CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  VIRUS LIKE PARTICLE 01-FEB-24 8RVJ  ***

LOGs for ID: 2607202025523007573

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607202025523007573.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607202025523007573.atom to be opened. Openam> File opened: 2607202025523007573.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1048 First residue number = 1 Last residue number = 315 Number of atoms found = 8431 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 327.026531 +/- 25.754776 From: 272.726000 To: 384.532000 = 358.633378 +/- 26.763045 From: 300.122000 To: 432.377000 = 499.477050 +/- 13.004175 From: 465.142000 To: 531.067000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9981 % Filled. Pdbmat> 3192657 non-zero elements. Pdbmat> 349179 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.83 +/- 21.46 Maximum number = 129 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 6.983580E+06 Pdbmat> Larger element = 501.406 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1048 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607202025523007573.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607202025523007573.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607202025523007573.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8431 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1048 residues. Blocpdb> 48 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 48 atoms in block 2 Block first atom: 49 Blocpdb> 51 atoms in block 3 Block first atom: 97 Blocpdb> 48 atoms in block 4 Block first atom: 148 Blocpdb> 49 atoms in block 5 Block first atom: 196 Blocpdb> 50 atoms in block 6 Block first atom: 245 Blocpdb> 52 atoms in block 7 Block first atom: 295 Blocpdb> 42 atoms in block 8 Block first atom: 347 Blocpdb> 49 atoms in block 9 Block first atom: 389 Blocpdb> 36 atoms in block 10 Block first atom: 438 Blocpdb> 55 atoms in block 11 Block first atom: 474 Blocpdb> 50 atoms in block 12 Block first atom: 529 Blocpdb> 55 atoms in block 13 Block first atom: 579 Blocpdb> 59 atoms in block 14 Block first atom: 634 Blocpdb> 44 atoms in block 15 Block first atom: 693 Blocpdb> 47 atoms in block 16 Block first atom: 737 Blocpdb> 39 atoms in block 17 Block first atom: 784 Blocpdb> 48 atoms in block 18 Block first atom: 823 Blocpdb> 54 atoms in block 19 Block first atom: 871 Blocpdb> 47 atoms in block 20 Block first atom: 925 Blocpdb> 43 atoms in block 21 Block first atom: 972 Blocpdb> 46 atoms in block 22 Block first atom: 1015 Blocpdb> 52 atoms in block 23 Block first atom: 1061 Blocpdb> 44 atoms in block 24 Block first atom: 1113 Blocpdb> 52 atoms in block 25 Block first atom: 1157 Blocpdb> 49 atoms in block 26 Block first atom: 1209 Blocpdb> 47 atoms in block 27 Block first atom: 1258 Blocpdb> 47 atoms in block 28 Block first atom: 1305 Blocpdb> 48 atoms in block 29 Block first atom: 1352 Blocpdb> 54 atoms in block 30 Block first atom: 1400 Blocpdb> 47 atoms in block 31 Block first atom: 1454 Blocpdb> 54 atoms in block 32 Block first atom: 1501 Blocpdb> 41 atoms in block 33 Block first atom: 1555 Blocpdb> 47 atoms in block 34 Block first atom: 1596 Blocpdb> 40 atoms in block 35 Block first atom: 1643 Blocpdb> 41 atoms in block 36 Block first atom: 1683 Blocpdb> 51 atoms in block 37 Block first atom: 1724 Blocpdb> 47 atoms in block 38 Block first atom: 1775 Blocpdb> 45 atoms in block 39 Block first atom: 1822 Blocpdb> 48 atoms in block 40 Block first atom: 1867 Blocpdb> 57 atoms in block 41 Block first atom: 1915 Blocpdb> 48 atoms in block 42 Block first atom: 1972 Blocpdb> 45 atoms in block 43 Block first atom: 2020 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 2065 Blocpdb> 9 atoms in block 45 Block first atom: 2109 Blocpdb> 52 atoms in block 46 Block first atom: 2118 Blocpdb> 43 atoms in block 47 Block first atom: 2170 Blocpdb> 53 atoms in block 48 Block first atom: 2213 Blocpdb> 47 atoms in block 49 Block first atom: 2266 Blocpdb> 50 atoms in block 50 Block first atom: 2313 Blocpdb> 52 atoms in block 51 Block first atom: 2363 Blocpdb> 48 atoms in block 52 Block first atom: 2415 Blocpdb> 44 atoms in block 53 Block first atom: 2463 Blocpdb> 48 atoms in block 54 Block first atom: 2507 Blocpdb> 28 atoms in block 55 Block first atom: 2555 Blocpdb> 55 atoms in block 56 Block first atom: 2583 Blocpdb> 50 atoms in block 57 Block first atom: 2638 Blocpdb> 55 atoms in block 58 Block first atom: 2688 Blocpdb> 59 atoms in block 59 Block first atom: 2743 Blocpdb> 44 atoms in block 60 Block first atom: 2802 Blocpdb> 47 atoms in block 61 Block first atom: 2846 Blocpdb> 39 atoms in block 62 Block first atom: 2893 Blocpdb> 48 atoms in block 63 Block first atom: 2932 Blocpdb> 54 atoms in block 64 Block first atom: 2980 Blocpdb> 47 atoms in block 65 Block first atom: 3034 Blocpdb> 43 atoms in block 66 Block first atom: 3081 Blocpdb> 46 atoms in block 67 Block first atom: 3124 Blocpdb> 52 atoms in block 68 Block first atom: 3170 Blocpdb> 44 atoms in block 69 Block first atom: 3222 Blocpdb> 52 atoms in block 70 Block first atom: 3266 Blocpdb> 49 atoms in block 71 Block first atom: 3318 Blocpdb> 47 atoms in block 72 Block first atom: 3367 Blocpdb> 47 atoms in block 73 Block first atom: 3414 Blocpdb> 48 atoms in block 74 Block first atom: 3461 Blocpdb> 54 atoms in block 75 Block first atom: 3509 Blocpdb> 47 atoms in block 76 Block first atom: 3563 Blocpdb> 54 atoms in block 77 Block first atom: 3610 Blocpdb> 41 atoms in block 78 Block first atom: 3664 Blocpdb> 47 atoms in block 79 Block first atom: 3705 Blocpdb> 40 atoms in block 80 Block first atom: 3752 Blocpdb> 41 atoms in block 81 Block first atom: 3792 Blocpdb> 51 atoms in block 82 Block first atom: 3833 Blocpdb> 47 atoms in block 83 Block first atom: 3884 Blocpdb> 45 atoms in block 84 Block first atom: 3931 Blocpdb> 48 atoms in block 85 Block first atom: 3976 Blocpdb> 57 atoms in block 86 Block first atom: 4024 Blocpdb> 48 atoms in block 87 Block first atom: 4081 Blocpdb> 45 atoms in block 88 Block first atom: 4129 Blocpdb> 44 atoms in block 89 Block first atom: 4174 Blocpdb> 48 atoms in block 90 Block first atom: 4218 Blocpdb> 48 atoms in block 91 Block first atom: 4266 Blocpdb> 51 atoms in block 92 Block first atom: 4314 Blocpdb> 48 atoms in block 93 Block first atom: 4365 Blocpdb> 49 atoms in block 94 Block first atom: 4413 Blocpdb> 50 atoms in block 95 Block first atom: 4462 Blocpdb> 52 atoms in block 96 Block first atom: 4512 Blocpdb> 42 atoms in block 97 Block first atom: 4564 Blocpdb> 49 atoms in block 98 Block first atom: 4606 Blocpdb> 36 atoms in block 99 Block first atom: 4655 Blocpdb> 55 atoms in block 100 Block first atom: 4691 Blocpdb> 50 atoms in block 101 Block first atom: 4746 Blocpdb> 55 atoms in block 102 Block first atom: 4796 Blocpdb> 59 atoms in block 103 Block first atom: 4851 Blocpdb> 44 atoms in block 104 Block first atom: 4910 Blocpdb> 47 atoms in block 105 Block first atom: 4954 Blocpdb> 39 atoms in block 106 Block first atom: 5001 Blocpdb> 48 atoms in block 107 Block first atom: 5040 Blocpdb> 54 atoms in block 108 Block first atom: 5088 Blocpdb> 47 atoms in block 109 Block first atom: 5142 Blocpdb> 43 atoms in block 110 Block first atom: 5189 Blocpdb> 46 atoms in block 111 Block first atom: 5232 Blocpdb> 52 atoms in block 112 Block first atom: 5278 Blocpdb> 44 atoms in block 113 Block first atom: 5330 Blocpdb> 52 atoms in block 114 Block first atom: 5374 Blocpdb> 49 atoms in block 115 Block first atom: 5426 Blocpdb> 47 atoms in block 116 Block first atom: 5475 Blocpdb> 47 atoms in block 117 Block first atom: 5522 Blocpdb> 48 atoms in block 118 Block first atom: 5569 Blocpdb> 54 atoms in block 119 Block first atom: 5617 Blocpdb> 47 atoms in block 120 Block first atom: 5671 Blocpdb> 54 atoms in block 121 Block first atom: 5718 Blocpdb> 41 atoms in block 122 Block first atom: 5772 Blocpdb> 47 atoms in block 123 Block first atom: 5813 Blocpdb> 40 atoms in block 124 Block first atom: 5860 Blocpdb> 41 atoms in block 125 Block first atom: 5900 Blocpdb> 51 atoms in block 126 Block first atom: 5941 Blocpdb> 47 atoms in block 127 Block first atom: 5992 Blocpdb> 45 atoms in block 128 Block first atom: 6039 Blocpdb> 48 atoms in block 129 Block first atom: 6084 Blocpdb> 57 atoms in block 130 Block first atom: 6132 Blocpdb> 48 atoms in block 131 Block first atom: 6189 Blocpdb> 45 atoms in block 132 Block first atom: 6237 Blocpdb> 44 atoms in block 133 Block first atom: 6282 Blocpdb> 52 atoms in block 134 Block first atom: 6326 Blocpdb> 43 atoms in block 135 Block first atom: 6378 Blocpdb> 53 atoms in block 136 Block first atom: 6421 Blocpdb> 47 atoms in block 137 Block first atom: 6474 Blocpdb> 50 atoms in block 138 Block first atom: 6521 Blocpdb> 52 atoms in block 139 Block first atom: 6571 Blocpdb> 48 atoms in block 140 Block first atom: 6623 Blocpdb> 44 atoms in block 141 Block first atom: 6671 Blocpdb> 48 atoms in block 142 Block first atom: 6715 Blocpdb> 19 atoms in block 143 Block first atom: 6763 Blocpdb> 49 atoms in block 144 Block first atom: 6782 Blocpdb> 50 atoms in block 145 Block first atom: 6831 Blocpdb> 55 atoms in block 146 Block first atom: 6881 Blocpdb> 62 atoms in block 147 Block first atom: 6936 Blocpdb> 45 atoms in block 148 Block first atom: 6998 Blocpdb> 48 atoms in block 149 Block first atom: 7043 Blocpdb> 35 atoms in block 150 Block first atom: 7091 Blocpdb> 50 atoms in block 151 Block first atom: 7126 Blocpdb> 53 atoms in block 152 Block first atom: 7176 Blocpdb> 49 atoms in block 153 Block first atom: 7229 Blocpdb> 43 atoms in block 154 Block first atom: 7278 Blocpdb> 47 atoms in block 155 Block first atom: 7321 Blocpdb> 45 atoms in block 156 Block first atom: 7368 Blocpdb> 53 atoms in block 157 Block first atom: 7413 Blocpdb> 48 atoms in block 158 Block first atom: 7466 Blocpdb> 50 atoms in block 159 Block first atom: 7514 Blocpdb> 51 atoms in block 160 Block first atom: 7564 Blocpdb> 43 atoms in block 161 Block first atom: 7615 Blocpdb> 50 atoms in block 162 Block first atom: 7658 Blocpdb> 50 atoms in block 163 Block first atom: 7708 Blocpdb> 49 atoms in block 164 Block first atom: 7758 Blocpdb> 51 atoms in block 165 Block first atom: 7807 Blocpdb> 48 atoms in block 166 Block first atom: 7858 Blocpdb> 44 atoms in block 167 Block first atom: 7906 Blocpdb> 43 atoms in block 168 Block first atom: 7950 Blocpdb> 41 atoms in block 169 Block first atom: 7993 Blocpdb> 47 atoms in block 170 Block first atom: 8034 Blocpdb> 44 atoms in block 171 Block first atom: 8081 Blocpdb> 52 atoms in block 172 Block first atom: 8125 Blocpdb> 42 atoms in block 173 Block first atom: 8177 Blocpdb> 58 atoms in block 174 Block first atom: 8219 Blocpdb> 49 atoms in block 175 Block first atom: 8277 Blocpdb> 45 atoms in block 176 Block first atom: 8326 Blocpdb> 45 atoms in block 177 Block first atom: 8371 Blocpdb> 16 atoms in block 178 Block first atom: 8415 Blocpdb> 178 blocks. Blocpdb> At most, 62 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3192835 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 25293 Prepmat> Matrix trace = 6983580.0000 Prepmat> Last element read: 25293 25293 122.3232 Prepmat> 15932 lines saved. Prepmat> 14437 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8431 RTB> Total mass = 8431.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8431 RTB> Number of blocks = 178 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 194625.8001 RTB> 51114 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1068 Diagstd> Nb of non-zero elements: 51114 Diagstd> Projected matrix trace = 194625.8001 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1068 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 194625.8001 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1201964 0.1373397 0.2517238 0.4541255 0.4721196 0.8840132 1.5604939 1.6483981 1.7255933 2.0277608 2.3522427 2.6726119 3.0476143 3.1002588 3.4286951 3.8943702 4.5021586 4.8507510 5.2425909 5.7848669 6.7476230 7.5458050 8.0531148 8.7537517 9.0121981 9.1237488 9.5490983 9.9352501 11.5458340 11.8852590 12.0136291 12.1547770 12.8736380 13.0334701 13.4472637 13.5356011 14.2575111 14.4718307 14.9808203 15.2829075 15.3975592 15.7575325 16.3536873 17.4871782 17.9162438 18.3889459 18.4621460 18.8882951 20.0179054 20.6161767 20.8194238 21.9470963 22.1610689 22.6338325 23.0410627 23.5951625 24.2665651 24.4124048 24.5481854 24.8116060 25.1218425 25.8931112 26.2925410 26.4644420 26.8933858 27.3823722 27.4541272 28.2847285 28.8765650 29.1854748 29.4254697 30.0169109 30.3571709 30.9427846 31.1559743 31.3265809 31.6484254 32.2095570 32.3318825 32.9525317 33.3517748 34.2387942 34.5318699 35.0092909 35.6741191 36.0792495 36.6052882 36.7456987 37.2180546 37.6740756 38.2600269 39.0837633 39.3900141 39.8260157 40.5544863 41.1878419 41.8553772 41.9201465 42.7190712 42.9562371 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034330 0.0034335 0.0034340 0.0034341 0.0034342 0.0034349 37.6479171 40.2432696 54.4825540 73.1784507 74.6141694 102.0997431 135.6520364 139.4204013 142.6476125 154.6335215 166.5468187 177.5265140 189.5724746 191.2028029 201.0757568 214.2959169 230.4123075 239.1661833 248.6384361 261.1812310 282.0789554 298.2964390 308.1606805 321.2864368 325.9947787 328.0061149 335.5648495 342.2824898 368.9843397 374.3687639 376.3850713 378.5896861 389.6242026 392.0354236 398.2100724 399.5158862 410.0314225 413.1017327 420.3035689 424.5201150 426.1095043 431.0616497 439.1401290 454.1038120 459.6410015 465.6651077 466.5910143 471.9452940 485.8526731 493.0595156 495.4839984 508.7258600 511.1997498 516.6237039 521.2505581 527.4809336 534.9330532 536.5380932 538.0281235 540.9071450 544.2783066 552.5701222 556.8158130 558.6330825 563.1421333 568.2387091 568.9827512 577.5256634 583.5365264 586.6494422 589.0565405 594.9469992 598.3095405 604.0529053 606.1302358 607.7875207 610.9017005 616.2935975 617.4627686 623.3610662 627.1259259 635.4106811 638.1243669 642.5204245 648.5924808 652.2649283 657.0027625 658.2616210 662.4789978 666.5252139 671.6885046 678.8807078 681.5352897 685.2968110 691.5359028 696.9149785 702.5397638 703.0831275 709.7512748 711.7187308 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8431 Rtb_to_modes> Number of blocs = 178 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1202 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1373 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2517 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4541 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4721 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8840 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.560 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.648 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.726 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.028 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.352 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.673 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.048 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.100 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.429 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.894 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.502 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.851 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.243 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.785 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.748 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.546 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.053 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.754 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.012 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.124 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.549 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.935 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.96 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1068 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00004 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99993 0.99998 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 151758 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00004 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99993 0.99998 1.00000 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607202025523007573.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607202025523007573.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607202025523007573.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607202025523007573.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1048 First residue number = 1 Last residue number = 315 Number of atoms found = 8431 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1202 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1373 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2517 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4541 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4721 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8840 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.560 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.648 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.726 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.028 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.352 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.673 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.048 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.100 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.429 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.894 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.502 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.851 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.243 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.785 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.748 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.546 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.053 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.754 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.012 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.124 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.549 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.935 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.96 Bfactors> 106 vectors, 25293 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.120200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.361 for 1048 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.061 +/- 0.06 Bfactors> = 66.995 +/- 14.47 Bfactors> Shiftng-fct= 66.934 Bfactors> Scaling-fct= 232.386 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607202025523007573.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607202025523007573.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.7 Chkmod> 106 vectors, 25293 coordinates in file. Chkmod> That is: 8431 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 44 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7249 0.0034 0.6089 0.0034 0.8324 0.0034 0.8283 0.0034 0.9436 0.0034 0.8107 37.6469 0.5329 40.2357 0.4795 54.4776 0.4764 73.1733 0.5456 74.6094 0.5914 102.0946 0.4148 135.6247 0.2856 139.3976 0.4199 142.6583 0.5097 154.6360 0.4848 166.5311 0.4544 177.5318 0.2373 189.5763 0.6467 191.1866 0.5575 201.0761 0.6868 214.2765 0.5852 230.3984 0.5000 239.1621 0.5056 248.6375 0.7114 261.1730 0.4352 282.0747 0.5727 298.2875 0.5710 308.1453 0.6452 321.2772 0.3998 325.9772 0.4399 327.9965 0.2877 335.5487 0.5446 342.2635 0.4571 369.0351 0.6391 374.4273 0.4452 376.3121 0.4882 378.4990 0.2984 389.5524 0.0598 391.9664 0.5895 398.2335 0.6323 399.5636 0.4588 410.0496 0.4829 413.0579 0.2142 420.2740 0.1160 424.4615 0.2891 426.1250 0.0782 431.0769 0.3351 439.0718 0.4780 454.1210 0.4959 459.6694 0.3528 465.6585 0.2071 466.5439 0.4225 471.9463 0.4319 485.8572 0.5052 493.0841 0.3779 495.4696 0.3856 508.7377 0.4297 511.1655 0.3508 516.5578 0.3301 521.2162 0.4419 527.5124 0.4280 534.9479 0.5100 536.4886 0.4332 538.0249 0.2677 540.8664 0.4197 544.2350 0.3202 552.5132 0.3157 556.7650 0.1082 558.5622 0.2845 563.0825 0.2506 568.1897 0.1700 568.9156 0.0556 577.4526 0.2507 583.5462 0.2226 586.6697 0.2489 589.0766 0.1551 594.9521 0.4084 598.3117 0.4486 603.9998 0.4307 606.1434 0.1655 607.7946 0.4030 610.8907 0.3648 616.2714 0.2779 617.4183 0.3992 623.3104 0.4160 627.0823 0.2764 635.3946 0.4868 638.0797 0.4845 642.4993 0.4094 648.5272 0.4551 652.2437 0.4469 657.0168 0.2084 658.2719 0.3799 662.4679 0.2671 666.4605 0.3133 671.6594 0.2413 678.8189 0.2385 681.5059 0.3713 685.3017 0.2813 691.4680 0.3872 696.9033 0.2162 702.5484 0.4042 703.0517 0.4461 709.7285 0.3645 711.7193 0.3524 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2607202025523007573 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom making animated gifs 11 models are in 2607202025523007573.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607202025523007573.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607202025523007573.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2607202025523007573 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom making animated gifs 11 models are in 2607202025523007573.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607202025523007573.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607202025523007573.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2607202025523007573 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom making animated gifs 11 models are in 2607202025523007573.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607202025523007573.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607202025523007573.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2607202025523007573 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom making animated gifs 11 models are in 2607202025523007573.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607202025523007573.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607202025523007573.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2607202025523007573 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607202025523007573.eigenfacs 2607202025523007573.atom making animated gifs 11 models are in 2607202025523007573.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607202025523007573.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607202025523007573.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2607202025523007573.10.pdb 2607202025523007573.11.pdb 2607202025523007573.7.pdb 2607202025523007573.8.pdb 2607202025523007573.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m42.623s user 0m42.325s sys 0m0.262s rm: cannot remove '2607202025523007573.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.