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* OXIDOREDUCTASE 24-OCT-19 6T86 *

LOGs for ID: 2608270702514181530

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2608270702514181530.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2608270702514181530.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2608270702514181530.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    454
            First residue number     =    129
            Last  residue number     =    582
            Number of atoms found    =   3460
            Mean number per residue  =      7.6

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    54.752184 +/-    14.226948 From:    20.589000 To:    85.180000
 =    16.189271 +/-     9.105895 From:    -4.945000 To:    40.215000
 =    29.457749 +/-    16.523101 From:    -1.785000 To:    68.761000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   2.4975 % Filled.
 Pdbmat>      1345578  non-zero elements.
 Pdbmat>       147227 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     85.10 +/-     21.94
         Maximum number =    130
         Minimum number =     13

 Pdbmat> Matrix trace   = 2.944540E+06
 Pdbmat> Larger element =  516.167    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
454 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2608270702514181530.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          3
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2608270702514181530.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2608270702514181530.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  3460 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     3 residue(s) per block.
 Blocpdb>   454 residues.
 Blocpdb>    29 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    27 atoms in block      2
 Block first atom:     30
 Blocpdb>    22 atoms in block      3
 Block first atom:     57
 Blocpdb>    18 atoms in block      4
 Block first atom:     79
 Blocpdb>    13 atoms in block      5
 Block first atom:     97
 Blocpdb>    21 atoms in block      6
 Block first atom:    110
 Blocpdb>    17 atoms in block      7
 Block first atom:    131
 Blocpdb>    22 atoms in block      8
 Block first atom:    148
 Blocpdb>    14 atoms in block      9
 Block first atom:    170
 Blocpdb>    22 atoms in block     10
 Block first atom:    184
 Blocpdb>    23 atoms in block     11
 Block first atom:    206
 Blocpdb>    26 atoms in block     12
 Block first atom:    229
 Blocpdb>    23 atoms in block     13
 Block first atom:    255
 Blocpdb>    16 atoms in block     14
 Block first atom:    278
 Blocpdb>    22 atoms in block     15
 Block first atom:    294
 Blocpdb>    15 atoms in block     16
 Block first atom:    316
 Blocpdb>    25 atoms in block     17
 Block first atom:    331
 Blocpdb>    16 atoms in block     18
 Block first atom:    356
 Blocpdb>    27 atoms in block     19
 Block first atom:    372
 Blocpdb>    26 atoms in block     20
 Block first atom:    399
 Blocpdb>    20 atoms in block     21
 Block first atom:    425
 Blocpdb>    21 atoms in block     22
 Block first atom:    445
 Blocpdb>    26 atoms in block     23
 Block first atom:    466
 Blocpdb>    25 atoms in block     24
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    23 atoms in block     25
 Block first atom:    517
 Blocpdb>    17 atoms in block     26
 Block first atom:    540
 Blocpdb>    28 atoms in block     27
 Block first atom:    557
 Blocpdb>    19 atoms in block     28
 Block first atom:    585
 Blocpdb>    24 atoms in block     29
 Block first atom:    604
 Blocpdb>    24 atoms in block     30
 Block first atom:    628
 Blocpdb>    23 atoms in block     31
 Block first atom:    652
 Blocpdb>    16 atoms in block     32
 Block first atom:    675
 Blocpdb>    19 atoms in block     33
 Block first atom:    691
 Blocpdb>    33 atoms in block     34
 Block first atom:    710
 Blocpdb>    27 atoms in block     35
 Block first atom:    743
 Blocpdb>    25 atoms in block     36
 Block first atom:    770
 Blocpdb>    30 atoms in block     37
 Block first atom:    795
 Blocpdb>    25 atoms in block     38
 Block first atom:    825
 Blocpdb>    31 atoms in block     39
 Block first atom:    850
 Blocpdb>    18 atoms in block     40
 Block first atom:    881
 Blocpdb>    22 atoms in block     41
 Block first atom:    899
 Blocpdb>    24 atoms in block     42
 Block first atom:    921
 Blocpdb>    24 atoms in block     43
 Block first atom:    945
 Blocpdb>    21 atoms in block     44
 Block first atom:    969
 Blocpdb>    18 atoms in block     45
 Block first atom:    990
 Blocpdb>    21 atoms in block     46
 Block first atom:   1008
 Blocpdb>    26 atoms in block     47
 Block first atom:   1029
 Blocpdb>    22 atoms in block     48
 Block first atom:   1055
 Blocpdb>    24 atoms in block     49
 Block first atom:   1077
 Blocpdb>    19 atoms in block     50
 Block first atom:   1101
 Blocpdb>    25 atoms in block     51
 Block first atom:   1120
 Blocpdb>    24 atoms in block     52
 Block first atom:   1145
 Blocpdb>    23 atoms in block     53
 Block first atom:   1169
 Blocpdb>    25 atoms in block     54
 Block first atom:   1192
 Blocpdb>    24 atoms in block     55
 Block first atom:   1217
 Blocpdb>    23 atoms in block     56
 Block first atom:   1241
 Blocpdb>    18 atoms in block     57
 Block first atom:   1264
 Blocpdb>    19 atoms in block     58
 Block first atom:   1282
 Blocpdb>    22 atoms in block     59
 Block first atom:   1301
 Blocpdb>    24 atoms in block     60
 Block first atom:   1323
 Blocpdb>    29 atoms in block     61
 Block first atom:   1347
 Blocpdb>    25 atoms in block     62
 Block first atom:   1376
 Blocpdb>    18 atoms in block     63
 Block first atom:   1401
 Blocpdb>    20 atoms in block     64
 Block first atom:   1419
 Blocpdb>    19 atoms in block     65
 Block first atom:   1439
 Blocpdb>    20 atoms in block     66
 Block first atom:   1458
 Blocpdb>    25 atoms in block     67
 Block first atom:   1478
 Blocpdb>    29 atoms in block     68
 Block first atom:   1503
 Blocpdb>    27 atoms in block     69
 Block first atom:   1532
 Blocpdb>    25 atoms in block     70
 Block first atom:   1559
 Blocpdb>    32 atoms in block     71
 Block first atom:   1584
 Blocpdb>    17 atoms in block     72
 Block first atom:   1616
 Blocpdb>    19 atoms in block     73
 Block first atom:   1633
 Blocpdb>    15 atoms in block     74
 Block first atom:   1652
 Blocpdb>    16 atoms in block     75
 Block first atom:   1667
 Blocpdb>    23 atoms in block     76
 Block first atom:   1683
 Blocpdb>    23 atoms in block     77
 Block first atom:   1706
 Blocpdb>    23 atoms in block     78
 Block first atom:   1729
 Blocpdb>    19 atoms in block     79
 Block first atom:   1752
 Blocpdb>    20 atoms in block     80
 Block first atom:   1771
 Blocpdb>    29 atoms in block     81
 Block first atom:   1791
 Blocpdb>    25 atoms in block     82
 Block first atom:   1820
 Blocpdb>    20 atoms in block     83
 Block first atom:   1845
 Blocpdb>    20 atoms in block     84
 Block first atom:   1865
 Blocpdb>    17 atoms in block     85
 Block first atom:   1885
 Blocpdb>    21 atoms in block     86
 Block first atom:   1902
 Blocpdb>    19 atoms in block     87
 Block first atom:   1923
 Blocpdb>    33 atoms in block     88
 Block first atom:   1942
 Blocpdb>    16 atoms in block     89
 Block first atom:   1975
 Blocpdb>    24 atoms in block     90
 Block first atom:   1991
 Blocpdb>    22 atoms in block     91
 Block first atom:   2015
 Blocpdb>    31 atoms in block     92
 Block first atom:   2037
 Blocpdb>    25 atoms in block     93
 Block first atom:   2068
 Blocpdb>    28 atoms in block     94
 Block first atom:   2093
 Blocpdb>    26 atoms in block     95
 Block first atom:   2121
 Blocpdb>    24 atoms in block     96
 Block first atom:   2147
 Blocpdb>    21 atoms in block     97
 Block first atom:   2171
 Blocpdb>    21 atoms in block     98
 Block first atom:   2192
 Blocpdb>    27 atoms in block     99
 Block first atom:   2213
 Blocpdb>    26 atoms in block    100
 Block first atom:   2240
 Blocpdb>    30 atoms in block    101
 Block first atom:   2266
 Blocpdb>    25 atoms in block    102
 Block first atom:   2296
 Blocpdb>    24 atoms in block    103
 Block first atom:   2321
 Blocpdb>    22 atoms in block    104
 Block first atom:   2345
 Blocpdb>    24 atoms in block    105
 Block first atom:   2367
 Blocpdb>    23 atoms in block    106
 Block first atom:   2391
 Blocpdb>    26 atoms in block    107
 Block first atom:   2414
 Blocpdb>    27 atoms in block    108
 Block first atom:   2440
 Blocpdb>    21 atoms in block    109
 Block first atom:   2467
 Blocpdb>    28 atoms in block    110
 Block first atom:   2488
 Blocpdb>    24 atoms in block    111
 Block first atom:   2516
 Blocpdb>    24 atoms in block    112
 Block first atom:   2540
 Blocpdb>    19 atoms in block    113
 Block first atom:   2564
 Blocpdb>    27 atoms in block    114
 Block first atom:   2583
 Blocpdb>    23 atoms in block    115
 Block first atom:   2610
 Blocpdb>    26 atoms in block    116
 Block first atom:   2633
 Blocpdb>    22 atoms in block    117
 Block first atom:   2659
 Blocpdb>    24 atoms in block    118
 Block first atom:   2681
 Blocpdb>    23 atoms in block    119
 Block first atom:   2705
 Blocpdb>    27 atoms in block    120
 Block first atom:   2728
 Blocpdb>    16 atoms in block    121
 Block first atom:   2755
 Blocpdb>    26 atoms in block    122
 Block first atom:   2771
 Blocpdb>    24 atoms in block    123
 Block first atom:   2797
 Blocpdb>    27 atoms in block    124
 Block first atom:   2821
 Blocpdb>    19 atoms in block    125
 Block first atom:   2848
 Blocpdb>    22 atoms in block    126
 Block first atom:   2867
 Blocpdb>    20 atoms in block    127
 Block first atom:   2889
 Blocpdb>    34 atoms in block    128
 Block first atom:   2909
 Blocpdb>    22 atoms in block    129
 Block first atom:   2943
 Blocpdb>    20 atoms in block    130
 Block first atom:   2965
 Blocpdb>    27 atoms in block    131
 Block first atom:   2985
 Blocpdb>    19 atoms in block    132
 Block first atom:   3012
 Blocpdb>    19 atoms in block    133
 Block first atom:   3031
 Blocpdb>    22 atoms in block    134
 Block first atom:   3050
 Blocpdb>    29 atoms in block    135
 Block first atom:   3072
 Blocpdb>    23 atoms in block    136
 Block first atom:   3101
 Blocpdb>    22 atoms in block    137
 Block first atom:   3124
 Blocpdb>    24 atoms in block    138
 Block first atom:   3146
 Blocpdb>    19 atoms in block    139
 Block first atom:   3170
 Blocpdb>    21 atoms in block    140
 Block first atom:   3189
 Blocpdb>    20 atoms in block    141
 Block first atom:   3210
 Blocpdb>    19 atoms in block    142
 Block first atom:   3230
 Blocpdb>    21 atoms in block    143
 Block first atom:   3249
 Blocpdb>    31 atoms in block    144
 Block first atom:   3270
 Blocpdb>    16 atoms in block    145
 Block first atom:   3301
 Blocpdb>    25 atoms in block    146
 Block first atom:   3317
 Blocpdb>    23 atoms in block    147
 Block first atom:   3342
 Blocpdb>    27 atoms in block    148
 Block first atom:   3365
 Blocpdb>    23 atoms in block    149
 Block first atom:   3392
 Blocpdb>    18 atoms in block    150
 Block first atom:   3415
 Blocpdb>    19 atoms in block    151
 Block first atom:   3433
 Blocpdb>     9 atoms in block    152
 Block first atom:   3451

 Blocpdb>   152 blocks.

 Blocpdb> At most,     34 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     9 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1345730 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      10380

 Prepmat> Matrix trace    =    2944540.0000
 Prepmat> Last element read:   10380  10380       126.0464
 Prepmat>        11629 lines saved.
 Prepmat>        10052 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  3460
 RTB> Total mass =        3460.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  3460
 RTB> Number of blocks =   152
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  207863.9992
 RTB>     54456 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      912
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    54456
 Diagstd> Projected matrix trace =  207863.9992

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    912 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 207863.9992
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.6178375      0.7496957      1.1887445      4.3615311
      4.4970371      5.6779029      6.9981663      8.3858475      9.6071313
     12.4175458     13.3104725     13.8680586     15.0255414     16.3953509
     16.8676288     17.6998102     17.8844134     18.9036398     19.5871415
     20.1782895     21.3751377     22.1813941     22.5978456     22.9847394
     24.5225128     25.0151198     25.4000375     26.8311486     27.7135392
     28.3611462     29.1917554     30.6388726     31.5185755     32.1838701
     32.4388170     33.4021041     35.0348185     35.4199976     35.7350601
     36.2004019     37.0173024     38.1544136     38.4432719     39.3826754
     40.6058852     41.1175175     41.5616895     42.2318064     43.5081789
     44.2052811     45.1941999     45.4863433     46.0336024     46.7556115
     47.5440334     48.3094296     48.6922271     49.6403777     51.0781051
     51.7214835     52.4237362     52.6780375     53.0737476     53.5369502
     53.6569208     54.9098967     55.3215180     56.3478174     56.8564488
     57.2988843     57.9023186     59.1744670     59.6282390     60.5966607
     61.1613700     62.4659380     62.8532191     63.4366550     63.5872021
     64.3754271     65.0313491     65.8068130     66.1102303     66.5694910
     68.4302087     68.8821088     69.4671350     69.9211417     71.0299345
     71.4524930     72.0705728     72.5872428     73.2312079     73.8470379
     74.3514479     74.8671369     75.9408191     76.6365259     76.8516825
     77.6665682

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034316      0.0034320      0.0034322      0.0034329      0.0034333
      0.0034350     85.3556789     94.0237960    118.3966854    226.7852298
    230.2812165    258.7553051    287.2681057    314.4624260    336.5829742
    382.6600865    396.1795159    404.3925202    420.9304512    439.6991617
    445.9871010    456.8562649    459.2325152    472.1369574    480.5967295
    487.7951238    502.0532012    511.4341216    516.2128348    520.6130761
    537.7467138    543.1209729    547.2836314    562.4901377    571.6645694
    578.3052964    586.7125607    601.0791594    609.6471821    616.0478036
    618.4830248    627.5989275    642.7546342    646.2782552    649.1462293
    653.3591485    660.6898940    670.7607967    673.2950967    681.4717988
    691.9739916    696.3197657    700.0706607    705.6918622    716.2765497
    721.9919551    730.0231479    732.3788477    736.7714043    742.5268306
    748.7611304    754.7640999    757.7485247    765.0905165    776.0910390
    780.9635540    786.2474772    788.1521668    791.1068730    794.5515772
    795.4413314    804.6751574    807.6855712    815.1430489    818.8137847
    821.9934619    826.3104736    835.3384220    838.5351495    845.3170455
    849.2467288    858.2561284    860.9125583    864.8990451    865.9247205
    871.2751791    875.7026463    880.9083153    882.9367942    885.9983201
    898.2954762    901.2566815    905.0758443    908.0286170    915.1999494
    917.9181837    921.8797326    925.1782839    929.2731287    933.1722599
    936.3538390    939.5954235    946.3088873    950.6336533    951.9671673
    957.0008822

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   3460
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    152

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9860E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9885E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9899E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9937E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9959E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.6178    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.7497    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.189    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.362    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.497    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.678    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.998    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.386    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.607    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.67    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    912 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00003 1.00004 0.99998 0.99997
 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99997
 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00002 1.00004 1.00000 1.00001
 1.00004 0.99999 1.00001 0.99999 0.99996
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
 1.00001 0.99999 1.00003 1.00002 0.99998
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 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999
 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000
 0.99997

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    62280 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00003 1.00004 0.99998 0.99997
 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99997
 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00002 1.00004 1.00000 1.00001
 1.00004 0.99999 1.00001 0.99999 0.99996
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
 1.00001 0.99999 1.00003 1.00002 0.99998
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00003
 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001
 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001
 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999
 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000
 0.99997

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2608270702514181530.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2608270702514181530.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2608270702514181530.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2608270702514181530.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    454
            First residue number     =    129
            Last  residue number     =    582
            Number of atoms found    =   3460
            Mean number per residue  =      7.6

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9860E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9885E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9899E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9937E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9959E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.6178    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7497    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.189    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.362    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.497    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.678    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.998    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.386    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.607    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.67    

 Bfactors>  106 vectors,  10380 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.617800
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.536 for    455 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.030 +/-   0.02
 Bfactors> =     30.097 +/-   6.76
 Bfactors> Shiftng-fct=     30.067
 Bfactors> Scaling-fct=    307.096

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2608270702514181530.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2608270702514181530.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4314E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4318E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4321E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4327E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4348E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   85.35    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   730.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   732.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   736.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   742.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   748.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   754.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   757.7    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   765.1    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   788.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   791.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   794.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   838.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   845.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   858.2    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   865.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   871.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   875.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   898.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   901.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   905.1    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   933.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   936.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   939.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   946.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   950.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   951.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   957.0    

 Chkmod>  106 vectors,  10380 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   3460 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7411
      0.0034      0.6600
      0.0034      0.8841
      0.0034      0.8396
      0.0034      0.9727
      0.0034      0.8597
     85.3494      0.6837
     94.0200      0.5592
    118.4043      0.6531
    226.7877      0.6805
    230.2704      0.5837
    258.7464      0.5610
    287.2524      0.5566
    314.4518      0.5892
    336.5662      0.4953
    382.6815      0.3241
    396.1555      0.3435
    404.4035      0.4920
    420.9748      0.4146
    439.7426      0.5062
    445.9993      0.4867
    456.8391      0.1522
    459.1561      0.3854
    472.0712      0.5976
    480.6112      0.1839
    487.7949      0.4731
    502.0887      0.3611
    511.3961      0.4215
    516.2153      0.4827
    520.5371      0.5890
    537.6961      0.5680
    543.1506      0.4595
    547.2597      0.4486
    562.4540      0.5080
    571.6035      0.4200
    578.2688      0.4734
    586.6697      0.3762
    601.0644      0.3177
    609.6348      0.3960
    615.9843      0.4389
    618.4678      0.4927
    627.5522      0.4995
    642.6828      0.5023
    646.2505      0.4635
    649.1632      0.4000
    653.3275      0.4684
    660.6856      0.3882
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    673.2375      0.5247
    681.4194      0.4941
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    696.3109      0.5761
    700.0264      0.3245
    705.6465      0.4904
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    794.5401      0.4461
    795.4300      0.4076
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    807.6398      0.5307
    815.1238      0.5153
    818.8042      0.4218
    821.9662      0.5972
    826.2585      0.5022
    835.2710      0.3385
    838.5115      0.5392
    845.3040      0.5010
    849.2008      0.3595
    858.2472      0.4540
    860.8536      0.4597
    864.8847      0.5292
    865.9066      0.5061
    871.2687      0.4611
    875.6560      0.4527
    880.8918      0.4708
    882.8974      0.4691
    885.9637      0.5365
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    951.9159      0.4944
    956.9809      0.3409
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2608270702514181530 7 -200 200 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-200
2608270702514181530.eigenfacs
2608270702514181530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-180
2608270702514181530.eigenfacs
2608270702514181530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-160
2608270702514181530.eigenfacs
2608270702514181530.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
2608270702514181530.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-120
2608270702514181530.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-100
2608270702514181530.eigenfacs
2608270702514181530.atom
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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