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***  CR3  ***

LOGs for ID: 2607161113431728021

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607161113431728021.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607161113431728021.atom to be opened. Openam> File opened: 2607161113431728021.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 570 First residue number = 1 Last residue number = 134 Number of atoms found = 4434 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 85.703139 +/- 18.127812 From: 48.004000 To: 127.146000 = 80.408041 +/- 11.547704 From: 50.169000 To: 109.147000 = 23.679619 +/- 21.509042 From: -31.073000 To: 60.200000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8624 % Filled. Pdbmat> 1647800 non-zero elements. Pdbmat> 180159 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.26 +/- 23.49 Maximum number = 138 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 3.603180E+06 Pdbmat> Larger element = 515.408 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 570 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607161113431728021.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607161113431728021.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607161113431728021.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4434 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 570 residues. Blocpdb> 21 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 22 Blocpdb> 27 atoms in block 3 Block first atom: 47 Blocpdb> 23 atoms in block 4 Block first atom: 74 Blocpdb> 20 atoms in block 5 Block first atom: 97 Blocpdb> 13 atoms in block 6 Block first atom: 117 Blocpdb> 26 atoms in block 7 Block first atom: 130 Blocpdb> 20 atoms in block 8 Block first atom: 156 Blocpdb> 22 atoms in block 9 Block first atom: 176 Blocpdb> 22 atoms in block 10 Block first atom: 198 Blocpdb> 22 atoms in block 11 Block first atom: 220 Blocpdb> 28 atoms in block 12 Block first atom: 242 Blocpdb> 25 atoms in block 13 Block first atom: 270 Blocpdb> 32 atoms in block 14 Block first atom: 295 Blocpdb> 24 atoms in block 15 Block first atom: 327 Blocpdb> 26 atoms in block 16 Block first atom: 351 Blocpdb> 24 atoms in block 17 Block first atom: 377 Blocpdb> 22 atoms in block 18 Block first atom: 401 Blocpdb> 25 atoms in block 19 Block first atom: 423 Blocpdb> 25 atoms in block 20 Block first atom: 448 Blocpdb> 25 atoms in block 21 Block first atom: 473 Blocpdb> 24 atoms in block 22 Block first atom: 498 Blocpdb> 27 atoms in block 23 Block first atom: 522 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 549 Blocpdb> 21 atoms in block 25 Block first atom: 566 Blocpdb> 27 atoms in block 26 Block first atom: 587 Blocpdb> 23 atoms in block 27 Block first atom: 614 Blocpdb> 27 atoms in block 28 Block first atom: 637 Blocpdb> 20 atoms in block 29 Block first atom: 664 Blocpdb> 26 atoms in block 30 Block first atom: 684 Blocpdb> 27 atoms in block 31 Block first atom: 710 Blocpdb> 19 atoms in block 32 Block first atom: 737 Blocpdb> 23 atoms in block 33 Block first atom: 756 Blocpdb> 21 atoms in block 34 Block first atom: 779 Blocpdb> 23 atoms in block 35 Block first atom: 800 Blocpdb> 21 atoms in block 36 Block first atom: 823 Blocpdb> 16 atoms in block 37 Block first atom: 844 Blocpdb> 31 atoms in block 38 Block first atom: 860 Blocpdb> 25 atoms in block 39 Block first atom: 891 Blocpdb> 27 atoms in block 40 Block first atom: 916 Blocpdb> 19 atoms in block 41 Block first atom: 943 Blocpdb> 27 atoms in block 42 Block first atom: 962 Blocpdb> 22 atoms in block 43 Block first atom: 989 Blocpdb> 22 atoms in block 44 Block first atom: 1011 Blocpdb> 28 atoms in block 45 Block first atom: 1033 Blocpdb> 20 atoms in block 46 Block first atom: 1061 Blocpdb> 23 atoms in block 47 Block first atom: 1081 Blocpdb> 24 atoms in block 48 Block first atom: 1104 Blocpdb> 26 atoms in block 49 Block first atom: 1128 Blocpdb> 21 atoms in block 50 Block first atom: 1154 Blocpdb> 23 atoms in block 51 Block first atom: 1175 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1198 Blocpdb> 23 atoms in block 53 Block first atom: 1221 Blocpdb> 23 atoms in block 54 Block first atom: 1244 Blocpdb> 22 atoms in block 55 Block first atom: 1267 Blocpdb> 27 atoms in block 56 Block first atom: 1289 Blocpdb> 21 atoms in block 57 Block first atom: 1316 Blocpdb> 19 atoms in block 58 Block first atom: 1337 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1356 Blocpdb> 18 atoms in block 60 Block first atom: 1377 Blocpdb> 27 atoms in block 61 Block first atom: 1395 Blocpdb> 22 atoms in block 62 Block first atom: 1422 Blocpdb> 28 atoms in block 63 Block first atom: 1444 Blocpdb> 28 atoms in block 64 Block first atom: 1472 Blocpdb> 25 atoms in block 65 Block first atom: 1500 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 1525 Blocpdb> 21 atoms in block 67 Block first atom: 1545 Blocpdb> 18 atoms in block 68 Block first atom: 1566 Blocpdb> 21 atoms in block 69 Block first atom: 1584 Blocpdb> 28 atoms in block 70 Block first atom: 1605 Blocpdb> 19 atoms in block 71 Block first atom: 1633 Blocpdb> 25 atoms in block 72 Block first atom: 1652 Blocpdb> 26 atoms in block 73 Block first atom: 1677 Blocpdb> 21 atoms in block 74 Block first atom: 1703 Blocpdb> 25 atoms in block 75 Block first atom: 1724 Blocpdb> 34 atoms in block 76 Block first atom: 1749 Blocpdb> 19 atoms in block 77 Block first atom: 1783 Blocpdb> 26 atoms in block 78 Block first atom: 1802 Blocpdb> 27 atoms in block 79 Block first atom: 1828 Blocpdb> 21 atoms in block 80 Block first atom: 1855 Blocpdb> 23 atoms in block 81 Block first atom: 1876 Blocpdb> 21 atoms in block 82 Block first atom: 1899 Blocpdb> 25 atoms in block 83 Block first atom: 1920 Blocpdb> 25 atoms in block 84 Block first atom: 1945 Blocpdb> 30 atoms in block 85 Block first atom: 1970 Blocpdb> 21 atoms in block 86 Block first atom: 2000 Blocpdb> 25 atoms in block 87 Block first atom: 2021 Blocpdb> 30 atoms in block 88 Block first atom: 2046 Blocpdb> 29 atoms in block 89 Block first atom: 2076 Blocpdb> 28 atoms in block 90 Block first atom: 2105 Blocpdb> 20 atoms in block 91 Block first atom: 2133 Blocpdb> 17 atoms in block 92 Block first atom: 2153 Blocpdb> 21 atoms in block 93 Block first atom: 2170 Blocpdb> 26 atoms in block 94 Block first atom: 2191 Blocpdb> 25 atoms in block 95 Block first atom: 2217 Blocpdb> 22 atoms in block 96 Block first atom: 2242 Blocpdb> 30 atoms in block 97 Block first atom: 2264 Blocpdb> 20 atoms in block 98 Block first atom: 2294 Blocpdb> 24 atoms in block 99 Block first atom: 2314 Blocpdb> 26 atoms in block 100 Block first atom: 2338 Blocpdb> 24 atoms in block 101 Block first atom: 2364 Blocpdb> 21 atoms in block 102 Block first atom: 2388 Blocpdb> 9 atoms in block 103 Block first atom: 2409 Blocpdb> 19 atoms in block 104 Block first atom: 2418 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 2437 Blocpdb> 21 atoms in block 106 Block first atom: 2453 Blocpdb> 24 atoms in block 107 Block first atom: 2474 Blocpdb> 23 atoms in block 108 Block first atom: 2498 Blocpdb> 30 atoms in block 109 Block first atom: 2521 Blocpdb> 20 atoms in block 110 Block first atom: 2551 Blocpdb> 20 atoms in block 111 Block first atom: 2571 Blocpdb> 18 atoms in block 112 Block first atom: 2591 Blocpdb> 31 atoms in block 113 Block first atom: 2609 Blocpdb> 18 atoms in block 114 Block first atom: 2640 Blocpdb> 22 atoms in block 115 Block first atom: 2658 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 2680 Blocpdb> 22 atoms in block 117 Block first atom: 2707 Blocpdb> 22 atoms in block 118 Block first atom: 2729 Blocpdb> 21 atoms in block 119 Block first atom: 2751 Blocpdb> 26 atoms in block 120 Block first atom: 2772 Blocpdb> 19 atoms in block 121 Block first atom: 2798 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 2817 Blocpdb> 21 atoms in block 123 Block first atom: 2846 Blocpdb> 22 atoms in block 124 Block first atom: 2867 Blocpdb> 32 atoms in block 125 Block first atom: 2889 Blocpdb> 29 atoms in block 126 Block first atom: 2921 Blocpdb> 18 atoms in block 127 Block first atom: 2950 Blocpdb> 23 atoms in block 128 Block first atom: 2968 Blocpdb> 22 atoms in block 129 Block first atom: 2991 Blocpdb> 20 atoms in block 130 Block first atom: 3013 Blocpdb> 28 atoms in block 131 Block first atom: 3033 Blocpdb> 17 atoms in block 132 Block first atom: 3061 Blocpdb> 30 atoms in block 133 Block first atom: 3078 Blocpdb> 22 atoms in block 134 Block first atom: 3108 Blocpdb> 20 atoms in block 135 Block first atom: 3130 Blocpdb> 22 atoms in block 136 Block first atom: 3150 Blocpdb> 24 atoms in block 137 Block first atom: 3172 Blocpdb> 25 atoms in block 138 Block first atom: 3196 Blocpdb> 20 atoms in block 139 Block first atom: 3221 Blocpdb> 22 atoms in block 140 Block first atom: 3241 Blocpdb> 29 atoms in block 141 Block first atom: 3263 Blocpdb> 21 atoms in block 142 Block first atom: 3292 Blocpdb> 26 atoms in block 143 Block first atom: 3313 Blocpdb> 25 atoms in block 144 Block first atom: 3339 Blocpdb> 22 atoms in block 145 Block first atom: 3364 Blocpdb> 19 atoms in block 146 Block first atom: 3386 Blocpdb> 19 atoms in block 147 Block first atom: 3405 Blocpdb> 16 atoms in block 148 Block first atom: 3424 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3440 Blocpdb> 24 atoms in block 150 Block first atom: 3461 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 3485 Blocpdb> 30 atoms in block 152 Block first atom: 3508 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3538 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3558 Blocpdb> 18 atoms in block 155 Block first atom: 3578 Blocpdb> 31 atoms in block 156 Block first atom: 3596 Blocpdb> 18 atoms in block 157 Block first atom: 3627 Blocpdb> 22 atoms in block 158 Block first atom: 3645 Blocpdb> 27 atoms in block 159 Block first atom: 3667 Blocpdb> 22 atoms in block 160 Block first atom: 3694 Blocpdb> 22 atoms in block 161 Block first atom: 3716 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3738 Blocpdb> 26 atoms in block 163 Block first atom: 3759 Blocpdb> 19 atoms in block 164 Block first atom: 3785 Blocpdb> 29 atoms in block 165 Block first atom: 3804 Blocpdb> 21 atoms in block 166 Block first atom: 3833 Blocpdb> 22 atoms in block 167 Block first atom: 3854 Blocpdb> 32 atoms in block 168 Block first atom: 3876 Blocpdb> 29 atoms in block 169 Block first atom: 3908 Blocpdb> 18 atoms in block 170 Block first atom: 3937 Blocpdb> 23 atoms in block 171 Block first atom: 3955 Blocpdb> 22 atoms in block 172 Block first atom: 3978 Blocpdb> 20 atoms in block 173 Block first atom: 4000 Blocpdb> 28 atoms in block 174 Block first atom: 4020 Blocpdb> 17 atoms in block 175 Block first atom: 4048 Blocpdb> 30 atoms in block 176 Block first atom: 4065 Blocpdb> 22 atoms in block 177 Block first atom: 4095 Blocpdb> 20 atoms in block 178 Block first atom: 4117 Blocpdb> 22 atoms in block 179 Block first atom: 4137 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4159 Blocpdb> 25 atoms in block 181 Block first atom: 4183 Blocpdb> 20 atoms in block 182 Block first atom: 4208 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4228 Blocpdb> 29 atoms in block 184 Block first atom: 4250 Blocpdb> 21 atoms in block 185 Block first atom: 4279 Blocpdb> 26 atoms in block 186 Block first atom: 4300 Blocpdb> 25 atoms in block 187 Block first atom: 4326 Blocpdb> 22 atoms in block 188 Block first atom: 4351 Blocpdb> 19 atoms in block 189 Block first atom: 4373 Blocpdb> 25 atoms in block 190 Block first atom: 4392 Blocpdb> 18 atoms in block 191 Block first atom: 4416 Blocpdb> 191 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1647991 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13302 Prepmat> Matrix trace = 3603180.0000 Prepmat> Last element read: 13302 13302 171.2650 Prepmat> 18337 lines saved. Prepmat> 16508 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4434 RTB> Total mass = 4434.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4434 RTB> Number of blocks = 191 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 243869.8513 RTB> 62943 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1146 Diagstd> Nb of non-zero elements: 62943 Diagstd> Projected matrix trace = 243869.8513 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1146 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 243869.8513 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1505887 0.2102238 0.3436957 0.7867134 0.9877503 1.3502973 1.8778153 2.0523339 2.5997755 2.7762348 3.3263126 4.2775842 4.8327765 5.4286792 5.9483667 7.0530064 7.5883923 8.5248872 8.9818144 9.3541898 10.6027399 10.9514182 11.9721157 12.4136367 13.1147474 13.3615565 13.7826776 14.3435879 15.0046806 15.3315399 16.5534099 16.7935046 17.3766686 17.7875375 18.4400973 18.6202245 19.0343000 19.3880170 19.9863960 20.1252287 20.9877460 21.4857409 22.0506809 22.7312355 23.1037039 23.4318830 23.8905885 24.3248333 24.7120841 25.2477316 25.7437959 26.5706485 26.6547501 27.1843339 28.2173428 28.4977625 28.9124054 28.9373384 29.5500218 30.0303461 30.8611525 31.8078588 32.1750798 33.0571873 34.0499677 34.2110802 34.8181143 34.8968687 35.5572228 36.1035184 37.0308019 37.2620937 37.6239296 38.6955763 38.8062589 39.7459308 40.1207681 40.3699602 40.7328713 42.2377250 42.4110357 42.9885098 43.1493467 43.9596174 44.3298742 44.6791310 45.2400981 45.8625391 46.1032740 46.3311030 46.7089912 47.2681852 48.0906452 48.3181785 48.9968214 49.5048944 49.9071524 50.4582050 50.9198563 51.6940890 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034330 0.0034340 0.0034340 0.0034345 0.0034346 0.0034354 42.1397098 49.7893206 63.6623019 96.3171328 107.9242042 126.1856547 148.8064378 155.5676500 175.0907515 180.9353299 198.0508959 224.5921448 238.7226544 253.0127281 264.8464441 288.3914765 299.1370229 317.0586453 325.4447870 332.1225543 353.5935501 359.3606022 375.7342055 382.5998506 393.2558988 396.9390323 403.1457433 411.2673001 420.6381488 425.1950200 441.8135331 445.0060842 452.6666921 457.9870463 466.3123138 468.5843034 473.7658305 478.1475955 485.4701417 487.1533492 497.4829258 503.3504343 509.9249739 517.7341365 521.9586329 525.6526708 530.7728559 535.5749013 539.8212378 545.6403299 550.9745917 559.7529066 560.6380737 566.1801360 576.8373027 579.6964775 583.8985441 584.1502564 590.3019027 595.0801294 603.2555841 612.4385191 615.9636680 624.3501632 633.6561182 635.1534682 640.7637045 641.4879604 647.5289602 652.4842662 660.8103530 662.8708285 666.0814773 675.5009120 676.4663042 684.6074431 687.8280774 689.9608382 693.0551460 705.7413106 707.1877340 711.9860352 713.3167011 719.9829833 723.0087108 725.8512670 730.3937513 735.4011890 737.3287429 739.1483300 742.1565487 746.5858325 753.0530679 754.8324418 760.1148787 764.0457240 767.1436166 771.3672195 774.8878743 780.7567063 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4434 Rtb_to_modes> Number of blocs = 191 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1506 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2102 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3437 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7867 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9878 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.350 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.878 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.052 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.600 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.776 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.326 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.278 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.833 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.429 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.948 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.053 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.588 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.525 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.982 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.354 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.69 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 1.00002 0.99999 0.99998 1.00004 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99996 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99995 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00005 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 79812 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 1.00002 0.99999 0.99998 1.00004 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99996 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99995 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00005 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607161113431728021.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607161113431728021.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607161113431728021.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607161113431728021.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 570 First residue number = 1 Last residue number = 134 Number of atoms found = 4434 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1506 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2102 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3437 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7867 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9878 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.350 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.878 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.052 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.600 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.776 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.326 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.278 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.833 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.429 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.948 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.053 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.588 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.525 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.982 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.354 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.69 Bfactors> 106 vectors, 13302 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.150600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.542 for 570 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.080 +/- 0.06 Bfactors> = 29.841 +/- 10.53 Bfactors> Shiftng-fct= 29.761 Bfactors> Scaling-fct= 191.224 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607161113431728021.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607161113431728021.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.4 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vecteur en lecture: 662.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.7 Chkmod> 106 vectors, 13302 coordinates in file. Chkmod> That is: 4434 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9513 0.0034 0.8395 0.0034 0.7757 0.0034 0.7157 0.0034 0.9817 0.0034 0.9009 42.1395 0.6296 49.7844 0.6767 63.6600 0.7385 96.3122 0.4325 107.9223 0.6346 126.1663 0.5932 148.8074 0.3714 155.5483 0.7229 175.0908 0.3613 180.9199 0.5246 198.0331 0.3619 224.5934 0.3873 238.7179 0.3308 253.0093 0.5591 264.8269 0.5903 288.3790 0.5543 299.1164 0.4123 317.0471 0.2867 325.4342 0.5514 332.1049 0.4097 353.5327 0.4678 359.3219 0.5115 375.6849 0.4632 382.5274 0.5710 393.1678 0.4200 396.8989 0.4728 403.0893 0.4332 411.1982 0.6193 420.5545 0.5211 425.1554 0.2841 441.7491 0.3299 444.9405 0.4009 452.6906 0.5109 457.9991 0.4294 466.2911 0.3086 468.5614 0.2725 473.6920 0.3560 478.1515 0.1725 485.4931 0.2262 487.1902 0.4264 497.4883 0.4863 503.3787 0.3519 509.8952 0.2631 517.6978 0.4249 521.8944 0.4167 525.6090 0.3061 530.7435 0.4470 535.4987 0.3187 539.7753 0.2040 545.6414 0.1340 550.9103 0.2827 559.7220 0.2204 560.5641 0.3490 566.1107 0.4680 576.8397 0.3124 579.6943 0.2965 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DQ=-80 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom making animated gifs 11 models are in 2607161113431728021.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607161113431728021.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607161113431728021.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2607161113431728021 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom making animated gifs 11 models are in 2607161113431728021.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607161113431728021.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607161113431728021.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2607161113431728021 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom making animated gifs 11 models are in 2607161113431728021.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607161113431728021.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607161113431728021.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2607161113431728021 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607161113431728021.eigenfacs 2607161113431728021.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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