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* Cyto C *

LOGs for ID: 2609081743322622464

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2609081743322622464.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2609081743322622464.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2609081743322622464.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    124
            First residue number     =      2
            Last  residue number     =    125
            Number of atoms found    =    905
            Mean number per residue  =      7.3

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    10.204644 +/-     7.986516 From:   -12.356000 To:    28.774000
 =    27.180314 +/-     8.433896 From:     8.863000 To:    45.001000
 =    40.328136 +/-     9.961462 From:    19.283000 To:    63.158000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   8.3356 % Filled.
 Pdbmat>       307332  non-zero elements.
 Pdbmat>        33553 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     74.15 +/-     18.59
         Maximum number =    117
         Minimum number =     25

 Pdbmat> Matrix trace   =  671060.    
 Pdbmat> Larger element =  463.403    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
124 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2609081743322622464.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2609081743322622464.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2609081743322622464.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>   905 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>   124 residues.
 Blocpdb>    11 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     5 atoms in block      2
 Block first atom:     12
 Blocpdb>     7 atoms in block      3
 Block first atom:     17
 Blocpdb>     7 atoms in block      4
 Block first atom:     24
 Blocpdb>     9 atoms in block      5
 Block first atom:     31
 Blocpdb>     8 atoms in block      6
 Block first atom:     40
 Blocpdb>     5 atoms in block      7
 Block first atom:     48
 Blocpdb>     7 atoms in block      8
 Block first atom:     53
 Blocpdb>     7 atoms in block      9
 Block first atom:     60
 Blocpdb>    12 atoms in block     10
 Block first atom:     67
 Blocpdb>    11 atoms in block     11
 Block first atom:     79
 Blocpdb>     9 atoms in block     12
 Block first atom:     90
 Blocpdb>     6 atoms in block     13
 Block first atom:     99
 Blocpdb>     5 atoms in block     14
 Block first atom:    105
 Blocpdb>     8 atoms in block     15
 Block first atom:    110
 Blocpdb>     7 atoms in block     16
 Block first atom:    118
 Blocpdb>     8 atoms in block     17
 Block first atom:    125
 Blocpdb>     8 atoms in block     18
 Block first atom:    133
 Blocpdb>     5 atoms in block     19
 Block first atom:    141
 Blocpdb>     6 atoms in block     20
 Block first atom:    146
 Blocpdb>    10 atoms in block     21
 Block first atom:    152
 Blocpdb>    11 atoms in block     22
 Block first atom:    162
 Blocpdb>     4 atoms in block     23
 Block first atom:    173
 Blocpdb>    11 atoms in block     24
 Block first atom:    177
 Blocpdb>     8 atoms in block     25
 Block first atom:    188
 Blocpdb>     7 atoms in block     26
 Block first atom:    196
 Blocpdb>     7 atoms in block     27
 Block first atom:    203
 Blocpdb>     7 atoms in block     28
 Block first atom:    210
 Blocpdb>     7 atoms in block     29
 Block first atom:    217
 Blocpdb>     7 atoms in block     30
 Block first atom:    224
 Blocpdb>     4 atoms in block     31
 Block first atom:    231
 Blocpdb>     9 atoms in block     32
 Block first atom:    235
 Blocpdb>     5 atoms in block     33
 Block first atom:    244
 Blocpdb>     7 atoms in block     34
 Block first atom:    249
 Blocpdb>    12 atoms in block     35
 Block first atom:    256
 Blocpdb>     8 atoms in block     36
 Block first atom:    268
 Blocpdb>     5 atoms in block     37
 Block first atom:    276
 Blocpdb>     5 atoms in block     38
 Block first atom:    281
 Blocpdb>     9 atoms in block     39
 Block first atom:    286
 Blocpdb>     8 atoms in block     40
 Block first atom:    295
 Blocpdb>     7 atoms in block     41
 Block first atom:    303
 Blocpdb>     5 atoms in block     42
 Block first atom:    310
 Blocpdb>     8 atoms in block     43
 Block first atom:    315
 Blocpdb>     7 atoms in block     44
 Block first atom:    323
 Blocpdb>     5 atoms in block     45
 Block first atom:    330
 Blocpdb>     7 atoms in block     46
 Block first atom:    335
 Blocpdb>     8 atoms in block     47
 Block first atom:    342
 Blocpdb>     7 atoms in block     48
 Block first atom:    350
 Blocpdb>     7 atoms in block     49
 Block first atom:    357
 Blocpdb>     8 atoms in block     50
 Block first atom:    364
 Blocpdb>     7 atoms in block     51
 Block first atom:    372
 Blocpdb>     5 atoms in block     52
 Block first atom:    379
 Blocpdb>     8 atoms in block     53
 Block first atom:    384
 Blocpdb>     7 atoms in block     54
 Block first atom:    392
 Blocpdb>    14 atoms in block     55
 Block first atom:    399
 Blocpdb>     5 atoms in block     56
 Block first atom:    413
 Blocpdb>     5 atoms in block     57
 Block first atom:    418
 Blocpdb>    11 atoms in block     58
 Block first atom:    423
 Blocpdb>     4 atoms in block     59
 Block first atom:    434
 Blocpdb>     7 atoms in block     60
 Block first atom:    438
 Blocpdb>     4 atoms in block     61
 Block first atom:    445
 Blocpdb>     7 atoms in block     62
 Block first atom:    449
 Blocpdb>     9 atoms in block     63
 Block first atom:    456
 Blocpdb>     4 atoms in block     64
 Block first atom:    465
 Blocpdb>     4 atoms in block     65
 Block first atom:    469
 Blocpdb>     8 atoms in block     66
 Block first atom:    473
 Blocpdb>     5 atoms in block     67
 Block first atom:    481
 Blocpdb>    11 atoms in block     68
 Block first atom:    486
 Blocpdb>     7 atoms in block     69
 Block first atom:    497
 Blocpdb>     9 atoms in block     70
 Block first atom:    504
 Blocpdb>     8 atoms in block     71
 Block first atom:    513
 Blocpdb>    14 atoms in block     72
 Block first atom:    521
 Blocpdb>     6 atoms in block     73
 Block first atom:    535
 Blocpdb>     8 atoms in block     74
 Block first atom:    541
 Blocpdb>     5 atoms in block     75
 Block first atom:    549
 Blocpdb>     5 atoms in block     76
 Block first atom:    554
 Blocpdb>     6 atoms in block     77
 Block first atom:    559
 Blocpdb>    11 atoms in block     78
 Block first atom:    565
 Blocpdb>     7 atoms in block     79
 Block first atom:    576
 Blocpdb>     5 atoms in block     80
 Block first atom:    583
 Blocpdb>     9 atoms in block     81
 Block first atom:    588
 Blocpdb>     9 atoms in block     82
 Block first atom:    597
 Blocpdb>     5 atoms in block     83
 Block first atom:    606
 Blocpdb>     5 atoms in block     84
 Block first atom:    611
 Blocpdb>    11 atoms in block     85
 Block first atom:    616
 Blocpdb>     9 atoms in block     86
 Block first atom:    627
 Blocpdb>     8 atoms in block     87
 Block first atom:    636
 Blocpdb>     8 atoms in block     88
 Block first atom:    644
 Blocpdb>     8 atoms in block     89
 Block first atom:    652
 Blocpdb>     7 atoms in block     90
 Block first atom:    660
 Blocpdb>     9 atoms in block     91
 Block first atom:    667
 Blocpdb>     8 atoms in block     92
 Block first atom:    676
 Blocpdb>     6 atoms in block     93
 Block first atom:    684
 Blocpdb>     5 atoms in block     94
 Block first atom:    690
 Blocpdb>     5 atoms in block     95
 Block first atom:    695
 Blocpdb>     5 atoms in block     96
 Block first atom:    700
 Blocpdb>     8 atoms in block     97
 Block first atom:    705
 Blocpdb>     5 atoms in block     98
 Block first atom:    713
 Blocpdb>     4 atoms in block     99
 Block first atom:    718
 Blocpdb>     8 atoms in block    100
 Block first atom:    722
 Blocpdb>     8 atoms in block    101
 Block first atom:    730
 Blocpdb>     8 atoms in block    102
 Block first atom:    738
 Blocpdb>     7 atoms in block    103
 Block first atom:    746
 Blocpdb>     8 atoms in block    104
 Block first atom:    753
 Blocpdb>    11 atoms in block    105
 Block first atom:    761
 Blocpdb>     5 atoms in block    106
 Block first atom:    772
 Blocpdb>     5 atoms in block    107
 Block first atom:    777
 Blocpdb>    11 atoms in block    108
 Block first atom:    782
 Blocpdb>     4 atoms in block    109
 Block first atom:    793
 Blocpdb>     8 atoms in block    110
 Block first atom:    797
 Blocpdb>     7 atoms in block    111
 Block first atom:    805
 Blocpdb>     4 atoms in block    112
 Block first atom:    812
 Blocpdb>     5 atoms in block    113
 Block first atom:    816
 Blocpdb>     6 atoms in block    114
 Block first atom:    821
 Blocpdb>     6 atoms in block    115
 Block first atom:    827
 Blocpdb>     7 atoms in block    116
 Block first atom:    833
 Blocpdb>     5 atoms in block    117
 Block first atom:    840
 Blocpdb>     6 atoms in block    118
 Block first atom:    845
 Blocpdb>    10 atoms in block    119
 Block first atom:    851
 Blocpdb>     8 atoms in block    120
 Block first atom:    861
 Blocpdb>     5 atoms in block    121
 Block first atom:    869
 Blocpdb>    12 atoms in block    122
 Block first atom:    874
 Blocpdb>    11 atoms in block    123
 Block first atom:    886
 Blocpdb>     9 atoms in block    124
 Block first atom:    896

 Blocpdb>   124 blocks.

 Blocpdb> At most,     14 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       307456 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       2715

 Prepmat> Matrix trace    =     671060.0000
 Prepmat> Last element read:    2715   2715       138.2284
 Prepmat>         7751 lines saved.
 Prepmat>         6341 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:   905
 RTB> Total mass =         905.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:   905
 RTB> Number of blocks =   124
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  163135.0322
 RTB>     48864 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      744
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    48864
 Diagstd> Projected matrix trace =  163135.0322

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    744 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 163135.0322
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      2.4194672      3.3788814      5.2719467      8.8707524
     10.7648804     12.1209462     14.1478047     14.3543422     18.1095368
     19.5485487     20.2887586     21.5114719     23.8309523     24.1587480
     26.1917137     28.8259079     30.2189083     31.0876399     32.8377203
     35.2532265     35.8924741     37.4603100     38.7098307     39.7544685
     39.7978949     40.6430005     41.2872102     42.6884572     44.1854760
     45.1037213     46.8236190     48.2432190     48.5823066     49.7543421
     49.9855242     52.4954550     53.2135734     54.5386056     55.2748617
     55.8409468     56.8571977     57.4567866     59.1394760     60.3928718
     61.2860448     62.0897642     64.1610654     64.9352799     65.3770407
     66.6054832     67.6973130     67.9680063     69.1471267     69.9509089
     70.2780465     71.6842097     72.2719552     73.3986585     74.5461164
     75.9633982     77.5597578     77.7646502     79.0064730     79.4402296
     80.8042742     82.8556339     83.3554876     84.0277823     85.2865720
     85.6268070     86.1410971     87.1420108     87.9510838     88.4631378
     89.0516364     90.2023637     91.0339968     91.6645118     93.3735190
     93.4866564     95.0148110     95.3130918     96.4314832     96.7334223
     97.7910965     98.8557883     99.3573323     99.6040352    100.7567700
    101.7604373    102.6264243    102.9760512    104.4457050    104.8382209
    104.9984984    105.9375167    106.5328856    107.1727915    107.6945082
    108.3156690

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034320      0.0034323      0.0034324      0.0034346      0.0034348
      0.0034348    168.9099161    199.6097517    249.3335865    323.4264308
    356.2869248    378.0624473    408.4508539    411.4214478    462.1138143
    480.1230323    489.1285553    503.6517458    530.1099776    533.7433683
    555.7471415    583.0244635    596.9454768    605.4651581    622.2741785
    644.7549963    650.5744125    664.6315663    675.6253186    684.6809681
    685.0548265    692.2901643    697.7551482    709.4969125    721.8302020
    729.2920308    743.0666485    754.2467010    756.8927505    765.9682604
    767.7457232    786.7851107    792.1482955    801.9500065    807.3449118
    811.4685019    818.8191778    823.1252931    835.0914100    843.8944311
    850.1118649    855.6679897    869.8233537    875.0555807    878.0270773
    886.2378048    893.4721008    895.2566295    902.9887707    908.2218818
    910.3431338    919.4053594    923.1668100    930.3349610    937.5788279
    946.4495573    956.3426013    957.6049708    965.2206787    967.8666503
    976.1407588    988.4536340    991.4307357    995.4208451   1002.8491476
   1004.8474970   1007.8606273   1013.6991185   1018.3941083   1021.3543668
   1024.7460018   1031.3456458   1036.0890539   1039.6709162   1049.3180498
   1049.9535687   1058.5001764   1060.1603536   1066.3621059   1068.0302581
   1073.8532554   1079.6831709   1082.4185875   1083.7615698   1090.0148100
   1095.4303331   1100.0815448   1101.9538262   1109.7894019   1111.8727880
   1112.7223833   1117.6869351   1120.8232353   1124.1843928   1126.9173336
   1130.1625796

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =    905
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    124

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9886E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9902E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9909E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.419    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.379    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.272    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.871    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   103.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   105.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   105.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   106.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   108.3    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    744 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99999 1.00003 1.00003 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00004
 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001
 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002
 0.99998 1.00002 1.00003 0.99996 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000
 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001
 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 1.00001
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 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
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 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    16290 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99999 1.00003 1.00003 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00004
 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001
 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002
 0.99998 1.00002 1.00003 0.99996 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000
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 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002
 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
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 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4:-0.000-0.000-0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   6: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector  10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2609081743322622464.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2609081743322622464.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2609081743322622464.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2609081743322622464.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    124
            First residue number     =      2
            Last  residue number     =    125
            Number of atoms found    =    905
            Mean number per residue  =      7.3

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9886E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9902E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9909E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.419    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.379    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.272    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.871    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   103.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   105.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   105.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   106.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   108.3    

 Bfactors>  106 vectors,   2715 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     2.419000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.314 for    124 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.044 +/-   0.03
 Bfactors> =     14.885 +/-   5.79
 Bfactors> Shiftng-fct=     14.841
 Bfactors> Scaling-fct=    173.170

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2609081743322622464.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2609081743322622464.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4319E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4321E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4323E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4347E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4347E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   168.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   199.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   249.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   323.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   356.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   378.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   408.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   411.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   462.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   480.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   489.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   503.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   530.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   533.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   555.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   583.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   596.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   605.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   622.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   644.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   650.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1112.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1113.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1117.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1121.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1124.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1127.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1130.    

 Chkmod>  106 vectors,   2715 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:    905 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    77 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8080
      0.0034      0.7493
      0.0034      0.9144
      0.0034      0.8234
      0.0034      0.7604
      0.0034      0.8361
    168.8864      0.6422
    199.6047      0.6876
    249.3241      0.7081
    323.4171      0.4389
    356.1909      0.4679
    378.0315      0.6877
    408.4650      0.5579
    411.3416      0.7282
    462.0999      0.4076
    480.1202      0.4686
    489.1225      0.3863
    503.6129      0.4735
    530.0766      0.4337
    533.7343      0.3199
    555.7051      0.4883
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    622.2691      0.4920
    644.6978      0.4205
    650.5241      0.4754
    664.6003      0.6732
    675.5978      0.5423
    684.6131      0.5847
    685.0435      0.3681
    692.2349      0.3417
    697.7488      0.2246
    709.4793      0.3413
    721.8362      0.3059
    729.2306      0.3826
    743.0060      0.5695
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    756.8423      0.5023
    765.9020      0.4918
    767.7471      0.4617
    786.7854      0.4428
    792.0877      0.4844
    801.9258      0.3109
    807.2748      0.4252
    811.4268      0.4696
    818.8042      0.3527
    823.1130      0.1638
    835.0593      0.1513
    843.8381      0.2934
    850.1028      0.4652
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    875.0498      0.4211
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   1130.0323      0.3324
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2609081743322622464 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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making animated gifs
11 models are in 2609081743322622464.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2609081743322622464.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2609081743322622464.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2609081743322622464 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
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MODEL 5 will be plotted
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getting mode 11
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2609081743322622464.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m5.367s
user	0m5.331s
sys	0m0.032s
rm: cannot remove '2609081743322622464.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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