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***  GPC Profiling  ***

LOGs for ID: 2607151522121571395

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607151522121571395.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607151522121571395.atom to be opened. Openam> File opened: 2607151522121571395.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 360 First residue number = 61 Last residue number = 420 Number of atoms found = 3528 Mean number per residue = 9.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = -68.890444 +/- 15.869891 From: -104.414000 To: -29.275000 = 24.238183 +/- 10.630572 From: 0.157000 To: 50.952000 = 62.712187 +/- 11.748411 From: 33.893000 To: 94.788000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.7077 % Filled. Pdbmat> 1516735 non-zero elements. Pdbmat> 166203 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 94.22 +/- 27.31 Maximum number = 152 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 3.324060E+06 Pdbmat> Larger element = 601.195 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 360 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607151522121571395.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607151522121571395.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607151522121571395.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3528 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 360 residues. Blocpdb> 29 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 30 Blocpdb> 26 atoms in block 3 Block first atom: 46 Blocpdb> 21 atoms in block 4 Block first atom: 72 Blocpdb> 18 atoms in block 5 Block first atom: 93 Blocpdb> 19 atoms in block 6 Block first atom: 111 Blocpdb> 20 atoms in block 7 Block first atom: 130 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 150 Blocpdb> 20 atoms in block 9 Block first atom: 169 Blocpdb> 18 atoms in block 10 Block first atom: 189 Blocpdb> 16 atoms in block 11 Block first atom: 207 Blocpdb> 17 atoms in block 12 Block first atom: 223 Blocpdb> 16 atoms in block 13 Block first atom: 240 Blocpdb> 24 atoms in block 14 Block first atom: 256 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 280 Blocpdb> 22 atoms in block 16 Block first atom: 299 Blocpdb> 23 atoms in block 17 Block first atom: 321 Blocpdb> 25 atoms in block 18 Block first atom: 344 Blocpdb> 16 atoms in block 19 Block first atom: 369 Blocpdb> 19 atoms in block 20 Block first atom: 385 Blocpdb> 14 atoms in block 21 Block first atom: 404 Blocpdb> 19 atoms in block 22 Block first atom: 418 Blocpdb> 18 atoms in block 23 Block first atom: 437 Blocpdb> 20 atoms in block 24 Block first atom: 455 Blocpdb> 17 atoms in block 25 Block first atom: 475 Blocpdb> 18 atoms in block 26 Block first atom: 492 Blocpdb> 19 atoms in block 27 Block first atom: 510 Blocpdb> 25 atoms in block 28 Block first atom: 529 Blocpdb> 18 atoms in block 29 Block first atom: 554 Blocpdb> 17 atoms in block 30 Block first atom: 572 Blocpdb> 15 atoms in block 31 Block first atom: 589 Blocpdb> 24 atoms in block 32 Block first atom: 604 Blocpdb> 24 atoms in block 33 Block first atom: 628 Blocpdb> 23 atoms in block 34 Block first atom: 652 Blocpdb> 20 atoms in block 35 Block first atom: 675 Blocpdb> 18 atoms in block 36 Block first atom: 695 Blocpdb> 17 atoms in block 37 Block first atom: 713 Blocpdb> 18 atoms in block 38 Block first atom: 730 Blocpdb> 17 atoms in block 39 Block first atom: 748 Blocpdb> 23 atoms in block 40 Block first atom: 765 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 788 Blocpdb> 16 atoms in block 42 Block first atom: 805 Blocpdb> 23 atoms in block 43 Block first atom: 821 Blocpdb> 23 atoms in block 44 Block first atom: 844 Blocpdb> 24 atoms in block 45 Block first atom: 867 Blocpdb> 15 atoms in block 46 Block first atom: 891 Blocpdb> 15 atoms in block 47 Block first atom: 906 Blocpdb> 21 atoms in block 48 Block first atom: 921 Blocpdb> 16 atoms in block 49 Block first atom: 942 Blocpdb> 18 atoms in block 50 Block first atom: 958 Blocpdb> 17 atoms in block 51 Block first atom: 976 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 993 Blocpdb> 25 atoms in block 53 Block first atom: 1013 Blocpdb> 17 atoms in block 54 Block first atom: 1038 Blocpdb> 17 atoms in block 55 Block first atom: 1055 Blocpdb> 20 atoms in block 56 Block first atom: 1072 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 1092 Blocpdb> 12 atoms in block 58 Block first atom: 1109 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1121 Blocpdb> 12 atoms in block 60 Block first atom: 1142 Blocpdb> 17 atoms in block 61 Block first atom: 1154 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 1171 Blocpdb> 13 atoms in block 63 Block first atom: 1188 Blocpdb> 21 atoms in block 64 Block first atom: 1201 Blocpdb> 21 atoms in block 65 Block first atom: 1222 Blocpdb> 26 atoms in block 66 Block first atom: 1243 Blocpdb> 15 atoms in block 67 Block first atom: 1269 Blocpdb> 21 atoms in block 68 Block first atom: 1284 Blocpdb> 13 atoms in block 69 Block first atom: 1305 Blocpdb> 23 atoms in block 70 Block first atom: 1318 Blocpdb> 15 atoms in block 71 Block first atom: 1341 Blocpdb> 17 atoms in block 72 Block first atom: 1356 Blocpdb> 18 atoms in block 73 Block first atom: 1373 Blocpdb> 13 atoms in block 74 Block first atom: 1391 Blocpdb> 25 atoms in block 75 Block first atom: 1404 Blocpdb> 16 atoms in block 76 Block first atom: 1429 Blocpdb> 18 atoms in block 77 Block first atom: 1445 Blocpdb> 22 atoms in block 78 Block first atom: 1463 Blocpdb> 26 atoms in block 79 Block first atom: 1485 Blocpdb> 18 atoms in block 80 Block first atom: 1511 Blocpdb> 21 atoms in block 81 Block first atom: 1529 Blocpdb> 20 atoms in block 82 Block first atom: 1550 Blocpdb> 25 atoms in block 83 Block first atom: 1570 Blocpdb> 18 atoms in block 84 Block first atom: 1595 Blocpdb> 18 atoms in block 85 Block first atom: 1613 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1631 Blocpdb> 25 atoms in block 87 Block first atom: 1655 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1680 Blocpdb> 16 atoms in block 89 Block first atom: 1695 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 1711 Blocpdb> 14 atoms in block 91 Block first atom: 1730 Blocpdb> 18 atoms in block 92 Block first atom: 1744 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 1762 Blocpdb> 26 atoms in block 94 Block first atom: 1782 Blocpdb> 26 atoms in block 95 Block first atom: 1808 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 1834 Blocpdb> 17 atoms in block 97 Block first atom: 1857 Blocpdb> 34 atoms in block 98 Block first atom: 1874 Blocpdb> 18 atoms in block 99 Block first atom: 1908 Blocpdb> 14 atoms in block 100 Block first atom: 1926 Blocpdb> 21 atoms in block 101 Block first atom: 1940 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 1961 Blocpdb> 17 atoms in block 103 Block first atom: 1986 Blocpdb> 17 atoms in block 104 Block first atom: 2003 Blocpdb> 15 atoms in block 105 Block first atom: 2020 Blocpdb> 23 atoms in block 106 Block first atom: 2035 Blocpdb> 16 atoms in block 107 Block first atom: 2058 Blocpdb> 10 atoms in block 108 Block first atom: 2074 Blocpdb> 21 atoms in block 109 Block first atom: 2084 Blocpdb> 18 atoms in block 110 Block first atom: 2105 Blocpdb> 33 atoms in block 111 Block first atom: 2123 Blocpdb> 18 atoms in block 112 Block first atom: 2156 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2174 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 2193 Blocpdb> 22 atoms in block 115 Block first atom: 2209 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2231 Blocpdb> 16 atoms in block 117 Block first atom: 2250 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 2266 Blocpdb> 14 atoms in block 119 Block first atom: 2281 Blocpdb> 20 atoms in block 120 Block first atom: 2295 Blocpdb> 21 atoms in block 121 Block first atom: 2315 Blocpdb> 24 atoms in block 122 Block first atom: 2336 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2360 Blocpdb> 22 atoms in block 124 Block first atom: 2379 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 2401 Blocpdb> 18 atoms in block 126 Block first atom: 2417 Blocpdb> 26 atoms in block 127 Block first atom: 2435 Blocpdb> 21 atoms in block 128 Block first atom: 2461 Blocpdb> 23 atoms in block 129 Block first atom: 2482 Blocpdb> 25 atoms in block 130 Block first atom: 2505 Blocpdb> 15 atoms in block 131 Block first atom: 2530 Blocpdb> 29 atoms in block 132 Block first atom: 2545 Blocpdb> 22 atoms in block 133 Block first atom: 2574 Blocpdb> 19 atoms in block 134 Block first atom: 2596 Blocpdb> 18 atoms in block 135 Block first atom: 2615 Blocpdb> 17 atoms in block 136 Block first atom: 2633 Blocpdb> 21 atoms in block 137 Block first atom: 2650 Blocpdb> 18 atoms in block 138 Block first atom: 2671 Blocpdb> 24 atoms in block 139 Block first atom: 2689 Blocpdb> 14 atoms in block 140 Block first atom: 2713 Blocpdb> 17 atoms in block 141 Block first atom: 2727 Blocpdb> 18 atoms in block 142 Block first atom: 2744 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 2762 Blocpdb> 21 atoms in block 144 Block first atom: 2782 Blocpdb> 18 atoms in block 145 Block first atom: 2803 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 2821 Blocpdb> 20 atoms in block 147 Block first atom: 2845 Blocpdb> 26 atoms in block 148 Block first atom: 2865 Blocpdb> 18 atoms in block 149 Block first atom: 2891 Blocpdb> 14 atoms in block 150 Block first atom: 2909 Blocpdb> 21 atoms in block 151 Block first atom: 2923 Blocpdb> 18 atoms in block 152 Block first atom: 2944 Blocpdb> 22 atoms in block 153 Block first atom: 2962 Blocpdb> 27 atoms in block 154 Block first atom: 2984 Blocpdb> 30 atoms in block 155 Block first atom: 3011 Blocpdb> 20 atoms in block 156 Block first atom: 3041 Blocpdb> 20 atoms in block 157 Block first atom: 3061 Blocpdb> 18 atoms in block 158 Block first atom: 3081 Blocpdb> 18 atoms in block 159 Block first atom: 3099 Blocpdb> 17 atoms in block 160 Block first atom: 3117 Blocpdb> 16 atoms in block 161 Block first atom: 3134 Blocpdb> 20 atoms in block 162 Block first atom: 3150 Blocpdb> 25 atoms in block 163 Block first atom: 3170 Blocpdb> 16 atoms in block 164 Block first atom: 3195 Blocpdb> 16 atoms in block 165 Block first atom: 3211 Blocpdb> 22 atoms in block 166 Block first atom: 3227 Blocpdb> 20 atoms in block 167 Block first atom: 3249 Blocpdb> 19 atoms in block 168 Block first atom: 3269 Blocpdb> 23 atoms in block 169 Block first atom: 3288 Blocpdb> 17 atoms in block 170 Block first atom: 3311 Blocpdb> 18 atoms in block 171 Block first atom: 3328 Blocpdb> 22 atoms in block 172 Block first atom: 3346 Blocpdb> 18 atoms in block 173 Block first atom: 3368 Blocpdb> 20 atoms in block 174 Block first atom: 3386 Blocpdb> 18 atoms in block 175 Block first atom: 3406 Blocpdb> 19 atoms in block 176 Block first atom: 3424 Blocpdb> 18 atoms in block 177 Block first atom: 3443 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 3461 Blocpdb> 24 atoms in block 179 Block first atom: 3486 Blocpdb> 19 atoms in block 180 Block first atom: 3509 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1516915 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 10584 Prepmat> Matrix trace = 3324060.0000 Prepmat> Last element read: 10584 10584 149.2862 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14297 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3528 RTB> Total mass = 3528.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3528 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 284789.0920 RTB> 69048 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 69048 Diagstd> Projected matrix trace = 284789.0920 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 284789.0920 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.2549749 1.6842197 2.4634806 2.7233235 3.6730880 5.0941075 5.7886605 6.5271375 7.2542602 8.0791986 8.6706859 9.4005787 9.7891465 11.2628029 11.8435003 12.2259401 13.7196634 14.2030872 15.0228715 15.9892363 16.4089625 16.8645993 17.4290719 17.7483165 18.1116002 19.8884107 20.4382402 20.9975213 22.1563747 22.9571684 23.4094884 23.6855786 24.7577665 24.9298037 25.3945726 27.0989900 27.5528377 28.3625956 28.9837269 29.0831029 29.2911554 30.3394514 30.9271318 31.3386153 31.5430852 32.6211676 33.1971866 33.7004210 34.7328055 34.9094864 35.3756546 35.9472295 36.4742816 36.9995743 37.3394394 38.1839997 39.0170445 40.9344087 41.2766403 41.7274284 42.7142638 42.9455239 43.6533216 44.6550237 45.2666271 45.7860469 46.0041367 46.8729139 46.9593661 48.1866961 48.6865149 49.1549216 50.5335149 50.7556394 51.2603130 51.8163895 53.1044157 54.7085376 54.9493213 55.7146579 56.7050390 56.9585326 57.5987289 58.1625545 58.4974706 59.4890485 60.5778512 61.0634303 61.5696939 62.4224715 62.9446769 63.6036240 64.3654507 64.7663448 65.6238866 66.1934499 66.6805099 67.4799086 68.1131735 69.3157536 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034329 0.0034330 0.0034335 0.0034342 0.0034342 0.0034347 121.6501920 140.9271441 170.4393449 179.2028421 208.1186249 245.0921113 261.2668555 277.4320689 292.4770840 308.6593386 319.7584341 332.9450604 339.7564380 364.4336940 373.7105160 379.6963414 402.2230997 409.2480864 420.8930518 434.2193180 439.8816466 445.9470478 453.3487373 457.4818430 462.1401405 484.2786469 490.9271260 497.5987666 511.1456050 520.3007359 525.4014196 528.4906147 540.3199609 542.1940034 547.2247531 565.2906891 570.0047143 578.3200735 584.6182850 585.6196628 587.7106111 598.1348985 603.9001021 607.9042536 609.8841748 620.2189497 625.6708479 630.3952669 639.9782473 641.6039217 645.8735842 651.0704620 655.8260353 660.5316684 663.5584394 671.0208108 678.3010114 694.7675740 697.6658268 701.4651361 709.7113373 711.6299747 717.4703000 725.6554186 730.6078734 734.7876606 736.5355657 743.4576881 744.1429873 753.8047249 757.7040773 761.3402394 771.9426455 773.6373560 777.4740585 781.6797381 791.3354065 803.1983976 804.9639785 810.5503811 817.7228000 819.5485315 824.1413979 828.1652747 830.5462550 837.5558796 845.1858398 848.5664929 852.0768725 857.9574703 861.5386881 866.0365295 871.2076648 873.9165703 879.6831112 883.4923401 886.7368081 892.0362909 896.2121717 904.0891450 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3528 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.255 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.684 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.463 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.723 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.673 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.094 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.789 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.527 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.254 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.079 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.671 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.401 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.789 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.32 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99995 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 63504 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99995 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607151522121571395.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607151522121571395.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607151522121571395.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607151522121571395.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 360 First residue number = 61 Last residue number = 420 Number of atoms found = 3528 Mean number per residue = 9.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9939E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.255 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.684 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.463 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.723 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.673 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.094 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.789 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.527 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.254 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.079 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.671 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.401 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.789 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.32 Bfactors> 106 vectors, 10584 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.255000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.022 +/- 0.04 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.022 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607151522121571395.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607151522121571395.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.6 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Chkmod> That is: 3528 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2607151522121571395 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom making animated gifs 11 models are in 2607151522121571395.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607151522121571395.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607151522121571395.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2607151522121571395 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607151522121571395.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2607151522121571395 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607151522121571395.eigenfacs 2607151522121571395.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607151522121571395.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607151522121571395.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2607151522121571395.10.pdb 2607151522121571395.11.pdb 2607151522121571395.7.pdb 2607151522121571395.8.pdb 2607151522121571395.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m21.097s user 0m20.873s sys 0m0.209s rm: cannot remove '2607151522121571395.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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