*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607171838462003706.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607171838462003706.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607171838462003706.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 291
First residue number = 702
Last residue number = 992
Number of atoms found = 4733
Mean number per residue = 16.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -33.589206 +/- 8.774418 From: -60.083000 To: -9.464000
= 41.285232 +/- 14.997101 From: 8.863000 To: 75.683000
= 15.247560 +/- 10.091838 From: -6.636000 To: 42.529000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.3579 % Filled.
Pdbmat> 3385160 non-zero elements.
Pdbmat> 373048 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 157.64 +/- 50.31
Maximum number = 253
Minimum number = 19
Pdbmat> Matrix trace = 7.460960E+06
Pdbmat> Larger element = 928.211
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
291 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607171838462003706.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607171838462003706.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607171838462003706.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4733 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 291 residues.
Blocpdb> 31 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 43 atoms in block 2
Block first atom: 32
Blocpdb> 38 atoms in block 3
Block first atom: 75
Blocpdb> 37 atoms in block 4
Block first atom: 113
Blocpdb> 29 atoms in block 5
Block first atom: 150
Blocpdb> 42 atoms in block 6
Block first atom: 179
Blocpdb> 41 atoms in block 7
Block first atom: 221
Blocpdb> 38 atoms in block 8
Block first atom: 262
Blocpdb> 26 atoms in block 9
Block first atom: 300
Blocpdb> 18 atoms in block 10
Block first atom: 326
Blocpdb> 30 atoms in block 11
Block first atom: 344
Blocpdb> 21 atoms in block 12
Block first atom: 374
Blocpdb> 37 atoms in block 13
Block first atom: 395
Blocpdb> 29 atoms in block 14
Block first atom: 432
Blocpdb> 43 atoms in block 15
Block first atom: 461
Blocpdb> 33 atoms in block 16
Block first atom: 504
Blocpdb> 22 atoms in block 17
Block first atom: 537
Blocpdb> 37 atoms in block 18
Block first atom: 559
Blocpdb> 38 atoms in block 19
Block first atom: 596
Blocpdb> 33 atoms in block 20
Block first atom: 634
Blocpdb> 26 atoms in block 21
Block first atom: 667
Blocpdb> 41 atoms in block 22
Block first atom: 693
Blocpdb> 34 atoms in block 23
Block first atom: 734
Blocpdb> 39 atoms in block 24
Block first atom: 768
Blocpdb> 24 atoms in block 25
Block first atom: 807
Blocpdb> 25 atoms in block 26
Block first atom: 831
Blocpdb> 32 atoms in block 27
Block first atom: 856
Blocpdb> 36 atoms in block 28
Block first atom: 888
Blocpdb> 34 atoms in block 29
Block first atom: 924
Blocpdb> 31 atoms in block 30
Block first atom: 958
Blocpdb> 25 atoms in block 31
Block first atom: 989
Blocpdb> 37 atoms in block 32
Block first atom: 1014
Blocpdb> 27 atoms in block 33
Block first atom: 1051
Blocpdb> 27 atoms in block 34
Block first atom: 1078
Blocpdb> 26 atoms in block 35
Block first atom: 1105
Blocpdb> 32 atoms in block 36
Block first atom: 1131
Blocpdb> 27 atoms in block 37
Block first atom: 1163
Blocpdb> 43 atoms in block 38
Block first atom: 1190
Blocpdb> 26 atoms in block 39
Block first atom: 1233
Blocpdb> 30 atoms in block 40
Block first atom: 1259
Blocpdb> 33 atoms in block 41
Block first atom: 1289
Blocpdb> 25 atoms in block 42
Block first atom: 1322
Blocpdb> 33 atoms in block 43
Block first atom: 1347
Blocpdb> 38 atoms in block 44
Block first atom: 1380
Blocpdb> 31 atoms in block 45
Block first atom: 1418
Blocpdb> 36 atoms in block 46
Block first atom: 1449
Blocpdb> 34 atoms in block 47
Block first atom: 1485
Blocpdb> 18 atoms in block 48
Block first atom: 1519
Blocpdb> 38 atoms in block 49
Block first atom: 1537
Blocpdb> 33 atoms in block 50
Block first atom: 1575
Blocpdb> 40 atoms in block 51
Block first atom: 1608
Blocpdb> 33 atoms in block 52
Block first atom: 1648
Blocpdb> 34 atoms in block 53
Block first atom: 1681
Blocpdb> 33 atoms in block 54
Block first atom: 1715
Blocpdb> 18 atoms in block 55
Block first atom: 1748
Blocpdb> 38 atoms in block 56
Block first atom: 1766
Blocpdb> 38 atoms in block 57
Block first atom: 1804
Blocpdb> 38 atoms in block 58
Block first atom: 1842
Blocpdb> 27 atoms in block 59
Block first atom: 1880
Blocpdb> 36 atoms in block 60
Block first atom: 1907
Blocpdb> 32 atoms in block 61
Block first atom: 1943
Blocpdb> 24 atoms in block 62
Block first atom: 1975
Blocpdb> 35 atoms in block 63
Block first atom: 1999
Blocpdb> 34 atoms in block 64
Block first atom: 2034
Blocpdb> 36 atoms in block 65
Block first atom: 2068
Blocpdb> 43 atoms in block 66
Block first atom: 2104
Blocpdb> 34 atoms in block 67
Block first atom: 2147
Blocpdb> 36 atoms in block 68
Block first atom: 2181
Blocpdb> 29 atoms in block 69
Block first atom: 2217
Blocpdb> 34 atoms in block 70
Block first atom: 2246
Blocpdb> 30 atoms in block 71
Block first atom: 2280
Blocpdb> 35 atoms in block 72
Block first atom: 2310
Blocpdb> 36 atoms in block 73
Block first atom: 2345
Blocpdb> 31 atoms in block 74
Block first atom: 2381
Blocpdb> 34 atoms in block 75
Block first atom: 2412
Blocpdb> 41 atoms in block 76
Block first atom: 2446
Blocpdb> 26 atoms in block 77
Block first atom: 2487
Blocpdb> 27 atoms in block 78
Block first atom: 2513
Blocpdb> 29 atoms in block 79
Block first atom: 2540
Blocpdb> 41 atoms in block 80
Block first atom: 2569
Blocpdb> 26 atoms in block 81
Block first atom: 2610
Blocpdb> 25 atoms in block 82
Block first atom: 2636
Blocpdb> 37 atoms in block 83
Block first atom: 2661
Blocpdb> 36 atoms in block 84
Block first atom: 2698
Blocpdb> 28 atoms in block 85
Block first atom: 2734
Blocpdb> 22 atoms in block 86
Block first atom: 2762
Blocpdb> 29 atoms in block 87
Block first atom: 2784
Blocpdb> 30 atoms in block 88
Block first atom: 2813
Blocpdb> 41 atoms in block 89
Block first atom: 2843
Blocpdb> 41 atoms in block 90
Block first atom: 2884
Blocpdb> 29 atoms in block 91
Block first atom: 2925
Blocpdb> 26 atoms in block 92
Block first atom: 2954
Blocpdb> 38 atoms in block 93
Block first atom: 2980
Blocpdb> 42 atoms in block 94
Block first atom: 3018
Blocpdb> 40 atoms in block 95
Block first atom: 3060
Blocpdb> 32 atoms in block 96
Block first atom: 3100
Blocpdb> 28 atoms in block 97
Block first atom: 3132
Blocpdb> 28 atoms in block 98
Block first atom: 3160
Blocpdb> 35 atoms in block 99
Block first atom: 3188
Blocpdb> 28 atoms in block 100
Block first atom: 3223
Blocpdb> 30 atoms in block 101
Block first atom: 3251
Blocpdb> 40 atoms in block 102
Block first atom: 3281
Blocpdb> 34 atoms in block 103
Block first atom: 3321
Blocpdb> 31 atoms in block 104
Block first atom: 3355
Blocpdb> 27 atoms in block 105
Block first atom: 3386
Blocpdb> 33 atoms in block 106
Block first atom: 3413
Blocpdb> 35 atoms in block 107
Block first atom: 3446
Blocpdb> 19 atoms in block 108
Block first atom: 3481
Blocpdb> 33 atoms in block 109
Block first atom: 3500
Blocpdb> 21 atoms in block 110
Block first atom: 3533
Blocpdb> 34 atoms in block 111
Block first atom: 3554
Blocpdb> 22 atoms in block 112
Block first atom: 3588
Blocpdb> 38 atoms in block 113
Block first atom: 3610
Blocpdb> 37 atoms in block 114
Block first atom: 3648
Blocpdb> 22 atoms in block 115
Block first atom: 3685
Blocpdb> 43 atoms in block 116
Block first atom: 3707
Blocpdb> 31 atoms in block 117
Block first atom: 3750
Blocpdb> 28 atoms in block 118
Block first atom: 3781
Blocpdb> 30 atoms in block 119
Block first atom: 3809
Blocpdb> 33 atoms in block 120
Block first atom: 3839
Blocpdb> 28 atoms in block 121
Block first atom: 3872
Blocpdb> 38 atoms in block 122
Block first atom: 3900
Blocpdb> 36 atoms in block 123
Block first atom: 3938
Blocpdb> 38 atoms in block 124
Block first atom: 3974
Blocpdb> 35 atoms in block 125
Block first atom: 4012
Blocpdb> 36 atoms in block 126
Block first atom: 4047
Blocpdb> 22 atoms in block 127
Block first atom: 4083
Blocpdb> 23 atoms in block 128
Block first atom: 4105
Blocpdb> 38 atoms in block 129
Block first atom: 4128
Blocpdb> 42 atoms in block 130
Block first atom: 4166
Blocpdb> 39 atoms in block 131
Block first atom: 4208
Blocpdb> 38 atoms in block 132
Block first atom: 4247
Blocpdb> 34 atoms in block 133
Block first atom: 4285
Blocpdb> 31 atoms in block 134
Block first atom: 4319
Blocpdb> 39 atoms in block 135
Block first atom: 4350
Blocpdb> 34 atoms in block 136
Block first atom: 4389
Blocpdb> 26 atoms in block 137
Block first atom: 4423
Blocpdb> 41 atoms in block 138
Block first atom: 4449
Blocpdb> 40 atoms in block 139
Block first atom: 4490
Blocpdb> 35 atoms in block 140
Block first atom: 4530
Blocpdb> 24 atoms in block 141
Block first atom: 4565
Blocpdb> 27 atoms in block 142
Block first atom: 4589
Blocpdb> 41 atoms in block 143
Block first atom: 4616
Blocpdb> 37 atoms in block 144
Block first atom: 4657
Blocpdb> 25 atoms in block 145
Block first atom: 4694
Blocpdb> 15 atoms in block 146
Block first atom: 4718
Blocpdb> 146 blocks.
Blocpdb> At most, 43 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 15 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3385306 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 14199
Prepmat> Matrix trace = 7460960.0000
Prepmat> Last element read: 14199 14199 142.9773
Prepmat> 10732 lines saved.
Prepmat> 8928 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4733
RTB> Total mass = 4733.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4733
RTB> Number of blocks = 146
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 385086.4070
RTB> 62718 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 876
Diagstd> Nb of non-zero elements: 62718
Diagstd> Projected matrix trace = 385086.4070
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 876 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 385086.4070
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.8089500 5.0466902 5.3194269 7.0378981
9.1378856 10.1658738 14.3773380 14.6671209 16.7185662
18.6003851 19.8790220 22.6556003 23.7255892 25.3994482
25.9387923 29.4815641 30.9672454 32.2976114 34.7399777
36.8257932 38.3481584 38.7922730 42.0161498 42.4966879
45.0276893 45.9303910 48.5667423 49.4382298 49.8188812
52.4282296 52.9136408 54.2825030 55.6585759 56.6515975
57.4117073 58.5214067 59.3513256 60.8384560 62.2478390
64.6001781 66.5296589 66.9829264 68.7306257 71.1635266
73.0891730 73.8321559 74.1216626 75.2123063 75.8978481
76.8133280 77.9332890 79.3458456 81.5995659 82.9233658
84.2604604 85.6658449 86.7243836 87.4824031 88.7830424
89.2614460 90.7875925 91.7705195 92.4218784 95.4088292
96.2948991 98.5140701 99.1644412 100.4072671 102.3799856
102.9151380 105.4202934 106.8616633 108.5848781 109.7462861
110.8867563 112.9078737 113.7741633 114.9998807 116.4340030
117.9123330 118.7709409 119.8225315 120.2147923 120.6613227
122.6568478 123.3460417 125.3827263 125.8472750 128.2184877
129.6142220 130.3580039 131.0392436 131.9206396 133.5010999
134.9149085 137.0004829 137.7521216 139.4326983 140.4119736
142.3539080
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034299 0.0034299 0.0034311 0.0034319 0.0034325
0.0034351 211.9326720 243.9487533 250.4538435 288.0824278
328.2601317 346.2323458 411.7508659 415.8796950 444.0120891
468.3346044 484.1643272 516.8720732 528.9367999 547.2772822
553.0573342 589.6177386 604.2916152 617.1354337 640.0443200
658.9786362 672.4616730 676.3443932 703.8877495 707.9014826
728.6770819 735.9449874 756.7714981 763.5311087 766.4648893
786.2811725 789.9127114 800.0648911 810.1423312 817.3373785
822.8023269 830.7161599 836.5858065 847.0018758 856.7565229
872.7947754 885.7332104 888.7453449 900.2651306 916.0601926
928.3715099 933.0782264 934.9058053 941.7589000 946.0411155
951.7295876 958.6427291 967.2915119 980.9326825 988.8575664
996.7980832 1005.0765294 1011.2671295 1015.6770338 1023.1994356
1025.9524650 1034.6858984 1040.2719193 1043.9571564 1060.6926601
1065.6066485 1077.8154669 1081.3673799 1088.1226577 1098.7599281
1101.6278600 1114.9551313 1122.5514241 1131.5661683 1137.6016058
1143.4972384 1153.8713617 1158.2894628 1164.5120189 1171.7506271
1179.1658592 1183.4512663 1188.6788234 1190.6229113 1192.8321090
1202.6553288 1206.0293830 1215.9455696 1218.1960536 1229.6191135
1236.2935655 1239.8356823 1243.0710982 1247.2446632 1254.6936560
1261.3199123 1271.0315453 1274.5134663 1282.2644331 1286.7594080
1295.6269629
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4733
Rtb_to_modes> Number of blocs = 146
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9762E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9766E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9836E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9877E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.809
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.047
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.319
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.038
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.138
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 140.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.4
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 876 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001
1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000
1.00004 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
1.00004 1.00005 1.00002 0.99999 0.99999
0.99998 0.99995 0.99998 1.00000 0.99998
1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99997 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
1.00003 1.00000 1.00001 1.00004 1.00002
0.99999 0.99997 1.00000 1.00003 0.99996
1.00002 1.00002 1.00001 0.99997 1.00003
1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 85194 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001
1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000
1.00004 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
1.00004 1.00005 1.00002 0.99999 0.99999
0.99998 0.99995 0.99998 1.00000 0.99998
1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99997 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
1.00003 1.00000 1.00001 1.00004 1.00002
0.99999 0.99997 1.00000 1.00003 0.99996
1.00002 1.00002 1.00001 0.99997 1.00003
1.00001 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607171838462003706.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607171838462003706.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607171838462003706.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607171838462003706.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 291
First residue number = 702
Last residue number = 992
Number of atoms found = 4733
Mean number per residue = 16.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9762E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9766E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9836E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9877E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.809
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.047
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.319
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.038
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.138
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.4
Bfactors> 106 vectors, 14199 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.809000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.646 for 291 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.007 +/- 0.01
Bfactors> = 0.718 +/- 0.14
Bfactors> Shiftng-fct= 0.711
Bfactors> Scaling-fct= 11.515
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607171838462003706.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607171838462003706.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4297E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4298E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1035.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1088.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1101.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1115.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1123.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1137.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1144.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1154.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1158.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1164.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1179.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1184.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1189.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1203.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1206.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1216.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1218.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1236.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1240.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1247.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1255.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1261.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1275.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1282.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1287.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1296.
Chkmod> 106 vectors, 14199 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4733 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 32 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7198
0.0034 0.7813
0.0034 0.7603
0.0034 0.9246
0.0034 0.8916
0.0034 0.9428
211.9250 0.0905
243.9458 0.2775
250.4330 0.4528
288.0721 0.2038
328.2481 0.2199
346.2877 0.2644
411.7713 0.3979
415.9027 0.0840
444.0121 0.2537
468.3097 0.0914
484.1555 0.4952
516.9001 0.4611
528.9633 0.3870
547.2597 0.4464
553.0465 0.2352
589.5768 0.3561
604.2925 0.2626
617.1318 0.4149
640.0171 0.1927
658.9880 0.2774
672.4490 0.2405
676.2955 0.2980
703.8898 0.2628
707.8987 0.0329
728.6645 0.1080
735.9103 0.2731
756.7644 0.3624
763.5120 0.4079
766.4406 0.1339
786.2607 0.2312
789.8516 0.1298
800.0121 0.3304
810.1179 0.4925
817.2908 0.3632
822.7548 0.3789
830.6705 0.4107
836.5406 0.4453
846.9763 0.3041
856.7346 0.4117
872.7561 0.4810
885.6975 0.5428
888.6878 0.3786
900.2224 0.3275
915.9982 0.2558
928.3369 0.4787
933.0245 0.4678
934.8552 0.3651
941.7040 0.2633
946.0139 0.2891
951.6681 0.2371
958.5813 0.0469
967.2753 0.4214
980.8932 0.3436
988.7950 0.2945
996.7526 0.4314
1005.0578 0.4348
1011.1982 0.2588
1015.6195 0.3510
1023.1380 0.2749
1025.9001 0.2846
1034.6552 0.2243
1040.2243 0.4479
1043.9017 0.1938
1060.6536 0.3182
1065.5338 0.3616
1077.7469 0.4265
1081.2967 0.3618
1088.0366 0.4359
1098.8202 0.3917
1101.4995 0.3418
1114.8000 0.4436
1122.7046 0.2603
1131.5964 0.2864
1137.3129 0.3512
1143.5164 0.5172
1153.7816 0.4631
1158.3712 0.3910
1164.4626 0.0741
1171.5292 0.2944
1179.0536 0.4680
1183.5452 0.2870
1188.5160 0.5452
1190.4985 0.0679
1192.9721 0.3914
1202.8152 0.2838
1205.7525 0.3366
1215.9771 0.3374
1217.9149 0.4742
1229.4777 0.4520
1236.1727 0.3463
1239.9821 0.4315
1242.8316 0.2890
1247.0936 0.4446
1254.6346 0.4584
1261.1961 0.4454
1270.9747 0.4651
1274.6802 0.4232
1282.0590 0.3305
1286.6493 0.4964
1295.7811 0.4068
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2607171838462003706.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607171838462003706.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2607171838462003706.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607171838462003706.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2607171838462003706.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2607171838462003706.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4297E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4298E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1035.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1088.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1101.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1115.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1123.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1137.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1144.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1154.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1158.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1164.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1179.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1184.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1189.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1203.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1206.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1216.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1218.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1236.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1240.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1247.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1255.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1261.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1275.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1282.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1287.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1296.
Projmod> 106 vectors, 14199 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 291
First residue number = 702
Last residue number = 992
Number of atoms found = 4733
Mean number per residue = 16.3
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 291
First residue number = 702
Last residue number = 992
Number of atoms found = 4733
Mean number per residue = 16.3
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 4733 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 0.00
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 2 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 3 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 4 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 5 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 6 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 7 F= 211.92 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 8 F= 243.95 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 9 F= 250.43 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 10 F= 288.07 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 11 F= 328.25 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 12 F= 346.29 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 13 F= 411.77 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 14 F= 415.90 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 15 F= 444.01 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 16 F= 468.31 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 17 F= 484.16 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 18 F= 516.90 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 19 F= 528.96 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 20 F= 547.26 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 21 F= 553.05 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 22 F= 589.58 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 23 F= 604.29 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 24 F= 617.13 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 25 F= 640.02 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 26 F= 658.99 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 27 F= 672.45 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 28 F= 676.30 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 29 F= 703.89 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 30 F= 707.90 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 31 F= 728.66 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
%Projmod-Wn> Eigenvector 32 Norm= 1.0001
Vector: 32 F= 735.91 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 33 F= 756.76 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 34 F= 763.51 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 35 F= 766.44 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 36 F= 786.26 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 37 F= 789.85 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 38 F= 800.01 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 39 F= 810.12 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 40 F= 817.29 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 41 F= 822.75 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 42 F= 830.67 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 43 F= 836.54 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 44 F= 846.98 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 45 F= 856.73 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 46 F= 872.76 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 47 F= 885.70 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 48 F= 888.69 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 49 F= 900.22 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 50 F= 916.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 51 F= 928.34 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 52 F= 933.02 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 53 F= 934.86 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 54 F= 941.70 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 55 F= 946.01 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 56 F= 951.67 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 57 F= 958.58 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 58 F= 967.28 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 59 F= 980.89 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 60 F= 988.80 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 61 F= 996.75 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 62 F= 1005.06 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 63 F= 1011.20 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 64 F= 1015.62 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 65 F= 1023.14 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 66 F= 1025.90 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 67 F= 1034.66 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 68 F= 1040.22 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 69 F= 1043.90 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 70 F= 1060.65 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 71 F= 1065.53 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 72 F= 1077.75 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 73 F= 1081.30 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 74 F= 1088.04 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 75 F= 1098.82 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 76 F= 1101.50 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 77 F= 1114.80 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 78 F= 1122.70 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 79 F= 1131.60 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 80 F= 1137.31 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 81 F= 1143.52 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 82 F= 1153.78 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 83 F= 1158.37 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 84 F= 1164.46 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 85 F= 1171.53 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 86 F= 1179.05 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 87 F= 1183.55 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 88 F= 1188.52 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 89 F= 1190.50 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 90 F= 1192.97 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 91 F= 1202.82 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 92 F= 1205.75 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 93 F= 1215.98 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 94 F= 1217.91 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
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Vector: 100 F= 1254.63 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
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Vector: 104 F= 1282.06 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 105 F= 1286.65 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 106 F= 1295.78 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003430
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 211.924966
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.00 for mode -1 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = NaN NaN NaN NaN NaN NaN
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2607171838462003706 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
making animated gifs
11 models are in 2607171838462003706.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607171838462003706.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607171838462003706.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 291 1.328 283 0.607
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 291 1.062 284 0.522
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 291 0.797 287 0.482
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 291 0.531 289 0.412
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 291 0.266 291 0.266
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 291 0.000 291 0.000
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 291 0.266 291 0.266
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 291 0.531 289 0.412
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 291 0.797 287 0.482
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 291 1.062 284 0.522
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 291 1.328 283 0.607
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2607171838462003706 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
making animated gifs
11 models are in 2607171838462003706.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607171838462003706.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607171838462003706.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 291 1.396 280 0.936
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 291 1.117 281 0.772
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 291 0.837 287 0.711
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 291 0.558 291 0.558
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 291 0.279 291 0.279
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 291 0.000 291 0.000
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 291 0.279 291 0.279
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 291 0.558 291 0.558
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 291 0.837 287 0.711
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 291 1.117 281 0.773
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 291 1.396 280 0.937
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2607171838462003706 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
making animated gifs
11 models are in 2607171838462003706.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607171838462003706.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607171838462003706.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 291 1.364 285 1.205
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 291 1.091 288 1.010
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 291 0.818 289 0.778
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 291 0.545 291 0.545
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 291 0.273 291 0.273
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 291 0.000 291 0.000
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 291 0.273 291 0.273
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 291 0.545 291 0.545
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 291 0.818 289 0.778
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 291 1.091 288 1.011
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 291 1.364 285 1.205
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2607171838462003706 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
making animated gifs
11 models are in 2607171838462003706.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607171838462003706.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607171838462003706.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 291 1.363 280 0.914
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 291 1.091 284 0.797
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 291 0.818 285 0.616
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 291 0.545 290 0.516
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 291 0.273 291 0.273
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 291 0.000 291 0.000
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 291 0.273 291 0.273
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 291 0.545 290 0.516
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 291 0.818 285 0.616
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 291 1.091 284 0.797
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 291 1.363 280 0.914
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2607171838462003706 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607171838462003706.eigenfacs
2607171838462003706.atom
making animated gifs
11 models are in 2607171838462003706.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607171838462003706.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607171838462003706.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 291 1.300 280 0.865
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 291 1.040 283 0.752
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 291 0.780 287 0.651
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 291 0.520 291 0.520
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 291 0.260 291 0.260
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 291 0.000 291 0.000
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 291 0.260 291 0.260
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 291 0.520 291 0.520
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 291 0.780 287 0.651
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 291 1.040 283 0.751
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 291 1.300 280 0.865
2607171838462003706.10.pdb
2607171838462003706.11.pdb
2607171838462003706.7.pdb
2607171838462003706.8.pdb
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