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***  TRANSFERASE 26-JUN-13 4LEV  ***

LOGs for ID: 2609081742582622328

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2609081742582622328.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2609081742582622328.atom to be opened. Openam> File opened: 2609081742582622328.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 728 First residue number = 154 Last residue number = 522 Number of atoms found = 6010 Mean number per residue = 8.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 125.803281 +/- 19.851753 From: 82.976000 To: 171.393000 = 13.526199 +/- 11.713931 From: -16.165000 To: 43.531000 = 22.846725 +/- 19.778527 From: -20.013000 To: 68.533000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3463 % Filled. Pdbmat> 2188416 non-zero elements. Pdbmat> 239194 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.60 +/- 22.29 Maximum number = 125 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 4.783880E+06 Pdbmat> Larger element = 481.417 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 728 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2609081742582622328.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2609081742582622328.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2609081742582622328.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6010 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 728 residues. Blocpdb> 36 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 21 atoms in block 2 Block first atom: 37 Blocpdb> 28 atoms in block 3 Block first atom: 58 Blocpdb> 31 atoms in block 4 Block first atom: 86 Blocpdb> 35 atoms in block 5 Block first atom: 117 Blocpdb> 33 atoms in block 6 Block first atom: 152 Blocpdb> 29 atoms in block 7 Block first atom: 185 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 214 Blocpdb> 27 atoms in block 9 Block first atom: 228 Blocpdb> 33 atoms in block 10 Block first atom: 255 Blocpdb> 35 atoms in block 11 Block first atom: 288 Blocpdb> 29 atoms in block 12 Block first atom: 323 Blocpdb> 31 atoms in block 13 Block first atom: 352 Blocpdb> 27 atoms in block 14 Block first atom: 383 Blocpdb> 25 atoms in block 15 Block first atom: 410 Blocpdb> 43 atoms in block 16 Block first atom: 435 Blocpdb> 30 atoms in block 17 Block first atom: 478 Blocpdb> 29 atoms in block 18 Block first atom: 508 Blocpdb> 26 atoms in block 19 Block first atom: 537 Blocpdb> 37 atoms in block 20 Block first atom: 563 Blocpdb> 33 atoms in block 21 Block first atom: 600 Blocpdb> 35 atoms in block 22 Block first atom: 633 Blocpdb> 33 atoms in block 23 Block first atom: 668 Blocpdb> 40 atoms in block 24 Block first atom: 701 Blocpdb> 38 atoms in block 25 Block first atom: 741 Blocpdb> 35 atoms in block 26 Block first atom: 779 Blocpdb> 33 atoms in block 27 Block first atom: 814 Blocpdb> 34 atoms in block 28 Block first atom: 847 Blocpdb> 30 atoms in block 29 Block first atom: 881 Blocpdb> 27 atoms in block 30 Block first atom: 911 Blocpdb> 15 atoms in block 31 Block first atom: 938 Blocpdb> 34 atoms in block 32 Block first atom: 953 Blocpdb> 36 atoms in block 33 Block first atom: 987 Blocpdb> 35 atoms in block 34 Block first atom: 1023 Blocpdb> 33 atoms in block 35 Block first atom: 1058 Blocpdb> 30 atoms in block 36 Block first atom: 1091 Blocpdb> 8 atoms in block 37 Block first atom: 1121 Blocpdb> 40 atoms in block 38 Block first atom: 1129 Blocpdb> 21 atoms in block 39 Block first atom: 1169 Blocpdb> 27 atoms in block 40 Block first atom: 1190 Blocpdb> 31 atoms in block 41 Block first atom: 1217 Blocpdb> 30 atoms in block 42 Block first atom: 1248 Blocpdb> 31 atoms in block 43 Block first atom: 1278 Blocpdb> 28 atoms in block 44 Block first atom: 1309 Blocpdb> 35 atoms in block 45 Block first atom: 1337 Blocpdb> 25 atoms in block 46 Block first atom: 1372 Blocpdb> 30 atoms in block 47 Block first atom: 1397 Blocpdb> 36 atoms in block 48 Block first atom: 1427 Blocpdb> 33 atoms in block 49 Block first atom: 1463 Blocpdb> 36 atoms in block 50 Block first atom: 1496 Blocpdb> 36 atoms in block 51 Block first atom: 1532 Blocpdb> 39 atoms in block 52 Block first atom: 1568 Blocpdb> 31 atoms in block 53 Block first atom: 1607 Blocpdb> 33 atoms in block 54 Block first atom: 1638 Blocpdb> 27 atoms in block 55 Block first atom: 1671 Blocpdb> 34 atoms in block 56 Block first atom: 1698 Blocpdb> 39 atoms in block 57 Block first atom: 1732 Blocpdb> 35 atoms in block 58 Block first atom: 1771 Blocpdb> 35 atoms in block 59 Block first atom: 1806 Blocpdb> 42 atoms in block 60 Block first atom: 1841 Blocpdb> 28 atoms in block 61 Block first atom: 1883 Blocpdb> 28 atoms in block 62 Block first atom: 1911 Blocpdb> 44 atoms in block 63 Block first atom: 1939 Blocpdb> 32 atoms in block 64 Block first atom: 1983 Blocpdb> 31 atoms in block 65 Block first atom: 2015 Blocpdb> 17 atoms in block 66 Block first atom: 2046 Blocpdb> 37 atoms in block 67 Block first atom: 2063 Blocpdb> 35 atoms in block 68 Block first atom: 2100 Blocpdb> 40 atoms in block 69 Block first atom: 2135 Blocpdb> 36 atoms in block 70 Block first atom: 2175 Blocpdb> 36 atoms in block 71 Block first atom: 2211 Blocpdb> 34 atoms in block 72 Block first atom: 2247 Blocpdb> 28 atoms in block 73 Block first atom: 2281 Blocpdb> 39 atoms in block 74 Block first atom: 2309 Blocpdb> 30 atoms in block 75 Block first atom: 2348 Blocpdb> 30 atoms in block 76 Block first atom: 2378 Blocpdb> 42 atoms in block 77 Block first atom: 2408 Blocpdb> 29 atoms in block 78 Block first atom: 2450 Blocpdb> 33 atoms in block 79 Block first atom: 2479 Blocpdb> 28 atoms in block 80 Block first atom: 2512 Blocpdb> 40 atoms in block 81 Block first atom: 2540 Blocpdb> 32 atoms in block 82 Block first atom: 2580 Blocpdb> 35 atoms in block 83 Block first atom: 2612 Blocpdb> 39 atoms in block 84 Block first atom: 2647 Blocpdb> 35 atoms in block 85 Block first atom: 2686 Blocpdb> 31 atoms in block 86 Block first atom: 2721 Blocpdb> 32 atoms in block 87 Block first atom: 2752 Blocpdb> 35 atoms in block 88 Block first atom: 2784 Blocpdb> 35 atoms in block 89 Block first atom: 2819 Blocpdb> 35 atoms in block 90 Block first atom: 2854 Blocpdb> 40 atoms in block 91 Block first atom: 2889 Blocpdb> 35 atoms in block 92 Block first atom: 2929 Blocpdb> 35 atoms in block 93 Block first atom: 2964 Blocpdb> 11 atoms in block 94 Block first atom: 2999 Blocpdb> 36 atoms in block 95 Block first atom: 3010 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 3046 Blocpdb> 28 atoms in block 97 Block first atom: 3067 Blocpdb> 31 atoms in block 98 Block first atom: 3095 Blocpdb> 35 atoms in block 99 Block first atom: 3126 Blocpdb> 33 atoms in block 100 Block first atom: 3161 Blocpdb> 29 atoms in block 101 Block first atom: 3194 Blocpdb> 14 atoms in block 102 Block first atom: 3223 Blocpdb> 27 atoms in block 103 Block first atom: 3237 Blocpdb> 33 atoms in block 104 Block first atom: 3264 Blocpdb> 35 atoms in block 105 Block first atom: 3297 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 3332 Blocpdb> 31 atoms in block 107 Block first atom: 3361 Blocpdb> 27 atoms in block 108 Block first atom: 3392 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 3419 Blocpdb> 43 atoms in block 110 Block first atom: 3444 Blocpdb> 30 atoms in block 111 Block first atom: 3487 Blocpdb> 29 atoms in block 112 Block first atom: 3517 Blocpdb> 26 atoms in block 113 Block first atom: 3546 Blocpdb> 37 atoms in block 114 Block first atom: 3572 Blocpdb> 33 atoms in block 115 Block first atom: 3609 Blocpdb> 35 atoms in block 116 Block first atom: 3642 Blocpdb> 33 atoms in block 117 Block first atom: 3677 Blocpdb> 40 atoms in block 118 Block first atom: 3710 Blocpdb> 38 atoms in block 119 Block first atom: 3750 Blocpdb> 35 atoms in block 120 Block first atom: 3788 Blocpdb> 33 atoms in block 121 Block first atom: 3823 Blocpdb> 34 atoms in block 122 Block first atom: 3856 Blocpdb> 30 atoms in block 123 Block first atom: 3890 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 3920 Blocpdb> 15 atoms in block 125 Block first atom: 3947 Blocpdb> 34 atoms in block 126 Block first atom: 3962 Blocpdb> 36 atoms in block 127 Block first atom: 3996 Blocpdb> 35 atoms in block 128 Block first atom: 4032 Blocpdb> 33 atoms in block 129 Block first atom: 4067 Blocpdb> 30 atoms in block 130 Block first atom: 4100 Blocpdb> 8 atoms in block 131 Block first atom: 4130 Blocpdb> 40 atoms in block 132 Block first atom: 4138 Blocpdb> 21 atoms in block 133 Block first atom: 4178 Blocpdb> 27 atoms in block 134 Block first atom: 4199 Blocpdb> 31 atoms in block 135 Block first atom: 4226 Blocpdb> 30 atoms in block 136 Block first atom: 4257 Blocpdb> 31 atoms in block 137 Block first atom: 4287 Blocpdb> 28 atoms in block 138 Block first atom: 4318 Blocpdb> 35 atoms in block 139 Block first atom: 4346 Blocpdb> 25 atoms in block 140 Block first atom: 4381 Blocpdb> 30 atoms in block 141 Block first atom: 4406 Blocpdb> 36 atoms in block 142 Block first atom: 4436 Blocpdb> 33 atoms in block 143 Block first atom: 4472 Blocpdb> 36 atoms in block 144 Block first atom: 4505 Blocpdb> 36 atoms in block 145 Block first atom: 4541 Blocpdb> 39 atoms in block 146 Block first atom: 4577 Blocpdb> 31 atoms in block 147 Block first atom: 4616 Blocpdb> 33 atoms in block 148 Block first atom: 4647 Blocpdb> 27 atoms in block 149 Block first atom: 4680 Blocpdb> 34 atoms in block 150 Block first atom: 4707 Blocpdb> 39 atoms in block 151 Block first atom: 4741 Blocpdb> 35 atoms in block 152 Block first atom: 4780 Blocpdb> 35 atoms in block 153 Block first atom: 4815 Blocpdb> 34 atoms in block 154 Block first atom: 4850 Blocpdb> 28 atoms in block 155 Block first atom: 4884 Blocpdb> 28 atoms in block 156 Block first atom: 4912 Blocpdb> 44 atoms in block 157 Block first atom: 4940 Blocpdb> 32 atoms in block 158 Block first atom: 4984 Blocpdb> 31 atoms in block 159 Block first atom: 5016 Blocpdb> 17 atoms in block 160 Block first atom: 5047 Blocpdb> 37 atoms in block 161 Block first atom: 5064 Blocpdb> 35 atoms in block 162 Block first atom: 5101 Blocpdb> 40 atoms in block 163 Block first atom: 5136 Blocpdb> 36 atoms in block 164 Block first atom: 5176 Blocpdb> 36 atoms in block 165 Block first atom: 5212 Blocpdb> 34 atoms in block 166 Block first atom: 5248 Blocpdb> 28 atoms in block 167 Block first atom: 5282 Blocpdb> 39 atoms in block 168 Block first atom: 5310 Blocpdb> 30 atoms in block 169 Block first atom: 5349 Blocpdb> 30 atoms in block 170 Block first atom: 5379 Blocpdb> 42 atoms in block 171 Block first atom: 5409 Blocpdb> 29 atoms in block 172 Block first atom: 5451 Blocpdb> 33 atoms in block 173 Block first atom: 5480 Blocpdb> 28 atoms in block 174 Block first atom: 5513 Blocpdb> 40 atoms in block 175 Block first atom: 5541 Blocpdb> 32 atoms in block 176 Block first atom: 5581 Blocpdb> 35 atoms in block 177 Block first atom: 5613 Blocpdb> 39 atoms in block 178 Block first atom: 5648 Blocpdb> 35 atoms in block 179 Block first atom: 5687 Blocpdb> 31 atoms in block 180 Block first atom: 5722 Blocpdb> 32 atoms in block 181 Block first atom: 5753 Blocpdb> 35 atoms in block 182 Block first atom: 5785 Blocpdb> 35 atoms in block 183 Block first atom: 5820 Blocpdb> 35 atoms in block 184 Block first atom: 5855 Blocpdb> 40 atoms in block 185 Block first atom: 5890 Blocpdb> 35 atoms in block 186 Block first atom: 5930 Blocpdb> 35 atoms in block 187 Block first atom: 5965 Blocpdb> 11 atoms in block 188 Block first atom: 5999 Blocpdb> 188 blocks. Blocpdb> At most, 44 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2188604 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 18030 Prepmat> Matrix trace = 4783880.0000 Prepmat> Last element read: 18030 18030 167.5924 Prepmat> 17767 lines saved. Prepmat> 16110 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6010 RTB> Total mass = 6010.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6010 RTB> Number of blocks = 188 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 214538.6186 RTB> 56796 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1128 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56796 Diagstd> Projected matrix trace = 214538.6186 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1128 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 214538.6186 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1144186 0.1362494 0.3317205 1.2238023 1.2779554 1.7906002 1.9334218 2.1327943 2.4974656 2.5779648 2.8728509 3.2230537 3.8034723 4.3050798 6.0057517 6.4227560 6.5609268 6.8531549 7.1684916 7.3377079 7.4945638 8.1980549 8.5069319 8.6274395 8.9315997 9.7270515 10.1540338 10.4221722 10.8590658 10.9465686 11.6674840 12.1668790 12.5482558 13.0170407 13.6025215 14.0615897 14.4994115 14.9390324 15.7027348 15.8939861 16.8174682 16.8694343 17.4581561 18.5708511 18.6526619 18.8258318 19.2096580 19.3641678 19.9071194 20.2292823 20.3981172 20.5421748 21.4696848 22.0319242 22.6128455 22.7341686 23.9347222 24.0408612 24.4125768 24.6774553 24.7553310 25.5017059 25.7259889 26.5279233 26.7052989 27.3442588 27.9035714 28.3347469 28.5841504 28.6006504 29.1663542 29.5301195 30.7078268 31.1232629 31.3926997 31.7613676 32.3304081 32.6937736 33.1809962 33.5635191 33.6321890 34.1326792 34.3213660 34.7206383 34.9881826 35.3489358 35.8958895 36.2004555 36.3713276 37.0048408 37.1903467 37.6404083 38.3747903 38.4194956 38.6057618 39.2365046 39.3739585 39.9056589 40.0241360 40.8407584 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034328 0.0034333 0.0034334 0.0034341 0.0034345 0.0034346 36.7319140 40.0832216 62.5433924 120.1298452 122.7589377 145.3096973 150.9936175 158.5877975 171.6109671 174.3547448 184.0567832 194.9526077 211.7802255 225.3128093 266.1208895 275.2047921 278.1492401 284.2762345 290.7429361 294.1544950 297.2818942 310.9214559 316.7245721 318.9600136 324.5337778 338.6771427 346.0306615 350.5697199 357.8421642 359.2810248 370.9231059 378.7781122 384.6687997 391.7882541 400.5022788 407.2044274 413.4951961 419.7169564 430.3114754 432.9240320 445.3234728 446.0109686 453.7268355 467.9626418 468.9922747 471.1642901 475.9431674 477.8534198 484.5063698 488.4110915 490.4450111 492.1737996 503.1623243 509.7080519 516.3841315 517.7675377 531.2628839 532.4395294 536.5399833 539.4428823 540.2933829 548.3778406 550.7840048 559.3026887 561.1694262 567.8431069 573.6211772 578.0360828 580.5744564 580.7419985 586.4572408 590.1030818 601.7551581 605.8119575 608.4285898 611.9907778 617.4486896 620.9087869 625.5182578 629.1135293 629.7567740 634.4252653 636.1764122 639.8661422 642.3266964 645.6296283 650.6053649 653.3596319 654.8997992 660.5786760 662.2323529 666.2273278 672.6951362 673.0868560 674.7165196 680.2059643 681.3963766 685.9816889 686.9992501 693.9723695 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6010 Rtb_to_modes> Number of blocs = 188 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9968E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1144 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1362 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3317 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.224 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.278 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.791 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.933 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.133 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.497 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.578 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.873 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.223 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.803 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.305 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.006 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.423 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.561 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.853 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.168 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.338 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.495 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.198 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.507 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.627 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.932 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.84 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1128 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00004 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 108180 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00004 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609081742582622328.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609081742582622328.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2609081742582622328.atom Openam> file on opening on unit 11: 2609081742582622328.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 728 First residue number = 154 Last residue number = 522 Number of atoms found = 6010 Mean number per residue = 8.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9968E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1144 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1362 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3317 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.224 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.278 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.791 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.933 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.133 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.497 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.578 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.873 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.223 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.803 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.305 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.006 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.423 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.561 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.853 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.168 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.338 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.495 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.198 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.507 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.627 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.932 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.84 Bfactors> 106 vectors, 18030 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.114400 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.645 for 731 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.072 +/- 0.06 Bfactors> = 48.624 +/- 32.20 Bfactors> Shiftng-fct= 48.551 Bfactors> Scaling-fct= 502.017 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609081742582622328.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609081742582622328.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.3 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vecteur en lecture: 590.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 6010 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9692 0.0034 0.9386 0.0034 0.7792 0.0034 0.7161 0.0034 0.9251 0.0034 0.7047 36.7274 0.6480 40.0742 0.7000 62.5388 0.7503 120.1344 0.7347 122.7558 0.5652 145.3197 0.0348 150.9707 0.0905 158.5886 0.4427 171.5876 0.5023 174.3485 0.3481 184.0537 0.4868 194.9426 0.1318 211.7580 0.1797 225.3010 0.2227 266.1150 0.5807 275.1982 0.3681 278.1389 0.4447 284.2608 0.4448 290.7205 0.4527 294.1477 0.1985 297.2778 0.4266 310.9071 0.3238 316.7122 0.2734 318.9382 0.3274 324.5271 0.4164 338.6617 0.1615 345.9471 0.0389 350.5181 0.1950 357.8422 0.0156 359.3219 0.3824 370.9472 0.2774 378.8104 0.3361 384.6790 0.5044 391.8160 0.3418 400.4480 0.1541 407.1639 0.3723 413.4858 0.5656 419.7125 0.4657 430.2555 0.4068 432.8512 0.3285 445.3379 0.5534 445.9993 0.3077 453.7313 0.3347 467.9318 0.6062 468.9387 0.2735 471.1962 0.2138 475.9270 0.5854 477.7815 0.3200 484.5206 0.4372 488.3988 0.5295 490.4466 0.4794 492.1266 0.3937 503.1444 0.3869 509.6639 0.5145 516.3295 0.4024 517.6978 0.3202 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DQ=-80 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom making animated gifs 11 models are in 2609081742582622328.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081742582622328.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081742582622328.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2609081742582622328 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609081742582622328.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2609081742582622328 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom making animated gifs 11 models are in 2609081742582622328.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081742582622328.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081742582622328.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2609081742582622328 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081742582622328.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2609081742582622328 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609081742582622328.eigenfacs 2609081742582622328.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609081742582622328.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609081742582622328.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2609081742582622328.10.pdb 2609081742582622328.11.pdb 2609081742582622328.7.pdb 2609081742582622328.8.pdb 2609081742582622328.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m29.628s user 0m29.430s sys 0m0.186s rm: cannot remove '2609081742582622328.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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