***  01-AUG-25  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2607240640404056357.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2607240640404056357.atom to be opened.
Openam> File opened: 2607240640404056357.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1132
First residue number = 1
Last residue number = 1132
Number of atoms found = 18128
Mean number per residue = 16.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 6.340381 +/- 21.731093 From: -46.850000 To: 60.949000
= 2.158760 +/- 19.547974 From: -61.939000 To: 60.033000
= 0.119894 +/- 21.010836 From: -47.377000 To: 74.003000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is -1.8052 % Filled.
Pdbmat> 12070667 non-zero elements.
Pdbmat> 1329326 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 146.66 +/- 58.72
Maximum number = 250
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 2.658652E+07
Pdbmat> Larger element = 892.086
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1132 non-zero elements, NRBL set to 6
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2607240640404056357.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 6
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2607240640404056357.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2607240640404056357.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 18128 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 6 residue(s) per block.
Blocpdb> 1132 residues.
Blocpdb> 105 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 96 atoms in block 2
Block first atom: 106
Blocpdb> 111 atoms in block 3
Block first atom: 202
Blocpdb> 107 atoms in block 4
Block first atom: 313
Blocpdb> 108 atoms in block 5
Block first atom: 420
Blocpdb> 88 atoms in block 6
Block first atom: 528
Blocpdb> 107 atoms in block 7
Block first atom: 616
Blocpdb> 90 atoms in block 8
Block first atom: 723
Blocpdb> 83 atoms in block 9
Block first atom: 813
Blocpdb> 100 atoms in block 10
Block first atom: 896
Blocpdb> 88 atoms in block 11
Block first atom: 996
Blocpdb> 89 atoms in block 12
Block first atom: 1084
Blocpdb> 96 atoms in block 13
Block first atom: 1173
Blocpdb> 100 atoms in block 14
Block first atom: 1269
Blocpdb> 105 atoms in block 15
Block first atom: 1369
Blocpdb> 93 atoms in block 16
Block first atom: 1474
Blocpdb> 86 atoms in block 17
Block first atom: 1567
Blocpdb> 91 atoms in block 18
Block first atom: 1653
Blocpdb> 67 atoms in block 19
Block first atom: 1744
Blocpdb> 99 atoms in block 20
Block first atom: 1811
Blocpdb> 93 atoms in block 21
Block first atom: 1910
Blocpdb> 95 atoms in block 22
Block first atom: 2003
Blocpdb> 66 atoms in block 23
Block first atom: 2098
Blocpdb> 121 atoms in block 24
Block first atom: 2164
Blocpdb> 82 atoms in block 25
Block first atom: 2285
Blocpdb> 100 atoms in block 26
Block first atom: 2367
Blocpdb> 100 atoms in block 27
Block first atom: 2467
Blocpdb> 77 atoms in block 28
Block first atom: 2567
Blocpdb> 79 atoms in block 29
Block first atom: 2644
Blocpdb> 93 atoms in block 30
Block first atom: 2723
Blocpdb> 89 atoms in block 31
Block first atom: 2816
Blocpdb> 73 atoms in block 32
Block first atom: 2905
Blocpdb> 112 atoms in block 33
Block first atom: 2978
Blocpdb> 98 atoms in block 34
Block first atom: 3090
Blocpdb> 93 atoms in block 35
Block first atom: 3188
Blocpdb> 82 atoms in block 36
Block first atom: 3281
Blocpdb> 79 atoms in block 37
Block first atom: 3363
Blocpdb> 83 atoms in block 38
Block first atom: 3442
Blocpdb> 98 atoms in block 39
Block first atom: 3525
Blocpdb> 122 atoms in block 40
Block first atom: 3623
Blocpdb> 70 atoms in block 41
Block first atom: 3745
Blocpdb> 90 atoms in block 42
Block first atom: 3815
Blocpdb> 86 atoms in block 43
Block first atom: 3905
Blocpdb> 90 atoms in block 44
Block first atom: 3991
Blocpdb> 88 atoms in block 45
Block first atom: 4081
Blocpdb> 78 atoms in block 46
Block first atom: 4169
Blocpdb> 88 atoms in block 47
Block first atom: 4247
Blocpdb> 76 atoms in block 48
Block first atom: 4335
Blocpdb> 92 atoms in block 49
Block first atom: 4411
Blocpdb> 76 atoms in block 50
Block first atom: 4503
Blocpdb> 92 atoms in block 51
Block first atom: 4579
Blocpdb> 88 atoms in block 52
Block first atom: 4671
Blocpdb> 102 atoms in block 53
Block first atom: 4759
Blocpdb> 83 atoms in block 54
Block first atom: 4861
Blocpdb> 99 atoms in block 55
Block first atom: 4944
Blocpdb> 89 atoms in block 56
Block first atom: 5043
Blocpdb> 109 atoms in block 57
Block first atom: 5132
Blocpdb> 94 atoms in block 58
Block first atom: 5241
Blocpdb> 98 atoms in block 59
Block first atom: 5335
Blocpdb> 98 atoms in block 60
Block first atom: 5433
Blocpdb> 103 atoms in block 61
Block first atom: 5531
Blocpdb> 97 atoms in block 62
Block first atom: 5634
Blocpdb> 97 atoms in block 63
Block first atom: 5731
Blocpdb> 107 atoms in block 64
Block first atom: 5828
Blocpdb> 127 atoms in block 65
Block first atom: 5935
Blocpdb> 106 atoms in block 66
Block first atom: 6062
Blocpdb> 84 atoms in block 67
Block first atom: 6168
Blocpdb> 88 atoms in block 68
Block first atom: 6252
Blocpdb> 97 atoms in block 69
Block first atom: 6340
Blocpdb> 93 atoms in block 70
Block first atom: 6437
Blocpdb> 68 atoms in block 71
Block first atom: 6530
Blocpdb> 102 atoms in block 72
Block first atom: 6598
Blocpdb> 68 atoms in block 73
Block first atom: 6700
Blocpdb> 83 atoms in block 74
Block first atom: 6768
Blocpdb> 114 atoms in block 75
Block first atom: 6851
Blocpdb> 107 atoms in block 76
Block first atom: 6965
Blocpdb> 103 atoms in block 77
Block first atom: 7072
Blocpdb> 88 atoms in block 78
Block first atom: 7175
Blocpdb> 116 atoms in block 79
Block first atom: 7263
Blocpdb> 82 atoms in block 80
Block first atom: 7379
Blocpdb> 118 atoms in block 81
Block first atom: 7461
Blocpdb> 113 atoms in block 82
Block first atom: 7579
Blocpdb> 98 atoms in block 83
Block first atom: 7692
Blocpdb> 101 atoms in block 84
Block first atom: 7790
Blocpdb> 108 atoms in block 85
Block first atom: 7891
Blocpdb> 102 atoms in block 86
Block first atom: 7999
Blocpdb> 112 atoms in block 87
Block first atom: 8101
Blocpdb> 66 atoms in block 88
Block first atom: 8213
Blocpdb> 82 atoms in block 89
Block first atom: 8279
Blocpdb> 116 atoms in block 90
Block first atom: 8361
Blocpdb> 107 atoms in block 91
Block first atom: 8477
Blocpdb> 108 atoms in block 92
Block first atom: 8584
Blocpdb> 109 atoms in block 93
Block first atom: 8692
Blocpdb> 102 atoms in block 94
Block first atom: 8801
Blocpdb> 102 atoms in block 95
Block first atom: 8903
Blocpdb> 118 atoms in block 96
Block first atom: 9005
Blocpdb> 108 atoms in block 97
Block first atom: 9123
Blocpdb> 95 atoms in block 98
Block first atom: 9231
Blocpdb> 118 atoms in block 99
Block first atom: 9326
Blocpdb> 115 atoms in block 100
Block first atom: 9444
Blocpdb> 86 atoms in block 101
Block first atom: 9559
Blocpdb> 107 atoms in block 102
Block first atom: 9645
Blocpdb> 100 atoms in block 103
Block first atom: 9752
Blocpdb> 117 atoms in block 104
Block first atom: 9852
Blocpdb> 88 atoms in block 105
Block first atom: 9969
Blocpdb> 104 atoms in block 106
Block first atom: 10057
Blocpdb> 82 atoms in block 107
Block first atom: 10161
Blocpdb> 121 atoms in block 108
Block first atom: 10243
Blocpdb> 114 atoms in block 109
Block first atom: 10364
Blocpdb> 97 atoms in block 110
Block first atom: 10478
Blocpdb> 99 atoms in block 111
Block first atom: 10575
Blocpdb> 118 atoms in block 112
Block first atom: 10674
Blocpdb> 76 atoms in block 113
Block first atom: 10792
Blocpdb> 84 atoms in block 114
Block first atom: 10868
Blocpdb> 106 atoms in block 115
Block first atom: 10952
Blocpdb> 117 atoms in block 116
Block first atom: 11058
Blocpdb> 93 atoms in block 117
Block first atom: 11175
Blocpdb> 103 atoms in block 118
Block first atom: 11268
Blocpdb> 96 atoms in block 119
Block first atom: 11371
Blocpdb> 83 atoms in block 120
Block first atom: 11467
Blocpdb> 100 atoms in block 121
Block first atom: 11550
Blocpdb> 90 atoms in block 122
Block first atom: 11650
Blocpdb> 100 atoms in block 123
Block first atom: 11740
Blocpdb> 117 atoms in block 124
Block first atom: 11840
Blocpdb> 91 atoms in block 125
Block first atom: 11957
Blocpdb> 91 atoms in block 126
Block first atom: 12048
Blocpdb> 102 atoms in block 127
Block first atom: 12139
Blocpdb> 86 atoms in block 128
Block first atom: 12241
Blocpdb> 112 atoms in block 129
Block first atom: 12327
Blocpdb> 99 atoms in block 130
Block first atom: 12439
Blocpdb> 90 atoms in block 131
Block first atom: 12538
Blocpdb> 97 atoms in block 132
Block first atom: 12628
Blocpdb> 84 atoms in block 133
Block first atom: 12725
Blocpdb> 68 atoms in block 134
Block first atom: 12809
Blocpdb> 106 atoms in block 135
Block first atom: 12877
Blocpdb> 106 atoms in block 136
Block first atom: 12983
Blocpdb> 100 atoms in block 137
Block first atom: 13089
Blocpdb> 98 atoms in block 138
Block first atom: 13189
Blocpdb> 81 atoms in block 139
Block first atom: 13287
Blocpdb> 93 atoms in block 140
Block first atom: 13368
Blocpdb> 92 atoms in block 141
Block first atom: 13461
Blocpdb> 87 atoms in block 142
Block first atom: 13553
Blocpdb> 99 atoms in block 143
Block first atom: 13640
Blocpdb> 100 atoms in block 144
Block first atom: 13739
Blocpdb> 103 atoms in block 145
Block first atom: 13839
Blocpdb> 99 atoms in block 146
Block first atom: 13942
Blocpdb> 96 atoms in block 147
Block first atom: 14041
Blocpdb> 112 atoms in block 148
Block first atom: 14137
Blocpdb> 97 atoms in block 149
Block first atom: 14249
Blocpdb> 83 atoms in block 150
Block first atom: 14346
Blocpdb> 106 atoms in block 151
Block first atom: 14429
Blocpdb> 92 atoms in block 152
Block first atom: 14535
Blocpdb> 67 atoms in block 153
Block first atom: 14627
Blocpdb> 94 atoms in block 154
Block first atom: 14694
Blocpdb> 101 atoms in block 155
Block first atom: 14788
Blocpdb> 87 atoms in block 156
Block first atom: 14889
Blocpdb> 102 atoms in block 157
Block first atom: 14976
Blocpdb> 83 atoms in block 158
Block first atom: 15078
Blocpdb> 99 atoms in block 159
Block first atom: 15161
Blocpdb> 98 atoms in block 160
Block first atom: 15260
Blocpdb> 97 atoms in block 161
Block first atom: 15358
Blocpdb> 110 atoms in block 162
Block first atom: 15455
Blocpdb> 103 atoms in block 163
Block first atom: 15565
Blocpdb> 104 atoms in block 164
Block first atom: 15668
Blocpdb> 106 atoms in block 165
Block first atom: 15772
Blocpdb> 91 atoms in block 166
Block first atom: 15878
Blocpdb> 95 atoms in block 167
Block first atom: 15969
Blocpdb> 115 atoms in block 168
Block first atom: 16064
Blocpdb> 102 atoms in block 169
Block first atom: 16179
Blocpdb> 96 atoms in block 170
Block first atom: 16281
Blocpdb> 111 atoms in block 171
Block first atom: 16377
Blocpdb> 104 atoms in block 172
Block first atom: 16488
Blocpdb> 101 atoms in block 173
Block first atom: 16592
Blocpdb> 86 atoms in block 174
Block first atom: 16693
Blocpdb> 103 atoms in block 175
Block first atom: 16779
Blocpdb> 78 atoms in block 176
Block first atom: 16882
Blocpdb> 66 atoms in block 177
Block first atom: 16960
Blocpdb> 80 atoms in block 178
Block first atom: 17026
Blocpdb> 97 atoms in block 179
Block first atom: 17106
Blocpdb> 102 atoms in block 180
Block first atom: 17203
Blocpdb> 120 atoms in block 181
Block first atom: 17305
Blocpdb> 100 atoms in block 182
Block first atom: 17425
Blocpdb> 94 atoms in block 183
Block first atom: 17525
Blocpdb> 88 atoms in block 184
Block first atom: 17619
Blocpdb> 100 atoms in block 185
Block first atom: 17707
Blocpdb> 91 atoms in block 186
Block first atom: 17807
Blocpdb> 68 atoms in block 187
Block first atom: 17898
Blocpdb> 98 atoms in block 188
Block first atom: 17966
Blocpdb> 65 atoms in block 189
Block first atom: 18063
Blocpdb> 189 blocks.
Blocpdb> At most, 127 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 65 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 12070856 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 54384
Prepmat> Matrix trace = 26586520.0001
Prepmat> Last element read: 54384 54384 408.7360
Prepmat> 17956 lines saved.
Prepmat> 16391 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 18128
RTB> Total mass = 18128.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 18128
RTB> Number of blocks = 189
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 351582.5918
RTB> 53469 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1134
Diagstd> Nb of non-zero elements: 53469
Diagstd> Projected matrix trace = 351582.5918
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1134 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 351582.5918
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0038490 0.0068519 0.0110290 0.0123370
0.0147711 0.0248721 0.0278067 0.0467131 0.0504081
0.0592506 0.0992119 0.1069554 0.1376288 0.1469691
0.1790040 0.2264256 0.2473268 0.2570088 0.2955749
0.3807438 0.3921108 0.4289239 0.4750955 0.5348807
0.5891712 0.6145081 0.6307205 0.6887176 0.7266747
0.8443269 0.9184357 1.0268309 1.0316501 1.1579916
1.1893897 1.3685127 1.4021042 1.4458628 1.4730352
1.6102734 1.6814794 1.7346585 2.0878549 2.1854882
2.2092466 2.3019829 2.4188334 2.6657288 2.7700141
2.9341742 2.9983466 3.2508567 3.3822068 3.5576059
3.6741996 3.8157276 4.2567541 4.4232306 4.5191399
4.6816537 4.7277596 4.8827943 5.2127262 5.3073791
5.4017864 5.6842388 5.7338717 6.0573589 6.2966272
6.8657407 7.1004878 7.1883035 7.7125884 7.8370986
7.9005546 8.3760634 8.8484307 9.3571413 9.5575654
9.6691369 9.8217430 9.9214642 10.1999387 10.3192974
10.7022206 10.7796856 11.0223771 11.3564088 11.6230524
11.9434490 12.3669145 13.0187622 13.2955998 14.2204918
14.5883960 14.9035792 15.8518494 15.9301975 16.4131656
16.9432607
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034314 0.0034328 0.0034333 0.0034336 0.0034336
0.0034350 6.7370118 8.9887552 11.4041836 12.0614529
13.1977834 17.1258082 18.1079819 23.4700936 24.3806677
26.4327098 34.2040196 35.5137510 40.2856048 41.6301785
45.9437758 51.6723307 54.0046179 55.0515119 59.0376476
67.0056967 67.9985559 71.1189648 74.8489581 79.4188793
83.3520013 85.1253846 86.2409921 90.1188954 92.5689400
99.7816279 104.0685900 110.0385232 110.2964411 116.8551838
118.4288080 127.0339200 128.5835518 130.5746354 131.7958814
137.7986886 140.8124510 143.0218132 156.9081263 160.5349206
161.4051449 164.7579304 168.8877915 177.2977655 180.7325065
186.0108286 188.0339202 195.7916607 199.7079540 204.8208659
208.1501145 212.1211460 224.0446410 228.3836812 230.8464367
234.9605344 236.1146705 239.9548283 247.9292335 250.1700606
252.3852575 258.8996343 260.0274919 267.2618271 272.4891850
284.5371519 289.3605847 291.1444286 301.5750142 303.9995472
305.2277875 314.2789252 323.0192512 332.1749477 335.7135878
337.6674011 340.3216390 342.0449353 346.8119568 348.8352349
355.2484806 356.5318463 360.5229474 365.9449757 370.2161655
375.2840952 381.8791601 391.8141606 395.9581145 409.4987572
414.7620884 419.2186253 432.3497861 433.4169182 439.9379799
446.9858519
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 18128
Rtb_to_modes> Number of blocs = 189
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9852E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9930E-10
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.735
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.558
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.684
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.734
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.188
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.558
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.822
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.93
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.94
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1134 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00002 0.99998 0.99997 0.99999 1.00002
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1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
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1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000
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1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 326304 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
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1.00000 0.99998 1.00004 1.00002 0.99997
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607240640404056357.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607240640404056357.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2607240640404056357.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2607240640404056357.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1132
First residue number = 1
Last residue number = 1132
Number of atoms found = 18128
Mean number per residue = 16.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9852E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9930E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.8519E-03
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.883
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.213
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.307
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.402
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.684
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.734
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.057
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.866
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.100
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.188
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.713
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.837
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.901
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.376
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.357
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.822
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.921
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.94
Bfactors> 106 vectors, 54384 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.003849
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.548 for 1132 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.771 +/- 2.83
Bfactors> = 80.204 +/- 23.88
Bfactors> Shiftng-fct= 79.433
Bfactors> Scaling-fct= 8.434
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2607240640404056357.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2607240640404056357.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.737
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.988
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.9
Chkmod> 106 vectors, 54384 coordinates in file.
Chkmod> That is: 18128 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 69 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8086
0.0034 0.9867
0.0034 0.7057
0.0034 0.6748
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Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 2m57.240s
user 2m55.780s
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