144
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 803 4.500 727 1.145
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 803 4.436 726 1.139
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 803 4.378 727 1.142
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 803 4.326 727 1.142
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 803 4.280 727 1.142
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 803 4.240 726 1.139
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 803 4.208 726 1.142
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 803 4.182 725 1.141
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 803 4.164 725 1.146
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 803 4.152 724 1.145
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2607150732291466857 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
making animated gifs
11 models are in 2607150732291466857.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150732291466857.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150732291466857.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 803 4.956 724 1.139
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 803 4.816 724 1.136
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 803 4.678 725 1.139
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 803 4.542 726 1.141
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 803 4.409 726 1.139
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 803 4.280 727 1.142
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 803 4.153 727 1.142
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 803 4.030 726 1.138
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 803 3.911 727 1.144
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 803 3.796 727 1.146
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 803 3.686 727 1.149
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2607150732291466857 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
making animated gifs
11 models are in 2607150732291466857.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150732291466857.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150732291466857.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 803 4.280 724 1.130
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 803 4.266 724 1.129
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 803 4.259 724 1.128
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 803 4.259 725 1.133
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 803 4.266 726 1.137
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 803 4.280 727 1.142
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 803 4.300 726 1.140
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 803 4.327 726 1.143
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 803 4.361 726 1.148
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 803 4.400 726 1.155
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 803 4.446 726 1.163
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2607150732291466857 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
making animated gifs
11 models are in 2607150732291466857.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150732291466857.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150732291466857.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 803 4.114 731 1.212
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 803 4.132 735 1.198
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 803 4.158 734 1.178
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 803 4.192 727 1.134
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 803 4.232 728 1.135
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 803 4.280 727 1.142
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 803 4.334 722 1.139
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 803 4.395 719 1.153
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 803 4.462 714 1.162
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 803 4.535 708 1.169
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 803 4.613 703 1.183
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2607150732291466857 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607150732291466857.eigenfacs
2607150732291466857.atom
making animated gifs
11 models are in 2607150732291466857.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150732291466857.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607150732291466857.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 803 4.211 712 1.166
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 803 4.210 713 1.148
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 803 4.216 719 1.156
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 803 4.230 722 1.150
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 803 4.251 723 1.136
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 803 4.280 727 1.142
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 803 4.316 727 1.136
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 803 4.359 726 1.137
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 803 4.408 730 1.170
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 803 4.465 729 1.181
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 803 4.527 723 1.183
2607150732291466857.10.pdb
2607150732291466857.11.pdb
2607150732291466857.7.pdb
2607150732291466857.8.pdb
2607150732291466857.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m22.506s
user 1m22.033s
sys 0m0.442s
rm: cannot remove '2607150732291466857.sdijf': No such file or directory
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