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***  3096  ***

LOGs for ID: 2609071050242286421

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2609071050242286421.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2609071050242286421.atom to be opened. Openam> File opened: 2609071050242286421.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 118 First residue number = 8 Last residue number = 125 Number of atoms found = 1874 Mean number per residue = 15.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 10.946198 +/- 8.843793 From: -7.504000 To: 29.799000 = 15.263478 +/- 7.147685 From: -0.809000 To: 31.389000 = 13.528608 +/- 8.617054 From: -4.881000 To: 35.281000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 8.2413 % Filled. Pdbmat> 1302637 non-zero elements. Pdbmat> 143512 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 153.16 +/- 48.70 Maximum number = 259 Minimum number = 35 Pdbmat> Matrix trace = 2.870240E+06 Pdbmat> Larger element = 943.698 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 118 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2609071050242286421.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2609071050242286421.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2609071050242286421.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1874 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 118 residues. Blocpdb> 9 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 12 atoms in block 2 Block first atom: 10 Blocpdb> 20 atoms in block 3 Block first atom: 22 Blocpdb> 19 atoms in block 4 Block first atom: 42 Blocpdb> 7 atoms in block 5 Block first atom: 61 Blocpdb> 19 atoms in block 6 Block first atom: 68 Blocpdb> 7 atoms in block 7 Block first atom: 87 Blocpdb> 22 atoms in block 8 Block first atom: 94 Blocpdb> 19 atoms in block 9 Block first atom: 116 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 135 Blocpdb> 12 atoms in block 11 Block first atom: 147 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 159 Blocpdb> 14 atoms in block 13 Block first atom: 179 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 193 Blocpdb> 7 atoms in block 15 Block first atom: 209 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 216 Blocpdb> 14 atoms in block 17 Block first atom: 235 Blocpdb> 22 atoms in block 18 Block first atom: 249 Blocpdb> 22 atoms in block 19 Block first atom: 271 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 293 Blocpdb> 10 atoms in block 21 Block first atom: 309 Blocpdb> 16 atoms in block 22 Block first atom: 319 Blocpdb> 14 atoms in block 23 Block first atom: 335 Blocpdb> 11 atoms in block 24 Block first atom: 349 Blocpdb> 11 atoms in block 25 Block first atom: 360 Blocpdb> 22 atoms in block 26 Block first atom: 371 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 393 Blocpdb> 12 atoms in block 28 Block first atom: 410 Blocpdb> 10 atoms in block 29 Block first atom: 422 Blocpdb> 24 atoms in block 30 Block first atom: 432 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 456 Blocpdb> 19 atoms in block 32 Block first atom: 470 Blocpdb> 20 atoms in block 33 Block first atom: 489 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 509 Blocpdb> 7 atoms in block 35 Block first atom: 524 Blocpdb> 19 atoms in block 36 Block first atom: 531 Blocpdb> 32 atoms in block 37 Block first atom: 550 Blocpdb> 17 atoms in block 38 Block first atom: 582 Blocpdb> 7 atoms in block 39 Block first atom: 599 Blocpdb> 11 atoms in block 40 Block first atom: 606 Blocpdb> 16 atoms in block 41 Block first atom: 617 Blocpdb> 24 atoms in block 42 Block first atom: 633 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 657 Blocpdb> 19 atoms in block 44 Block first atom: 673 Blocpdb> 24 atoms in block 45 Block first atom: 692 Blocpdb> 17 atoms in block 46 Block first atom: 716 Blocpdb> 22 atoms in block 47 Block first atom: 733 Blocpdb> 12 atoms in block 48 Block first atom: 755 Blocpdb> 12 atoms in block 49 Block first atom: 767 Blocpdb> 11 atoms in block 50 Block first atom: 779 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 790 Blocpdb> 22 atoms in block 52 Block first atom: 809 Blocpdb> 16 atoms in block 53 Block first atom: 831 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 847 Blocpdb> 11 atoms in block 55 Block first atom: 867 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 878 Blocpdb> 28 atoms in block 57 Block first atom: 892 Blocpdb> 11 atoms in block 58 Block first atom: 920 Blocpdb> 14 atoms in block 59 Block first atom: 931 Blocpdb> 17 atoms in block 60 Block first atom: 945 Blocpdb> 19 atoms in block 61 Block first atom: 962 Blocpdb> 7 atoms in block 62 Block first atom: 981 Blocpdb> 10 atoms in block 63 Block first atom: 988 Blocpdb> 7 atoms in block 64 Block first atom: 998 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 1005 Blocpdb> 12 atoms in block 66 Block first atom: 1024 Blocpdb> 24 atoms in block 67 Block first atom: 1036 Blocpdb> 10 atoms in block 68 Block first atom: 1060 Blocpdb> 14 atoms in block 69 Block first atom: 1070 Blocpdb> 12 atoms in block 70 Block first atom: 1084 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1096 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 1112 Blocpdb> 24 atoms in block 73 Block first atom: 1123 Blocpdb> 20 atoms in block 74 Block first atom: 1147 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1167 Blocpdb> 10 atoms in block 76 Block first atom: 1186 Blocpdb> 14 atoms in block 77 Block first atom: 1196 Blocpdb> 10 atoms in block 78 Block first atom: 1210 Blocpdb> 17 atoms in block 79 Block first atom: 1220 Blocpdb> 15 atoms in block 80 Block first atom: 1237 Blocpdb> 7 atoms in block 81 Block first atom: 1252 Blocpdb> 16 atoms in block 82 Block first atom: 1259 Blocpdb> 20 atoms in block 83 Block first atom: 1275 Blocpdb> 12 atoms in block 84 Block first atom: 1295 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1307 Blocpdb> 14 atoms in block 86 Block first atom: 1323 Blocpdb> 7 atoms in block 87 Block first atom: 1337 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 1344 Blocpdb> 14 atoms in block 89 Block first atom: 1366 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 1380 Blocpdb> 19 atoms in block 91 Block first atom: 1399 Blocpdb> 7 atoms in block 92 Block first atom: 1418 Blocpdb> 14 atoms in block 93 Block first atom: 1425 Blocpdb> 10 atoms in block 94 Block first atom: 1439 Blocpdb> 14 atoms in block 95 Block first atom: 1449 Blocpdb> 24 atoms in block 96 Block first atom: 1463 Blocpdb> 7 atoms in block 97 Block first atom: 1487 Blocpdb> 17 atoms in block 98 Block first atom: 1494 Blocpdb> 21 atoms in block 99 Block first atom: 1511 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 1532 Blocpdb> 21 atoms in block 101 Block first atom: 1554 Blocpdb> 24 atoms in block 102 Block first atom: 1575 Blocpdb> 28 atoms in block 103 Block first atom: 1599 Blocpdb> 22 atoms in block 104 Block first atom: 1627 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1649 Blocpdb> 15 atoms in block 106 Block first atom: 1665 Blocpdb> 14 atoms in block 107 Block first atom: 1680 Blocpdb> 28 atoms in block 108 Block first atom: 1694 Blocpdb> 14 atoms in block 109 Block first atom: 1722 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1736 Blocpdb> 20 atoms in block 111 Block first atom: 1752 Blocpdb> 16 atoms in block 112 Block first atom: 1772 Blocpdb> 12 atoms in block 113 Block first atom: 1788 Blocpdb> 21 atoms in block 114 Block first atom: 1800 Blocpdb> 10 atoms in block 115 Block first atom: 1821 Blocpdb> 10 atoms in block 116 Block first atom: 1831 Blocpdb> 19 atoms in block 117 Block first atom: 1841 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1859 Blocpdb> 118 blocks. Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1302755 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 5622 Prepmat> Matrix trace = 2870240.0000 Prepmat> Last element read: 5622 5622 155.8228 Prepmat> 7022 lines saved. Prepmat> 5461 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1874 RTB> Total mass = 1874.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1874 RTB> Number of blocks = 118 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 325289.8325 RTB> 54390 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 708 Diagstd> Nb of non-zero elements: 54390 Diagstd> Projected matrix trace = 325289.8325 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 708 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 325289.8325 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 7.4648337 11.6143247 14.3116660 15.6289815 18.6492146 24.1227442 31.6263580 34.6731918 37.7007450 39.2195883 41.8693643 45.5577000 48.7606221 53.4490063 55.0945094 57.2906385 63.0048467 65.3923997 67.1820962 69.2030823 72.8450015 75.2458633 80.2096872 81.7478247 85.6104500 87.0926217 90.3059962 95.1234748 95.5361107 99.0047000 104.8808418 105.5215609 105.7136043 108.6499072 112.4778054 113.8400262 115.0366707 117.8694020 120.1545231 123.4399808 125.0170865 126.5251673 129.7774926 130.6461625 134.4160642 134.9522208 137.9717345 140.6424862 142.2542427 145.1537252 145.9689568 146.4691629 149.3938585 151.6906647 153.7181052 155.3088303 156.0000644 158.8462962 162.1510461 163.9491108 164.1893656 164.4667912 167.8842152 169.7749832 171.1112534 173.0927201 173.9188280 176.5223022 178.5012502 180.0139020 181.7875877 184.2105015 186.7470426 187.8314419 189.1947597 189.8425778 191.9397285 193.0608328 194.9455244 197.2932288 199.7861211 200.6085359 201.9948813 205.5612766 206.0191260 208.2602766 209.9244363 211.2356046 213.2208672 214.1043734 215.1060200 215.9350244 217.0750299 218.4044422 220.5557790 221.6761438 223.9395158 225.4036695 226.8565600 227.5952159 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034292 0.0034316 0.0034321 0.0034334 0.0034335 0.0034365 296.6916677 370.0771428 410.8094042 429.2997334 468.9489352 533.3455015 610.6886829 639.4287971 666.7610879 680.0593174 702.6571398 732.9530820 758.2805200 793.8987130 806.0267223 821.9343138 861.9503686 878.1302091 890.0656801 903.3540570 926.8194911 941.9689661 972.5427299 981.8234095 1004.7515160 1013.4118129 1031.9379264 1059.1052805 1061.3999403 1080.4960567 1112.0987751 1115.4905194 1116.5051238 1131.9049526 1151.6717057 1158.6246760 1164.6982751 1178.9511772 1190.3244171 1206.4885452 1214.1713112 1221.4726311 1237.0719790 1241.2052651 1258.9859042 1261.4943163 1275.5290154 1287.8152032 1295.1733340 1308.3061210 1311.9749180 1314.2209317 1327.2772556 1337.4412305 1346.3494324 1353.2977342 1356.3059567 1368.6229765 1382.7865853 1390.4321882 1391.4506010 1392.6256498 1407.0198118 1414.9207913 1420.4781789 1428.6790676 1432.0842893 1442.7632509 1450.8279426 1456.9622628 1464.1224288 1473.8472409 1483.9598359 1488.2621148 1493.6534003 1496.2084097 1504.4498605 1508.8371478 1516.1840191 1525.2863031 1534.8924073 1538.0483370 1543.3536820 1556.9186942 1558.6516028 1567.1064594 1573.3551936 1578.2610598 1585.6602269 1588.9420175 1592.6544621 1595.7205035 1599.9271749 1604.8188394 1612.7033981 1616.7942624 1625.0272488 1630.3309427 1635.5768368 1638.2374315 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1874 Rtb_to_modes> Number of blocs = 118 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9722E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9861E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9889E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.465 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99996 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99996 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00004 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00004 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00005 0.99999 0.99997 1.00002 1.00002 0.99998 0.99998 0.99995 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00003 0.99996 1.00001 1.00004 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609071050242286421.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609071050242286421.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2609071050242286421.atom Openam> file on opening on unit 11: 2609071050242286421.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 118 First residue number = 8 Last residue number = 125 Number of atoms found = 1874 Mean number per residue = 15.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9722E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9861E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9889E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.465 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.31 Rdmodfacs> Numero du 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Valeur propre du vecteur en lecture: 48.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.25 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lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 149.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 156.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 163.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 167.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 169.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 171.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 178.5 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 194.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 197.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 199.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 200.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 202.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 205.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 206.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 209.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 211.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 213.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 214.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 215.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 215.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 217.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 218.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 220.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 221.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 223.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 225.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 226.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 227.6 Bfactors> 106 vectors, 5622 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 7.465000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.405 for 124 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.008 +/- 0.01 Bfactors> = 23.467 +/- 7.04 Bfactors> Shiftng-fct= 23.458 Bfactors> Scaling-fct= 978.541 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609071050242286421.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609071050242286421.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4290E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1464. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1474. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1484. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1488. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1494. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1496. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1504. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1509. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1516. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1630. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1636. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1638. Chkmod> 106 vectors, 5622 coordinates in file. Chkmod> That is: 1874 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 13 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 71 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8767 0.0034 0.9327 0.0034 0.7782 0.0034 0.7553 0.0034 0.7050 0.0034 0.7172 296.6822 0.4485 369.9924 0.5702 410.7679 0.4096 429.2953 0.5873 468.9387 0.3646 533.2923 0.5169 610.6976 0.2527 639.3719 0.3324 666.7259 0.1432 680.0337 0.2934 702.6323 0.5945 732.9401 0.5727 758.2431 0.6104 793.8720 0.3679 805.9591 0.4293 821.8945 0.2552 861.8802 0.4258 878.0764 0.2689 890.0136 0.3656 903.2952 0.4913 926.8115 0.2629 941.9544 0.3316 972.5029 0.2667 981.7943 0.3286 1004.7057 0.3764 1013.3531 0.3881 1031.9165 0.2199 1059.0405 0.3547 1061.3760 0.3617 1080.4240 0.4499 1112.1526 0.4460 1115.3287 0.4253 1116.3854 0.4964 1131.5964 0.3188 1151.7359 0.2282 1158.3712 0.3792 1164.4626 0.3645 1179.0536 0.2637 1190.4985 0.4399 1206.2414 0.5008 1214.0362 0.4269 1221.2987 0.4781 1237.1261 0.3017 1240.9327 0.4389 1258.8566 0.4163 1261.6634 0.4100 1275.6049 0.3971 1287.5654 0.4027 1295.3260 0.3311 1308.4585 0.4658 1312.0581 0.3859 1314.3028 0.4277 1327.2476 0.5031 1337.4250 0.5347 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