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***  vps4b  ***

CA distance fluctuations for 2609092319512946827

---  normal mode 7  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
ALA 371 0.33 ALA 123 -0.00 SER 202
ALA 371 0.32 ILE 124 -0.00 SER 201
ALA 371 0.33 VAL 125 -0.01 ILE 280
ALA 371 0.33 ILE 126 -0.01 ILE 280
ALA 371 0.33 GLU 127 -0.01 ILE 280
ALA 371 0.32 ARG 128 -0.01 PRO 175
ALA 371 0.30 PRO 129 -0.01 PRO 176
ALA 371 0.28 ASN 130 -0.01 PRO 176
ALA 371 0.24 VAL 131 -0.02 PRO 176
ALA 371 0.18 LYS 132 -0.02 PRO 176
ALA 371 0.14 TRP 133 -0.01 PRO 176
ALA 371 0.11 SER 134 -0.03 ALA 339
ALA 371 0.16 ASP 135 -0.04 ALA 339
ALA 371 0.14 VAL 136 -0.04 ALA 339
ALA 371 0.10 ALA 137 -0.04 ALA 339
ALA 371 0.07 GLY 138 -0.05 ASP 388
ALA 371 0.09 LEU 139 -0.05 ASP 388
ALA 371 0.07 GLU 140 -0.07 HIS 304
ALA 371 0.07 GLY 141 -0.09 HIS 304
ALA 371 0.10 ALA 142 -0.06 GLU 302
ALA 371 0.11 LYS 143 -0.04 HIS 304
ALA 371 0.09 GLU 144 -0.06 HIS 304
ALA 371 0.10 ALA 145 -0.05 GLU 302
ALA 371 0.13 LEU 146 -0.04 GLU 302
ALA 371 0.12 LYS 147 -0.03 HIS 304
ALA 371 0.11 GLU 148 -0.04 HIS 304
ALA 371 0.13 ALA 149 -0.04 GLU 302
ALA 371 0.15 VAL 150 -0.03 GLU 302
ALA 371 0.14 ILE 151 -0.02 GLU 302
ALA 371 0.12 LEU 152 -0.03 HIS 304
ALA 371 0.14 PRO 153 -0.03 GLU 302
ALA 371 0.16 ILE 154 -0.02 GLU 302
ALA 371 0.14 LYS 155 -0.02 GLU 302
ALA 371 0.13 PHE 156 -0.03 PRO 303
ALA 371 0.14 PRO 157 -0.02 GLU 302
ALA 371 0.13 HIS 158 -0.03 ARG 331
ALA 371 0.11 LEU 159 -0.03 ARG 331
ALA 371 0.13 PHE 160 -0.03 ARG 331
ALA 371 0.13 THR 161 -0.03 ARG 331
ALA 371 0.13 GLY 162 -0.03 ARG 331
ALA 371 0.12 LYS 163 -0.04 ARG 331
ALA 371 0.12 ARG 164 -0.04 ARG 331
ALA 371 0.14 THR 165 -0.03 GLU 302
ALA 371 0.15 PRO 166 -0.03 GLU 302
ALA 371 0.15 TRP 167 -0.03 GLU 302
ALA 371 0.17 ARG 168 -0.02 GLU 302
ALA 371 0.17 GLY 169 -0.02 GLU 302
ALA 371 0.16 ILE 170 -0.03 GLU 302
ALA 371 0.15 LEU 171 -0.03 ASP 334
ALA 371 0.15 LEU 172 -0.03 ASP 334
ALA 371 0.13 PHE 173 -0.04 ASP 334
ALA 371 0.11 GLY 174 -0.05 GLY 387
ALA 371 0.10 PRO 175 -0.06 GLY 387
ALA 371 0.13 PRO 176 -0.04 GLY 387
ALA 339 0.14 GLY 177 -0.03 GLY 387
ALA 371 0.13 THR 178 -0.03 GLY 387
ALA 371 0.18 GLY 179 -0.03 PRO 176
ALA 371 0.18 LYS 180 -0.02 PRO 176
ALA 371 0.22 SER 181 -0.01 PRO 175
ALA 371 0.22 TYR 182 -0.02 PRO 176
ALA 371 0.18 LEU 183 -0.01 PRO 176
ALA 371 0.20 ALA 184 -0.02 PRO 299
ALA 371 0.24 LYS 185 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.20 ALA 186 -0.01 PRO 176
ALA 371 0.19 VAL 187 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.22 ALA 188 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.22 THR 189 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.19 GLU 190 -0.01 GLU 140
ALA 371 0.19 ALA 191 -0.01 GLU 140
ALA 371 0.20 ASN 192 -0.01 GLU 140
ALA 371 0.24 ASN 193 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.24 SER 194 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.28 THR 195 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.28 PHE 196 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.28 PHE 197 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.28 SER 198 -0.01 ILE 280
ALA 371 0.28 ILE 199 -0.00 TRP 282
ALA 371 0.26 SER 200 -0.00 ILE 280
GLY 401 0.24 SER 201 -0.00 ILE 124
GLY 401 0.26 SER 202 -0.00 ALA 123
GLY 401 0.25 ASP 203 -0.01 SER 238
GLY 401 0.26 LEU 204 -0.01 ARG 243
GLY 401 0.30 VAL 205 -0.01 SER 242
GLY 401 0.30 SER 206 -0.01 SER 242
GLY 401 0.33 LYS 207 -0.01 SER 242
GLY 401 0.32 TRP 208 -0.01 GLY 241
GLY 401 0.30 LEU 209 -0.01 GLY 241
GLY 401 0.28 GLY 210 -0.01 LYS 207
GLY 401 0.27 GLU 211 -0.01 LYS 207
GLY 401 0.27 SER 212 -0.00 SER 206
GLY 401 0.25 GLU 213 -0.01 SER 206
GLY 401 0.26 LYS 214 -0.00 SER 206
GLY 401 0.27 LEU 215 -0.00 SER 206
ALA 371 0.25 VAL 216 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.25 LYS 217 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.27 ASN 218 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.27 LEU 219 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.24 PHE 220 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.25 GLN 221 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.28 LEU 222 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.26 ALA 223 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.24 ARG 224 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.26 GLU 225 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.27 ASN 226 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.24 LYS 227 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.23 PRO 228 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.24 SER 229 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.23 ILE 230 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.24 ILE 231 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.23 PHE 232 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.23 ILE 233 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.22 ASP 234 -0.01 ILE 280
GLY 401 0.20 GLU 235 -0.01 ILE 280
ALA 371 0.19 ILE 236 -0.01 PRO 299
GLY 401 0.18 ASP 237 -0.01 ASP 334
GLY 401 0.20 SER 238 -0.01 LEU 204
GLY 401 0.21 LEU 239 -0.01 SER 206
GLY 401 0.18 CYS 240 -0.01 ASP 334
GLY 401 0.20 GLY 241 -0.01 SER 206
GLY 401 0.19 SER 242 -0.01 SER 206
GLY 401 0.17 ARG 243 -0.01 SER 206
GLY 401 0.17 SER 244 -0.01 SER 206
GLY 401 0.19 GLU 245 -0.01 SER 206
GLY 401 0.20 ASN 246 -0.01 SER 206
GLY 401 0.21 GLU 247 -0.01 SER 206
GLY 401 0.20 SER 248 -0.01 SER 206
GLY 401 0.22 GLU 249 -0.01 SER 206
GLY 401 0.23 ALA 250 -0.01 SER 206
GLY 401 0.22 ALA 251 -0.01 SER 206
GLY 401 0.20 ARG 252 -0.01 SER 206
GLY 401 0.22 ARG 253 -0.01 SER 206
GLY 401 0.22 ILE 254 -0.01 SER 206
GLY 401 0.20 LYS 255 -0.01 ASP 334
GLY 401 0.19 THR 256 -0.01 ASP 334
GLY 401 0.21 GLU 257 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.21 PHE 258 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.19 LEU 259 -0.01 ASP 334
ALA 371 0.19 VAL 260 -0.01 ASP 334
ALA 371 0.21 GLN 261 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.19 MET 262 -0.02 ASP 334
ALA 371 0.18 GLN 263 -0.02 ASP 334
ALA 371 0.19 GLY 264 -0.02 GLU 302
ALA 371 0.19 VAL 265 -0.01 GLU 302
ALA 371 0.19 GLY 266 -0.01 GLU 302
ALA 371 0.20 VAL 267 -0.01 GLU 302
ALA 371 0.19 ASP 268 -0.01 GLU 302
ALA 371 0.20 ASN 269 -0.01 GLU 302
ALA 371 0.19 ASP 270 -0.02 GLU 302
ALA 371 0.20 GLY 271 -0.01 ILE 154
ALA 371 0.21 ILE 272 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.20 LEU 273 -0.01 PRO 299
ALA 371 0.20 VAL 274 -0.02 PRO 299
ALA 371 0.19 LEU 275 -0.02 PRO 299
ALA 371 0.19 GLY 276 -0.02 PRO 299
ALA 371 0.18 ALA 277 -0.02 PRO 299
ALA 371 0.16 THR 278 -0.02 ASP 334
ALA 371 0.14 ASN 279 -0.03 GLY 387
GLY 401 0.13 ILE 280 -0.03 GLY 387
GLY 401 0.13 PRO 281 -0.04 ASP 334
GLY 401 0.12 TRP 282 -0.04 ASP 334
GLY 401 0.14 VAL 283 -0.03 ASP 334
GLY 401 0.15 LEU 284 -0.03 ASP 334
GLY 401 0.16 ASP 285 -0.03 ASP 334
GLY 401 0.14 SER 286 -0.03 ASP 334
GLY 401 0.15 ALA 287 -0.03 ASP 334
ALA 371 0.16 ILE 288 -0.02 ASP 334
ALA 371 0.15 ARG 289 -0.03 ASP 334
ALA 371 0.14 ARG 290 -0.04 ASP 334
ALA 371 0.16 ARG 291 -0.03 ASP 334
ALA 371 0.15 PHE 292 -0.03 ASP 334
ALA 371 0.13 GLU 293 -0.04 ASP 334
ALA 371 0.13 LYS 294 -0.04 GLU 302
ALA 371 0.12 ARG 295 -0.05 ASP 334
ALA 371 0.11 ILE 296 -0.06 GLU 302
ALA 371 0.10 TYR 297 -0.06 ASP 334
ALA 371 0.11 ILE 298 -0.07 PRO 299
ALA 371 0.08 PRO 299 -0.07 ASP 388
ALA 371 0.07 LEU 300 -0.07 ASP 388
ALA 371 0.07 PRO 301 -0.07 ASP 388
ALA 371 0.05 GLU 302 -0.08 ASP 388
LEU 204 0.04 PRO 303 -0.09 ASP 388
ASP 135 0.07 HIS 304 -0.09 GLY 141
ASP 135 0.06 ALA 305 -0.06 GLY 141
GLY 179 0.07 ARG 306 -0.07 ASP 388
TYR 182 0.08 ALA 307 -0.07 ASP 388
TYR 182 0.10 ALA 308 -0.05 ASP 388
TYR 182 0.13 MET 309 -0.05 SER 385
TYR 182 0.11 PHE 310 -0.05 SER 385
TYR 182 0.12 LYS 311 -0.03 SER 385
TYR 182 0.16 LEU 312 -0.02 SER 385
TYR 182 0.17 HIS 313 -0.03 SER 385
VAL 125 0.16 LEU 314 -0.02 SER 385
GLU 127 0.19 GLY 315 -0.01 ASP 347
GLU 127 0.20 THR 316 -0.02 MET 350
VAL 125 0.19 THR 317 -0.02 MET 350
VAL 125 0.17 GLN 318 -0.03 VAL 353
VAL 125 0.15 ASN 319 -0.03 PRO 373
ALA 123 0.13 SER 320 -0.11 PRO 368
VAL 125 0.11 LEU 321 -0.09 GLY 367
VAL 125 0.10 THR 322 -0.10 GLY 367
ASN 130 0.09 GLU 323 -0.07 GLY 367
VAL 205 0.08 ALA 324 -0.10 PRO 389
VAL 205 0.09 ASP 325 -0.10 PRO 389
VAL 205 0.09 PHE 326 -0.08 PRO 389
VAL 205 0.07 ARG 327 -0.09 PRO 389
VAL 205 0.07 GLU 328 -0.12 PRO 389
VAL 205 0.08 LEU 329 -0.11 ASP 388
VAL 205 0.07 GLY 330 -0.10 ASP 388
VAL 205 0.05 ARG 331 -0.12 ASP 388
LEU 204 0.06 LYS 332 -0.13 ASP 388
LEU 204 0.06 THR 333 -0.11 ASP 388
LEU 204 0.04 ASP 334 -0.11 ASP 388
ALA 371 0.05 GLY 335 -0.10 ASP 388
LEU 204 0.06 TYR 336 -0.09 ASP 388
ALA 371 0.08 SER 337 -0.07 GLY 387
GLY 179 0.11 GLY 338 -0.05 SER 385
GLY 177 0.14 ALA 339 -0.04 SER 385
LEU 204 0.12 ASP 340 -0.07 SER 385
LEU 204 0.12 ILE 341 -0.07 SER 385
LEU 204 0.16 SER 342 -0.05 SER 385
LEU 204 0.19 ILE 343 -0.06 SER 385
LEU 204 0.15 ILE 344 -0.08 SER 385
VAL 205 0.16 VAL 345 -0.06 SER 385
VAL 205 0.20 ARG 346 -0.04 SER 385
LEU 204 0.20 ASP 347 -0.07 SER 385
VAL 205 0.17 ALA 348 -0.07 SER 385
VAL 205 0.20 LEU 349 -0.03 SER 385
VAL 205 0.22 MET 350 -0.04 SER 385
VAL 205 0.19 GLN 351 -0.06 SER 385
LYS 207 0.20 PRO 352 -0.04 VAL 353
LYS 207 0.24 VAL 353 -0.04 PRO 352
LYS 207 0.22 ARG 354 -0.05 SER 385
LYS 207 0.19 LYS 355 -0.06 CYS 384
LYS 207 0.22 VAL 356 -0.03 SER 412
LYS 207 0.24 GLN 357 -0.02 VAL 356
LYS 207 0.20 SER 358 -0.04 ARG 416
LYS 207 0.19 ALA 359 -0.08 ARG 416
LYS 207 0.18 THR 360 -0.08 ARG 416
LYS 207 0.18 HIS 361 -0.09 SER 412
LYS 207 0.19 PHE 362 -0.10 SER 412
LYS 207 0.18 LYS 363 -0.12 SER 412
ALA 123 0.20 LYS 364 -0.11 SER 412
ALA 123 0.19 VAL 365 -0.12 SER 412
ALA 123 0.21 ARG 366 -0.11 SER 412
ALA 123 0.21 GLY 367 -0.11 SER 412
ALA 123 0.24 PRO 368 -0.11 SER 320
ALA 123 0.28 SER 369 -0.08 SER 320
ALA 123 0.31 ARG 370 -0.07 SER 320
ILE 126 0.33 ALA 371 -0.06 SER 320
GLU 127 0.31 ASP 372 -0.08 SER 320
GLU 127 0.27 PRO 373 -0.10 SER 320
GLU 127 0.26 ASN 374 -0.10 THR 322
ALA 123 0.26 HIS 375 -0.09 THR 322
ALA 123 0.24 LEU 376 -0.09 THR 322
ALA 123 0.26 VAL 377 -0.08 SER 412
ALA 123 0.23 ASP 378 -0.09 SER 412
ALA 123 0.23 ASP 379 -0.09 SER 412
ALA 123 0.24 LEU 380 -0.08 SER 412
ALA 123 0.22 LEU 381 -0.09 SER 412
LYS 207 0.20 THR 382 -0.11 SER 412
LYS 207 0.18 PRO 383 -0.11 SER 412
LYS 207 0.15 CYS 384 -0.15 SER 412
LYS 207 0.12 SER 385 -0.17 ARG 416
LYS 207 0.13 PRO 386 -0.14 SER 419
LYS 207 0.12 GLY 387 -0.15 SER 419
LYS 207 0.12 ASP 388 -0.15 SER 412
ALA 123 0.13 PRO 389 -0.14 SER 412
ALA 123 0.15 GLY 390 -0.13 SER 412
LYS 207 0.16 ALA 391 -0.12 SER 412
LYS 207 0.18 ILE 392 -0.10 SER 412
LYS 207 0.19 GLU 393 -0.08 SER 412
LYS 207 0.22 MET 394 -0.06 SER 412
LYS 207 0.24 THR 395 -0.05 SER 412
LYS 207 0.27 TRP 396 -0.04 SER 412
LYS 207 0.30 MET 397 -0.03 SER 412
LYS 207 0.28 ASP 398 -0.04 SER 412
LYS 207 0.27 VAL 399 -0.05 SER 412
LYS 207 0.30 PRO 400 -0.04 SER 412
ALA 123 0.33 GLY 401 -0.03 SER 320
ALA 123 0.32 ASP 402 -0.04 SER 320
ALA 123 0.28 LYS 403 -0.05 SER 412
ALA 123 0.26 LEU 404 -0.05 SER 412
ALA 123 0.23 LEU 405 -0.07 SER 412
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