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***  LBR  ***

LOGs for ID: 2609080407172443039

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2609080407172443039.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2609080407172443039.atom to be opened. Openam> File opened: 2609080407172443039.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1230 First residue number = 1 Last residue number = 615 Number of atoms found = 10035 Mean number per residue = 8.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = 2.021221 +/- 17.968230 From: -37.869000 To: 61.871000 = 1.451265 +/- 13.964977 From: -55.809000 To: 35.688000 = -16.148844 +/- 26.554212 From: -108.966000 To: 31.304000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3685 % Filled. Pdbmat> 6201417 non-zero elements. Pdbmat> 682463 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 136.02 +/- 58.01 Maximum number = 248 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 1.364926E+07 Pdbmat> Larger element = 892.638 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1230 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2609080407172443039.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2609080407172443039.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2609080407172443039.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10035 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1230 residues. Blocpdb> 57 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 50 atoms in block 2 Block first atom: 58 Blocpdb> 56 atoms in block 3 Block first atom: 108 Blocpdb> 65 atoms in block 4 Block first atom: 164 Blocpdb> 52 atoms in block 5 Block first atom: 229 Blocpdb> 64 atoms in block 6 Block first atom: 281 Blocpdb> 53 atoms in block 7 Block first atom: 345 Blocpdb> 58 atoms in block 8 Block first atom: 398 Blocpdb> 63 atoms in block 9 Block first atom: 456 Blocpdb> 42 atoms in block 10 Block first atom: 519 Blocpdb> 56 atoms in block 11 Block first atom: 561 Blocpdb> 57 atoms in block 12 Block first atom: 617 Blocpdb> 53 atoms in block 13 Block first atom: 674 Blocpdb> 53 atoms in block 14 Block first atom: 727 Blocpdb> 49 atoms in block 15 Block first atom: 780 Blocpdb> 62 atoms in block 16 Block first atom: 829 Blocpdb> 54 atoms in block 17 Block first atom: 891 Blocpdb> 55 atoms in block 18 Block first atom: 945 Blocpdb> 59 atoms in block 19 Block first atom: 1000 Blocpdb> 56 atoms in block 20 Block first atom: 1059 Blocpdb> 58 atoms in block 21 Block first atom: 1115 Blocpdb> 59 atoms in block 22 Block first atom: 1173 Blocpdb> 56 atoms in block 23 Block first atom: 1232 Blocpdb> 55 atoms in block 24 Block first atom: 1288 Blocpdb> 65 atoms in block 25 Block first atom: 1343 Blocpdb> 57 atoms in block 26 Block first atom: 1408 Blocpdb> 60 atoms in block 27 Block first atom: 1465 Blocpdb> 56 atoms in block 28 Block first atom: 1525 Blocpdb> 60 atoms in block 29 Block first atom: 1581 Blocpdb> 54 atoms in block 30 Block first atom: 1641 Blocpdb> 48 atoms in block 31 Block first atom: 1695 Blocpdb> 53 atoms in block 32 Block first atom: 1743 Blocpdb> 62 atoms in block 33 Block first atom: 1796 Blocpdb> 56 atoms in block 34 Block first atom: 1858 Blocpdb> 55 atoms in block 35 Block first atom: 1914 Blocpdb> 56 atoms in block 36 Block first atom: 1969 Blocpdb> 67 atoms in block 37 Block first atom: 2025 Blocpdb> 64 atoms in block 38 Block first atom: 2092 Blocpdb> 63 atoms in block 39 Block first atom: 2156 Blocpdb> 51 atoms in block 40 Block first atom: 2219 Blocpdb> 50 atoms in block 41 Block first atom: 2270 Blocpdb> 63 atoms in block 42 Block first atom: 2320 Blocpdb> 59 atoms in block 43 Block first atom: 2383 Blocpdb> 52 atoms in block 44 Block first atom: 2442 Blocpdb> 53 atoms in block 45 Block first atom: 2494 Blocpdb> 60 atoms in block 46 Block first atom: 2547 Blocpdb> 67 atoms in block 47 Block first atom: 2607 Blocpdb> 48 atoms in block 48 Block first atom: 2674 Blocpdb> 53 atoms in block 49 Block first atom: 2722 Blocpdb> 62 atoms in block 50 Block first atom: 2775 Blocpdb> 53 atoms in block 51 Block first atom: 2837 Blocpdb> 41 atoms in block 52 Block first atom: 2890 Blocpdb> 61 atoms in block 53 Block first atom: 2931 Blocpdb> 62 atoms in block 54 Block first atom: 2992 Blocpdb> 59 atoms in block 55 Block first atom: 3054 Blocpdb> 56 atoms in block 56 Block first atom: 3113 Blocpdb> 56 atoms in block 57 Block first atom: 3169 Blocpdb> 52 atoms in block 58 Block first atom: 3225 Blocpdb> 62 atoms in block 59 Block first atom: 3277 Blocpdb> 46 atoms in block 60 Block first atom: 3339 Blocpdb> 57 atoms in block 61 Block first atom: 3385 Blocpdb> 55 atoms in block 62 Block first atom: 3442 Blocpdb> 61 atoms in block 63 Block first atom: 3497 Blocpdb> 54 atoms in block 64 Block first atom: 3558 Blocpdb> 56 atoms in block 65 Block first atom: 3612 Blocpdb> 51 atoms in block 66 Block first atom: 3668 Blocpdb> 65 atoms in block 67 Block first atom: 3719 Blocpdb> 63 atoms in block 68 Block first atom: 3784 Blocpdb> 53 atoms in block 69 Block first atom: 3847 Blocpdb> 56 atoms in block 70 Block first atom: 3900 Blocpdb> 50 atoms in block 71 Block first atom: 3956 Blocpdb> 58 atoms in block 72 Block first atom: 4006 Blocpdb> 56 atoms in block 73 Block first atom: 4064 Blocpdb> 56 atoms in block 74 Block first atom: 4120 Blocpdb> 56 atoms in block 75 Block first atom: 4176 Blocpdb> 51 atoms in block 76 Block first atom: 4232 Blocpdb> 55 atoms in block 77 Block first atom: 4283 Blocpdb> 64 atoms in block 78 Block first atom: 4338 Blocpdb> 56 atoms in block 79 Block first atom: 4402 Blocpdb> 54 atoms in block 80 Block first atom: 4458 Blocpdb> 54 atoms in block 81 Block first atom: 4512 Blocpdb> 66 atoms in block 82 Block first atom: 4566 Blocpdb> 61 atoms in block 83 Block first atom: 4632 Blocpdb> 63 atoms in block 84 Block first atom: 4693 Blocpdb> 67 atoms in block 85 Block first atom: 4756 Blocpdb> 60 atoms in block 86 Block first atom: 4823 Blocpdb> 63 atoms in block 87 Block first atom: 4883 Blocpdb> 59 atoms in block 88 Block first atom: 4946 Blocpdb> 60 atoms in block 89 Block first atom: 5005 Blocpdb> 48 atoms in block 90 Block first atom: 5065 Blocpdb> 53 atoms in block 91 Block first atom: 5113 Blocpdb> 63 atoms in block 92 Block first atom: 5166 Blocpdb> 42 atoms in block 93 Block first atom: 5229 Blocpdb> 69 atoms in block 94 Block first atom: 5271 Blocpdb> 51 atoms in block 95 Block first atom: 5340 Blocpdb> 60 atoms in block 96 Block first atom: 5391 Blocpdb> 64 atoms in block 97 Block first atom: 5451 Blocpdb> 40 atoms in block 98 Block first atom: 5515 Blocpdb> 56 atoms in block 99 Block first atom: 5555 Blocpdb> 56 atoms in block 100 Block first atom: 5611 Blocpdb> 53 atoms in block 101 Block first atom: 5667 Blocpdb> 56 atoms in block 102 Block first atom: 5720 Blocpdb> 40 atoms in block 103 Block first atom: 5776 Blocpdb> 66 atoms in block 104 Block first atom: 5816 Blocpdb> 62 atoms in block 105 Block first atom: 5882 Blocpdb> 64 atoms in block 106 Block first atom: 5944 Blocpdb> 54 atoms in block 107 Block first atom: 6008 Blocpdb> 49 atoms in block 108 Block first atom: 6062 Blocpdb> 54 atoms in block 109 Block first atom: 6111 Blocpdb> 54 atoms in block 110 Block first atom: 6165 Blocpdb> 50 atoms in block 111 Block first atom: 6219 Blocpdb> 56 atoms in block 112 Block first atom: 6269 Blocpdb> 66 atoms in block 113 Block first atom: 6325 Blocpdb> 63 atoms in block 114 Block first atom: 6391 Blocpdb> 61 atoms in block 115 Block first atom: 6454 Blocpdb> 63 atoms in block 116 Block first atom: 6515 Blocpdb> 62 atoms in block 117 Block first atom: 6578 Blocpdb> 52 atoms in block 118 Block first atom: 6640 Blocpdb> 51 atoms in block 119 Block first atom: 6692 Blocpdb> 59 atoms in block 120 Block first atom: 6743 Blocpdb> 73 atoms in block 121 Block first atom: 6802 Blocpdb> 58 atoms in block 122 Block first atom: 6875 Blocpdb> 56 atoms in block 123 Block first atom: 6933 Blocpdb> 57 atoms in block 124 Block first atom: 6989 Blocpdb> 65 atoms in block 125 Block first atom: 7046 Blocpdb> 62 atoms in block 126 Block first atom: 7111 Blocpdb> 68 atoms in block 127 Block first atom: 7173 Blocpdb> 64 atoms in block 128 Block first atom: 7241 Blocpdb> 55 atoms in block 129 Block first atom: 7305 Blocpdb> 64 atoms in block 130 Block first atom: 7360 Blocpdb> 55 atoms in block 131 Block first atom: 7424 Blocpdb> 57 atoms in block 132 Block first atom: 7479 Blocpdb> 54 atoms in block 133 Block first atom: 7536 Blocpdb> 53 atoms in block 134 Block first atom: 7590 Blocpdb> 58 atoms in block 135 Block first atom: 7643 Blocpdb> 51 atoms in block 136 Block first atom: 7701 Blocpdb> 57 atoms in block 137 Block first atom: 7752 Blocpdb> 69 atoms in block 138 Block first atom: 7809 Blocpdb> 51 atoms in block 139 Block first atom: 7878 Blocpdb> 36 atoms in block 140 Block first atom: 7929 Blocpdb> 55 atoms in block 141 Block first atom: 7965 Blocpdb> 66 atoms in block 142 Block first atom: 8020 Blocpdb> 56 atoms in block 143 Block first atom: 8086 Blocpdb> 54 atoms in block 144 Block first atom: 8142 Blocpdb> 64 atoms in block 145 Block first atom: 8196 Blocpdb> 62 atoms in block 146 Block first atom: 8260 Blocpdb> 64 atoms in block 147 Block first atom: 8322 Blocpdb> 51 atoms in block 148 Block first atom: 8386 Blocpdb> 59 atoms in block 149 Block first atom: 8437 Blocpdb> 59 atoms in block 150 Block first atom: 8496 Blocpdb> 57 atoms in block 151 Block first atom: 8555 Blocpdb> 61 atoms in block 152 Block first atom: 8612 Blocpdb> 45 atoms in block 153 Block first atom: 8673 Blocpdb> 53 atoms in block 154 Block first atom: 8718 Blocpdb> 60 atoms in block 155 Block first atom: 8771 Blocpdb> 60 atoms in block 156 Block first atom: 8831 Blocpdb> 46 atoms in block 157 Block first atom: 8891 Blocpdb> 58 atoms in block 158 Block first atom: 8937 Blocpdb> 62 atoms in block 159 Block first atom: 8995 Blocpdb> 58 atoms in block 160 Block first atom: 9057 Blocpdb> 51 atoms in block 161 Block first atom: 9115 Blocpdb> 54 atoms in block 162 Block first atom: 9166 Blocpdb> 65 atoms in block 163 Block first atom: 9220 Blocpdb> 52 atoms in block 164 Block first atom: 9285 Blocpdb> 55 atoms in block 165 Block first atom: 9337 Blocpdb> 57 atoms in block 166 Block first atom: 9392 Blocpdb> 56 atoms in block 167 Block first atom: 9449 Blocpdb> 56 atoms in block 168 Block first atom: 9505 Blocpdb> 48 atoms in block 169 Block first atom: 9561 Blocpdb> 67 atoms in block 170 Block first atom: 9609 Blocpdb> 65 atoms in block 171 Block first atom: 9676 Blocpdb> 55 atoms in block 172 Block first atom: 9741 Blocpdb> 66 atoms in block 173 Block first atom: 9796 Blocpdb> 55 atoms in block 174 Block first atom: 9862 Blocpdb> 62 atoms in block 175 Block first atom: 9917 Blocpdb> 57 atoms in block 176 Block first atom: 9978 Blocpdb> 176 blocks. Blocpdb> At most, 73 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 36 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6201593 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 30105 Prepmat> Matrix trace = 13649260.0000 Prepmat> Last element read: 30105 30105 553.2759 Prepmat> 15577 lines saved. Prepmat> 13421 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10035 RTB> Total mass = 10035.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10035 RTB> Number of blocks = 176 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 363148.9133 RTB> 74940 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1056 Diagstd> Nb of non-zero elements: 74940 Diagstd> Projected matrix trace = 363148.9133 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1056 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 363148.9133 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0049783 0.0103294 0.0131028 0.0244127 0.0386222 0.0711805 0.0959903 0.1195869 0.1400852 0.1509800 0.1803253 0.2011265 0.2799652 0.2850635 0.4089176 0.4571387 0.4820869 0.5346605 0.6723198 0.7703284 0.8092213 0.9496722 0.9711826 1.1324724 1.2164208 1.2402088 1.3148372 1.4075522 1.7473486 1.7959237 2.3171437 2.3804383 2.4550485 2.5801054 3.1667336 3.2916902 3.6615279 3.7424003 4.2596176 4.4147718 4.5903691 4.8306261 5.0456999 5.3773591 5.9715000 7.1421997 7.2767003 7.7144088 7.8698244 8.5423168 8.9931636 9.2075889 9.6710631 10.0686081 10.5886568 10.9847941 11.4868867 12.0247881 12.6956100 12.7299551 13.3896203 13.7291786 14.0188638 14.5314848 14.7831735 16.2405274 17.7527357 18.1794510 19.1545244 20.4306627 21.6585417 21.6985170 21.9300571 22.8087128 23.3746458 23.7121504 24.9028129 25.2680307 25.9471651 26.6863671 27.9210518 28.3906067 28.9622625 29.1899735 30.0643969 30.2955062 31.3561392 32.1473147 33.1243337 34.0643230 34.6558936 35.4406059 36.5213589 36.5420650 37.4165533 38.3217149 38.6120238 40.6409699 41.3545347 42.7266577 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034319 0.0034323 0.0034328 0.0034338 0.0034348 0.0034356 7.6619091 11.0365523 12.4301554 16.9669243 21.3409600 28.9718297 33.6441085 37.5523450 40.6435241 42.1944193 46.1130237 48.7001114 57.4575734 57.9783859 69.4405532 73.4208265 75.3976713 79.4025309 89.0396035 95.3088501 97.6852384 105.8235052 107.0152661 115.5604138 119.7670101 120.9324042 124.5177540 128.8331212 143.5440053 145.5255418 165.2995844 167.5420202 170.1474002 174.4271173 193.2417870 197.0174800 207.7908656 210.0730785 224.1199847 228.1652032 232.6585860 238.6695384 243.9248186 251.8139586 265.3609419 290.2092661 292.9291056 301.6106035 304.6335994 317.3826019 325.6503332 329.5097283 337.7010332 344.5720123 353.3586412 359.9077854 368.0412092 376.5598360 386.9207902 387.4438008 397.3556664 402.3625558 406.5853141 413.9522775 417.5217622 437.6181682 457.5387947 463.0049804 475.2596754 490.8361123 505.3704985 505.8366665 508.5283411 518.6157101 525.0102708 528.7869766 541.9004143 545.8596322 553.1465875 560.9704806 573.8008235 578.6055790 584.4017707 586.6946537 595.4174086 597.7015571 608.0741927 615.6978415 624.9839378 633.7896774 639.2692739 646.4662390 656.2491357 656.4351426 664.2432809 672.2297800 674.7712388 692.2728705 698.3238092 709.8142944 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10035 Rtb_to_modes> Number of blocs = 176 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9883E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9905E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9783E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0329E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3103E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4413E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8622E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1181E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.5990E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1196 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1401 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1510 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1803 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2011 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2851 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4089 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4571 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4821 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5347 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6723 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7703 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8092 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9497 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9712 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.132 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.216 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.240 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.315 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.408 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.747 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.796 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.317 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.380 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.455 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.580 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.167 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.292 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.662 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.742 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.260 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.590 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.831 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.046 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.377 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.972 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.142 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.277 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.714 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.870 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.542 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.993 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.208 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.671 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.73 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1056 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 0.99997 1.00001 1.00001 0.99996 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 0.99995 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00005 0.99999 0.99997 1.00004 0.99998 0.99997 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 0.99996 0.99998 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00005 1.00001 0.99998 1.00002 0.99996 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 0.99997 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 0.99995 1.00003 0.99997 1.00004 0.99999 1.00006 1.00001 1.00001 1.00004 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00005 1.00002 0.99995 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 180630 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 0.99997 1.00001 1.00001 0.99996 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 0.99995 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00005 0.99999 0.99997 1.00004 0.99998 0.99997 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 0.99996 0.99998 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00005 1.00001 0.99998 1.00002 0.99996 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 0.99997 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999 0.99995 1.00003 0.99997 1.00004 0.99999 1.00006 1.00001 1.00001 1.00004 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00005 1.00002 0.99995 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609080407172443039.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609080407172443039.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2609080407172443039.atom Openam> file on opening on unit 11: 2609080407172443039.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1230 First residue number = 1 Last residue number = 615 Number of atoms found = 10035 Mean number per residue = 8.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9883E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9905E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9783E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0329E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3103E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4413E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8622E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.1181E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.5990E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1196 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1401 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1510 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1803 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2011 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2851 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4089 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4571 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4821 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5347 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6723 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7703 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8092 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9497 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9712 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.132 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.216 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.240 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.315 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.408 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.747 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.796 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.317 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.380 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.455 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.580 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.167 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.292 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.662 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.742 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.260 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.590 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.831 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.046 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.377 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.972 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.142 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.277 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.714 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.870 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.542 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.993 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.208 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.671 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.73 Bfactors> 106 vectors, 30105 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.004978 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.792 +/- 2.13 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.792 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609080407172443039.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609080407172443039.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.662 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.4 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Chkmod> That is: 10035 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 25 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 30 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 95 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 105 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.5815 0.0034 0.6957 0.0034 0.7986 0.0034 0.9416 0.0034 0.8370 0.0034 0.8810 7.6616 0.1403 11.0358 0.1552 12.4297 0.1058 16.9663 0.1945 21.3400 0.0993 28.9707 0.1327 33.6426 0.1043 37.5528 0.1617 40.6439 0.2757 42.1954 0.3689 46.1078 0.0766 48.6948 0.1885 57.4587 0.1995 57.9796 0.3837 69.4361 0.1756 73.4146 0.2314 75.3955 0.4002 79.4021 0.1965 89.0345 0.1975 95.3030 0.0986 97.6798 0.2057 105.8205 0.0794 107.0116 0.3570 115.5314 0.1635 119.7411 0.1351 120.9170 0.1253 124.5201 0.1653 128.8481 0.1758 143.5235 0.1478 145.5224 0.2994 165.2874 0.3056 167.5194 0.0673 170.1384 0.1896 174.4161 0.1820 193.2416 0.0487 197.0183 0.1855 207.7953 0.1470 210.0528 0.1767 224.1204 0.0686 228.1613 0.0699 232.6392 0.1120 238.6685 0.0999 243.9216 0.1067 251.7947 0.0606 265.3607 0.1416 290.1928 0.1290 292.9226 0.4471 301.5897 0.1454 304.6239 0.0912 317.3631 0.2584 325.6334 0.2625 329.5029 0.0975 337.6854 0.3173 344.5810 0.0540 353.3659 0.0974 359.8138 0.1065 368.0753 0.2240 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perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom making animated gifs 11 models are in 2609080407172443039.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609080407172443039.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609080407172443039.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2609080407172443039 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609080407172443039.eigenfacs 2609080407172443039.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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