CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  01-AUG-25  ***

LOGs for ID: 2607240640404056357

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607240640404056357.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607240640404056357.atom to be opened. Openam> File opened: 2607240640404056357.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1132 First residue number = 1 Last residue number = 1132 Number of atoms found = 18128 Mean number per residue = 16.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 6.340381 +/- 21.731093 From: -46.850000 To: 60.949000 = 2.158760 +/- 19.547974 From: -61.939000 To: 60.033000 = 0.119894 +/- 21.010836 From: -47.377000 To: 74.003000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -1.8052 % Filled. Pdbmat> 12070667 non-zero elements. Pdbmat> 1329326 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 146.66 +/- 58.72 Maximum number = 250 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 2.658652E+07 Pdbmat> Larger element = 892.086 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1132 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607240640404056357.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607240640404056357.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607240640404056357.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 18128 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1132 residues. Blocpdb> 105 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 96 atoms in block 2 Block first atom: 106 Blocpdb> 111 atoms in block 3 Block first atom: 202 Blocpdb> 107 atoms in block 4 Block first atom: 313 Blocpdb> 108 atoms in block 5 Block first atom: 420 Blocpdb> 88 atoms in block 6 Block first atom: 528 Blocpdb> 107 atoms in block 7 Block first atom: 616 Blocpdb> 90 atoms in block 8 Block first atom: 723 Blocpdb> 83 atoms in block 9 Block first atom: 813 Blocpdb> 100 atoms in block 10 Block first atom: 896 Blocpdb> 88 atoms in block 11 Block first atom: 996 Blocpdb> 89 atoms in block 12 Block first atom: 1084 Blocpdb> 96 atoms in block 13 Block first atom: 1173 Blocpdb> 100 atoms in block 14 Block first atom: 1269 Blocpdb> 105 atoms in block 15 Block first atom: 1369 Blocpdb> 93 atoms in block 16 Block first atom: 1474 Blocpdb> 86 atoms in block 17 Block first atom: 1567 Blocpdb> 91 atoms in block 18 Block first atom: 1653 Blocpdb> 67 atoms in block 19 Block first atom: 1744 Blocpdb> 99 atoms in block 20 Block first atom: 1811 Blocpdb> 93 atoms in block 21 Block first atom: 1910 Blocpdb> 95 atoms in block 22 Block first atom: 2003 Blocpdb> 66 atoms in block 23 Block first atom: 2098 Blocpdb> 121 atoms in block 24 Block first atom: 2164 Blocpdb> 82 atoms in block 25 Block first atom: 2285 Blocpdb> 100 atoms in block 26 Block first atom: 2367 Blocpdb> 100 atoms in block 27 Block first atom: 2467 Blocpdb> 77 atoms in block 28 Block first atom: 2567 Blocpdb> 79 atoms in block 29 Block first atom: 2644 Blocpdb> 93 atoms in block 30 Block first atom: 2723 Blocpdb> 89 atoms in block 31 Block first atom: 2816 Blocpdb> 73 atoms in block 32 Block first atom: 2905 Blocpdb> 112 atoms in block 33 Block first atom: 2978 Blocpdb> 98 atoms in block 34 Block first atom: 3090 Blocpdb> 93 atoms in block 35 Block first atom: 3188 Blocpdb> 82 atoms in block 36 Block first atom: 3281 Blocpdb> 79 atoms in block 37 Block first atom: 3363 Blocpdb> 83 atoms in block 38 Block first atom: 3442 Blocpdb> 98 atoms in block 39 Block first atom: 3525 Blocpdb> 122 atoms in block 40 Block first atom: 3623 Blocpdb> 70 atoms in block 41 Block first atom: 3745 Blocpdb> 90 atoms in block 42 Block first atom: 3815 Blocpdb> 86 atoms in block 43 Block first atom: 3905 Blocpdb> 90 atoms in block 44 Block first atom: 3991 Blocpdb> 88 atoms in block 45 Block first atom: 4081 Blocpdb> 78 atoms in block 46 Block first atom: 4169 Blocpdb> 88 atoms in block 47 Block first atom: 4247 Blocpdb> 76 atoms in block 48 Block first atom: 4335 Blocpdb> 92 atoms in block 49 Block first atom: 4411 Blocpdb> 76 atoms in block 50 Block first atom: 4503 Blocpdb> 92 atoms in block 51 Block first atom: 4579 Blocpdb> 88 atoms in block 52 Block first atom: 4671 Blocpdb> 102 atoms in block 53 Block first atom: 4759 Blocpdb> 83 atoms in block 54 Block first atom: 4861 Blocpdb> 99 atoms in block 55 Block first atom: 4944 Blocpdb> 89 atoms in block 56 Block first atom: 5043 Blocpdb> 109 atoms in block 57 Block first atom: 5132 Blocpdb> 94 atoms in block 58 Block first atom: 5241 Blocpdb> 98 atoms in block 59 Block first atom: 5335 Blocpdb> 98 atoms in block 60 Block first atom: 5433 Blocpdb> 103 atoms in block 61 Block first atom: 5531 Blocpdb> 97 atoms in block 62 Block first atom: 5634 Blocpdb> 97 atoms in block 63 Block first atom: 5731 Blocpdb> 107 atoms in block 64 Block first atom: 5828 Blocpdb> 127 atoms in block 65 Block first atom: 5935 Blocpdb> 106 atoms in block 66 Block first atom: 6062 Blocpdb> 84 atoms in block 67 Block first atom: 6168 Blocpdb> 88 atoms in block 68 Block first atom: 6252 Blocpdb> 97 atoms in block 69 Block first atom: 6340 Blocpdb> 93 atoms in block 70 Block first atom: 6437 Blocpdb> 68 atoms in block 71 Block first atom: 6530 Blocpdb> 102 atoms in block 72 Block first atom: 6598 Blocpdb> 68 atoms in block 73 Block first atom: 6700 Blocpdb> 83 atoms in block 74 Block first atom: 6768 Blocpdb> 114 atoms in block 75 Block first atom: 6851 Blocpdb> 107 atoms in block 76 Block first atom: 6965 Blocpdb> 103 atoms in block 77 Block first atom: 7072 Blocpdb> 88 atoms in block 78 Block first atom: 7175 Blocpdb> 116 atoms in block 79 Block first atom: 7263 Blocpdb> 82 atoms in block 80 Block first atom: 7379 Blocpdb> 118 atoms in block 81 Block first atom: 7461 Blocpdb> 113 atoms in block 82 Block first atom: 7579 Blocpdb> 98 atoms in block 83 Block first atom: 7692 Blocpdb> 101 atoms in block 84 Block first atom: 7790 Blocpdb> 108 atoms in block 85 Block first atom: 7891 Blocpdb> 102 atoms in block 86 Block first atom: 7999 Blocpdb> 112 atoms in block 87 Block first atom: 8101 Blocpdb> 66 atoms in block 88 Block first atom: 8213 Blocpdb> 82 atoms in block 89 Block first atom: 8279 Blocpdb> 116 atoms in block 90 Block first atom: 8361 Blocpdb> 107 atoms in block 91 Block first atom: 8477 Blocpdb> 108 atoms in block 92 Block first atom: 8584 Blocpdb> 109 atoms in block 93 Block first atom: 8692 Blocpdb> 102 atoms in block 94 Block first atom: 8801 Blocpdb> 102 atoms in block 95 Block first atom: 8903 Blocpdb> 118 atoms in block 96 Block first atom: 9005 Blocpdb> 108 atoms in block 97 Block first atom: 9123 Blocpdb> 95 atoms in block 98 Block first atom: 9231 Blocpdb> 118 atoms in block 99 Block first atom: 9326 Blocpdb> 115 atoms in block 100 Block first atom: 9444 Blocpdb> 86 atoms in block 101 Block first atom: 9559 Blocpdb> 107 atoms in block 102 Block first atom: 9645 Blocpdb> 100 atoms in block 103 Block first atom: 9752 Blocpdb> 117 atoms in block 104 Block first atom: 9852 Blocpdb> 88 atoms in block 105 Block first atom: 9969 Blocpdb> 104 atoms in block 106 Block first atom: 10057 Blocpdb> 82 atoms in block 107 Block first atom: 10161 Blocpdb> 121 atoms in block 108 Block first atom: 10243 Blocpdb> 114 atoms in block 109 Block first atom: 10364 Blocpdb> 97 atoms in block 110 Block first atom: 10478 Blocpdb> 99 atoms in block 111 Block first atom: 10575 Blocpdb> 118 atoms in block 112 Block first atom: 10674 Blocpdb> 76 atoms in block 113 Block first atom: 10792 Blocpdb> 84 atoms in block 114 Block first atom: 10868 Blocpdb> 106 atoms in block 115 Block first atom: 10952 Blocpdb> 117 atoms in block 116 Block first atom: 11058 Blocpdb> 93 atoms in block 117 Block first atom: 11175 Blocpdb> 103 atoms in block 118 Block first atom: 11268 Blocpdb> 96 atoms in block 119 Block first atom: 11371 Blocpdb> 83 atoms in block 120 Block first atom: 11467 Blocpdb> 100 atoms in block 121 Block first atom: 11550 Blocpdb> 90 atoms in block 122 Block first atom: 11650 Blocpdb> 100 atoms in block 123 Block first atom: 11740 Blocpdb> 117 atoms in block 124 Block first atom: 11840 Blocpdb> 91 atoms in block 125 Block first atom: 11957 Blocpdb> 91 atoms in block 126 Block first atom: 12048 Blocpdb> 102 atoms in block 127 Block first atom: 12139 Blocpdb> 86 atoms in block 128 Block first atom: 12241 Blocpdb> 112 atoms in block 129 Block first atom: 12327 Blocpdb> 99 atoms in block 130 Block first atom: 12439 Blocpdb> 90 atoms in block 131 Block first atom: 12538 Blocpdb> 97 atoms in block 132 Block first atom: 12628 Blocpdb> 84 atoms in block 133 Block first atom: 12725 Blocpdb> 68 atoms in block 134 Block first atom: 12809 Blocpdb> 106 atoms in block 135 Block first atom: 12877 Blocpdb> 106 atoms in block 136 Block first atom: 12983 Blocpdb> 100 atoms in block 137 Block first atom: 13089 Blocpdb> 98 atoms in block 138 Block first atom: 13189 Blocpdb> 81 atoms in block 139 Block first atom: 13287 Blocpdb> 93 atoms in block 140 Block first atom: 13368 Blocpdb> 92 atoms in block 141 Block first atom: 13461 Blocpdb> 87 atoms in block 142 Block first atom: 13553 Blocpdb> 99 atoms in block 143 Block first atom: 13640 Blocpdb> 100 atoms in block 144 Block first atom: 13739 Blocpdb> 103 atoms in block 145 Block first atom: 13839 Blocpdb> 99 atoms in block 146 Block first atom: 13942 Blocpdb> 96 atoms in block 147 Block first atom: 14041 Blocpdb> 112 atoms in block 148 Block first atom: 14137 Blocpdb> 97 atoms in block 149 Block first atom: 14249 Blocpdb> 83 atoms in block 150 Block first atom: 14346 Blocpdb> 106 atoms in block 151 Block first atom: 14429 Blocpdb> 92 atoms in block 152 Block first atom: 14535 Blocpdb> 67 atoms in block 153 Block first atom: 14627 Blocpdb> 94 atoms in block 154 Block first atom: 14694 Blocpdb> 101 atoms in block 155 Block first atom: 14788 Blocpdb> 87 atoms in block 156 Block first atom: 14889 Blocpdb> 102 atoms in block 157 Block first atom: 14976 Blocpdb> 83 atoms in block 158 Block first atom: 15078 Blocpdb> 99 atoms in block 159 Block first atom: 15161 Blocpdb> 98 atoms in block 160 Block first atom: 15260 Blocpdb> 97 atoms in block 161 Block first atom: 15358 Blocpdb> 110 atoms in block 162 Block first atom: 15455 Blocpdb> 103 atoms in block 163 Block first atom: 15565 Blocpdb> 104 atoms in block 164 Block first atom: 15668 Blocpdb> 106 atoms in block 165 Block first atom: 15772 Blocpdb> 91 atoms in block 166 Block first atom: 15878 Blocpdb> 95 atoms in block 167 Block first atom: 15969 Blocpdb> 115 atoms in block 168 Block first atom: 16064 Blocpdb> 102 atoms in block 169 Block first atom: 16179 Blocpdb> 96 atoms in block 170 Block first atom: 16281 Blocpdb> 111 atoms in block 171 Block first atom: 16377 Blocpdb> 104 atoms in block 172 Block first atom: 16488 Blocpdb> 101 atoms in block 173 Block first atom: 16592 Blocpdb> 86 atoms in block 174 Block first atom: 16693 Blocpdb> 103 atoms in block 175 Block first atom: 16779 Blocpdb> 78 atoms in block 176 Block first atom: 16882 Blocpdb> 66 atoms in block 177 Block first atom: 16960 Blocpdb> 80 atoms in block 178 Block first atom: 17026 Blocpdb> 97 atoms in block 179 Block first atom: 17106 Blocpdb> 102 atoms in block 180 Block first atom: 17203 Blocpdb> 120 atoms in block 181 Block first atom: 17305 Blocpdb> 100 atoms in block 182 Block first atom: 17425 Blocpdb> 94 atoms in block 183 Block first atom: 17525 Blocpdb> 88 atoms in block 184 Block first atom: 17619 Blocpdb> 100 atoms in block 185 Block first atom: 17707 Blocpdb> 91 atoms in block 186 Block first atom: 17807 Blocpdb> 68 atoms in block 187 Block first atom: 17898 Blocpdb> 98 atoms in block 188 Block first atom: 17966 Blocpdb> 65 atoms in block 189 Block first atom: 18063 Blocpdb> 189 blocks. Blocpdb> At most, 127 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 65 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 12070856 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 54384 Prepmat> Matrix trace = 26586520.0001 Prepmat> Last element read: 54384 54384 408.7360 Prepmat> 17956 lines saved. Prepmat> 16391 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 18128 RTB> Total mass = 18128.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 18128 RTB> Number of blocks = 189 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 351582.5918 RTB> 53469 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1134 Diagstd> Nb of non-zero elements: 53469 Diagstd> Projected matrix trace = 351582.5918 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1134 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 351582.5918 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0038490 0.0068519 0.0110290 0.0123370 0.0147711 0.0248721 0.0278067 0.0467131 0.0504081 0.0592506 0.0992119 0.1069554 0.1376288 0.1469691 0.1790040 0.2264256 0.2473268 0.2570088 0.2955749 0.3807438 0.3921108 0.4289239 0.4750955 0.5348807 0.5891712 0.6145081 0.6307205 0.6887176 0.7266747 0.8443269 0.9184357 1.0268309 1.0316501 1.1579916 1.1893897 1.3685127 1.4021042 1.4458628 1.4730352 1.6102734 1.6814794 1.7346585 2.0878549 2.1854882 2.2092466 2.3019829 2.4188334 2.6657288 2.7700141 2.9341742 2.9983466 3.2508567 3.3822068 3.5576059 3.6741996 3.8157276 4.2567541 4.4232306 4.5191399 4.6816537 4.7277596 4.8827943 5.2127262 5.3073791 5.4017864 5.6842388 5.7338717 6.0573589 6.2966272 6.8657407 7.1004878 7.1883035 7.7125884 7.8370986 7.9005546 8.3760634 8.8484307 9.3571413 9.5575654 9.6691369 9.8217430 9.9214642 10.1999387 10.3192974 10.7022206 10.7796856 11.0223771 11.3564088 11.6230524 11.9434490 12.3669145 13.0187622 13.2955998 14.2204918 14.5883960 14.9035792 15.8518494 15.9301975 16.4131656 16.9432607 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034314 0.0034328 0.0034333 0.0034336 0.0034336 0.0034350 6.7370118 8.9887552 11.4041836 12.0614529 13.1977834 17.1258082 18.1079819 23.4700936 24.3806677 26.4327098 34.2040196 35.5137510 40.2856048 41.6301785 45.9437758 51.6723307 54.0046179 55.0515119 59.0376476 67.0056967 67.9985559 71.1189648 74.8489581 79.4188793 83.3520013 85.1253846 86.2409921 90.1188954 92.5689400 99.7816279 104.0685900 110.0385232 110.2964411 116.8551838 118.4288080 127.0339200 128.5835518 130.5746354 131.7958814 137.7986886 140.8124510 143.0218132 156.9081263 160.5349206 161.4051449 164.7579304 168.8877915 177.2977655 180.7325065 186.0108286 188.0339202 195.7916607 199.7079540 204.8208659 208.1501145 212.1211460 224.0446410 228.3836812 230.8464367 234.9605344 236.1146705 239.9548283 247.9292335 250.1700606 252.3852575 258.8996343 260.0274919 267.2618271 272.4891850 284.5371519 289.3605847 291.1444286 301.5750142 303.9995472 305.2277875 314.2789252 323.0192512 332.1749477 335.7135878 337.6674011 340.3216390 342.0449353 346.8119568 348.8352349 355.2484806 356.5318463 360.5229474 365.9449757 370.2161655 375.2840952 381.8791601 391.8141606 395.9581145 409.4987572 414.7620884 419.2186253 432.3497861 433.4169182 439.9379799 446.9858519 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 18128 Rtb_to_modes> Number of blocs = 189 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9852E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9930E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8490E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.8519E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1029E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2337E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4771E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4872E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.7807E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6713E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.0408E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.9251E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9212E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1070 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1376 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1470 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1790 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2264 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2473 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2570 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2956 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3807 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3921 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4289 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4751 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5349 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5892 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6145 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6307 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6887 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8443 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9184 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.032 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.158 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.189 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.369 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.402 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.446 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.473 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.610 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.681 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.735 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.088 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.185 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.209 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.302 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.666 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.770 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.934 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.998 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.251 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.382 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.558 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.674 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.816 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.257 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.423 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.519 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.682 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.728 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.883 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.213 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.307 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.402 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.684 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.734 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.057 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.297 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.866 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.100 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.188 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.713 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.837 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.901 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.376 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.848 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.357 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.558 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.669 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.822 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.921 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.94 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1134 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 0.99997 1.00002 0.99997 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00004 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002 0.99998 0.99997 0.99999 1.00002 1.00004 1.00002 0.99996 1.00000 1.00004 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 0.99995 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 0.99998 0.99994 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997 1.00003 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 1.00002 0.99997 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 326304 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00002 0.99999 0.99997 1.00002 0.99997 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00004 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002 0.99998 0.99997 0.99999 1.00002 1.00004 1.00002 0.99996 1.00000 1.00004 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 0.99995 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 0.99998 0.99994 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997 1.00003 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 1.00002 0.99997 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607240640404056357.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607240640404056357.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607240640404056357.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607240640404056357.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1132 First residue number = 1 Last residue number = 1132 Number of atoms found = 18128 Mean number per residue = 16.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9852E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9930E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8490E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.8519E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1029E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2337E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4771E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4872E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.7807E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6713E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.0408E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9251E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9212E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1070 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1376 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1470 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1790 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2264 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2473 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2570 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2956 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3807 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3921 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4289 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4751 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5349 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5892 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6145 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6307 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6887 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8443 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9184 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.032 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.158 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.189 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.402 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.446 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.473 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.610 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.681 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.735 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.088 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.185 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.302 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.419 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.666 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.770 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.934 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.998 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.251 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.382 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.558 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.674 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.816 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.257 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.423 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.519 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.682 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.728 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.883 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.213 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.307 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.402 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.684 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.734 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.057 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.297 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.866 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.100 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.188 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.713 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.837 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.901 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.376 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.848 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.357 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.558 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.669 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.822 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.921 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.94 Bfactors> 106 vectors, 54384 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.003849 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.548 for 1132 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.771 +/- 2.83 Bfactors> = 80.204 +/- 23.88 Bfactors> Shiftng-fct= 79.433 Bfactors> Scaling-fct= 8.434 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607240640404056357.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607240640404056357.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.988 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.9 Chkmod> 106 vectors, 54384 coordinates in file. Chkmod> That is: 18128 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 69 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8086 0.0034 0.9867 0.0034 0.7057 0.0034 0.6748 0.0034 0.6957 0.0034 0.9546 6.7368 0.0336 8.9884 0.0397 11.4037 0.0815 12.0609 0.0477 13.1972 0.0498 17.1251 0.0591 18.1073 0.0597 23.4691 0.0482 24.3796 0.0413 26.4317 0.0483 34.2026 0.0599 35.5196 0.0668 40.2797 0.0233 41.6328 0.0334 45.9413 0.0437 51.6672 0.0235 53.9994 0.0530 55.0482 0.0638 59.0376 0.0770 66.9990 0.0192 67.9947 0.0445 71.1139 0.0517 74.8461 0.0414 79.4169 0.4569 83.3505 0.1140 85.1212 0.0685 86.2359 0.0753 90.1139 0.0656 92.5666 0.0666 99.7758 0.0704 104.0621 0.0527 110.0429 0.0339 110.3104 0.5021 116.8506 0.0335 118.4043 0.0457 127.0511 0.1259 128.5733 0.0467 130.5752 0.0267 131.7887 0.0431 137.7811 0.2289 140.7863 0.1202 143.0297 0.0515 156.9068 0.2766 160.5101 0.1536 161.3892 0.0117 164.7515 0.0532 168.8864 0.1848 177.2992 0.3650 180.7243 0.3701 185.9973 0.0538 188.0150 0.0176 195.7876 0.0626 199.6933 0.1721 204.8234 0.0453 208.1355 0.1184 212.1196 0.2435 224.0415 0.3118 228.3679 0.0865 230.8330 0.0881 234.9591 0.1247 236.1105 0.2981 239.9496 0.0882 247.9251 0.0811 250.1504 0.0759 252.3794 0.1341 258.8831 0.0326 260.0192 0.2319 267.2424 0.5108 272.4856 0.2268 284.5303 0.0563 289.3382 0.1936 291.1258 0.5057 301.5701 0.2498 303.9846 0.0530 305.2233 0.1780 314.2642 0.5314 322.9975 0.0348 332.1582 0.1552 335.7068 0.0624 337.6505 0.2179 340.3115 0.0440 342.0223 0.4099 346.7981 0.1197 348.8321 0.1889 355.1964 0.0815 356.5217 0.1429 360.4686 0.0758 365.9871 0.3089 370.1517 0.1390 375.2138 0.0281 381.9104 0.2061 391.8160 0.1072 396.0066 0.1844 409.4741 0.2948 414.7671 0.3195 419.1503 0.0791 432.3060 0.0803 433.3956 0.0814 439.8767 0.3177 446.9237 0.1565 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2607240640404056357 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom making animated gifs 11 models are in 2607240640404056357.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607240640404056357.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607240640404056357.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2607240640404056357 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom making animated gifs 11 models are in 2607240640404056357.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607240640404056357.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607240640404056357.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2607240640404056357 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom making animated gifs 11 models are in 2607240640404056357.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607240640404056357.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607240640404056357.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2607240640404056357 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom making animated gifs 11 models are in 2607240640404056357.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607240640404056357.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607240640404056357.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2607240640404056357 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607240640404056357.eigenfacs 2607240640404056357.atom making animated gifs 11 models are in 2607240640404056357.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607240640404056357.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607240640404056357.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2607240640404056357.10.pdb 2607240640404056357.11.pdb 2607240640404056357.7.pdb 2607240640404056357.8.pdb 2607240640404056357.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 2m57.240s user 2m55.780s sys 0m1.377s rm: cannot remove '2607240640404056357.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.