*** MHC1 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607180828532135053.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607180828532135053.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607180828532135053.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 940
First residue number = 1
Last residue number = 114
Number of atoms found = 7444
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -13.235983 +/- 17.989610 From: -54.467000 To: 50.725000
= 1.651977 +/- 17.374919 From: -49.833000 To: 49.330000
= 21.382679 +/- 22.983010 From: -44.711000 To: 66.630000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.0032 % Filled.
Pdbmat> 2501785 non-zero elements.
Pdbmat> 273064 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 73.36 +/- 25.88
Maximum number = 132
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 5.461280E+06
Pdbmat> Larger element = 478.152
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
940 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607180828532135053.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607180828532135053.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607180828532135053.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 7444 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 940 residues.
Blocpdb> 36 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 42 atoms in block 2
Block first atom: 37
Blocpdb> 30 atoms in block 3
Block first atom: 79
Blocpdb> 38 atoms in block 4
Block first atom: 109
Blocpdb> 40 atoms in block 5
Block first atom: 147
Blocpdb> 37 atoms in block 6
Block first atom: 187
Blocpdb> 37 atoms in block 7
Block first atom: 224
Blocpdb> 27 atoms in block 8
Block first atom: 261
Blocpdb> 26 atoms in block 9
Block first atom: 288
Blocpdb> 31 atoms in block 10
Block first atom: 314
Blocpdb> 43 atoms in block 11
Block first atom: 345
Blocpdb> 41 atoms in block 12
Block first atom: 388
Blocpdb> 35 atoms in block 13
Block first atom: 429
Blocpdb> 36 atoms in block 14
Block first atom: 464
Blocpdb> 40 atoms in block 15
Block first atom: 500
Blocpdb> 28 atoms in block 16
Block first atom: 540
Blocpdb> 35 atoms in block 17
Block first atom: 568
Blocpdb> 41 atoms in block 18
Block first atom: 603
Blocpdb> 30 atoms in block 19
Block first atom: 644
Blocpdb> 37 atoms in block 20
Block first atom: 674
Blocpdb> 39 atoms in block 21
Block first atom: 711
Blocpdb> 42 atoms in block 22
Block first atom: 750
Blocpdb> 37 atoms in block 23
Block first atom: 792
Blocpdb> 31 atoms in block 24
Block first atom: 829
Blocpdb> 36 atoms in block 25
Block first atom: 860
Blocpdb> 40 atoms in block 26
Block first atom: 896
Blocpdb> 39 atoms in block 27
Block first atom: 936
Blocpdb> 46 atoms in block 28
Block first atom: 975
Blocpdb> 29 atoms in block 29
Block first atom: 1021
Blocpdb> 37 atoms in block 30
Block first atom: 1050
Blocpdb> 39 atoms in block 31
Block first atom: 1087
Blocpdb> 48 atoms in block 32
Block first atom: 1126
Blocpdb> 28 atoms in block 33
Block first atom: 1174
Blocpdb> 29 atoms in block 34
Block first atom: 1202
Blocpdb> 43 atoms in block 35
Block first atom: 1231
Blocpdb> 47 atoms in block 36
Block first atom: 1274
Blocpdb> 31 atoms in block 37
Block first atom: 1321
Blocpdb> 33 atoms in block 38
Block first atom: 1352
Blocpdb> 47 atoms in block 39
Block first atom: 1385
Blocpdb> 39 atoms in block 40
Block first atom: 1432
Blocpdb> 27 atoms in block 41
Block first atom: 1471
Blocpdb> 36 atoms in block 42
Block first atom: 1498
Blocpdb> 39 atoms in block 43
Block first atom: 1534
Blocpdb> 42 atoms in block 44
Block first atom: 1573
Blocpdb> 35 atoms in block 45
Block first atom: 1615
Blocpdb> 40 atoms in block 46
Block first atom: 1650
Blocpdb> 38 atoms in block 47
Block first atom: 1690
Blocpdb> 39 atoms in block 48
Block first atom: 1728
Blocpdb> 37 atoms in block 49
Block first atom: 1767
Blocpdb> 33 atoms in block 50
Block first atom: 1804
Blocpdb> 42 atoms in block 51
Block first atom: 1837
Blocpdb> 46 atoms in block 52
Block first atom: 1879
Blocpdb> 37 atoms in block 53
Block first atom: 1925
Blocpdb> 41 atoms in block 54
Block first atom: 1962
Blocpdb> 45 atoms in block 55
Block first atom: 2003
Blocpdb> 49 atoms in block 56
Block first atom: 2048
Blocpdb> 32 atoms in block 57
Block first atom: 2097
Blocpdb> 41 atoms in block 58
Block first atom: 2129
Blocpdb> 34 atoms in block 59
Block first atom: 2170
Blocpdb> 38 atoms in block 60
Block first atom: 2204
Blocpdb> 44 atoms in block 61
Block first atom: 2242
Blocpdb> 37 atoms in block 62
Block first atom: 2286
Blocpdb> 43 atoms in block 63
Block first atom: 2323
Blocpdb> 39 atoms in block 64
Block first atom: 2366
Blocpdb> 40 atoms in block 65
Block first atom: 2405
Blocpdb> 48 atoms in block 66
Block first atom: 2445
Blocpdb> 35 atoms in block 67
Block first atom: 2493
Blocpdb> 30 atoms in block 68
Block first atom: 2528
Blocpdb> 34 atoms in block 69
Block first atom: 2558
Blocpdb> 52 atoms in block 70
Block first atom: 2592
Blocpdb> 37 atoms in block 71
Block first atom: 2644
Blocpdb> 35 atoms in block 72
Block first atom: 2681
Blocpdb> 42 atoms in block 73
Block first atom: 2716
Blocpdb> 39 atoms in block 74
Block first atom: 2758
Blocpdb> 45 atoms in block 75
Block first atom: 2797
Blocpdb> 38 atoms in block 76
Block first atom: 2842
Blocpdb> 39 atoms in block 77
Block first atom: 2880
Blocpdb> 39 atoms in block 78
Block first atom: 2919
Blocpdb> 49 atoms in block 79
Block first atom: 2958
Blocpdb> 46 atoms in block 80
Block first atom: 3007
Blocpdb> 39 atoms in block 81
Block first atom: 3053
Blocpdb> 40 atoms in block 82
Block first atom: 3092
Blocpdb> 43 atoms in block 83
Block first atom: 3132
Blocpdb> 34 atoms in block 84
Block first atom: 3175
Blocpdb> 47 atoms in block 85
Block first atom: 3209
Blocpdb> 37 atoms in block 86
Block first atom: 3256
Blocpdb> 34 atoms in block 87
Block first atom: 3293
Blocpdb> 44 atoms in block 88
Block first atom: 3327
Blocpdb> 31 atoms in block 89
Block first atom: 3371
Blocpdb> 52 atoms in block 90
Block first atom: 3402
Blocpdb> 46 atoms in block 91
Block first atom: 3454
Blocpdb> 41 atoms in block 92
Block first atom: 3500
Blocpdb> 42 atoms in block 93
Block first atom: 3541
Blocpdb> 42 atoms in block 94
Block first atom: 3583
Blocpdb> 43 atoms in block 95
Block first atom: 3625
Blocpdb> 31 atoms in block 96
Block first atom: 3668
Blocpdb> 42 atoms in block 97
Block first atom: 3699
Blocpdb> 42 atoms in block 98
Block first atom: 3741
Blocpdb> 40 atoms in block 99
Block first atom: 3783
Blocpdb> 44 atoms in block 100
Block first atom: 3823
Blocpdb> 33 atoms in block 101
Block first atom: 3867
Blocpdb> 53 atoms in block 102
Block first atom: 3900
Blocpdb> 41 atoms in block 103
Block first atom: 3953
Blocpdb> 42 atoms in block 104
Block first atom: 3994
Blocpdb> 38 atoms in block 105
Block first atom: 4036
Blocpdb> 41 atoms in block 106
Block first atom: 4074
Blocpdb> 38 atoms in block 107
Block first atom: 4115
Blocpdb> 39 atoms in block 108
Block first atom: 4153
Blocpdb> 44 atoms in block 109
Block first atom: 4192
Blocpdb> 44 atoms in block 110
Block first atom: 4236
Blocpdb> 37 atoms in block 111
Block first atom: 4280
Blocpdb> 49 atoms in block 112
Block first atom: 4317
Blocpdb> 37 atoms in block 113
Block first atom: 4366
Blocpdb> 41 atoms in block 114
Block first atom: 4403
Blocpdb> 41 atoms in block 115
Block first atom: 4444
Blocpdb> 28 atoms in block 116
Block first atom: 4485
Blocpdb> 48 atoms in block 117
Block first atom: 4513
Blocpdb> 33 atoms in block 118
Block first atom: 4561
Blocpdb> 37 atoms in block 119
Block first atom: 4594
Blocpdb> 46 atoms in block 120
Block first atom: 4631
Blocpdb> 39 atoms in block 121
Block first atom: 4677
Blocpdb> 39 atoms in block 122
Block first atom: 4716
Blocpdb> 49 atoms in block 123
Block first atom: 4755
Blocpdb> 8 atoms in block 124
Block first atom: 4804
Blocpdb> 43 atoms in block 125
Block first atom: 4812
Blocpdb> 42 atoms in block 126
Block first atom: 4855
Blocpdb> 42 atoms in block 127
Block first atom: 4897
Blocpdb> 35 atoms in block 128
Block first atom: 4939
Blocpdb> 45 atoms in block 129
Block first atom: 4974
Blocpdb> 38 atoms in block 130
Block first atom: 5019
Blocpdb> 38 atoms in block 131
Block first atom: 5057
Blocpdb> 40 atoms in block 132
Block first atom: 5095
Blocpdb> 40 atoms in block 133
Block first atom: 5135
Blocpdb> 44 atoms in block 134
Block first atom: 5175
Blocpdb> 39 atoms in block 135
Block first atom: 5219
Blocpdb> 43 atoms in block 136
Block first atom: 5258
Blocpdb> 51 atoms in block 137
Block first atom: 5301
Blocpdb> 46 atoms in block 138
Block first atom: 5352
Blocpdb> 40 atoms in block 139
Block first atom: 5398
Blocpdb> 43 atoms in block 140
Block first atom: 5438
Blocpdb> 39 atoms in block 141
Block first atom: 5481
Blocpdb> 39 atoms in block 142
Block first atom: 5520
Blocpdb> 46 atoms in block 143
Block first atom: 5559
Blocpdb> 28 atoms in block 144
Block first atom: 5605
Blocpdb> 44 atoms in block 145
Block first atom: 5633
Blocpdb> 40 atoms in block 146
Block first atom: 5677
Blocpdb> 41 atoms in block 147
Block first atom: 5717
Blocpdb> 40 atoms in block 148
Block first atom: 5758
Blocpdb> 39 atoms in block 149
Block first atom: 5798
Blocpdb> 36 atoms in block 150
Block first atom: 5837
Blocpdb> 36 atoms in block 151
Block first atom: 5873
Blocpdb> 46 atoms in block 152
Block first atom: 5909
Blocpdb> 25 atoms in block 153
Block first atom: 5955
Blocpdb> 41 atoms in block 154
Block first atom: 5980
Blocpdb> 43 atoms in block 155
Block first atom: 6021
Blocpdb> 35 atoms in block 156
Block first atom: 6064
Blocpdb> 36 atoms in block 157
Block first atom: 6099
Blocpdb> 41 atoms in block 158
Block first atom: 6135
Blocpdb> 40 atoms in block 159
Block first atom: 6176
Blocpdb> 40 atoms in block 160
Block first atom: 6216
Blocpdb> 44 atoms in block 161
Block first atom: 6256
Blocpdb> 41 atoms in block 162
Block first atom: 6300
Blocpdb> 47 atoms in block 163
Block first atom: 6341
Blocpdb> 33 atoms in block 164
Block first atom: 6388
Blocpdb> 45 atoms in block 165
Block first atom: 6421
Blocpdb> 42 atoms in block 166
Block first atom: 6466
Blocpdb> 31 atoms in block 167
Block first atom: 6508
Blocpdb> 44 atoms in block 168
Block first atom: 6539
Blocpdb> 40 atoms in block 169
Block first atom: 6583
Blocpdb> 41 atoms in block 170
Block first atom: 6623
Blocpdb> 40 atoms in block 171
Block first atom: 6664
Blocpdb> 39 atoms in block 172
Block first atom: 6704
Blocpdb> 36 atoms in block 173
Block first atom: 6743
Blocpdb> 36 atoms in block 174
Block first atom: 6779
Blocpdb> 46 atoms in block 175
Block first atom: 6815
Blocpdb> 25 atoms in block 176
Block first atom: 6861
Blocpdb> 41 atoms in block 177
Block first atom: 6886
Blocpdb> 43 atoms in block 178
Block first atom: 6927
Blocpdb> 35 atoms in block 179
Block first atom: 6970
Blocpdb> 36 atoms in block 180
Block first atom: 7005
Blocpdb> 41 atoms in block 181
Block first atom: 7041
Blocpdb> 40 atoms in block 182
Block first atom: 7082
Blocpdb> 40 atoms in block 183
Block first atom: 7122
Blocpdb> 44 atoms in block 184
Block first atom: 7162
Blocpdb> 41 atoms in block 185
Block first atom: 7206
Blocpdb> 47 atoms in block 186
Block first atom: 7247
Blocpdb> 33 atoms in block 187
Block first atom: 7294
Blocpdb> 45 atoms in block 188
Block first atom: 7327
Blocpdb> 42 atoms in block 189
Block first atom: 7372
Blocpdb> 31 atoms in block 190
Block first atom: 7413
Blocpdb> 190 blocks.
Blocpdb> At most, 53 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2501975 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 22332
Prepmat> Matrix trace = 5461280.0000
Prepmat> Last element read: 22332 22332 97.8192
Prepmat> 18146 lines saved.
Prepmat> 16674 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7444
RTB> Total mass = 7444.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 7444
RTB> Number of blocks = 190
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 184071.3669
RTB> 50106 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1140
Diagstd> Nb of non-zero elements: 50106
Diagstd> Projected matrix trace = 184071.3669
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1140 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 184071.3669
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0015011 0.0021075 0.0052068 0.0080197
0.0172493 0.0202224 0.0299712 0.0327664 0.0432935
0.0799664 0.0991499 0.1147090 0.1508433 0.1897625
0.2090226 0.2162666 0.2190329 0.2340376 0.2887459
0.3374990 0.4445008 0.4781802 0.5292669 0.5490135
0.5963543 0.6967309 0.7436907 0.8141407 0.8995834
0.9899781 1.0063664 1.0125811 1.1733451 1.3055848
1.3884667 1.5354546 1.6359771 1.7230979 1.7765223
1.9046230 2.0158447 2.1414526 2.1931517 2.4154453
2.4829704 2.6550668 2.8182081 2.9141650 3.0107244
3.1532053 3.2397251 3.4097427 3.5259839 3.5638423
3.6587935 3.7134695 3.8212129 3.8928479 4.0580821
4.3030308 4.3767821 4.4254243 4.4956192 4.6430862
4.9955641 5.2507382 5.3572336 5.5438679 5.9079318
6.1766776 6.3188590 6.4579055 6.5069501 6.7304348
6.8490662 6.9447674 7.1833341 7.3514304 7.5127056
7.8291983 7.9307490 8.0335593 8.3000739 8.3537251
8.5716627 9.0757990 9.3826146 9.5201402 9.7034636
9.8943823 10.2610869 10.6470420 10.7484466 11.3042890
11.3651521 11.5819624 11.7162329 11.9321838 12.1898444
12.3492323
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034326 0.0034330 0.0034330 0.0034340
0.0034341 4.2072598 4.9851248 7.8357241 9.7246742
14.2620201 15.4422801 18.7995593 19.6566604 22.5947077
30.7078275 34.1933275 36.7784975 42.1753094 47.3042872
49.6468677 50.4998368 50.8217857 52.5337108 58.3516595
63.0857832 72.3988276 75.0915495 79.0010142 80.4612506
83.8585722 90.6416505 93.6464792 97.9817107 102.9949656
108.0458444 108.9364835 109.2723276 117.6273069 124.0788660
127.9566954 134.5593166 138.8941299 142.5444334 144.7373503
149.8648533 154.1784993 158.9093734 160.8161349 168.7694697
171.1122301 176.9428463 182.2979591 185.3755073 188.4216421
192.8285809 195.4561581 200.5192567 203.9085521 205.0003098
207.7132641 209.2595122 212.2735562 214.2540300 218.7538458
225.2591847 227.1813840 228.4403097 230.2449093 233.9907317
242.7099329 248.8315596 251.3422920 255.6829207 263.9447435
269.8812717 272.9698080 275.9568140 277.0027110 281.7194556
284.1914210 286.1700194 291.0437741 294.4294202 297.6414868
303.8462822 305.8104936 307.7862982 312.8500720 313.8595658
317.9272968 327.1430620 332.6267861 335.0556558 338.2662515
341.5777886 347.8499637 354.3315016 356.0148657 365.1042650
366.0858192 369.5611895 371.6971902 375.1070674 379.1354209
381.6060585
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7444
Rtb_to_modes> Number of blocs = 190
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9913E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9922E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5011E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1075E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.2068E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.0197E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7249E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0222E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.9971E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2766E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.3294E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.9966E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9150E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1147
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1508
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1898
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2090
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2163
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2190
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2340
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2887
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3375
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4445
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4782
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5293
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5490
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5964
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6967
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7437
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8141
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8996
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9900
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.006
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.013
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.173
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.306
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.388
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.535
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.636
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.723
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.777
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.905
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.016
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.141
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.193
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.415
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.483
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.655
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.818
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.914
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.011
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.153
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.240
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.410
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.526
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.564
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.659
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.713
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.821
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.893
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.058
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.303
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.377
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.425
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.496
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.643
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.996
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.251
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.357
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.544
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.908
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.177
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.319
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.458
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.507
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.730
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.849
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.945
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.183
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.351
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.513
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.829
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.931
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.034
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.300
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.354
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.572
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.076
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.383
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.520
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.703
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.894
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.35
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1140 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00004 0.99996 0.99997 1.00003
1.00000 0.99996 0.99998 0.99998 1.00001
0.99997 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000
1.00000 1.00003 0.99996 0.99997 1.00001
0.99996 1.00000 1.00000 1.00004 1.00003
1.00003 0.99997 1.00001 1.00004 1.00001
1.00002 0.99997 1.00004 1.00000 1.00000
1.00001 1.00002 1.00000 1.00004 1.00002
0.99996 0.99997 0.99997 0.99998 0.99999
1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00003
1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 1.00004
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999
1.00001 0.99997 0.99997 1.00002 1.00003
1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002
0.99997 1.00001 1.00004 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000
1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 0.99997
1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001
1.00004
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 133992 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00004 0.99996 0.99997 1.00003
1.00000 0.99996 0.99998 0.99998 1.00001
0.99997 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000
1.00000 1.00003 0.99996 0.99997 1.00001
0.99996 1.00000 1.00000 1.00004 1.00003
1.00003 0.99997 1.00001 1.00004 1.00001
1.00002 0.99997 1.00004 1.00000 1.00000
1.00001 1.00002 1.00000 1.00004 1.00002
0.99996 0.99997 0.99997 0.99998 0.99999
1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00003
1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 1.00004
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999
1.00001 0.99997 0.99997 1.00002 1.00003
1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002
0.99997 1.00001 1.00004 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000
1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 0.99997
1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001
1.00004
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607180828532135053.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607180828532135053.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607180828532135053.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607180828532135053.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 940
First residue number = 1
Last residue number = 114
Number of atoms found = 7444
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9913E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9922E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5011E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1075E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.2068E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.0197E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7249E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0222E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9971E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2766E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.3294E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.9966E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9150E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1147
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1508
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1898
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2090
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2163
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2190
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2340
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2887
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3375
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4445
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4782
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5293
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5490
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5964
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6967
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7437
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8141
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8996
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9900
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.006
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.013
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.173
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.306
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.388
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.535
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.636
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.723
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.777
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.905
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.016
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.141
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.193
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.415
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.483
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.655
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.818
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.914
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.011
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.153
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.240
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.410
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.526
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.564
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.659
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.713
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.821
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.893
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.058
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.303
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.377
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.425
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.496
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.643
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.996
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.251
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.357
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.544
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.908
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.177
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.319
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.458
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.507
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.730
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.849
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.945
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.183
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.351
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.513
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.829
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.931
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.034
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.300
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.354
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.572
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.076
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.383
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.520
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.703
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.894
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.35
Bfactors> 106 vectors, 22332 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.001501
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 3.151 +/- 16.45
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -3.151
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607180828532135053.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607180828532135053.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.207
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.985
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.835
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.724
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.6
Chkmod> 106 vectors, 22332 coordinates in file.
Chkmod> That is: 7444 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9285
0.0034 0.7741
0.0034 0.9639
0.0034 0.9247
0.0034 0.7105
0.0034 0.6118
4.2071 0.0153
4.9849 0.0950
7.8354 0.0487
9.7242 0.0716
14.2613 0.1469
15.4415 0.0701
18.7987 0.1229
19.6557 0.0063
22.5939 0.0773
30.7064 0.0587
34.1919 0.0431
36.7755 0.0314
42.1674 0.0515
47.3069 0.1219
49.6421 0.0616
50.5016 0.1139
50.8158 0.0548
52.5272 0.0850
58.3445 0.2409
63.0832 0.2975
72.3957 0.0891
75.0899 0.2138
79.0001 0.0952
80.4568 0.0680
83.8582 0.0248
90.6358 0.1189
93.6430 0.1213
97.9751 0.1753
102.9915 0.0786
108.0424 0.0898
108.9120 0.0503
109.2902 0.2214
117.6050 0.1772
124.0933 0.2500
127.9297 0.0810
134.5336 0.0546
138.8891 0.2945
142.5343 0.1429
144.7506 0.0653
149.8733 0.1878
154.1778 0.1972
158.8858 0.0550
160.8037 0.0707
168.7467 0.3039
171.1059 0.4412
176.9330 0.2985
182.2834 0.0948
185.3623 0.3557
188.4222 0.2060
192.8140 0.1609
195.4561 0.0695
200.5182 0.0321
203.9003 0.3356
204.9960 0.0508
207.7102 0.5035
209.2373 0.0705
212.2585 0.4784
214.2490 0.1194
218.7422 0.4043
225.2487 0.1067
227.1773 0.2455
228.4196 0.1791
230.2448 0.0280
233.9785 0.2204
242.7101 0.3975
248.8271 0.0403
251.3260 0.0795
255.6750 0.3246
263.9349 0.3839
269.8767 0.5300
272.9611 0.1455
275.9470 0.1028
276.9919 0.4757
281.6983 0.2458
284.1778 0.0435
286.1625 0.0849
291.0245 0.1668
294.4082 0.3728
297.6345 0.4464
303.8294 0.1944
305.8022 0.4499
307.7815 0.1672
312.8352 0.4412
313.8513 0.2069
317.9199 0.3893
327.1326 0.0646
332.6193 0.1375
335.0388 0.0363
338.2437 0.2641
341.5565 0.4533
347.8166 0.0485
354.3655 0.1513
356.0253 0.3474
365.0193 0.0703
366.1482 0.3319
369.5140 0.3270
371.7410 0.3831
375.0566 0.3907
379.1216 0.1133
381.6015 0.4486
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2607180828532135053 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
making animated gifs
11 models are in 2607180828532135053.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607180828532135053.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607180828532135053.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2607180828532135053 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
making animated gifs
11 models are in 2607180828532135053.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607180828532135053.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607180828532135053.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2607180828532135053 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
making animated gifs
11 models are in 2607180828532135053.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607180828532135053.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607180828532135053.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2607180828532135053 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
making animated gifs
11 models are in 2607180828532135053.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607180828532135053.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607180828532135053.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2607180828532135053 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607180828532135053.eigenfacs
2607180828532135053.atom
making animated gifs
11 models are in 2607180828532135053.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607180828532135053.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607180828532135053.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2607180828532135053.10.pdb
2607180828532135053.11.pdb
2607180828532135053.7.pdb
2607180828532135053.8.pdb
2607180828532135053.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m45.008s
user 0m44.805s
sys 0m0.196s
rm: cannot remove '2607180828532135053.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
