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LOGs for ID: 2608270829352786

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2608270829352786.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2608270829352786.atom to be opened. Openam> File opened: 2608270829352786.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 557 First residue number = 1 Last residue number = 557 Number of atoms found = 4198 Mean number per residue = 7.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.663849 +/- 13.921764 From: -42.511000 To: 25.744000 = 0.827046 +/- 13.665129 From: -33.898000 To: 32.403000 = 0.874557 +/- 15.391079 From: -33.633000 To: 37.965000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.0362 % Filled. Pdbmat> 1614944 non-zero elements. Pdbmat> 176664 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.17 +/- 22.51 Maximum number = 129 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 3.533280E+06 Pdbmat> Larger element = 500.036 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 557 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2608270829352786.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2608270829352786.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2608270829352786.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4198 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 557 residues. Blocpdb> 24 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 24 atoms in block 2 Block first atom: 25 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 49 Blocpdb> 22 atoms in block 4 Block first atom: 65 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 87 Blocpdb> 23 atoms in block 6 Block first atom: 110 Blocpdb> 23 atoms in block 7 Block first atom: 133 Blocpdb> 28 atoms in block 8 Block first atom: 156 Blocpdb> 22 atoms in block 9 Block first atom: 184 Blocpdb> 20 atoms in block 10 Block first atom: 206 Blocpdb> 23 atoms in block 11 Block first atom: 226 Blocpdb> 27 atoms in block 12 Block first atom: 249 Blocpdb> 26 atoms in block 13 Block first atom: 276 Blocpdb> 20 atoms in block 14 Block first atom: 302 Blocpdb> 16 atoms in block 15 Block first atom: 322 Blocpdb> 28 atoms in block 16 Block first atom: 338 Blocpdb> 25 atoms in block 17 Block first atom: 366 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 391 Blocpdb> 24 atoms in block 19 Block first atom: 412 Blocpdb> 23 atoms in block 20 Block first atom: 436 Blocpdb> 19 atoms in block 21 Block first atom: 459 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 478 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 495 Blocpdb> 22 atoms in block 24 Block first atom: 514 Blocpdb> 22 atoms in block 25 Block first atom: 536 Blocpdb> 21 atoms in block 26 Block first atom: 558 Blocpdb> 19 atoms in block 27 Block first atom: 579 Blocpdb> 22 atoms in block 28 Block first atom: 598 Blocpdb> 16 atoms in block 29 Block first atom: 620 Blocpdb> 22 atoms in block 30 Block first atom: 636 Blocpdb> 17 atoms in block 31 Block first atom: 658 Blocpdb> 20 atoms in block 32 Block first atom: 675 Blocpdb> 24 atoms in block 33 Block first atom: 695 Blocpdb> 20 atoms in block 34 Block first atom: 719 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 739 Blocpdb> 31 atoms in block 36 Block first atom: 760 Blocpdb> 22 atoms in block 37 Block first atom: 791 Blocpdb> 20 atoms in block 38 Block first atom: 813 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 833 Blocpdb> 20 atoms in block 40 Block first atom: 847 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 867 Blocpdb> 22 atoms in block 42 Block first atom: 882 Blocpdb> 18 atoms in block 43 Block first atom: 904 Blocpdb> 21 atoms in block 44 Block first atom: 922 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 943 Blocpdb> 26 atoms in block 46 Block first atom: 963 Blocpdb> 23 atoms in block 47 Block first atom: 989 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 1012 Blocpdb> 22 atoms in block 49 Block first atom: 1028 Blocpdb> 18 atoms in block 50 Block first atom: 1050 Blocpdb> 22 atoms in block 51 Block first atom: 1068 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 1090 Blocpdb> 24 atoms in block 53 Block first atom: 1110 Blocpdb> 25 atoms in block 54 Block first atom: 1134 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1159 Blocpdb> 23 atoms in block 56 Block first atom: 1179 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1202 Blocpdb> 27 atoms in block 58 Block first atom: 1226 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1253 Blocpdb> 21 atoms in block 60 Block first atom: 1274 Blocpdb> 23 atoms in block 61 Block first atom: 1295 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1318 Blocpdb> 24 atoms in block 63 Block first atom: 1339 Blocpdb> 23 atoms in block 64 Block first atom: 1363 Blocpdb> 23 atoms in block 65 Block first atom: 1386 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 1409 Blocpdb> 14 atoms in block 67 Block first atom: 1429 Blocpdb> 31 atoms in block 68 Block first atom: 1443 Blocpdb> 31 atoms in block 69 Block first atom: 1474 Blocpdb> 23 atoms in block 70 Block first atom: 1505 Blocpdb> 32 atoms in block 71 Block first atom: 1528 Blocpdb> 24 atoms in block 72 Block first atom: 1560 Blocpdb> 28 atoms in block 73 Block first atom: 1584 Blocpdb> 19 atoms in block 74 Block first atom: 1612 Blocpdb> 23 atoms in block 75 Block first atom: 1631 Blocpdb> 25 atoms in block 76 Block first atom: 1654 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1679 Blocpdb> 23 atoms in block 78 Block first atom: 1702 Blocpdb> 16 atoms in block 79 Block first atom: 1725 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1741 Blocpdb> 26 atoms in block 81 Block first atom: 1765 Blocpdb> 23 atoms in block 82 Block first atom: 1791 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1814 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1836 Blocpdb> 25 atoms in block 85 Block first atom: 1855 Blocpdb> 22 atoms in block 86 Block first atom: 1880 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1902 Blocpdb> 25 atoms in block 88 Block first atom: 1925 Blocpdb> 26 atoms in block 89 Block first atom: 1950 Blocpdb> 22 atoms in block 90 Block first atom: 1976 Blocpdb> 19 atoms in block 91 Block first atom: 1998 Blocpdb> 21 atoms in block 92 Block first atom: 2017 Blocpdb> 23 atoms in block 93 Block first atom: 2038 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 2061 Blocpdb> 27 atoms in block 95 Block first atom: 2081 Blocpdb> 24 atoms in block 96 Block first atom: 2108 Blocpdb> 22 atoms in block 97 Block first atom: 2132 Blocpdb> 20 atoms in block 98 Block first atom: 2154 Blocpdb> 15 atoms in block 99 Block first atom: 2174 Blocpdb> 23 atoms in block 100 Block first atom: 2189 Blocpdb> 25 atoms in block 101 Block first atom: 2212 Blocpdb> 28 atoms in block 102 Block first atom: 2237 Blocpdb> 29 atoms in block 103 Block first atom: 2265 Blocpdb> 24 atoms in block 104 Block first atom: 2294 Blocpdb> 28 atoms in block 105 Block first atom: 2318 Blocpdb> 22 atoms in block 106 Block first atom: 2346 Blocpdb> 21 atoms in block 107 Block first atom: 2368 Blocpdb> 13 atoms in block 108 Block first atom: 2389 Blocpdb> 19 atoms in block 109 Block first atom: 2402 Blocpdb> 19 atoms in block 110 Block first atom: 2421 Blocpdb> 22 atoms in block 111 Block first atom: 2440 Blocpdb> 27 atoms in block 112 Block first atom: 2462 Blocpdb> 15 atoms in block 113 Block first atom: 2489 Blocpdb> 25 atoms in block 114 Block first atom: 2504 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 2529 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 2553 Blocpdb> 21 atoms in block 117 Block first atom: 2580 Blocpdb> 20 atoms in block 118 Block first atom: 2601 Blocpdb> 15 atoms in block 119 Block first atom: 2621 Blocpdb> 21 atoms in block 120 Block first atom: 2636 Blocpdb> 21 atoms in block 121 Block first atom: 2657 Blocpdb> 28 atoms in block 122 Block first atom: 2678 Blocpdb> 20 atoms in block 123 Block first atom: 2706 Blocpdb> 23 atoms in block 124 Block first atom: 2726 Blocpdb> 26 atoms in block 125 Block first atom: 2749 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2775 Blocpdb> 27 atoms in block 127 Block first atom: 2799 Blocpdb> 26 atoms in block 128 Block first atom: 2826 Blocpdb> 30 atoms in block 129 Block first atom: 2852 Blocpdb> 21 atoms in block 130 Block first atom: 2882 Blocpdb> 23 atoms in block 131 Block first atom: 2903 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2926 Blocpdb> 22 atoms in block 133 Block first atom: 2948 Blocpdb> 31 atoms in block 134 Block first atom: 2970 Blocpdb> 29 atoms in block 135 Block first atom: 3001 Blocpdb> 25 atoms in block 136 Block first atom: 3030 Blocpdb> 25 atoms in block 137 Block first atom: 3055 Blocpdb> 22 atoms in block 138 Block first atom: 3080 Blocpdb> 23 atoms in block 139 Block first atom: 3102 Blocpdb> 27 atoms in block 140 Block first atom: 3125 Blocpdb> 21 atoms in block 141 Block first atom: 3152 Blocpdb> 29 atoms in block 142 Block first atom: 3173 Blocpdb> 24 atoms in block 143 Block first atom: 3202 Blocpdb> 20 atoms in block 144 Block first atom: 3226 Blocpdb> 28 atoms in block 145 Block first atom: 3246 Blocpdb> 23 atoms in block 146 Block first atom: 3274 Blocpdb> 23 atoms in block 147 Block first atom: 3297 Blocpdb> 21 atoms in block 148 Block first atom: 3320 Blocpdb> 27 atoms in block 149 Block first atom: 3341 Blocpdb> 24 atoms in block 150 Block first atom: 3368 Blocpdb> 25 atoms in block 151 Block first atom: 3392 Blocpdb> 21 atoms in block 152 Block first atom: 3417 Blocpdb> 24 atoms in block 153 Block first atom: 3438 Blocpdb> 30 atoms in block 154 Block first atom: 3462 Blocpdb> 17 atoms in block 155 Block first atom: 3492 Blocpdb> 21 atoms in block 156 Block first atom: 3509 Blocpdb> 25 atoms in block 157 Block first atom: 3530 Blocpdb> 29 atoms in block 158 Block first atom: 3555 Blocpdb> 18 atoms in block 159 Block first atom: 3584 Blocpdb> 23 atoms in block 160 Block first atom: 3602 Blocpdb> 19 atoms in block 161 Block first atom: 3625 Blocpdb> 33 atoms in block 162 Block first atom: 3644 Blocpdb> 25 atoms in block 163 Block first atom: 3677 Blocpdb> 19 atoms in block 164 Block first atom: 3702 Blocpdb> 23 atoms in block 165 Block first atom: 3721 Blocpdb> 25 atoms in block 166 Block first atom: 3744 Blocpdb> 16 atoms in block 167 Block first atom: 3769 Blocpdb> 22 atoms in block 168 Block first atom: 3785 Blocpdb> 25 atoms in block 169 Block first atom: 3807 Blocpdb> 26 atoms in block 170 Block first atom: 3832 Blocpdb> 26 atoms in block 171 Block first atom: 3858 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3884 Blocpdb> 19 atoms in block 173 Block first atom: 3904 Blocpdb> 24 atoms in block 174 Block first atom: 3923 Blocpdb> 18 atoms in block 175 Block first atom: 3947 Blocpdb> 18 atoms in block 176 Block first atom: 3965 Blocpdb> 25 atoms in block 177 Block first atom: 3983 Blocpdb> 19 atoms in block 178 Block first atom: 4008 Blocpdb> 23 atoms in block 179 Block first atom: 4027 Blocpdb> 17 atoms in block 180 Block first atom: 4050 Blocpdb> 27 atoms in block 181 Block first atom: 4067 Blocpdb> 23 atoms in block 182 Block first atom: 4094 Blocpdb> 27 atoms in block 183 Block first atom: 4117 Blocpdb> 17 atoms in block 184 Block first atom: 4144 Blocpdb> 23 atoms in block 185 Block first atom: 4161 Blocpdb> 15 atoms in block 186 Block first atom: 4183 Blocpdb> 186 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 13 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1615130 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12594 Prepmat> Matrix trace = 3533280.0000 Prepmat> Last element read: 12594 12594 196.7590 Prepmat> 17392 lines saved. Prepmat> 15414 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4198 RTB> Total mass = 4198.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4198 RTB> Number of blocks = 186 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 250939.4405 RTB> 68382 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1116 Diagstd> Nb of non-zero elements: 68382 Diagstd> Projected matrix trace = 250939.4405 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1116 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 250939.4405 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4610887 1.3282175 1.3501033 3.0200689 3.3782839 3.6754906 4.0483974 5.0337068 5.5388967 6.0415895 7.4345282 7.6444766 9.1809984 10.2038538 10.9875238 12.4751281 12.8050107 13.2881048 14.1691044 14.5370919 15.0887390 16.2134564 16.8629734 17.0675939 18.1049346 18.2484453 19.1575317 19.8280376 20.2557827 20.9790501 21.3955267 21.8288452 22.5368926 23.9164026 24.0586904 25.1282439 25.4302719 25.8781401 26.8170059 27.3811523 28.2019776 28.5907492 29.7911554 30.1652262 30.9227694 31.7728752 32.7049860 32.8251292 33.2791561 34.1064131 34.5087086 35.3076121 35.7792593 36.6150211 36.9609205 37.3671974 38.0392445 39.5052422 39.6814336 40.2418483 40.7419879 41.6625060 42.1493539 42.4014902 42.5857341 43.4034705 43.8276180 44.4781931 44.6164159 45.1649022 45.5640744 46.4628941 47.1173575 47.5063958 47.5979840 48.7439087 48.8316898 49.3812227 49.5962160 50.1240076 50.8785686 51.1328385 51.3623166 52.4514131 52.7902884 53.2038339 53.6978706 54.1389564 54.6300842 55.1557721 55.8715624 56.3350532 56.8943178 57.5631726 57.8527042 58.6943232 59.1264908 59.5827807 59.6734855 60.3395405 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034328 0.0034338 0.0034343 0.0034346 0.0034354 73.7373526 125.1497180 126.1765894 188.7138185 199.5921019 208.1866800 218.4926572 243.6347527 255.5682583 266.9137137 296.0888051 300.2404188 329.0335892 346.8785092 359.9525006 383.5462903 388.5843035 395.8464935 408.7582027 414.0321335 421.8147419 437.2532878 445.9255506 448.6228915 462.0550919 463.8827412 475.2969825 483.5430516 488.7308966 497.3798537 502.2925905 507.3534998 515.5161762 531.0595319 532.6369268 544.3476471 547.6092586 552.4103536 562.3418745 568.2260513 576.6802284 580.6414671 592.7054952 596.4150215 603.8575091 612.1016343 621.0152482 622.1548667 626.4428154 634.1811134 637.9103284 645.2521404 649.5475557 657.0901010 660.1865465 663.8050365 669.7476862 682.5314133 684.0517481 688.8651907 693.1327001 700.9192297 705.0026363 707.1081455 708.6427517 715.4141218 718.9012088 724.2172222 725.3416573 729.7864870 733.0043574 740.1988555 745.3937434 748.4646984 749.1858390 758.1505532 758.8329083 763.0907685 764.7501162 768.8084960 774.5736565 776.5067425 778.2472274 786.4549978 788.9914511 792.0758000 795.7448057 799.0063306 802.6222878 806.4747315 811.6909210 815.0507186 819.0864233 823.8869834 825.9563801 831.9425364 834.9997250 838.2154549 838.8532335 843.5217390 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4198 Rtb_to_modes> Number of blocs = 186 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9860E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4611 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.328 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.350 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.020 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.378 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.675 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.048 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.034 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.539 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.042 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.435 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.644 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.181 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.34 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99996 0.99997 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 75564 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99996 0.99997 1.00000 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2608270829352786.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2608270829352786.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2608270829352786.atom Openam> file on opening on unit 11: 2608270829352786.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 557 First residue number = 1 Last residue number = 557 Number of atoms found = 4198 Mean number per residue = 7.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9860E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4611 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.328 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.350 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.020 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.378 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.675 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.048 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.034 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.539 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.042 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.435 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.644 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.181 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.34 Bfactors> 106 vectors, 12594 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.461100 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.473 for 557 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.030 +/- 0.04 Bfactors> = 95.206 +/- 4.94 Bfactors> Shiftng-fct= 95.176 Bfactors> Scaling-fct= 136.296 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2608270829352786.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2608270829352786.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.9 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Chkmod> That is: 4198 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8244 0.0034 0.6793 0.0034 0.6783 0.0034 0.8234 0.0034 0.8010 0.0034 0.9045 73.7351 0.4413 125.1341 0.2166 126.1663 0.3993 188.7036 0.5667 199.5751 0.5919 208.1638 0.5142 218.4726 0.6114 243.6314 0.1587 255.5597 0.2740 266.9113 0.2907 296.0855 0.3319 300.2182 0.5640 329.0195 0.5676 346.7981 0.4972 359.9776 0.3937 383.6047 0.3407 388.6433 0.2148 395.8577 0.2769 408.7536 0.3890 414.0558 0.5214 421.8143 0.3265 437.1879 0.3442 445.8671 0.3039 448.6353 0.3994 461.9723 0.0984 463.8826 0.3600 475.3072 0.5244 483.5462 0.1553 488.7608 0.3287 497.3698 0.4035 502.3235 0.4797 507.3451 0.4946 515.5296 0.2923 531.0767 0.5153 532.6286 0.2215 544.3433 0.4794 547.5828 0.3973 552.4065 0.4863 562.3491 0.4673 568.1897 0.5384 576.6353 0.4073 580.6089 0.4276 592.6686 0.3998 596.4366 0.3064 603.8045 0.5707 612.0477 0.4281 620.9413 0.2264 622.1743 0.4982 626.4239 0.1782 634.1872 0.3001 637.8949 0.3737 645.2463 0.3941 649.5264 0.4577 657.1066 0.4353 660.1500 0.3060 663.8014 0.5962 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structure for DQ=40 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=120 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=140 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=160 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=180 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=200 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom making animated gifs 21 models are in 2608270829352786.7.pdb, 3 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 17 will be plotted MODEL 21 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21 models are in 2608270829352786.7.pdb, 3 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 17 will be plotted MODEL 21 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21 models are in 2608270829352786.7.pdb, 3 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 17 will be plotted MODEL 21 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2608270829352786 8 -200 200 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-200 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-140 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=120 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=140 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=160 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=180 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=200 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom making animated gifs 21 models are in 2608270829352786.8.pdb, 3 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 17 will be plotted MODEL 21 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21 models are in 2608270829352786.8.pdb, 3 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 17 will be plotted MODEL 21 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21 models are in 2608270829352786.8.pdb, 3 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 17 will be plotted MODEL 21 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2608270829352786 9 -200 200 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-200 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-140 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2608270829352786.eigenfacs 2608270829352786.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2608270829352786.eigenfacs 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