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***  VIRUS LIKE PARTICLE 01-FEB-24 8RVJ  ***

CA distance fluctuations for 2607202025523007573

---  normal mode 7  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
GLY 45 0.02 MET 1 -0.08 THR 13
PRO 43 0.01 ASN 2 -0.07 THR 13
PRO 43 0.01 LYS 3 -0.07 PRO 8
PRO 43 0.01 SER 4 -0.07 PRO 8
MET 1 0.01 GLN 5 -0.10 PRO 8
MET 1 0.01 LEU 6 -0.09 ASP 9
MET 1 0.02 TYR 7 -0.08 ASP 9
MET 1 0.02 PRO 8 -0.10 PRO 8
MET 1 0.02 ASP 9 -0.06 PRO 8
GLN 15 0.01 SER 10 -0.05 PRO 8
ASP 139 0.01 PRO 11 -0.04 PRO 8
GLU 168 0.01 LEU 12 -0.04 PRO 8
PRO 43 0.01 THR 13 -0.06 PRO 8
PRO 43 0.01 ASP 14 -0.06 PRO 8
PRO 43 0.01 GLN 15 -0.05 GLN 5
GLU 168 0.01 ASP 16 -0.04 PRO 8
GLU 168 0.01 PHE 17 -0.05 PRO 8
GLU 168 0.01 ASN 18 -0.04 PRO 8
GLU 168 0.02 GLN 19 -0.04 PRO 8
GLU 168 0.02 LEU 20 -0.03 PRO 8
GLU 168 0.02 ASP 21 -0.04 THR 13
GLU 168 0.02 GLN 22 -0.03 THR 13
GLU 168 0.03 THR 23 -0.03 PRO 8
GLU 168 0.03 VAL 24 -0.03 PRO 8
GLU 168 0.03 ILE 25 -0.04 PRO 8
GLU 168 0.03 GLU 26 -0.04 PRO 8
GLU 168 0.04 ALA 27 -0.04 PRO 8
GLU 168 0.04 ALA 28 -0.04 PRO 8
ARG 112 0.03 ARG 29 -0.05 PRO 8
GLU 168 0.04 ARG 30 -0.05 PRO 8
GLU 168 0.04 GLN 31 -0.05 GLY 284
ARG 112 0.04 LEU 32 -0.06 GLY 284
ARG 112 0.05 VAL 33 -0.06 GLY 284
ARG 112 0.05 GLY 34 -0.07 GLY 284
ARG 112 0.04 ARG 35 -0.07 PRO 8
ARG 112 0.04 ARG 36 -0.08 PRO 8
LYS 178 0.04 PHE 37 -0.08 ASP 9
ARG 112 0.04 ILE 38 -0.08 PRO 8
ARG 112 0.03 GLU 39 -0.09 PRO 8
ARG 112 0.03 LEU 40 -0.08 LEU 6
ARG 112 0.03 TYR 41 -0.09 LEU 6
ARG 112 0.02 GLY 42 -0.09 GLY 47
ARG 112 0.02 PRO 43 -0.07 GLY 47
ARG 112 0.02 LEU 44 -0.08 GLY 47
MET 1 0.02 GLY 45 -0.08 ALA 137
MET 1 0.01 ARG 46 -0.05 ALA 137
MET 1 0.01 GLY 47 -0.08 GLN 134
ASN 115 0.01 MET 48 -0.05 GLY 47
ARG 113 0.02 GLN 49 -0.04 MET 48
VAL 114 0.03 SER 50 -0.04 MET 48
VAL 114 0.03 VAL 51 -0.07 GLY 47
ASP 170 0.04 PHE 52 -0.07 LEU 283
ASP 170 0.05 ASN 53 -0.08 GLY 284
ASP 170 0.05 ASP 54 -0.11 GLY 284
ASP 170 0.06 ILE 55 -0.11 GLY 284
ASP 170 0.05 PHE 56 -0.13 GLY 284
LYS 178 0.06 MET 57 -0.13 GLU 286
LYS 178 0.06 GLU 58 -0.14 GLU 286
ASP 170 0.06 SER 111 -0.13 GLY 284
ASP 170 0.07 ARG 112 -0.10 GLY 284
ASP 170 0.07 ARG 113 -0.09 LEU 283
ASP 170 0.07 VAL 114 -0.07 GLY 284
ASN 115 0.06 ASN 115 -0.05 GLY 284
VAL 114 0.07 TYR 116 -0.05 GLY 284
ARG 113 0.07 THR 117 -0.04 GLY 284
ARG 113 0.05 ILE 118 -0.04 GLY 284
ARG 112 0.06 PRO 119 -0.04 GLY 284
ARG 112 0.05 MET 120 -0.03 GLY 284
SER 111 0.05 LEU 121 -0.03 GLY 284
VAL 126 0.05 TYR 122 -0.03 GLU 286
GLU 168 0.05 LYS 123 -0.03 GLU 286
GLY 287 0.05 ASP 124 -0.02 GLU 286
GLU 168 0.05 PHE 125 -0.02 GLU 286
GLU 168 0.04 VAL 126 -0.02 GLU 286
GLU 168 0.03 LEU 127 -0.02 GLU 286
GLU 168 0.04 TYR 128 -0.01 GLU 286
GLU 168 0.03 TRP 129 -0.01 GLU 286
GLU 168 0.03 ARG 130 -0.01 GLU 286
GLU 168 0.03 ASP 131 -0.01 PRO 8
GLU 168 0.02 LEU 132 -0.02 PRO 8
GLU 168 0.02 GLU 133 -0.02 GLN 5
GLU 168 0.02 GLN 134 -0.02 GLN 5
GLU 168 0.02 SER 135 -0.02 GLN 5
GLU 168 0.01 LYS 136 -0.03 GLN 5
GLU 168 0.01 ALA 137 -0.03 GLN 5
GLU 168 0.01 LEU 138 -0.03 GLN 5
GLU 168 0.01 ASP 139 -0.03 GLN 5
GLU 168 0.02 ILE 140 -0.03 GLN 5
GLU 168 0.02 PRO 141 -0.03 GLN 5
GLU 168 0.02 ILE 142 -0.03 PRO 8
GLU 168 0.03 ASP 143 -0.02 PRO 8
GLU 168 0.03 PHE 144 -0.02 GLU 286
GLU 168 0.04 SER 145 -0.03 GLU 286
GLU 168 0.04 VAL 146 -0.03 GLU 286
GLU 168 0.04 ALA 147 -0.03 GLU 286
GLU 168 0.04 ALA 148 -0.03 GLY 284
GLU 168 0.05 ASN 149 -0.03 GLU 286
GLU 168 0.05 ALA 150 -0.03 GLU 286
GLU 168 0.04 ALA 151 -0.03 GLY 284
GLU 168 0.05 ARG 152 -0.04 GLY 284
GLU 168 0.05 ASP 153 -0.04 GLU 286
SER 111 0.05 VAL 154 -0.04 GLY 284
SER 111 0.04 ALA 155 -0.05 GLY 284
SER 111 0.05 PHE 156 -0.05 GLY 284
SER 111 0.06 LEU 157 -0.05 GLU 286
ARG 112 0.06 GLU 158 -0.05 GLY 284
ARG 112 0.06 ASP 159 -0.06 GLY 284
ARG 112 0.07 GLN 160 -0.05 GLU 286
ARG 112 0.08 MET 161 -0.05 GLY 284
ARG 112 0.07 ILE 162 -0.06 GLY 284
ARG 112 0.07 PHE 163 -0.07 GLY 284
ARG 112 0.08 HIS 164 -0.06 GLU 286
ARG 112 0.09 GLY 165 -0.06 GLU 286
ARG 112 0.11 SER 166 -0.05 GLU 286
ARG 112 0.13 LYS 167 -0.05 GLU 286
ARG 112 0.16 GLU 168 -0.04 GLU 286
ARG 112 0.14 PHE 169 -0.04 GLU 286
ARG 112 0.13 ASP 170 -0.05 GLU 286
ARG 112 0.10 ILE 171 -0.06 GLY 284
ARG 112 0.09 PRO 172 -0.07 GLU 286
ARG 112 0.08 GLY 173 -0.07 GLY 284
LYS 178 0.07 LEU 174 -0.08 GLY 284
GLY 179 0.08 MET 175 -0.08 GLU 286
LYS 178 0.09 ASN 176 -0.07 GLU 286
LYS 178 0.09 VAL 177 -0.08 GLU 286
LYS 178 0.09 LYS 178 -0.09 GLU 286
LYS 178 0.08 GLY 179 -0.10 GLU 286
LYS 178 0.07 ARG 180 -0.10 GLU 286
LYS 178 0.07 LEU 181 -0.10 GLU 286
LYS 178 0.07 THR 182 -0.09 GLU 286
GLY 179 0.07 HIS 183 -0.09 GLY 287
GLY 179 0.07 LEU 184 -0.08 GLY 287
PRO 314 0.07 ILE 185 -0.08 GLY 287
PRO 314 0.07 GLY 186 -0.08 GLY 287
PRO 314 0.07 ASN 187 -0.08 GLY 287
PRO 314 0.07 TRP 188 -0.08 GLY 287
PRO 314 0.07 TYR 189 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.07 GLU 190 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.06 SER 191 -0.08 GLY 287
PRO 314 0.06 GLY 192 -0.08 GLY 287
PRO 314 0.06 ASN 193 -0.08 GLY 287
PRO 314 0.06 ALA 194 -0.08 GLY 287
PRO 314 0.06 PHE 195 -0.09 GLY 287
PRO 314 0.06 GLN 196 -0.09 GLY 287
PRO 314 0.06 ASP 197 -0.09 GLY 287
GLY 179 0.06 ILE 198 -0.09 GLY 287
PRO 314 0.05 VAL 199 -0.10 GLY 287
PRO 314 0.06 GLU 200 -0.10 GLY 287
LYS 178 0.06 ALA 201 -0.10 GLY 287
LYS 178 0.05 ARG 202 -0.11 GLU 286
PRO 314 0.05 ASN 203 -0.11 GLY 287
LYS 178 0.06 LYS 204 -0.11 GLY 287
LYS 178 0.05 LEU 205 -0.12 GLU 286
LYS 178 0.05 LEU 206 -0.13 GLU 286
PRO 314 0.05 GLU 207 -0.13 GLY 287
LYS 178 0.05 MET 208 -0.14 GLU 286
LYS 178 0.04 ASN 209 -0.15 GLU 286
LYS 178 0.04 HIS 210 -0.13 GLU 286
LYS 178 0.04 ASN 211 -0.13 GLU 286
LYS 178 0.04 GLY 212 -0.12 GLY 284
LYS 178 0.04 PRO 213 -0.11 ASP 9
LYS 178 0.04 TYR 214 -0.10 GLY 284
LYS 178 0.05 ALA 215 -0.09 GLY 284
GLY 179 0.05 LEU 216 -0.09 GLY 284
GLY 179 0.06 VAL 217 -0.08 GLU 286
GLY 179 0.06 LEU 218 -0.07 GLU 286
GLU 58 0.06 SER 219 -0.07 GLU 286
PRO 314 0.06 PRO 220 -0.06 GLU 286
PRO 314 0.07 GLU 221 -0.06 GLY 287
PRO 314 0.07 LEU 222 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.06 TYR 223 -0.07 GLU 286
PRO 314 0.06 SER 224 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.06 LEU 225 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.06 LEU 226 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.06 HIS 227 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.06 ARG 228 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.06 VAL 229 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.06 HIS 230 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.06 LYS 231 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.06 ASP 232 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.06 THR 233 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.06 ASN 234 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.05 VAL 235 -0.08 GLY 287
PRO 314 0.05 LEU 236 -0.08 GLY 287
PRO 314 0.05 GLU 237 -0.08 GLY 287
PRO 314 0.05 ILE 238 -0.08 ASP 9
PRO 314 0.05 GLU 239 -0.08 ASP 9
PRO 314 0.05 HIS 240 -0.09 ASP 9
PRO 314 0.05 VAL 241 -0.09 GLY 287
PRO 314 0.04 ARG 242 -0.09 ASP 9
PRO 314 0.04 GLU 243 -0.10 ASP 9
LYS 178 0.04 LEU 244 -0.10 ASP 9
LYS 178 0.04 ILE 245 -0.10 ASP 9
LYS 178 0.04 THR 246 -0.10 ASP 9
LYS 178 0.04 ALA 247 -0.10 ASP 9
GLY 179 0.04 GLY 248 -0.09 ASP 9
GLY 179 0.05 VAL 249 -0.08 ASP 9
GLY 179 0.05 PHE 250 -0.07 ASP 9
PRO 314 0.05 GLN 251 -0.07 GLU 286
GLU 58 0.06 SER 252 -0.06 GLU 286
GLU 58 0.06 PRO 253 -0.06 GLU 286
GLU 58 0.07 VAL 254 -0.06 GLU 286
GLU 58 0.07 LEU 255 -0.06 GLU 286
GLU 58 0.08 LYS 256 -0.06 GLU 286
GLY 257 0.08 GLY 257 -0.06 GLY 287
GLY 257 0.07 LYS 258 -0.07 GLY 287
GLY 179 0.07 SER 259 -0.07 GLU 286
GLY 179 0.07 GLY 260 -0.08 GLU 286
GLY 179 0.06 VAL 261 -0.08 GLU 286
LYS 178 0.06 ILE 262 -0.09 GLU 286
LYS 178 0.05 VAL 263 -0.10 GLY 284
LYS 178 0.05 ASN 264 -0.11 GLY 284
LYS 178 0.04 THR 265 -0.11 GLY 284
LYS 178 0.04 GLY 266 -0.12 GLY 284
LYS 178 0.03 ARG 267 -0.12 GLY 284
LYS 178 0.04 ASN 268 -0.13 GLY 284
LYS 178 0.04 ASN 269 -0.12 GLY 284
LYS 178 0.05 LEU 270 -0.10 GLY 284
LYS 178 0.04 ASP 271 -0.09 GLY 284
ARG 112 0.04 LEU 272 -0.07 GLY 284
ARG 112 0.04 ALA 273 -0.07 GLY 47
ARG 112 0.03 ILE 274 -0.06 GLY 47
ARG 112 0.02 SER 275 -0.06 GLY 47
ARG 112 0.02 GLU 276 -0.05 GLY 47
ARG 112 0.03 ASP 277 -0.04 GLY 47
ARG 112 0.03 PHE 278 -0.03 PRO 8
ARG 112 0.02 GLU 279 -0.03 THR 13
GLY 287 0.02 THR 280 -0.03 THR 13
GLY 287 0.02 ALA 281 -0.03 ASP 9
GLU 168 0.02 TYR 282 -0.03 ASP 9
GLU 168 0.02 LEU 283 -0.01 THR 117
GLN 15 0.02 GLY 284 -0.01 THR 117
ASP 139 0.02 GLU 285 -0.01 THR 117
LEU 283 0.04 GLU 286 -0.01 THR 117
GLU 168 0.04 GLY 287 -0.01 THR 117
GLU 168 0.03 MET 288 -0.01 THR 117
GLU 168 0.03 ASN 289 -0.01 GLU 286
GLU 168 0.03 HIS 290 -0.01 GLU 286
GLU 168 0.04 PRO 291 -0.01 GLU 286
GLY 287 0.03 PHE 292 -0.02 GLU 286
GLY 287 0.04 ARG 293 -0.02 GLU 286
GLY 287 0.03 VAL 294 -0.03 GLU 286
GLY 287 0.03 TYR 295 -0.03 GLY 284
ARG 112 0.03 GLU 296 -0.03 GLY 284
ARG 112 0.04 THR 297 -0.04 GLY 47
ARG 112 0.05 VAL 298 -0.05 GLY 284
ARG 112 0.06 VAL 299 -0.06 GLY 284
ARG 112 0.06 LEU 300 -0.07 GLY 284
ARG 112 0.05 ARG 301 -0.08 GLY 284
LYS 178 0.06 ILE 302 -0.09 GLY 284
LYS 178 0.05 LYS 303 -0.11 GLY 284
LYS 178 0.05 ARG 304 -0.12 GLY 284
LYS 178 0.06 PRO 305 -0.10 GLY 284
LYS 178 0.06 ALA 306 -0.11 GLU 286
LYS 178 0.06 ALA 307 -0.11 GLY 284
LYS 178 0.06 ILE 308 -0.10 GLU 286
LYS 178 0.06 CYS 309 -0.10 GLU 286
LYS 178 0.07 THR 310 -0.09 GLU 286
GLY 179 0.07 LEU 311 -0.08 GLU 286
GLY 179 0.08 ILE 312 -0.08 GLY 287
GLY 179 0.08 ASP 313 -0.07 GLY 287
GLY 257 0.08 PRO 314 -0.07 GLY 287
PRO 314 0.09 GLU 315 -0.07 GLY 287
MET 1 0.04 ASN 2 -0.07 GLN 5
MET 1 0.04 LYS 3 -0.07 GLN 5
MET 1 0.04 SER 4 -0.08 GLN 5
MET 1 0.04 GLN 5 -0.09 GLN 5
MET 1 0.04 LEU 6 -0.07 GLN 5
MET 1 0.03 TYR 7 -0.08 GLN 5
MET 1 0.04 PRO 8 -0.10 GLN 5
MET 1 0.03 ASP 9 -0.09 LEU 6
MET 1 0.03 SER 10 -0.08 LEU 6
MET 1 0.03 PRO 11 -0.07 LEU 6
MET 1 0.04 LEU 12 -0.07 LEU 6
MET 1 0.05 THR 13 -0.08 MET 1
MET 1 0.05 ASP 14 -0.08 MET 1
MET 1 0.05 GLN 15 -0.07 MET 1
MET 1 0.04 ASP 16 -0.06 MET 1
MET 1 0.04 PHE 17 -0.06 MET 1
MET 1 0.04 ASN 18 -0.05 MET 1
MET 1 0.04 GLN 19 -0.05 MET 1
GLU 168 0.04 LEU 20 -0.04 MET 1
GLU 168 0.04 ASP 21 -0.04 MET 1
GLU 168 0.04 GLN 22 -0.04 MET 1
GLU 168 0.05 THR 23 -0.04 MET 1
GLU 168 0.05 VAL 24 -0.03 GLN 5
GLU 168 0.05 ILE 25 -0.03 MET 1
GLU 168 0.05 GLU 26 -0.03 MET 1
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GLU 168 0.08 ASN 149 -0.02 GLY 47
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GLU 168 0.07 ALA 151 -0.03 GLN 5
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ASP 139 0.05 ASN 268 -0.03 GLN 5
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ASP 124 0.04 GLU 286 -0.01 PRO 8
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GLN 15 0.05 ASN 2 -0.09 ASN 268
GLN 15 0.04 LYS 3 -0.10 ASN 268
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GLN 15 0.03 ASP 9 -0.13 ASN 209
GLN 15 0.03 SER 10 -0.12 ASN 209
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GLN 15 0.03 LEU 12 -0.10 ASN 209
GLN 15 0.04 THR 13 -0.10 ASN 209
GLN 15 0.04 ASP 14 -0.09 ASN 209
GLN 15 0.04 GLN 15 -0.08 ASN 209
GLN 15 0.04 ASP 16 -0.08 ASN 209
GLN 15 0.04 PHE 17 -0.08 ASN 268
GLN 15 0.04 ASN 18 -0.07 ASN 268
GLN 15 0.04 GLN 19 -0.07 ASN 209
GLN 15 0.03 LEU 20 -0.07 ASN 209
GLN 15 0.04 ASP 21 -0.07 ASN 268
GLN 15 0.04 GLN 22 -0.06 ASN 268
GLN 15 0.03 THR 23 -0.06 ASN 268
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GLN 15 0.02 ALA 27 -0.05 ASN 268
GLN 22 0.02 ALA 28 -0.04 ASN 268
GLN 22 0.03 ARG 29 -0.04 ASN 268
GLN 22 0.02 ARG 30 -0.03 ASN 268
GLN 22 0.02 GLN 31 -0.03 ASN 268
GLU 168 0.02 LEU 32 -0.03 ASN 268
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GLU 168 0.04 ARG 36 -0.03 GLY 42
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PRO 141 0.03 LEU 44 -0.05 GLY 42
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ASP 139 0.02 ARG 46 -0.08 TYR 41
ASP 139 0.02 GLY 47 -0.09 GLY 42
ILE 118 0.02 MET 48 -0.06 VAL 51
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ASN 115 0.02 SER 50 -0.03 SER 275
ASP 170 0.03 VAL 51 -0.03 GLY 47
PHE 169 0.05 PHE 52 -0.03 THR 117
PHE 169 0.07 ASN 53 -0.02 THR 117
GLU 168 0.09 ASP 54 -0.02 THR 117
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GLU 168 0.11 PHE 56 -0.01 SER 110
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GLU 168 0.14 SER 111 -0.02 PHE 125
GLU 168 0.16 ARG 112 -0.02 ASP 170
PHE 169 0.13 ARG 113 -0.02 THR 117
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GLN 15 0.01 ASN 209 -0.02 SER 111
GLN 15 0.01 HIS 210 -0.02 ASN 268
GLU 315 0.01 ASN 211 -0.02 ASN 268
GLN 22 0.01 GLY 212 -0.02 ASN 268
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GLU 315 0.03 ARG 242 -0.02 GLY 42
GLU 315 0.03 GLU 243 -0.02 GLY 42
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ARG 30 0.02 THR 246 -0.02 ASN 268
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ARG 30 0.02 PHE 250 -0.02 ASN 268
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GLN 15 0.03 ALA 273 -0.06 ASN 209
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ASN 2 0.03 GLU 276 -0.06 ASN 209
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GLY 42 0.03 GLU 279 -0.05 ASN 209
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GLY 266 0.03 GLY 287 -0.05 ASN 209
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GLY 266 0.03 ASN 289 -0.04 ASN 209
GLY 266 0.03 HIS 290 -0.05 ASN 209
GLY 266 0.03 PRO 291 -0.05 ASN 209
THR 246 0.03 PHE 292 -0.05 ASN 209
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GLN 15 0.02 VAL 299 -0.06 ASN 209
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GLN 15 0.02 ARG 304 -0.05 ASN 209
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GLU 315 0.02 GLU 315 -0.01 PRO 314

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