*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2608040528142607898.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2608040528142607898.atom to be opened.
Openam> File opened: 2608040528142607898.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1019
First residue number = 2
Last residue number = 1020
Number of atoms found = 15566
Mean number per residue = 15.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 66.428168 +/- 18.584068 From: 23.318000 To: 122.542000
= 67.499887 +/- 16.390733 From: 18.456000 To: 101.408000
= 73.038557 +/- 23.354882 From: 22.888000 To: 131.838000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is -1.0645 % Filled.
Pdbmat> 11253186 non-zero elements.
Pdbmat> 1240180 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 159.34 +/- 49.92
Maximum number = 254
Minimum number = 21
Pdbmat> Matrix trace = 2.480360E+07
Pdbmat> Larger element = 899.679
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1019 non-zero elements, NRBL set to 6
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2608040528142607898.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 6
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2608040528142607898.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2608040528142607898.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 15566 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 6 residue(s) per block.
Blocpdb> 1019 residues.
Blocpdb> 94 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 79 atoms in block 2
Block first atom: 95
Blocpdb> 92 atoms in block 3
Block first atom: 174
Blocpdb> 100 atoms in block 4
Block first atom: 266
Blocpdb> 79 atoms in block 5
Block first atom: 366
Blocpdb> 96 atoms in block 6
Block first atom: 445
Blocpdb> 131 atoms in block 7
Block first atom: 541
Blocpdb> 87 atoms in block 8
Block first atom: 672
Blocpdb> 101 atoms in block 9
Block first atom: 759
Blocpdb> 87 atoms in block 10
Block first atom: 860
Blocpdb> 105 atoms in block 11
Block first atom: 947
Blocpdb> 82 atoms in block 12
Block first atom: 1052
Blocpdb> 100 atoms in block 13
Block first atom: 1134
Blocpdb> 83 atoms in block 14
Block first atom: 1234
Blocpdb> 84 atoms in block 15
Block first atom: 1317
Blocpdb> 92 atoms in block 16
Block first atom: 1401
Blocpdb> 97 atoms in block 17
Block first atom: 1493
Blocpdb> 100 atoms in block 18
Block first atom: 1590
Blocpdb> 87 atoms in block 19
Block first atom: 1690
Blocpdb> 90 atoms in block 20
Block first atom: 1777
Blocpdb> 77 atoms in block 21
Block first atom: 1867
Blocpdb> 82 atoms in block 22
Block first atom: 1944
Blocpdb> 71 atoms in block 23
Block first atom: 2026
Blocpdb> 88 atoms in block 24
Block first atom: 2097
Blocpdb> 84 atoms in block 25
Block first atom: 2185
Blocpdb> 86 atoms in block 26
Block first atom: 2269
Blocpdb> 95 atoms in block 27
Block first atom: 2355
Blocpdb> 93 atoms in block 28
Block first atom: 2450
Blocpdb> 99 atoms in block 29
Block first atom: 2543
Blocpdb> 98 atoms in block 30
Block first atom: 2642
Blocpdb> 85 atoms in block 31
Block first atom: 2740
Blocpdb> 100 atoms in block 32
Block first atom: 2825
Blocpdb> 59 atoms in block 33
Block first atom: 2925
Blocpdb> 82 atoms in block 34
Block first atom: 2984
Blocpdb> 100 atoms in block 35
Block first atom: 3066
Blocpdb> 95 atoms in block 36
Block first atom: 3166
Blocpdb> 106 atoms in block 37
Block first atom: 3261
Blocpdb> 69 atoms in block 38
Block first atom: 3367
Blocpdb> 109 atoms in block 39
Block first atom: 3436
Blocpdb> 98 atoms in block 40
Block first atom: 3545
Blocpdb> 102 atoms in block 41
Block first atom: 3643
Blocpdb> 93 atoms in block 42
Block first atom: 3745
Blocpdb> 100 atoms in block 43
Block first atom: 3838
Blocpdb> 86 atoms in block 44
Block first atom: 3938
Blocpdb> 94 atoms in block 45
Block first atom: 4024
Blocpdb> 109 atoms in block 46
Block first atom: 4118
Blocpdb> 85 atoms in block 47
Block first atom: 4227
Blocpdb> 83 atoms in block 48
Block first atom: 4312
Blocpdb> 100 atoms in block 49
Block first atom: 4395
Blocpdb> 86 atoms in block 50
Block first atom: 4495
Blocpdb> 95 atoms in block 51
Block first atom: 4581
Blocpdb> 100 atoms in block 52
Block first atom: 4676
Blocpdb> 81 atoms in block 53
Block first atom: 4776
Blocpdb> 73 atoms in block 54
Block first atom: 4857
Blocpdb> 88 atoms in block 55
Block first atom: 4930
Blocpdb> 98 atoms in block 56
Block first atom: 5018
Blocpdb> 69 atoms in block 57
Block first atom: 5116
Blocpdb> 77 atoms in block 58
Block first atom: 5185
Blocpdb> 82 atoms in block 59
Block first atom: 5262
Blocpdb> 113 atoms in block 60
Block first atom: 5344
Blocpdb> 109 atoms in block 61
Block first atom: 5457
Blocpdb> 99 atoms in block 62
Block first atom: 5566
Blocpdb> 96 atoms in block 63
Block first atom: 5665
Blocpdb> 95 atoms in block 64
Block first atom: 5761
Blocpdb> 107 atoms in block 65
Block first atom: 5856
Blocpdb> 106 atoms in block 66
Block first atom: 5963
Blocpdb> 95 atoms in block 67
Block first atom: 6069
Blocpdb> 96 atoms in block 68
Block first atom: 6164
Blocpdb> 97 atoms in block 69
Block first atom: 6260
Blocpdb> 96 atoms in block 70
Block first atom: 6357
Blocpdb> 89 atoms in block 71
Block first atom: 6453
Blocpdb> 96 atoms in block 72
Block first atom: 6542
Blocpdb> 83 atoms in block 73
Block first atom: 6638
Blocpdb> 83 atoms in block 74
Block first atom: 6721
Blocpdb> 104 atoms in block 75
Block first atom: 6804
Blocpdb> 100 atoms in block 76
Block first atom: 6908
Blocpdb> 103 atoms in block 77
Block first atom: 7008
Blocpdb> 88 atoms in block 78
Block first atom: 7111
Blocpdb> 91 atoms in block 79
Block first atom: 7199
Blocpdb> 72 atoms in block 80
Block first atom: 7290
Blocpdb> 82 atoms in block 81
Block first atom: 7362
Blocpdb> 86 atoms in block 82
Block first atom: 7444
Blocpdb> 82 atoms in block 83
Block first atom: 7530
Blocpdb> 114 atoms in block 84
Block first atom: 7612
Blocpdb> 103 atoms in block 85
Block first atom: 7726
Blocpdb> 65 atoms in block 86
Block first atom: 7829
Blocpdb> 103 atoms in block 87
Block first atom: 7894
Blocpdb> 100 atoms in block 88
Block first atom: 7997
Blocpdb> 93 atoms in block 89
Block first atom: 8097
Blocpdb> 90 atoms in block 90
Block first atom: 8190
Blocpdb> 94 atoms in block 91
Block first atom: 8280
Blocpdb> 78 atoms in block 92
Block first atom: 8374
Blocpdb> 77 atoms in block 93
Block first atom: 8452
Blocpdb> 112 atoms in block 94
Block first atom: 8529
Blocpdb> 78 atoms in block 95
Block first atom: 8641
Blocpdb> 100 atoms in block 96
Block first atom: 8719
Blocpdb> 100 atoms in block 97
Block first atom: 8819
Blocpdb> 93 atoms in block 98
Block first atom: 8919
Blocpdb> 97 atoms in block 99
Block first atom: 9012
Blocpdb> 77 atoms in block 100
Block first atom: 9109
Blocpdb> 80 atoms in block 101
Block first atom: 9186
Blocpdb> 105 atoms in block 102
Block first atom: 9266
Blocpdb> 82 atoms in block 103
Block first atom: 9371
Blocpdb> 100 atoms in block 104
Block first atom: 9453
Blocpdb> 92 atoms in block 105
Block first atom: 9553
Blocpdb> 95 atoms in block 106
Block first atom: 9645
Blocpdb> 87 atoms in block 107
Block first atom: 9740
Blocpdb> 94 atoms in block 108
Block first atom: 9827
Blocpdb> 104 atoms in block 109
Block first atom: 9921
Blocpdb> 78 atoms in block 110
Block first atom: 10025
Blocpdb> 85 atoms in block 111
Block first atom: 10103
Blocpdb> 86 atoms in block 112
Block first atom: 10188
Blocpdb> 77 atoms in block 113
Block first atom: 10274
Blocpdb> 71 atoms in block 114
Block first atom: 10351
Blocpdb> 93 atoms in block 115
Block first atom: 10422
Blocpdb> 116 atoms in block 116
Block first atom: 10515
Blocpdb> 100 atoms in block 117
Block first atom: 10631
Blocpdb> 105 atoms in block 118
Block first atom: 10731
Blocpdb> 91 atoms in block 119
Block first atom: 10836
Blocpdb> 87 atoms in block 120
Block first atom: 10927
Blocpdb> 88 atoms in block 121
Block first atom: 11014
Blocpdb> 68 atoms in block 122
Block first atom: 11102
Blocpdb> 79 atoms in block 123
Block first atom: 11170
Blocpdb> 91 atoms in block 124
Block first atom: 11249
Blocpdb> 82 atoms in block 125
Block first atom: 11340
Blocpdb> 76 atoms in block 126
Block first atom: 11422
Blocpdb> 102 atoms in block 127
Block first atom: 11498
Blocpdb> 65 atoms in block 128
Block first atom: 11600
Blocpdb> 105 atoms in block 129
Block first atom: 11665
Blocpdb> 94 atoms in block 130
Block first atom: 11770
Blocpdb> 84 atoms in block 131
Block first atom: 11864
Blocpdb> 96 atoms in block 132
Block first atom: 11948
Blocpdb> 66 atoms in block 133
Block first atom: 12044
Blocpdb> 89 atoms in block 134
Block first atom: 12110
Blocpdb> 75 atoms in block 135
Block first atom: 12199
Blocpdb> 90 atoms in block 136
Block first atom: 12274
Blocpdb> 89 atoms in block 137
Block first atom: 12364
Blocpdb> 96 atoms in block 138
Block first atom: 12453
Blocpdb> 94 atoms in block 139
Block first atom: 12549
Blocpdb> 110 atoms in block 140
Block first atom: 12643
Blocpdb> 96 atoms in block 141
Block first atom: 12753
Blocpdb> 83 atoms in block 142
Block first atom: 12849
Blocpdb> 82 atoms in block 143
Block first atom: 12932
Blocpdb> 98 atoms in block 144
Block first atom: 13014
Blocpdb> 101 atoms in block 145
Block first atom: 13112
Blocpdb> 106 atoms in block 146
Block first atom: 13213
Blocpdb> 92 atoms in block 147
Block first atom: 13319
Blocpdb> 119 atoms in block 148
Block first atom: 13411
Blocpdb> 99 atoms in block 149
Block first atom: 13530
Blocpdb> 111 atoms in block 150
Block first atom: 13629
Blocpdb> 90 atoms in block 151
Block first atom: 13740
Blocpdb> 110 atoms in block 152
Block first atom: 13830
Blocpdb> 107 atoms in block 153
Block first atom: 13940
Blocpdb> 102 atoms in block 154
Block first atom: 14047
Blocpdb> 96 atoms in block 155
Block first atom: 14149
Blocpdb> 82 atoms in block 156
Block first atom: 14245
Blocpdb> 92 atoms in block 157
Block first atom: 14327
Blocpdb> 90 atoms in block 158
Block first atom: 14419
Blocpdb> 90 atoms in block 159
Block first atom: 14509
Blocpdb> 87 atoms in block 160
Block first atom: 14599
Blocpdb> 69 atoms in block 161
Block first atom: 14686
Blocpdb> 104 atoms in block 162
Block first atom: 14755
Blocpdb> 91 atoms in block 163
Block first atom: 14859
Blocpdb> 87 atoms in block 164
Block first atom: 14950
Blocpdb> 76 atoms in block 165
Block first atom: 15037
Blocpdb> 81 atoms in block 166
Block first atom: 15113
Blocpdb> 99 atoms in block 167
Block first atom: 15194
Blocpdb> 96 atoms in block 168
Block first atom: 15293
Blocpdb> 110 atoms in block 169
Block first atom: 15389
Blocpdb> 68 atoms in block 170
Block first atom: 15498
Blocpdb> 170 blocks.
Blocpdb> At most, 131 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 59 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 11253356 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 46698
Prepmat> Matrix trace = 24803600.0000
Prepmat> Last element read: 46698 46698 231.1342
Prepmat> 14536 lines saved.
Prepmat> 12939 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 15566
RTB> Total mass = 15566.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 15566
RTB> Number of blocks = 170
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 369556.3243
RTB> 54906 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1020
Diagstd> Nb of non-zero elements: 54906
Diagstd> Projected matrix trace = 369556.3243
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1020 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 369556.3243
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.6120251 0.7880514 1.3032871 1.6875330
1.8808700 1.9962473 2.4604993 3.7392654 3.9486208
4.5027746 5.0192949 5.7495032 6.1161616 6.8565773
7.3042404 7.7355157 8.0065677 8.5453546 8.9853624
9.3293143 10.1236529 10.8654483 12.6148272 13.0419707
13.8653104 14.6525088 15.9341910 16.4142245 17.3372445
18.7212887 19.9909152 20.3745623 21.2237382 22.1929634
22.4650713 23.2473881 23.4001959 23.7982746 24.7923126
26.4879539 26.6030470 27.6191197 29.1384480 29.7249929
30.7855141 31.8603326 32.2462519 33.2906641 34.0176291
35.1673588 35.9578328 37.6674759 37.8521818 38.6598589
39.4410644 40.2755458 41.4545201 42.0244515 43.6515557
43.9229398 44.9560508 45.7122120 47.1204044 47.9798305
49.3607960 50.4539492 50.8898871 51.0954132 52.3663244
52.7010607 53.3499883 54.0011141 54.9478088 55.5015037
56.1273952 57.8648054 58.8843459 59.1984687 59.4270856
60.3722260 61.5864266 61.9776482 63.1334528 64.7738139
65.6449107 66.0369445 67.0449097 67.3879884 68.2259430
68.6863541 69.3999723 69.9191060 72.6879172 73.0340463
73.9229442 74.9336909 75.9847397 76.3892571 77.0248585
77.9707355
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034292 0.0034295 0.0034324 0.0034327 0.0034347
0.0034350 84.9532307 96.3990064 123.9696391 141.0656982
148.9274228 153.4272339 170.3361816 209.9850748 215.7833821
230.4280708 243.2857308 260.3816894 268.5559366 284.3472086
293.4829049 302.0229300 307.2688044 317.4390301 325.5090588
331.6806554 345.5126117 357.9473115 385.6878282 392.1632477
404.3524495 415.6724824 433.4712409 439.9521703 452.1528971
469.8542400 485.5250248 490.1617576 500.2720274 511.5674796
514.6940894 523.5791740 525.2971292 529.7464026 540.6968005
558.8811810 560.0940655 570.6899127 586.1766145 592.0469662
602.5158629 612.9434841 616.6445559 626.5511185 633.3551428
643.9692890 651.1664774 666.4668303 668.0988730 675.1890846
681.9767890 689.1535497 699.1674899 703.9572843 717.4557873
719.6825626 728.0971932 734.1949599 745.4178438 752.1849420
762.9329245 771.3346887 774.6598084 776.2225194 785.8168303
788.3243809 793.1629963 797.9885136 804.9529004 808.9983857
813.5471430 826.0427591 833.2881538 835.5078156 837.1195732
843.7501733 852.1926484 854.8950975 862.8296309 873.9669605
879.8240133 882.4472733 889.1564542 891.4285236 896.9537579
899.9751386 904.6382128 908.0153988 925.8196465 928.0213371
933.6517339 940.0129626 946.5824978 949.0987984 953.0391356
958.8730128
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 15566
Rtb_to_modes> Number of blocs = 170
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9722E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9742E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9910E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6120
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7881
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.303
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.688
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.881
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.996
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.460
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.739
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.949
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.503
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.019
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.750
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.116
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.857
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.304
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.736
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.007
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.545
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.985
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.329
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.97
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00005
1.00003 0.99996 1.00003 1.00001 1.00002
1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998
0.99997 1.00004 1.00002 0.99996 0.99999
1.00003 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001
0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002
0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00004
0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00004
1.00001 1.00002 0.99999 1.00003 0.99999
0.99998 0.99996 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
0.99999 1.00004 1.00000 1.00002 1.00001
0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999
0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002
1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002
1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99998
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 280188 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00005
1.00003 0.99996 1.00003 1.00001 1.00002
1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998
0.99997 1.00004 1.00002 0.99996 0.99999
1.00003 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001
0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002
0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00004
0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00004
1.00001 1.00002 0.99999 1.00003 0.99999
0.99998 0.99996 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
0.99999 1.00004 1.00000 1.00002 1.00001
0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999
0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002
1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002
1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99998
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2608040528142607898.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2608040528142607898.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2608040528142607898.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2608040528142607898.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1019
First residue number = 2
Last residue number = 1020
Number of atoms found = 15566
Mean number per residue = 15.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9722E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9742E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9910E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6120
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.303
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.688
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.996
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.460
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.739
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.949
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.503
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.019
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.750
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.116
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.857
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.304
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.736
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.007
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.545
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.985
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.329
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.97
Bfactors> 106 vectors, 46698 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.612000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.318 for 1019 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.010 +/- 0.02
Bfactors> = 0.890 +/- 0.08
Bfactors> Shiftng-fct= 0.880
Bfactors> Scaling-fct= 3.732
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2608040528142607898.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2608040528142607898.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4290E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4294E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.8
Chkmod> 106 vectors, 46698 coordinates in file.
Chkmod> That is: 15566 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9808
0.0034 0.6740
0.0034 0.7769
0.0034 0.7924
0.0034 0.8808
0.0034 0.9070
84.9478 0.2917
96.3978 0.4878
123.9507 0.2516
141.0792 0.2797
148.9262 0.2781
153.4111 0.4001
170.3116 0.0271
209.9686 0.4004
215.7845 0.2650
230.4239 0.3087
243.2681 0.1924
260.3818 0.5658
268.5409 0.1508
284.3438 0.3576
293.4655 0.4861
302.0194 0.3555
307.2639 0.1214
317.4188 0.1078
325.4885 0.1860
331.6608 0.2859
345.4354 0.5626
358.0069 0.4386
385.5975 0.3029
392.1168 0.5274
404.4035 0.4569
415.6191 0.3933
433.3956 0.2493
439.8767 0.3351
452.1694 0.1164
469.8179 0.3382
485.4931 0.4658
490.0858 0.1140
500.2065 0.2965
511.5114 0.3145
514.7284 0.2555
523.5861 0.4651
525.2724 0.3588
529.7429 0.2987
540.6484 0.3668
558.8788 0.3144
560.0379 0.3753
570.6745 0.3319
586.1671 0.1424
591.9718 0.2461
602.5339 0.2331
612.9140 0.3916
616.6539 0.1265
626.5180 0.3064
633.3500 0.2099
643.9658 0.4193
651.1581 0.2302
666.4605 0.3192
668.0509 0.1121
675.1613 0.3129
681.9383 0.3264
689.1621 0.1079
699.0994 0.3920
703.8898 0.3768
717.4122 0.3004
719.6276 0.5558
728.0979 0.2908
734.1457 0.4667
745.3826 0.4663
752.1540 0.4477
762.8940 0.2891
771.2714 0.0989
774.6274 0.3962
776.2240 0.0377
785.8107 0.4449
788.2826 0.4249
793.1290 0.4760
797.9460 0.2561
804.9344 0.1691
808.9527 0.5457
813.5311 0.1183
825.9730 0.3267
833.2216 0.4336
835.4828 0.3179
837.1042 0.5111
843.6984 0.4423
852.1808 0.4472
854.8746 0.3843
862.7690 0.4979
873.9037 0.3843
879.7533 0.2691
882.4298 0.1854
889.0857 0.3941
891.4036 0.4852
896.9419 0.2859
899.9604 0.4372
904.5996 0.4511
907.9822 0.4507
925.7932 0.4751
927.9558 0.4933
933.5931 0.4326
939.9495 0.5179
946.5123 0.3803
949.0627 0.5131
952.9682 0.3563
958.8273 0.4994
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2608040528142607898 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
making animated gifs
11 models are in 2608040528142607898.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608040528142607898.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608040528142607898.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2608040528142607898 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
making animated gifs
11 models are in 2608040528142607898.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608040528142607898.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608040528142607898.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2608040528142607898 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
making animated gifs
11 models are in 2608040528142607898.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608040528142607898.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608040528142607898.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2608040528142607898 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
making animated gifs
11 models are in 2608040528142607898.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608040528142607898.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608040528142607898.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2608040528142607898 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2608040528142607898.eigenfacs
2608040528142607898.atom
making animated gifs
11 models are in 2608040528142607898.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608040528142607898.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2608040528142607898.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2608040528142607898.10.pdb
2608040528142607898.11.pdb
2608040528142607898.7.pdb
2608040528142607898.8.pdb
2608040528142607898.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 2m31.477s
user 2m30.504s
sys 0m0.911s
rm: cannot remove '2608040528142607898.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
