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***  TLR_3_simulation  ***

LOGs for ID: 2608260325273940753

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2608260325273940753.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2608260325273940753.atom to be opened. Openam> File opened: 2608260325273940753.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 963 First residue number = 26 Last residue number = 292 Number of atoms found = 7504 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = -26.384820 +/- 23.959972 From: -72.488000 To: 24.672000 = -20.539022 +/- 20.993945 From: -71.690000 To: 21.642000 = 24.796977 +/- 16.908840 From: -8.610000 To: 75.217000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.0207 % Filled. Pdbmat> 2586452 non-zero elements. Pdbmat> 282427 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 75.27 +/- 24.82 Maximum number = 125 Minimum number = 7 Pdbmat> Matrix trace = 5.648540E+06 Pdbmat> Larger element = 486.487 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 963 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2608260325273940753.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2608260325273940753.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2608260325273940753.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7504 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 963 residues. Blocpdb> 36 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 37 atoms in block 2 Block first atom: 37 Blocpdb> 38 atoms in block 3 Block first atom: 74 Blocpdb> 40 atoms in block 4 Block first atom: 112 Blocpdb> 38 atoms in block 5 Block first atom: 152 Blocpdb> 37 atoms in block 6 Block first atom: 190 Blocpdb> 41 atoms in block 7 Block first atom: 227 Blocpdb> 47 atoms in block 8 Block first atom: 268 Blocpdb> 33 atoms in block 9 Block first atom: 315 Blocpdb> 47 atoms in block 10 Block first atom: 348 Blocpdb> 38 atoms in block 11 Block first atom: 395 Blocpdb> 38 atoms in block 12 Block first atom: 433 Blocpdb> 38 atoms in block 13 Block first atom: 471 Blocpdb> 39 atoms in block 14 Block first atom: 509 Blocpdb> 41 atoms in block 15 Block first atom: 548 Blocpdb> 40 atoms in block 16 Block first atom: 589 Blocpdb> 44 atoms in block 17 Block first atom: 629 Blocpdb> 37 atoms in block 18 Block first atom: 673 Blocpdb> 40 atoms in block 19 Block first atom: 710 Blocpdb> 40 atoms in block 20 Block first atom: 750 Blocpdb> 42 atoms in block 21 Block first atom: 790 Blocpdb> 36 atoms in block 22 Block first atom: 832 Blocpdb> 43 atoms in block 23 Block first atom: 868 Blocpdb> 42 atoms in block 24 Block first atom: 911 Blocpdb> 42 atoms in block 25 Block first atom: 953 Blocpdb> 37 atoms in block 26 Block first atom: 995 Blocpdb> 36 atoms in block 27 Block first atom: 1032 Blocpdb> 34 atoms in block 28 Block first atom: 1068 Blocpdb> 40 atoms in block 29 Block first atom: 1102 Blocpdb> 43 atoms in block 30 Block first atom: 1142 Blocpdb> 38 atoms in block 31 Block first atom: 1185 Blocpdb> 39 atoms in block 32 Block first atom: 1223 Blocpdb> 41 atoms in block 33 Block first atom: 1262 Blocpdb> 40 atoms in block 34 Block first atom: 1303 Blocpdb> 37 atoms in block 35 Block first atom: 1343 Blocpdb> 40 atoms in block 36 Block first atom: 1380 Blocpdb> 40 atoms in block 37 Block first atom: 1420 Blocpdb> 37 atoms in block 38 Block first atom: 1460 Blocpdb> 40 atoms in block 39 Block first atom: 1497 Blocpdb> 38 atoms in block 40 Block first atom: 1537 Blocpdb> 43 atoms in block 41 Block first atom: 1575 Blocpdb> 35 atoms in block 42 Block first atom: 1618 Blocpdb> 39 atoms in block 43 Block first atom: 1653 Blocpdb> 39 atoms in block 44 Block first atom: 1692 Blocpdb> 34 atoms in block 45 Block first atom: 1731 Blocpdb> 41 atoms in block 46 Block first atom: 1765 Blocpdb> 37 atoms in block 47 Block first atom: 1806 Blocpdb> 34 atoms in block 48 Block first atom: 1843 Blocpdb> 37 atoms in block 49 Block first atom: 1877 Blocpdb> 46 atoms in block 50 Block first atom: 1914 Blocpdb> 39 atoms in block 51 Block first atom: 1960 Blocpdb> 42 atoms in block 52 Block first atom: 1999 Blocpdb> 34 atoms in block 53 Block first atom: 2041 Blocpdb> 38 atoms in block 54 Block first atom: 2075 Blocpdb> 46 atoms in block 55 Block first atom: 2113 Blocpdb> 51 atoms in block 56 Block first atom: 2159 Blocpdb> 45 atoms in block 57 Block first atom: 2210 Blocpdb> 44 atoms in block 58 Block first atom: 2255 Blocpdb> 38 atoms in block 59 Block first atom: 2299 Blocpdb> 45 atoms in block 60 Block first atom: 2337 Blocpdb> 45 atoms in block 61 Block first atom: 2382 Blocpdb> 44 atoms in block 62 Block first atom: 2427 Blocpdb> 37 atoms in block 63 Block first atom: 2471 Blocpdb> 35 atoms in block 64 Block first atom: 2508 Blocpdb> 41 atoms in block 65 Block first atom: 2543 Blocpdb> 51 atoms in block 66 Block first atom: 2584 Blocpdb> 41 atoms in block 67 Block first atom: 2635 Blocpdb> 41 atoms in block 68 Block first atom: 2676 Blocpdb> 35 atoms in block 69 Block first atom: 2717 Blocpdb> 42 atoms in block 70 Block first atom: 2752 Blocpdb> 35 atoms in block 71 Block first atom: 2794 Blocpdb> 43 atoms in block 72 Block first atom: 2829 Blocpdb> 39 atoms in block 73 Block first atom: 2872 Blocpdb> 39 atoms in block 74 Block first atom: 2911 Blocpdb> 39 atoms in block 75 Block first atom: 2950 Blocpdb> 37 atoms in block 76 Block first atom: 2989 Blocpdb> 41 atoms in block 77 Block first atom: 3026 Blocpdb> 39 atoms in block 78 Block first atom: 3067 Blocpdb> 40 atoms in block 79 Block first atom: 3106 Blocpdb> 40 atoms in block 80 Block first atom: 3146 Blocpdb> 44 atoms in block 81 Block first atom: 3186 Blocpdb> 38 atoms in block 82 Block first atom: 3230 Blocpdb> 36 atoms in block 83 Block first atom: 3268 Blocpdb> 38 atoms in block 84 Block first atom: 3304 Blocpdb> 37 atoms in block 85 Block first atom: 3342 Blocpdb> 46 atoms in block 86 Block first atom: 3379 Blocpdb> 45 atoms in block 87 Block first atom: 3425 Blocpdb> 46 atoms in block 88 Block first atom: 3470 Blocpdb> 46 atoms in block 89 Block first atom: 3516 Blocpdb> 40 atoms in block 90 Block first atom: 3562 Blocpdb> 38 atoms in block 91 Block first atom: 3602 Blocpdb> 42 atoms in block 92 Block first atom: 3640 Blocpdb> 45 atoms in block 93 Block first atom: 3682 Blocpdb> 37 atoms in block 94 Block first atom: 3727 Blocpdb> 33 atoms in block 95 Block first atom: 3764 Blocpdb> 42 atoms in block 96 Block first atom: 3797 Blocpdb> 42 atoms in block 97 Block first atom: 3839 Blocpdb> 38 atoms in block 98 Block first atom: 3881 Blocpdb> 37 atoms in block 99 Block first atom: 3919 Blocpdb> 40 atoms in block 100 Block first atom: 3956 Blocpdb> 38 atoms in block 101 Block first atom: 3996 Blocpdb> 42 atoms in block 102 Block first atom: 4034 Blocpdb> 43 atoms in block 103 Block first atom: 4076 Blocpdb> 40 atoms in block 104 Block first atom: 4119 Blocpdb> 46 atoms in block 105 Block first atom: 4159 Blocpdb> 30 atoms in block 106 Block first atom: 4205 Blocpdb> 44 atoms in block 107 Block first atom: 4235 Blocpdb> 42 atoms in block 108 Block first atom: 4279 Blocpdb> 41 atoms in block 109 Block first atom: 4321 Blocpdb> 37 atoms in block 110 Block first atom: 4362 Blocpdb> 40 atoms in block 111 Block first atom: 4399 Blocpdb> 43 atoms in block 112 Block first atom: 4439 Blocpdb> 45 atoms in block 113 Block first atom: 4482 Blocpdb> 36 atoms in block 114 Block first atom: 4527 Blocpdb> 39 atoms in block 115 Block first atom: 4563 Blocpdb> 33 atoms in block 116 Block first atom: 4602 Blocpdb> 43 atoms in block 117 Block first atom: 4635 Blocpdb> 37 atoms in block 118 Block first atom: 4678 Blocpdb> 42 atoms in block 119 Block first atom: 4715 Blocpdb> 36 atoms in block 120 Block first atom: 4757 Blocpdb> 45 atoms in block 121 Block first atom: 4793 Blocpdb> 38 atoms in block 122 Block first atom: 4838 Blocpdb> 40 atoms in block 123 Block first atom: 4876 Blocpdb> 46 atoms in block 124 Block first atom: 4916 Blocpdb> 39 atoms in block 125 Block first atom: 4962 Blocpdb> 34 atoms in block 126 Block first atom: 5001 Blocpdb> 54 atoms in block 127 Block first atom: 5035 Blocpdb> 42 atoms in block 128 Block first atom: 5089 Blocpdb> 39 atoms in block 129 Block first atom: 5131 Blocpdb> 42 atoms in block 130 Block first atom: 5170 Blocpdb> 36 atoms in block 131 Block first atom: 5212 Blocpdb> 43 atoms in block 132 Block first atom: 5248 Blocpdb> 44 atoms in block 133 Block first atom: 5291 Blocpdb> 38 atoms in block 134 Block first atom: 5335 Blocpdb> 7 atoms in block 135 Block first atom: 5373 Blocpdb> 33 atoms in block 136 Block first atom: 5380 Blocpdb> 43 atoms in block 137 Block first atom: 5413 Blocpdb> 37 atoms in block 138 Block first atom: 5456 Blocpdb> 42 atoms in block 139 Block first atom: 5493 Blocpdb> 39 atoms in block 140 Block first atom: 5535 Blocpdb> 46 atoms in block 141 Block first atom: 5574 Blocpdb> 41 atoms in block 142 Block first atom: 5620 Blocpdb> 32 atoms in block 143 Block first atom: 5661 Blocpdb> 46 atoms in block 144 Block first atom: 5693 Blocpdb> 41 atoms in block 145 Block first atom: 5739 Blocpdb> 46 atoms in block 146 Block first atom: 5780 Blocpdb> 40 atoms in block 147 Block first atom: 5826 Blocpdb> 36 atoms in block 148 Block first atom: 5866 Blocpdb> 46 atoms in block 149 Block first atom: 5902 Blocpdb> 42 atoms in block 150 Block first atom: 5948 Blocpdb> 35 atoms in block 151 Block first atom: 5990 Blocpdb> 40 atoms in block 152 Block first atom: 6025 Blocpdb> 33 atoms in block 153 Block first atom: 6065 Blocpdb> 26 atoms in block 154 Block first atom: 6098 Blocpdb> 33 atoms in block 155 Block first atom: 6124 Blocpdb> 33 atoms in block 156 Block first atom: 6157 Blocpdb> 31 atoms in block 157 Block first atom: 6190 Blocpdb> 40 atoms in block 158 Block first atom: 6221 Blocpdb> 27 atoms in block 159 Block first atom: 6261 Blocpdb> 37 atoms in block 160 Block first atom: 6288 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 6325 Blocpdb> 25 atoms in block 162 Block first atom: 6358 Blocpdb> 47 atoms in block 163 Block first atom: 6383 Blocpdb> 31 atoms in block 164 Block first atom: 6430 Blocpdb> 31 atoms in block 165 Block first atom: 6461 Blocpdb> 40 atoms in block 166 Block first atom: 6492 Blocpdb> 23 atoms in block 167 Block first atom: 6532 Blocpdb> 30 atoms in block 168 Block first atom: 6555 Blocpdb> 37 atoms in block 169 Block first atom: 6585 Blocpdb> 29 atoms in block 170 Block first atom: 6622 Blocpdb> 38 atoms in block 171 Block first atom: 6651 Blocpdb> 36 atoms in block 172 Block first atom: 6689 Blocpdb> 35 atoms in block 173 Block first atom: 6725 Blocpdb> 31 atoms in block 174 Block first atom: 6760 Blocpdb> 38 atoms in block 175 Block first atom: 6791 Blocpdb> 37 atoms in block 176 Block first atom: 6829 Blocpdb> 30 atoms in block 177 Block first atom: 6866 Blocpdb> 26 atoms in block 178 Block first atom: 6896 Blocpdb> 38 atoms in block 179 Block first atom: 6922 Blocpdb> 33 atoms in block 180 Block first atom: 6960 Blocpdb> 30 atoms in block 181 Block first atom: 6993 Blocpdb> 40 atoms in block 182 Block first atom: 7023 Blocpdb> 38 atoms in block 183 Block first atom: 7063 Blocpdb> 36 atoms in block 184 Block first atom: 7101 Blocpdb> 43 atoms in block 185 Block first atom: 7137 Blocpdb> 35 atoms in block 186 Block first atom: 7180 Blocpdb> 39 atoms in block 187 Block first atom: 7215 Blocpdb> 34 atoms in block 188 Block first atom: 7254 Blocpdb> 45 atoms in block 189 Block first atom: 7288 Blocpdb> 41 atoms in block 190 Block first atom: 7333 Blocpdb> 43 atoms in block 191 Block first atom: 7374 Blocpdb> 39 atoms in block 192 Block first atom: 7417 Blocpdb> 41 atoms in block 193 Block first atom: 7456 Blocpdb> 8 atoms in block 194 Block first atom: 7496 Blocpdb> 194 blocks. Blocpdb> At most, 54 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2586646 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 22512 Prepmat> Matrix trace = 5648540.0000 Prepmat> Last element read: 22512 22512 96.9948 Prepmat> 18916 lines saved. Prepmat> 17495 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7504 RTB> Total mass = 7504.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7504 RTB> Number of blocks = 194 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 194302.9518 RTB> 48210 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1164 Diagstd> Nb of non-zero elements: 48210 Diagstd> Projected matrix trace = 194302.9518 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1164 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 194302.9518 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0313308 0.0548541 0.0966106 0.1275571 0.1801216 0.2104570 0.2448649 0.3317870 0.3627657 0.3811232 0.4479346 0.5011880 0.5477964 0.6186033 0.6459328 0.9479739 1.0135093 1.0855552 1.1540284 1.1715935 1.3018981 1.4583114 1.5985117 1.7677105 1.8511627 1.9104293 1.9832858 2.1889656 2.3301928 2.5464167 2.5627680 2.8360033 2.8852821 2.9880097 3.0580325 3.2578199 3.3645967 3.4861735 3.6037658 3.7060161 3.8997775 4.2290766 4.2809169 4.4219281 4.7266395 4.8192779 4.9850532 5.1984793 5.4115027 5.5669822 5.6848489 5.7723785 5.8650531 6.2074619 6.4078037 6.5031688 6.6579498 6.9590956 7.0783458 7.2977584 7.5827129 7.8429057 8.0352376 8.2446846 8.3930615 8.6517729 8.7627736 9.0890368 9.4597934 9.5309814 9.7959221 9.8751097 10.4937223 10.5848393 10.6448830 10.7994551 11.0253612 11.1969141 11.5507419 11.8080370 12.0542113 12.1466738 12.3590338 12.6722510 12.7509462 13.0342103 13.2727807 13.4753856 13.7245943 13.9240996 14.1265918 14.3943444 14.8668592 14.9588430 15.5049681 15.6578498 15.9005737 16.0470354 16.3879600 16.7607723 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034320 0.0034325 0.0034327 0.0034336 0.0034340 0.0034345 19.2212323 25.4331239 33.7526283 38.7835591 46.0869727 49.8169332 53.7351606 62.5496605 65.4046153 67.0390694 72.6779330 76.8768540 80.3720138 85.4085624 87.2748150 105.7288399 109.3223955 113.1413186 116.6550464 117.5394753 123.9035563 131.1355421 137.2945138 144.3779425 147.7466280 150.0931121 152.9283232 160.6625835 165.7643772 173.2846210 173.8400851 182.8726013 184.4545721 187.7095111 189.8962230 196.0012389 199.1873656 202.7541628 206.1453593 209.0494023 214.4446402 223.3150822 224.6796185 228.3500531 236.0866983 238.3890296 242.4544611 247.5901927 252.6121401 256.2153797 258.9135290 260.8991590 262.9851683 270.5529737 274.8842640 276.9222124 280.1983273 286.4650745 288.9090641 293.3526533 299.0250607 304.1121538 307.8184473 311.8044465 314.5976564 319.4095053 321.4519586 327.3815574 333.9920313 335.2463754 339.8739985 341.2449594 351.7710241 353.2949384 354.2955729 356.8586276 360.5717462 363.3661384 369.0627552 373.1505907 377.0202526 378.4634674 381.7574671 386.5646734 387.7631067 392.0465551 395.6181789 398.6262383 402.2953728 405.2087746 408.1445284 411.9943166 418.7018641 419.9951565 427.5931300 429.6960298 433.0137396 435.0034347 439.6000454 444.5721913 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7504 Rtb_to_modes> Number of blocs = 194 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9888E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1331E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.4854E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.6611E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1276 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1801 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2105 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2449 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3318 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3628 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3811 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4479 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5012 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5478 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6186 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6459 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.014 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.086 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.154 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.172 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.302 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.458 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.599 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.768 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.851 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.983 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.189 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.546 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.563 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.836 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.885 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.988 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.058 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.258 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.365 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.486 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.604 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.706 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.900 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.229 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.281 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.422 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.819 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.198 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.412 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.567 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.685 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.772 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.865 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.207 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.408 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.503 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.658 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.959 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.078 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.298 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.583 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.843 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.035 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.245 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.652 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.763 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.089 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.460 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.531 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.796 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.875 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.76 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1164 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 0.99995 1.00002 0.99997 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999 0.99996 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 135072 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 0.99995 1.00002 0.99997 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999 0.99996 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2608260325273940753.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2608260325273940753.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2608260325273940753.atom Openam> file on opening on unit 11: 2608260325273940753.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 963 First residue number = 26 Last residue number = 292 Number of atoms found = 7504 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9888E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1331E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.4854E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.6611E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1276 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1801 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2105 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2449 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3318 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3628 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3811 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4479 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5012 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5478 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6186 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6459 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9480 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.014 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.086 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.154 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.172 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.302 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.458 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.599 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.768 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.851 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.983 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.189 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.546 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.563 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.836 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.885 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.988 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.058 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.258 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.365 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.486 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.604 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.706 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.900 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.229 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.281 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.422 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.819 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.198 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.412 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.567 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.685 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.772 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.865 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.207 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.408 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.503 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.658 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.959 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.078 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.298 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.583 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.843 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.035 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.245 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.652 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.763 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.089 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.460 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.531 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.796 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.875 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.76 Bfactors> 106 vectors, 22512 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.031331 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.265 +/- 0.78 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.265 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2608260325273940753.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2608260325273940753.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.5 Chkmod> 106 vectors, 22512 coordinates in file. Chkmod> That is: 7504 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 26 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6380 0.0034 0.7996 0.0034 0.7050 0.0034 0.8459 0.0034 0.9199 0.0034 0.9666 19.2205 0.3348 25.4320 0.0282 33.7513 0.3037 38.7884 0.1048 46.0822 0.1288 49.8199 0.0375 53.7367 0.1301 62.5482 0.3143 65.4049 0.6654 67.0342 0.0506 72.6720 0.4777 76.8745 0.3725 80.3688 0.1981 85.4047 0.3148 87.2689 0.3423 105.7258 0.2165 109.3442 0.4430 113.1596 0.1550 116.6486 0.1879 117.5548 0.2458 123.9031 0.3301 131.1159 0.5952 137.3096 0.5374 144.3836 0.1182 147.7338 0.5110 150.0698 0.0773 152.9107 0.0462 160.6569 0.2047 165.7504 0.4989 173.2630 0.4580 173.8405 0.1707 182.8646 0.1483 184.4376 0.4906 187.7011 0.0655 189.8871 0.2488 195.9982 0.3764 199.1908 0.3778 202.7404 0.2191 206.1432 0.1166 209.0400 0.1772 214.4416 0.3303 223.3035 0.1342 224.6722 0.2956 228.3421 0.1140 236.0856 0.4496 238.3719 0.0899 242.4428 0.1544 247.5682 0.2658 252.6129 0.3466 256.2048 0.1905 258.9059 0.4933 260.8794 0.1656 262.9727 0.2428 270.5313 0.1293 274.8767 0.1677 276.9067 0.3620 280.1874 0.3384 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perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2608260325273940753.eigenfacs 2608260325273940753.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608260325273940753.eigenfacs 2608260325273940753.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608260325273940753.eigenfacs 2608260325273940753.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608260325273940753.eigenfacs 2608260325273940753.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608260325273940753.eigenfacs 2608260325273940753.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608260325273940753.eigenfacs 2608260325273940753.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608260325273940753.eigenfacs 2608260325273940753.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2608260325273940753.eigenfacs 2608260325273940753.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608260325273940753.eigenfacs 2608260325273940753.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608260325273940753.eigenfacs 2608260325273940753.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2608260325273940753.eigenfacs 2608260325273940753.atom making animated gifs 11 models are in 2608260325273940753.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608260325273940753.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2608260325273940753.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making 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