CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  xx  ***

LOGs for ID: 2607190525002433494

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607190525002433494.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607190525002433494.atom to be opened. Openam> File opened: 2607190525002433494.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 354 First residue number = 1 Last residue number = 354 Number of atoms found = 2695 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.021156 +/- 14.456224 From: -27.873000 To: 50.725000 = 0.121896 +/- 24.917355 From: -68.326000 To: 49.330000 = -0.011442 +/- 20.574696 From: -44.711000 To: 39.270000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9575 % Filled. Pdbmat> 639866 non-zero elements. Pdbmat> 69314 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 51.44 +/- 18.75 Maximum number = 115 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 1.386280E+06 Pdbmat> Larger element = 447.043 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 354 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607190525002433494.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607190525002433494.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607190525002433494.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2695 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 354 residues. Blocpdb> 14 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 15 atoms in block 2 Block first atom: 15 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 30 Blocpdb> 17 atoms in block 4 Block first atom: 46 Blocpdb> 16 atoms in block 5 Block first atom: 63 Blocpdb> 13 atoms in block 6 Block first atom: 79 Blocpdb> 12 atoms in block 7 Block first atom: 92 Blocpdb> 13 atoms in block 8 Block first atom: 104 Blocpdb> 13 atoms in block 9 Block first atom: 117 Blocpdb> 17 atoms in block 10 Block first atom: 130 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 147 Blocpdb> 17 atoms in block 12 Block first atom: 162 Blocpdb> 14 atoms in block 13 Block first atom: 179 Blocpdb> 13 atoms in block 14 Block first atom: 193 Blocpdb> 18 atoms in block 15 Block first atom: 206 Blocpdb> 20 atoms in block 16 Block first atom: 224 Blocpdb> 11 atoms in block 17 Block first atom: 244 Blocpdb> 11 atoms in block 18 Block first atom: 255 Blocpdb> 10 atoms in block 19 Block first atom: 266 Blocpdb> 12 atoms in block 20 Block first atom: 276 Blocpdb> 9 atoms in block 21 Block first atom: 288 Blocpdb> 12 atoms in block 22 Block first atom: 297 Blocpdb> 10 atoms in block 23 Block first atom: 309 Blocpdb> 16 atoms in block 24 Block first atom: 319 Blocpdb> 10 atoms in block 25 Block first atom: 335 Blocpdb> 18 atoms in block 26 Block first atom: 345 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 363 Blocpdb> 20 atoms in block 28 Block first atom: 379 Blocpdb> 15 atoms in block 29 Block first atom: 399 Blocpdb> 15 atoms in block 30 Block first atom: 414 Blocpdb> 11 atoms in block 31 Block first atom: 429 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 440 Blocpdb> 17 atoms in block 33 Block first atom: 455 Blocpdb> 16 atoms in block 34 Block first atom: 472 Blocpdb> 12 atoms in block 35 Block first atom: 488 Blocpdb> 17 atoms in block 36 Block first atom: 500 Blocpdb> 12 atoms in block 37 Block first atom: 517 Blocpdb> 15 atoms in block 38 Block first atom: 529 Blocpdb> 12 atoms in block 39 Block first atom: 544 Blocpdb> 12 atoms in block 40 Block first atom: 556 Blocpdb> 12 atoms in block 41 Block first atom: 568 Blocpdb> 18 atoms in block 42 Block first atom: 580 Blocpdb> 14 atoms in block 43 Block first atom: 598 Blocpdb> 16 atoms in block 44 Block first atom: 612 Blocpdb> 16 atoms in block 45 Block first atom: 628 Blocpdb> 11 atoms in block 46 Block first atom: 644 Blocpdb> 12 atoms in block 47 Block first atom: 655 Blocpdb> 15 atoms in block 48 Block first atom: 667 Blocpdb> 18 atoms in block 49 Block first atom: 682 Blocpdb> 11 atoms in block 50 Block first atom: 700 Blocpdb> 17 atoms in block 51 Block first atom: 711 Blocpdb> 17 atoms in block 52 Block first atom: 728 Blocpdb> 14 atoms in block 53 Block first atom: 745 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 759 Blocpdb> 18 atoms in block 55 Block first atom: 774 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 792 Blocpdb> 18 atoms in block 57 Block first atom: 806 Blocpdb> 9 atoms in block 58 Block first atom: 824 Blocpdb> 11 atoms in block 59 Block first atom: 833 Blocpdb> 16 atoms in block 60 Block first atom: 844 Blocpdb> 17 atoms in block 61 Block first atom: 860 Blocpdb> 14 atoms in block 62 Block first atom: 877 Blocpdb> 10 atoms in block 63 Block first atom: 891 Blocpdb> 14 atoms in block 64 Block first atom: 901 Blocpdb> 21 atoms in block 65 Block first atom: 915 Blocpdb> 16 atoms in block 66 Block first atom: 936 Blocpdb> 14 atoms in block 67 Block first atom: 952 Blocpdb> 21 atoms in block 68 Block first atom: 966 Blocpdb> 18 atoms in block 69 Block first atom: 987 Blocpdb> 16 atoms in block 70 Block first atom: 1005 Blocpdb> 14 atoms in block 71 Block first atom: 1021 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 1035 Blocpdb> 11 atoms in block 73 Block first atom: 1046 Blocpdb> 13 atoms in block 74 Block first atom: 1057 Blocpdb> 17 atoms in block 75 Block first atom: 1070 Blocpdb> 17 atoms in block 76 Block first atom: 1087 Blocpdb> 14 atoms in block 77 Block first atom: 1104 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 1118 Blocpdb> 19 atoms in block 79 Block first atom: 1135 Blocpdb> 20 atoms in block 80 Block first atom: 1154 Blocpdb> 13 atoms in block 81 Block first atom: 1174 Blocpdb> 11 atoms in block 82 Block first atom: 1187 Blocpdb> 11 atoms in block 83 Block first atom: 1198 Blocpdb> 8 atoms in block 84 Block first atom: 1209 Blocpdb> 14 atoms in block 85 Block first atom: 1217 Blocpdb> 21 atoms in block 86 Block first atom: 1231 Blocpdb> 16 atoms in block 87 Block first atom: 1252 Blocpdb> 14 atoms in block 88 Block first atom: 1268 Blocpdb> 21 atoms in block 89 Block first atom: 1282 Blocpdb> 18 atoms in block 90 Block first atom: 1303 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1321 Blocpdb> 11 atoms in block 92 Block first atom: 1337 Blocpdb> 11 atoms in block 93 Block first atom: 1348 Blocpdb> 12 atoms in block 94 Block first atom: 1359 Blocpdb> 14 atoms in block 95 Block first atom: 1371 Blocpdb> 17 atoms in block 96 Block first atom: 1385 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 1402 Blocpdb> 20 atoms in block 98 Block first atom: 1421 Blocpdb> 13 atoms in block 99 Block first atom: 1441 Blocpdb> 17 atoms in block 100 Block first atom: 1454 Blocpdb> 12 atoms in block 101 Block first atom: 1471 Blocpdb> 11 atoms in block 102 Block first atom: 1483 Blocpdb> 11 atoms in block 103 Block first atom: 1494 Blocpdb> 12 atoms in block 104 Block first atom: 1505 Blocpdb> 17 atoms in block 105 Block first atom: 1517 Blocpdb> 12 atoms in block 106 Block first atom: 1534 Blocpdb> 21 atoms in block 107 Block first atom: 1546 Blocpdb> 18 atoms in block 108 Block first atom: 1567 Blocpdb> 10 atoms in block 109 Block first atom: 1585 Blocpdb> 20 atoms in block 110 Block first atom: 1595 Blocpdb> 13 atoms in block 111 Block first atom: 1615 Blocpdb> 17 atoms in block 112 Block first atom: 1628 Blocpdb> 11 atoms in block 113 Block first atom: 1645 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 1656 Blocpdb> 18 atoms in block 115 Block first atom: 1672 Blocpdb> 15 atoms in block 116 Block first atom: 1690 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1705 Blocpdb> 10 atoms in block 118 Block first atom: 1722 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 1732 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1752 Blocpdb> 15 atoms in block 121 Block first atom: 1767 Blocpdb> 13 atoms in block 122 Block first atom: 1782 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1795 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 1810 Blocpdb> 12 atoms in block 125 Block first atom: 1825 Blocpdb> 12 atoms in block 126 Block first atom: 1837 Blocpdb> 18 atoms in block 127 Block first atom: 1849 Blocpdb> 23 atoms in block 128 Block first atom: 1867 Blocpdb> 20 atoms in block 129 Block first atom: 1890 Blocpdb> 15 atoms in block 130 Block first atom: 1910 Blocpdb> 15 atoms in block 131 Block first atom: 1925 Blocpdb> 13 atoms in block 132 Block first atom: 1940 Blocpdb> 18 atoms in block 133 Block first atom: 1953 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 1971 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 1986 Blocpdb> 18 atoms in block 136 Block first atom: 2003 Blocpdb> 21 atoms in block 137 Block first atom: 2021 Blocpdb> 18 atoms in block 138 Block first atom: 2042 Blocpdb> 21 atoms in block 139 Block first atom: 2060 Blocpdb> 16 atoms in block 140 Block first atom: 2081 Blocpdb> 15 atoms in block 141 Block first atom: 2097 Blocpdb> 17 atoms in block 142 Block first atom: 2112 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 2129 Blocpdb> 17 atoms in block 144 Block first atom: 2149 Blocpdb> 21 atoms in block 145 Block first atom: 2166 Blocpdb> 21 atoms in block 146 Block first atom: 2187 Blocpdb> 11 atoms in block 147 Block first atom: 2208 Blocpdb> 18 atoms in block 148 Block first atom: 2219 Blocpdb> 14 atoms in block 149 Block first atom: 2237 Blocpdb> 11 atoms in block 150 Block first atom: 2251 Blocpdb> 18 atoms in block 151 Block first atom: 2262 Blocpdb> 15 atoms in block 152 Block first atom: 2280 Blocpdb> 14 atoms in block 153 Block first atom: 2295 Blocpdb> 16 atoms in block 154 Block first atom: 2309 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 2325 Blocpdb> 16 atoms in block 156 Block first atom: 2345 Blocpdb> 12 atoms in block 157 Block first atom: 2361 Blocpdb> 17 atoms in block 158 Block first atom: 2373 Blocpdb> 17 atoms in block 159 Block first atom: 2390 Blocpdb> 15 atoms in block 160 Block first atom: 2407 Blocpdb> 19 atoms in block 161 Block first atom: 2422 Blocpdb> 15 atoms in block 162 Block first atom: 2441 Blocpdb> 16 atoms in block 163 Block first atom: 2456 Blocpdb> 18 atoms in block 164 Block first atom: 2472 Blocpdb> 14 atoms in block 165 Block first atom: 2490 Blocpdb> 17 atoms in block 166 Block first atom: 2504 Blocpdb> 17 atoms in block 167 Block first atom: 2521 Blocpdb> 22 atoms in block 168 Block first atom: 2538 Blocpdb> 15 atoms in block 169 Block first atom: 2560 Blocpdb> 12 atoms in block 170 Block first atom: 2575 Blocpdb> 15 atoms in block 171 Block first atom: 2587 Blocpdb> 15 atoms in block 172 Block first atom: 2602 Blocpdb> 8 atoms in block 173 Block first atom: 2617 Blocpdb> 10 atoms in block 174 Block first atom: 2625 Blocpdb> 20 atoms in block 175 Block first atom: 2635 Blocpdb> 20 atoms in block 176 Block first atom: 2655 Blocpdb> 21 atoms in block 177 Block first atom: 2674 Blocpdb> 177 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 640043 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8085 Prepmat> Matrix trace = 1386280.0000 Prepmat> Last element read: 8085 8085 118.9101 Prepmat> 15754 lines saved. Prepmat> 14761 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2695 RTB> Total mass = 2695.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2695 RTB> Number of blocks = 177 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 135833.9313 RTB> 33057 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1062 Diagstd> Nb of non-zero elements: 33057 Diagstd> Projected matrix trace = 135833.9313 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1062 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 135833.9313 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0016190 0.0025863 0.0034067 0.0039102 0.0050767 0.0093554 0.0106663 0.0138526 0.0153369 0.0201458 0.0264861 0.0297502 0.0572458 0.0584503 0.0691185 0.0837362 0.0950688 0.1005141 0.1049615 0.1344584 0.1543880 0.1610856 0.1882621 0.2159097 0.2568124 0.3002233 0.3033127 0.3420263 0.3470300 0.3762508 0.4129726 0.5062881 0.5549078 0.5581428 0.5994261 0.6129457 0.6462821 0.6776154 0.7002829 0.8508862 0.9533981 1.0408892 1.0969948 1.1191829 1.1698205 1.2495393 1.2953838 1.3999964 1.4989111 1.5480514 1.5836969 1.6992988 1.7149019 1.7459219 1.8991547 1.9358034 2.0288528 2.1037653 2.1163505 2.1476360 2.2338316 2.3032709 2.3462442 2.4481944 2.5699455 2.5919437 2.6845296 2.7092953 2.7578825 2.9211697 3.0098181 3.0870074 3.3064471 3.3877767 3.5298440 3.5675662 3.7113774 3.7681925 3.9121518 3.9291598 4.2381683 4.2982610 4.5140680 4.5568074 4.8144424 4.9510496 5.0055658 5.0887252 5.2135511 5.3574865 5.6233858 5.7080897 5.8396223 5.8669647 5.9370986 6.0644267 6.1415925 6.2010234 6.2327771 6.3641043 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034336 0.0034336 0.0034337 0.0034337 0.0034339 0.0034342 4.3693566 5.5225239 6.3381202 6.7903527 7.7372384 10.5033052 11.2150857 12.7808629 13.4481973 15.4130250 17.6727420 18.7301005 25.9816794 26.2535937 28.5490904 31.4233007 33.4822294 34.4277583 35.1811750 39.8189049 42.6679834 43.5836536 47.1169032 50.4581561 55.0304747 59.5000730 59.8054254 63.5074994 63.9703606 66.6091676 69.7840029 77.2670191 80.8920220 81.1274724 84.0742666 85.0171000 87.2984105 89.3895825 90.8724070 100.1684664 106.0308924 110.7892243 113.7358984 114.8803691 117.4505075 121.3864574 123.5931830 128.4868669 132.9484305 135.1101481 136.6568227 141.5566097 142.2050162 143.4853903 149.6495630 151.0865840 154.6751511 157.5048491 157.9752580 159.1386323 162.3007376 164.8040154 166.3343286 169.9097237 174.0833490 174.8268220 177.9218876 178.7406997 180.3363027 185.5981627 188.3932797 190.7937390 197.4586087 199.8723281 204.0201377 205.1073854 209.2005596 210.7957369 214.7845960 215.2509748 223.5549955 225.1343030 230.7168586 231.8065041 238.2694041 241.6261408 242.9527781 244.9625990 247.9488506 251.3482256 257.5100714 259.4422332 262.4143981 263.0280216 264.5954736 267.4177043 269.1136813 270.4126254 271.1040946 273.9453457 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2695 Rtb_to_modes> Number of blocs = 177 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6190E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5863E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.4067E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.9102E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.0767E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.3554E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0666E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3853E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5337E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0146E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6486E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.9750E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.7246E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.8450E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.9118E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.3736E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.5069E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1005 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1050 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1345 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1544 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1611 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1883 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2568 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3002 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3033 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3420 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3470 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3763 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4130 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5063 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5549 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5581 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5994 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6129 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6463 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6776 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7003 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8509 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9534 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.041 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.097 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.119 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.170 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.250 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.295 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.400 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.499 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.548 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.584 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.699 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.715 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.746 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.899 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.936 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.029 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.116 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.148 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.234 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.303 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.346 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.448 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.570 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.592 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.685 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.709 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.758 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.921 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.010 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.087 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.306 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.388 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.530 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.568 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.711 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.768 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.912 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.929 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.238 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.298 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.514 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.557 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.814 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.951 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.006 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.089 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.214 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.357 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.623 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.708 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.840 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.867 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.937 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.064 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.142 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.201 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.233 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.364 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1062 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 0.99999 1.00003 1.00003 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 1.00005 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00004 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00003 1.00004 0.99997 0.99996 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99996 1.00003 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 48510 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 0.99999 1.00003 1.00003 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 1.00005 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00004 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00003 1.00004 0.99997 0.99996 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99996 1.00003 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607190525002433494.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607190525002433494.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607190525002433494.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607190525002433494.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 354 First residue number = 1 Last residue number = 354 Number of atoms found = 2695 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6190E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5863E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.4067E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9102E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.0767E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.3554E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0666E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3853E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5337E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0146E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6486E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9750E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.7246E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.8450E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.9118E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.3736E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.5069E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1005 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1050 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1345 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1544 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1611 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1883 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2568 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3002 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3033 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3420 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3470 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3763 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4130 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5063 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5549 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5581 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5994 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6129 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6463 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6776 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7003 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8509 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9534 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.041 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.097 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.119 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.170 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.250 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.295 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.400 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.499 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.548 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.584 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.699 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.715 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.746 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.899 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.936 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.029 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.116 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.148 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.234 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.303 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.346 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.448 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.570 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.592 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.685 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.709 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.758 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.921 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.010 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.087 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.306 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.388 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.530 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.568 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.711 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.768 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.912 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.929 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.238 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.298 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.514 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.557 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.814 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.951 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.006 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.089 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.214 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.357 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.623 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.708 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.840 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.867 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.937 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.064 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.142 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.201 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.233 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.364 Bfactors> 106 vectors, 8085 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.001619 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.067 for 354 C-alpha atoms. Bfactors> = 12.358 +/- 24.93 Bfactors> = 53.428 +/- 25.10 Bfactors> Shiftng-fct= 41.070 Bfactors> Scaling-fct= 1.007 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607190525002433494.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607190525002433494.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.522 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.338 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.790 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.9 Chkmod> 106 vectors, 8085 coordinates in file. Chkmod> That is: 2695 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 31 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7343 0.0034 0.6930 0.0034 0.7401 0.0034 0.9785 0.0034 0.8511 0.0034 0.9771 4.3692 0.3390 5.5223 0.1085 6.3379 0.1658 6.7901 0.2354 7.7369 0.4758 10.5029 0.3871 11.2144 0.4309 12.7805 0.5118 13.4477 0.0194 15.4124 0.5349 17.6720 0.4730 18.7292 0.4573 25.9806 0.5818 26.2524 0.4798 28.5478 0.5634 31.4219 0.4728 33.4808 0.5683 34.4239 0.3679 35.1861 0.5642 39.8233 0.4913 42.6678 0.2434 43.5837 0.5041 47.1196 0.2930 50.4549 0.5621 55.0268 0.3133 59.4952 0.4259 59.8016 0.5023 63.5023 0.2420 63.9648 0.3374 66.6107 0.3681 69.7833 0.4647 77.2646 0.5019 80.8880 0.3262 81.1209 0.2974 84.0688 0.3995 85.0103 0.0515 87.2959 0.4367 89.3847 0.4127 90.8696 0.4987 100.1650 0.4924 106.0264 0.3111 110.7904 0.2676 113.7313 0.2325 114.8660 0.2770 117.4545 0.4513 121.4036 0.3111 123.5696 0.2967 128.4815 0.6148 132.9467 0.2610 135.1021 0.4310 136.6640 0.4146 141.5381 0.2777 142.2030 0.4261 143.4824 0.3817 149.6370 0.1045 151.0878 0.3050 154.6741 0.1739 157.5069 0.2504 157.9554 0.2944 159.1453 0.1799 162.2999 0.3602 164.7872 0.3718 166.3185 0.2196 169.8957 0.1555 174.0777 0.2370 174.8212 0.2985 177.9298 0.1230 178.7233 0.0629 180.3324 0.3209 185.5848 0.1879 188.3909 0.1360 190.7853 0.0621 197.4368 0.3567 199.8703 0.2774 204.0159 0.2798 205.1111 0.2039 209.1809 0.2958 210.7813 0.2923 214.7712 0.1732 215.2374 0.1419 223.5410 0.0469 225.1178 0.1166 230.7052 0.0805 231.8015 0.2864 238.2482 0.0747 241.6146 0.1141 242.9529 0.2391 244.9587 0.2860 247.9489 0.2114 251.3260 0.2075 257.4902 0.2839 259.4291 0.0681 262.4116 0.1485 263.0175 0.1061 264.5819 0.2568 267.3968 0.0319 269.1111 0.2644 270.4005 0.2369 271.0973 0.3322 273.9313 0.2355 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2607190525002433494 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom making animated gifs 11 models are in 2607190525002433494.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607190525002433494.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607190525002433494.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2607190525002433494 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom making animated gifs 11 models are in 2607190525002433494.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607190525002433494.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607190525002433494.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2607190525002433494 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom making animated gifs 11 models are in 2607190525002433494.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607190525002433494.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607190525002433494.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2607190525002433494 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom making animated gifs 11 models are in 2607190525002433494.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607190525002433494.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607190525002433494.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2607190525002433494 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607190525002433494.eigenfacs 2607190525002433494.atom making animated gifs 11 models are in 2607190525002433494.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607190525002433494.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607190525002433494.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2607190525002433494.10.pdb 2607190525002433494.11.pdb 2607190525002433494.7.pdb 2607190525002433494.8.pdb 2607190525002433494.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m21.242s user 0m21.141s sys 0m0.094s rm: cannot remove '2607190525002433494.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.