*** IMMUNE SYSTEM 08-OCT-20 7AMA ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2608031210382337882.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2608031210382337882.atom to be opened.
Openam> File opened: 2608031210382337882.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 197
First residue number = 19
Last residue number = 127
Number of atoms found = 3220
Mean number per residue = 16.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -20.404003 +/- 12.810060 From: -48.648000 To: 8.053000
= -13.891214 +/- 8.281895 From: -33.890000 To: 6.809000
= -11.422421 +/- 11.843444 From: -38.841000 To: 15.623000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.7070 % Filled.
Pdbmat> 2196418 non-zero elements.
Pdbmat> 241942 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 150.27 +/- 45.62
Maximum number = 253
Minimum number = 35
Pdbmat> Matrix trace = 4.838840E+06
Pdbmat> Larger element = 921.178
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
197 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2608031210382337882.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2608031210382337882.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2608031210382337882.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3220 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 197 residues.
Blocpdb> 15 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 24 atoms in block 2
Block first atom: 16
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 40
Blocpdb> 16 atoms in block 4
Block first atom: 54
Blocpdb> 17 atoms in block 5
Block first atom: 70
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 87
Blocpdb> 14 atoms in block 7
Block first atom: 103
Blocpdb> 19 atoms in block 8
Block first atom: 117
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 136
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 150
Blocpdb> 18 atoms in block 11
Block first atom: 169
Blocpdb> 12 atoms in block 12
Block first atom: 187
Blocpdb> 11 atoms in block 13
Block first atom: 199
Blocpdb> 12 atoms in block 14
Block first atom: 210
Blocpdb> 21 atoms in block 15
Block first atom: 222
Blocpdb> 21 atoms in block 16
Block first atom: 243
Blocpdb> 14 atoms in block 17
Block first atom: 264
Blocpdb> 24 atoms in block 18
Block first atom: 278
Blocpdb> 11 atoms in block 19
Block first atom: 302
Blocpdb> 14 atoms in block 20
Block first atom: 313
Blocpdb> 11 atoms in block 21
Block first atom: 327
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 338
Blocpdb> 24 atoms in block 23
Block first atom: 352
Blocpdb> 14 atoms in block 24
Block first atom: 376
Blocpdb> 19 atoms in block 25
Block first atom: 390
Blocpdb> 17 atoms in block 26
Block first atom: 409
Blocpdb> 24 atoms in block 27
Block first atom: 426
Blocpdb> 14 atoms in block 28
Block first atom: 450
Blocpdb> 15 atoms in block 29
Block first atom: 464
Blocpdb> 12 atoms in block 30
Block first atom: 479
Blocpdb> 14 atoms in block 31
Block first atom: 491
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 505
Blocpdb> 24 atoms in block 33
Block first atom: 520
Blocpdb> 21 atoms in block 34
Block first atom: 544
Blocpdb> 14 atoms in block 35
Block first atom: 565
Blocpdb> 11 atoms in block 36
Block first atom: 579
Blocpdb> 16 atoms in block 37
Block first atom: 590
Blocpdb> 19 atoms in block 38
Block first atom: 606
Blocpdb> 24 atoms in block 39
Block first atom: 625
Blocpdb> 15 atoms in block 40
Block first atom: 649
Blocpdb> 10 atoms in block 41
Block first atom: 664
Blocpdb> 22 atoms in block 42
Block first atom: 674
Blocpdb> 10 atoms in block 43
Block first atom: 696
Blocpdb> 24 atoms in block 44
Block first atom: 706
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 730
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 747
Blocpdb> 7 atoms in block 47
Block first atom: 766
Blocpdb> 10 atoms in block 48
Block first atom: 773
Blocpdb> 19 atoms in block 49
Block first atom: 783
Blocpdb> 14 atoms in block 50
Block first atom: 802
Blocpdb> 10 atoms in block 51
Block first atom: 816
Blocpdb> 12 atoms in block 52
Block first atom: 826
Blocpdb> 7 atoms in block 53
Block first atom: 838
Blocpdb> 14 atoms in block 54
Block first atom: 845
Blocpdb> 16 atoms in block 55
Block first atom: 859
Blocpdb> 12 atoms in block 56
Block first atom: 875
Blocpdb> 21 atoms in block 57
Block first atom: 887
Blocpdb> 17 atoms in block 58
Block first atom: 908
Blocpdb> 17 atoms in block 59
Block first atom: 925
Blocpdb> 14 atoms in block 60
Block first atom: 942
Blocpdb> 11 atoms in block 61
Block first atom: 956
Blocpdb> 16 atoms in block 62
Block first atom: 967
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 983
Blocpdb> 19 atoms in block 64
Block first atom: 997
Blocpdb> 17 atoms in block 65
Block first atom: 1016
Blocpdb> 30 atoms in block 66
Block first atom: 1033
Blocpdb> 15 atoms in block 67
Block first atom: 1063
Blocpdb> 19 atoms in block 68
Block first atom: 1078
Blocpdb> 19 atoms in block 69
Block first atom: 1097
Blocpdb> 16 atoms in block 70
Block first atom: 1116
Blocpdb> 19 atoms in block 71
Block first atom: 1132
Blocpdb> 24 atoms in block 72
Block first atom: 1151
Blocpdb> 24 atoms in block 73
Block first atom: 1175
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1199
Blocpdb> 14 atoms in block 75
Block first atom: 1214
Blocpdb> 14 atoms in block 76
Block first atom: 1228
Blocpdb> 17 atoms in block 77
Block first atom: 1242
Blocpdb> 11 atoms in block 78
Block first atom: 1259
Blocpdb> 14 atoms in block 79
Block first atom: 1270
Blocpdb> 28 atoms in block 80
Block first atom: 1284
Blocpdb> 11 atoms in block 81
Block first atom: 1312
Blocpdb> 20 atoms in block 82
Block first atom: 1323
Blocpdb> 24 atoms in block 83
Block first atom: 1343
Blocpdb> 19 atoms in block 84
Block first atom: 1367
Blocpdb> 15 atoms in block 85
Block first atom: 1386
Blocpdb> 22 atoms in block 86
Block first atom: 1401
Blocpdb> 19 atoms in block 87
Block first atom: 1423
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 1442
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1461
Blocpdb> 11 atoms in block 90
Block first atom: 1477
Blocpdb> 16 atoms in block 91
Block first atom: 1488
Blocpdb> 7 atoms in block 92
Block first atom: 1504
Blocpdb> 10 atoms in block 93
Block first atom: 1511
Blocpdb> 14 atoms in block 94
Block first atom: 1521
Blocpdb> 10 atoms in block 95
Block first atom: 1535
Blocpdb> 16 atoms in block 96
Block first atom: 1545
Blocpdb> 14 atoms in block 97
Block first atom: 1561
Blocpdb> 14 atoms in block 98
Block first atom: 1575
Blocpdb> 20 atoms in block 99
Block first atom: 1589
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1609
Blocpdb> 24 atoms in block 101
Block first atom: 1624
Blocpdb> 14 atoms in block 102
Block first atom: 1648
Blocpdb> 16 atoms in block 103
Block first atom: 1662
Blocpdb> 17 atoms in block 104
Block first atom: 1678
Blocpdb> 16 atoms in block 105
Block first atom: 1695
Blocpdb> 14 atoms in block 106
Block first atom: 1711
Blocpdb> 19 atoms in block 107
Block first atom: 1725
Blocpdb> 14 atoms in block 108
Block first atom: 1744
Blocpdb> 19 atoms in block 109
Block first atom: 1758
Blocpdb> 18 atoms in block 110
Block first atom: 1777
Blocpdb> 12 atoms in block 111
Block first atom: 1795
Blocpdb> 12 atoms in block 112
Block first atom: 1807
Blocpdb> 42 atoms in block 113
Block first atom: 1819
Blocpdb> 21 atoms in block 114
Block first atom: 1861
Blocpdb> 14 atoms in block 115
Block first atom: 1882
Blocpdb> 24 atoms in block 116
Block first atom: 1896
Blocpdb> 11 atoms in block 117
Block first atom: 1920
Blocpdb> 14 atoms in block 118
Block first atom: 1931
Blocpdb> 11 atoms in block 119
Block first atom: 1945
Blocpdb> 14 atoms in block 120
Block first atom: 1956
Blocpdb> 24 atoms in block 121
Block first atom: 1970
Blocpdb> 14 atoms in block 122
Block first atom: 1994
Blocpdb> 19 atoms in block 123
Block first atom: 2008
Blocpdb> 17 atoms in block 124
Block first atom: 2027
Blocpdb> 24 atoms in block 125
Block first atom: 2044
Blocpdb> 14 atoms in block 126
Block first atom: 2068
Blocpdb> 15 atoms in block 127
Block first atom: 2082
Blocpdb> 12 atoms in block 128
Block first atom: 2097
Blocpdb> 14 atoms in block 129
Block first atom: 2109
Blocpdb> 15 atoms in block 130
Block first atom: 2123
Blocpdb> 24 atoms in block 131
Block first atom: 2138
Blocpdb> 21 atoms in block 132
Block first atom: 2162
Blocpdb> 14 atoms in block 133
Block first atom: 2183
Blocpdb> 11 atoms in block 134
Block first atom: 2197
Blocpdb> 16 atoms in block 135
Block first atom: 2208
Blocpdb> 19 atoms in block 136
Block first atom: 2224
Blocpdb> 24 atoms in block 137
Block first atom: 2243
Blocpdb> 15 atoms in block 138
Block first atom: 2267
Blocpdb> 10 atoms in block 139
Block first atom: 2282
Blocpdb> 22 atoms in block 140
Block first atom: 2292
Blocpdb> 10 atoms in block 141
Block first atom: 2314
Blocpdb> 24 atoms in block 142
Block first atom: 2324
Blocpdb> 17 atoms in block 143
Block first atom: 2348
Blocpdb> 19 atoms in block 144
Block first atom: 2365
Blocpdb> 7 atoms in block 145
Block first atom: 2384
Blocpdb> 10 atoms in block 146
Block first atom: 2391
Blocpdb> 19 atoms in block 147
Block first atom: 2401
Blocpdb> 14 atoms in block 148
Block first atom: 2420
Blocpdb> 10 atoms in block 149
Block first atom: 2434
Blocpdb> 12 atoms in block 150
Block first atom: 2444
Blocpdb> 7 atoms in block 151
Block first atom: 2456
Blocpdb> 14 atoms in block 152
Block first atom: 2463
Blocpdb> 16 atoms in block 153
Block first atom: 2477
Blocpdb> 12 atoms in block 154
Block first atom: 2493
Blocpdb> 21 atoms in block 155
Block first atom: 2505
Blocpdb> 17 atoms in block 156
Block first atom: 2526
Blocpdb> 17 atoms in block 157
Block first atom: 2543
Blocpdb> 14 atoms in block 158
Block first atom: 2560
Blocpdb> 11 atoms in block 159
Block first atom: 2574
Blocpdb> 16 atoms in block 160
Block first atom: 2585
Blocpdb> 14 atoms in block 161
Block first atom: 2601
Blocpdb> 19 atoms in block 162
Block first atom: 2615
Blocpdb> 17 atoms in block 163
Block first atom: 2634
Blocpdb> 17 atoms in block 164
Block first atom: 2651
Blocpdb> 15 atoms in block 165
Block first atom: 2668
Blocpdb> 19 atoms in block 166
Block first atom: 2683
Blocpdb> 19 atoms in block 167
Block first atom: 2702
Blocpdb> 16 atoms in block 168
Block first atom: 2721
Blocpdb> 19 atoms in block 169
Block first atom: 2737
Blocpdb> 24 atoms in block 170
Block first atom: 2756
Blocpdb> 24 atoms in block 171
Block first atom: 2780
Blocpdb> 15 atoms in block 172
Block first atom: 2804
Blocpdb> 14 atoms in block 173
Block first atom: 2819
Blocpdb> 14 atoms in block 174
Block first atom: 2833
Blocpdb> 17 atoms in block 175
Block first atom: 2847
Blocpdb> 11 atoms in block 176
Block first atom: 2864
Blocpdb> 14 atoms in block 177
Block first atom: 2875
Blocpdb> 28 atoms in block 178
Block first atom: 2889
Blocpdb> 11 atoms in block 179
Block first atom: 2917
Blocpdb> 20 atoms in block 180
Block first atom: 2928
Blocpdb> 24 atoms in block 181
Block first atom: 2948
Blocpdb> 19 atoms in block 182
Block first atom: 2972
Blocpdb> 15 atoms in block 183
Block first atom: 2991
Blocpdb> 22 atoms in block 184
Block first atom: 3006
Blocpdb> 19 atoms in block 185
Block first atom: 3028
Blocpdb> 19 atoms in block 186
Block first atom: 3047
Blocpdb> 16 atoms in block 187
Block first atom: 3066
Blocpdb> 18 atoms in block 188
Block first atom: 3082
Blocpdb> 16 atoms in block 189
Block first atom: 3100
Blocpdb> 7 atoms in block 190
Block first atom: 3116
Blocpdb> 10 atoms in block 191
Block first atom: 3123
Blocpdb> 14 atoms in block 192
Block first atom: 3133
Blocpdb> 10 atoms in block 193
Block first atom: 3147
Blocpdb> 16 atoms in block 194
Block first atom: 3157
Blocpdb> 14 atoms in block 195
Block first atom: 3173
Blocpdb> 14 atoms in block 196
Block first atom: 3187
Blocpdb> 20 atoms in block 197
Block first atom: 3200
Blocpdb> 197 blocks.
Blocpdb> At most, 42 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2196615 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 9660
Prepmat> Matrix trace = 4838840.0000
Prepmat> Last element read: 9660 9660 277.8483
Prepmat> 19504 lines saved.
Prepmat> 16783 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3220
RTB> Total mass = 3220.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3220
RTB> Number of blocks = 197
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 542150.6395
RTB> 94943 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1182
Diagstd> Nb of non-zero elements: 94943
Diagstd> Projected matrix trace = 542150.6395
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1182 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 542150.6395
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.7503575 3.0927516 6.5648831 13.0768224
13.7159274 13.9678381 14.3938623 14.7232076 17.0933442
18.5513311 22.2133472 24.6623543 25.0150247 26.2760960
28.3804872 30.8606290 33.3559346 34.9301382 37.6680970
39.2598899 40.0903299 40.8865408 42.6222443 43.4022354
45.3912299 47.6785607 47.9951614 49.3463939 50.6964107
51.9568926 52.1688038 53.2510936 55.9167053 57.2298233
57.3848480 59.5278731 60.8748464 61.2551496 62.0536412
62.5960008 64.7547962 66.4107422 69.8381152 71.0248981
72.6384534 73.6345447 74.4344838 75.1814229 76.5298756
78.5462627 79.3242112 81.7163343 81.8873922 83.7649444
85.0047812 87.0505440 88.1721927 88.2591024 90.9700820
93.8724148 96.3149091 98.0588557 98.3469779 100.5065344
101.4977989 102.0375554 104.5200638 105.1027965 106.4260008
107.5960622 109.4198697 110.6219361 111.0042184 113.0549630
114.1842427 117.9368771 118.6656589 120.4031188 122.6375016
123.6757496 124.1732594 125.1900801 125.9724838 127.3801558
129.1425993 130.7175712 132.3656578 135.1393422 135.8956420
136.2322613 137.1546265 137.4805989 138.7602735 139.3208325
140.2168184 141.0986652 141.3292221 142.3231791 144.5909971
145.1293660
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034304 0.0034314 0.0034315 0.0034328 0.0034345
0.0034371 180.0901058 190.9711678 278.2330906 392.6868818
402.1683306 405.8446977 411.9874168 416.6740928 448.9611891
467.7166372 511.8023581 539.2778055 543.1199406 556.6416524
578.5024510 603.2504670 627.1650335 641.7936744 666.4723250
680.4086390 687.5671120 694.3612316 708.9464581 715.4039429
731.6127328 749.8197040 752.3051044 762.8216153 773.1858304
782.7388049 784.3334182 792.4275134 812.0187682 821.4979476
822.6098358 837.8291434 847.2551539 849.8975606 855.4190458
859.1491682 873.8386522 884.9412657 907.4893467 915.1675021
925.5045848 931.8287014 936.8765546 941.5655295 949.9719541
962.4053824 967.1596318 981.6342851 982.6611826 993.8627933
1001.1910468 1013.1669747 1019.6734251 1020.1758381 1035.7252721
1052.1175747 1065.7173588 1075.3223955 1076.9010239 1088.6604092
1094.0157956 1096.9208788 1110.1843817 1113.2748961 1120.2608314
1126.4021454 1135.9085719 1142.1309694 1144.1027299 1154.6227131
1160.3750128 1179.2885776 1182.9266276 1191.5551514 1202.5604799
1207.6401846 1210.0667308 1215.0110817 1218.8019110 1225.5927072
1234.0422869 1241.5444282 1249.3466062 1262.3685917 1265.8960511
1267.4629205 1271.7463830 1273.2567520 1279.1687874 1281.7499543
1285.8648790 1289.9020499 1290.9554772 1295.4871164 1305.7676552
1308.1963387
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3220
Rtb_to_modes> Number of blocs = 197
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9794E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9852E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9856E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0018E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.750
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.093
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.565
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 140.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.1
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1182 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002
0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002
0.99997 1.00004 1.00006 0.99995 0.99998
1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998
0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 0.99996
1.00000 1.00003 1.00002 0.99998 0.99997
1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00003
0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000
1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003
1.00003 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001
1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99996
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 57960 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002
0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002
0.99997 1.00004 1.00006 0.99995 0.99998
1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998
0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 0.99996
1.00000 1.00003 1.00002 0.99998 0.99997
1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 1.00001
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00003
0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000
1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003
1.00003 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001
1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99996
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2608031210382337882.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2608031210382337882.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2608031210382337882.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2608031210382337882.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 197
First residue number = 19
Last residue number = 127
Number of atoms found = 3220
Mean number per residue = 16.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9794E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9852E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9856E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0018E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.750
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.093
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.565
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.1
Bfactors> 106 vectors, 9660 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.750000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.458 for 202 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.010 +/- 0.01
Bfactors> = 101.570 +/- 21.51
Bfactors> Shiftng-fct= 101.560
Bfactors> Scaling-fct= 2207.458
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2608031210382337882.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2608031210382337882.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4303E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4369E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 962.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1013.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1052.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1077.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1089.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1094.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1097.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1110.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1113.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1120.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1144.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1155.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1179.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1183.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1191.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1202.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1208.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1210.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1219.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1226.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1234.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1241.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1249.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1262.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1266.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1267.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1272.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1273.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1279.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1282.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1286.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1290.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1291.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1295.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1306.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1308.
Chkmod> 106 vectors, 9660 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3220 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 27 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 28 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7038
0.0034 0.7378
0.0034 0.7392
0.0034 0.9321
0.0034 0.7654
0.0034 0.7459
180.0707 0.6787
190.9706 0.7448
278.2236 0.6702
392.7177 0.5765
402.2108 0.3936
405.8587 0.5387
411.9145 0.4377
416.6108 0.4159
448.8980 0.3322
467.6798 0.1253
511.7418 0.1837
539.2289 0.3386
543.1506 0.4951
556.6591 0.0890
578.4727 0.4678
603.2184 0.4692
627.1763 0.5136
641.7649 0.4785
666.4605 0.1044
680.3804 0.2811
687.5348 0.1253
694.3608 0.0926
708.8974 0.2838
715.3548 0.1094
731.5714 0.2313
749.7988 0.3130
752.3107 0.1738
762.8167 0.3793
773.1800 0.3773
782.7286 0.3464
784.3087 0.1866
792.3854 0.4282
812.0078 0.3198
821.4640 0.2447
822.5398 0.5750
837.8081 0.3723
847.1851 0.4592
849.8947 0.1354
855.3572 0.1829
859.1397 0.3677
873.7688 0.4216
884.8983 0.2788
907.4626 0.5002
915.0967 0.4353
925.4747 0.5647
931.7599 0.4869
936.8081 0.5329
941.5162 0.4847
949.9319 0.4245
962.3870 0.3391
967.0924 0.4756
981.6142 0.3295
982.6346 0.4354
993.7908 0.3946
1001.1199 0.3547
1013.1203 0.2742
1019.6170 0.3884
1020.1372 0.4134
1035.6803 0.4294
1052.0589 0.4606
1065.6445 0.3881
1075.2825 0.4166
1076.8713 0.4005
1088.5783 0.3686
1093.9807 0.2353
1096.6719 0.1528
1110.0302 0.3964
1113.2123 0.3064
1120.0759 0.4441
1126.3744 0.3266
1135.7567 0.4746
1141.9687 0.3674
1144.0319 0.4226
1154.8031 0.3638
1160.4053 0.2314
1179.0536 0.4407
1183.0470 0.3747
1191.4886 0.3363
1202.3250 0.4027
1207.7067 0.4748
1210.1451 0.4590
1215.0071 0.4502
1218.8827 0.4623
1225.6356 0.4150
1233.7858 0.3534
1241.4077 0.3958
1249.4550 0.1759
1262.1306 0.4050
1265.8620 0.1943
1267.2584 0.2872
1271.9021 0.4389
1273.2919 0.2340
1279.2970 0.2982
1281.5991 0.3612
1285.7326 0.2491
1289.8528 0.2933
1290.7666 0.2069
1295.3260 0.3147
1305.7523 0.3088
1308.0078 0.3469
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2608031210382337882 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
making animated gifs
11 models are in 2608031210382337882.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608031210382337882.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608031210382337882.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2608031210382337882 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
making animated gifs
11 models are in 2608031210382337882.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608031210382337882.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608031210382337882.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2608031210382337882 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
making animated gifs
11 models are in 2608031210382337882.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608031210382337882.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608031210382337882.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2608031210382337882 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
making animated gifs
11 models are in 2608031210382337882.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608031210382337882.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608031210382337882.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2608031210382337882 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608031210382337882.eigenfacs
2608031210382337882.atom
making animated gifs
11 models are in 2608031210382337882.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608031210382337882.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608031210382337882.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2608031210382337882.10.pdb
2608031210382337882.11.pdb
2608031210382337882.7.pdb
2608031210382337882.8.pdb
2608031210382337882.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m36.984s
user 0m36.742s
sys 0m0.225s
rm: cannot remove '2608031210382337882.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
