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LOGs for ID: 2609081731422618845

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2609081731422618845.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2609081731422618845.atom to be opened. Openam> File opened: 2609081731422618845.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 370 First residue number = 154 Last residue number = 601 Number of atoms found = 3033 Mean number per residue = 8.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = 140.623671 +/- 13.575382 From: 107.213000 To: 171.393000 = 9.159645 +/- 10.812836 From: -16.165000 To: 35.619000 = 8.048876 +/- 12.813686 From: -20.013000 To: 39.026000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'ZN ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.6734 % Filled. Pdbmat> 1106818 non-zero elements. Pdbmat> 120980 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.78 +/- 23.00 Maximum number = 125 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 2.419600E+06 Pdbmat> Larger element = 471.587 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 370 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2609081731422618845.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2609081731422618845.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2609081731422618845.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3033 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 370 residues. Blocpdb> 20 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 21 Blocpdb> 10 atoms in block 3 Block first atom: 37 Blocpdb> 11 atoms in block 4 Block first atom: 47 Blocpdb> 11 atoms in block 5 Block first atom: 58 Blocpdb> 17 atoms in block 6 Block first atom: 69 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 86 Blocpdb> 15 atoms in block 8 Block first atom: 102 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 117 Blocpdb> 17 atoms in block 10 Block first atom: 135 Blocpdb> 14 atoms in block 11 Block first atom: 152 Blocpdb> 19 atoms in block 12 Block first atom: 166 Blocpdb> 16 atoms in block 13 Block first atom: 185 Blocpdb> 13 atoms in block 14 Block first atom: 201 Blocpdb> 10 atoms in block 15 Block first atom: 214 Blocpdb> 12 atoms in block 16 Block first atom: 224 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 236 Blocpdb> 11 atoms in block 18 Block first atom: 252 Blocpdb> 15 atoms in block 19 Block first atom: 263 Blocpdb> 18 atoms in block 20 Block first atom: 278 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 296 Blocpdb> 19 atoms in block 22 Block first atom: 312 Blocpdb> 15 atoms in block 23 Block first atom: 331 Blocpdb> 14 atoms in block 24 Block first atom: 346 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 360 Blocpdb> 15 atoms in block 26 Block first atom: 376 Blocpdb> 11 atoms in block 27 Block first atom: 391 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 402 Blocpdb> 15 atoms in block 29 Block first atom: 418 Blocpdb> 10 atoms in block 30 Block first atom: 433 Blocpdb> 24 atoms in block 31 Block first atom: 443 Blocpdb> 19 atoms in block 32 Block first atom: 467 Blocpdb> 16 atoms in block 33 Block first atom: 486 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 502 Blocpdb> 12 atoms in block 35 Block first atom: 516 Blocpdb> 17 atoms in block 36 Block first atom: 528 Blocpdb> 19 atoms in block 37 Block first atom: 545 Blocpdb> 15 atoms in block 38 Block first atom: 564 Blocpdb> 20 atoms in block 39 Block first atom: 579 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 599 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 616 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 630 Blocpdb> 17 atoms in block 43 Block first atom: 649 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 666 Blocpdb> 18 atoms in block 45 Block first atom: 684 Blocpdb> 15 atoms in block 46 Block first atom: 702 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 717 Blocpdb> 24 atoms in block 48 Block first atom: 733 Blocpdb> 18 atoms in block 49 Block first atom: 757 Blocpdb> 20 atoms in block 50 Block first atom: 775 Blocpdb> 20 atoms in block 51 Block first atom: 795 Blocpdb> 15 atoms in block 52 Block first atom: 815 Blocpdb> 18 atoms in block 53 Block first atom: 830 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 848 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 863 Blocpdb> 20 atoms in block 56 Block first atom: 877 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 897 Blocpdb> 13 atoms in block 58 Block first atom: 914 Blocpdb> 16 atoms in block 59 Block first atom: 927 Blocpdb> 11 atoms in block 60 Block first atom: 943 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 954 Blocpdb> 16 atoms in block 62 Block first atom: 969 Blocpdb> 15 atoms in block 63 Block first atom: 985 Blocpdb> 22 atoms in block 64 Block first atom: 1000 Blocpdb> 17 atoms in block 65 Block first atom: 1022 Blocpdb> 17 atoms in block 66 Block first atom: 1039 Blocpdb> 18 atoms in block 67 Block first atom: 1056 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1074 Blocpdb> 16 atoms in block 69 Block first atom: 1090 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1106 Blocpdb> 15 atoms in block 71 Block first atom: 1123 Blocpdb> 15 atoms in block 72 Block first atom: 1138 Blocpdb> 17 atoms in block 73 Block first atom: 1153 Blocpdb> 20 atoms in block 74 Block first atom: 1170 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1190 Blocpdb> 10 atoms in block 76 Block first atom: 1205 Blocpdb> 12 atoms in block 77 Block first atom: 1215 Blocpdb> 14 atoms in block 78 Block first atom: 1227 Blocpdb> 16 atoms in block 79 Block first atom: 1241 Blocpdb> 14 atoms in block 80 Block first atom: 1257 Blocpdb> 18 atoms in block 81 Block first atom: 1271 Blocpdb> 14 atoms in block 82 Block first atom: 1289 Blocpdb> 15 atoms in block 83 Block first atom: 1303 Blocpdb> 15 atoms in block 84 Block first atom: 1318 Blocpdb> 13 atoms in block 85 Block first atom: 1333 Blocpdb> 17 atoms in block 86 Block first atom: 1346 Blocpdb> 15 atoms in block 87 Block first atom: 1363 Blocpdb> 12 atoms in block 88 Block first atom: 1378 Blocpdb> 21 atoms in block 89 Block first atom: 1390 Blocpdb> 11 atoms in block 90 Block first atom: 1411 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1422 Blocpdb> 13 atoms in block 92 Block first atom: 1438 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 1451 Blocpdb> 17 atoms in block 94 Block first atom: 1470 Blocpdb> 22 atoms in block 95 Block first atom: 1487 Blocpdb> 14 atoms in block 96 Block first atom: 1509 Blocpdb> 14 atoms in block 97 Block first atom: 1523 Blocpdb> 18 atoms in block 98 Block first atom: 1537 Blocpdb> 18 atoms in block 99 Block first atom: 1555 Blocpdb> 19 atoms in block 100 Block first atom: 1573 Blocpdb> 17 atoms in block 101 Block first atom: 1592 Blocpdb> 18 atoms in block 102 Block first atom: 1609 Blocpdb> 20 atoms in block 103 Block first atom: 1627 Blocpdb> 14 atoms in block 104 Block first atom: 1647 Blocpdb> 19 atoms in block 105 Block first atom: 1661 Blocpdb> 14 atoms in block 106 Block first atom: 1680 Blocpdb> 13 atoms in block 107 Block first atom: 1694 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 1707 Blocpdb> 20 atoms in block 109 Block first atom: 1719 Blocpdb> 18 atoms in block 110 Block first atom: 1739 Blocpdb> 21 atoms in block 111 Block first atom: 1757 Blocpdb> 19 atoms in block 112 Block first atom: 1778 Blocpdb> 17 atoms in block 113 Block first atom: 1797 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 1814 Blocpdb> 17 atoms in block 115 Block first atom: 1830 Blocpdb> 18 atoms in block 116 Block first atom: 1847 Blocpdb> 16 atoms in block 117 Block first atom: 1865 Blocpdb> 16 atoms in block 118 Block first atom: 1881 Blocpdb> 14 atoms in block 119 Block first atom: 1897 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1911 Blocpdb> 16 atoms in block 121 Block first atom: 1926 Blocpdb> 12 atoms in block 122 Block first atom: 1942 Blocpdb> 17 atoms in block 123 Block first atom: 1954 Blocpdb> 18 atoms in block 124 Block first atom: 1971 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 1989 Blocpdb> 12 atoms in block 126 Block first atom: 2007 Blocpdb> 20 atoms in block 127 Block first atom: 2019 Blocpdb> 14 atoms in block 128 Block first atom: 2039 Blocpdb> 17 atoms in block 129 Block first atom: 2053 Blocpdb> 16 atoms in block 130 Block first atom: 2070 Blocpdb> 21 atoms in block 131 Block first atom: 2086 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 2107 Blocpdb> 18 atoms in block 133 Block first atom: 2123 Blocpdb> 17 atoms in block 134 Block first atom: 2141 Blocpdb> 20 atoms in block 135 Block first atom: 2158 Blocpdb> 20 atoms in block 136 Block first atom: 2178 Blocpdb> 17 atoms in block 137 Block first atom: 2198 Blocpdb> 19 atoms in block 138 Block first atom: 2215 Blocpdb> 16 atoms in block 139 Block first atom: 2234 Blocpdb> 20 atoms in block 140 Block first atom: 2250 Blocpdb> 12 atoms in block 141 Block first atom: 2270 Blocpdb> 22 atoms in block 142 Block first atom: 2282 Blocpdb> 16 atoms in block 143 Block first atom: 2304 Blocpdb> 12 atoms in block 144 Block first atom: 2320 Blocpdb> 22 atoms in block 145 Block first atom: 2332 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2354 Blocpdb> 13 atoms in block 147 Block first atom: 2371 Blocpdb> 17 atoms in block 148 Block first atom: 2384 Blocpdb> 16 atoms in block 149 Block first atom: 2401 Blocpdb> 14 atoms in block 150 Block first atom: 2417 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 2431 Blocpdb> 19 atoms in block 152 Block first atom: 2454 Blocpdb> 17 atoms in block 153 Block first atom: 2473 Blocpdb> 12 atoms in block 154 Block first atom: 2490 Blocpdb> 14 atoms in block 155 Block first atom: 2502 Blocpdb> 19 atoms in block 156 Block first atom: 2516 Blocpdb> 14 atoms in block 157 Block first atom: 2535 Blocpdb> 14 atoms in block 158 Block first atom: 2549 Blocpdb> 23 atoms in block 159 Block first atom: 2563 Blocpdb> 17 atoms in block 160 Block first atom: 2586 Blocpdb> 14 atoms in block 161 Block first atom: 2603 Blocpdb> 18 atoms in block 162 Block first atom: 2617 Blocpdb> 18 atoms in block 163 Block first atom: 2635 Blocpdb> 17 atoms in block 164 Block first atom: 2653 Blocpdb> 20 atoms in block 165 Block first atom: 2670 Blocpdb> 19 atoms in block 166 Block first atom: 2690 Blocpdb> 16 atoms in block 167 Block first atom: 2709 Blocpdb> 19 atoms in block 168 Block first atom: 2725 Blocpdb> 19 atoms in block 169 Block first atom: 2744 Blocpdb> 12 atoms in block 170 Block first atom: 2763 Blocpdb> 16 atoms in block 171 Block first atom: 2775 Blocpdb> 16 atoms in block 172 Block first atom: 2791 Blocpdb> 20 atoms in block 173 Block first atom: 2807 Blocpdb> 15 atoms in block 174 Block first atom: 2827 Blocpdb> 20 atoms in block 175 Block first atom: 2842 Blocpdb> 15 atoms in block 176 Block first atom: 2862 Blocpdb> 18 atoms in block 177 Block first atom: 2877 Blocpdb> 17 atoms in block 178 Block first atom: 2895 Blocpdb> 21 atoms in block 179 Block first atom: 2912 Blocpdb> 19 atoms in block 180 Block first atom: 2933 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 2952 Blocpdb> 18 atoms in block 182 Block first atom: 2969 Blocpdb> 18 atoms in block 183 Block first atom: 2987 Blocpdb> 17 atoms in block 184 Block first atom: 3005 Blocpdb> 12 atoms in block 185 Block first atom: 3021 Blocpdb> 185 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1107003 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9099 Prepmat> Matrix trace = 2419600.0000 Prepmat> Last element read: 9099 9099 315.8023 Prepmat> 17206 lines saved. Prepmat> 15239 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3033 RTB> Total mass = 3033.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3033 RTB> Number of blocks = 185 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 246313.7430 RTB> 68001 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1110 Diagstd> Nb of non-zero elements: 68001 Diagstd> Projected matrix trace = 246313.7430 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1110 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 246313.7430 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0571149 1.5083581 1.6438795 2.1858414 3.3549022 3.8772046 4.3675638 4.8691002 5.3698909 6.0060055 6.3384290 6.9162323 7.2971795 8.7076171 8.9171425 9.5717707 9.7062252 10.8756331 11.3980182 12.1313995 12.5237390 13.1141881 13.2427216 13.8745806 15.0561714 15.1697205 15.5496319 16.2004748 16.8820140 17.1717562 17.8242387 18.5248778 19.3483515 19.6599059 20.4165392 21.1173465 21.4459042 22.7670236 23.1033711 23.6035624 24.9942290 25.1666246 26.0074127 26.3417580 26.5065798 26.9705919 27.8780770 28.2068247 28.5948426 28.8619465 29.3694399 30.0664354 30.7004227 31.3095826 31.7801021 32.3845995 32.5248115 32.8041755 33.7812836 34.2799858 34.7954938 35.8060970 35.8947818 36.7112479 37.1807091 37.6736875 37.9759551 38.3043320 39.2928173 40.1154951 40.5661512 41.0399998 41.7319913 42.5124605 42.6239485 43.0130212 43.5675142 44.2044961 44.3492630 44.8397687 45.1107152 45.7744033 46.6853106 47.2610482 47.7749911 47.9428950 48.9982169 49.6730761 50.0987672 50.8866024 51.3838316 51.8905452 52.5558415 52.9851854 53.5248472 53.8366214 54.6074144 55.1529404 55.2641412 56.3121789 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034339 0.0034341 0.0034347 0.0034349 0.0034349 111.6493964 133.3667343 139.2291798 160.5478915 198.9001976 213.8231087 226.9420166 239.6181092 251.6390348 266.1265123 273.3921846 285.5814974 293.3410189 320.4386853 324.2710174 335.9629787 338.3143829 358.1150351 366.6147666 378.2254366 384.2928322 393.2475135 395.1699434 404.4876002 421.3592722 422.9451699 428.2085513 437.0782056 446.1772361 449.9897670 458.4592875 467.3830482 477.6582294 481.4885871 490.6664278 499.0165548 502.8835868 518.1415368 521.9548739 527.5748179 542.8941380 544.7632039 553.7884003 557.3367209 559.0776445 563.9498940 573.3590702 576.7297835 580.6830316 583.3888027 588.4954542 595.4375941 601.6826071 607.6226011 612.1712429 617.9659490 619.3022735 621.9562603 631.1511151 635.7927872 640.5555267 649.7911200 650.5953265 657.9529733 662.1465402 666.5217805 669.1902934 672.0772999 680.6939092 687.7828752 691.6353505 695.6630805 701.5034871 708.0328387 708.9606315 712.1889885 716.7648026 721.9855445 723.1668062 727.1549454 729.3485710 734.6942247 741.9683951 746.5294673 750.5775797 751.8953652 760.1257034 765.3424601 768.6149009 774.6348072 778.4102091 782.2388782 787.2375067 790.4465523 794.4617605 796.7722109 802.4557388 806.4540285 807.2666160 814.8852300 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3033 Rtb_to_modes> Number of blocs = 185 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.057 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.508 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.644 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.186 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.355 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.877 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.368 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.869 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.370 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.006 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.338 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.916 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.297 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.708 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.917 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.572 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.706 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.31 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1110 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 0.99996 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 0.99993 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001 0.99998 1.00004 1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00006 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 54594 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 0.99996 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 0.99993 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001 0.99998 1.00004 1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00006 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609081731422618845.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609081731422618845.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2609081731422618845.atom Openam> file on opening on unit 11: 2609081731422618845.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 370 First residue number = 154 Last residue number = 601 Number of atoms found = 3033 Mean number per residue = 8.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.057 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.508 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.644 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.186 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.355 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.877 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.368 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.869 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.370 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.006 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.338 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.916 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.297 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.708 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.917 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.572 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.706 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.31 Bfactors> 106 vectors, 9099 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.057000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.377 for 369 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.033 +/- 0.09 Bfactors> = 45.593 +/- 30.34 Bfactors> Shiftng-fct= 45.560 Bfactors> Scaling-fct= 339.466 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609081731422618845.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609081731422618845.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.8 Chkmod> 106 vectors, 9099 coordinates in file. Chkmod> That is: 3033 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 30 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 101 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8271 0.0034 0.9318 0.0034 0.7734 0.0034 0.8837 0.0034 0.8793 0.0034 0.7111 111.6385 0.0125 133.3452 0.4314 139.2283 0.3822 160.5468 0.1328 198.8946 0.1253 213.8083 0.0886 226.9436 0.3627 239.6054 0.2040 251.6308 0.2260 266.1150 0.3875 273.3712 0.2613 285.5644 0.2744 293.3248 0.2959 320.4320 0.6265 324.2545 0.2815 335.9526 0.2892 338.2959 0.5006 358.1715 0.3412 366.6309 0.3143 378.1874 0.4368 384.2190 0.0224 393.1678 0.2855 395.1124 0.1678 404.4035 0.2874 421.3948 0.4644 422.9309 0.2118 428.1952 0.2013 437.0530 0.2923 446.1315 0.2288 449.9474 0.1675 458.3851 0.3286 467.3014 0.2535 477.6581 0.5351 481.4691 0.4552 490.6869 0.2969 499.0265 0.3942 502.9100 0.4516 518.1532 0.4603 521.8944 0.2408 527.5124 0.4330 542.8249 0.3968 544.7763 0.3924 553.7922 0.3158 557.2942 0.3068 559.0897 0.2261 563.9195 0.2139 573.3542 0.3304 576.7375 0.2874 580.6089 0.3150 583.3441 0.5007 588.4758 0.3111 595.4473 0.3067 601.6526 0.4225 607.6006 0.3634 612.1440 0.3300 617.8955 0.3686 619.2299 0.3640 621.8900 0.2959 631.1120 0.2267 635.7656 0.2405 640.5695 0.2462 649.7986 0.2827 650.5241 0.1891 657.9135 0.4382 662.1118 0.4074 666.4605 0.5266 669.1972 0.3008 672.0104 0.3855 680.6403 0.4113 687.7920 0.4596 691.6385 0.3436 695.6332 0.3534 701.4566 0.5210 707.9820 0.3438 708.8974 0.3700 712.1334 0.4077 716.7545 0.3443 721.9178 0.5027 723.1418 0.4637 727.1256 0.5609 729.3115 0.4065 734.6273 0.3264 741.9738 0.3948 746.4891 0.4909 750.5062 0.4072 751.8404 0.4488 760.1069 0.3231 765.2859 0.4780 768.5914 0.3880 774.6274 0.5303 778.3478 0.4839 782.2012 0.3782 787.2349 0.3436 790.4485 0.4421 794.3917 0.3050 796.7630 0.3878 802.4403 0.4981 806.3979 0.4650 807.2017 0.4079 814.8345 0.3719 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2609081731422618845 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom making animated gifs 11 models are in 2609081731422618845.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081731422618845.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081731422618845.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2609081731422618845 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom making animated gifs 11 models are in 2609081731422618845.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081731422618845.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081731422618845.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2609081731422618845 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom making animated gifs 11 models are in 2609081731422618845.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081731422618845.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081731422618845.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2609081731422618845 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081731422618845.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2609081731422618845 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609081731422618845.eigenfacs 2609081731422618845.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609081731422618845.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081731422618845.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2609081731422618845.10.pdb 2609081731422618845.11.pdb 2609081731422618845.7.pdb 2609081731422618845.8.pdb 2609081731422618845.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m19.878s user 0m19.703s sys 0m0.167s rm: cannot remove '2609081731422618845.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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