*** dar29 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607160252271657563.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607160252271657563.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607160252271657563.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2608
First residue number = 1
Last residue number = 719
Number of atoms found = 20408
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.043436 +/- 27.173883 From: -75.620000 To: 75.811000
= 0.284342 +/- 25.817241 From: -61.063000 To: 63.163000
= 25.654853 +/- 33.230232 From: -40.604000 To: 119.551000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is -2.5291 % Filled.
Pdbmat> 6911200 non-zero elements.
Pdbmat> 754418 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 73.93 +/- 26.79
Maximum number = 128
Minimum number = 7
Pdbmat> Matrix trace = 1.508836E+07
Pdbmat> Larger element = 513.529
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607160252271657563.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 8
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607160252271657563.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607160252271657563.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 20408 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 8 residue(s) per block.
Blocpdb> 2608 residues.
Blocpdb> 60 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 42 atoms in block 2
Block first atom: 61
Blocpdb> 58 atoms in block 3
Block first atom: 103
Blocpdb> 53 atoms in block 4
Block first atom: 161
Blocpdb> 59 atoms in block 5
Block first atom: 214
Blocpdb> 54 atoms in block 6
Block first atom: 273
Blocpdb> 55 atoms in block 7
Block first atom: 327
Blocpdb> 69 atoms in block 8
Block first atom: 382
Blocpdb> 53 atoms in block 9
Block first atom: 451
Blocpdb> 54 atoms in block 10
Block first atom: 504
Blocpdb> 57 atoms in block 11
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Blocpdb> 58 atoms in block 271
Block first atom: 16736
Blocpdb> 43 atoms in block 272
Block first atom: 16794
Blocpdb> 63 atoms in block 273
Block first atom: 16837
Blocpdb> 69 atoms in block 274
Block first atom: 16900
Blocpdb> 69 atoms in block 275
Block first atom: 16969
Blocpdb> 60 atoms in block 276
Block first atom: 17038
Blocpdb> 81 atoms in block 277
Block first atom: 17098
Blocpdb> 64 atoms in block 278
Block first atom: 17179
Blocpdb> 61 atoms in block 279
Block first atom: 17243
Blocpdb> 67 atoms in block 280
Block first atom: 17304
Blocpdb> 60 atoms in block 281
Block first atom: 17371
Blocpdb> 69 atoms in block 282
Block first atom: 17431
Blocpdb> 69 atoms in block 283
Block first atom: 17500
Blocpdb> 70 atoms in block 284
Block first atom: 17569
Blocpdb> 55 atoms in block 285
Block first atom: 17639
Blocpdb> 67 atoms in block 286
Block first atom: 17694
Blocpdb> 76 atoms in block 287
Block first atom: 17761
Blocpdb> 60 atoms in block 288
Block first atom: 17837
Blocpdb> 67 atoms in block 289
Block first atom: 17897
Blocpdb> 52 atoms in block 290
Block first atom: 17964
Blocpdb> 61 atoms in block 291
Block first atom: 18016
Blocpdb> 47 atoms in block 292
Block first atom: 18077
Blocpdb> 65 atoms in block 293
Block first atom: 18124
Blocpdb> 72 atoms in block 294
Block first atom: 18189
Blocpdb> 70 atoms in block 295
Block first atom: 18261
Blocpdb> 56 atoms in block 296
Block first atom: 18331
Blocpdb> 65 atoms in block 297
Block first atom: 18387
Blocpdb> 75 atoms in block 298
Block first atom: 18452
Blocpdb> 57 atoms in block 299
Block first atom: 18527
Blocpdb> 65 atoms in block 300
Block first atom: 18584
Blocpdb> 61 atoms in block 301
Block first atom: 18649
Blocpdb> 63 atoms in block 302
Block first atom: 18710
Blocpdb> 64 atoms in block 303
Block first atom: 18773
Blocpdb> 69 atoms in block 304
Block first atom: 18837
Blocpdb> 72 atoms in block 305
Block first atom: 18906
Blocpdb> 68 atoms in block 306
Block first atom: 18978
Blocpdb> 69 atoms in block 307
Block first atom: 19046
Blocpdb> 61 atoms in block 308
Block first atom: 19115
Blocpdb> 65 atoms in block 309
Block first atom: 19176
Blocpdb> 58 atoms in block 310
Block first atom: 19241
Blocpdb> 78 atoms in block 311
Block first atom: 19299
Blocpdb> 70 atoms in block 312
Block first atom: 19377
Blocpdb> 58 atoms in block 313
Block first atom: 19447
Blocpdb> 61 atoms in block 314
Block first atom: 19505
Blocpdb> 70 atoms in block 315
Block first atom: 19566
Blocpdb> 68 atoms in block 316
Block first atom: 19636
Blocpdb> 65 atoms in block 317
Block first atom: 19704
Blocpdb> 63 atoms in block 318
Block first atom: 19769
Blocpdb> 58 atoms in block 319
Block first atom: 19832
Blocpdb> 54 atoms in block 320
Block first atom: 19890
Blocpdb> 70 atoms in block 321
Block first atom: 19944
Blocpdb> 68 atoms in block 322
Block first atom: 20014
Blocpdb> 54 atoms in block 323
Block first atom: 20082
Blocpdb> 54 atoms in block 324
Block first atom: 20136
Blocpdb> 53 atoms in block 325
Block first atom: 20190
Blocpdb> 54 atoms in block 326
Block first atom: 20243
Blocpdb> 60 atoms in block 327
Block first atom: 20297
Blocpdb> 52 atoms in block 328
Block first atom: 20356
Blocpdb> 328 blocks.
Blocpdb> At most, 81 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 42 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 6911528 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 61224
Prepmat> Matrix trace = 15088360.0001
Prepmat> Last element read: 61224 61224 40.5633
Prepmat> 53957 lines saved.
Prepmat> 51885 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 20408
RTB> Total mass = 20408.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 20408
RTB> Number of blocks = 328
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 257355.6461
RTB> 69636 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1968
Diagstd> Nb of non-zero elements: 69636
Diagstd> Projected matrix trace = 257355.6461
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1968 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 257355.6461
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000254 0.0000272 0.0000341 0.0000374
0.0000398 0.0000465 0.0000505 0.0000556 0.0003208
0.0003363 0.0003746 0.0005362 0.0005999 0.0007874
0.0008139 0.0009128 0.0022069 0.0025783 0.0029151
0.0030943 0.0049872 0.0059009 0.0060499 0.0076998
0.0098018 0.0103189 0.0119057 0.0127858 0.0145807
0.0156676 0.0185514 0.0199142 0.0253618 0.0262478
0.0318340 0.0334181 0.0381192 0.0421834 0.0441550
0.0466804 0.0488209 0.0603586 0.0642314 0.0671148
0.0688048 0.0698527 0.0712414 0.0740059 0.0907928
0.0922242 0.0997355 0.1046207 0.1075328 0.1080119
0.1234115 0.1526194 0.1762486 0.1790389 0.1875922
0.1964431 0.1992092 0.2045577 0.2049389 0.2103318
0.2146829 0.2330763 0.2348886 0.2470432 0.2540764
0.2559294 0.2700397 0.2829589 0.3001168 0.3235354
0.3348395 0.3606241 0.3934027 0.3999629 0.4076905
0.4158599 0.4168870 0.4262364 0.4439141 0.4447140
0.4558867 0.4584025 0.4729157 0.5201866 0.5362196
0.5526431 0.5768013 0.5824800 0.6139573 0.6183916
0.6292457 0.6623392 0.6954411 0.7071487 0.7486165
0.7528332
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034341
0.0034354 0.5469534 0.5668501 0.6339032 0.6636577
0.6853758 0.7404085 0.7714197 0.8094115 1.9448622
1.9913624 2.1018466 2.5146247 2.6597629 3.0471176
3.0980534 3.2808962 5.1013689 5.5139249 5.8630294
6.0405039 7.6687284 8.3416899 8.4463710 9.5287514
10.7509756 11.0309105 11.8487458 12.2788710 13.1124506
13.5924080 14.7905354 15.3241651 17.2936071 17.5930598
19.3749605 19.8511699 21.2015230 22.3031324 22.8183921
23.4618714 23.9937421 26.6787127 27.5213013 28.1322432
28.4842410 28.7003275 28.9842028 29.5412216 32.7205811
32.9775046 34.2941511 35.1240062 35.6094968 35.6887299
38.1481109 42.4228741 45.5887977 45.9482516 47.0329962
48.1297595 48.4674279 49.1137615 49.1594999 49.8021150
50.3145949 52.4257115 52.6291339 53.9736448 54.7365571
54.9357940 56.4298757 57.7639597 59.4895147 61.7669570
62.8367364 65.2112654 68.1104791 68.6760258 69.3362866
70.0275275 70.1139544 70.8958030 72.3510358 72.4161925
73.3202132 73.5222470 74.6770494 78.3203903 79.5182146
80.7267858 82.4723514 82.8773343 85.0872228 85.3939421
86.1401052 88.3762393 90.5577169 91.3167918 93.9560996
94.2203399
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 20408
Rtb_to_modes> Number of blocs = 328
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5369E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.7249E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.4077E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7351E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.9835E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6489E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.0465E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.5558E-05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2077E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3629E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7464E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.3624E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.9992E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.8739E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.1393E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.1284E-04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2069E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5783E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.9151E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0943E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9872E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.9009E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.0499E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.6998E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.8018E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0319E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1906E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2786E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4581E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5668E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8551E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9914E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5362E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6248E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1834E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3418E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8119E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.2183E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.4155E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6680E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.8821E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.0359E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.4231E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.7115E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.8805E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.9853E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1241E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.4006E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.0793E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.2224E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9735E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1046
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1075
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1080
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1234
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1526
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1762
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1790
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1876
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1964
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1992
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2046
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2049
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2103
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2147
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2331
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2349
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2470
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2541
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2559
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2700
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2830
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3001
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3235
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3348
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3606
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3934
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4000
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4077
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4159
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4169
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4262
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4439
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4447
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4559
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4584
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4729
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5202
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5362
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5526
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5768
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5825
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6140
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6184
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6292
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6623
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6954
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7071
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7486
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7528
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1968 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 1.00004
1.00000 0.99995 1.00004 1.00003 1.00005
0.99995 1.00000 1.00000 0.99999 0.99996
1.00001 0.99997 0.99994 0.99999 0.99997
1.00004 0.99997 1.00001 0.99999 0.99995
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
0.99996 1.00004 0.99998 1.00002 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99996
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
0.99999 0.99995 1.00000 0.99999 1.00003
1.00001 1.00003 0.99998 0.99997 1.00003
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 0.99998 0.99998 1.00005 0.99998
1.00003 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 1.00003
1.00000 0.99998 1.00005 0.99998 0.99999
1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 1.00005
0.99999 1.00004 1.00000 1.00003 0.99999
1.00001 0.99995 1.00004 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 1.00001
1.00005
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 367344 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 1.00004
1.00000 0.99995 1.00004 1.00003 1.00005
0.99995 1.00000 1.00000 0.99999 0.99996
1.00001 0.99997 0.99994 0.99999 0.99997
1.00004 0.99997 1.00001 0.99999 0.99995
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
0.99996 1.00004 0.99998 1.00002 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99996
1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
0.99999 0.99995 1.00000 0.99999 1.00003
1.00001 1.00003 0.99998 0.99997 1.00003
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 0.99998 0.99998 1.00005 0.99998
1.00003 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 1.00003
1.00000 0.99998 1.00005 0.99998 0.99999
1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 1.00005
0.99999 1.00004 1.00000 1.00003 0.99999
1.00001 0.99995 1.00004 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 1.00001
1.00005
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607160252271657563.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607160252271657563.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607160252271657563.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607160252271657563.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2608
First residue number = 1
Last residue number = 719
Number of atoms found = 20408
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5369E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.7249E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.4077E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7351E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9835E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6489E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.0465E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.5558E-05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2077E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3629E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7464E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.3624E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9992E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.8739E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.1393E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.1284E-04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2069E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5783E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9151E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0943E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9872E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9009E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.0499E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.6998E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8018E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0319E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1906E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2786E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4581E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5668E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8551E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9914E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5362E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6248E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1834E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3418E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8119E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.2183E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.4155E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6680E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.8821E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.0359E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.4231E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.7115E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.8805E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.9853E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.1241E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.4006E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.0793E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.2224E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9735E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1046
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1075
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1080
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1234
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1526
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1762
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1790
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1876
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1964
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1992
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2046
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2049
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2103
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2147
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2331
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2349
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2470
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2541
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2559
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2700
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2830
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3001
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3235
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3348
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3606
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3934
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4000
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4077
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4159
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4169
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4262
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4439
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4447
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4559
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4584
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4729
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5202
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5362
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5526
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5768
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5825
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6140
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6184
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6292
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6623
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6954
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7071
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7486
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7528
Bfactors> 106 vectors, 61224 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000025
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.437 for 2608 C-alpha atoms.
Bfactors> = 205.888 +/- 982.78
Bfactors> = 73.799 +/- 23.03
Bfactors> Shiftng-fct= -132.089
Bfactors> Scaling-fct= 0.023
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607160252271657563.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607160252271657563.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.5469
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.5668
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.6339
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.6636
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.6853
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.7404
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.7714
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.8094
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.21
Chkmod> 106 vectors, 61224 coordinates in file.
Chkmod> That is: 20408 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 23 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 37 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 83 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7550
0.0034 0.7238
0.0034 0.9865
0.0034 0.6175
0.0034 0.9747
0.0034 0.7000
0.5469 0.0139
0.5668 0.0177
0.6339 0.0229
0.6636 0.0331
0.6853 0.0131
0.7404 0.0142
0.7714 0.0138
0.8094 0.0145
1.9448 0.0292
1.9913 0.0448
2.1018 0.0327
2.5145 0.0263
2.6596 0.0310
3.0470 0.0231
3.0979 0.0235
3.2808 0.0207
5.1011 0.0253
5.5137 0.0284
5.8628 0.0242
6.0403 0.0191
7.6684 0.0226
8.3413 0.0334
8.4460 0.0407
9.5283 0.0204
10.7505 0.0282
11.0305 0.0289
11.8484 0.0244
12.2785 0.0220
13.1120 0.0296
13.5920 0.0322
14.7897 0.0181
15.3234 0.0163
17.2929 0.0130
17.5924 0.0197
19.3741 0.0131
19.8503 0.0098
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22.8174 0.0195
23.4608 0.0209
23.9927 0.0188
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48.4642 0.0194
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49.1527 0.0205
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52.4261 0.0173
52.6282 0.0230
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56.4233 0.0907
57.7657 0.1997
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70.1120 0.2170
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getting mode 7
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normal mode computation
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normal mode computation
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2607160252271657563.eigenfacs
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2607160252271657563.eigenfacs
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normal mode computation
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getting mode 11
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-500
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 4m44.062s
user 4m43.137s
sys 0m0.842s
rm: cannot remove '2607160252271657563.sdijf': No such file or directory
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