*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2608010940541938707.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2608010940541938707.atom to be opened.
Openam> File opened: 2608010940541938707.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 4260
First residue number = 1
Last residue number = 1065
Number of atoms found = 4260
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 99.365568 +/- 30.856291 From: 16.860000 To: 172.340000
= 98.543270 +/- 30.664252 From: 23.000000 To: 166.280000
= 133.954641 +/- 29.214271 From: 62.340000 To: 185.070000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 88 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.2557 % Filled.
Pdbmat> 208837 non-zero elements.
Pdbmat> 20393 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 9.57 +/- 2.57
Maximum number = 18
Minimum number = 2
Pdbmat> Matrix trace = 407860.
Pdbmat> Larger element = 73.2143
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
4260 non-zero elements, NRBL set to 22
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2608010940541938707.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 22
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2608010940541938707.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2608010940541938707.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4260 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 22 residue(s) per block.
Blocpdb> 4260 residues.
Blocpdb> 22 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 22 atoms in block 2
Block first atom: 23
Blocpdb> 22 atoms in block 3
Block first atom: 45
Blocpdb> 22 atoms in block 4
Block first atom: 67
Blocpdb> 22 atoms in block 5
Block first atom: 89
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 111
Blocpdb> 22 atoms in block 7
Block first atom: 133
Blocpdb> 22 atoms in block 8
Block first atom: 155
Blocpdb> 22 atoms in block 9
Block first atom: 177
Blocpdb> 22 atoms in block 10
Block first atom: 199
Blocpdb> 22 atoms in block 11
Block first atom: 221
Blocpdb> 22 atoms in block 12
Block first atom: 243
Blocpdb> 22 atoms in block 13
Block first atom: 265
Blocpdb> 22 atoms in block 14
Block first atom: 287
Blocpdb> 22 atoms in block 15
Block first atom: 309
Blocpdb> 22 atoms in block 16
Block first atom: 331
Blocpdb> 22 atoms in block 17
Block first atom: 353
Blocpdb> 22 atoms in block 18
Block first atom: 375
Blocpdb> 22 atoms in block 19
Block first atom: 397
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 419
Blocpdb> 22 atoms in block 21
Block first atom: 441
Blocpdb> 22 atoms in block 22
Block first atom: 463
Blocpdb> 22 atoms in block 23
Block first atom: 485
Blocpdb> 22 atoms in block 24
Block first atom: 507
Blocpdb> 22 atoms in block 25
Block first atom: 529
Blocpdb> 22 atoms in block 26
Block first atom: 551
Blocpdb> 22 atoms in block 27
Block first atom: 573
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 595
Blocpdb> 22 atoms in block 29
Block first atom: 617
Blocpdb> 22 atoms in block 30
Block first atom: 639
Blocpdb> 22 atoms in block 31
Block first atom: 661
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 683
Blocpdb> 22 atoms in block 33
Block first atom: 705
Blocpdb> 22 atoms in block 34
Block first atom: 727
Blocpdb> 22 atoms in block 35
Block first atom: 749
Blocpdb> 22 atoms in block 36
Block first atom: 771
Blocpdb> 22 atoms in block 37
Block first atom: 793
Blocpdb> 22 atoms in block 38
Block first atom: 815
Blocpdb> 22 atoms in block 39
Block first atom: 837
Blocpdb> 22 atoms in block 40
Block first atom: 859
Blocpdb> 22 atoms in block 41
Block first atom: 881
Blocpdb> 22 atoms in block 42
Block first atom: 903
Blocpdb> 22 atoms in block 43
Block first atom: 925
Blocpdb> 22 atoms in block 44
Block first atom: 947
Blocpdb> 22 atoms in block 45
Block first atom: 969
Blocpdb> 22 atoms in block 46
Block first atom: 991
Blocpdb> 22 atoms in block 47
Block first atom: 1013
Blocpdb> 22 atoms in block 48
Block first atom: 1035
Blocpdb> 9 atoms in block 49
Block first atom: 1057
Blocpdb> 22 atoms in block 50
Block first atom: 1066
Blocpdb> 22 atoms in block 51
Block first atom: 1088
Blocpdb> 22 atoms in block 52
Block first atom: 1110
Blocpdb> 22 atoms in block 53
Block first atom: 1132
Blocpdb> 22 atoms in block 54
Block first atom: 1154
Blocpdb> 22 atoms in block 55
Block first atom: 1176
Blocpdb> 22 atoms in block 56
Block first atom: 1198
Blocpdb> 22 atoms in block 57
Block first atom: 1220
Blocpdb> 22 atoms in block 58
Block first atom: 1242
Blocpdb> 22 atoms in block 59
Block first atom: 1264
Blocpdb> 22 atoms in block 60
Block first atom: 1286
Blocpdb> 22 atoms in block 61
Block first atom: 1308
Blocpdb> 22 atoms in block 62
Block first atom: 1330
Blocpdb> 22 atoms in block 63
Block first atom: 1352
Blocpdb> 22 atoms in block 64
Block first atom: 1374
Blocpdb> 22 atoms in block 65
Block first atom: 1396
Blocpdb> 22 atoms in block 66
Block first atom: 1418
Blocpdb> 22 atoms in block 67
Block first atom: 1440
Blocpdb> 22 atoms in block 68
Block first atom: 1462
Blocpdb> 22 atoms in block 69
Block first atom: 1484
Blocpdb> 22 atoms in block 70
Block first atom: 1506
Blocpdb> 22 atoms in block 71
Block first atom: 1528
Blocpdb> 22 atoms in block 72
Block first atom: 1550
Blocpdb> 22 atoms in block 73
Block first atom: 1572
Blocpdb> 22 atoms in block 74
Block first atom: 1594
Blocpdb> 22 atoms in block 75
Block first atom: 1616
Blocpdb> 22 atoms in block 76
Block first atom: 1638
Blocpdb> 22 atoms in block 77
Block first atom: 1660
Blocpdb> 22 atoms in block 78
Block first atom: 1682
Blocpdb> 22 atoms in block 79
Block first atom: 1704
Blocpdb> 22 atoms in block 80
Block first atom: 1726
Blocpdb> 22 atoms in block 81
Block first atom: 1748
Blocpdb> 22 atoms in block 82
Block first atom: 1770
Blocpdb> 22 atoms in block 83
Block first atom: 1792
Blocpdb> 22 atoms in block 84
Block first atom: 1814
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 1836
Blocpdb> 22 atoms in block 86
Block first atom: 1858
Blocpdb> 22 atoms in block 87
Block first atom: 1880
Blocpdb> 22 atoms in block 88
Block first atom: 1902
Blocpdb> 22 atoms in block 89
Block first atom: 1924
Blocpdb> 22 atoms in block 90
Block first atom: 1946
Blocpdb> 22 atoms in block 91
Block first atom: 1968
Blocpdb> 22 atoms in block 92
Block first atom: 1990
Blocpdb> 22 atoms in block 93
Block first atom: 2012
Blocpdb> 22 atoms in block 94
Block first atom: 2034
Blocpdb> 22 atoms in block 95
Block first atom: 2056
Blocpdb> 22 atoms in block 96
Block first atom: 2078
Blocpdb> 22 atoms in block 97
Block first atom: 2100
Blocpdb> 9 atoms in block 98
Block first atom: 2122
Blocpdb> 22 atoms in block 99
Block first atom: 2131
Blocpdb> 22 atoms in block 100
Block first atom: 2153
Blocpdb> 22 atoms in block 101
Block first atom: 2175
Blocpdb> 22 atoms in block 102
Block first atom: 2197
Blocpdb> 22 atoms in block 103
Block first atom: 2219
Blocpdb> 22 atoms in block 104
Block first atom: 2241
Blocpdb> 22 atoms in block 105
Block first atom: 2263
Blocpdb> 22 atoms in block 106
Block first atom: 2285
Blocpdb> 22 atoms in block 107
Block first atom: 2307
Blocpdb> 22 atoms in block 108
Block first atom: 2329
Blocpdb> 22 atoms in block 109
Block first atom: 2351
Blocpdb> 22 atoms in block 110
Block first atom: 2373
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 2395
Blocpdb> 22 atoms in block 112
Block first atom: 2417
Blocpdb> 22 atoms in block 113
Block first atom: 2439
Blocpdb> 22 atoms in block 114
Block first atom: 2461
Blocpdb> 22 atoms in block 115
Block first atom: 2483
Blocpdb> 22 atoms in block 116
Block first atom: 2505
Blocpdb> 22 atoms in block 117
Block first atom: 2527
Blocpdb> 22 atoms in block 118
Block first atom: 2549
Blocpdb> 22 atoms in block 119
Block first atom: 2571
Blocpdb> 22 atoms in block 120
Block first atom: 2593
Blocpdb> 22 atoms in block 121
Block first atom: 2615
Blocpdb> 22 atoms in block 122
Block first atom: 2637
Blocpdb> 22 atoms in block 123
Block first atom: 2659
Blocpdb> 22 atoms in block 124
Block first atom: 2681
Blocpdb> 22 atoms in block 125
Block first atom: 2703
Blocpdb> 22 atoms in block 126
Block first atom: 2725
Blocpdb> 22 atoms in block 127
Block first atom: 2747
Blocpdb> 22 atoms in block 128
Block first atom: 2769
Blocpdb> 22 atoms in block 129
Block first atom: 2791
Blocpdb> 22 atoms in block 130
Block first atom: 2813
Blocpdb> 22 atoms in block 131
Block first atom: 2835
Blocpdb> 22 atoms in block 132
Block first atom: 2857
Blocpdb> 22 atoms in block 133
Block first atom: 2879
Blocpdb> 22 atoms in block 134
Block first atom: 2901
Blocpdb> 22 atoms in block 135
Block first atom: 2923
Blocpdb> 22 atoms in block 136
Block first atom: 2945
Blocpdb> 22 atoms in block 137
Block first atom: 2967
Blocpdb> 22 atoms in block 138
Block first atom: 2989
Blocpdb> 22 atoms in block 139
Block first atom: 3011
Blocpdb> 22 atoms in block 140
Block first atom: 3033
Blocpdb> 22 atoms in block 141
Block first atom: 3055
Blocpdb> 22 atoms in block 142
Block first atom: 3077
Blocpdb> 22 atoms in block 143
Block first atom: 3099
Blocpdb> 22 atoms in block 144
Block first atom: 3121
Blocpdb> 22 atoms in block 145
Block first atom: 3143
Blocpdb> 22 atoms in block 146
Block first atom: 3165
Blocpdb> 9 atoms in block 147
Block first atom: 3187
Blocpdb> 22 atoms in block 148
Block first atom: 3196
Blocpdb> 22 atoms in block 149
Block first atom: 3218
Blocpdb> 22 atoms in block 150
Block first atom: 3240
Blocpdb> 22 atoms in block 151
Block first atom: 3262
Blocpdb> 22 atoms in block 152
Block first atom: 3284
Blocpdb> 22 atoms in block 153
Block first atom: 3306
Blocpdb> 22 atoms in block 154
Block first atom: 3328
Blocpdb> 22 atoms in block 155
Block first atom: 3350
Blocpdb> 22 atoms in block 156
Block first atom: 3372
Blocpdb> 22 atoms in block 157
Block first atom: 3394
Blocpdb> 22 atoms in block 158
Block first atom: 3416
Blocpdb> 22 atoms in block 159
Block first atom: 3438
Blocpdb> 22 atoms in block 160
Block first atom: 3460
Blocpdb> 22 atoms in block 161
Block first atom: 3482
Blocpdb> 22 atoms in block 162
Block first atom: 3504
Blocpdb> 22 atoms in block 163
Block first atom: 3526
Blocpdb> 22 atoms in block 164
Block first atom: 3548
Blocpdb> 22 atoms in block 165
Block first atom: 3570
Blocpdb> 22 atoms in block 166
Block first atom: 3592
Blocpdb> 22 atoms in block 167
Block first atom: 3614
Blocpdb> 22 atoms in block 168
Block first atom: 3636
Blocpdb> 22 atoms in block 169
Block first atom: 3658
Blocpdb> 22 atoms in block 170
Block first atom: 3680
Blocpdb> 22 atoms in block 171
Block first atom: 3702
Blocpdb> 22 atoms in block 172
Block first atom: 3724
Blocpdb> 22 atoms in block 173
Block first atom: 3746
Blocpdb> 22 atoms in block 174
Block first atom: 3768
Blocpdb> 22 atoms in block 175
Block first atom: 3790
Blocpdb> 22 atoms in block 176
Block first atom: 3812
Blocpdb> 22 atoms in block 177
Block first atom: 3834
Blocpdb> 22 atoms in block 178
Block first atom: 3856
Blocpdb> 22 atoms in block 179
Block first atom: 3878
Blocpdb> 22 atoms in block 180
Block first atom: 3900
Blocpdb> 22 atoms in block 181
Block first atom: 3922
Blocpdb> 22 atoms in block 182
Block first atom: 3944
Blocpdb> 22 atoms in block 183
Block first atom: 3966
Blocpdb> 22 atoms in block 184
Block first atom: 3988
Blocpdb> 22 atoms in block 185
Block first atom: 4010
Blocpdb> 22 atoms in block 186
Block first atom: 4032
Blocpdb> 22 atoms in block 187
Block first atom: 4054
Blocpdb> 22 atoms in block 188
Block first atom: 4076
Blocpdb> 22 atoms in block 189
Block first atom: 4098
Blocpdb> 22 atoms in block 190
Block first atom: 4120
Blocpdb> 22 atoms in block 191
Block first atom: 4142
Blocpdb> 22 atoms in block 192
Block first atom: 4164
Blocpdb> 22 atoms in block 193
Block first atom: 4186
Blocpdb> 22 atoms in block 194
Block first atom: 4208
Blocpdb> 22 atoms in block 195
Block first atom: 4230
Blocpdb> 9 atoms in block 196
Block first atom: 4251
Blocpdb> 196 blocks.
Blocpdb> At most, 22 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 209033 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 12780
Prepmat> Matrix trace = 407860.0000
Prepmat> Last element read: 12780 12780 36.6240
Prepmat> 19307 lines saved.
Prepmat> 18363 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4260
RTB> Total mass = 4260.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4260
RTB> Number of blocks = 196
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 16705.8379
RTB> 31008 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1176
Diagstd> Nb of non-zero elements: 31008
Diagstd> Projected matrix trace = 16705.8379
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1176 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 16705.8379
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0018367 0.0093420 0.0163656 0.0253926
0.0261506 0.0325198 0.0381449 0.0403655 0.0434116
0.0494845 0.0531750 0.0592087 0.0629305 0.0662777
0.0731566 0.0787841 0.0821746 0.0932910 0.0952885
0.1026025 0.1106207 0.1162006 0.1197640 0.1240850
0.1277074 0.1389098 0.1434591 0.1626798 0.1758343
0.1789891 0.1913912 0.1984343 0.2075083 0.2154555
0.2311648 0.2369129 0.2376214 0.2582930 0.2637334
0.2774503 0.2779736 0.2957528 0.3140273 0.3154084
0.3257882 0.3326310 0.3425879 0.3558228 0.3662521
0.3700593 0.3902328 0.4017724 0.4177641 0.4244521
0.4417047 0.4554974 0.4664017 0.4747657 0.4914528
0.5092290 0.5258422 0.5377320 0.5608976 0.5628071
0.5733336 0.5826184 0.5894269 0.6177242 0.6291621
0.6398449 0.6592089 0.6692771 0.6895847 0.7191477
0.7279018 0.7417314 0.7428152 0.7613318 0.7687787
0.7910683 0.8204829 0.8228823 0.8353405 0.8420355
0.8767998 0.8817367 0.8882541 0.9009234 0.9118957
0.9156357 0.9481059 0.9615426 0.9789596 0.9816272
0.9906410 0.9947468 1.0198678 1.0265930 1.0432699
1.0621482
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034340
0.0034340 4.6538963 10.4957665 13.8918962 17.3041027
17.5604826 19.5825360 21.2086869 21.8172664 22.6255070
24.1562616 25.0408509 26.4233701 27.2411793 27.9562535
29.3712329 30.4799637 31.1289268 33.1676872 33.5208909
34.7835757 36.1171496 37.0168514 37.5801463 38.2520662
38.8063965 40.4726615 41.1300530 43.7987844 45.5351817
45.9418612 47.5068505 48.3730714 49.4667077 50.4050584
52.2102959 52.8554377 52.9344032 55.1888785 55.7670755
57.1989258 57.2528467 59.0554098 60.8525829 60.9862492
61.9816250 62.6291685 63.5596161 64.7757113 65.7181563
66.0588368 67.8355254 68.8311987 70.1876760 70.7472563
72.1707590 73.2889021 74.1609567 74.8229724 76.1265537
77.4911003 78.7450014 79.6302736 81.3274345 81.4657487
82.2240724 82.8871836 83.3700874 85.3478521 86.1343862
86.8625628 88.1671534 88.8378986 90.1756120 92.0882709
92.6470703 93.5230416 93.5913393 94.7506653 95.2129353
96.5833504 98.3626137 98.5063297 99.2492074 99.6461415
101.6823315 101.9681972 102.3443549 103.0716444 103.6973973
103.9098294 105.7361990 106.4828195 107.4428859 107.5891734
108.0820129 108.3057611 109.6647897 110.0257733 110.9158523
111.9148792
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4260
Rtb_to_modes> Number of blocs = 196
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8367E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.3420E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6366E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5393E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6151E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2520E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8145E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0365E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.3412E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9484E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.3175E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.9209E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.2931E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.6278E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.3157E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.8784E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.2175E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.3291E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.5289E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1026
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1106
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1162
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1198
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1241
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1277
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1389
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1435
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1627
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1758
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1790
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1914
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1984
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2075
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2155
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2312
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2369
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2376
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2583
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2637
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2775
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2780
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2958
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3140
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3154
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3258
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3326
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3426
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3558
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3663
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3902
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4018
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4178
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4245
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4417
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4555
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4664
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4748
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4915
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5092
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5258
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5377
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5609
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5628
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5733
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5826
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5894
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6177
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6292
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6398
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6592
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6693
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6896
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7191
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7279
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7417
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7428
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7613
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7688
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7911
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8205
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8229
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8353
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8420
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8768
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8817
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8883
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9009
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9119
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9156
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9481
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9615
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9790
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9816
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9906
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9947
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.020
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.027
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.043
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.062
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
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1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999
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0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998
1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998
0.99996 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997
1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
1.00001 0.99996 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001
1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 76680 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 0.99995 1.00003 1.00001
1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999
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0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998
1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998
0.99996 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997
1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
1.00001 0.99996 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001
1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2608010940541938707.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2608010940541938707.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2608010940541938707.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2608010940541938707.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 4260
First residue number = 1
Last residue number = 1065
Number of atoms found = 4260
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8367E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.3420E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6366E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5393E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6151E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2520E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8145E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.0365E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.3412E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9484E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.3175E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9209E-02
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.062
Bfactors> 106 vectors, 12780 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.001837
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 4.645 +/- 26.67
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -4.645
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2608010940541938707.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2608010940541938707.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.654
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.82
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.83
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.82
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.74
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.34
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.86
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.9
Chkmod> 106 vectors, 12780 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4260 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7661
0.0034 0.9139
0.0034 0.8445
0.0034 0.8568
0.0034 0.7760
0.0034 0.8071
4.6537 0.0093
10.4953 0.0461
13.8915 0.0350
17.3035 0.3031
17.5598 0.5091
19.5818 0.1082
21.2078 0.2985
21.8162 0.3689
22.6246 0.2730
24.1551 0.2772
25.0398 0.2171
26.4223 0.3796
27.2401 0.3294
27.9551 0.3840
29.3700 0.1804
30.4786 0.5724
31.1277 0.4238
33.1663 0.4981
33.5195 0.1857
34.7817 0.3736
36.1122 0.4383
37.0152 0.3047
37.5842 0.4214
38.2527 0.2603
38.8036 0.3513
40.4695 0.4753
41.1342 0.3613
43.7996 0.3629
45.5288 0.4460
45.9413 0.3564
47.5059 0.5828
48.3668 0.5999
49.4636 0.3957
50.4081 0.3034
52.2120 0.4278
52.8517 0.4171
52.9298 0.3232
55.1873 0.4944
55.7611 0.4643
57.2016 0.3168
57.2531 0.4438
59.0576 0.3450
60.8473 0.4650
60.9828 0.2799
61.9801 0.5579
62.6236 0.5152
63.5580 0.3783
64.7709 0.5143
65.7196 0.3053
66.0596 0.3538
67.8298 0.4033
68.8306 0.5643
70.1877 0.5618
70.7482 0.5230
72.1673 0.4975
73.2860 0.3812
74.1576 0.2744
74.8225 0.5698
76.1269 0.4299
77.4856 0.3206
78.7385 0.4144
79.6245 0.3253
81.3241 0.3453
81.4617 0.3398
82.2181 0.2997
82.8823 0.5033
83.3646 0.4494
85.3425 0.5392
86.1333 0.2710
86.8558 0.3864
88.1628 0.3246
88.8356 0.4816
90.1727 0.3852
92.0813 0.4434
92.6430 0.3431
93.5170 0.2903
93.5864 0.4306
94.7446 0.3340
95.2102 0.4305
96.5811 0.3536
98.3594 0.5032
98.5032 0.2297
99.2425 0.4726
99.6398 0.4721
101.6780 0.3016
101.9617 0.4514
102.3426 0.4438
103.0659 0.4724
103.6932 0.4763
103.9033 0.4765
105.7313 0.4707
106.4759 0.3280
107.4405 0.5073
107.5831 0.4750
108.0751 0.4017
108.2986 0.4496
109.6672 0.4218
110.0429 0.4923
110.8967 0.4608
111.9023 0.4837
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2608010940541938707.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2608010940541938707.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2608010940541938707.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2608010940541938707.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2608010940541938707.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2608010940541938707.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.654
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.9
Projmod> 106 vectors, 12780 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 4260
First residue number = 1
Last residue number = 1065
Number of atoms found = 4260
Mean number per residue = 1.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 4260
First residue number = 1
Last residue number = 1065
Number of atoms found = 4260
Mean number per residue = 1.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 4260 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 10.00
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0018
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0002
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0001
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0002
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0010
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0038
Vector: 7 F= 4.65 Cos= 0.071 Sum= 0.005 q= 46.6448
Vector: 8 F= 10.50 Cos= 0.186 Sum= 0.040 q= 121.5088
Vector: 9 F= 13.89 Cos= -0.053 Sum= 0.043 q= -34.8763
Vector: 10 F= 17.30 Cos= -0.234 Sum= 0.097 q= -152.3750
Vector: 11 F= 17.56 Cos= -0.056 Sum= 0.100 q= -36.7131
Vector: 12 F= 19.58 Cos= -0.103 Sum= 0.111 q= -67.4526
Vector: 13 F= 21.21 Cos= 0.034 Sum= 0.112 q= 21.9752
Vector: 14 F= 21.82 Cos= 0.035 Sum= 0.113 q= 22.6970
Vector: 15 F= 22.62 Cos= 0.087 Sum= 0.121 q= 56.9063
Vector: 16 F= 24.16 Cos= -0.082 Sum= 0.128 q= -53.1769
Vector: 17 F= 25.04 Cos= -0.052 Sum= 0.130 q= -34.1524
Vector: 18 F= 26.42 Cos= 0.007 Sum= 0.130 q= 4.2912
Vector: 19 F= 27.24 Cos= 0.110 Sum= 0.143 q= 71.9362
Vector: 20 F= 27.96 Cos= 0.087 Sum= 0.150 q= 56.5778
Vector: 21 F= 29.37 Cos= 0.032 Sum= 0.151 q= 21.0214
Vector: 22 F= 30.48 Cos= 0.062 Sum= 0.155 q= 40.7433
Vector: 23 F= 31.13 Cos= 0.050 Sum= 0.158 q= 32.8802
Vector: 24 F= 33.17 Cos= -0.053 Sum= 0.160 q= -34.4841
Vector: 25 F= 33.52 Cos= 0.090 Sum= 0.169 q= 58.8454
Vector: 26 F= 34.78 Cos= 0.002 Sum= 0.169 q= 1.3096
Vector: 27 F= 36.11 Cos= -0.076 Sum= 0.174 q= -49.7610
Vector: 28 F= 37.02 Cos= -0.032 Sum= 0.175 q= -20.8458
Vector: 29 F= 37.58 Cos= -0.097 Sum= 0.185 q= -63.3732
Vector: 30 F= 38.25 Cos= -0.155 Sum= 0.209 q= -100.8248
Vector: 31 F= 38.80 Cos= 0.002 Sum= 0.209 q= 1.1454
Vector: 32 F= 40.47 Cos= -0.055 Sum= 0.212 q= -35.5931
Vector: 33 F= 41.13 Cos= 0.080 Sum= 0.218 q= 52.3275
Vector: 34 F= 43.80 Cos= -0.033 Sum= 0.219 q= -21.7897
Vector: 35 F= 45.53 Cos= 0.069 Sum= 0.224 q= 44.9004
Vector: 36 F= 45.94 Cos= -0.065 Sum= 0.228 q= -42.2694
Vector: 37 F= 47.51 Cos= 0.015 Sum= 0.228 q= 9.4967
Vector: 38 F= 48.37 Cos= -0.034 Sum= 0.230 q= -21.9496
Vector: 39 F= 49.46 Cos= 0.022 Sum= 0.230 q= 14.6445
Vector: 40 F= 50.41 Cos= -0.046 Sum= 0.232 q= -30.2491
Vector: 41 F= 52.21 Cos= 0.033 Sum= 0.233 q= 21.4751
Vector: 42 F= 52.85 Cos= 0.080 Sum= 0.240 q= 52.0828
Vector: 43 F= 52.93 Cos= 0.086 Sum= 0.247 q= 55.9403
Vector: 44 F= 55.19 Cos= 0.007 Sum= 0.247 q= 4.6669
Vector: 45 F= 55.76 Cos= -0.017 Sum= 0.247 q= -11.1601
Vector: 46 F= 57.20 Cos= -0.043 Sum= 0.249 q= -28.2534
Vector: 47 F= 57.25 Cos= 0.047 Sum= 0.251 q= 30.4666
Vector: 48 F= 59.06 Cos= -0.124 Sum= 0.267 q= -80.7202
Vector: 49 F= 60.85 Cos= 0.018 Sum= 0.267 q= 11.7480
Vector: 50 F= 60.98 Cos= 0.027 Sum= 0.268 q= 17.7484
Vector: 51 F= 61.98 Cos= 0.069 Sum= 0.273 q= 44.9848
Vector: 52 F= 62.62 Cos= 0.011 Sum= 0.273 q= 7.0282
Vector: 53 F= 63.56 Cos= 0.086 Sum= 0.280 q= 56.0646
Vector: 54 F= 64.77 Cos= -0.054 Sum= 0.283 q= -34.9729
Vector: 55 F= 65.72 Cos= -0.033 Sum= 0.284 q= -21.4451
Vector: 56 F= 66.06 Cos= 0.023 Sum= 0.284 q= 15.0433
Vector: 57 F= 67.83 Cos= -0.068 Sum= 0.289 q= -44.5375
Vector: 58 F= 68.83 Cos= -0.014 Sum= 0.289 q= -8.9064
Vector: 59 F= 70.19 Cos= -0.037 Sum= 0.291 q= -23.9402
Vector: 60 F= 70.75 Cos= -0.001 Sum= 0.291 q= -0.6466
Vector: 61 F= 72.17 Cos= -0.123 Sum= 0.306 q= -80.0429
Vector: 62 F= 73.29 Cos= 0.012 Sum= 0.306 q= 7.5564
Vector: 63 F= 74.16 Cos= -0.006 Sum= 0.306 q= -3.7193
Vector: 64 F= 74.82 Cos= 0.065 Sum= 0.310 q= 42.7190
Vector: 65 F= 76.13 Cos= 0.063 Sum= 0.314 q= 40.8836
Vector: 66 F= 77.49 Cos= -0.053 Sum= 0.317 q= -34.3320
Vector: 67 F= 78.74 Cos= 0.015 Sum= 0.317 q= 10.0742
Vector: 68 F= 79.62 Cos= -0.022 Sum= 0.318 q= -14.4033
Vector: 69 F= 81.32 Cos= 0.013 Sum= 0.318 q= 8.7348
Vector: 70 F= 81.46 Cos= -0.012 Sum= 0.318 q= -7.9059
Vector: 71 F= 82.22 Cos= 0.028 Sum= 0.319 q= 18.5664
Vector: 72 F= 82.88 Cos= -0.061 Sum= 0.323 q= -40.1148
Vector: 73 F= 83.36 Cos= -0.001 Sum= 0.323 q= -0.3336
Vector: 74 F= 85.34 Cos= 0.027 Sum= 0.323 q= 17.5523
Vector: 75 F= 86.13 Cos= 0.029 Sum= 0.324 q= 19.0197
Vector: 76 F= 86.86 Cos= -0.065 Sum= 0.328 q= -42.4168
Vector: 77 F= 88.16 Cos= -0.022 Sum= 0.329 q= -14.5433
Vector: 78 F= 88.84 Cos= 0.030 Sum= 0.330 q= 19.8960
Vector: 79 F= 90.17 Cos= 0.038 Sum= 0.331 q= 25.0204
Vector: 80 F= 92.08 Cos= 0.014 Sum= 0.331 q= 9.0823
Vector: 81 F= 92.64 Cos= -0.004 Sum= 0.331 q= -2.7343
Vector: 82 F= 93.52 Cos= 0.008 Sum= 0.332 q= 5.3355
Vector: 83 F= 93.59 Cos= 0.014 Sum= 0.332 q= 9.4473
Vector: 84 F= 94.74 Cos= -0.042 Sum= 0.334 q= -27.6761
Vector: 85 F= 95.21 Cos= 0.072 Sum= 0.339 q= 46.9296
Vector: 86 F= 96.58 Cos= 0.018 Sum= 0.339 q= 11.6389
Vector: 87 F= 98.36 Cos= -0.048 Sum= 0.341 q= -31.4299
Vector: 88 F= 98.50 Cos= -0.009 Sum= 0.341 q= -6.1554
Vector: 89 F= 99.24 Cos= 0.024 Sum= 0.342 q= 15.4857
Vector: 90 F= 99.64 Cos= 0.023 Sum= 0.343 q= 14.7575
Vector: 91 F= 101.68 Cos= -0.010 Sum= 0.343 q= -6.4857
Vector: 92 F= 101.96 Cos= 0.020 Sum= 0.343 q= 13.2949
Vector: 93 F= 102.34 Cos= 0.002 Sum= 0.343 q= 1.3465
Vector: 94 F= 103.07 Cos= 0.003 Sum= 0.343 q= 1.9820
Vector: 95 F= 103.69 Cos= 0.024 Sum= 0.344 q= 15.5234
Vector: 96 F= 103.90 Cos= 0.058 Sum= 0.347 q= 37.9171
Vector: 97 F= 105.73 Cos= -0.094 Sum= 0.356 q= -61.4184
Vector: 98 F= 106.48 Cos= 0.026 Sum= 0.357 q= 16.8906
Vector: 99 F= 107.44 Cos= -0.032 Sum= 0.358 q= -20.6362
Vector: 100 F= 107.58 Cos= -0.042 Sum= 0.359 q= -27.5549
Vector: 101 F= 108.08 Cos= 0.037 Sum= 0.361 q= 23.8418
Vector: 102 F= 108.30 Cos= 0.015 Sum= 0.361 q= 10.0437
Vector: 103 F= 109.67 Cos= 0.038 Sum= 0.362 q= 25.0671
Vector: 104 F= 110.04 Cos= -0.011 Sum= 0.362 q= -6.9889
Vector: 105 F= 110.90 Cos= 0.061 Sum= 0.366 q= 39.6171
Vector: 106 F= 111.90 Cos= 0.024 Sum= 0.367 q= 15.4865
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003434
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 4.653672
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.23 for mode 10 with F= 17.30 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.055 0.113 0.156 0.185 0.208 0.367
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2608010940541938707 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
making animated gifs
11 models are in 2608010940541938707.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608010940541938707.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608010940541938707.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 1065 8.898 497 1.631
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 1065 8.899 497 1.631
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 1065 8.899 497 1.631
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 1065 8.899 497 1.631
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 1065 8.900 497 1.631
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 1065 8.900 497 1.632
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 1065 8.901 497 1.632
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 1065 8.901 497 1.632
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 1065 8.902 497 1.632
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 1065 8.902 497 1.632
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 1065 8.902 497 1.633
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2608010940541938707 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
making animated gifs
11 models are in 2608010940541938707.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608010940541938707.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608010940541938707.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 1065 8.911 500 1.640
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 1065 8.909 499 1.636
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 1065 8.907 499 1.637
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 1065 8.904 499 1.638
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 1065 8.902 497 1.631
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 1065 8.900 497 1.632
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 1065 8.898 497 1.632
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 1065 8.896 496 1.629
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 1065 8.895 496 1.630
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 1065 8.893 496 1.631
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 1065 8.891 496 1.632
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2608010940541938707 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
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2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
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2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
making animated gifs
11 models are in 2608010940541938707.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608010940541938707.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608010940541938707.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 1065 8.901 501 1.662
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 1065 8.900 498 1.646
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 1065 8.899 499 1.646
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 1065 8.899 498 1.637
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 1065 8.899 497 1.634
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 1065 8.900 497 1.632
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 1065 8.902 496 1.625
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 1065 8.904 497 1.626
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 1065 8.906 496 1.620
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 1065 8.909 497 1.622
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 1065 8.913 497 1.620
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2608010940541938707 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
making animated gifs
11 models are in 2608010940541938707.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608010940541938707.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608010940541938707.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 1065 8.881 498 1.615
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 1065 8.877 501 1.630
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 1065 8.876 498 1.619
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 1065 8.880 497 1.617
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 1065 8.888 497 1.622
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 1065 8.900 497 1.632
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 1065 8.917 500 1.655
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 1065 8.938 498 1.654
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 1065 8.963 497 1.657
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 1065 8.992 497 1.663
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 1065 9.025 494 1.659
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2608010940541938707 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608010940541938707.eigenfacs
2608010940541938707.atom
making animated gifs
11 models are in 2608010940541938707.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608010940541938707.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608010940541938707.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 1065 8.827 514 1.654
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 1065 8.838 511 1.638
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 1065 8.851 508 1.639
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 1065 8.866 501 1.646
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 1065 8.882 498 1.624
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 1065 8.900 497 1.632
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 1065 8.920 494 1.631
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 1065 8.942 492 1.638
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 1065 8.965 489 1.643
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 1065 8.990 487 1.654
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 1065 9.017 481 1.637
2608010940541938707.10.pdb
2608010940541938707.11.pdb
2608010940541938707.7.pdb
2608010940541938707.8.pdb
2608010940541938707.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m34.661s
user 0m34.523s
sys 0m0.117s
rm: cannot remove '2608010940541938707.sdijf': No such file or directory
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