*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607232355593928074.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607232355593928074.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607232355593928074.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 221
First residue number = 1
Last residue number = 221
Number of atoms found = 1741
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 1.109614 +/- 13.929361 From: -32.457000 To: 29.154000
= 22.987704 +/- 7.515007 From: 3.832000 To: 40.137000
= -10.491508 +/- 10.163340 From: -37.621000 To: 13.568000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.6717 % Filled.
Pdbmat> 637335 non-zero elements.
Pdbmat> 69666 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.03 +/- 22.60
Maximum number = 130
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 1.393320E+06
Pdbmat> Larger element = 490.896
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
221 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607232355593928074.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607232355593928074.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607232355593928074.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1741 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 221 residues.
Blocpdb> 19 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 20
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 34
Blocpdb> 19 atoms in block 4
Block first atom: 49
Blocpdb> 16 atoms in block 5
Block first atom: 68
Blocpdb> 11 atoms in block 6
Block first atom: 84
Blocpdb> 15 atoms in block 7
Block first atom: 95
Blocpdb> 20 atoms in block 8
Block first atom: 110
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 130
Blocpdb> 22 atoms in block 10
Block first atom: 144
Blocpdb> 22 atoms in block 11
Block first atom: 166
Blocpdb> 19 atoms in block 12
Block first atom: 188
Blocpdb> 14 atoms in block 13
Block first atom: 207
Blocpdb> 13 atoms in block 14
Block first atom: 221
Blocpdb> 18 atoms in block 15
Block first atom: 234
Blocpdb> 12 atoms in block 16
Block first atom: 252
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 264
Blocpdb> 11 atoms in block 18
Block first atom: 280
Blocpdb> 19 atoms in block 19
Block first atom: 291
Blocpdb> 26 atoms in block 20
Block first atom: 310
Blocpdb> 17 atoms in block 21
Block first atom: 336
Blocpdb> 17 atoms in block 22
Block first atom: 353
Blocpdb> 13 atoms in block 23
Block first atom: 370
Blocpdb> 13 atoms in block 24
Block first atom: 383
Blocpdb> 20 atoms in block 25
Block first atom: 396
Blocpdb> 14 atoms in block 26
Block first atom: 416
Blocpdb> 17 atoms in block 27
Block first atom: 430
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 447
Blocpdb> 16 atoms in block 29
Block first atom: 469
Blocpdb> 13 atoms in block 30
Block first atom: 485
Blocpdb> 17 atoms in block 31
Block first atom: 498
Blocpdb> 16 atoms in block 32
Block first atom: 515
Blocpdb> 11 atoms in block 33
Block first atom: 531
Blocpdb> 24 atoms in block 34
Block first atom: 542
Blocpdb> 20 atoms in block 35
Block first atom: 566
Blocpdb> 17 atoms in block 36
Block first atom: 586
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 603
Blocpdb> 20 atoms in block 38
Block first atom: 617
Blocpdb> 16 atoms in block 39
Block first atom: 637
Blocpdb> 20 atoms in block 40
Block first atom: 653
Blocpdb> 16 atoms in block 41
Block first atom: 673
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 689
Blocpdb> 17 atoms in block 43
Block first atom: 705
Blocpdb> 11 atoms in block 44
Block first atom: 722
Blocpdb> 8 atoms in block 45
Block first atom: 733
Blocpdb> 11 atoms in block 46
Block first atom: 741
Blocpdb> 19 atoms in block 47
Block first atom: 752
Blocpdb> 12 atoms in block 48
Block first atom: 771
Blocpdb> 17 atoms in block 49
Block first atom: 783
Blocpdb> 16 atoms in block 50
Block first atom: 800
Blocpdb> 17 atoms in block 51
Block first atom: 816
Blocpdb> 27 atoms in block 52
Block first atom: 833
Blocpdb> 14 atoms in block 53
Block first atom: 860
Blocpdb> 17 atoms in block 54
Block first atom: 874
Blocpdb> 17 atoms in block 55
Block first atom: 891
Blocpdb> 13 atoms in block 56
Block first atom: 908
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 921
Blocpdb> 11 atoms in block 58
Block first atom: 932
Blocpdb> 17 atoms in block 59
Block first atom: 943
Blocpdb> 11 atoms in block 60
Block first atom: 960
Blocpdb> 19 atoms in block 61
Block first atom: 971
Blocpdb> 17 atoms in block 62
Block first atom: 990
Blocpdb> 27 atoms in block 63
Block first atom: 1007
Blocpdb> 16 atoms in block 64
Block first atom: 1034
Blocpdb> 11 atoms in block 65
Block first atom: 1050
Blocpdb> 23 atoms in block 66
Block first atom: 1061
Blocpdb> 13 atoms in block 67
Block first atom: 1084
Blocpdb> 13 atoms in block 68
Block first atom: 1097
Blocpdb> 15 atoms in block 69
Block first atom: 1110
Blocpdb> 14 atoms in block 70
Block first atom: 1125
Blocpdb> 12 atoms in block 71
Block first atom: 1139
Blocpdb> 11 atoms in block 72
Block first atom: 1151
Blocpdb> 16 atoms in block 73
Block first atom: 1162
Blocpdb> 12 atoms in block 74
Block first atom: 1178
Blocpdb> 21 atoms in block 75
Block first atom: 1190
Blocpdb> 19 atoms in block 76
Block first atom: 1211
Blocpdb> 10 atoms in block 77
Block first atom: 1230
Blocpdb> 15 atoms in block 78
Block first atom: 1240
Blocpdb> 12 atoms in block 79
Block first atom: 1255
Blocpdb> 11 atoms in block 80
Block first atom: 1267
Blocpdb> 12 atoms in block 81
Block first atom: 1278
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 1290
Blocpdb> 14 atoms in block 83
Block first atom: 1305
Blocpdb> 12 atoms in block 84
Block first atom: 1319
Blocpdb> 17 atoms in block 85
Block first atom: 1331
Blocpdb> 15 atoms in block 86
Block first atom: 1348
Blocpdb> 9 atoms in block 87
Block first atom: 1363
Blocpdb> 17 atoms in block 88
Block first atom: 1372
Blocpdb> 13 atoms in block 89
Block first atom: 1389
Blocpdb> 17 atoms in block 90
Block first atom: 1402
Blocpdb> 10 atoms in block 91
Block first atom: 1419
Blocpdb> 13 atoms in block 92
Block first atom: 1429
Blocpdb> 15 atoms in block 93
Block first atom: 1442
Blocpdb> 11 atoms in block 94
Block first atom: 1457
Blocpdb> 15 atoms in block 95
Block first atom: 1468
Blocpdb> 16 atoms in block 96
Block first atom: 1483
Blocpdb> 16 atoms in block 97
Block first atom: 1499
Blocpdb> 12 atoms in block 98
Block first atom: 1515
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 1527
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1543
Blocpdb> 14 atoms in block 101
Block first atom: 1558
Blocpdb> 15 atoms in block 102
Block first atom: 1572
Blocpdb> 16 atoms in block 103
Block first atom: 1587
Blocpdb> 19 atoms in block 104
Block first atom: 1603
Blocpdb> 17 atoms in block 105
Block first atom: 1622
Blocpdb> 19 atoms in block 106
Block first atom: 1639
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 1658
Blocpdb> 21 atoms in block 108
Block first atom: 1676
Blocpdb> 17 atoms in block 109
Block first atom: 1697
Blocpdb> 18 atoms in block 110
Block first atom: 1714
Blocpdb> 10 atoms in block 111
Block first atom: 1731
Blocpdb> 111 blocks.
Blocpdb> At most, 27 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 637446 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 5223
Prepmat> Matrix trace = 1393320.0000
Prepmat> Last element read: 5223 5223 100.6603
Prepmat> 6217 lines saved.
Prepmat> 5080 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1741
RTB> Total mass = 1741.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1741
RTB> Number of blocks = 111
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 148968.0291
RTB> 39231 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 666
Diagstd> Nb of non-zero elements: 39231
Diagstd> Projected matrix trace = 148968.0291
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 666 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 148968.0291
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.8021980 0.8749722 1.7869001 4.3816318
5.3707376 5.9474313 7.8640916 9.3481484 12.0880050
14.4262066 15.3104896 15.5542764 16.4209076 16.6850015
19.9150560 20.0091910 21.1900921 22.5730682 22.7501958
24.1887322 26.7389506 26.8239010 28.4647298 29.0958464
30.3775464 30.7288396 32.1158593 32.7577035 33.4345755
33.6702564 34.6676325 36.0180739 37.4955866 38.1570771
39.7067849 40.7697555 41.6831949 42.3170074 43.8974163
44.5829414 45.2722466 46.3798953 46.6763982 47.8075355
48.7042898 49.4685482 49.9183109 51.5909576 52.0354379
53.0411138 54.4936984 55.7437283 56.5624944 56.9535450
57.8255749 58.0663475 58.7828954 60.3536846 61.0878342
61.9508594 62.4141802 64.1908639 65.3110811 66.3291222
67.0929601 67.1961755 67.8677250 68.6388372 69.7965204
70.2979799 71.8625720 73.7328418 74.4374527 75.3745329
76.2449767 76.5162615 76.9797160 78.1573862 78.9528958
79.4948479 79.8813065 82.1141546 82.2652159 82.8843613
83.8074830 84.6446972 84.9201563 86.1427430 86.8449313
88.2814661 88.9437189 89.9183456 90.1347082 90.5944362
91.4059338 92.1377474 93.6421105 94.2140309 94.6027420
95.7164692
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034314 0.0034332 0.0034337 0.0034343 0.0034347
0.0034349 97.2604060 101.5763038 145.1594855 227.3072143
251.6588742 264.8256191 304.5226235 332.0152855 377.5483666
412.4500441 424.9030213 428.2724983 440.0417252 443.5661591
484.6029422 485.7469084 499.8753289 515.9297574 517.9500150
534.0744888 561.5228835 562.4141636 579.3604073 585.7479504
598.5102973 601.9610073 615.3965446 621.5155570 627.9039098
630.1130759 639.3775345 651.7117069 664.9444357 670.7842084
684.2702233 693.3688613 701.0932401 706.4033564 719.4734296
725.0695040 730.6532219 739.5374340 741.8975696 750.8331838
757.8423794 763.7651935 767.2293726 779.9775002 783.3302300
790.8636191 801.6197747 810.7618152 816.6943615 819.5126486
825.7626965 827.4800547 832.5700176 843.6205977 848.7360406
854.7103204 857.9004892 870.0253171 877.5840402 884.3972945
889.4750220 890.1589404 894.5959463 899.6637853 907.2190608
910.4722278 920.5484662 932.4504578 936.8952381 942.7740006
948.2020685 949.8874538 952.7598176 960.0200288 964.8933472
968.1993163 970.5498792 984.0208333 984.9255443 988.6249758
994.1151198 999.0682515 1000.6925642 1007.8702562 1011.9697213
1020.3050794 1024.1248925 1029.7206781 1030.9587972 1033.5846323
1038.2034679 1042.3512112 1050.8261624 1054.0302450 1056.2023815
1062.4013535
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1741
Rtb_to_modes> Number of blocs = 111
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9854E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8022
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8750
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.787
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.382
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.371
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.947
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.864
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.348
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.72
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 666 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000
1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
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1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998
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0.99998 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000
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1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 31338 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001
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1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000
1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000
1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998
1.00000 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000
1.00001 1.00003 1.00003 1.00002 1.00001
0.99998 1.00002 0.99996 0.99998 1.00000
1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998
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0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607232355593928074.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607232355593928074.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607232355593928074.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607232355593928074.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 221
First residue number = 1
Last residue number = 221
Number of atoms found = 1741
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9854E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8022
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8750
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.787
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.382
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.371
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.947
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.864
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.348
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.72
Bfactors> 106 vectors, 5223 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.802200
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.604 for 228 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.046 +/- 0.04
Bfactors> = 14.791 +/- 5.18
Bfactors> Shiftng-fct= 14.745
Bfactors> Scaling-fct= 130.735
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607232355593928074.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607232355593928074.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1012.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1030.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1034.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1054.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1056.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1062.
Chkmod> 106 vectors, 5223 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1741 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7561
0.0034 0.7796
0.0034 0.9412
0.0034 0.9034
0.0034 0.8602
0.0034 0.9062
97.2563 0.5598
101.5736 0.6765
145.1573 0.5032
227.3070 0.5329
251.6542 0.5510
264.8046 0.0294
304.5078 0.5977
331.9984 0.1142
377.5633 0.2759
412.4866 0.2330
424.8780 0.1060
428.1952 0.2672
440.0107 0.1700
443.6136 0.3929
484.6423 0.4407
485.7359 0.3404
499.8528 0.2600
515.8725 0.3653
517.9256 0.1766
534.0656 0.5733
561.5098 0.3745
562.3491 0.5198
579.2874 0.4781
585.7646 0.5560
598.5088 0.5257
601.9465 0.4140
615.4098 0.4368
621.5107 0.1630
627.8340 0.3767
630.0836 0.5499
639.3719 0.5748
651.7012 0.4884
664.9550 0.4559
670.7811 0.2680
684.2686 0.4419
693.3412 0.6448
701.0363 0.5128
706.3980 0.5109
719.4637 0.5724
725.0145 0.4352
730.6037 0.6198
739.5065 0.5796
741.8943 0.5388
750.8203 0.3834
757.7765 0.2616
763.7436 0.6231
767.2094 0.5056
779.9368 0.4289
783.3309 0.4257
790.8214 0.1565
801.5582 0.4745
810.6999 0.5033
816.6413 0.4814
819.4520 0.5206
825.7588 0.5406
827.4706 0.4550
832.5138 0.6085
843.5586 0.4817
848.7147 0.4243
854.6677 0.4085
857.8349 0.5152
869.9821 0.2413
877.5391 0.3687
884.3652 0.4984
889.4172 0.4349
890.1461 0.2832
894.5725 0.5171
899.6328 0.3216
907.2027 0.5934
910.4462 0.1959
920.4925 0.4336
932.3925 0.4329
936.8710 0.4405
942.7052 0.5314
948.1304 0.5437
949.8699 0.4137
952.7207 0.3598
959.9949 0.4351
964.8342 0.4380
968.1282 0.4486
970.5003 0.4709
983.9537 0.4802
984.9119 0.5242
988.5565 0.5009
994.0874 0.4473
998.9976 0.3345
1000.6487 0.3636
1007.8109 0.3363
1011.8975 0.4870
1020.2528 0.4057
1024.0595 0.3116
1029.6859 0.4245
1030.8876 0.4865
1033.5150 0.4535
1038.1820 0.5631
1042.3192 0.5000
1050.7692 0.3876
1053.9625 0.3471
1056.1417 0.5142
1062.3753 0.5347
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2607232355593928074.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607232355593928074.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2607232355593928074.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607232355593928074.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2607232355593928074.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2607232355593928074.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
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Projmod> 106 vectors, 5223 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 221
First residue number = 1
Last residue number = 221
Number of atoms found = 1741
Mean number per residue = 7.9
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 221
First residue number = 1
Last residue number = 221
Number of atoms found = 1744
Mean number per residue = 7.9
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
Projmod> All atoms of first conformer were found in second one.
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 1741 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 31.65
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.034 Sum= 0.001 q= -44.6484
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.028 Sum= 0.002 q= -36.4492
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.401 Sum= 0.163 q= -529.4250
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.722 Sum= 0.683 q= 952.8775
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.013 Sum= 0.683 q= 17.2611
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.153 Sum= 0.707 q= -201.7109
Vector: 7 F= 97.26 Cos= -0.093 Sum= 0.715 q= -122.7618
Vector: 8 F= 101.57 Cos= 0.072 Sum= 0.721 q= 94.9142
Vector: 9 F= 145.16 Cos= 0.041 Sum= 0.722 q= 53.5856
Vector: 10 F= 227.31 Cos= -0.047 Sum= 0.724 q= -62.4911
Vector: 11 F= 251.65 Cos= 0.128 Sum= 0.741 q= 169.4284
Vector: 12 F= 264.80 Cos= 0.037 Sum= 0.742 q= 49.4654
Vector: 13 F= 304.51 Cos= -0.082 Sum= 0.749 q= -108.1903
Vector: 14 F= 332.00 Cos= 0.107 Sum= 0.760 q= 140.6958
Vector: 15 F= 377.56 Cos= -0.013 Sum= 0.761 q= -17.0178
Vector: 16 F= 412.49 Cos= -0.014 Sum= 0.761 q= -19.0753
Vector: 17 F= 424.88 Cos= 0.022 Sum= 0.761 q= 29.4486
Vector: 18 F= 428.20 Cos= -0.031 Sum= 0.762 q= -41.5871
Vector: 19 F= 440.01 Cos= 0.010 Sum= 0.762 q= 13.0692
Vector: 20 F= 443.61 Cos= 0.010 Sum= 0.762 q= 13.4689
Vector: 21 F= 484.64 Cos= -0.006 Sum= 0.762 q= -7.4817
Vector: 22 F= 485.74 Cos= 0.009 Sum= 0.763 q= 11.6346
Vector: 23 F= 499.85 Cos= 0.078 Sum= 0.769 q= 103.4473
Vector: 24 F= 515.87 Cos= 0.018 Sum= 0.769 q= 24.2590
Vector: 25 F= 517.93 Cos= 0.025 Sum= 0.770 q= 32.8438
Vector: 26 F= 534.07 Cos= 0.032 Sum= 0.771 q= 41.9620
Vector: 27 F= 561.51 Cos= 0.019 Sum= 0.771 q= 25.2111
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Vector: 29 F= 579.29 Cos= 0.116 Sum= 0.786 q= 152.9116
Vector: 30 F= 585.76 Cos= 0.023 Sum= 0.787 q= 30.8545
Vector: 31 F= 598.51 Cos= 0.094 Sum= 0.795 q= 124.0207
Vector: 32 F= 601.95 Cos= -0.026 Sum= 0.796 q= -33.8624
Vector: 33 F= 615.41 Cos= -0.074 Sum= 0.802 q= -98.2772
Vector: 34 F= 621.51 Cos= -0.021 Sum= 0.802 q= -27.8111
Vector: 35 F= 627.83 Cos= 0.111 Sum= 0.814 q= 146.6507
Vector: 36 F= 630.08 Cos= 0.041 Sum= 0.816 q= 54.4424
Vector: 37 F= 639.37 Cos= -0.072 Sum= 0.821 q= -95.4157
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Vector: 39 F= 664.96 Cos= 0.005 Sum= 0.822 q= 6.8327
Vector: 40 F= 670.78 Cos= -0.097 Sum= 0.831 q= -127.8911
Vector: 41 F= 684.27 Cos= -0.068 Sum= 0.836 q= -89.3045
Vector: 42 F= 693.34 Cos= -0.051 Sum= 0.839 q= -67.5223
Vector: 43 F= 701.04 Cos= -0.051 Sum= 0.841 q= -67.2074
Vector: 44 F= 706.40 Cos= -0.005 Sum= 0.841 q= -7.0733
Vector: 45 F= 719.46 Cos= 0.009 Sum= 0.841 q= 11.2656
Vector: 46 F= 725.01 Cos= -0.112 Sum= 0.854 q= -147.4195
Vector: 47 F= 730.60 Cos= 0.100 Sum= 0.864 q= 132.6169
Vector: 48 F= 739.51 Cos= -0.080 Sum= 0.870 q= -106.2065
Vector: 49 F= 741.89 Cos= -0.014 Sum= 0.871 q= -18.0123
Vector: 50 F= 750.82 Cos= 0.048 Sum= 0.873 q= 62.8688
Vector: 51 F= 757.78 Cos= 0.012 Sum= 0.873 q= 16.4044
Vector: 52 F= 763.74 Cos= -0.074 Sum= 0.878 q= -97.3472
Vector: 53 F= 767.21 Cos= 0.022 Sum= 0.879 q= 29.6267
Vector: 54 F= 779.94 Cos= -0.057 Sum= 0.882 q= -75.1168
Vector: 55 F= 783.33 Cos= -0.097 Sum= 0.891 q= -127.7078
Vector: 56 F= 790.82 Cos= -0.007 Sum= 0.892 q= -8.6591
Vector: 57 F= 801.56 Cos= 0.003 Sum= 0.892 q= 4.2936
Vector: 58 F= 810.70 Cos= 0.011 Sum= 0.892 q= 15.0827
Vector: 59 F= 816.64 Cos= -0.068 Sum= 0.896 q= -90.0219
Vector: 60 F= 819.45 Cos= -0.013 Sum= 0.896 q= -16.8089
Vector: 61 F= 825.76 Cos= 0.061 Sum= 0.900 q= 80.2336
Vector: 62 F= 827.47 Cos= 0.030 Sum= 0.901 q= 40.1925
Vector: 63 F= 832.51 Cos= 0.025 Sum= 0.902 q= 32.8894
Vector: 64 F= 843.56 Cos= 0.009 Sum= 0.902 q= 12.4959
Vector: 65 F= 848.71 Cos= 0.030 Sum= 0.903 q= 39.3274
Vector: 66 F= 854.67 Cos= 0.041 Sum= 0.904 q= 53.5096
Vector: 67 F= 857.83 Cos= -0.020 Sum= 0.905 q= -26.1569
Vector: 68 F= 869.98 Cos= 0.025 Sum= 0.905 q= 32.8512
Vector: 69 F= 877.54 Cos= -0.016 Sum= 0.906 q= -20.5220
Vector: 70 F= 884.37 Cos= 0.036 Sum= 0.907 q= 46.8864
Vector: 71 F= 889.42 Cos= 0.014 Sum= 0.907 q= 18.7911
Vector: 72 F= 890.15 Cos= -0.010 Sum= 0.907 q= -12.6508
Vector: 73 F= 894.57 Cos= 0.044 Sum= 0.909 q= 58.0554
Vector: 74 F= 899.63 Cos= -0.018 Sum= 0.909 q= -23.6264
Vector: 75 F= 907.20 Cos= -0.028 Sum= 0.910 q= -37.3845
Vector: 76 F= 910.45 Cos= -0.038 Sum= 0.912 q= -50.5413
Vector: 77 F= 920.49 Cos= 0.017 Sum= 0.912 q= 22.7144
Vector: 78 F= 932.39 Cos= -0.019 Sum= 0.912 q= -25.2278
Vector: 79 F= 936.87 Cos= 0.012 Sum= 0.912 q= 16.3718
Vector: 80 F= 942.71 Cos= -0.081 Sum= 0.919 q= -106.5752
Vector: 81 F= 948.13 Cos= 0.010 Sum= 0.919 q= 13.6714
Vector: 82 F= 949.87 Cos= -0.075 Sum= 0.925 q= -99.5489
Vector: 83 F= 952.72 Cos= -0.051 Sum= 0.927 q= -66.8460
Vector: 84 F= 959.99 Cos= -0.003 Sum= 0.927 q= -4.0026
Vector: 85 F= 964.83 Cos= -0.042 Sum= 0.929 q= -55.5401
Vector: 86 F= 968.13 Cos= 0.012 Sum= 0.929 q= 15.5459
Vector: 87 F= 970.50 Cos= -0.062 Sum= 0.933 q= -81.6725
Vector: 88 F= 983.95 Cos= -0.046 Sum= 0.935 q= -61.3607
Vector: 89 F= 984.91 Cos= -0.032 Sum= 0.936 q= -42.0907
Vector: 90 F= 988.56 Cos= 0.009 Sum= 0.936 q= 12.5261
Vector: 91 F= 994.09 Cos= -0.037 Sum= 0.938 q= -48.4408
Vector: 92 F= 999.00 Cos= 0.042 Sum= 0.939 q= 55.4317
Vector: 93 F= 1000.65 Cos= -0.008 Sum= 0.940 q= -10.8396
Vector: 94 F= 1007.81 Cos= 0.012 Sum= 0.940 q= 16.2863
Vector: 95 F= 1011.90 Cos= -0.025 Sum= 0.940 q= -32.6387
Vector: 96 F= 1020.25 Cos= -0.018 Sum= 0.941 q= -23.4009
Vector: 97 F= 1024.06 Cos= 0.005 Sum= 0.941 q= 6.9409
Vector: 98 F= 1029.69 Cos= 0.013 Sum= 0.941 q= 17.7819
Vector: 99 F= 1030.89 Cos= 0.081 Sum= 0.947 q= 107.3490
Vector: 100 F= 1033.51 Cos= -0.018 Sum= 0.948 q= -23.8726
Vector: 101 F= 1038.18 Cos= -0.022 Sum= 0.948 q= -28.8762
Vector: 102 F= 1042.32 Cos= 0.040 Sum= 0.950 q= 52.3533
Vector: 103 F= 1050.77 Cos= 0.034 Sum= 0.951 q= 44.4072
Vector: 104 F= 1053.96 Cos= -0.002 Sum= 0.951 q= -2.5701
Vector: 105 F= 1056.14 Cos= -0.005 Sum= 0.951 q= -7.0601
Vector: 106 F= 1062.38 Cos= 0.032 Sum= 0.952 q= 41.9919
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003431
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 97.256350
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.72 for mode 4 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.521 0.705 0.747 0.781 0.808 0.952
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2607232355593928074 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
making animated gifs
11 models are in 2607232355593928074.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607232355593928074.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607232355593928074.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 221 1.595 205 1.269
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 221 1.543 208 1.303
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 221 1.631 206 1.366
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 221 1.840 198 1.397
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 221 2.135 190 1.451
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 221 2.486 179 1.361
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 221 2.872 170 0.948
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 221 3.280 167 0.996
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 221 3.704 162 1.121
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 221 4.138 162 0.899
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 221 4.580 160 0.899
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2607232355593928074 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
making animated gifs
11 models are in 2607232355593928074.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607232355593928074.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607232355593928074.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 221 2.404 173 1.502
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 221 2.236 176 1.411
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 221 2.156 182 1.367
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 221 2.174 184 1.371
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 221 2.289 185 1.403
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 221 2.486 179 1.361
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 221 2.748 170 0.900
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 221 3.059 167 0.863
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 221 3.404 167 0.987
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 221 3.776 162 0.922
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 221 4.166 159 0.957
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2607232355593928074 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607232355593928074.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
making animated gifs
11 models are in 2607232355593928074.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607232355593928074.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607232355593928074.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 221 3.812 168 1.045
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 221 3.470 172 1.034
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 221 3.157 170 0.933
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 221 2.880 170 0.855
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 221 2.652 171 1.305
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 221 2.486 179 1.361
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 221 2.395 182 1.485
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 221 2.387 185 1.522
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 221 2.463 180 1.502
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 221 2.616 177 1.622
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 221 2.834 173 1.275
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2607232355593928074 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
making animated gifs
11 models are in 2607232355593928074.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607232355593928074.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607232355593928074.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 221 3.210 138 2.053
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 221 2.948 150 1.993
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 221 2.733 158 1.825
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 221 2.578 167 1.691
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 221 2.493 173 1.527
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 221 2.486 179 1.361
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 221 2.557 182 1.350
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 221 2.700 177 1.271
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 221 2.904 171 1.027
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 221 3.158 163 1.317
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 221 3.451 157 1.147
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2607232355593928074 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2607232355593928074.eigenfacs
2607232355593928074.atom
making animated gifs
11 models are in 2607232355593928074.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607232355593928074.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2607232355593928074.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 221 3.318 141 1.123
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 221 3.045 147 1.272
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 221 2.814 163 1.216
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 221 2.637 171 1.366
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 221 2.525 178 1.381
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 221 2.486 179 1.361
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 221 2.524 175 1.465
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 221 2.636 173 1.254
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 221 2.812 168 1.515
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 221 3.042 164 1.656
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 221 3.315 152 1.909
2607232355593928074.10.pdb
2607232355593928074.11.pdb
2607232355593928074.7.pdb
2607232355593928074.8.pdb
2607232355593928074.9.pdb
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