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LOGs for ID: 2608040544052611990

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2608040544052611990.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2608040544052611990.atom to be opened. Openam> File opened: 2608040544052611990.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1019 First residue number = 2 Last residue number = 1020 Number of atoms found = 15566 Mean number per residue = 15.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 66.428401 +/- 18.584322 From: 23.318000 To: 122.542000 = 67.497804 +/- 16.390070 From: 18.456000 To: 101.408000 = 73.035701 +/- 23.352937 From: 22.887000 To: 131.838000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -1.0645 % Filled. Pdbmat> 11252621 non-zero elements. Pdbmat> 1240105 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 159.34 +/- 49.89 Maximum number = 255 Minimum number = 21 Pdbmat> Matrix trace = 2.480210E+07 Pdbmat> Larger element = 899.680 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1019 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2608040544052611990.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2608040544052611990.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2608040544052611990.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 15566 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1019 residues. Blocpdb> 94 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 79 atoms in block 2 Block first atom: 95 Blocpdb> 92 atoms in block 3 Block first atom: 174 Blocpdb> 100 atoms in block 4 Block first atom: 266 Blocpdb> 79 atoms in block 5 Block first atom: 366 Blocpdb> 96 atoms in block 6 Block first atom: 445 Blocpdb> 131 atoms in block 7 Block first atom: 541 Blocpdb> 87 atoms in block 8 Block first atom: 672 Blocpdb> 101 atoms in block 9 Block first atom: 759 Blocpdb> 87 atoms in block 10 Block first atom: 860 Blocpdb> 105 atoms in block 11 Block first atom: 947 Blocpdb> 82 atoms in block 12 Block first atom: 1052 Blocpdb> 100 atoms in block 13 Block first atom: 1134 Blocpdb> 83 atoms in block 14 Block first atom: 1234 Blocpdb> 84 atoms in block 15 Block first atom: 1317 Blocpdb> 92 atoms in block 16 Block first atom: 1401 Blocpdb> 97 atoms in block 17 Block first atom: 1493 Blocpdb> 100 atoms in block 18 Block first atom: 1590 Blocpdb> 87 atoms in block 19 Block first atom: 1690 Blocpdb> 90 atoms in block 20 Block first atom: 1777 Blocpdb> 77 atoms in block 21 Block first atom: 1867 Blocpdb> 82 atoms in block 22 Block first atom: 1944 Blocpdb> 71 atoms in block 23 Block first atom: 2026 Blocpdb> 88 atoms in block 24 Block first atom: 2097 Blocpdb> 84 atoms in block 25 Block first atom: 2185 Blocpdb> 86 atoms in block 26 Block first atom: 2269 Blocpdb> 95 atoms in block 27 Block first atom: 2355 Blocpdb> 93 atoms in block 28 Block first atom: 2450 Blocpdb> 99 atoms in block 29 Block first atom: 2543 Blocpdb> 98 atoms in block 30 Block first atom: 2642 Blocpdb> 85 atoms in block 31 Block first atom: 2740 Blocpdb> 100 atoms in block 32 Block first atom: 2825 Blocpdb> 59 atoms in block 33 Block first atom: 2925 Blocpdb> 82 atoms in block 34 Block first atom: 2984 Blocpdb> 100 atoms in block 35 Block first atom: 3066 Blocpdb> 95 atoms in block 36 Block first atom: 3166 Blocpdb> 106 atoms in block 37 Block first atom: 3261 Blocpdb> 69 atoms in block 38 Block first atom: 3367 Blocpdb> 109 atoms in block 39 Block first atom: 3436 Blocpdb> 98 atoms in block 40 Block first atom: 3545 Blocpdb> 102 atoms in block 41 Block first atom: 3643 Blocpdb> 93 atoms in block 42 Block first atom: 3745 Blocpdb> 100 atoms in block 43 Block first atom: 3838 Blocpdb> 86 atoms in block 44 Block first atom: 3938 Blocpdb> 94 atoms in block 45 Block first atom: 4024 Blocpdb> 109 atoms in block 46 Block first atom: 4118 Blocpdb> 85 atoms in block 47 Block first atom: 4227 Blocpdb> 83 atoms in block 48 Block first atom: 4312 Blocpdb> 100 atoms in block 49 Block first atom: 4395 Blocpdb> 86 atoms in block 50 Block first atom: 4495 Blocpdb> 95 atoms in block 51 Block first atom: 4581 Blocpdb> 100 atoms in block 52 Block first atom: 4676 Blocpdb> 81 atoms in block 53 Block first atom: 4776 Blocpdb> 73 atoms in block 54 Block first atom: 4857 Blocpdb> 88 atoms in block 55 Block first atom: 4930 Blocpdb> 98 atoms in block 56 Block first atom: 5018 Blocpdb> 69 atoms in block 57 Block first atom: 5116 Blocpdb> 77 atoms in block 58 Block first atom: 5185 Blocpdb> 82 atoms in block 59 Block first atom: 5262 Blocpdb> 113 atoms in block 60 Block first atom: 5344 Blocpdb> 109 atoms in block 61 Block first atom: 5457 Blocpdb> 99 atoms in block 62 Block first atom: 5566 Blocpdb> 96 atoms in block 63 Block first atom: 5665 Blocpdb> 95 atoms in block 64 Block first atom: 5761 Blocpdb> 107 atoms in block 65 Block first atom: 5856 Blocpdb> 106 atoms in block 66 Block first atom: 5963 Blocpdb> 95 atoms in block 67 Block first atom: 6069 Blocpdb> 96 atoms in block 68 Block first atom: 6164 Blocpdb> 97 atoms in block 69 Block first atom: 6260 Blocpdb> 96 atoms in block 70 Block first atom: 6357 Blocpdb> 89 atoms in block 71 Block first atom: 6453 Blocpdb> 96 atoms in block 72 Block first atom: 6542 Blocpdb> 83 atoms in block 73 Block first atom: 6638 Blocpdb> 83 atoms in block 74 Block first atom: 6721 Blocpdb> 104 atoms in block 75 Block first atom: 6804 Blocpdb> 100 atoms in block 76 Block first atom: 6908 Blocpdb> 103 atoms in block 77 Block first atom: 7008 Blocpdb> 88 atoms in block 78 Block first atom: 7111 Blocpdb> 91 atoms in block 79 Block first atom: 7199 Blocpdb> 72 atoms in block 80 Block first atom: 7290 Blocpdb> 82 atoms in block 81 Block first atom: 7362 Blocpdb> 86 atoms in block 82 Block first atom: 7444 Blocpdb> 82 atoms in block 83 Block first atom: 7530 Blocpdb> 114 atoms in block 84 Block first atom: 7612 Blocpdb> 103 atoms in block 85 Block first atom: 7726 Blocpdb> 65 atoms in block 86 Block first atom: 7829 Blocpdb> 103 atoms in block 87 Block first atom: 7894 Blocpdb> 100 atoms in block 88 Block first atom: 7997 Blocpdb> 93 atoms in block 89 Block first atom: 8097 Blocpdb> 90 atoms in block 90 Block first atom: 8190 Blocpdb> 94 atoms in block 91 Block first atom: 8280 Blocpdb> 78 atoms in block 92 Block first atom: 8374 Blocpdb> 77 atoms in block 93 Block first atom: 8452 Blocpdb> 112 atoms in block 94 Block first atom: 8529 Blocpdb> 78 atoms in block 95 Block first atom: 8641 Blocpdb> 100 atoms in block 96 Block first atom: 8719 Blocpdb> 100 atoms in block 97 Block first atom: 8819 Blocpdb> 93 atoms in block 98 Block first atom: 8919 Blocpdb> 97 atoms in block 99 Block first atom: 9012 Blocpdb> 77 atoms in block 100 Block first atom: 9109 Blocpdb> 80 atoms in block 101 Block first atom: 9186 Blocpdb> 105 atoms in block 102 Block first atom: 9266 Blocpdb> 82 atoms in block 103 Block first atom: 9371 Blocpdb> 100 atoms in block 104 Block first atom: 9453 Blocpdb> 92 atoms in block 105 Block first atom: 9553 Blocpdb> 95 atoms in block 106 Block first atom: 9645 Blocpdb> 87 atoms in block 107 Block first atom: 9740 Blocpdb> 94 atoms in block 108 Block first atom: 9827 Blocpdb> 104 atoms in block 109 Block first atom: 9921 Blocpdb> 78 atoms in block 110 Block first atom: 10025 Blocpdb> 85 atoms in block 111 Block first atom: 10103 Blocpdb> 86 atoms in block 112 Block first atom: 10188 Blocpdb> 77 atoms in block 113 Block first atom: 10274 Blocpdb> 71 atoms in block 114 Block first atom: 10351 Blocpdb> 93 atoms in block 115 Block first atom: 10422 Blocpdb> 116 atoms in block 116 Block first atom: 10515 Blocpdb> 100 atoms in block 117 Block first atom: 10631 Blocpdb> 105 atoms in block 118 Block first atom: 10731 Blocpdb> 91 atoms in block 119 Block first atom: 10836 Blocpdb> 87 atoms in block 120 Block first atom: 10927 Blocpdb> 88 atoms in block 121 Block first atom: 11014 Blocpdb> 68 atoms in block 122 Block first atom: 11102 Blocpdb> 79 atoms in block 123 Block first atom: 11170 Blocpdb> 91 atoms in block 124 Block first atom: 11249 Blocpdb> 82 atoms in block 125 Block first atom: 11340 Blocpdb> 76 atoms in block 126 Block first atom: 11422 Blocpdb> 102 atoms in block 127 Block first atom: 11498 Blocpdb> 65 atoms in block 128 Block first atom: 11600 Blocpdb> 105 atoms in block 129 Block first atom: 11665 Blocpdb> 94 atoms in block 130 Block first atom: 11770 Blocpdb> 84 atoms in block 131 Block first atom: 11864 Blocpdb> 96 atoms in block 132 Block first atom: 11948 Blocpdb> 66 atoms in block 133 Block first atom: 12044 Blocpdb> 89 atoms in block 134 Block first atom: 12110 Blocpdb> 75 atoms in block 135 Block first atom: 12199 Blocpdb> 90 atoms in block 136 Block first atom: 12274 Blocpdb> 89 atoms in block 137 Block first atom: 12364 Blocpdb> 96 atoms in block 138 Block first atom: 12453 Blocpdb> 94 atoms in block 139 Block first atom: 12549 Blocpdb> 110 atoms in block 140 Block first atom: 12643 Blocpdb> 96 atoms in block 141 Block first atom: 12753 Blocpdb> 83 atoms in block 142 Block first atom: 12849 Blocpdb> 82 atoms in block 143 Block first atom: 12932 Blocpdb> 98 atoms in block 144 Block first atom: 13014 Blocpdb> 101 atoms in block 145 Block first atom: 13112 Blocpdb> 106 atoms in block 146 Block first atom: 13213 Blocpdb> 92 atoms in block 147 Block first atom: 13319 Blocpdb> 119 atoms in block 148 Block first atom: 13411 Blocpdb> 99 atoms in block 149 Block first atom: 13530 Blocpdb> 111 atoms in block 150 Block first atom: 13629 Blocpdb> 90 atoms in block 151 Block first atom: 13740 Blocpdb> 110 atoms in block 152 Block first atom: 13830 Blocpdb> 107 atoms in block 153 Block first atom: 13940 Blocpdb> 102 atoms in block 154 Block first atom: 14047 Blocpdb> 96 atoms in block 155 Block first atom: 14149 Blocpdb> 82 atoms in block 156 Block first atom: 14245 Blocpdb> 92 atoms in block 157 Block first atom: 14327 Blocpdb> 90 atoms in block 158 Block first atom: 14419 Blocpdb> 90 atoms in block 159 Block first atom: 14509 Blocpdb> 87 atoms in block 160 Block first atom: 14599 Blocpdb> 69 atoms in block 161 Block first atom: 14686 Blocpdb> 104 atoms in block 162 Block first atom: 14755 Blocpdb> 91 atoms in block 163 Block first atom: 14859 Blocpdb> 87 atoms in block 164 Block first atom: 14950 Blocpdb> 76 atoms in block 165 Block first atom: 15037 Blocpdb> 81 atoms in block 166 Block first atom: 15113 Blocpdb> 99 atoms in block 167 Block first atom: 15194 Blocpdb> 96 atoms in block 168 Block first atom: 15293 Blocpdb> 110 atoms in block 169 Block first atom: 15389 Blocpdb> 68 atoms in block 170 Block first atom: 15498 Blocpdb> 170 blocks. Blocpdb> At most, 131 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 59 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 11252791 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 46698 Prepmat> Matrix trace = 24802100.0000 Prepmat> Last element read: 46698 46698 231.1202 Prepmat> 14536 lines saved. Prepmat> 12939 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 15566 RTB> Total mass = 15566.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 15566 RTB> Number of blocks = 170 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 369643.6222 RTB> 54906 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1020 Diagstd> Nb of non-zero elements: 54906 Diagstd> Projected matrix trace = 369643.6222 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1020 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 369643.6222 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.6120863 0.7882806 1.3036549 1.6878405 1.8818168 1.9977286 2.4606413 3.7409841 3.9512778 4.5021427 5.0213303 5.7542604 6.1150110 6.8611441 7.3136998 7.7361968 8.0062996 8.5467867 8.9914666 9.3313180 10.1308901 10.8722556 12.6164217 13.0535776 13.8689934 14.6585887 15.9463751 16.4248212 17.3398685 18.7665891 19.9780742 20.3769332 21.2215547 22.2099488 22.4891242 23.2284079 23.3884117 23.7894445 24.8029318 26.4797570 26.6092441 27.6213268 29.1399837 29.7357450 30.8101236 31.8485461 32.2487979 33.2876475 34.0257748 35.1837963 35.9548575 37.6504081 37.8524433 38.6510435 39.4422977 40.2869691 41.4414776 42.0424588 43.6400705 43.9291370 44.9429686 45.7468028 47.1383289 48.0119950 49.3518316 50.4643899 50.8864964 51.0972983 52.3693112 52.7074465 53.3422408 53.9739187 54.9542325 55.5004329 56.1247625 57.8886944 58.8873634 59.2482170 59.4256463 60.3845013 61.5612302 61.9984964 63.1496288 64.7313190 65.6429768 66.0760365 67.1532959 67.3935890 68.2078822 68.6772319 69.4144130 69.9336806 72.6881262 73.0085471 73.9161138 74.9645564 76.0209223 76.3460079 77.0222410 77.9702071 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034311 0.0034320 0.0034325 0.0034334 0.0034347 0.0034369 84.9574778 96.4130216 123.9871284 141.0785473 148.9649004 153.4841473 170.3410935 210.0333278 215.8559695 230.4119008 243.3350524 260.4893891 268.5306729 284.4418871 293.6728830 302.0362253 307.2636605 317.4656298 325.6196065 331.7162707 345.6360891 358.0594227 385.7122029 392.3377139 404.4061498 415.7587141 433.6369365 440.0941597 452.1871115 470.4223558 485.3690631 490.1902749 500.2462924 511.7632069 514.9695516 523.3653933 525.1648438 529.6481150 540.8125855 558.7946998 560.1592974 570.7127155 586.1920610 592.1540341 602.7566359 612.8300972 616.6688989 626.5227306 633.4309683 644.1197698 651.1395370 666.3158192 668.1011802 675.1121003 681.9874514 689.2512746 699.0574949 704.1080891 717.3613961 719.7333324 727.9912478 734.4726930 745.5596083 752.4370225 762.8636440 771.4144927 774.6340009 776.2368384 785.8392400 788.3721404 793.1054018 797.7875517 804.9999502 808.9905813 813.5280621 826.2132542 833.3095042 835.8588075 837.1094359 843.8359471 852.0183047 855.0388711 862.9401609 873.6802301 879.8110536 882.7084268 889.8748784 891.4655664 896.8350294 899.9153745 904.7323265 908.1100313 925.8209777 927.8593172 933.6085988 940.2065406 946.8078444 948.8300854 953.0229422 958.8697640 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 15566 Rtb_to_modes> Number of blocs = 170 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9836E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9883E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0017E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6121 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7883 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.304 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.688 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.882 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.998 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.461 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.741 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.951 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.502 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.021 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.754 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.115 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.861 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.314 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.736 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.006 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.547 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.991 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.331 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.97 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 1.00002 0.99996 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 1.00003 0.99998 1.00004 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00005 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00004 0.99998 1.00000 1.00002 1.00005 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 1.00003 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00003 1.00003 1.00000 1.00001 0.99997 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 280188 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 1.00002 0.99996 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 1.00003 0.99998 1.00004 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00005 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00004 0.99998 1.00000 1.00002 1.00005 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 1.00003 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00003 1.00003 1.00000 1.00001 0.99997 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2608040544052611990.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2608040544052611990.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2608040544052611990.atom Openam> file on opening on unit 11: 2608040544052611990.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1019 First residue number = 2 Last residue number = 1020 Number of atoms found = 15566 Mean number per residue = 15.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9836E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9883E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0017E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6121 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7883 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.304 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.688 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.882 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.998 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.461 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.741 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.951 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.502 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.021 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.754 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.115 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.861 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.314 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.736 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.006 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.547 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.991 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.331 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.97 Bfactors> 106 vectors, 46698 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.612100 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.318 for 1019 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.010 +/- 0.02 Bfactors> = 0.890 +/- 0.08 Bfactors> Shiftng-fct= 0.880 Bfactors> Scaling-fct= 3.733 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2608040544052611990.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2608040544052611990.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.5 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vecteur en lecture: 797.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.8 Chkmod> 106 vectors, 46698 coordinates in file. Chkmod> That is: 15566 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 13 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 50 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7749 0.0034 0.8250 0.0034 0.7516 0.0034 0.6587 0.0034 0.9352 0.0034 0.7976 84.9548 0.2914 96.4101 0.4880 123.9982 0.2513 141.0792 0.2795 148.9658 0.2766 153.4880 0.4020 170.3462 0.0271 210.0248 0.3988 215.8391 0.2660 230.3984 0.3091 243.3166 0.1909 260.4723 0.5669 268.5189 0.1489 284.4267 0.3604 293.6663 0.4859 302.0194 0.3548 307.2447 0.1216 317.4560 0.1056 325.5972 0.1885 331.6964 0.2856 345.6061 0.5601 358.0069 0.4387 385.7503 0.3014 392.2671 0.5260 404.4035 0.4582 415.7609 0.3942 433.6676 0.2481 440.0107 0.3342 452.1694 0.1132 470.4449 0.3393 485.3716 0.4633 490.2061 0.1145 500.2065 0.2965 511.7418 0.3088 514.9575 0.2529 523.3609 0.4659 525.1601 0.3458 529.6316 0.2948 540.7574 0.3661 558.7733 0.3579 560.1432 0.3668 570.6745 0.3322 586.1671 0.1419 592.1710 0.2486 602.7296 0.2370 612.8178 0.3851 616.6539 0.1342 626.5180 0.3025 633.4431 0.2124 644.0574 0.4196 651.0676 0.2309 666.2836 0.3216 668.0509 0.1129 675.0740 0.3140 681.9383 0.3252 689.2476 0.1069 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DQ=-80 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom making animated gifs 11 models are in 2608040544052611990.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608040544052611990.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608040544052611990.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2608040544052611990 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom making animated gifs 11 models are in 2608040544052611990.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608040544052611990.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608040544052611990.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2608040544052611990 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom making animated gifs 11 models are in 2608040544052611990.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608040544052611990.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608040544052611990.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2608040544052611990 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608040544052611990.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2608040544052611990 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608040544052611990.eigenfacs 2608040544052611990.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608040544052611990.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608040544052611990.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2608040544052611990.10.pdb 2608040544052611990.11.pdb 2608040544052611990.7.pdb 2608040544052611990.8.pdb 2608040544052611990.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 2m30.473s user 2m29.471s sys 0m0.940s rm: cannot remove '2608040544052611990.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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