CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  LBR-TM-150  ***

LOGs for ID: 2609090623252715620

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2609090623252715620.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2609090623252715620.atom to be opened. Openam> File opened: 2609090623252715620.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 416 First residue number = 200 Last residue number = 615 Number of atoms found = 6830 Mean number per residue = 16.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = -4.584967 +/- 13.188151 From: -37.869000 To: 31.938000 = 2.579610 +/- 10.235296 From: -25.072000 To: 28.580000 = -2.142541 +/- 14.460257 From: -37.593000 To: 31.304000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.3433 % Filled. Pdbmat> 4919240 non-zero elements. Pdbmat> 542110 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 158.74 +/- 46.87 Maximum number = 246 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 1.084220E+07 Pdbmat> Larger element = 892.638 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 416 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2609090623252715620.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2609090623252715620.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2609090623252715620.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6830 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 416 residues. Blocpdb> 47 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 54 atoms in block 2 Block first atom: 48 Blocpdb> 48 atoms in block 3 Block first atom: 102 Blocpdb> 34 atoms in block 4 Block first atom: 150 Blocpdb> 37 atoms in block 5 Block first atom: 184 Blocpdb> 55 atoms in block 6 Block first atom: 221 Blocpdb> 56 atoms in block 7 Block first atom: 276 Blocpdb> 40 atoms in block 8 Block first atom: 332 Blocpdb> 55 atoms in block 9 Block first atom: 372 Blocpdb> 58 atoms in block 10 Block first atom: 427 Blocpdb> 55 atoms in block 11 Block first atom: 485 Blocpdb> 49 atoms in block 12 Block first atom: 540 Blocpdb> 48 atoms in block 13 Block first atom: 589 Blocpdb> 49 atoms in block 14 Block first atom: 637 Blocpdb> 48 atoms in block 15 Block first atom: 686 Blocpdb> 47 atoms in block 16 Block first atom: 734 Blocpdb> 43 atoms in block 17 Block first atom: 781 Blocpdb> 56 atoms in block 18 Block first atom: 824 Blocpdb> 54 atoms in block 19 Block first atom: 880 Blocpdb> 59 atoms in block 20 Block first atom: 934 Blocpdb> 44 atoms in block 21 Block first atom: 993 Blocpdb> 62 atoms in block 22 Block first atom: 1037 Blocpdb> 58 atoms in block 23 Block first atom: 1099 Blocpdb> 52 atoms in block 24 Block first atom: 1157 Blocpdb> 60 atoms in block 25 Block first atom: 1209 Blocpdb> 52 atoms in block 26 Block first atom: 1269 Blocpdb> 44 atoms in block 27 Block first atom: 1321 Blocpdb> 39 atoms in block 28 Block first atom: 1365 Blocpdb> 47 atoms in block 29 Block first atom: 1404 Blocpdb> 39 atoms in block 30 Block first atom: 1451 Blocpdb> 65 atoms in block 31 Block first atom: 1490 Blocpdb> 65 atoms in block 32 Block first atom: 1555 Blocpdb> 40 atoms in block 33 Block first atom: 1620 Blocpdb> 51 atoms in block 34 Block first atom: 1660 Blocpdb> 58 atoms in block 35 Block first atom: 1711 Blocpdb> 35 atoms in block 36 Block first atom: 1769 Blocpdb> 42 atoms in block 37 Block first atom: 1804 Blocpdb> 44 atoms in block 38 Block first atom: 1846 Blocpdb> 44 atoms in block 39 Block first atom: 1890 Blocpdb> 52 atoms in block 40 Block first atom: 1934 Blocpdb> 54 atoms in block 41 Block first atom: 1986 Blocpdb> 49 atoms in block 42 Block first atom: 2040 Blocpdb> 56 atoms in block 43 Block first atom: 2089 Blocpdb> 49 atoms in block 44 Block first atom: 2145 Blocpdb> 34 atoms in block 45 Block first atom: 2194 Blocpdb> 47 atoms in block 46 Block first atom: 2228 Blocpdb> 51 atoms in block 47 Block first atom: 2275 Blocpdb> 48 atoms in block 48 Block first atom: 2326 Blocpdb> 57 atoms in block 49 Block first atom: 2374 Blocpdb> 53 atoms in block 50 Block first atom: 2431 Blocpdb> 45 atoms in block 51 Block first atom: 2484 Blocpdb> 50 atoms in block 52 Block first atom: 2529 Blocpdb> 44 atoms in block 53 Block first atom: 2579 Blocpdb> 32 atoms in block 54 Block first atom: 2623 Blocpdb> 31 atoms in block 55 Block first atom: 2655 Blocpdb> 50 atoms in block 56 Block first atom: 2686 Blocpdb> 59 atoms in block 57 Block first atom: 2736 Blocpdb> 46 atoms in block 58 Block first atom: 2795 Blocpdb> 47 atoms in block 59 Block first atom: 2841 Blocpdb> 49 atoms in block 60 Block first atom: 2888 Blocpdb> 47 atoms in block 61 Block first atom: 2937 Blocpdb> 61 atoms in block 62 Block first atom: 2984 Blocpdb> 47 atoms in block 63 Block first atom: 3045 Blocpdb> 56 atoms in block 64 Block first atom: 3092 Blocpdb> 45 atoms in block 65 Block first atom: 3148 Blocpdb> 47 atoms in block 66 Block first atom: 3193 Blocpdb> 49 atoms in block 67 Block first atom: 3240 Blocpdb> 52 atoms in block 68 Block first atom: 3289 Blocpdb> 48 atoms in block 69 Block first atom: 3341 Blocpdb> 54 atoms in block 70 Block first atom: 3389 Blocpdb> 49 atoms in block 71 Block first atom: 3443 Blocpdb> 49 atoms in block 72 Block first atom: 3492 Blocpdb> 44 atoms in block 73 Block first atom: 3541 Blocpdb> 46 atoms in block 74 Block first atom: 3585 Blocpdb> 49 atoms in block 75 Block first atom: 3631 Blocpdb> 48 atoms in block 76 Block first atom: 3680 Blocpdb> 59 atoms in block 77 Block first atom: 3728 Blocpdb> 45 atoms in block 78 Block first atom: 3787 Blocpdb> 53 atoms in block 79 Block first atom: 3832 Blocpdb> 46 atoms in block 80 Block first atom: 3885 Blocpdb> 48 atoms in block 81 Block first atom: 3931 Blocpdb> 45 atoms in block 82 Block first atom: 3979 Blocpdb> 51 atoms in block 83 Block first atom: 4024 Blocpdb> 37 atoms in block 84 Block first atom: 4075 Blocpdb> 47 atoms in block 85 Block first atom: 4112 Blocpdb> 46 atoms in block 86 Block first atom: 4159 Blocpdb> 40 atoms in block 87 Block first atom: 4205 Blocpdb> 59 atoms in block 88 Block first atom: 4245 Blocpdb> 50 atoms in block 89 Block first atom: 4304 Blocpdb> 51 atoms in block 90 Block first atom: 4354 Blocpdb> 47 atoms in block 91 Block first atom: 4405 Blocpdb> 60 atoms in block 92 Block first atom: 4452 Blocpdb> 44 atoms in block 93 Block first atom: 4512 Blocpdb> 44 atoms in block 94 Block first atom: 4556 Blocpdb> 51 atoms in block 95 Block first atom: 4600 Blocpdb> 41 atoms in block 96 Block first atom: 4651 Blocpdb> 49 atoms in block 97 Block first atom: 4692 Blocpdb> 54 atoms in block 98 Block first atom: 4741 Blocpdb> 51 atoms in block 99 Block first atom: 4795 Blocpdb> 44 atoms in block 100 Block first atom: 4846 Blocpdb> 62 atoms in block 101 Block first atom: 4890 Blocpdb> 31 atoms in block 102 Block first atom: 4952 Blocpdb> 49 atoms in block 103 Block first atom: 4983 Blocpdb> 44 atoms in block 104 Block first atom: 5032 Blocpdb> 58 atoms in block 105 Block first atom: 5076 Blocpdb> 38 atoms in block 106 Block first atom: 5134 Blocpdb> 54 atoms in block 107 Block first atom: 5172 Blocpdb> 46 atoms in block 108 Block first atom: 5226 Blocpdb> 54 atoms in block 109 Block first atom: 5272 Blocpdb> 42 atoms in block 110 Block first atom: 5326 Blocpdb> 42 atoms in block 111 Block first atom: 5368 Blocpdb> 52 atoms in block 112 Block first atom: 5410 Blocpdb> 34 atoms in block 113 Block first atom: 5462 Blocpdb> 55 atoms in block 114 Block first atom: 5496 Blocpdb> 59 atoms in block 115 Block first atom: 5551 Blocpdb> 45 atoms in block 116 Block first atom: 5610 Blocpdb> 47 atoms in block 117 Block first atom: 5655 Blocpdb> 51 atoms in block 118 Block first atom: 5702 Blocpdb> 46 atoms in block 119 Block first atom: 5753 Blocpdb> 45 atoms in block 120 Block first atom: 5799 Blocpdb> 44 atoms in block 121 Block first atom: 5844 Blocpdb> 41 atoms in block 122 Block first atom: 5888 Blocpdb> 55 atoms in block 123 Block first atom: 5929 Blocpdb> 55 atoms in block 124 Block first atom: 5984 Blocpdb> 59 atoms in block 125 Block first atom: 6039 Blocpdb> 55 atoms in block 126 Block first atom: 6098 Blocpdb> 55 atoms in block 127 Block first atom: 6153 Blocpdb> 56 atoms in block 128 Block first atom: 6208 Blocpdb> 49 atoms in block 129 Block first atom: 6264 Blocpdb> 50 atoms in block 130 Block first atom: 6313 Blocpdb> 49 atoms in block 131 Block first atom: 6363 Blocpdb> 63 atoms in block 132 Block first atom: 6412 Blocpdb> 33 atoms in block 133 Block first atom: 6475 Blocpdb> 61 atoms in block 134 Block first atom: 6508 Blocpdb> 49 atoms in block 135 Block first atom: 6569 Blocpdb> 53 atoms in block 136 Block first atom: 6618 Blocpdb> 63 atoms in block 137 Block first atom: 6671 Blocpdb> 55 atoms in block 138 Block first atom: 6734 Blocpdb> 42 atoms in block 139 Block first atom: 6788 Blocpdb> 139 blocks. Blocpdb> At most, 65 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 31 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 4919379 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 20490 Prepmat> Matrix trace = 10842200.0000 Prepmat> Last element read: 20490 20490 553.2759 Prepmat> 9731 lines saved. Prepmat> 8145 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6830 RTB> Total mass = 6830.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6830 RTB> Number of blocks = 139 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 345902.9416 RTB> 54975 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 834 Diagstd> Nb of non-zero elements: 54975 Diagstd> Projected matrix trace = 345902.9416 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 834 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 345902.9416 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.8985504 4.7732099 6.2691543 8.2121988 8.3845078 11.6766141 12.1498247 12.7319840 13.3051735 16.1885400 16.7615691 18.7615866 18.9732504 20.8448551 22.9753546 23.5383264 25.8169700 26.3437177 27.6597752 29.2419443 29.9035989 30.5385514 31.5880399 33.7201438 33.9049021 35.7399148 40.7379328 41.2661807 42.4271666 44.1958876 45.8750373 46.6054134 47.3055040 48.8881891 50.4964948 51.5073491 52.4282046 53.4060072 54.7520064 57.1382123 58.5983495 58.7280486 60.3675506 60.9234120 62.1819298 63.0642107 65.2278510 66.4051368 67.9840290 68.5604565 70.9883437 72.0595218 73.8734710 75.3033910 75.9255425 76.7272232 78.1268713 78.2613978 79.5940630 81.8625691 83.4984517 83.7712134 85.4389351 86.1460615 87.9379120 90.7047065 91.7458083 93.0482518 95.5579098 96.3683974 97.1548987 98.4967558 99.2731116 99.5765436 100.7557162 101.6747232 104.4722864 104.9747288 105.7266973 107.8733715 108.7882159 109.5389349 111.3433367 112.1552303 114.8856560 116.9378270 117.1081283 118.7708257 119.6636365 120.7906770 122.1221735 123.4104095 124.4351019 126.8527880 127.2335748 128.2003679 130.6897784 130.9639708 131.6427205 132.5276147 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034294 0.0034317 0.0034328 0.0034339 0.0034345 0.0034358 184.8782004 237.2469005 271.8940847 311.1895526 314.4373068 371.0682051 378.5125524 387.4746748 396.1006469 436.9171803 444.5827591 470.3596534 473.0054553 495.7865266 520.5067815 526.8452524 551.7570809 557.3574525 571.1097876 587.2167064 593.8229929 600.0942931 610.3186194 630.5797053 632.3048716 649.1903216 693.0982052 697.5774262 707.3222093 721.9152406 735.5013864 741.3332217 746.8804940 759.2717746 771.6598366 779.3452269 786.2809852 793.5793081 803.5174259 820.8401754 831.2620851 832.1815164 843.7175011 847.5930547 856.3028281 862.3563441 877.0246814 884.9039184 895.3621466 899.1499624 914.9319675 921.8090512 933.3392567 942.3289789 946.2137007 951.1960124 959.8326008 960.6586120 968.8033179 982.5122303 992.2805790 993.8999831 1003.7445347 1007.8896691 1018.3178465 1034.2134739 1040.1318516 1047.4888028 1061.5210268 1066.0132401 1070.3544817 1077.7207468 1081.9597318 1083.6119955 1090.0091096 1094.9688882 1109.9306136 1112.5964272 1116.5742630 1127.8527598 1132.6251673 1136.5264232 1145.8490166 1150.0190807 1163.9335440 1174.2830437 1175.1378110 1183.4506926 1187.8904163 1193.4713227 1200.0312145 1206.3440234 1211.3418847 1223.0530319 1224.8873371 1229.5322259 1241.4124344 1242.7140187 1245.9301768 1250.1106958 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6830 Rtb_to_modes> Number of blocs = 139 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9733E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9867E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.899 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.773 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.269 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.385 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.5 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 834 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 122940 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609090623252715620.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609090623252715620.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2609090623252715620.atom Openam> file on opening on unit 11: 2609090623252715620.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 416 First residue number = 200 Last residue number = 615 Number of atoms found = 6830 Mean number per residue = 16.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9733E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9867E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.899 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.773 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.269 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.385 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.5 Bfactors> 106 vectors, 20490 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.899000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.006 +/- 0.01 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.006 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609090623252715620.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609090623252715620.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4292E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1034. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1070. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1082. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1110. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1113. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1128. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1146. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1164. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1174. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1175. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1184. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1188. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1200. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1206. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1211. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1223. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1225. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1241. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1246. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1250. Chkmod> 106 vectors, 20490 coordinates in file. Chkmod> That is: 6830 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8160 0.0034 0.7412 0.0034 0.9851 0.0034 0.6623 0.0034 0.9823 0.0034 0.8954 184.8846 0.0087 237.2315 0.5073 271.8791 0.2544 311.1724 0.1248 314.4330 0.4534 371.1061 0.3094 378.4990 0.2256 387.4279 0.3557 396.1555 0.4178 436.9181 0.1481 444.5429 0.6329 470.3196 0.0456 472.9446 0.3429 495.7075 0.4331 520.5371 0.4364 526.8414 0.3568 551.7658 0.3676 557.2942 0.6709 571.0876 0.4909 587.1720 0.2043 593.7618 0.4636 600.0828 0.5302 610.3114 0.5152 630.5513 0.3214 632.2320 0.5164 649.1632 0.2685 693.0860 0.5164 697.5798 0.3557 707.3155 0.3032 721.9178 0.4338 735.5096 0.2777 741.3379 0.3067 746.8839 0.3107 759.2532 0.3306 771.6535 0.3269 779.3318 0.3334 786.2607 0.5044 793.5749 0.4133 803.4682 0.3640 820.8178 0.4910 831.2381 0.4220 832.1596 0.2894 843.6984 0.1373 847.5329 0.2980 856.2528 0.3905 862.2905 0.3929 877.0015 0.3438 884.8983 0.5049 895.2972 0.3573 899.1084 0.5202 914.9034 0.4507 921.7725 0.4431 933.2773 0.5219 942.2673 0.3477 946.2009 0.4464 951.1724 0.2726 959.8106 0.3122 960.6088 0.3690 968.7370 0.4198 982.4546 0.5065 992.2472 0.4749 993.8501 0.4413 1003.7077 0.4053 1007.8694 0.4510 1018.2862 0.4898 1034.1422 0.4620 1040.1110 0.4327 1047.4537 0.4599 1061.4871 0.4159 1065.9763 0.4490 1070.2816 0.3798 1077.6922 0.4373 1081.8963 0.4202 1083.5843 0.3080 1090.2018 0.3630 1095.0580 0.2800 1110.0302 0.4393 1112.6826 0.4477 1116.3854 0.4159 1127.9435 0.3992 1132.6379 0.5512 1136.2756 0.2858 1145.5768 0.4931 1150.1992 0.4911 1163.9562 0.4877 1174.0427 0.3995 1175.0466 0.2839 1183.5452 0.3928 1188.0199 0.4071 1193.4661 0.4066 1199.8708 0.3773 1206.2414 0.3084 1211.1190 0.3495 1223.2281 0.4227 1224.6731 0.4135 1229.4777 0.4060 1241.4077 0.4028 1242.8316 0.4247 1245.6745 0.4248 1249.9268 0.4197 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2609090623252715620 7 -150 150 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-150 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-130 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-110 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-90 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-70 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-50 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=70 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=90 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=110 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=130 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=150 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom making animated gifs 16 models are in 2609090623252715620.7.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2609090623252715620.7.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2609090623252715620.7.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2609090623252715620 8 -150 150 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-150 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-130 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-110 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-90 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-70 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-50 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=70 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=90 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=110 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=130 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=150 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom making animated gifs 16 models are in 2609090623252715620.8.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2609090623252715620.8.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2609090623252715620.8.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2609090623252715620 9 -150 150 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-150 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-130 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-110 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-90 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-70 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-50 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=70 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=90 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=110 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=130 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=150 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom making animated gifs 16 models are in 2609090623252715620.9.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2609090623252715620.9.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2609090623252715620.9.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2609090623252715620 10 -150 150 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-150 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-130 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-110 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-90 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-70 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-50 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=70 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=90 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=110 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=130 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=150 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom making animated gifs 16 models are in 2609090623252715620.10.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2609090623252715620.10.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2609090623252715620.10.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2609090623252715620 11 -150 150 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-150 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-130 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-110 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-90 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-70 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-50 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=70 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=90 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=110 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=130 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom calculating perturbed structure for DQ=150 2609090623252715620.eigenfacs 2609090623252715620.atom making animated gifs 16 models are in 2609090623252715620.11.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2609090623252715620.11.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2609090623252715620.11.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2609090623252715620.10.pdb 2609090623252715620.11.pdb 2609090623252715620.7.pdb 2609090623252715620.8.pdb 2609090623252715620.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m28.530s user 0m28.115s sys 0m0.390s rm: cannot remove '2609090623252715620.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.