***    ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2609081731422618845.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2609081731422618845.atom to be opened.
Openam> File opened: 2609081731422618845.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 370
First residue number = 154
Last residue number = 601
Number of atoms found = 3033
Mean number per residue = 8.2
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 140.623671 +/- 13.575382 From: 107.213000 To: 171.393000
= 9.159645 +/- 10.812836 From: -16.165000 To: 35.619000
= 8.048876 +/- 12.813686 From: -20.013000 To: 39.026000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'ZN ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 1 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.6734 % Filled.
Pdbmat> 1106818 non-zero elements.
Pdbmat> 120980 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.78 +/- 23.00
Maximum number = 125
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 2.419600E+06
Pdbmat> Larger element = 471.587
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
370 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2609081731422618845.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2609081731422618845.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2609081731422618845.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3033 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 370 residues.
Blocpdb> 20 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 16 atoms in block 2
Block first atom: 21
Blocpdb> 10 atoms in block 3
Block first atom: 37
Blocpdb> 11 atoms in block 4
Block first atom: 47
Blocpdb> 11 atoms in block 5
Block first atom: 58
Blocpdb> 17 atoms in block 6
Block first atom: 69
Blocpdb> 16 atoms in block 7
Block first atom: 86
Blocpdb> 15 atoms in block 8
Block first atom: 102
Blocpdb> 18 atoms in block 9
Block first atom: 117
Blocpdb> 17 atoms in block 10
Block first atom: 135
Blocpdb> 14 atoms in block 11
Block first atom: 152
Blocpdb> 19 atoms in block 12
Block first atom: 166
Blocpdb> 16 atoms in block 13
Block first atom: 185
Blocpdb> 13 atoms in block 14
Block first atom: 201
Blocpdb> 10 atoms in block 15
Block first atom: 214
Blocpdb> 12 atoms in block 16
Block first atom: 224
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 236
Blocpdb> 11 atoms in block 18
Block first atom: 252
Blocpdb> 15 atoms in block 19
Block first atom: 263
Blocpdb> 18 atoms in block 20
Block first atom: 278
Blocpdb> 16 atoms in block 21
Block first atom: 296
Blocpdb> 19 atoms in block 22
Block first atom: 312
Blocpdb> 15 atoms in block 23
Block first atom: 331
Blocpdb> 14 atoms in block 24
Block first atom: 346
Blocpdb> 16 atoms in block 25
Block first atom: 360
Blocpdb> 15 atoms in block 26
Block first atom: 376
Blocpdb> 11 atoms in block 27
Block first atom: 391
Blocpdb> 16 atoms in block 28
Block first atom: 402
Blocpdb> 15 atoms in block 29
Block first atom: 418
Blocpdb> 10 atoms in block 30
Block first atom: 433
Blocpdb> 24 atoms in block 31
Block first atom: 443
Blocpdb> 19 atoms in block 32
Block first atom: 467
Blocpdb> 16 atoms in block 33
Block first atom: 486
Blocpdb> 14 atoms in block 34
Block first atom: 502
Blocpdb> 12 atoms in block 35
Block first atom: 516
Blocpdb> 17 atoms in block 36
Block first atom: 528
Blocpdb> 19 atoms in block 37
Block first atom: 545
Blocpdb> 15 atoms in block 38
Block first atom: 564
Blocpdb> 20 atoms in block 39
Block first atom: 579
Blocpdb> 17 atoms in block 40
Block first atom: 599
Blocpdb> 14 atoms in block 41
Block first atom: 616
Blocpdb> 19 atoms in block 42
Block first atom: 630
Blocpdb> 17 atoms in block 43
Block first atom: 649
Blocpdb> 18 atoms in block 44
Block first atom: 666
Blocpdb> 18 atoms in block 45
Block first atom: 684
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 702
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 717
Blocpdb> 24 atoms in block 48
Block first atom: 733
Blocpdb> 18 atoms in block 49
Block first atom: 757
Blocpdb> 20 atoms in block 50
Block first atom: 775
Blocpdb> 20 atoms in block 51
Block first atom: 795
Blocpdb> 15 atoms in block 52
Block first atom: 815
Blocpdb> 18 atoms in block 53
Block first atom: 830
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 848
Blocpdb> 14 atoms in block 55
Block first atom: 863
Blocpdb> 20 atoms in block 56
Block first atom: 877
Blocpdb> 17 atoms in block 57
Block first atom: 897
Blocpdb> 13 atoms in block 58
Block first atom: 914
Blocpdb> 16 atoms in block 59
Block first atom: 927
Blocpdb> 11 atoms in block 60
Block first atom: 943
Blocpdb> 15 atoms in block 61
Block first atom: 954
Blocpdb> 16 atoms in block 62
Block first atom: 969
Blocpdb> 15 atoms in block 63
Block first atom: 985
Blocpdb> 22 atoms in block 64
Block first atom: 1000
Blocpdb> 17 atoms in block 65
Block first atom: 1022
Blocpdb> 17 atoms in block 66
Block first atom: 1039
Blocpdb> 18 atoms in block 67
Block first atom: 1056
Blocpdb> 16 atoms in block 68
Block first atom: 1074
Blocpdb> 16 atoms in block 69
Block first atom: 1090
Blocpdb> 17 atoms in block 70
Block first atom: 1106
Blocpdb> 15 atoms in block 71
Block first atom: 1123
Blocpdb> 15 atoms in block 72
Block first atom: 1138
Blocpdb> 17 atoms in block 73
Block first atom: 1153
Blocpdb> 20 atoms in block 74
Block first atom: 1170
Blocpdb> 15 atoms in block 75
Block first atom: 1190
Blocpdb> 10 atoms in block 76
Block first atom: 1205
Blocpdb> 12 atoms in block 77
Block first atom: 1215
Blocpdb> 14 atoms in block 78
Block first atom: 1227
Blocpdb> 16 atoms in block 79
Block first atom: 1241
Blocpdb> 14 atoms in block 80
Block first atom: 1257
Blocpdb> 18 atoms in block 81
Block first atom: 1271
Blocpdb> 14 atoms in block 82
Block first atom: 1289
Blocpdb> 15 atoms in block 83
Block first atom: 1303
Blocpdb> 15 atoms in block 84
Block first atom: 1318
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1333
Blocpdb> 17 atoms in block 86
Block first atom: 1346
Blocpdb> 15 atoms in block 87
Block first atom: 1363
Blocpdb> 12 atoms in block 88
Block first atom: 1378
Blocpdb> 21 atoms in block 89
Block first atom: 1390
Blocpdb> 11 atoms in block 90
Block first atom: 1411
Blocpdb> 16 atoms in block 91
Block first atom: 1422
Blocpdb> 13 atoms in block 92
Block first atom: 1438
Blocpdb> 19 atoms in block 93
Block first atom: 1451
Blocpdb> 17 atoms in block 94
Block first atom: 1470
Blocpdb> 22 atoms in block 95
Block first atom: 1487
Blocpdb> 14 atoms in block 96
Block first atom: 1509
Blocpdb> 14 atoms in block 97
Block first atom: 1523
Blocpdb> 18 atoms in block 98
Block first atom: 1537
Blocpdb> 18 atoms in block 99
Block first atom: 1555
Blocpdb> 19 atoms in block 100
Block first atom: 1573
Blocpdb> 17 atoms in block 101
Block first atom: 1592
Blocpdb> 18 atoms in block 102
Block first atom: 1609
Blocpdb> 20 atoms in block 103
Block first atom: 1627
Blocpdb> 14 atoms in block 104
Block first atom: 1647
Blocpdb> 19 atoms in block 105
Block first atom: 1661
Blocpdb> 14 atoms in block 106
Block first atom: 1680
Blocpdb> 13 atoms in block 107
Block first atom: 1694
Blocpdb> 12 atoms in block 108
Block first atom: 1707
Blocpdb> 20 atoms in block 109
Block first atom: 1719
Blocpdb> 18 atoms in block 110
Block first atom: 1739
Blocpdb> 21 atoms in block 111
Block first atom: 1757
Blocpdb> 19 atoms in block 112
Block first atom: 1778
Blocpdb> 17 atoms in block 113
Block first atom: 1797
Blocpdb> 16 atoms in block 114
Block first atom: 1814
Blocpdb> 17 atoms in block 115
Block first atom: 1830
Blocpdb> 18 atoms in block 116
Block first atom: 1847
Blocpdb> 16 atoms in block 117
Block first atom: 1865
Blocpdb> 16 atoms in block 118
Block first atom: 1881
Blocpdb> 14 atoms in block 119
Block first atom: 1897
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1911
Blocpdb> 16 atoms in block 121
Block first atom: 1926
Blocpdb> 12 atoms in block 122
Block first atom: 1942
Blocpdb> 17 atoms in block 123
Block first atom: 1954
Blocpdb> 18 atoms in block 124
Block first atom: 1971
Blocpdb> 18 atoms in block 125
Block first atom: 1989
Blocpdb> 12 atoms in block 126
Block first atom: 2007
Blocpdb> 20 atoms in block 127
Block first atom: 2019
Blocpdb> 14 atoms in block 128
Block first atom: 2039
Blocpdb> 17 atoms in block 129
Block first atom: 2053
Blocpdb> 16 atoms in block 130
Block first atom: 2070
Blocpdb> 21 atoms in block 131
Block first atom: 2086
Blocpdb> 16 atoms in block 132
Block first atom: 2107
Blocpdb> 18 atoms in block 133
Block first atom: 2123
Blocpdb> 17 atoms in block 134
Block first atom: 2141
Blocpdb> 20 atoms in block 135
Block first atom: 2158
Blocpdb> 20 atoms in block 136
Block first atom: 2178
Blocpdb> 17 atoms in block 137
Block first atom: 2198
Blocpdb> 19 atoms in block 138
Block first atom: 2215
Blocpdb> 16 atoms in block 139
Block first atom: 2234
Blocpdb> 20 atoms in block 140
Block first atom: 2250
Blocpdb> 12 atoms in block 141
Block first atom: 2270
Blocpdb> 22 atoms in block 142
Block first atom: 2282
Blocpdb> 16 atoms in block 143
Block first atom: 2304
Blocpdb> 12 atoms in block 144
Block first atom: 2320
Blocpdb> 22 atoms in block 145
Block first atom: 2332
Blocpdb> 17 atoms in block 146
Block first atom: 2354
Blocpdb> 13 atoms in block 147
Block first atom: 2371
Blocpdb> 17 atoms in block 148
Block first atom: 2384
Blocpdb> 16 atoms in block 149
Block first atom: 2401
Blocpdb> 14 atoms in block 150
Block first atom: 2417
Blocpdb> 23 atoms in block 151
Block first atom: 2431
Blocpdb> 19 atoms in block 152
Block first atom: 2454
Blocpdb> 17 atoms in block 153
Block first atom: 2473
Blocpdb> 12 atoms in block 154
Block first atom: 2490
Blocpdb> 14 atoms in block 155
Block first atom: 2502
Blocpdb> 19 atoms in block 156
Block first atom: 2516
Blocpdb> 14 atoms in block 157
Block first atom: 2535
Blocpdb> 14 atoms in block 158
Block first atom: 2549
Blocpdb> 23 atoms in block 159
Block first atom: 2563
Blocpdb> 17 atoms in block 160
Block first atom: 2586
Blocpdb> 14 atoms in block 161
Block first atom: 2603
Blocpdb> 18 atoms in block 162
Block first atom: 2617
Blocpdb> 18 atoms in block 163
Block first atom: 2635
Blocpdb> 17 atoms in block 164
Block first atom: 2653
Blocpdb> 20 atoms in block 165
Block first atom: 2670
Blocpdb> 19 atoms in block 166
Block first atom: 2690
Blocpdb> 16 atoms in block 167
Block first atom: 2709
Blocpdb> 19 atoms in block 168
Block first atom: 2725
Blocpdb> 19 atoms in block 169
Block first atom: 2744
Blocpdb> 12 atoms in block 170
Block first atom: 2763
Blocpdb> 16 atoms in block 171
Block first atom: 2775
Blocpdb> 16 atoms in block 172
Block first atom: 2791
Blocpdb> 20 atoms in block 173
Block first atom: 2807
Blocpdb> 15 atoms in block 174
Block first atom: 2827
Blocpdb> 20 atoms in block 175
Block first atom: 2842
Blocpdb> 15 atoms in block 176
Block first atom: 2862
Blocpdb> 18 atoms in block 177
Block first atom: 2877
Blocpdb> 17 atoms in block 178
Block first atom: 2895
Blocpdb> 21 atoms in block 179
Block first atom: 2912
Blocpdb> 19 atoms in block 180
Block first atom: 2933
Blocpdb> 17 atoms in block 181
Block first atom: 2952
Blocpdb> 18 atoms in block 182
Block first atom: 2969
Blocpdb> 18 atoms in block 183
Block first atom: 2987
Blocpdb> 17 atoms in block 184
Block first atom: 3005
Blocpdb> 12 atoms in block 185
Block first atom: 3021
Blocpdb> 185 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1107003 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 9099
Prepmat> Matrix trace = 2419600.0000
Prepmat> Last element read: 9099 9099 315.8023
Prepmat> 17206 lines saved.
Prepmat> 15239 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3033
RTB> Total mass = 3033.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3033
RTB> Number of blocks = 185
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 246313.7430
RTB> 68001 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1110
Diagstd> Nb of non-zero elements: 68001
Diagstd> Projected matrix trace = 246313.7430
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1110 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 246313.7430
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.0571149 1.5083581 1.6438795 2.1858414
3.3549022 3.8772046 4.3675638 4.8691002 5.3698909
6.0060055 6.3384290 6.9162323 7.2971795 8.7076171
8.9171425 9.5717707 9.7062252 10.8756331 11.3980182
12.1313995 12.5237390 13.1141881 13.2427216 13.8745806
15.0561714 15.1697205 15.5496319 16.2004748 16.8820140
17.1717562 17.8242387 18.5248778 19.3483515 19.6599059
20.4165392 21.1173465 21.4459042 22.7670236 23.1033711
23.6035624 24.9942290 25.1666246 26.0074127 26.3417580
26.5065798 26.9705919 27.8780770 28.2068247 28.5948426
28.8619465 29.3694399 30.0664354 30.7004227 31.3095826
31.7801021 32.3845995 32.5248115 32.8041755 33.7812836
34.2799858 34.7954938 35.8060970 35.8947818 36.7112479
37.1807091 37.6736875 37.9759551 38.3043320 39.2928173
40.1154951 40.5661512 41.0399998 41.7319913 42.5124605
42.6239485 43.0130212 43.5675142 44.2044961 44.3492630
44.8397687 45.1107152 45.7744033 46.6853106 47.2610482
47.7749911 47.9428950 48.9982169 49.6730761 50.0987672
50.8866024 51.3838316 51.8905452 52.5558415 52.9851854
53.5248472 53.8366214 54.6074144 55.1529404 55.2641412
56.3121789
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034339 0.0034341 0.0034347 0.0034349
0.0034349 111.6493964 133.3667343 139.2291798 160.5478915
198.9001976 213.8231087 226.9420166 239.6181092 251.6390348
266.1265123 273.3921846 285.5814974 293.3410189 320.4386853
324.2710174 335.9629787 338.3143829 358.1150351 366.6147666
378.2254366 384.2928322 393.2475135 395.1699434 404.4876002
421.3592722 422.9451699 428.2085513 437.0782056 446.1772361
449.9897670 458.4592875 467.3830482 477.6582294 481.4885871
490.6664278 499.0165548 502.8835868 518.1415368 521.9548739
527.5748179 542.8941380 544.7632039 553.7884003 557.3367209
559.0776445 563.9498940 573.3590702 576.7297835 580.6830316
583.3888027 588.4954542 595.4375941 601.6826071 607.6226011
612.1712429 617.9659490 619.3022735 621.9562603 631.1511151
635.7927872 640.5555267 649.7911200 650.5953265 657.9529733
662.1465402 666.5217805 669.1902934 672.0772999 680.6939092
687.7828752 691.6353505 695.6630805 701.5034871 708.0328387
708.9606315 712.1889885 716.7648026 721.9855445 723.1668062
727.1549454 729.3485710 734.6942247 741.9683951 746.5294673
750.5775797 751.8953652 760.1257034 765.3424601 768.6149009
774.6348072 778.4102091 782.2388782 787.2375067 790.4465523
794.4617605 796.7722109 802.4557388 806.4540285 807.2666160
814.8852300
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3033
Rtb_to_modes> Number of blocs = 185
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.057
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.508
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.644
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.186
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.355
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.877
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.368
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.869
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.370
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.006
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.338
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.916
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.297
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.708
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.917
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.572
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.706
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.31
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1110 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000
1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00002
0.99998 0.99996 0.99999 1.00000 1.00000
0.99997 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000
1.00003 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002
0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 0.99993
1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002
1.00000 0.99998 1.00001 1.00004 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
1.00003 0.99998 1.00001 0.99998 1.00004
1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998
1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000
0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999
0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 0.99997
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998
1.00006 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 54594 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000
1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00002
0.99998 0.99996 0.99999 1.00000 1.00000
0.99997 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000
1.00003 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002
0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 0.99993
1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002
1.00000 0.99998 1.00001 1.00004 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
1.00003 0.99998 1.00001 0.99998 1.00004
1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998
1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000
0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999
0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 0.99997
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998
1.00006 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2609081731422618845.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2609081731422618845.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2609081731422618845.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2609081731422618845.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 370
First residue number = 154
Last residue number = 601
Number of atoms found = 3033
Mean number per residue = 8.2
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.057
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.508
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.644
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.186
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.355
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.877
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.368
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.869
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.370
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.006
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.338
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.916
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.297
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.708
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.917
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.572
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.706
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.31
Bfactors> 106 vectors, 9099 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.057000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.377 for 369 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.033 +/- 0.09
Bfactors> = 45.593 +/- 30.34
Bfactors> Shiftng-fct= 45.560
Bfactors> Scaling-fct= 339.466
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2609081731422618845.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2609081731422618845.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.8
Chkmod> 106 vectors, 9099 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3033 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 30 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 101 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8271
0.0034 0.9318
0.0034 0.7734
0.0034 0.8837
0.0034 0.8793
0.0034 0.7111
111.6385 0.0125
133.3452 0.4314
139.2283 0.3822
160.5468 0.1328
198.8946 0.1253
213.8083 0.0886
226.9436 0.3627
239.6054 0.2040
251.6308 0.2260
266.1150 0.3875
273.3712 0.2613
285.5644 0.2744
293.3248 0.2959
320.4320 0.6265
324.2545 0.2815
335.9526 0.2892
338.2959 0.5006
358.1715 0.3412
366.6309 0.3143
378.1874 0.4368
384.2190 0.0224
393.1678 0.2855
395.1124 0.1678
404.4035 0.2874
421.3948 0.4644
422.9309 0.2118
428.1952 0.2013
437.0530 0.2923
446.1315 0.2288
449.9474 0.1675
458.3851 0.3286
467.3014 0.2535
477.6581 0.5351
481.4691 0.4552
490.6869 0.2969
499.0265 0.3942
502.9100 0.4516
518.1532 0.4603
521.8944 0.2408
527.5124 0.4330
542.8249 0.3968
544.7763 0.3924
553.7922 0.3158
557.2942 0.3068
559.0897 0.2261
563.9195 0.2139
573.3542 0.3304
576.7375 0.2874
580.6089 0.3150
583.3441 0.5007
588.4758 0.3111
595.4473 0.3067
601.6526 0.4225
607.6006 0.3634
612.1440 0.3300
617.8955 0.3686
619.2299 0.3640
621.8900 0.2959
631.1120 0.2267
635.7656 0.2405
640.5695 0.2462
649.7986 0.2827
650.5241 0.1891
657.9135 0.4382
662.1118 0.4074
666.4605 0.5266
669.1972 0.3008
672.0104 0.3855
680.6403 0.4113
687.7920 0.4596
691.6385 0.3436
695.6332 0.3534
701.4566 0.5210
707.9820 0.3438
708.8974 0.3700
712.1334 0.4077
716.7545 0.3443
721.9178 0.5027
723.1418 0.4637
727.1256 0.5609
729.3115 0.4065
734.6273 0.3264
741.9738 0.3948
746.4891 0.4909
750.5062 0.4072
751.8404 0.4488
760.1069 0.3231
765.2859 0.4780
768.5914 0.3880
774.6274 0.5303
778.3478 0.4839
782.2012 0.3782
787.2349 0.3436
790.4485 0.4421
794.3917 0.3050
796.7630 0.3878
802.4403 0.4981
806.3979 0.4650
807.2017 0.4079
814.8345 0.3719
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2609081731422618845 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
making animated gifs
11 models are in 2609081731422618845.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2609081731422618845.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2609081731422618845.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2609081731422618845 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
making animated gifs
11 models are in 2609081731422618845.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2609081731422618845.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2609081731422618845.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2609081731422618845 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
making animated gifs
11 models are in 2609081731422618845.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2609081731422618845.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2609081731422618845.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2609081731422618845 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
making animated gifs
11 models are in 2609081731422618845.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2609081731422618845.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2609081731422618845.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2609081731422618845 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2609081731422618845.eigenfacs
2609081731422618845.atom
making animated gifs
11 models are in 2609081731422618845.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2609081731422618845.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2609081731422618845.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2609081731422618845.10.pdb
2609081731422618845.11.pdb
2609081731422618845.7.pdb
2609081731422618845.8.pdb
2609081731422618845.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m19.878s
user 0m19.703s
sys 0m0.167s
rm: cannot remove '2609081731422618845.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|