*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607160412491670535.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607160412491670535.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607160412491670535.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 294
First residue number = 325
Last residue number = 9
Number of atoms found = 2270
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 17.230655 +/- 9.522958 From: -5.779000 To: 41.106000
= 16.617563 +/- 10.566563 From: -5.949000 To: 43.542000
= 6.906515 +/- 10.307392 From: -13.739000 To: 33.693000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.8571 % Filled.
Pdbmat> 894524 non-zero elements.
Pdbmat> 97891 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 86.25 +/- 23.44
Maximum number = 132
Minimum number = 18
Pdbmat> Matrix trace = 1.957820E+06
Pdbmat> Larger element = 533.651
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
294 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607160412491670535.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607160412491670535.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607160412491670535.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2270 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 294 residues.
Blocpdb> 15 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 16 atoms in block 2
Block first atom: 16
Blocpdb> 19 atoms in block 3
Block first atom: 32
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 51
Blocpdb> 16 atoms in block 5
Block first atom: 60
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 76
Blocpdb> 15 atoms in block 7
Block first atom: 98
Blocpdb> 14 atoms in block 8
Block first atom: 113
Blocpdb> 20 atoms in block 9
Block first atom: 127
Blocpdb> 14 atoms in block 10
Block first atom: 147
Blocpdb> 20 atoms in block 11
Block first atom: 161
Blocpdb> 13 atoms in block 12
Block first atom: 181
Blocpdb> 12 atoms in block 13
Block first atom: 194
Blocpdb> 21 atoms in block 14
Block first atom: 206
Blocpdb> 19 atoms in block 15
Block first atom: 227
Blocpdb> 13 atoms in block 16
Block first atom: 246
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 259
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 275
Blocpdb> 18 atoms in block 19
Block first atom: 291
Blocpdb> 10 atoms in block 20
Block first atom: 309
Blocpdb> 13 atoms in block 21
Block first atom: 319
Blocpdb> 10 atoms in block 22
Block first atom: 332
Blocpdb> 14 atoms in block 23
Block first atom: 342
Blocpdb> 8 atoms in block 24
Block first atom: 356
Blocpdb> 16 atoms in block 25
Block first atom: 364
Blocpdb> 17 atoms in block 26
Block first atom: 380
Blocpdb> 11 atoms in block 27
Block first atom: 397
Blocpdb> 15 atoms in block 28
Block first atom: 408
Blocpdb> 16 atoms in block 29
Block first atom: 423
Blocpdb> 13 atoms in block 30
Block first atom: 439
Blocpdb> 12 atoms in block 31
Block first atom: 452
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 464
Blocpdb> 14 atoms in block 33
Block first atom: 479
Blocpdb> 11 atoms in block 34
Block first atom: 493
Blocpdb> 16 atoms in block 35
Block first atom: 504
Blocpdb> 18 atoms in block 36
Block first atom: 520
Blocpdb> 15 atoms in block 37
Block first atom: 538
Blocpdb> 15 atoms in block 38
Block first atom: 553
Blocpdb> 17 atoms in block 39
Block first atom: 568
Blocpdb> 20 atoms in block 40
Block first atom: 585
Blocpdb> 13 atoms in block 41
Block first atom: 605
Blocpdb> 12 atoms in block 42
Block first atom: 618
Blocpdb> 14 atoms in block 43
Block first atom: 630
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 644
Blocpdb> 19 atoms in block 45
Block first atom: 658
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 677
Blocpdb> 11 atoms in block 47
Block first atom: 696
Blocpdb> 11 atoms in block 48
Block first atom: 707
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 718
Blocpdb> 14 atoms in block 50
Block first atom: 734
Blocpdb> 20 atoms in block 51
Block first atom: 748
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 768
Blocpdb> 8 atoms in block 53
Block first atom: 780
Blocpdb> 16 atoms in block 54
Block first atom: 788
Blocpdb> 10 atoms in block 55
Block first atom: 804
Blocpdb> 18 atoms in block 56
Block first atom: 814
Blocpdb> 18 atoms in block 57
Block first atom: 832
Blocpdb> 13 atoms in block 58
Block first atom: 850
Blocpdb> 20 atoms in block 59
Block first atom: 863
Blocpdb> 21 atoms in block 60
Block first atom: 883
Blocpdb> 16 atoms in block 61
Block first atom: 904
Blocpdb> 19 atoms in block 62
Block first atom: 920
Blocpdb> 23 atoms in block 63
Block first atom: 939
Blocpdb> 18 atoms in block 64
Block first atom: 962
Blocpdb> 12 atoms in block 65
Block first atom: 980
Blocpdb> 15 atoms in block 66
Block first atom: 992
Blocpdb> 15 atoms in block 67
Block first atom: 1007
Blocpdb> 22 atoms in block 68
Block first atom: 1022
Blocpdb> 12 atoms in block 69
Block first atom: 1044
Blocpdb> 11 atoms in block 70
Block first atom: 1056
Blocpdb> 12 atoms in block 71
Block first atom: 1067
Blocpdb> 15 atoms in block 72
Block first atom: 1079
Blocpdb> 19 atoms in block 73
Block first atom: 1094
Blocpdb> 16 atoms in block 74
Block first atom: 1113
Blocpdb> 17 atoms in block 75
Block first atom: 1129
Blocpdb> 11 atoms in block 76
Block first atom: 1146
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1157
Blocpdb> 12 atoms in block 78
Block first atom: 1172
Blocpdb> 15 atoms in block 79
Block first atom: 1184
Blocpdb> 19 atoms in block 80
Block first atom: 1199
Blocpdb> 14 atoms in block 81
Block first atom: 1218
Blocpdb> 14 atoms in block 82
Block first atom: 1232
Blocpdb> 18 atoms in block 83
Block first atom: 1246
Blocpdb> 19 atoms in block 84
Block first atom: 1264
Blocpdb> 20 atoms in block 85
Block first atom: 1283
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1303
Blocpdb> 25 atoms in block 87
Block first atom: 1320
Blocpdb> 16 atoms in block 88
Block first atom: 1345
Blocpdb> 12 atoms in block 89
Block first atom: 1361
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 1373
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1389
Blocpdb> 17 atoms in block 92
Block first atom: 1404
Blocpdb> 9 atoms in block 93
Block first atom: 1421
Blocpdb> 11 atoms in block 94
Block first atom: 1430
Blocpdb> 13 atoms in block 95
Block first atom: 1441
Blocpdb> 18 atoms in block 96
Block first atom: 1454
Blocpdb> 14 atoms in block 97
Block first atom: 1472
Blocpdb> 20 atoms in block 98
Block first atom: 1486
Blocpdb> 10 atoms in block 99
Block first atom: 1506
Blocpdb> 8 atoms in block 100
Block first atom: 1516
Blocpdb> 20 atoms in block 101
Block first atom: 1524
Blocpdb> 13 atoms in block 102
Block first atom: 1544
Blocpdb> 17 atoms in block 103
Block first atom: 1557
Blocpdb> 16 atoms in block 104
Block first atom: 1574
Blocpdb> 13 atoms in block 105
Block first atom: 1590
Blocpdb> 20 atoms in block 106
Block first atom: 1603
Blocpdb> 20 atoms in block 107
Block first atom: 1623
Blocpdb> 16 atoms in block 108
Block first atom: 1643
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 1659
Blocpdb> 21 atoms in block 110
Block first atom: 1675
Blocpdb> 18 atoms in block 111
Block first atom: 1696
Blocpdb> 12 atoms in block 112
Block first atom: 1714
Blocpdb> 15 atoms in block 113
Block first atom: 1726
Blocpdb> 19 atoms in block 114
Block first atom: 1741
Blocpdb> 22 atoms in block 115
Block first atom: 1760
Blocpdb> 11 atoms in block 116
Block first atom: 1782
Blocpdb> 12 atoms in block 117
Block first atom: 1793
Blocpdb> 15 atoms in block 118
Block first atom: 1805
Blocpdb> 17 atoms in block 119
Block first atom: 1820
Blocpdb> 13 atoms in block 120
Block first atom: 1837
Blocpdb> 19 atoms in block 121
Block first atom: 1850
Blocpdb> 19 atoms in block 122
Block first atom: 1869
Blocpdb> 12 atoms in block 123
Block first atom: 1888
Blocpdb> 16 atoms in block 124
Block first atom: 1900
Blocpdb> 12 atoms in block 125
Block first atom: 1916
Blocpdb> 17 atoms in block 126
Block first atom: 1928
Blocpdb> 19 atoms in block 127
Block first atom: 1945
Blocpdb> 14 atoms in block 128
Block first atom: 1964
Blocpdb> 16 atoms in block 129
Block first atom: 1978
Blocpdb> 18 atoms in block 130
Block first atom: 1994
Blocpdb> 15 atoms in block 131
Block first atom: 2012
Blocpdb> 15 atoms in block 132
Block first atom: 2027
Blocpdb> 15 atoms in block 133
Block first atom: 2042
Blocpdb> 20 atoms in block 134
Block first atom: 2057
Blocpdb> 16 atoms in block 135
Block first atom: 2077
Blocpdb> 18 atoms in block 136
Block first atom: 2093
Blocpdb> 15 atoms in block 137
Block first atom: 2111
Blocpdb> 10 atoms in block 138
Block first atom: 2126
Blocpdb> 17 atoms in block 139
Block first atom: 2136
Blocpdb> 11 atoms in block 140
Block first atom: 2153
Blocpdb> 11 atoms in block 141
Block first atom: 2164
Blocpdb> 12 atoms in block 142
Block first atom: 2175
Blocpdb> 8 atoms in block 143
Block first atom: 2187
Blocpdb> 13 atoms in block 144
Block first atom: 2195
Blocpdb> 18 atoms in block 145
Block first atom: 2208
Blocpdb> 16 atoms in block 146
Block first atom: 2226
Blocpdb> 20 atoms in block 147
Block first atom: 2242
Blocpdb> 9 atoms in block 148
Block first atom: 2261
Blocpdb> 148 blocks.
Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 894672 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6810
Prepmat> Matrix trace = 1957820.0000
Prepmat> Last element read: 6810 6810 176.7736
Prepmat> 11027 lines saved.
Prepmat> 9245 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2270
RTB> Total mass = 2270.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2270
RTB> Number of blocks = 148
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 220763.8923
RTB> 61896 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 888
Diagstd> Nb of non-zero elements: 61896
Diagstd> Projected matrix trace = 220763.8923
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 888 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 220763.8923
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 6.5218453 6.7587302 7.9152935 12.8541597
13.7773503 14.1787510 14.3166299 15.2687974 15.5030880
16.1187143 18.0264563 18.6666462 18.7665611 19.3283700
19.8750140 20.5733802 22.8562987 23.3211373 24.7071226
25.2027207 27.3128180 27.8686529 28.6334443 29.9741570
31.2995038 32.3328727 32.7223509 33.2022950 34.8095444
35.0170906 35.4615668 37.0564398 38.0680546 38.4320038
39.2942519 40.0463013 40.9117632 41.8219911 43.7560346
44.3263328 44.7964913 45.0035671 45.5632139 47.1461362
47.6343763 49.4041383 49.8218639 50.6954587 51.2597681
51.7625013 52.9131935 54.1831753 55.1101761 55.6016792
56.3853364 57.9027127 58.2748276 59.1244668 59.6103583
60.1075375 60.7324359 61.3149270 62.2469020 63.7852825
64.1390316 65.2187886 65.3222457 66.2603207 67.3456767
67.8508039 68.0969537 68.4006480 70.0765048 70.9581525
71.5269716 72.4990314 72.8789838 74.0346360 74.6255154
75.4085673 76.4935681 77.2794043 77.4416570 78.1981467
78.5022008 80.0991533 80.3805807 81.0848911 81.9996707
83.4828076 84.2828395 84.5312519 85.0536368 86.1926807
87.4054596 87.7802339 87.8904184 89.0168222 90.0840623
90.9996001
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034329 0.0034331 0.0034336 0.0034339 0.0034340
0.0034350 277.3195755 282.3110221 305.5123641 389.3293332
403.0678241 408.8973243 410.8806409 424.3240983 427.5672048
435.9738886 461.0525835 469.1680485 470.4220048 477.4115214
484.1155156 492.5474849 519.1564231 524.4090080 539.7670445
545.1537366 567.5165561 573.2621505 581.0748466 594.5231487
607.5247932 617.4722245 621.1800928 625.7189850 640.6848428
642.5919933 646.6573834 661.0390667 670.0012640 673.1964149
680.7063354 687.1894534 694.5753700 702.2595158 718.3138804
722.9798305 726.8039517 728.4818731 732.9974356 745.6213476
749.4721886 763.2678058 766.4878340 773.1785707 777.4699263
781.2731647 789.9093730 799.3325650 806.1413157 809.7281431
815.4143843 826.3132860 828.9642069 834.9854330 838.4094143
841.8985246 846.2635405 850.3121562 856.7500750 867.2723923
869.6739863 876.9637550 877.6590463 883.9384941 891.1486239
894.4844168 896.1054581 898.1014311 909.0368664 914.7373871
918.3964559 924.6159534 927.0356473 934.3568051 938.0780028
942.9868254 949.7465838 954.6126020 955.6142089 960.2703302
962.1354054 971.8723870 973.5782206 977.8342594 983.3346311
992.1876193 996.9304461 998.3985248 1001.4787175 1008.1623490
1015.2302756 1017.4044832 1018.0428221 1024.5456728 1030.6691129
1035.8932956
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2270
Rtb_to_modes> Number of blocs = 148
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.00
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 888 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999
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0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997
1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998
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1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000
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1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 40860 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
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1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000
0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 0.99998
0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002
1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000
0.99998 1.00001 0.99999 0.99996 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607160412491670535.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607160412491670535.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607160412491670535.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607160412491670535.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 294
First residue number = 325
Last residue number = 9
Number of atoms found = 2270
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.759
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.915
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.32
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.97
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.79
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.50
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.00
Bfactors> 106 vectors, 6810 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 6.522000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.458 for 294 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.017 +/- 0.02
Bfactors> = 15.321 +/- 3.78
Bfactors> Shiftng-fct= 15.304
Bfactors> Scaling-fct= 185.242
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607160412491670535.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607160412491670535.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 962.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1025.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036.
Chkmod> 106 vectors, 6810 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2270 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 42 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 96 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8579
0.0034 0.7679
0.0034 0.9481
0.0034 0.8579
0.0034 0.7715
0.0034 0.7513
277.3110 0.3515
282.3045 0.4900
305.4936 0.0544
389.2496 0.2371
403.0893 0.3688
408.8978 0.4261
410.9114 0.4233
424.3226 0.5754
427.5063 0.6955
435.9726 0.4394
461.0781 0.1980
469.1901 0.4423
470.4449 0.6760
477.4112 0.4886
484.1555 0.2804
492.4859 0.3785
519.1762 0.2040
524.3737 0.2931
539.7753 0.3706
545.1009 0.8216
567.4629 0.2815
573.2514 0.2737
581.0150 0.3001
594.4564 0.3178
607.5035 0.3596
617.4183 0.3982
621.1311 0.2646
625.6705 0.1749
640.6615 0.5693
642.5911 0.3897
646.6153 0.3498
661.0424 0.5679
669.9896 0.6081
673.1500 0.5243
680.6403 0.4207
687.1917 0.4587
694.5306 0.4273
702.2127 0.5097
718.3156 0.5951
722.9787 0.3912
726.8012 0.4428
728.4217 0.4715
732.9401 0.4171
745.6199 0.4261
749.4056 0.4629
763.2031 0.3748
766.4406 0.4731
773.1800 0.3466
777.4383 0.4560
781.2208 0.3124
789.8516 0.3303
799.2748 0.3609
806.1054 0.4163
809.6812 0.4017
815.4131 0.2971
826.2585 0.4280
828.8943 0.3294
834.9180 0.3365
838.3709 0.3977
841.8796 0.5273
846.2102 0.4769
850.2415 0.4021
856.7346 0.4515
867.2672 0.5091
869.6432 0.4097
876.9343 0.3796
877.6063 0.3704
883.8984 0.3918
891.1390 0.4029
894.4407 0.4221
896.0870 0.3095
898.0586 0.4480
909.0205 0.3216
914.7100 0.4353
918.3765 0.5158
924.5824 0.3059
927.0023 0.3578
934.2874 0.4119
938.0659 0.1923
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m9.213s
user 0m9.145s
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rm: cannot remove '2607160412491670535.sdijf': No such file or directory
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